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Semestre Ago-Dic 2017

Extraccin de DNA, RNA de Linfocitos y Electroforesis de muestras.


Equipo 2, Sptimo y A
Muoz Hernndez Edna Victoria, Regalado Rodrguez Mauricio y Medina Reyes Manuel Horacio. Viernes 1:00
p.m. 4:00 p.m. Extraccin de DNA (29-09-2017), Extraccin de RNA (6-10-2017) & Electroforesis (13-10-2017)
Ciclo Agosto-Diciembre 2017.
Laboratorio de Gentica, Unidad Acadmica de Ciencias Qumicas, Universidad Autnoma de Zacatecas.
rrm.96@hotmail.com

Resumen: Por medio de este articulo nos vamos a dar cuenta en algunas de las formas ms utilizadas para la
extraccin del ADN, a partir de sangre perifrica que se puede utilizar para muchas finalidades por ejemplo para el
anlisis de algunas enfermedades que se presenten en cada uno de los individuos en particularidad y
posteriormente podamos dar una hiptesis de dicho resultados al realizar la practica con el fin de posteriormente el
ADN extrado lo analizaremos para detectar anomalas de la persona, en caso de tener sospechas de alguna
patologa.
La metodologa que se va a utilizar en esta prctica, permite recuperar el ARN de la fase acuosa como ya se
mencion, igualmente el ADN y las protenas pueden ser recuperados de la fase orgnica por precipitacin
secuencia, as con etanol se logra precipitar el ADN de la interface y con una precipitacin adicional pueden
recuperarse las protenas de la fase orgnica. Esta tcnica permite obtener ARN a partir de pequeas cantidades
de sangre perifrica de origen humano.
La electroforesis en gel de agarosa es de las ms utilizada para analizar y caracterizar cidos nucleicos de
distintas procedencias. Los geles se comportan como un tamiz molecular y permite separar molculas cargadas
en funcin a su tamao y forma. As molculas de ADN Y ARN de diferente tamao van a migrar de forma distinta
en una electroforesis en gel de agarosa, adems si en dicha electroforesis se aplican marcadores de peso
molecular (fragmentos de ADN Y ARN de tamao conocido), se puede calcular el tamao aproximado de las
molculas en estudio.
Palabras clave: DNA, RNA, Electroforesis, Agarosa, Marcador, Buffer, Cualitativo.

Introduccin Se han desarrollado diversos procedimientos


En los ltimos aos los avances en el campo o protocolos de extraccin teniendo en cuenta
de la gentica molecular han mejorado de el origen o fuente del ADN. en los ltimos
forma notable el conocimiento de los aos las casas comerciales a desarrollado
mecanismos fisiopatolgicos y el diagnostico diversos kits de obtencin del ADN a partir de
de distintas enfermedades en ADN se sangre, todo tipo de tejidos y cultivos
encuentra la informacin gentica del celulares que pretendan optimizar los
individuo, por tanto, el primer paso para llegar procedimientos para poder obtener un
a cabo un estudio de gentica molecular mximo de ADN de buena calidad y en el
implica la obtencin de muestra de cidos menor tiempo posible. A partir de sangre: las
nucleicos, especialmente de ADN. Las clulas nucleadas de sangre perifrica son
tcnicas de extraccin de cidos nucleicos una de las fuentes ms esequibles son las
son sencillas, pero es importante mantener ms utilizadas en medicina para la obtencin
una serie de precauciones para evitar la de ADN genmico. La revelacin ms
degradacin por nucleasas durante la importante de la gentica molecular fue
manipulacin. El objetivo es obtener la concebida en 1953, al ser descubierta la
mxima cantidad y la mayor calidad del ADN. estructura de la molcula de ADN por los
cientficos Watson y Crick. Segn Brker R.
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descubrimientos precedentes llevados a celulosa o gel (agarosa, acrilamida...) y los


cabos por otros investigadores como Rosalind componentes de la muestra migran en forma
Franklin, Maurice Wilkins y Linus Pauling de pequeas bandas, tambin llamadas
fueron sin lugar a dudas imprescindibles para zonas. La electroforesis en geles una tcnica
lograr este importante hallazgo que muy utilizada para separar molculas o
revolucion el campo de las investigaciones fragmentos de molculas de cidos nucleicos.
biolgicas. Desde entonces, varios mtodos Los materiales ms comunes para separar
de purificacin utilizan perlas de cristal, perlas molculas de cidos nucleicos son polmeros
magnticas, detergentes o los juegos como la poliacrilamida o la agarosa. Estos
comerciales establecidos, con la finalidad de geles se colocan en la cubeta de
obtener una molcula cada vez ms pura e electroforesis, sumergidos en un tampn de
ntegra. Los autores aslan esta molcula con pH alrededor de 8. De esta forma, las
diferentes objetivos, que van desde los molculas de DNA o RNA sometidas a
estudios relacionados a los procesos electroforesis se desplazarn al polo positivo
evolutivos de las especies, hasta sus ya que a pH superiores a 5 poseen carga
aplicaciones en las ciencias forenses y en las negativa. Los geles se comportan como un
ciencias biomdicas, fundamentalmente tamiz molecular y permiten separar molculas
destinadas al diagnstico de diversas cargadas en funcin de su tamao y forma.
enfermedades. As, molculas de DNA de diferente tamao,
van a emigrar de forma distinta en un gel de
El trmino electroforesis se usa para describir electroforesis. La distancia recorrida por cada
la migracin de una partcula cargada bajo la fragmento de DNA va a ser inversamente
influencia de un campo elctrico. Muchas proporcional al logaritmo de su peso
molculas importantes biolgicamente molecular. Es importante la utilizacin de
(aminocidos, pptidos, protenas, marcadores de tamao conocido porque nos
nucletidos, cidos nucleicos...) poseen permitirn calcular el peso molecular de las
grupos ionizables y existen en solucin como muestras de DNA Y RNA problema [4].
especies cargadas, bien como cationes, o
bien como aniones. Estas especies cargadas Material y Mtodos
se van a separar en funcin de su carga
cuando se aplica un voltaje a travs de los
Extraccin de DNA Sangre perifrica
electrodos. Existen muchos tipos de
electroforesis, que se engloban en dos
Por puncin venosa se obtuvieron 5 ml
categoras fundamentales:
de sangre y depositaron en tubo con EDTA
para evitar que coagular, se llev a
-Electroforesis de frente mvil.
centrifugar 2500 rpm durante 8 minutos y se
extrajo la capa de leucocitos, colocndola en
-Electroforesis de zona.
un tubo cnico de 15 ml. Se completaron 8 ml
en el tubo cnico al agregar solucin de SLR
Actualmente, slo se utiliza la electroforesis
fro y se homogeniz por inversin, posterior
de zona, en la cual la muestra se desplaza
se colocaron en hielo por 15 minutos y cada 5
sobre un soporte slido, como papel de filtro,
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minutos se homogenizaba. Posterior a retirar botn con PBS estril. Se dej 100 l de
del hielo, se llev a centrifugar a 3000 rpm por remanente del lavado con SLR para
10 minutos para la obtencin del botn de resuspender los leucocitos, se transfiri a un
leucocitos, el sobrenadante fue desechado y tubo para micro centrifuga y se le agrego el
los pocos eritrocitos que quedaron junto al Trizol el cual se lisaron las clulas por medio
botn fueron lavados con SLR. Al botn de de un pipeteo y se dej por 5 minutos a
leucocitos se le agreg 500 l de DNAzol y temperatura amiente. Para evitar las
para lisarlos se realiz un pequeo pipeteo y contaminaciones y perder nuestra muestra se
al estar lisado se transfiri a un tubo para agreg 200 l de cloroformo, se reposo por 3
microcentrifuga de 1.5 ml. Al tubo de micro minutos a temperatura ambiente y se llev a
centrifuga con las clulas ya lisadas, se les centrifugar 11000 rpm por 10 minutos, se
agreg etanol absoluto fro y se invirti el tubo transfiri a un tubo para micro centrifuga en el
para poder observar las hebras de ADN, cual se formaron tres fases, de las cuales la
despus el sobrenadante fue desechado por superior se encontraba el ARN. Se agregaron
medio de una pipeta, cuidando el no traernos 500 l de isopropanol y dej reposar por una
el ADN. Para el lavado se agreg a nuestro semana, despus transcurrid la semana se
tubo 1 ml de etanol al 75% para el lavado de centrifug a 8000 rpm por 10 minutos y se
las hebras de ADN y se desech el desech el sobrenadante Como ultimo lavado
sobrenadante con una micropipeta, este se realiz con etanol al 75% y se llev a
procedimiento se realiz dos veces Se Re centrifugar por 5 minutos a 8000 rpm el cual
suspendieron con 500 l de buffer TE 1x y se se sedimento y el sobrenadante fue
dej as para su posterior anlisis desechado. La re suspensin se realiz con
electrofortico. agua esteril y se guard para su anlisis
electrofortico.
Extraccin de RNA de sangre perifrica
Electroforesis en gel de agarosa
Se obtuvo sangre por puncin venosa
y se coloc en un tubo con anticoagulante con Se prepar un gel de agarosa al 1%,
EDTA, se llev a centrifugar a 2500 rpm por 8 en el cual primero se derriti en un horno de
minutos, se extrajo la capa de leucocitos y se microondas hasta disolver completamente y
transfirieron a un tubo cnico de 15 ml. Para dejar enfriar un poco. Despus se le aadi 3
la lisis de los eritrocitos se agreg SLR fro l de bromuro de etidio y se homegeniz.
hasta completar 8 ml y se homogenizo por Tambin fue colocado el peine para los
inmersin cada 5 minutos durante los 15 pozos. Finalmente se coloc en el plato de la
minutos que fue colocado a incubar en hielo. cmara evitando la formacin de burbujas.
Se llevo a centrifugar a 3000 rpm durante 10 Una vez solidificado se aadi a la cmara el
minutos para obtener el botn de leucocitos, buffer de corrimiento TAE 10x y fue retirado el
se desech el sobrenadante y se agreg SLR peine. Se mezclaron las muestras de ADN y
para lavar los eritrocitos que hayan podido ARN con los buffer de carga y fueron
haber quedado, esto se realiz dos veces depositados en los carriles correspondientes y
para u mejor lavado y finalmente se lav el dejando el primero para colocar el marcador
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de peso molecular. Se aplic un voltaje de 75 Referencias


volts durante 30 minutos
1.-Lodish H, Berk A, Zipursky L, Matsudaira P,
Baltimore D, DarnellJ. Biologa Celular y
Resultados Molecular. 4ta Edicin. Buenos Aires: Editorial
El resultado obtenido en el gel de agarosa fue Mdica Panamericana; 2002.
un poco dudoso, debido a que el corrimiento 2.-Revista Nature Protocolos Aos 2009-2013.
de la muestra no fue el suficiente como para Almonacid, C Pinilla G. Introduccin al anlisis
tener un resultado muy representativo, lo que Bioqumico y a sus Mtodos de separacin.
se muestra en la figura 1 adems de que Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca.
2008
algunas muestras de los dems equipos se 3- Chomczynski, P. 1993 A reagent for the single-
degradaron principalmente RNA. step simultaneous Isolation of RNA, DNA and
proteins from celland tissue sam-ples.
4.- Bio-Rad: protocolo que acompaa al
quantum Pre Miniprep Kit Nelson DL,Cox MM
(2001: principios de bioqumica. 3 ed. Editorial
Omega (Barcelona, Espaol).

Figura 1. Corrimiento de Gel de Agarosa con


muestras de DNA y RNA mas el Peso Molecular

Discusin y Conclusin
En cuanto a la extraccin de ADN y rna se
llev acabo en perfectas condiciones respecto
al procedimiento. Pero en cuanto se llev
acabo el corrimiento de la electroforesis,
podemos llegar a la conclusin que el ADN no
corri y ARN coro muy poco en cuanto al
control tambin se qued, referente a esto
podemos decir que en el gel de agarosa pudo
estar contaminado, la pureza del TAE, el poco
tiempo de corrimiento, el voltaje ya que solo
se qued en un solo voltaje.

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