Benemrita Universidad Autnoma de Puebla

Facultad de Medicina

Licenciatura en Nutricin Clnica

Gentica y Genmica Nutricional

Profesor: Guadalupe Soto Rodrguez

Alumno: Brenda Prez Gonzlez

A. Insulina

1. Alias:
2. Secuencia nuclotidica
3. Secuencia de aminocidos
4. Funcin
5. Estructura pdb 3D
6. Localizacin en el la clula
7. Tipo de protena
8. Regulacin trascripcional
9. Modificaciones post traduccionales
10. Interaccin con otras protenas
11. Homologa
12. Polimorfismos

1. BioSystems

2.

3.
 Insulina
Protena codificante: protena verdadera.

13. Alias:
Insulina dependiente de Diabetes Mellitus 2
MODY10
Proinsulina

Cromosoma:
11
Comienzo:
2.159.779 pb de PTER
Fin:
2.161.341 pb de PTER
Tamao:
1.563 bases

14. Secuencia nuclotidica

1 gctggttcaa gggctttatt ccatctctct cggtgcagga ggcggcgggt gtggggctgc

61 ctgcgggctg cgtctagttg cagtagttct ccagctggta gagggagcag atgctggtac
121 agcattgttc cacaatgcca cgcttctgca gggacccctc cagggccaag ggctgcaggc
181 tgcctgcacc agggcccccg cccagctcca cctgccccac tgccaggacg tgccgcgcag
241 agcaggttcc ggaacagcgg cgaggcagag ggacacagga ggacacagtc agggagacac
301 agtgcccgcc tgcccgccag ccctaggtcg cactcccacc catctccagc cgggctggac
361 ccaggttaga gggagggtca cccacactgg gtgtggacct acaggcccca acgcccacat
421 gtcccacctc cttcccccgc cccggggcag cgtcacagtg ggagcctgaa caggtgatcc
481 cagtacttct ccccagggcc tgtccccagc atcttcccca tctcctgact atggagctgc
541 cgtgaggcct ggcgacaggg gtctggccca ctcaggcagg cagccacgcc ctcctccggg
601 cgtgatgggg tgttcgccca gaggcaggca gcgtggggca ccctgtgacc ccaggtcacc
661 caggacttta cttaacaaaa cacttgaatc tgcggtcatc aaatgagggt ggagaaatgg
721 gctgcggggc atttgtttga ggggcgagtg gagggaggag cgtgcccacc ctctgatgta
781 tctcggggct gccgaagcca acaccgtcct caggctgaga ttctgactgg gccacaggga
841 gctggtcact tttaggacgt gaccaagaga acttcttttt aaaaaagtgc acctgacccc
901 ctgctgggtg gcagcctcct gcccccttct gcccatgctg ggtgggagcg ccaggagcag
961 ggggtggctg ggggcggcca ggggcagcaa tgggcagttg gctcaccctg caggtcctct
1021 gcctcccggc gggtcttggg tgtgtagaag aagcctcgtt ccccgcacac taggtagaga
1081 gcttccacca ggtgtgagcc gcacaggtgt tggttcacaa aggctgcggc tgggtcaggt
1141 ccccagaggg ccagcagcgc cagcaggggc aggaggcgca tccacagggc catggcagaa
1201 ggacagtgat ctgggagaca ggcagggctg aggcaggctg aaggccaggt gccctgcctt
1261 ggggcccctg ggctcacccc cacatgcttc acgagcccag ccacgtcctc cctgctgcag
1321 agctggggcc tggggtccag ccaccctgga atcctgagcc cacctgacgc aaaggccctt
1381 ggaacagacc tgcttgatgg cctcttctga tgcagcctgt cctggagggc tgagggctgc
1441 tgggcccccg ctggctttat agtctcagag cccatctccc ctacctctca acccctgccg
1501 cctggcccat tagggcctgg ggtggggggg tcggcagatg gctgggggct gaggctgcaa
1561 ttt

15. Secuencia de aminocidos

 MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQ
VGQVELGGGPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

16. Funcin

La insulina disminuye la concentracin de glucosa en sangre. Se aumenta la permeabilidad celular

a monosacridos, aminocidos y cidos grasos. Acelera la gluclisis, el ciclo de las pentosas fosfato
y la sntesis de glucgeno en el hgado.

17. Estructura pdb 3D

18. Localizacin en el la clula

 19. Tipo de protena

Hormona
Tamao: 110 aminocidos Masa molecular: 11981 Da
Estructura cuaternaria:
Heterodmero de una cadena B y una cadena A unidos por dos enlaces disulfuro.

Genmica funcional
20. Regulacin trascripcional

Elementos reguladores para INS gnica

Potenciadores de genes de los SIN ENHANCERS

Promotor de Elite y / o Elite-promotor de asociacin al gen

Factores de Transcripcin para el gene INS
Los factores de transcripcin que regulan genes INS y su sitio de unin

21. Modificaciones post traduccionales

Sitios de modificacin
Despus de la eliminacin del precursor de pptido seal, la proinsulina se escinde despus de la
traduccin en tres pptidos: la cadena B y A pptidos de cadena, que estn unidos covalentemente
a travs de dos enlaces disulfuro para formar la insulina y pptido C.

Procesamiento de la molcula.
Estrutura Position(s) Descripcin- acciones Vista grafica Longitud

Pptido seal 1 24 Add BLAST 24

Peptido 25 54 Insulin B chain Add BLAST 30

Propedtido 57 87 C peptide Add BLAST 31

Pedtido 90 110 Insulin A chain Add BLAST 21

Modificacin de aminocidos

Modificaciones de aminocidos
Estructura Posicin Descripcin de acciones

Enlace disulfuro 31 96 Intercatenarios (entre cadenas B y A)

Enlace disulfuro 43 109 Intercatenarios (entre cadenas B y A)

Enlace disulfuro 95 100

Interacciones gnicas y vas de sealizacin para el gen de INS

RET sealizacin
Regulacin de la
traduccin de la
insulina
signalosome GAB1
El transporte al Golgi y
posterior modificacin
transduccin de seales aguas abajo 0.94 interacciones DAP12 0.89
La sealizacin por PDGF 0.94 NGF sealizacin a travs de TRKA
la sealizacin de DAP12 0.92 de la membrana plasmtica 0.87
La cascada de sealizacin del receptor de insulina 0.92 La sealizacin por SCF-KIT 0.85
La sealizacin por receptor de insulina 0.92 La sealizacin por NGF 0,81
La sealizacin por EGFR 0.91 Fc receptor epsilon de sealizacin
(FceRI) 0,78
Regulacin de las cascadas de sealizacin-genrico Resistencia a la insulina
metabolismo de los lpidos de insulina 0.59 la activacin del IRS
regulacin de la insulina traduccin de la traduccin atenuacin de la seal
0.59
homeostasis de la glucosa
regulacin HIF transcripcin mediada por receptor 0.51
Reglamento traduccin de la actividad eIF2 0.47
va de sealizacin de la insulina
regulacin negativa de la red de PI3K / AKT Papel de LAT2 / NTAL / LAB en la
PI5P, PP2A y IER3 Regular PI3K / AKT sealizacin movilizacin de calcio
PIP3 activa la sealizacin de AKT signalosome GAB1
PI3K / AKT activacin
ER a Golgi antergrada Transporte transporte antergrado COPI
El transporte al Golgi y posterior modificacin mediada
glicosilacin ligada a N Asparagina
Longevidad regulacin va de la regulacin de la longevidad La regulacin de la liplisis en los
de va - mltiples
especies Longevidad regulacin de va - mltiples especies adipocitos

22. Interaccin con otras protenas

RPS6KB1 protena ribosomal S6 quinasa, 70 kDa, polipptido 1; Serina / treonina-protena quinasa que acta aguas
abajo de la sealizacin de mTOR en respuesta a factores de crecimiento y nutrientes para promover la
proliferacin celular, el crecimiento celular y la progresin del ciclo celular. Regula la sntesis de protenas
a travs de la fosforilacin de eIF4B, RPS6 y eEF2K, y contribuye a la supervivencia celular mediante la
represin de la funcin pro-apopttica de BAD. En condiciones de agotamiento de los nutrientes, la
forma inactiva esta asociada con el complejo de iniciacin de la traduccin eIF3.
NCK2 NCK protena adaptadora 2; protena adaptadora que se asocia con tirosina receptores del factor de
crecimiento fosforilados o sus sustratos celulares. Mantiene los niveles bajos de fosforilacin EIF2S1
promoviendo su defosforilacin por PP1.
FOXA1 caja forkhead A1; factor de transcripcin que est involucrado en el desarrollo embrionario, el
establecimiento de la expresin gnica especfica de tejido y la regulacin de la expresin gnica en
tejidos diferenciados. Est pensado para actuar como factor de un 'pionero' abrir la cromatina
compactada para otras protenas a travs de interacciones con histonas del ncleo nucleosomal y
sustituyendo as histonas enlazador en potenciador de destino y / o sitios de promotor. Se une al ADN con
la secuencia de consenso 5 '- [AC] A [AT] T [AG] TT [GT] [AG] [CT] T [CT] -3' (por similitud). Propuesto para
desempear un papel en la traduccin de las firmas epigenticos en el tipo de clulas SPE [...] (472 bis)
EXOC4 exocyst componente complejo 4; Componente del complejo exocyst implicado en el acoplamiento de
vesculas exocticas con sitios de fusin en la membrana plasmtica (por similitud) (974 aa)
SNAP25 protena sinaptosomal asociada, 25 kDa (206 aa)
PCSK2 proprotena convertasa subtilisina / Kexin tipo 2 (638 aa)
PIK3CA fosfatidilinositol-4,5-bifosfato 3-quinasa, cataltica subunidad alfa; Fosfoinostido 3-quinasa (PI3K) que
fosforila PtdIns (fosfatidilinositol), PtdIns4P (fosfatidilinositol 4- fosfato) y PtdIns (4,5) P2 (fosfatidilinositol
4,5-bifosfato) para generar fosfatidilinositol 3,4,5-trifosfato (PIP3 ). PIP3 juega un papel clave mediante el
reclutamiento de protenas que contienen el dominio de PH a la membrana, incluyendo AKT1 y PDPK1, la
activacin de cascadas de sealizacin implicadas en el crecimiento celular, la supervivencia, la
proliferacin, motilidad y morfologa. Participa en la sealizacin celular en respuesta a variou [...] (1068
aa)
ATP6V0A1 ATPasa, transportador de H +, lisosomal V0 subunidad a1; Necesarias para el ensamblaje y la actividad de
la ATPasa vacuolar. papel potencial en la orientacin y la regulacin de la enzima diferencial para un
orgnulo especfico (por similitud) (838 aa)
PIK3R1 fosfoinostido-3-quinasa, subunidad reguladora 1 (alfa) (724 aa)
ATP6V0D1 ATPasa, transportador de H +, lisosomal 38 kDa, V0 subunidad d1; Subunidad del complejo V0 de
membrana integral de ATPasa vacuolar. ATPasa vacuolar es responsable de la acidificacin de una
variedad de compartimentos intracelulares en clulas eucariticas, proporcionando as la mayor parte de
la energa necesaria para los procesos de transporte en el sistema vacuolar. Puede desempear un papel
en el acoplamiento de transporte de protones y la hidrlisis de ATP (por similitud) (351 aa)
PRKCI protena quinasa C, iota; Calcio y serina / treonina-protena quinasa diacilglicerol-independiente que
desempea un papel protector contra los estmulos apoptticos en general, est implicado en la
activacin de NF-kappa-B, la supervivencia celular, la diferenciacin y la polaridad, y contribuye a la
regulacin de la dinmica de los microtbulos en los primeros va secretora. Es necesario para la
resistencia mediada por oncogenes BCR-ABL a drogas apopttica en clulas de leucemia, la proteccin de
las clulas de leucemia contra la apoptosis inducida por frmacos. En las neuronas cultivadas, previene
amiloide beta apoptosis inducida por la protena mediante la interrupcin de proceso de la muerte celular
a una [...] (596 aa)
FOXA2 caja forkhead A2; factor de transcripcin que est involucrado en el desarrollo embrionario, el
establecimiento de la expresin gnica especfica de tejido y la regulacin de la expresin gnica en
tejidos diferenciados.
ATP6V0A2 ATPasa, transportador de H +, lisosomal V0 subunidad a2; Parte de la canal de protones de V-
ATPasas. Componente esencial de la maquinaria endosomal pH de deteccin. Puede desempear un papel
en el mantenimiento de las funciones de Golgi, tales como la maduracin de glicosilacin, mediante el
control del pH de Golgi (856 aa)
EXOC7 exocyst componente complejo 7 (735 aa)
CAV1 caveolina 1, protena caveolae, 22 kDa; Puede actuar como un andamio de protenas dentro de las
membranas caveolar. Interacta directamente con subunidades alfa-protena G y puede regular
funcionalmente su actividad (por similitud). Participa en la seal coestimuladora esencial para receptor de
clulas T (TCR) - mediada por la activacin de clulas T. Su unin a DPP4 induce la proliferacin de clulas
T y la activacin de NF-kappa-B de una forma del receptor de clulas T / CD3 dependiente.

PTPN11 protena tirosina fosfatasa, tipo no receptor 11; Hechos aguas abajo de diversos receptor y protena
tirosina quinasas citoplsmicas participar en la transduccin de seales desde la superficie celular al
ncleo. Desfosforila ROCK2 en Tyr-722 resultante en stimulatation de su actividad de unin RhoA (593 aa)

STXBP1 protena 1 de unin sintaxina; Puede participar en la regulacin del acoplamiento de la vescula sinptica
y la fusin, posiblemente a travs de la interaccin con protenas de unin a GTP. Esencial para la
neurotransmisin y se une sintaxina, un componente de la maquinaria de fusin de vesculas sinpticas
probablemente en una proporcin de 1-1. Pueden interactuar con syntaxins 1, 2, y 3, pero no syntaxin 4.
puede jugar un papel en la determinacin de la especificidad de las reacciones de fusin intracelulares
(603 aa)
PAX6 Paired box 6; factor de transcripcin con funciones importantes en el desarrollo del ojo, nariz, sistema
nervioso central y el pncreas. Requerido para la diferenciacin de clulas de los islotes alfa del pncreas
(por similitud). Compite con PAX4 en la unin a un elemento comn en los promotores de glucagn,
insulina y somatostatina.

SLC30A6 familia de portador de soluto 30 (transportador de zinc), miembro 6; Zinc-transportador de eflujo que
asigna el zinc citoplsmica a la red trans-Golgi (TGN), as como el compartimiento vesicular (por similitud)
(501 aa)
FoxO1 caja forkhead O1; factor de transcripcin que es el principal objetivo de la sealizacin de la insulina y
regula la homeostasis metablica en respuesta al estrs oxidativo. Se une al elemento de respuesta a
insulina (IRE) con la secuencia de consenso 5 '-TT [/ A G] TTTTG-3' y el elemento de unin relacionada DAF-
16 familia (DBE) con la secuencia consenso 5'-TT [/ A G] TTTAC -3' . Actividad suprimida por la
insulina. principal regulador del equilibrio redox y los nmeros de osteoblastos y la masa controles
hueso. Orquesta la funcin endocrina del esqueleto en la regulacin de metabolismo de la glucosa.
Ptpra protena tirosina fosfatasa, de tipo receptor, A (802 aa)
ERO1L ERO1-como (S. cerevisiae); oxidorreductasa esencial que oxida las protenas en el retculo endoplsmico
para producir enlaces disulfuro. Hechos por oxidacin directamente P4HB / PDI isomerasa a travs de un
intercambio de disulfuro directa. No acta como un oxidante directo del sustrato plegado, pero depende
de P4HB / PDI para transferir equivalente oxidante.
SLC30A5 familia de portador de soluto 30 (transportador de zinc), miembro 5; Funciona como un transportador de
zinc. Puede ser un transportador de zinc en clulas beta con el fin de formar cristales de insulina. En parte,
regula la homeostasis del zinc celular. Requiere con ZNT7 para la activacin de las enzimas de zinc que
requieren, fosfatasas alcalinas (ALPS). Transporta zinc en los lmenes del aparato de Golgi y
compartimentos vesiculares donde ALPs localizar, por lo tanto, la conversin de apoALPs a holoALPs.
GRB10 protena unida al receptor del factor de crecimiento 10 (594 aa)
Vas de sealizacin de la Insulina

Genmica comparativa

23. Homologa
Organism Taxonomy Gene Similarity Type
mouse Mammalia Ins2 34 16 35 82.42 (n)
(Mus musculus)
Ins1 35 80 (a) OneToMany
chicken Aves INS 34 35 65.42 (n)
(Gallus gallus)
lizard Reptilia -- 35 55 (a) OneToMany
(Anolis carolinensis)
zebrafish Actinopterygii ins 34 35 61.78 (n)
(Danio rerio) insb 35 31 (a) ManyToMany

Este gen tiene 5 transcripciones ( variantes de empalme) , 51 orthologues , 1 paralogue , es un

miembro de 1 familia de protenas Ensembl y se asocia con 6 fenotipos .
rbol de genes
 24. Polimorfismos

Las variaciones de secuencia de bpSNP del gene INS.

Genecard nos da un resultado de 370 variantes polimrficas y 48,7% de todos los genes tiene mayor
probabilidad de ser causantes de enfermedades.

SNP Posicin Secuencia AA Type

Cromosoma11
rs112812 2,161,918(+) TCCCC(A/G)GACCC R [Arg] H [His] upstream-variant-2
956 5 KB
rs113412 2,160,503(+) GGCTG(A/C/T)GGGGC - intron-variant
173 5
rs115109 2,162,282(+) TCCTG(A/G)CCCCC - upstream-variant-2
269 5 KB
rs115576 2,160,978(-) TGTCC(C/T)TCTGC -- nc-transcript-varian
05 5 t, utr-variant-5-prim
e
rs115576 2,159,848(-) AGACG(C/T)AGCCC -- intron-variant, utr-v
06 5 ariant-3-prime

Referencia Bibliogrfica

Genecard: Insulin: http://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=INS

Uniprot INS HUMAN: http://www.uniprot.org/uniprot/P01308

Online Tools for Bioinformatics Analyses in Nutrition Sciences

 4. BioSystems
Nos muestra el biosistema que rodea a la protena de bsqueda, algunos ejemplos que podemos
agregar al trabajo son 2, de los importante la regulacin en la secrecin de la insulina y la
importacin de glucosa en respuesta al estimulo de la insulina.

1) Regulacin de la secrecin de insulina:

Cualquier proceso que modula la frecuencia, velocidad o la extensin de la liberacin regulada
de insulina: genes relacionados y sistemas biolgicos relacionados.
2) Importacin de glucosa celular en respuesta al estmulo de insulina.

El movimiento dirigido de la glucosa (monosacrido) en una clula como resultado del estmulo
de insulina:

Los genes relacionados con la importacin de glucosa; como se puede observar la mayora son
genes que codifican transportadores. Como se observa a continuacin, las protenas implicadas
en la importacin de la glucosa por el estimulo de insulina:
 5.

Esta pagina permite encontrar las diferentes mutaciones del gen que codifica la insulina, aquellos
que estn relacionadas a diversas enfermedades, as como su dominio y la familia de genes que
se relacionan, como se muestra a continuacin:

Nos despliega una tabla con los posibles genes afectados e involucrados en las distintas
enfermedades.
Adems nos da redireccin a NCBI y nos permite ver la secuencia conservada de la familia y el
dominio de insulina entre diferente especies.
Familia de protenas de dominio conservado: Insulina
La insulina / IGF familia / relaxina
Superfamilia incluye insulinas; relaxinas; similar a la insulina factor de crecimiento; y bombyxin.
Todo se secretan hormonas reguladoras. Rica en disulfuro, doblez todo-alfa. La alineacin incluye
cadena B, enlazador (que se procesa fuera del producto final), y una cadena A. Se puede observar
que la alineacin de color rojo representa que tan conservada eta esa secuencia.

IlGF_like familia, subgrupo insulin_like, especfico para los vertebrados. Los miembros incluyen un
nmero de pptidos como la insulina y I y II factores de crecimiento similares a la insulina, que
desempean una variedad de funciones en los procesos que controlan tales como el metabolismo,
el crecimiento y la diferenciacin, y la reproduccin. A nivel celular que afectan el ciclo celular, la
apoptosis, migracin celular y la diferenciacin. Con la excepcin de los factores de crecimiento
similares a la insulina, las formas activas de estas hormonas peptdicas estn compuestos de dos
cadenas (A y B) unidos por dos enlaces disulfuro; la disposicin de cuatro cistenas se conserva en
la "A" de la cadena: Cys1 est unida por un enlace disulfuro a Cys3, Cys2 y Cys4 estn unidos por
enlaces disulfuro intercatenarios de cistenas en la cadena "B". Esta alineacin contiene ambas
cadenas, adems de la regin de engarce que interviene,
dispuestos como se encuentra en la forma de
propptido. Propptidos se escinden para producir dos
cadenas separadas enlazado covalentemente por los dos
enlaces disulfuro.
 6.

Permite al usuario encontrar artculos y

publicaciones sobre diversas investigaciones del
papel del gen y la protena; en este caso la
insulina y alguna enfermedad especifica, por
ejemplo:

Grasa perirrenal y epiddimo afecta el

metabolismo heptico en ratas.

Ben-Shlomo S, Einstein FH, Zvibel I, Atias D, Shlomai A, Halpern Z, Barzilai N, Fishman S.

Obesidad (Silver Spring). 2012 Ene; 20 (1): 151-6.

El presente estudio examin si el (PEVF) depot perirrenal y epiddimo grasa visceral bajo exceso de
nutrientes a corto plazo protegida el hgado atrapando cidos de nutrientes derivada de no
esterificados grasos libres (NEFA) o tena efectos deletreos sobre los triglicridos hepticos (TGs)
acumulacin y resistencia a la insulina debido a adipokine secrecin. Las ratas jvenes
preventivamente se sometieron a las operaciones de remocin PEVF o sham quirrgicos y fueron
alimentadas ya sea con dieta alta en grasas (HFD) (PEVF-HFD) o Chow regular (RC) (PEVF-RC) durante
3 das. Sensibilidad a la insulina se midi por pinza hiperinsulinmico euglucmico. Se evaluaron
hgado TG, NEFA srica, y adipoquinas derivadas de la grasa. La insulina y la sealizacin de la
lipognesis se evaluaron mediante transferencias Western. eliminacin PEVF Preferente disminuye
significativamente la supresin inducida por la insulina de la produccin de glucosa heptica (HGP),
tanto en RC y en ratas alimentadas-HFD. De acuerdo con los resultados de la abrazadera, la
acumulacin de TG heptica tambin se reduce significativamente por PEVF escisin tanto en RC y
ratas alimentadas-HFD. Estos resultados se validaron adicionalmente por los resultados de la
sealizacin de insulina, que muestran que la eliminacin PEVF preventivo aumenta la fosforilacin
de Akt heptica, independientemente de la dieta. Notablemente, los altos niveles de leptina en
suero inducidos por HFD se reducen significativamente mediante escisin PEVF preventiva. Adems,
la expresin de lipognica enzima p-acetil-CoA-carboxilasa, que denota reducida lipognesis, se
aumenta en las ratas PEVF-HFD. En conclusin, PEVF tiene un efecto perjudicial sobre el hgado
como fuente de insulina adipoquinas inductoras de resistencia independientemente de la dieta, y
no sirve como un amortiguador para el exceso de nutrientes.

Referencia Bibliogrfica
National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine,
BioSystem: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/biosystems/
Peterson, T.A., Adadey, A., Santana-Cruz ,I., Sun, Y., Winder A, Kann, M.G., (2010)
DMDM: Domain Mapping of Disease Mutations. Bioinformatics 26 (19), 2458-2459.
http://bioinf.umbc.edu/dmdm/generatelogo.php?accession=pfam00049
Roadmap Epigenomics Project - Publications http://www.roadmapepigenomics.org/data/,
www.roadmapepigenomics.org/publications