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Abstract
Meat foods are the main vehicle of foodborne diseases as a result of poor handling during processing. The objective of this
study was to determine the frequency and antibiotic resistance factors of Escherichia coli in TIF plants of the Estado de
Mexico. For this, 3 Federal Inspection Type (TIF) plants in Mexico were analyzed, with n = 90 samples, 10 raw meat product
(beef, pork and turkey meat), 10 finished meat product and 70 work tools. Eighteen (20%) E. coli strains were isolated (3 raw
meat product, 2 finished meat products and 13 work tools (P > 0.05). The E. coli isolates showed high levels of resistance
to ampicillin (88.8%), cephalothin (88.8%), carbenicillin (83.3%) and chloramphenicol (61.1%). There was a relationship bet-
ween E. coli strains resistant to ampicillin and chloramphenicol and presence of resistance genes Pse-1 4/18 (22%) and floR
4/18 (22%). Five (55.5%) positive isolates to Pse-1 and floR, also exhibit the Cs3 Cs5 genes for the class I integrons. The
results indicate that antimicrobial resistance and genetic resistance factors are present in Escherichia coli isolated from food
processing plants, suggesting that they can be transmitted to the intestine microbiota of human population by contamination
and consumption of improperly processed products and become a risk factor for public health.
Resumen
Los alimentos crnicos constituyen uno de los principales vehculos de enfermedades transmitidas por alimentos, como
consecuencia de un manejo deficiente durante su procesamiento. El objetivo del presente trabajo fue determinar la fre-
cuencia de algunos factores de resistencia antibitica de Escherichia coli en plantas Tipo Inspeccin Federal (TIF) del
Estado de Mxico. Para este fin se analizaron muestras de tres plantas TIF en el Estado de Mxico (n = 90), 10 de
materia prima (carne de bovino, cerdo y pavo), 10 de producto terminado y 70 de utensilios de trabajo. Se aislaron
18 (20%) cepas de E. coli, 3 de materia prima, 2 de producto terminado y 13 de utensilios de trabajo (P > 0.05). Las
E. coli aisladas presentaron una frecuencia alta de resistencia a ampicilina (88.8%), cefalotina (88.8%), carbencilina
(83.3%) y cloranfenicol (61.1%). Se encontr una relacin entre las cepas de E. coli resistentes a ampicilina y cloran-
fenicol y la presencia de genes de resistencia Pse-1 4/18 (22%) y floR 4/18 (22%). Cinco (55.5%) aislamientos positivos
a Pse-1 y floR tambin presentaron el gen Cs3 Cs5 del integrn clase I. Los resultados indican que la resistencia anti-
microbiana y los factores de resistencia genticos estn presentes en Escherichia coli aislada de plantas procesadoras
de alimentos, lo que sugiere que estos elementos pueden transmitirse a la microbiota intestinal de la poblacin humana
a travs de la contaminacion y consumo de productos mal procesados, y ser un factor de riesgo para la salud pblica.
R L
esistance to antibiotics is a natural biological a resistencia antibitica es un fenmeno
phenomenon due to mutations and the high biolgico natural debido a las mutaciones y a la
capacity of bacteria to horizontally transfer gran capacidad de las bacterias para transferir
their genetic material with a clear correlation between horizontalmente su material gentico, por lo que
antibiotic use and bacterial resistance. 1 Enterobacteria existe una clara correlacin entre el uso de antibiticos
throughout the world have shown high resistance y la resistencia bacteriana.1 En todo el mundo las
to ampicillin, trimethoprim, sulfamethoxazole, enterobacterias presentan alta resistencia a la
tetracycline, chloramphenicol and nalidixic acid. 2 ampicilina, trimetoprim-sulfametoxazol, tetraciclina,
An important structure in the resistance mechanism cloranfenicol y cido nalidxico.2 Una estructura
are integrons, which are capable of obtaining genes importante en el mecanismo de resistencia son los
that code for factors that determine resistance integrones, los cuales son capaces de captar genes
to antibiotics.3 Integrons are composed by three que codifican factores determinantes de resistencia
elements that are needed for insertion and expression antibitica.3 Los integrones estn compuestos por tres
of exogenous genes: a fragment that codes for an elementos necesarios para la insercin y expresin
integrase (intI), an attI sequence to which genes de genes exgenos: un fragmento que codifica una
join in cassette mode coding for various resistance integrasa (intI), una secuencia attI a la que se unen los
mechanisms and within intI, at the 3 end, there is genes en casetes que codifican diferentes mecanismos
a promoter sequence (Pc) from which integrated de resistencia y dentro de la intI, en el extremo 3,
resistance cassettes are transcribed.4 There are two una secuencia promotora (Pc) a partir de la cual se
groups of integrons: Group I, also known as mobile transcriben los casetes de resistencia integrados.4
integrons, can be found within plasmids and are Existen dos grupos de integrones: el Grupo I, tambin
related to sequences that code for resistance to llamados integrones mviles, se encuentran en
antibiotics, and Group II or superintegrons which plsmidos y estn relacionados con secuencias que
are present at the chromosome level and, in contrast to codifican la resistencia antibitica, y el Grupo II o
the former, are not related with resistance to antibiotics superintegrones, presentes a nivel cromosmico, y a
except in point exceptions.2,5 Due to the relationship diferencia de los primeros, no estn relacionados con
between integrons and resistance to various antibiotic la resistencia antibitica, salvo algunas excepciones.2,5
families, during the last years different prevalences Debido a la relacin entre los integrones y la resistencia
have been recorded in enterobacteria.6 Given the a diferentes familias de antibiticos, durante los
recent increase in antibiotic resistant of E. coli and ltimos aos se han registrado diversas prevalencias
its impact in public health worldwide, it is important en enterobacterias.6 Dada la creciente resistencia
to carry out a study on microbial resistance and the antibitica de E. coli y su actual impacto en salud
presence of class I integrons in E. coli isolated from pblica en todo el mundo, es importante realizar un
raw materials and meat products in TIF plants in the estudio sobre la resistencia microbiana y la presencia
Estado de Mexico, in order to determine the behavior del integrn clase I en E. coli, a partir de materia prima
of genetic resistance in these strains. y productos crnicos en plantas TIF en el Estado de
Mxico, para conocer el comportamiento gentico de
Materials and Methods la resistencia en estas cepas.
24
work utensils); n = 90. Samples from raw materials porcino y pavo, de la misma manera se obtuvieron 4
and finished product were collected as established in del TIF A y 3 del TIF B y C (10 muestras de produc-
the Mexican Official Standard NOM-109-SSA-1994 8; to terminado) y 28 del TIF A y 21 del TIF B y C (70
samples from work utensils were taken when products muestras de utensilios de trabajo) n = 90. Las muestras
were being processed using the methods described by de materia prima y producto terminado se tomaron
the European Union.1 Samples were transported in re- conforme a lo establecido en la Norma Oficial Mexica-
frigeration to the Centro de Investigacion y Estudios na NOM-109-SSA-1994,8 la muestra de los utensilios de
Avanzados en Salud Animal (CIESA) of the Facultad trabajo se tom durante el proceso de los productos y
de Medicina Veterinaria y Zootecnia of the Univer- se utiliz el mtodo descrito por la Unin Europea.1
sidad Autonoma del Estado de Mexico. Samples from Las muestras fueron transportadas en refrigeracin al
raw materials and finished product were previously in- Centro de Investigacin y Estudios Avanzados en Salud
cubated for 6 2 h at 37C and samples from work Animal (CIESA) de la Facultad de Medicina Veterina-
utensils for 24 2 h at 37C in 10% peptone broth, ria y Zootecnia de la Universidad Autnoma del Estado
later in MacConkeys Agar and MacConkey Sorbitol de Mxico. Las muestras de materia prima y producto
Agar.*9 Suspected colonies were identified using rou- terminado se incubaron previamente 6 2 h a 37C y
tine biochemical tests.10 Resistance to antimicrobial las muestras de utensilios de trabajo, 24 2 h a 37C
agents was determined using Kirby-Bauers technique en caldo peptonado al 10 % y posteriormente en Agar
following recommendations of the Clinical Laboratory MacConkey y Agar MacConkey Sorbitol.*9 Las colonias
Standards Institute (CLSI).11 Resistance to the follow- sospechosas se identificaron con pruebas bioqumicas
ing antibiotics was evaluated: amikacin (30 g), ampi- de rutina.10 La resistencia a los agentes antimicrobia-
cillin (10 g), carbenicillin (100 mg) cephalothin (30 nos se determin mediante la tcnica de Kirby-Bauer
g), cephotaxim (30 g), cephtriaxone (30 g), chlor- de acuerdo con el Clinical Laboratory Standars Inti-
amphenicol (30 g), gentamycin (10 g), nethylmy- tute (CLSI).11 Se evalu la resistencia a los siguientes
cin (30 g), nitrofurantoin (200 g), pefloxacin (5 antibiticos: amikacina (30 g), ampicilina (10 g),
g) and sulphamethoxazole-trimethoprim (25 g).** cefalotina (30 g), carbenicilina (100 mg) cefotaxima
Readings were compared to standard interpretation (30 g), ceftriazona (30 g), cloranfenicol (30 g),
tables following CLSI. 11,12 Real-time PCR testing was gentamicina (10 g), netilmicina (30 g), nitrofuran-
carried out by extracting DNA using the Insta GeneTM tona (300 g), pefloxacina (5 g) y trimetropim-sulfa-
Matrix commercial kit.*** Specific primer sequences metoxasol (25 g).** Las lecturas se compararon con
(Pse-1 and floR) and size of amplified fragments have las tablas de interpretacin de acuerdo con el CLSI.11,12
been described by Chiu et al., 12 and Cordova13 (Table Para la prueba de PCR en tiempo real se realiz la ex-
1). Total PCR volume was 25 l consisting of: 2 l DNA, traccin de ADN utilizando un paquete comercial Ins-
0.6 ml each oligonucleotide, 12.5 l Master Mix Kit, ta Gene TM Matrix,*** la base de secuencias y el tamao
1 l SYBRGreen 1X and 8.3 l H2O. Samples were previsto de la amplificacin para los oligonucletidos
run under the following conditions: initial denaturing especficos (Pse-1 y floR) utilizados fueron sealados
at 95C for 5 minutes followed by 35 cycles of denatur- por Chiu et al.,12 y Crdova13 (Cuadro 1). Se realiz un
ing at 95C for 5 minutes, aligning at 58C for 1 minute PCR en tiempo real utilizando un volumen total de 25
and extension at 72C for 1 minute and final extension l que consisti en: 2 l de ADN, 0.6 ml de cada oligo-
at 72C for 5 min. PCR reaction for identification of nucletido, 12.5 l de Master Mix Kit, 1 l SYBRGreen
the class I integron was done in 25 l total volume us- 1 X y 8.3 l de H2O. Las reacciones se sometieron a
ing: 2 l DNA, 0.6ml each oligonucleotide (Cs3Cs5), las siguientes condiciones: desnaturalizacin inicial de
12.5 l Master Mix Kit 1 l SYBRGreen 1X and 8.3 95C por 5 minutos, seguido de 35 ciclos de 95C por
l H2O. Samples were run under the following condi- 5 minutos de desnaturalizacin, 58C por 1 minuto de
tions: initial denaturing at 94C for 3 minutes followed alineacin y 72C durante 1 minuto de sntesis de ADN
by 35 cycles of denaturing at 94C for 40 seconds, align- y extensin final a 72C por 5 min. La reaccin de la
ing at 58C for 40 seconds and extension at 75C for 40 PCR para la identificacin del integrn clase I se rea-
seconds, and a final extension at 75C for 7 minutes. 13 liz con 25 l como volumen total, utilizando: 2 l de
Results were analyzed using a chi square test at a 95% ADN, 0.6 ml del oligonucletido (Cs3Cs5) 12.5 l de
confidence level. 14 Master Mix, 1 l SYBRGreen 1 X y 8.3 l de H2O.
La reaccin se someti a las siguientes temperaturas:
Results *SMAC Becton Dickinson. Heidelberg, Alemania.
**Sensidiscos, Gram Negativos BIO-RAD. Hercules, California,
Estados Unidos de Amrica
A total of 18 (20%) E. coli isolates were obtained from ***Instagene TM Matrix (Bio-Rad). Hercules, California, Estados
the total samples analyzed (n = 90). From the 10 raw Unidos de Amrica.
Applied Biosystems, Estados Unidos de Amrica
Cuadro 1
Secuencia de oligonucletidos utilizados para determinar los genes Pse-1, floR y Cs3Cs5
Sequence of oligonucleotides used for determining the presence of the Pse-1, floR and Cs3Cs5 genes
Fragment size
Gene Primer Oligonucleotide sequence (5-3) Reference
(bp)
GGCAATCACACTCGATGATGCGT
Pse Pse-1 156 Chiu et al.12
GGCTCAATACGGTCTAGACGAGT
CTTTGGCTATACTGGCGATG
Flor floR 266 Chiu et al.12
GATCATTACAAGCGCGACAG
26
Sanitary Operation Procedures (SSOP) implemented carne cruda picada en Estados Unidos de Amrica se en-
in TIF plants significantly reduces the presence of contr 0.5% de E. coli O157:H7, en plantas con inspec-
E. coli. Notwithstanding this, the presence of said agent cin federal.15 En este trabajo se realiz el aislamiento
is a risk to product safety due to the resistance to an- en medio MacConkey Sorbitol para tratar de identificar
tibiotics which it has. Due to this, resistance to anti- Escherichia coli O157:H7; sin embargo, no se encontr
biotics of E. coli is an emerging issue worldwide since ninguna cepa de este serotipo. Byrne et al.16 registraron
high percentages of resistance to ampicillin, trime- una prevalencia de 4.9% en plantas empacadoras en Es-
thoprim-sulphamethoxazole, tetracycline, chloram- tados Unidos de Amrica, aunque tambin se han men-
phenicol and nalidixic acid have been reported. 2 Our cionado prevalencias que van de 0.1 a 54%, por lo que
study found resistance to four antibiotics (ampicillin, se puede considerar que hay diferentes factores dentro
carbenicillin, cephalothin and chloramphenicol) in de los procesos de obtencin de crnicos que intervie-
agreement with the report by Reyes, 10 who recorded nen en el aislamiento de E. coli. En estudios realizados
resistance rates of 25% to ampicillin, 75% to cepha- en rastros municipales del Estado de Mxico se regis-
lothin, and 62.5% to carbenicillin by E. coli O157:H7 tr una prevalencia de 2.6% para E. coli O157:H7;10,17
Cuadro 2
Caractersticas de los aislamientos de E. coli obtenidos en las plantas TIF en el Estado de Mxico
Characteristics of the E. coli isolates obtained in TIF plants in the Estado de Mexico
2 A Raw material - + + + + + +
4 A Hand + + + + + + +
5 A Table - + - + + + +
6 B Grinder + - + + + + +
8 C Sterilizer + - + + + + +
9 C Table + - + + + + +
11 A Sterilizer - - - + + + +
13 A Raw material - - - + - + -
14 B Finished product - - - - - - -
15 B Table - - - - - - -
16 C Raw material - - - + + + -
20 C Finished product - - - + + + -
Total 5 5 5 16 13 15 11
isolated from samples taken from bovine carcasses in sin embargo, y como se mencion anteriormente, este
municipal establishments. Ratnam et al., 17 indicate that serotipo no se encontr en el presente estudio, lo que
of 174 E. coli O157:H7 isolates obtained from bovine puede indicar que las buenas prcticas de manufactura
carcasses, 0.6% were resistant to ampicillin, carbeni- y los Procedimientos Operativos Estndares de Sanitiza-
cillin and tetracycline. Ji-Yeon et al.18 state that of the cin (POES) implementados en las plantas TIF redu-
isolates found from swine and cattle in Korea and the cen significativamente la presencia de E. coli; a pesar de
United States of America, 100% were resistant to eryth- ello, la presencia de este agente supone un riesgo a la
romycin, 27.2% to ampicillin, 18.2% to cephalothin inocuidad del producto, dada la resistencia antibitica
as well as tetracycline. Several authors have recorded que presenta. Por esta razn, la resistencia antibitica
the resistance to chloramphenicol of up to 91% of E. de E. coli representa un problema emergente en todo el
coli isolated in European, Asian and North American mundo, ya que se han registrado altos porcentajes de re-
28
countries.19-23 Resistance to the aforementioned anti- sistencia hacia ampicilina, trimetoprim-sulfametoxazol,
biotics is similar to other studies carried out in the Es- tetraciclina, cloranfenicol y cido nalidxico.2 En este es-
tado de Mexico, as well as Asian, European and North tudio se encontr resistencia a cuatro antibiticos (am-
American countries, suggesting dynamic horizontal picilina, carbencilina, cefalotina y cloranfenicol), lo que
transmission of genetic material in animal populations coincide con lo referido por Reyes,10 quien registra una
from the production stage up to the manufacturing of resistencia a ampicilina 25%, cefalotina 75% y carbenci-
animal origin products and byproducts. E. coli isolates lina 62.5%, en aislamientos de E. coli O157:H7 a partir
that had resistance to ampicillin and chloramphenicol de muestras tomadas de canales de bovinos en estableci-
also had the Pse-1 and floR genes, which agrees with mientos municipales. Ratnam et al.17 indican que de 174
the report by Varela, 24 who found a 73.68% relation- aislamientos estudiados de E. coli O157:H7 a partir de
ship between resistance to ampicillin and the presence canales de bovinos, 0.6% fue resistente a la ampicilina,
of the Pse-1 in Salmonella spp. In terms of resistance to carbencilina y la tetraciclina. Ji-Yeon et al.18 mencionan
chloramphenicol, studies carried out in Peru by Mos- que de los aislamientos encontrados en un estudio en
quito et al., 2 suggest that it can be mediated or related cerdos y bovinos en Corea y Estados Unidos de Am-
to genes such as cmlA and floR. 2 Furthermore, a study rica, el 100% fue resistente a eritromicina, seguido de
carried out in Mozambique with Shigella and Salmonella ampicilina (27.2%), cefalotina (18.2%) y tetraciclina
found that the mechanisms of resistance to chloram- (18.2%). Diversos autores han registrado resistencia a
phenicol were related to the presence of CAT (89 and cloranfenicol hasta de 91% en cepas de E. coli aisladas
67 %), cmlA (2 and 33 %) and floR (0 and 83 %), re- en pases europeos, asiticos y de Amrica del Norte.19-23
spectively.25 In this study, a correspondence between La resistencia a los antimicrobianos mencionados son
isolates that had the Pse-1 and floR resistance genes similares a otros estudios en el Estado de Mxico y pa-
with the presence of class I integrons was found, which ses asiticos, europeos y de Amrica del Norte, lo que
in turn are related with the cassettes for resistance to sugiere una transferencia horizontal de material gen-
Beta-lactams and other antibiotics. It was found that tico en forma dinmica en las poblaciones animales
5 of the 10 (50%) isolates that had the Pse-1 and floR desde la etapa de produccin hasta la elaboracin de
genes also had the Cs3Cs5 gene coinciding with the productos y subproductos de origen animal. Los aisla-
findings in Peru with E. coli isolates that were multire- mientos de E. coli que presentaron resistencia a ampici-
sistant and had class I integron. lina y cloranfenicol tambin presentaron los genes Pse-1
These results suggest that resistance to antibiotics y flor resultados coincidentes con los mencionados por
and the transfer of genetic material could be due to Varela,24 quien inform una relacin de 73.68% para la
the inadequate use of antibiotics, which represents a resistencia a ampicilina y la presencia del gen Pse-1, en
public health risk and highlights the need for a per- aislamientos de Salmonella spp. En cuanto a la resisten-
manent surveillance of their use in order to determine cia a cloranfenicol, estudios realizados en Per por Mos-
the presence and prevalence of resistant strains in quito et al.,2 sugieren que sta puede estar mediada o
relacionada con genes como cmlA y floR.2 En un estudio
meat food products.26
realizado en Mozambique con Shigella y Salmonella se de-
termin que los mecanismos de resistencia a cloranfeni-
Referencias col se relacionaban con la presencia de CAT (89 y 67%),
cmlA (2 y 33%) y floR (0 y 83%), respectivamente.25 En
1. OFFICIAL JOURNAL OF THE EUROPEAN COMMU- este estudio se encontr una correspondencia entre los
NITY L165/48. European Directive 2001/471/EC. aislamientos que presentaron los genes de resistencia
2. MOSQUITO S, RUIZ J, BAUER JL, OCHOA TJ. Pse-1 y floR, con la presencia de integrones clase I, los
Mecanismos moleculares de resistencia antibitica en cuales estn relacionados con los casetes de resistencia
Escherichia coli asociadas a diarrea. Rev Peru Med Exp
a Beta-lactmicos y otros antibiticos. Se encontr que 5
Salud Pblica 2011; 28:648-656.
3. DI CONZA JA, GUTKIND GO. Integrons: gene
de los 10 (50%) aislamientos que presentaron los genes
collectors. Rev Argent Microbiol 2010; 42:63-78. Pse-1 y floR, presentaron tambin el gen Cs3 Cs5, coin-
4. SABATE M, GUILLEM P. Estructura y funcin de los inte- cidiendo con lo registrado en Per en aislamientos de
grones. Enfer Infecc Microbiol Clin 2002; 20:341-345. E. coli, que describan multirresistencia y presentaban
5. FALLAH F, KARIMI A, GOUDARZI M, SHIVA integrn clase I.
F, NAVIDINIA M, HADIPOR JAHROMI M et al. Estos resultados sugieren que la resistencia antibi-
Determination of integron frequency by a polyme- tica y la transferencia de material gentico pueden ser
rase chain reaction-restriction fragment length poly- por el uso inadecuado de antibiticos, que representa
morphism method in multidrug-resistant Escherichia un riesgo para la salud pblica, por lo que la vigilancia
coli which causes urinary tract infections. Microb Drug permanente en su uso es de suma importancia para
Resist 2012; 2020. determinar la presencia y la prevalencia de cepas resis-
tentes en alimentos crnicos.26
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