Vous êtes sur la page 1sur 11

Artculo de datos

Biodiversidad de grupos funcionales de microorganismos asociados


a suelos bajo cultivo de papa, ganadera y pramo en el Parque
Nacional Natural de Los Nevados, Colombia
Biodiversity of functional groups of microorganisms associated soils under potato
crop, livestock and pramo the Nevados National Natural Park, Colombia

Lizeth M. Avellaneda-Torres y Esperanza Torres-Rojas

Citacin del recurso. Avellaneda-Torres, L. M. y E. Torres-Rojas. 2013. Grupos funcionales de microorganismos del
suelo asociados a cultivo de papa, ganadera y pramo del Parque Nacional Natural de Los Nevados, 1060 registros, En
lnea, http://ipt.sibcolombia.net/sib/resource.do?r=unal_gebix, publicado el 23/07/2013. GBIF key: http://www.gbif.org/
dataset/b5e9e6f3-3214-4aae-9af7-92d08d8f8a9d doi:10.15468/oabpy4

Resumen
El presente artculo reporta 1.060 morfotipos microbianos (bacterias y hongos) aislados de medios selectivos
para grupos funcionales del suelo, como fijadores de nitrgeno, solubilizadores de fosfato y celulolticos. Los
aislamientos se realizaron en suelos bajo cultivo de papa, ganadera y pramo con la menor intervencin antrpica
posible en la vereda El Bosque, del Parque Nacional Natural Los Nevados, Colombia. Para cada morfotipo
se reporta la identificacin realizada mediante marcadores moleculares, el grupo funcional al que pertenece,
la georreferenciacin del lugar de aislamiento y el uso del suelo asociado. De esta manera se contribuye a la
caracterizacin de la biodiversidad de bacterias y hongos de los pramos colombianos, situacin relevante dado el
poco conocimiento que existe al respecto y las condiciones ambientales extremas en las que se encuentran dichos
microorganismos.

Palabras clave. Fijador de nitrgeno. Solubilizador de fosfato. Celuloltico. Microbiota cultivable edfica.
Diversidad microbiana.

Abstract
This article describes the isolation of 1,060 microbial morphotypes (bacteria and fungi) nitrogen fixing, phosphate
solubilizing and cellulolytics of soils under potato crop, livestock and pramo with the least human intervention
possible from the municipality El Bosque in Los Nevados National Natural Park. For each morphotype the
taxonomic identification using molecular markers, the functional group to which it belongs (nitrogen fixing,
phosphate solubilizing or cellulolytic), and the georeferenced location of isolation and associated land use was
reported. This work contributes to the characterization of the poorly known biodiversity of bacteria and fungi
from the extreme environmental conditions of Colombian pramos.

Keywords. Nitrogen fixing. Phosphate solubilizing. Cellulolytics. Cultivable soil microbiota. Microbial diversity.

78 Biota Colombiana 16 (1) - 2015


Avellaneda-Torres y Torres-Rojas Biodiversidad de grupos funcionales de microorganismos asociados a suelos bajo
cultivo de papa, ganadera y pramo en el Parque Nacional Natural de Los Nevados, Colombia

Introduccin
Propsito. Los pramos prestan a la sociedad DTNO-N-20/2007. Los autores tambin agradecen al
servicios ambientales como la provisin continua de Centro Colombiano en Genmica y Bioinformtica
agua, regulacin hidrolgica, estabilidad de suelos, en Ambientes Extremos (GEBIX) y a la Universidad
mantenimiento de la biodiversidad, almacenamiento Nacional de Colombia por la financiacin de la
de carbono y valor paisajstico y cultural. En este presente investigacin.
contexto los pramos han sido considerados hotspots
por su ubicacin dentro de la cordillera de los Andes Descripcin del rea estudio. El PNN Los Nevados
(Myers et al. 2000, Madrin et al. 2013). Al interior constituye una regin de alto inters biolgico en
del pramo y especficamente en la vereda El Bosque Colombia y el mundo. Es una de las principales reas
del Parque Nacional Natural de Los Nevados (PNN protegidas de carcter nacional que hace parte de los
Los Nevados), se desarrollan actividades productivas procesos de ordenamiento ambiental del territorio,
entre las que se destacan el cultivo de papa y la donde se viene consolidando un Sistema Regional de
ganadera. reas Protegidas para la ecorregin del Eje Cafetero.
El parque incluye diversos ecosistemas como nieves
En el marco del proyecto titulado Caracterizacin de perpetuas, superpramo, pramo y bosques altoandinos,
comunidades microbianas asociadas a prcticas agr- andinos y subandinos, siendo el pramo y superpramo
colas y usos del suelo de la vereda El Bosque - PNN los ecosistemas ms representativos en rea (Fandio
Los Nevados, que busc avanzar en el conocimiento y Wyngaarden 2002). El PNN Los Nevados hace parte
de los efectos del cultivo de papa y la ganadera sobre del macizo Ruiz-Tolima el cual alinea de sur a norte
la diversidad microbiana del suelo, se realiz la pre- ocho volcanes principales: Cerro Machn, Nevado del
sente base de datos de microorganismos cultivables Tolima, Pramo de Santa Rosa, Paramillo del Quindo,
de grupos funcionales asociados a los ciclos biogoqu- Nevado Santa Isabel, Paramillo del Cisne, Nevado del
micos del nitrgeno, fsforo y carbono: fijadores de Ruiz y Cerro Bravo (PNN Los Nevados 2010).
nitrgeno, solubilizadores de fosfato y celulolticos,
Al interior del PNN Los Nevados se encuentra la vereda
respectivamente. Lo anterior con el objetivo de contri-
El Bosque, del municipio de Pereira, la cual presenta
buir al conocimiento y as mismo ser una herramienta
pramos y bosques altoandinos asociados a la cuenca
de consulta para la comunidad cientfica, las institu-
alta del ro Otn, con ecosistemas de alta montaa
ciones acadmicas y gubernamentales, y sectores de la
ecuatorial que conservan poblaciones vegetales y
sociedad interesados en la biodiversidad microbiana
animales de gran diversidad (Chiquito y Zuluaga
de los pramos colombianos.
2007). La vereda El Bosque est ubicada en una de las
rutas de acceso al complejo de humedales del Otn,
Datos del proyecto designado como de importancia internacional por la
Ttulo. Caracterizacin de comunidades microbianas Convencin Ramsar desde el 25 de junio de 2008.
asociadas a prcticas agrcolas y usos del suelo de la
vereda El Bosque - Parque Nacional Natural de Los Descripcin del proyecto
Nevados.
El objetivo general del proyecto fue caracterizar las
Nombre. Lizeth Manuela Avellaneda-Torres (Inves- comunidades microbianas de suelos de diferentes
tigadora principal). agroecosistemas de la vereda El Bosque PNN Los
Nevados, con el fin de determinar posibles relaciones
Fuentes de financiacin. Investigacin financiada entre las prcticas asociadas al cultivo de papa y la
por Colciencias (Contrato 246-2011) y llevada a ganadera sobre la diversidad microbiana del suelo.
cabo bajo el contrato de acceso a recursos genticos En el marco de este proyecto se estableci la presente
nmero 15 de 2008 del Ministerio de Ambiente y coleccin de grupos funcionales de microorganismos
Desarrollo Territorial (MAVDT) y el permiso de cultivables del suelo aislados mediante medios
investigacin de la Unidad Administrativa Especial del selectivos asociados a los ciclos biogeoqumicos del
Sistema de Parques Naturales (UAESPNN) nmero nitrgeno, fsforo y carbono, siendo estos fijadores de

Biota Colombiana 16 (1) - 2015 79


Biodiversidad de grupos funcionales de microorganismos asociados a suelos bajo Avellaneda-Torres y Torres-Rojas
cultivo de papa, ganadera y pramo en el Parque Nacional Natural de Los Nevados, Colombia

nitrgeno, solubilizadores de fosfato y celulolticos Leucobacter, Microbacterium, Micromonospora,


respectivamente, en suelos bajo cultivo de papa, Oerskovia, Paenibacillus, Pantoea, Pedobacter,
ganadera y pramo con la menor intervencin Pseudomonas, Rahnella, Rhodococcus, Roseomonas,
antrpica posible. Staphylococcus, Stenotrophomonas y Streptomyces.

El cultivo de papa desarrollado en la zona se realiza en


ciclos bianuales con periodos de barbecho superiores Cobertura taxonmica
a los siete aos. De esta manera se aplica un sistema de Descripcin. Las hongos identificados pertenecen
cultivo de papa en rotacin con pastos, el cual aplica a cuatro Phylum diferentes entre los que se
tecnologas provenientes de la Revolucin Verde encuentran: Ascomycota, Zygomicota, Basidiomicota
(como son aplicacin de fertilizantes y plaguicidas y Glomeromycota. As mismo se encuentran
de sntesis qumica), as como saberes locales de la distribuidos en ocho clases diferentes: Eurotiomycetes,
comunidad campesina de la zona. Sordariomycetes, Zygomycetes, Dothideomycetes,
Tremellomycetes, Leotiomycetes, Glomeromycetes
Cobertura taxonmica y Mucormycotina. Se identificaron 12 rdenes:
Eurotiales, Hypocreales, Saccharomycetes, Xilariales,
Descripcin. Las bacterias identificadas pertenecen a Mortierellales, Pleosporales, Tremellales, Helotiales,
cuatro phylum diferentes entre los que se encuentran: Dothideales, Glomerales, Mucorales y Sordariales.
Bacteroidetes, Actinobacteria, Proteobacteria y De igual forma se identificaron 14 familias:
Firmicutes.As mismo se encuentran distribuidas en seis Hypocraceae, Saccharomycetaceae, Amphisphariaceae,
clases diferentes: Sphingobacteriia, Actinobacteria, Mortierellaceae, Leptosphaeriaceae, Trichosporanaceae,
Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Bacilli Nectriaceae, Cordycipitaceae, Myxotrichaceae,
y Alphaproteobacteria. Se identificaron nueve Dothioraceae, Glomeraceae, Mucoraceae,
ordenes: Sphingobacteriales, Actinomicetales, Sporomiaceae y Sordariaceae. Se identificaron 23
Burkholderiales, Pseudomonadales, Bacillales, gneros y 25 especies, entre los gneros se encuentran:
Enterobacteriales, Rhodospirillales, Xanthomonadales Aspergillus, Aureobasidium, Beauveria, Bionectria,
y Rhizobiales. De igual forma se identificaron 19 Coniothyrium, Diplogelasinospora, Drechslera,
familias: Sphingobacteriaceae, Streptomycetaceae, Fusarium, Geomyces, Hypocrea, Leptosphaeria,
Micrococcaceae, Burkholderiaceae, Pseudomonaceae, Mortierella, Mucor, Neonectria, Paecilomyces,
Bacillaceae, Nocardiaceae, Paenibacillaceae, Penicillium, Preussia, Torula, Trichoderma,
Moraxallaceae, Trichocomaceae, Rhizobiaceae, Trichosporon, Truncatella y Umbelopsis.
Santomonadaceae, Cellulomanadaceae, Micromo-
nosporaceae, Comamonadaceae, Chitinophagaceae,
Acetobacteraceae, Microbacteria y Enterobacteriaceae. Categoras
Se identificaron 25 gneros y 18 especies, entre los Gnero. Aspergillus, Aureobasidium, Beauveria,
gneros se encuentran: Pedobacter, Streptomyces, Bionectria, Coniothyrium, Diplogelasinospora,
Arthrobacter, Burkholderia, Pseudomonas, Drechslera, Fusarium, Geomyces, Hypocrea,
Paenibacillus, Bacillus, Rhodococcus, Brevibacillus, Leptosphaeria, Mortierella, Mucor, Neonectria,
Acinetobacter, Kaistia, Stenotrophomonas, Micromo- Paecilomyces, Penicillium, Preussia, Torula,
nospora, Sthaphylococcaceae, Oerskovia, Enterobacter, Trichoderma, Trichosporon, Truncatella y Umbelopsis.
Chitinophaga, Pantoea, Roseomonas, Leucobacter,
Rahnella, Escherichia, Bionectria, Comamonas
y Microbacterium. Cobertura geogrfica
Descripcin. El PNN Los Nevados se encuentra
Categoras
localizado en la cordillera Central de Colombia,
Gnero. Acinetobacter, Arthrobacter, Bacillus, entre las vertientes oriental y occidental, con alturas
Brevibacillus, Burkholderia, Chitinophaga, entre los 2.600 y 5.321 m s.n.m. (Figura 1).
Comamonas, Enterobacter, Escherichia, Kaistia,

80 Biota Colombiana 16 (1) - 2015


Avellaneda-Torres y Torres-Rojas Biodiversidad de grupos funcionales de microorganismos asociados a suelos bajo
cultivo de papa, ganadera y pramo en el Parque Nacional Natural de Los Nevados, Colombia

Figura 1. Ubicacin del Parque Nacional Natural de Los Nevados. Los puntos al interior del
crculo representan la zona de muestreo.

Comprende un rea aproximada de 58.300 hectreas, Descripcin del muestreo


en jurisdiccin de los departamentos de Caldas
Se tomaron muestras de suelos rizosfricos en las
(Municipio de Villamara), Risaralda (Municipios de
fincas Buenos Aires (3.769 m s.n.m.), El Edn (3.590
Santa Rosa de Cabal y Pereira), Quindo (Municipio de
m s.n.m.) y La Secreta (3.432 m s.n.m.) en la vereda El
Salento) y Tolima (Municipios de Ibagu, Anzotegui,
Bosque, municipio de Pereira, Risaralda. En cada sitio
Santa Isabel, Murillo, Villahermosa, Casabianca y
se evaluaron los usos del suelo: pramo, cultivo de
Herveo) (PNNN 2007).
papa (Solanum tuberosum) y ganadera en pocas seca
Coordenadas. 44355,2N y 4453,6N Latitud; y hmeda. En cada uno de los tipos de uso de suelo
752649,2W y 752631,2W Longitud. se evaluaron tres ventanas de observacin, compuestas
por diez submuestras cada una. Se evaluaron tres
usos del suelo por tres fincas por dos pocas por tres
Cobertura temporal ventanas de observacin, para un total de 54 muestras.
8 de junio de 2011 - 10 de noviembre de 2012. En cada muestra se determin la abundancia y
diversidad de microorganismos fijadores de nitrgeno,
solubilizadores de fosfato y celulolticos.
Datos de la coleccin
Nombre de la coleccin. Grupos funcionales de
Control de calidad
microorganismos asociados al cultivo de papa,
ganadera y pramo en el Parque Nacional Natural de La validacin y depuracin de la informacin
Los Nevados. geogrfica, taxonmica y los datos adicionales
asociados con las muestras de suelo y los morfotipos
Identificador de la coleccin. UNAL: GEBIX: PNNN. aislados fueron incorporados en varios 15 pasos del
proyecto como un componente esencial del proceso
Identificador de la coleccin parental. UNAL: de digitalizacin. La identificacin de los morfotipos
GEBIX: PNNN. se realiz mediante Basic Local Alignment Search
Tool (Altschul et al. 1990, Benson et al. 2000) y
Material y mtodos Geneious PRO 5.1.5. y la confirmacin de los nombre
cientficos de los especmenes se realiz utilizando las
rea de estudio bases de datos: NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/),
Parque Nacional Natural de Los Nevados Vereda El Ribosomal Database Project (http://rdp.cme.msu.edu/)
Bosque. Colombia. y Catalogue of Life (http://www.catalogueoflife.org/).

Biota Colombiana 16 (1) - 2015 81


Biodiversidad de grupos funcionales de microorganismos asociados a suelos bajo Avellaneda-Torres y Torres-Rojas
cultivo de papa, ganadera y pramo en el Parque Nacional Natural de Los Nevados, Colombia

Los departamentos Colombianos fueron codificados se incubaron a 25 C durante 48 h y los hongos


teniendo en cuenta la divisin poltico administrativa a temperatura ambiente de cinco a siete das. Se
de Colombia suministrada por el Departamento realiz conteo de clulas viables en las placas que
Administrativo Nacional de Estadstica - DANE contenan entre 30 y 300 UFC. Se realiz aislamiento
(http://190.25.231.237/dvpbuscar/dvpbuscar.html). y purificacin de los morfotipos encontrados.

Los diferentes morfotipos de bacterias y hongos


Descripcin de la metodologa paso a paso aislados se caracterizaron macroscpicamente,
Se realiz el recuento de las unidades formadoras microscpicamente y usando marcadores moleculares.
de colonia por gramo de suelo (UFC/g ss) de los Para bacterias se determin la secuencia del 16S del
microorganismos asociados a los grupos funcionales. ADNr de acuerdo a los procedimientos de Lane
(1991). Para los hongos se extrajo ADN con base en lo
Para los microorganismos fijadores de nitrgeno reportado por Melo et al. (2006), GEBIX (2009, 2010)
se realiz conteo y aislamiento utilizando el medio y Paza et al. (2004) y se usaron iniciadores ITS1 y
selectivo carente de nitrgeno segn Rennie (1981) ITS4 de acuerdo con el procedimiento descrito por
con modificaciones: 5 g manitol; 5 g cido mlico; Vargas et al. (2007) y GEBIX (2010). Las secuencias
0,5 mL lactato de sodio (60 %, v/v); 0,8 g K2HPO4; se analizaron mediante Basic Local Alignment Search
0,2 g KH2PO4; 0,2 g MgSO4.7H2O; 0,06 g CaCl2; Tool (Altschul et al. 1990, Benson et al. 2000) y
0,1 g NaCl; 0,001 g extracto de levadura; 0,0025 utilizando Geneious PRO 5.1.5.
g Na2MoO4. 2H2O; 0,0024 g Na2EDTA; 0,0018 g
FeSO4; 5 g biotina; 10 g cido p-aminobenzoico;
18,0 g, agar; 2,0 ml azul de bromotimol (0,5 % en Resultados
etanol 95 %), 1 L de agua destilada, pH 7.
Descripcin del conjunto de datos
Para el conteo y aislamiento de microorganismos
solubilizadores de fosfatos se utiliz el medio segn URL del recurso. Para acceder a la ltima versin del
Sundara y Sinha (1963) modificado: 0,5 g (NH4)2SO4; conjunto de datos:
0,2 g KCl; 0,3 g MgSO4.7H2O; 0,004 g MnSO4; 0,002 IPT.http://ipt.sibcolombia.net/sib/resource.do?
g FeSO4.7H2O; 0,2 g NaCl; 10 g glucosa; 0,5 g extracto r=unal_gebix
de levadura, 0,1 g purpura de bromocresol; 5 g Ca3
Portal de datos. http://data.sibcolombia.net/
(PO4)2; 15 g agar; 1 L de agua destilada, pH 7,2.
conjuntos/resource/95
El conteo y aislamiento de los microorganismos Portal GBIF. http://www.gbif.org/dataset/
celulolticos se realiz utilizando el medio con b5e9e6f3-3214-4aae-9af7-92d08d8f8a9d
carboximetilcelulosa al 1 % como nica fuente de
carbono as: 0,5 g KH2PO4; 0,2 g MgSO4.7H2O; 0,1 g DOI. 10.15468/oabpy4
NH4NO3; 0,02 g FeSO4.7H2O; 0.05 g Ca (NO3)2.4H2O;
15 g agar, 10 g carboximetilcelulosa, 1 L de agua Nombre. Archivo Darwin Core Biodiversidad de
destilada. Se utiliz pH 7,0 para bacterias y pH 5 para grupos funcionales de microorganismos asociados a
hongos con adicin de 34 g/L de cloranfenicol. Todos suelos bajo cultivo de papa, ganadera y pramo en el
los conteos fueron realizados por triplicado. Parque Nacional Natural de Los Nevados, Colombia.
Idioma. Espaol.
Para esto se tomaron 10 g de las respectivas muestras
de suelo y se suspendieron en 90 ml de solucin salina Codificacin de caracteres. UTF-8.
al 0,85 %, se agitaron en vrtex por 10 minutos. A
URL del archivo. Para acceder a la versin del
partir de 100 l de la suspensin anterior se realizaron
conjunto de datos descrita en este artculo: http://ipt.
diluciones seriadas de 10-1 hasta 10-8. Las bacterias
sibcolombia.net/biota/resource.do?r=unal_gebix2013
y hongos se cultivaron de manera independiente en
condiciones de aerobiosis. En el caso de las bacterias Formato del archivo. Darwin Core Archive.

82 Biota Colombiana 16 (1) - 2015


Avellaneda-Torres y Torres-Rojas Biodiversidad de grupos funcionales de microorganismos asociados a suelos bajo
cultivo de papa, ganadera y pramo en el Parque Nacional Natural de Los Nevados, Colombia

Versin del formato del archivo. 1.0. microorganismos del suelo en ciclos biogeoqumicos
del nitrgeno, fsforo y carbono: fijadores de nitrgeno
Nivel de jerarqua. Conjunto de datos.
(Figura 2), solubilizadores de fosfato (Figura 3) y
Fecha de publicacin de los datos. 2014-11-25. celulolticos (Figura 4) en el PNN Los Nevados.
Idioma de los metadatos. Espaol. Esta coleccin de microorganismos contribuye a la
caracterizacin de la biodiversidad de bacterias y
Fecha de creacin de los metadatos. 2013-05-21.
hongos de los pramos colombianos, especficamente
Licencia de uso. Este trabajo est bajo una en el PNN Los Nevados, donde el ecosistema ms
licencia Creative Commons Zero (CC0) 1.0 http:// representativo es el pramo. Situacin relevante s se
creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/legalcode tiene en cuenta que estos ecosistemas de alta montaa se
pueden considerar extremos debido a las caractersticas
Discusin ambientales que presentan (p. e. alta radiacin solar,
baja presin atmosfrica, cambios diarios extremos de
Existen pocos reportes acerca de los microorganismos temperatura, presencia de zonas volcnicas, etc.), por
del suelo en los ecosistemas de pramo, y en lo cual es de esperar la presencia de microorganismos
Colombia est informacin es an ms restringida. extremfilos, los cuales podran ser evaluados a futuro y
Al respecto, se encuentran los reportes de Moratto et ser de utilidad a la hora de explorar sus potencialidades
al. (2005) quienes evaluaron la abundancia de hongos ante las diversas problemticas ambientales que
solubilizadores de fosfato y bacterias diazotrficas en se presentan en la actualidad, as como su posible
el pramo de Guerrero. Los citados autores realizaron aplicacin biotecnolgica.
identificacin de los microorganismos mediante claves
taxonmicas (para los hongos) y pruebas bioqumicas Finalmente, los presentes registros biolgicos son
(para las bacterias diazotrficas). Por otro lado Bernal un insumo y hacen parte del proyecto general que
et al. (2006) reportan microorganismos celulolticos busca avanzar en el conocimiento acerca de los
cultivables y endomicorrizas en hojarasca de bosque impactos que genera el cultivo de papa y la ganadera,
del pramo de Guerrero, los cuales fueron identificados sobre la biodiversidad y grupos funcionales de
mediante claves taxonmicas y pruebas bioqumicas. microorganismos como los fijadores de nitrgeno,
solubilizadores de fosfato y celulolticos. Esto permite
A pesar de la importancia de estos reportes, las
ampliar el entendimiento de la dinmica agroecolgica
publicaciones citadas no se encuentran asociadas a
de los microorganismos del suelo en los ecosistemas
registros biolgicos con los respectivos metadatos
de alta montaa.
complementarios, y a la fecha no se encontraron
publicaciones reconocidas de registros biolgicos
de microorganismos cultivables aislados de suelos Agradecimientos
de pramos colombianos. Tampoco se reporta esta
La presente investigacin fue financiada por
informacin para el PNN Los Nevados. Por todo lo
Colciencias (Contrato 246-2011) y fue llevada a
anterior la publicacin de estos registros microbianos
cabo bajo el Contrato No 15 de 2008 del MAVDT
reviste especial importancia, dada la poca informacin
para acceso a recursos genticos y el permiso de
que se tiene al respecto y la importancia de los pramos
investigacin de la UAESPNN (DTNO-N-20/2007).
como ecosistemas estratgicos, considerados hotspots
Se agradece tambin al Centro Colombiano en
(Myers et al. 2000, Madrin et al. 2013), debido a
Genmica y Bioinformtica en Ambientes Extremos
que cumplen con la doble condicin de presentar por
(GEBIX) y a la Universidad Nacional de Colombia
una parte alta biodiversidad y por otra, que esta se
por la financiacin de esta investigacin. Se agradece
encuentra altamente amenazada.
especialmente a los campesinos de la vereda El Bosque
En las figuras 2, 3 y 4 se presenta la distribucin de por permitir el desarrollo de la presente investigacin.
los niveles taxonmicos aislados en cada uno de los A Rosita Meja por sus aportes para la culminacin del
medios selectivos para los grupos funcionales de presente proyecto.

Biota Colombiana 16 (1) - 2015 83


Biodiversidad de grupos funcionales de microorganismos asociados a suelos bajo Avellaneda-Torres y Torres-Rojas
cultivo de papa, ganadera y pramo en el Parque Nacional Natural de Los Nevados, Colombia

A Cobertura taxonmica (Clase)


A
Sphingobacteriia
Actinobacteria
Betaproteobacteria
Gammaproteobacteria
Bacilli
Alphaproteobacteria

B Cobertura taxonmica (Orden)


B
Sphingobacteriales
Actinomycetales
Burkholderiales
Pseudomonadales
Bacillales
Enterobacteriales
Rhodospirillales
Xantomonadales

C C Cobertura taxonmica (Familia) Micrococcaceae


Burkholderiaceae
Pseudomonaceae
Bacillaceae
Nocardiaceae
Xantomonadaceae
Cellulomanadaceae
Micromonosporaceae
Comamonadaceae
Chitinophagaceae
Acetobacteraceae
Enterobacteriaceae

Figuar 2. Cobertura taxonmica de fijadores de nitrgeno. A) Clase. B) Orden. C) Familia.

Figura 2. Cobertura taxonmica fijadores de nitrge


84 Biota Colombiana 16 (1) - 2015
Avellaneda-Torres y Torres-Rojas Biodiversidad de grupos funcionales de microorganismos asociados a suelos bajo
cultivo de papa, ganadera y pramo en el Parque Nacional Natural de Los Nevados, Colombia

A Cobertura taxonmica (Clase)


A
Sphingobacteriia
Actinobacteria
Betaproteobacteria
Gammaproteobacteria
Bacilli
Sordariomycetes
Zygomycetes
Dothideomycetes
Mucormycotina

B B Cobertura taxonmica (Orden)


Sphingobacteriales
Actinomycetales
Burkholderiales
Pseudomonadales
Bacillales
Eurotiales
Hypocreales
Saccharomycetes
Xilariales
Mortierellales
Pleosporales
Mucorales

C C Cobertura taxonmica (Familia) Sphingobacteriaceae


Burkholderiaceae
Pseudomonaceae
Bacillaceae
Nocardiaceae
Trichocomaceae
Microbacteria
Enterobacteriaceae
Hypocreaceae
Saccharomycetales
Mortierellaceae
Sporomiaceae
Sordariaceae

Figura 3. Cobertura taxonmica de solubilizadores de fosfato. A) Clase. B) Orden. C) Familia.

Biota Colombiana 16 (1) - 2015 85


Figura 3. Cobertura taxonmica solubilizadores de fosfato. A Clase B Orden C Familia
A
Biodiversidad de grupos funcionales de microorganismos asociados a suelos bajo Avellaneda-Torres y Torres-Rojas
cultivo de papa, ganadera y pramo en el Parque Nacional Natural de Los Nevados, Colombia

A Cobertura taxonmica (Clase) Sphingobacteriia


Actinobacteria
Betaproteobacteria
Gammaproteobacteria
Bacilli
Alphaproteobacteria
Eurotiomycetes
Sordariomycetes
Zygomycetes
Dothideomycetes
Tremellomycetes
Leotiomycetes
Glomeromycetes
Mucormycotina

B Cobertura taxonmica (Orden) Sphingobacteriales


Actinomycetales
Burkholderiales
Pseudomonadales
Bacillales
Xantomonadales
Rhizobiales
Eurotiales
Hypocreales
Saccharomycetes
Xilariales
Mortierellales
Pleosporales
Tremellales
Helotiales
Dothideales
Glomerales
Mucorales
Sordariales

C Cobertura taxonmica (Familia)


Sphingobacteriaceae
Streptomycetaceae
Micrococcaceae
Burkholderiaceae
Pseudomonaceae
Bacillaceae Nocardiaceae
Paenibacillaceae
Moraxellaceae
Trichocomaceae
Rhizobiaceae
Xantomonadaceae
Cellulomanadaceae
Hypocreaceae
Saccharomycetales
Amphisphaeriaceae
Mortierellaceae
Leptosphaeriaceae
Trichosporonaceae
Nectriaceae
Cordycipitaceae
Myxotrichaceae
Dothioraceae
Glomeraceae
Mucoraceae
Sporomiaceae
Sordariaceae
Figura 4. Cobertura taxonomica de celulticos. A) Clase. B) Orden. C) Familia.

86 Biota Colombiana 16 (1) - 2015


Avellaneda-Torres y Torres-Rojas Biodiversidad de grupos funcionales de microorganismos asociados a suelos bajo
cultivo de papa, ganadera y pramo en el Parque Nacional Natural de Los Nevados, Colombia

Bibliografa
Altschul, S., W. Gish, W. Miller y L. Myersew. 1990. Basic molecular identification of the basidiomycete Crinipellis
local alignment search tool. Journal Molecular Biology perniciosa. Genetics and Molecular Research 5 (4):
215 (3): 403-410. 851-855.
Benson, D., L. Karsch-Mizrachi, D. Lipman, J. Ostell, Moratto, C., L. Martnez, H. Valencia y J. Snche. 2005.
M. Rap y D. Wheeler. 2000. GenBank. Nucleic Acids Efecto del uso del suelo sobre hongos solubilizadores
Research 28:15-18. de fosfato y bacterias diazotrficas en el pramo de
Bernal, E., S. Celis, X. Galndez, C. Moratto, D. Guerrero (Cundinamarca). Agronoma Colombiana 23
Snchez y D. Garca, D. 2006. Microflora cultivable (2): 299 309.
y endomicorrizas obtenidas en hojarasca de bosque Myers, N., R. A. Mittermeier, C. G. Mittermeier, G. A.
(Pramo Guerrero - finca Puente de Tierra) Zipaquir, Da Fonseca y J. Kent. 2000. Biodiversity hotspots for
Colombia. Acta Biologica Colombiana 11 (2): 125-130. conservation priorities. Nature 403: 853-858.
Chiquito, S. y S. Zuluaga. 2007. Plan de accin ambiental
Paza, G. A., R. Upchurch, R. L. Brigmon, W. B. Whitman,
vereda El Bosque cuenca alta del ro Otn. Universidad
y K. Ulfig. 2004. Rapid DNA Extraction for Screening
Tecnolgica de Pereira, Pereira. Colombia. 129 pp.
Soil Filamentous Fungi Using PCR Amplification. Polish
Fandio, M. y V. Wyngaarden. 2002. Parque Nacional Journal of Environmental Studies 13 (3): 315-318.
Natural Los Nevados. Un Caso de seleccin y
zonificacin de reas de conservacin biolgica. PNN Los Nevados. 2007. Plan de Manejo Parque Nacional
IDEADE-DET, Bogot. Colombia. Natural de Los Nevados 2007-2011. Parques Nacionales
Naturales de Colombia, Manizales, Colombia. 37 pp.
GEBIX. 2009. Second Progress Report - Colciencias.
Colombian Center for Genomics and Bioinformatics of PNN Los Nevados. 2010. Restauracin ecolgica en
Extreme Environments. Bogot, Colombia. 75 pp. pramos del Parque Nacional Natural de Los Nevados.
GEBIX. 2010. Third progress report and final report Phase Editorial Andina, Manizales, Colombia. 148 pp.
I. Centro Colombiano en Genmica y Bioinformtica en Rennie, R., J. 1981. A single medium for the isolation of
Ambientes Extremos. Bogot, Colombia. 50 pp. of acetilene-reducting (Dinitrogen-fixing) bacteria from
Lane, D. J. 1991. 16S/23S rRNA sequencing. Pp. 115-175. soils. Canadian Journal of Microbiology 27: 8-14.
En: E. Stackebrandt and M. Goodfellow (Eds). Nucleic Sundara, R. y M. Sinha. 1963. Organisms phosphate
acid techniques in bacterial systematics. John Wiley and solubilizers in soil. Soil Science and Plant Nutrition 9
Sons, New York. (2): 45-49.
Madrin, S., A. J. Cort y J. E. Richardson. 2013. Pramo Vargas, A. M., A. Correa, D. C. Lozano, A. Gonzlez, A. J.
is the worlds fastest evolving and coolest biodiversity Bernal, S. Restrepo y P. Jimnez. 2007. First Report of
hotspot. Frontiers in genetics 4: 192. Late Blight Caused by Phytophthora infestans on Cape
Melo, S., C. Pungartnik, J. Cascardo y M. Brendel. 2006. Gooseberry (Physalis peruviana) in Colombia. APS
Rapid and efficient protocol for DNA extraction and Journals, Plant Disease 91 (4): 464.

Lizeth Manuela Avellaneda-Torres Biodiversidad de grupos funcionales de microorganismos


Universidad Nacional de Colombia asociados a suelos bajo cultivo de papa, ganadera y
Centro Colombiano en Genmica y Bioinformtica pramo en el Parque Nacional Natural de Los Nevados,
en Ambientes Extremos (GEBIX). Colombia.
Bogot D.C., Colombia
lmavellanedat@unal.edu.co Citacin del artculo. Avellaneda-Torres, L. M. y E.
Torres-Rojas. 2015. Biodiversidad de grupos funcionales
Esperanza Torres-Rojas de microorganismos asociados a suelos bajo cultivo de
Universidad Nacional de Colombia papa, ganadera y pramo en el Parque Nacional Natural de
Centro Colombiano en Genmica y Bioinformtica Los Nevados, Colombia. Biota Colombiana 16 (1): 78-87 .
en Ambientes Extremos (GEBIX). doi:10.15468/oabpy4
Bogot D.C., Colombia ID del recurso. GBIF key: http://www.gbif.org/dataset/
etorresr@unal.edu.co b5e9e6f3-3214-4aae-9af7-92d08d8f8a9d

Recibido: 24 de julio de 2014


Aprobado: 9 de diciembre de 2014

Biota Colombiana 16 (1) - 2015 87


Copyright of Biota Colombiana is the property of Instituto Alexander von Humboldt and its
content may not be copied or emailed to multiple sites or posted to a listserv without the
copyright holder's express written permission. However, users may print, download, or email
articles for individual use.