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clnica
Alex Snchez
http://ueb.ir.vhebron.net/bdclinica
Y quien es l
Introduccin
Todos los procesos
en que participamos
implican gestin de
informacin.
Las bases de datos y
los sistemas para
gestionarlas
permiten un manejo
eficiente de la
informacin.
Bases de datos
Una base de datos o banco de datos
es un conjunto de datos pertenecientes
a un mismo contexto y almacenados
sistemticamente para su posterior uso.
Ejemplos
Contactos del mvil
Pacientes del hospital
Datos de un estudio clnico
SGBD
Un sistema gestor de bases de datos
(SGBD) es un programa para la
[creacin] y
administracin (entrada, edicin, salida)
de datos de forma rpida y estructurada.
Ejemplos
Access (MS), Base (LO), Filemaker
SQL, Oracle
Qu/Que no
En esta sesin
Presentamos algunas ideas para diseo de
bases de datos relacionales de tipo personal
Ilustramos con ejemplos como llevarlo a cabo.
Valoramos algunos problemas que conlleva la
mala praxis en la gestin de los datos
NO discutimos
Bases de datos pre-existentes en el entorno
clnico u hospitalario.
Aspectos legislativos o de regulacin.
Un caso de estudio
The Infant Jaundice Study
Estudio de cohorte (nested double cohort).
Sujetos: Nios de 5 aos
con ictericia neonatal o sin ella
seleccionados al azar
de igual edad.
Variable predictora: Presencia/Ausencia Ict.
Variable respuesta: Puntuaciones neurofisiolgicas
(IQ [55-145]).
Newman, T. B., P. Liljestrand, et al. (2006). "Outcomes among
newborns with total serum bilirubin levels of 25 mg per deciliter or
more." N Engl J Med 354(18): 1889-900.
Datos del estudio
Unos 400 nios
Nombre, Fecha nac., Sexo, Etnia, Raza
5 mdicos para examinarlos.
Unos 700 examenes neurofisiolgicos
Fecha examen, Peso, Altura, Edad, IQ
Los examinadores no se repiten nunca.
Si el nio ha fallecido antes de los 5
aos se registra su edad y circunstancia
de la muerte.
Como almacenar los datos
Paso 0: decidir un formato para
almacenar los datos.
Dos opciones obvias
Hoja de clculo o base de datos de SPSS
Base de datos relacional
Aproximacin naf
Usar hoja de clculo Importar SPSS/R
Intuitivo y directo pero...
Dificil de compartir datos entre usuarios
Integridad de los datos difcil de mantener
Un ordenar mal aplicado deshace la BD
Poco control sobre pequeas variaciones
Snchez <> Sanchez <> SANCHEZ
Puede aceptar un 30-02-2012
Mala gestin de los datos redundantes
Nombre o direccin repetidos en muchas filas
Alternativa:
Bases de datos relacionales
Coleccin de tablas parecidas a hojas de
clculo en donde
Filas = registros = entidades
Columnas = caractersticas = atributos
En cada tabla:
Columna con un valor nico: clave primaria
Columna con valor de clave primaria de otra tabla:
clave externa.
Las tablas pueden relacionarse a travs de sus
claves
Tabla de sujetos del estudio
Comn a cualquier
estudio.
Nombre, Fecha.
Nac., Sexo,
Afectado,
Clave principal?
DOB o Nombre estan
repetidos
Mejor crear una clave
nica y artificial para
cada registro.
Clave principal
Aignando una ID
distinta a cada
participante se
garantiza la
identidad nica
de cada sujeto
en el estudio.
Las variables del estudio (1)
Mediciones realizadas sobre los sujetos
Pueden incluirse en la tabla si hay tan slo
una por sujeto.
Puede ser recomendable mantenerlas
aparte si cambian dinmicamente a lo largo
del estudio.
No es recomendable incluirlas en esta tabla
si puede haber ms de una (en n variable)
por sujeto.
Sujetos y variables juntos
De una a varias tablas
Si el nmero de campos crece en
exceso
Puede ser conveniente fraccionar la tabla en
varias ms pequeas y homogneas.
Si aparecen medidas repetidas en
nmero variable o fijo por sujeto
Puede ser conveniente almacenarlas en una
tabla relacionada
Lo que no hay que hacer
Tampoco hay que duplicar datos
Si creamos una
tabla aparte
eliminamos los
campos vacos
y el gasto de
espacio
Una BD relacional
Integridad referencial