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Niveles de organizacin
Una o varias cadenas de aminocidos o polipeptdicas componen una enorme diversidad de formas y
tamaos de protenas, que se organizan en varios niveles de complejidad y que le otorgan diferentes
funciones.
Estructura primaria: Esta estructura consiste en una cadena de las unidades fundamentales de
las protenas, los aminocidos.
Estructura secundaria: Cuando los aminocidos de la misma cadena interactan a travs de
puentes de hidrgeno formando determinadas estructuras.
Estructura terciaria: Son diferentes atracciones entre estructuras secundarias, que conforman
una estructura plegada y compacta.
Estructura cuaternaria: Es cuando varias cadenas de aminocidos con sus estructuras se
unen mediante atracciones o enlaces.
NOMENCLATURA
Clasificacin[editar]
Existen muchas formas de clasificar los aminocidos; las tres que se presentan a continuacin
son las ms comunes.
Neutros polares, polares o hidrfilos: serina (Ser, S), treonina (Thr, T), glutamina (Gln,
Q), asparagina(Asn, N), tirosina (Tyr, Y), cistena (Cys, C).
Neutros no polares, apolares o hidrfobos: alanina (Ala, A), valina (Val, V), leucina (Leu,
L), isoleucina (Ile, I), metionina (Met, M), prolina (Pro, P), fenilalanina (Phe,
F), triptfano (Trp, W) y glicina (Gly, G).
Con carga negativa o cidos: cido asprtico (Asp, D) y cido glutmico (Glu, E).
Con carga positiva o bsicos: lisina (Lys, K), arginina (Arg, R) e histidina (His, H).
Aromticos: fenilalanina (Phe, F), tirosina (Tyr, Y), triptfano (Trp, W) y prolina (Pro, P) (ya
incluidos en los grupos neutros polares y neutros no polares).
Segn su obtencin[
A los aminocidos que deben ser captados como parte de los alimentos y no pueden ser
sintetizados por el organismo se los llama esenciales. La carencia de estos aminocidos en la
dieta limita el desarrollo del organismo, ya que no es posible reponer las clulas de los tejidos
que mueren o crear tejidos nuevos, en el caso del crecimiento. Para el ser humano, los
aminocidos esenciales son:
Valina (Val, V)
Leucina (Leu, L)
Treonina (Thr, T)
Lisina (Lys, K)
Triptfano (Trp, W)
Histidina (His, H) *
Fenilalanina (Phe, F)
Isoleucina (Ile, I)
Arginina (Arg, R) *
Metionina (Met, M)
A los aminocidos que pueden sintetizarse en el propio organismo se los conoce como no
esenciales y son:
Alanina (Ala, A)
Prolina (Pro, P)
Glicina (Gly, G)
Serina (Ser, S)
Cistena (Cys, C) **
Asparagina (Asn, N)
Glutamina (Gln, Q)
Tirosina (Tyr, Y) **
cido asprtico (Asp, D)
cido glutmico (Glu, E)
Selenocistena (Sec, U)
Pirrolisina (Pyl, O)
Estas clasificaciones sobre aminocidos esenciales varan segn la especie. Se han aislado
cepas de bacterias con requerimientos diferentes de cada tipo de aminocido. Para algunos
aminocidos hay dudas sobre si son esenciales en algunas especies, segn diferentes
autores.
PROPIEDADES
Los aminocidos son compuestos slidos; incoloros; cristalizables; de elevado
punto de fusin (habitualmente por encima de los 200 C); solubles en agua; con
actividad ptica y con un comportamiento anftero.
SINTESIS
La 'sntesis d es el conjunto de procesos bioqumicos (rutas metablicas) mediante los cuales
se producen los distintos tipos de aminocidos a partir de otros compuestos.
Los sustratos para estas reacciones se obtienen a partir de la dieta del organismo o bien
del medio de cultivo. No todos los organismos son capaces de sintetizar todos los
aminocidos. Los seres humanos, por ejemplo, slo son capaces de sintetizar 11 de los 20
aminocidos que pueden encontrarse en su organismo, formando parte de sus protenas o
como intermediarios metablicos. Los otros nueve se denominan aminocidos esenciales y
deben incorporarse a la dieta, lo mismo ocurre con la histidina durante periodos de crecimiento
rpido.1
ndice
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Aminocidos aromticos[
El triptofano, la fenilalanina, y la tirosina son conocidos como aminocidos aromticos. La
sntesis de los tres comparte una fase inicial, la formacin de cido corsmico a partir
de fosfoenolpiruvato (PEP) y eritrosa-4-fosfato (E4P). el primer paso, la condensacin
de cido 3-deoxy-D-arabino-heptulosonico 7-fosfato (DAHP) a partir de PEP/E4P, utiliza
tres isoenzimas (AroF, AroG y AroH). La sntesis de cada una de ellas est regulada por
la tirosina, la fenilalanina y el triptofano, respectivamente. Estas tres isoenzimas tienen la
capacidad de ayudar a la sntesis de DAPH mediante inhibicin por retroalimentacin. Esto
acta en la clula controlando las concentraciones de cada uno de los tres aminocidos
aromticos. Cuando hay demasiada concentracin de alguno de ellos, este
controla alostricamente la DAHP sintetasa, inactivndola. Con el primer paso de la ruta
comn desactivado, la sntesis de los tres aminocidos se detiene. El resto de las enzimas de
la ruta comn (conversin del DAHP a cido corsmico) parecen estar sintetizadas de forma
constitutiva, excepto shikimato quinasa que puede ser inhibida por shikimato
mediante inhibicin mixta. Si se produce demasiado shikimato, este puede unirse a la
shikimato quinasa para detener la produccin.
Aminocidos derivados de la ribosa-5-fosfato
La histidina es el nico aminocido derivado de la ribosa-5-fosfato, sintetizndose a partir de
la va de las pentosas fosfato.
METABOLISMO
Ciclo de la Urea
Transdesaminacin
La transdesaminacin es una transaminacin ligada a la desaminacin oxidativa.
Como las reacciones de transaminacin transfieren, en ltima instancia, grupos amino de la
mayora de los aminocidos al cido alfacetoglutrico para formar glutamato, se considera que
todo el nitrgeno amnico proveniente de los aminocidos se puede concentrar en el
glutamato. Esto es importante porque la liberacin de este nitrgeno como amoniaco es
catalizado por la L-glutamato deshidrogenasa, enzima ampliamente distribuida, que permite
una reaccin que enforma global es a lo que finalmente se le denomina como
transdesaminacin.
Metabolismo de Aminocidos
En el organismo existen 20 aminocidos, nueve de los cuales son esenciales y once ms que
son los llamados no esenciales. Los aminocidos escenciales son los que no pueden ser
sintetizados por el organismo y, por lo tanto, deben ser obtenidos a partir de la dieta.
Los nueve aminocidos esenciales son los siguientes:
Histidina (His)
Valina (Val)
Leucina (Leu)
Isoleucina (Ile)
Lisina (Lys)
Metionina (Met)
Treonina (Thr)
Fenilalanina (Phe)
Triptofano (Trp)
Los aminocidos no esenciales pueden ser sintetizados por el organismo a partir de productos
intermedios del ciclo del cido tricarboxlico y otras vas metablicas. Son los siguientes:
Tirosina (Tyr)
Glicina (Gly)
Alanina (Ala)
Cistena (Cys)
Serina (Ser)
cido asprtico (Asp)
Asparagina (Asn)
Glutamato (Glu)
Glutamina (Gln)
Arginina (Arg)
Prolina (Pro)
Hay dos reacciones esenciales para el metabolismo de los aminocidos, los cuales son la
transaminacin y desaminacin oxidativa.
La glutamato deshidrogenasa elimina el grupo amino del glutamato dejando el esqueleto del
carbono. El amonaco formado entra en el ciclo de la urea y los esqueletos del carbono (-
cetocidos) son todos productos intermedios glucolticos y del ciclo del cido tricarboxilico. La
glutamato deshidrogenasa es especfica para el glutamato y es inusial porque puede emplear
NAD+ o NADP+ como cofactor. Todo esto es producido a nivel Mitocondrial. En cuanto a la
forma de control, la reaccin es reversible. ATP y GDP inhiben alostricamente a la enzima,
mientras que GDP y ADP la activan. Por lo tanto, cuando los niveles de energa son bajos, los
aminocidos se desaminan para proporcionar -cetoglutarato al ciclo del cido tricarboxilico
para generar energa. Tambin puede conseguirse la desaminacin mediante otras enzimas
menores.