Explorer les Livres électroniques
Catégories
Explorer les Livres audio
Catégories
Explorer les Magazines
Catégories
Explorer les Documents
Catégories
lantibiogramme
Jean-Didier CAVALLO
Ecole du Val-de-Grce
1
Pourquoi un antibiogramme ?
2
Dlai entre introduction des antibiotiques et
apparition des rsistances acquises
Antibiotique Annes
mise sur le march rsistances acquises
pnicilline 1943 1945 (S. aureus)
streptomycine 1947 1947
ttracycline 1952 1956
mthicilline 1960 1961 (S. aureus)
acide nalidixique 1964 1966
gentamicine 1967 1969
vancomycine 1972 1987 (entrocoques)
cfotaxime 1981 1981-1983
linzolide 2000 1999 (E. faecium)
daptomycine 2003 1991 (S. aureus)
3
Pression de slection antibiotique
les effets collatraux
gurison
Traitement antibiotique bactrie cible
chec
Flores commensales
Hte
Sensible
Rsistant
4
Slection des rsistances
Rsistances acquises
mutant prexistant
5
La prvalence des rsistances acquises
dpend de trois facteurs
Pression antibiotique
Homme, animal
6
Apparition de rsistance acquise pendant une
monothrapie (infections svres BG-)
Amoxicilline 68 41* 54
Amoxicilline + AC 72 41* 59
Ac nalidixique 92 83 63*
Ciprofloxacine 97 94 78*
* diffrence significative Source AFORCOPI-BIO, 1999 8
Emergence de rsistance sous traitement par -
lactamines ou fluoroquinolones
Pseudomonas aeruginosa
Analyse multivarie
Rsistance un des 4 Ab dont lAb utilis
RR p RR p
10
Des mcanismes de rsistance et outils
Mutation
gntiques varis
prexistante
Antibiotique
2. Hyperexpression 1.Impermabilit
efflux actif
plasmide
transformation
3. Hydrolyse
enzymatique
4. modification ou
protection de la cible
intgron transposon
11
Mcanismes de rsistance (1)
13
Mcanismes de rsistance (2)
Acquisition
Macrolides Estrase ou
Gram (-): naturelle mthylase de lARN
Lincosamides phosphotransfrases
Efflux (cocci G+) (rare) 23S ou mutation
Streptogramines
ARN 23S
Mutation ARN 23S
oxazilidones Gram (-): naturelle -
(rare)
Dficit transport
Glutathion-S-
Fosfomycine (systmes GlpT ou
transfrase (rare)
UlpT)
ADP-ribosyl Mutation ARN-
Rifampicine Gram (-) : naturelle
transfrase (rare) polymrase
Acide fusidique Gram (-): naturelle Mutation EF-6
14
Mcanismes de rsistance (3)
Impermabilit- Enzymes Modification de la
Antibiotiques
efflux, autres dinactivation cible
Mutation porines
Ttracyclines TetX (Bacteroides) Protection de la cible
Efflux
Chloramphnicol
Chloramphnicol Efflux
acetyl transfrase
Mutation DHPS
Sulfamides - - DHPS additionnelle
faible affinit
Mutation DHFR
DHFR additionnelle
Trimthoprime - -
faible affinit
Surproduction DHFR
Impermabilit
Polymyxines membranaire (LPS)
(rare)
Mtronidazole Dfaut dactivation Nim (Bacteroides)
15
Antibiotique slecteur
16
Hyperexpression des systmes defflux
rsistances croises chez P. aeruginosa
17
Rsistances associes
exemple de P. aeruginosa
S S S aucun (62 %) 5 5 3 14
I/R S S/I RNE (16 %) 27 22 15 46
I I/R S Case BN (6 %) 25 50 29 68
R R R Case HN (4 %) 75 69 62 75
R I I Case BN + RNE 36 36 14 64
R R S Pase (2 %) 30 100 80 80
R R I Pase + Case (5 %) 59 77 50 77
18
Mthodes dtude au laboratoire
en routine
Etude de la sensibilit aux antibiotiques
+ lecture interprtative
Conclusion S, I, R
19
CMI par dilution en milieu liquide
0,125mg/l 64 mg/L
Ab 1
0,25mg/l 64 mg/L Ab 2
AB3
Ab4
Ab 5
AB6
Ab7
Ab8
Macrodilution Microdilution
CMI
0 c C CMI (mg/l)
22
Valeurs critiques des diamtres dinhibition (mm)
par antibiotique espce
0 d D Diamtre (mm)
23
Pseudomonas
aeruginosa
TIC CFS
IPM
FOS
PIP FEP TM
AN
TCC ATM
CS
PTZ CAZ
CIP SXT
24
Galerie antibiogramme
25
Galerie Antibiogramme
mise en vidence de la croissance bactrienne
en milieu liquide
DO
lecture automatise
ou visuelle
Permet un rendu
lecture rapide en 6 heures
automatise
DO
0 3 5 18
26
heures
Rle du microbiologiste
27
Choix des antibiotiques tester
Recommandations CA-SFM
Par espce ou groupe bactrien
Antibiogramme standard (liste 1)
antibiotiques ncessaires l orientation thrapeutique, en fonction des
indications cliniques (type d infection) et de la prvalence de la rsistance
acquise
Tests complmentaires (liste 2)
Intrt pidmiologique, aptitude dtecter un mcanisme de rsistance
ou antibiotique de recours
28
S. pneumoniae
29
Antibiotiques marqueurs
30
Equivalence
31
Rsistances naturelles chez les
entrobactries
Klebsiella spp. R R
C. koseri R R
C. freundii R R R R R
E. cloacae R R R R R
E. aerogenes R R R R R
S. marcescens R R R R R R
P. mirabilis R R R
P. vulgaris R R R R R R R
M. morganii R R R R R R R R
P. stuartii R R R R R R R
Y. enterocolitica R R R R R R R
R : rsistance naturelle
AM : aminopnicillines ; AMC : amoxicilline + acide clavulanique ; TIC : ticarcilline ; PIP : pipracilline
C1G : cphalosporines de 1re gnration ; FOX : cfoxitine ; CTT : cfottan ; MA : cfamandole ; CXM : cfuroxime ;
GM : gentamicine ; TET : ttracyclines y compris la tigcycline ; COL : colistine, polymyxine B ; FT : nitrofuranes.
32
Dmarche interprtative
du microbiologiste
Phnotype de rsistance observ in vitro
lecture des CMI, diamtres ou galeries
cohrence avec lidentification (Rn)
connaissance des mcanismes R acq.
tests complmentaires ventuels
Mcanismes R peu exprims
Rendu de lantibiogramme en S, I, R
Commentaires (quivalence, conseils)
33
Mthode de dtection des
mcanismes de rsistance
Mthodes indirectes
voquent la prsence dun mcanisme de rsistance
antibiotiques marqueurs
synergie entre deux antibiotiques
Mthodes directes
mcanismes biochimiques
ex: production de -lactamase chez N. gonorrhoeae, H. influenzae
support gntique de la rsistance
ex: mise en vidence des gnes mecA (staphylocoques), vanA,vanB
(entrocoques), rpoB (M. Tuberculosis)
34
Staphylocoques
MOX PG
MOX PG
Pni*,AMX S R R
FOX*,AMC,OXA S S R
Autres -lactamines**
* Ab marqueurs
** Sauf ceftaroline, ceftobiprole
36
SARM typique
K GM MOX PG
CIP FOX
E L
VA TEC
37
SARM communautaire
MOX PG
PCR
mecA
positive
CIP
FOX
VA TEC
38
S.epidermidis
K GM MOX PG
FA RA CIP FOX
RA E L PT
SXT DO VA TEC
39
Aminosides et lecture interprtative
chez les cocci Gram +
40
S. pneumoniae et -lactamines
41
Macrolides et streptocoques
42
S. pneumoniae OXA R NOR S
ERY LIN
OXA
NOR
43
S. pneumoniae OXA R
E-test
PG : 1 mg/L
AM : 0,38 mg/L
CTX : 0,5 mg/L
44
Glycopeptides et entrocoques
45
Glycopeptides et entrocoques
Vancomycine S R R R
Teicoplanine S R S S
46
E. faecalis sauvage
AM L
Enterococcus
FUR CRO GM
500
TEC VA
AM L AM L
GM FUR CRO GM
FUR CRO 500 500
TEC VA TEC VA
47
Haemophilus influenzae
48
Haemophilus influenzae
Amoxicilline S R R
Amox + Ac Clav S S R
Cfalotine* S S R
Cfotaxime S S S
49
H. influenzae mutation PLP3
AP AMC
CEF
AM
50
Entrobactries
51
-lactamines et entrobactries
52
Dpistage des BLSE
Synergie C3G acide clavulanique
Images de synergie
C3G et acide
clavulanique
53
E. coli produisant CTX-M
54
PCR positive CTX-M
55
K. pneumoniae OXA 48 (carbapnmase)
Carbapnmases
IMP 1, 7 R I R S I/R -/+
VIM 1, 2, 3 R R R S I/R -/+
* Sauf OXA 18 : + / - 57
Pseudomonas aeruginosa BLSE
PIP FEP TM AN
TCC ATM GM CS
TIC
ATM PIP
TCC
FEP TZP
SYNERGIE
CAZ
59
P. aeruginosa
Synergie avec lacide clavulanique mieux
vue sur MH + Cloxacilline
FEP
ATM TCC
CAZ
60
Pseudomonas aeruginosa
avec carbapnamase VIM-2
PIP FEP TM AN
Aztronam
moins touch
TCC ATM TM CS
Mais
Attention la spcificit
Faux positifs avec OprD2
62
Confirmer par PCR ++
Conclusion
Rle du biologiste
Identifier les rsistances acquises
Antibiotiques vise thrapeutique
Lecture interprtative de lantibiogramme
Aide pour le clinicien
Dpister les mcanismes sous surveillance
Isolement des patients
Dialogue biologiste-clinicien ++
63