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Gentica molecular bacteriana

Unidad 1. Flujo de informacin gentica

Ingeniera en Biotecnologa

Noveno cuatrimestre

Gentica molecular bacteriana

Unidad 1. Flujo de informacin gentica

Clave

190930933

Universidad Abierta y a Distancia de Mxico

Ciencias de la Salud Biolgicas y Ambientales | Ingeniera en Biotecnologa


Gentica Molecular Bacteriana
Unidad 1. Flujo de informacin gentica

Unidad 1. Flujo de informacin gentica

Presentacin de la Unidad

Dentro del dominio bacteria se incluye una diversidad de microorganismos que residen en
diferentes ambientes. Entre sus caractersticas de sobrevivencia, destaca su plasticidad
adaptativa y la capacidad de responder a condiciones de estrs.

Desde mediados del siglo XX, con el auge de disciplinas como la gentica y la tecnologa
del ADN recombinante, se inici el estudio de la gentica bacteriana como una de las
alternativas para comprender cmo las bacterias responden a estmulos de estrs. Desde
este punto de vista, los trabajos de investigadores como Avery-MacLeod-Mcarty (1944) y
Watson-Crick-Franklin-Wilkins (1953), entre muchos otros, sirvieron como bases de los
paradigmas que se revisarn en la presente unidad, la cual abarca la replicacin del cido
desoxirribonucleico (ADN) como molcula que porta la informacin hereditaria, as como
generacin y maduracin del ARNm y la traduccin de protenas, generando lo que se
conoce como flujo de informacin gentica.

Paralelamente al desarrollo de la ciencia bsica, a finales del siglo XX y principios del


presente, dichos avances conceptuales han sido los cimientos de lo que se ha
denominado biotecnologa, referida en la Convencin de Diversidad Biolgica como la
aplicacin tecnolgica que utiliza sistemas biolgicos y organismos vivos o sus derivados
para la creacin o modificacin de productos o procesos para usos especficos
(Convention on Biological Diversity; Art 2. ONU. 1992). Posteriormente, el Dr. Xavier
Soberon (1996) enfatiz: Lo que podemos llamar nueva biotecnologa o biotecnologa
moderna, es la que se sirve de las tcnicas de ADN recombinante para realizar la mejora
de los seres vivos, con miras a su utilizacin. Se habla hoy, por tanto, de que nos
encontramos en la era de la biotecnologa. Sin embargo, para poder ahondar en el
rea biotecnolgica desde un punto de vista tico y acadmico serio, es indispensable
conocer las bases tericas de los procesos biotecnolgicos que se desarrollan en la
industria.

Propsitos de la unidad

Describir el flujo de informacin gentica, as como los procesos de mutagnesis


bacteriana, mediante la revisin de temas selectos para poder direccionarlos a la industria
biotecnolgica.

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Unidad 1. Flujo de informacin gentica

Competencia especfica

Relacionar los procesos moleculares bacterianos mediante la descripcin del flujo de


informacin gentica para definirlos como eventos susceptibles de modificacin
biotecnolgica.

Temario de la Unidad

1. Flujo de informacin gentica

1.1. De la secuencia de ADN a la generacin de protenas


1.1.1. ADN bacteriano y su replicacin
1.1.2. Transcripcin de ARNm
1.1.3. Traduccin de protenas

1.2. La mutacin de cidos nucleicos conlleva a la variabilidad gentica


1.2.1. Definicin de mutacin
1.2.2. Tipos de mutaciones
1.2.3. Descripcin de mutagnesis dirigida para la obtencin de bacterias
genticamente modificadas (BGM)

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Unidad 1. Flujo de informacin gentica

1. Flujo de informacin gentica

1.1. De la secuencia de ADN a la generacin de protenas

Los procariontes (microorganismos unicelulares sin ncleo definido) estn conformados


por los dominios Archea y Bacteria, de acuerdo al anlisis filogentico de ARN ribosomal
16S (rARN). Particularmente el dominio Bacteria, tambin llamado eubacteria (bacterias
verdaderas), est conformado por una gran diversidad de organismos que incluyen
hipertrficos, anaerobios, as como bacterias grampositivas, gramnegativas,
cianobacterias y proteobacterias.

Su distribucin es cosmopolita, y habitan ambientes extremos como agua dulce, salubre,


zonas calientes y fras; pero tambin se alojan como parsitos en animales o forman
asociaciones mutualistas con otros organismos (Curtis, et al., 2008). Esta capacidad
colonizadora y adaptativa fue una de las inquietudes para estudiar su base gentica, es
decir, la organizacin de su genoma, definido como el conjunto de genes dentro del
organismo, tanto en su cromosoma como en sus elementos genticos extracromosmicos
(Murray, et al., 2009).

Por otra parte, se recordar que el flujo de informacin gentica est definido como los
procesos involucrados en la generacin de un fenotipo a partir de un genotipo. En
trminos moleculares, se refiere a la expresin de una protena a partir de una secuencia
de ADN, cuyos paradigmas generaron el Dogma Central de la biologa molecular (Fig. 1;
Lodish, et. al., 2005; Alberts, et. al., 2010).

Fig. 1. Representacin de las investigaciones del siglo XX que generaron el Dogma Central de la
Biologa Molecular. El cido desoxirribonucleico (ADN) es la molcula que porta la informacin

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hereditaria (genoma), el cual es replicado durante la proliferacin celular. Es reparado cuando hay
dao mnimo (es importante sealar que si el dao es severo, no hay reparacin) y hay intercambio
(recombinacin) con otras molculas de ADN. Este ADN es interpretado por complejos proteicos
para generar molculas de cido ribonucleico (ARN) a travs de la transcripcin, generando tres
tipos de ARN: ARN mensajero (ARNm), ARN ribosomal (ARNr), y ARN de transferencia (ARNt).
Particularmente, la secuencia del ARNm es la encargada de portar la informacin para producir
una cadena polipeptdica (protena) por medio del proceso denominado traduccin (Figura tomada
de Alberts, et al., 2010).

Como se aprecia en la figura anterior, el flujo de informacin gentica involucra la sntesis


de tres molculas, es decir, ADN, ARN y protenas. Para comprender la complejidad de
estos procesos es preciso recordar su estructura, por tanto, se abordar de manera
general la composicin de las mismas.

Los cidos nucleicos (ADN y ARN) presentan estructuras primarias similares, es decir,
son polmeros lineales cuyo esqueleto principal es una cadena de azcar (pentosa)
fosfato, unido por enlaces fosfodister entre el carbono 5 de una azcar y el carbono 3
de la azcar contigua, por tanto, tienen direccionalidad denominada 5 3 (Fig. 2a). La
unidad bsica de estas cadenas es denominada nucletido, y estn compuestos por un
azcar (Desoxirribosa para el ADN, y ribosa para el ARN); una base orgnica unida al
carbono 1 de la pentosa, y un grupo fosfato unido al carbono 5 del azcar (Fig. 2b). Se
conocen dos tipos de nucletidos de acuerdo al tipo de base nitrogenada, es decir,
purinas que contienen dos anillos fusionados (Adenina A y Guanina G ) y las
pirimidinas (Citocina C ; Timina T y Uracilo U ; Fig 2c.). Estructuralmente, las
diferencias entre ADN y ARN son el azcar (Desoxirribosa y ribosa, respectivamente) y la
timina contenida en el ADN, reemplazada en el ARN por el uracilo (Lodish, et al., 2010;
Alberts, et al., 2010).

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a. b.

c.

Fig.2. Los cidos nucleicos presentan la misma estructura bsica. (a) Esqueleto de desoxirribosa
fosfato, se denota en enlace fosfodister, la direccionalidad 5 3 y las base nitrogenada (C, A y
G). (b) Azcar ribosa (izquierda) que distingue al ARN del ADN que contiene una desoxirribosa
(derecha); la diferencia es el grupo hidroxilo en el carbono 2 del azcar. (c) Bases nitrogenadas
unidas al esqueleto azcar fosfato. El (*) denota el nitrgeno donde se une la azcar a la base
(Figura modificada de Lodish, et al., 2010).

El ADN est formado por dos cadenas de polinucletidos que forman una doble hlice
antiparalela. Su organizacin involucra el esqueleto exterior de desoxirribosa fosfato, y
un interior de bases nitrogenadas apareadas, es decir, Adenina genera dos enlaces de
hidrgeno con la Timina (A=T) y la Citosina genera tres puentes de hidrgeno con la
Guanina (C=G; Fig. 3). Esta doble cadena se estabiliza por la interaccin de miles de
enlaces de H, as como por las fuerzas hidrofbicas entre las bases adyacentes de la
hlice (Lodish, et al., 2005). La estructura descrita por Watson y Crick (1953) presenta un
giro a la derecha, con una separacin de 0.36 nm entre cada par de bases (pb), por lo
tanto, para un giro completo de la hlice, abarca 3.6 nm, es decir, alrededor de 10 pb. Con
estas caractersticas se distingue un surco mayor y un surco menor (Fig. 3; Lodish, et al.,
2005; Alberts, et al., 2010).

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Fig. 3. Estructura clsica del ADN. (a) Modelo espacial de ADN B, en azul y rojo se denotan los
esqueletos de azcar fosfato de los dos polinucletidos; las flechas denotan la direccionalidad de
los mismos. En el interior se representan las bases nitrogenadas apareadas, as como el surco
mayor y surco menor observado en esta conformacin. (b) Esquema que representa los puentes
de hidrgeno durante el apareamiento purinas pirimidinas dentro de la molcula de ADN (Figura
tomada de Lodish, et al., 2005).

Por su parte, el ARN de procariotas son molculas de cadena sencilla que, como se
mencion, constan de un esqueleto de azcar ribosa fosfato y las bases nitrogenadas
(A, U, C y G). Debido al grupo OH de la ribosa en el C 2, el ARN es ms susceptible a
degradacin, y pueden formar doble cadena con otras molculas de RNA o generando un
hlice hibrida con ADN. Sin embargo, es ms comn encontrarlas como cadena sencilla y
adoptando conformaciones particulares que dependen de la longitud y tipo de ARN; por
ejemplo, estructuras tipo horquilla, formadas por bases separadas entre 5 10 nt, y los
llamados tallos bucle, apareamientos formados entre bases separadas por nucletidos
(Fig. 3). Este tipo de estructuras son relevantes en molculas de ARN que presentan
actividad cataltica como los ARN ribosomales o estructural como los ARN de
transferencia, sin embargo, los ARN mensajeros encargados de portar la informacin
gentica tambin pueden presentar estructuras tipo tallo-asa que intervienen en los
procesos de traduccin y regulacin de la expresin de la expresin gnica (Lodish, et al.,
2005; Alberts, et al., 2010).

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Fig. 3. Estructuras secundarias adoptadas por ARN de cadena sencilla. En ARNr y ARNt, este tipo
de plegamiento es esencial para funciones especficas de las molculas (Figura tomada de Lodish,
et al., 2005).

Las otras macromolculas involucradas en el flujo de informacin gentica son las


protenas, que, desde el punto de vista molecular, es el fenotipo resultante de la expresin
del genotipo; es decir, son las molculas operadoras de la clula. Clasificarlas ha sido un
trabajo extenuante y casi imposible, sin embargo, se sabe que presentan diversas
funciones como estructurales, transportadoras, reguladoras, motoras, catalticas, etc.

Las protenas son polmeros lineales de longitud variable. Cuentan con un esqueleto
formado por N amido, un carbono (C) y el C carbonilo de cada aminocido presente en
el polipptido, pero tambin presentan polaridad, es decir, en un extremo presentan un
residuo amino libre (N terminal, representado siempre a la izquierda), y del otro lado,
residuo carboxilo libre (C- terminal, representado a la derecha; Lodish, et al., 2010).

La unidad bsica de las protenas son los aminocidos, formados por un carbono (C),
un grupo amino (-NH2), un grupo carboxilo (-COOH), un Hidrgeno (-H) y una cadena
lateral variable (-R; Fig. 4). La cadena lateral de los aminocidos le confiere diversas
propiedades; es decir, por la posicin del C se generan dos tipos de aminocidos
posibles, de los cuales slo los L-aminocidos estn presentes en la naturaleza. Por otra
parte, la cadena R vara tambin en tamao, forma, carga, solubilidad en el agua y
reactividad, por lo que pueden ser clasificados segn las propiedades de sus cadenas
laterales en: Polares, No Polares, y aminocidos con carga (Fig. 4b). Los aminocidos
estn unidos por medio del enlace covalente, es decir, un enlace amido entre el grupo
carboxilo de un aminocido, y el grupo amino del siguiente, conocido como enlace
peptdico (Fig. 4c).

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Fig. 4. Estructura bsica de los aminocidos. (a) El C de los aminocidos es asimtrico, excepto
de la Gly, por lo que se pueden formar imgenes especulares designadas D y L, cuyas funciones
biolgicas son distintas. (b) Lista de los 20 aminocidos y su clasificacin. (c) Ilustracin del enlace
peptdico entre dos amiocidos (Figuras modificadas de Lodish, et al., 2013 y
http://laguna.fmedic.unam.mx/~evazquez/0403/enlace peptidico.html)

Para entender el comportamiento de las protenas, se han diferenciado niveles de


organizacin de acuerdo a la complejidad observada en ellas, siendo la estructura
primaria la organizacin ms simple y considerada como la secuencia de aminocidos
sin ninguna alteracin. Por otra parte, debido a las caractersticas de las cadenas laterales
de los aminocidos, a la naturaleza rgida del enlace peptdico, y la combinacin de
residuos contenidos en la cadena, al menos el 60% de los residuos de aminocidos
contenidos en la secuencia primaria adquieren diferentes conformaciones bsicas,
conocidas como hlices y hojas , generando lo que se conoce como estructura
secundaria de la protena, la cual se estabiliza por puentes de hidrgeno entre las
cadenas laterales de los aminocidos y se sugiere que son elementos de sostn (Fig. 5a).
El siguiente nivel de organizacin es la estructura terciaria, y se refiere a la conformacin
tridimensional de la protena, que incluye dominios de estructura secundaria estabilizados
mediante interacciones hidrofbicas de las cadenas laterales no polares, puentes de

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hidrgeno entre residuos polares y enlaces peptdicos (Fig. 5b). Alternativamente, se ha


denominado la interaccin entre polmeros plegados como estructura cuaternaria, como
en el caso de la hemoglobina, formada por cuatro monmeros de la protena (Fig. 5c).

Fig. 5 Representaciones de los niveles de organizacin de las protenas. (a) Se denotan diferentes
representaciones de hlices y hojas . (b) Representaciones de la estructura terciaria integrada
por diferentes dominios estructuras secundarias estabilizadas diferentes tipos de interacciones. (c)
Representacin de la estructura de la hemoglobina como modelo de una protena estructurada en
mdulos. Las representaciones denotadas incluyen listones y flechas (ms empleadas), esferas y
bastones, trazando slo la cadena principal (figuras modificadas de Lodish, et. al., 2005;
http://themedicalbiochemistrypage.org/es/protein-structure-sp.php;
http://en.citizendium.org/wiki/Protein_structure:
http://www.cryst.bbk.ac.uk/PPS2/course/section8/ss-960531_5.html).

Se ha revisado la estructura y forma de las macromolculas involucradas en el flujo de


informacin gentica, sin embargo, es esencial revisar los procesos que originan a los
cidos nucledos y protenas a nivel subcelular para tener un panorama general de los
eventos susceptibles de alteracin con metodologas que se revisarn en el presente
curso.

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1.1.1. ADN bacteriano y su replicacin

Toda la informacin gentica de bacterias se encuentra contenida en una molcula de


ADN de doble cadena y circular; molcula que se conoce como cromosoma bacteriano
(Alberts, et al., 2010).

Sin embargo, la mayora de las bacterias contienen, adems, ADN extra cromosmico
denominado ADN plasmdico, ya que se encuentra contenido en estructuras llamadas
plsmidos. La informacin gentica contenida en ellos codifica para funciones no
esenciales para la bacteria, aunque tambin puede contener genes que permiten
adaptarse a diversos medios; genes de resistencia a antibiticos, toxicidad, entre otros
que se abordarn en detalle en la Unidad 2.

El ADN circular tiene la capacidad de adquirir una estructura superenrollada que le


permite compactarse en nucleosomas en la bacteria. Las bacterias poseen enzimas
capaces de alterar la estructura del ADN, introduciendo (enzima girasa) o eliminando
(enzima topoisomerasa) vueltas en la estructura superenrollada para permitir la
replicacin y transcripcin (Fig. 6; Betancor, et. al., 2006).

Figura 6. Diversas estructuras del cromosoma bacteriano. Esquema de la estructura de un


cromosoma bacteriano relajado (ambos extremos) y superenrollado (estructura central) por accin
de las enzimas: topoisomerasa que elimina vueltas en las hebras de ADN, y la enzima girasa que
introduce vueltas en la misma. (Betancor, et. al., 2006).

Replicacin

La replicacin es el proceso para duplicar el ADN durante la proliferacin celular para


conservar la informacin gentica. Este proceso se realiza de forma exacta justo antes de
cada divisin celular. Adems de exacto, este proceso se caracteriza por ser rpido; la
velocidad de replicacin del DNA en bacterias es aproximadamente de 500 nucletidos

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por segundo, mientras que en mamferos es de unos 50 nucletidos por segundo (Alberts,
et al., 2010).

La unidad que contiene todos los elementos necesarios para duplicar el material gentico
es denominada replicn. En bacterias, este proceso se caracteriza por iniciar en un mismo
punto de origen; ste se mueve hasta completar la replicacin del cromosoma completo.
El punto inicial constituye la regulacin de la replicacin, es decir, una vez iniciado el
proceso, se replica el cromosoma completo (Betancor, L., et. al., 2006).

La horquilla de replicacin se refiere a la regin donde se est duplicando el ADN. Se


denomin como horquilla debido a su forma de Y; dependiendo del nmero de horquillas
que se generen, la replicacin puede ser unidireccional o bidireccional, como se muestra
en la figura 7. La generacin de la estructura de horquilla se debe al desempalme de las
dos cadenas de ADN en la regin de replicacin.

Figura 7. Imagen y esquema de replicacin bidireccional en un cromosoma bacteriano. A la


izquierda, micrografa de un cromosoma bacteriano durante el proceso de replicacin bidireccional.
A la derecha, esquema de la micrografa mostrada en la parte izquierda, donde se denotan los
puntos donde se encuentran las horquillas de replicacin (del ingls, replication forks; Alberts, et.
al., 2010).

El proceso de replicacin sucede al mismo tiempo en ambas hlices de ADN mediante la


accin de un complejo enzimtico que contiene al ADN polimerasa. Debido a que las
hlices del ADN son antiparalelas, y que la direccin del proceso de replicacin es 53,
es necesaria la sntesis de un fragmento de ADN en la cadena antisentido. Este
fragmento se denomina fragmento de Okasaki, y se sintetiza a partir de un cebador que
permite sintetizar en direccin correcta (53) la cadena antisentido, generando
fragmentos que, posteriormente, sern unidos por la enzima ligasa (Alberts, et al., 2010).

Se puntualiza que la replicacin es semiconservativa, es decir, al replicarse la doble


cadena, las cadenas generadas contienen una hebra de la cadena parental y una
recientemente sintetizada (Fig. 8). Las enzimas que catalizan la replicacin de ADN se
llaman polimerasas de ADN. Se ha caracterizado tres enzimas polimerasas, la polimerasa
III es la encargada de la mayor parte del proceso de replicacin, mientras que la I y II
tienen mayor funcin en reparacin de errores de la replicacin. Por su parte, las enzimas

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helicasas son las responsables de desenrollar el ADN en la horquilla de replicacin


(Betancor, et al., 2006; Alberts, et al., 2010).

Figura 8. Esquema de la caracterstica semiconservativa del ADN en la replicacin. Se observa en


el esquema cmo, durante la replicacin del ADN, se generan dos dobles hlices completamente
idnticas al constituirse de ambas una nueva cadena (new strand) y la cadena recin sintetizada.
(Betancor, et al., 2006).

A continuacin se describen las enzimas involucradas en el proceso de replicacin


(Alberts, et al., 2010):

- Helicasa, enzima encargada de abrir la cadena de ADN en dos hlices para su


replicacin, permitiendo la unin del complejo enzimtico encargado de la adicin
de nucleotidos y reparacin de las hebras.

- ADN polimerasa I, sintetiza los cebadores, sintetiza en sentido 35, y colabora


con algunos procesos de reparacin.

- ADN polimerasa II, esta enzima se involucra en los sistemas de reparacin.

- ADN polimerasa III, encargada de la adicin de los nucletidos en la nueva


cadena de ADN que se est sintetizando.

- Toposimerasas, estas enzimas estabilizan las hlices de ADN en el momento en


que se encuentran separadas, manteniendo stas como cadena sencilla mientras
se realiza la adicin de nucletidos, es decir, la replicacin.

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- Ligasa, enzimas encargadas de insertar pequeos fragmentos de nucletidos


complementarios en zonas entre fragmentos en las cadenas; en ocasiones son
utilizadas como un sistema de reparacin del ADN.

La replicacin se divide en tres fases:

1. Iniciacin. A partir del punto de origen, se genera una o dos horquillas de


replicacin, debido a la accin de las helicasas que cooperan en la unin del
complejo proteico de replicacin. Primeramente, se genera un pequeo fragmento
de ADN (oligonucletido) conocido como cebador, a partir del cual se adhieren los
nucletidos correspondientes en la nueva cadena.

2. Elongacin. Esta etapa consiste en el avance de la horquilla de replicacin,


adicionando las bases complementarias. La adicin de las bases es funcin de la
enzima polimerasa III. La direccin de este proceso es de 5 3, donde se va
extendiendo la cadena a partir del cebador debido a la adicin de nucletidos.

3. Terminacin. Las regiones terminales son fragmentos de ADN que contienen


secuencias que bloquean el avance de las horquillas y desestabilizan el complejo
de replicacin.

Esquematizacin del proceso de replicacin con las enzimas descritas en la seccin (Fig.
9).

Figura 9. Esquema del proceso de replicacin. Descripcin del proceso conteniendo las enzimas
involucradas en este proceso (Alberts, et al., 2010).

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Sistemas de reparacin

Un factor de mucha importancia durante la replicacin del ADN es la fidelidad con que se
sintetizan las nuevas cadenas. Debido al elevado recambio de nucletidos generados
cada vez que se replica el contenido gentico, las clulas contienden contra la
probabilidad de errores en este proceso mediante la implementacin de diferentes
procesos de reparacin (Alberts, et al., 2010).

Por otro lado, los procesos de reparacin se utilizan para responder a los daos
espontneos generados por factores del medio ambiente (mutaciones por lesiones
qumicas, radiaciones, etc.) y evitar que deleciones, adiciones o mutaciones en el material
gentico, pasen de generacin en generacin.

Observa el siguiente video donde se explica la replicacin de ADN:


http://www.youtube.com/watch?v=8xnmaj9m87s

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1.1.2. Transcripcin de ARNm

Para comprender este proceso se tiene que definir el concepto de gen como la "unidad de
ADN que contiene la informacin para especificar la sntesis de una nica cadena
polipeptdica o cido ribonucleico (ARN) funcional (tal como un ARNr ARNt; Lodish et
al., 2005). De manera general, casi todos los genes son codificantes, es decir, contienen
la informacin para generar protenas; sin embargo, alguna proporcin de ARN no genera
una cadena polipptidica, pero presenta algunas funciones esenciales para la regulacin
de procesos celulares como la traduccin: es el caso de los ARN ribosomales (ARNr) y
los ARN de transferencia (ARNt), que se describirn ms adelante.

La transcripcin est definida como el proceso mediado por un complejo enzimtico (ARN
polimerasa) por el que se genera cido ribonucleico (ARN) de cadena sencilla a partir de
un fragmento de ADN. Se han descrito tres tipos de molculas de ARN que, en caso de
bacterias, se sintentizan con la misma ARN polimerasa (Alberts, et al., 2010):

1) La funcin del ARN mensajero (ARNm), como se mencion anteriormente, es


transportar la informacin adquirida a partir de una cadena de ADN para la sntesis
de una protena. En el caso de bacterias, los ARNm pueden ser monocistrnicos
(portan la informacin de un gen) o policistrnicos (dentro de su secuencia llevan
la informacin necesaria para obtener dos o ms protenas maduras). Esta entidad
molecular tiene la regin central donde se encuentra el marco abierto de lectura
(ORF- del ingls Open Reading Frame) o la regin codificante del gen, es decir,
desde el codn de inicio hasta el codn de trmino de la transcripicin. En los
extremos 5 y 3 se encuentran regiones no codificantes denominadas Lider y
trailer, que contienen secuencias involucradas para la regulacin de la traduccin y
en la estabilidad del ARNm. Por su parte, los ARNm policistrnicos presentan
pequeas regiones espaciadoras (alrededor de diez nucletidos) que separan a
las diferentes regiones codificantes. Es importante denotar que cada cistrn tiene
su propio ORF. En la figura 10 se esquematiza un ARNm policistrnico con sus
partes principales.

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Figura 10. Esquema de un proceso de flujo de informacin gentica del opern de lactosa (Lac).
Se denota que el ARNm contiene ms de un gen (policistrnico); en regiones rojo, las regiones no
codificantes de los extremos; en amarillo y verde, los diferentes ORF (imagen obtenida de
http://pendientedemigracion.ucm.es/info/genetica/grupod/Operon/Operon.htm).

2) ARN ribosmico (ARNr) es la forma ms abundante de ARN en las clulas, ya que


constituyen a los ribosomas, que son complejos macromoleculares (constituidos de ARN y
protenas) donde se realiza el proceso de traduccin. Estos ARN se denominan segn su
coeficiente de sedimentacin (Grados Svedberg: S) y constituyen la subunidad mayor y
subunidad menor de los ribosomas. En procariotas, los ribosomas son de 70S, donde la
subunidad mayor constituye 50S y la menor 30S (Fig. 11). Su funcin en el proceso de
traduccin se desglosar a detalle en la siguiente seccin.

Figura 11. Esquema de un ribosoma procariote. Se describe la estructura de un ribosoma


desglosando la subunidad mayor 50S y la menor 30S en sus diferentes contenidos de molculas
de ARN (Alberts, et al., 2010).

3) ARN de transferencia (ARNt), esta molcula de ARN se constituye de una sola hebra
cuya funcin radica en su estructura debido a que sta le permite reconocer secuencias
de ARNm para reclutar y transportar a los aminicidos requeridos a los ribosomas para la
sntesis de protenas (Alberts, et al., 2010). Existe una ARNt para cada aminicido. En la
figura 12 se muestra la estructura funcional de un ARNt. Su funcin en el proceso de
traduccin se desglosar a detalle en la siguiente seccin.

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Figura 12. Esquema de un ribosoma de transferencia. Esquema de la estructura funcional que


adopta un ARNt para el reconocimiento y transporte de aminocidos durante la traduccin de
protenas (Alberts, et al., 2010).

Transcripcin

La ARN polimerasa de bacterias se encuentra libre y est constituida por mltiples


subunidades. Esta enzima se une de manera aleatoria a distintas regiones del ADN del
procarionte; esta unin generalmente es dbil, sin embargo, la enzima reconoce a la
secuencia de inicio o promotor y se une fuertemente. Posteriormente, la cadena de ADN
se abre para permitir la sntesis del ARNm; esta cadena de ARN se extiende, en direccin
5 3, hasta el momento en que la ARN polimerasa se encuentra con la secuencia de
terminacin. La secuencia nucleotdica del ARNm tambin es conocido como transcrito,
respecto a la constitucin de nucleotidos entre el ARNm y el ADN, la diferencia es que el
nucletido timina (T) es reemplazado por el nucletido uracilo (U) en el ARNm (Alberts, et
al., 2010). En la figura 13 se presenta una imagen donde se observa el proceso de
transcripcin descrito anteriormente.

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Unidad 1. Flujo de informacin gentica

Figura 13. Imagen del proceso de transcripcin. Se observa la sntesis de la molculas ARNm a
partir de la una de las hebras del ADN mediante la actividad de la enzima ARN polimerasa (Lodish,
et al., 2005).

En las bacterias, los ARNm no tienen procesamiento post-traduccional debido a que su


genoma no contiene intrones (secuencia de ADN no codificante), por lo tanto, todos los
transcritos se traducen directamente (Alberts, et al., 2010). Otra entidad molecular
bacteriana caracterizada en la decada de los 60 por Jacob F. y col., es el opern, definida
como largas cadenas de ARNm que contienen ms de un gen para obtener varias
protenas. Se sugiere que por medio de operones la bacteria sintetiza mayor cantidad de
protenas en un menor tiempo, disminuyendo el consumo energtico, sobre lo cual se
ahondar en la unidad 3.

Tanto la transcripcin como la traduccin son procesos sincronizados, es decir, al iniciar


la formacin del ARNm naciente, se acopla a la maquinaria de traduccin para la rpida
generacin de la protena. Se sugiere que, con ello, la bacteria es capaz de responder
rpidamente a diferentes estmulos de estrs.

Video explicativo sobre la transcripcin:


https://www.youtube.com/watch?v=mFh9L-nu8Hk

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Unidad 1. Flujo de informacin gentica

1.1.3. Traduccin de protenas

La traduccin es la accin de formar una protena a partir de un ARNm. En este proceso


estn involucrados tres componentes esenciales:

a) El ARNm que es transcrito a partir del ADN, que es interpretado en la traduccin


en triadas nucleotdicas llamadas codones,
b) Los ARN de transferencia (ARNt), definidos con entidades moleculares de RNA
con estructura secundaria que portan un aminocido en su extremo 3. Se conocen
diversos ARNt con diferentes aminocidos y anticodones (tripletes de nucletidos
que reconocen codones especficos). Existen 61 combinaciones de codones para
20 diferentes aminocidos, obteniendo lo que se ha denominado cdigo gentico
(piedra angular en la tecnologa del ADN recombinante; Fig. 5). Es decir, un existe
ms de un ARNt para 18 aminocidos, excepto para: la metionina (Met; M codn
AUG) y el triptfano (Trp; W condn UGG); adicionalmente, tambin es
necesaria una seal de trmino de la traduccin, la cual est dada por tres
codones (UAA, UAG, UGA; Lodish, et al., 2005; Alberts, et al., 2008).
c) El ribosoma es el complejo enzimtico encargado de catalizar el proceso de
traduccin, guiando la elongacin del polipptido a una velocidad promedio de 20
aminocidos por segundo en procariontes. Estn constituidos en su mayora por
molculas de ARN ribosomal (ARNr) que catalizan el proceso de traduccin y
complejos proteicos que le dan estabilidad al ribosoma. Estas molculas estn
organizadas en una subunidad mayor (complejo donde se cataliza el enlace
peptdico de la protena) y subunidad menor (ayuda en el acoplamiento ARNm con
el ARNt). Tienen un sitio para ARNm y sitios donde se unen los ARNt fuertemente
si empalman con el codn correcto, es decir, un Sitio A (Amino-acil ARNt;
reconocimiento de codn), Sitio P (Peptidil-ARNt; formacin del enlace peptdico),
y Sitio E (Salida de ARNt. Fig. 6, Lodish, et al., 2005; Alberts, et al., 2008).

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Unidad 1. Flujo de informacin gentica

Cdigo Cdigo
Aminocido triada actual
Alanina Ala A
Arginina Arg R
Asparagina Asn N
cido
asprtico Asp D
Cistena Cys C
Glutamina Gln Q
cido
glutmico Glu E
Glicina Gly G
Histidina His H
Isoleucina Ile I
Leucina Leu L
Lisina Lys K
Metionina Met M
Fenilalanina Phe F
Prolina Pro P
Serina Ser S
Treonina Thr T
Triptfano Trp W
Tirosina Tyr Y
Valina Val V

Fig. 5. A la izquierda se ilustran la combinacin de nucletidos que generan el codigo gentico


utilizado por los seres vivos para generar protenas a partir del ARNm. A la derecha est la lista de
los 20 aminocidos que forman las protenas y las nomenclaturas utilizadas para abreviar los
nombres (Lodish, et al., 2005; Alberts, et al., 2010).

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Unidad 1. Flujo de informacin gentica

Sitio Sitio Sitio


E P A

Subunidad
mayor
ribosoma

Subunidad
menor
ribosoma

Sitio de Unin
al ARNm

Fig. 6. (A-C) Modelo del ribosoma bacteriano hlices y listones desde distintos ngulos. La
subunidad mayor (verde claro) muestra ARNt en los sitios E (rojo), P (naranja) y A (amarillo). Es
importante mencionar que durante la traduccin no estn ocupados todos sitios de unin de ARNt.
La subunidad menor se denota en verde oscuro. (D) Representacin esquemtica del ribosoma y
los sitios de unin de molculas de ARN (Alberts, et al., 2010).

El proceso de traduccin se lleva a cabo el espacio citoplsmatico de las bacterias en


direccin 5 a 3. Comienza con la formacin de un complejo iniciador que est constituido
por la subunidad menor del ribosomal, la unin del el ARNt de iniciacin (ARNfMet ARN
formil metionina en procariontes) en el sitio P, y otras protenas (factores de iniciacin)
que ayudan en la estabilizacin del ribosoma con el ARNm y ARNtfMet. Este complejose
une al ARNm en una secuencia denominada Shine-Dalgarno (5'-AGGAGGU-3') que se
encuentra ro abajo del codn de inicio AUG y se aparea con el rRNA 16S de la
subunidad menor para ubicar dicho codn en el sitio P del ribosoma. Posteriormente se
une la subunidad mayor y el ARNt del siguiente codn en el sitio A; esta unin es fuerte y
conlleva a la accin de la peptidil-tranferasa con hidrlisis de GTP para formar el enlace
peptdico. Posteriormente, el proceso de elongacin de la cadena de aminocidos
consiste en el movimiento del ribosoma en la cadena del ARNm, por lo tanto, los ARNt se
traslocan al sitio contiguo, es decir, el ARNtfMet pasa del sitio P al sitio E para ser liberado.
El ARNt del siguiente codn pasa al sitio P y queda disponible el sitio A para la unin del
siguiente ARNt del siguiente codn. As cada aminocido es agregado en el extremo
carboxilo terminal, colaborando en el crecimiento de la cadena polipeptdica en un ciclo de
tres pasos secuenciales: unin del aminoacil-ARNt, formacin del enlace peptdico y

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Unidad 1. Flujo de informacin gentica

translocacin del ribosoma. Cuando el ribosoma llega a un codn de paro, un factor de


liberacin se une a dicho codn, terminando la traduccin y liberando la protena completa
del ribosoma. Los ARN bacterianos son comnmente policistrnicos, es decir, que
codifican mltiples protenas que son traducidas por separado de la misma molcula de
ARNm (Lodish, et al., 2005; Alberts, et al., 2010).

Videos del proceso de traduccin:


http://biomodel.uah.es/biomodel-misc/anim/traduc/traduccion-
procar.html
https://www.youtube.com/watch?v=mFh9L-nu8Hk

Videos representativos de la transcripcin:


http://www.youtube.com/watch?v=vAtdvsXVNuc
http://www.youtube.com/watch?v=ChhfCRYtAnY

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Unidad 1. Flujo de informacin gentica

Actividad 1. Generacin de protenas bacterianas

Se revis el flujo de informacin gentica bacteriana, ya que son los conceptos tericos
esenciales para realizar estrategias de modificacin o expresin de protenas en
procariontes.

Para demostrar que puedes describir los conceptos revisados, debers realizar la
siguiente actividad:

1. Elabora una presentacin en la que desgloses la replicacin, transcripcin del


ADN y traduccin de protenas. Debes incluir:
Localizacin subcelular donde se lleva a cabo el proceso.
Enzimas requeridas en cada proceso.
Tipos de molculas involucradas.

Haz uso de herramientas de dibujo (crculos, cuadros, flechas, animaciones). Puedes


aadir imgenes y revisar los videos de apoyo que se te proporcionan.

2. Guarda tu diagrama en un archivo de Word y envalo a la seccin Tareas con la


siguiente nomenclatura: BGMB_U1_A1_XXYZ. Espera la retroalimentacin de tu
Facilitador(a), quien aportar elementos importantes para perfeccionar tu trabajo.

Para enviar tus tareas, considera los siguientes puntos:

La herramienta est configurada para subir hasta dos archivos por cada tarea: la
primera versin y, una vez que hayas recibido las observaciones de tu
Facilitador(a), la segunda con las correcciones.
El botn Enviar para calificar aparece desde el primer envo, sin embargo, no
debes presionarlo, sino hasta que subas la segunda versin de tu ltima
tarea, de lo contrario no podrs subir ningn otro documento, dado que el aula
tomar como la versin final de tu trabajo el documento enviado con dicho botn.

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Unidad 1. Flujo de informacin gentica

1.2. La mutacin de cidos nuclicos conlleva a la variabilidad


gentica

En esta seccin se abordarn los procesos involucrados en la variacin fenotpica


bacteriana (cambios en el fenotipo celular de la poblacin), dado que el genoma est
sujeto a modificaciones debido a mutaciones y, por otro lado, el intercambio material
gentico es una estrategia de sobrevivencia bacteriana.

A continuacin se abordar la mutacin como proceso de variabilidad en la obtencin de


bacterias genticamente modificadas.

1.2.1. Definicin de mutacin

La palabra mutacin se deriva del Latn mutatio, del verbo mutare, cuya apelacin implica
cambio o movimiento. En el Diccionario de la Real Academia de la Lengua Espaola se
refiere a una accin y efecto de mudarse o moverse, y en sentido biolgico, lo refiere
como alteracin producida en la estructura o en el nmero de los genes o de los
cromosomas de un organismo transmisible por herencia. Sin embargo, el botnico Hugo
de Vries utiliz por primera vez el trmino mutacin (1901) en un trabajo con plantas del
gnero Oenothera. En su investigacin describi que algunas de las plantas obtenidas de
sus cruzas presentaban variantes fenotpicas ausentes en los progenitores, sugiriendo
que haba cambios espontneos en sus cromosomas (chromos color, soma - cuerpo) y
que se heredaban a su progenie; a este fenmeno, De Vries lo denomin mutaciones, y a
los organismos con variantes fenotpicas heredables los llam mutantes (Paap 1996;
Curtis, et al., 2008).

Actualmente una mutacin es definida como cambios heredables en la secuencia de ADN


de un organismo. Estos cambios pueden ser considerados errores en la replicacin (la
DNA polimerasa bacteriana tiene una frecuencia de mutacin de alrededor de un error en
109 nucletidos), que generalmente son corregidos por la maquinaria de reparacin, sin
embargo, tambin se han descrito mutaciones espontneas, mutaciones inducidas por
agentes mutagnicos (qumicos, fsicos o biolgicos); dichos procesos se han
aprovechado como herramientas en el rea de la ingeniera gentica. Sin embargo,
debido a la baja frecuencia de mutaciones en bacterias, slo se pueden observar cuando
presentan tasas de crecimiento altas, tales que sean detectables, y frecuentemente
afectan propiedades reconocibles como requerimientos nutricionales, morfologa o
resistencia a drogas (Lodish, et al., 2005; Betancor, et al., 2006; Alberts, et al., 2010).

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Unidad 1. Flujo de informacin gentica

1.2.2. Tipos de mutaciones

De acuerdo al efecto fenotpico, las mutaciones se clasifican en dos rubros:


mutaciones selectivas, son aquellas modificaciones que le dan ventajas a la bacteria
mutante sobre la cepa parental; es decir, este tipo de mutacin le dara la capacidad de
responder eficientemente a un estmulo de estrs al que la bacteria progenitora no
sobrevivira, por ejemplo, la resistencia a algn antibitico. Por otra parte, las mutaciones
no selectivas refieren a los cambios en el genoma, donde no hay ventajas selectivas con
respecto a la cepa bacteriana parental, como la prdida de pigmento de las colonias de
Serratia marcescens, que se observa al ser cultivadas en agar.

Por otra parte, a nivel molecular se llaman mutaciones puntuales a los cambios en
nucletidos particulares de la secuencia de ADN que pueden alterar el marco de lectura
de la traduccin, es decir, mutacin que cambia el marco de lectura de un aminocido por
otro diferente, por ejemplo, en el codn GGC que codifica para glicina, si sufre un cambio
a GAC, codificara para el aminocido asparagina. Las mutaciones silenciosas son
aquellas modificaciones que no implican cambio en el aminocido codificado, por ejemplo,
CGU, CGC, CGA O CGG; todos ellos codifican para la arginina. Por ltimo, las
mutaciones sin sentido son aquellas que generan un codn de paro, por tanto, durante la
traduccin se obtendr una protena incompleta (Lodish, et al., 2005; Betancor, et al.,
2006; Alberts, et al., 2010).

Otro fenmeno que se ha descrito son las deleciones y las inserciones que generan
cambios en el tamao del material gentico, ya que se pierden o incorporan fragmentos
de ADN de distinto tamao en el genoma. Si los fragmentos perdidos o ganados no son
mltiplos de 3 (debido a los codones), se obtienen mutaciones por desplazamiento del
marco de lectura que suelen provocar la prdida total del fenotipo.

1.2.3. Descripcin de mutagnesis dirigida para la obtencin de


bacterias genticamente modificadas (BGM)

El concepto de mutagnesis dirigida fue introducido en la segunda parte del siglo XX


cuando la tecnologa del ADN recombinante se convirti en un concepto econmicamente
redituable, y se refiere a modificaciones de genes (secuencias de ADN que codifican para
una protena) para obtener productos especficos. Para ello, cabe recordar que es habitual
el uso de la clonacin para la insercin de un fragmento de ADN en un vector de
clonacin (herramienta molecular que consiste, generalmente, en un fragmento circular de
ADN con todos elementos para ser replicado por un microorganismo hospedero), por
tanto, se puede tener infinidad de copias del gen de inters a partir de una muestra
limitada. La estrategia bsica para obtencin de ADN recombinante es:

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Unidad 1. Flujo de informacin gentica

Fragmento
de ADN Secuenciacin
Ligacin Transformacin Clona
+
ADN
Recombinante + Cepa
Bacteriana
bacteriana
recombinante
Expresin de protenas

Vector de Mutaciones, deleciones, inserciones,


clonacin

Esquema representativo de una estrategia de clonacin de ADN. El fragmento de ADN que se


desea clonar debe ser obtenido de ADN genmico, ADNc (utilizando tcnicas como enzimas de
restriccin, PCR o RT-PCR). El vector de clonacin ser seleccionado de acuerdo a la cepa
bacteriana que se utilice en el proceso de BMG (lo cual se abordar en la siguiente unidad). Con la
clona que presenta el recombinante, se pueden abordar diferentes lneas de trabajo: por un lado,
secuenciar el fragmento de ADN y verificar si es el fragmento deseado, si tiene mutaciones, etc.;
por otro, expresar la protena que se genere del ADN clonado, modificarlo para hacer mutaciones
puntuales, deleciones, inserciones, etc.

Las herramientas necesarias para poder obtener ADN recombinante incluyen el uso de
tcnicas de biologa molecular como:

Enzimas de restriccin. Actualmente existen comercialmente una gran variedad de


endonucleasas que cortan el ADN en regiones especficas llamadas sitio de
restriccin. Son utilizadas para obtener fragmentos especficos de ADN a partir de
un genoma e insertarlo en vectores de clonacin. Un ejemplo es la enzima Eco RI,
derivada de la bacteria Escherichia coli, que escinde en el ADN cuando encuentra
la secuencia 5 GAATTC 3 (Lodish, et al., 2005; Betancor, et al., 2006). Algunas
de estas enzimas tienen la capacidad de dejar extremos cohesivos, es decir,
algunos pares de bases sin aparear con su cadena complementaria, lo que les
permite unirse ms fcilmente a otro fragmento de ADN cuando se aparean con su
nucletido correspondiente. Otro tipo de endonucleasas no dejan pares de bases
sin aparear (Extremos romos al ras -), sin embargo, tambin se pueden unir
otros fragmentos de ADN (Lodish, et al., 2005).

La reaccin en cadena de la polimerasa (PCR por sus siglas en ingls),


desarrollada en 1987 por Kary Mullis. El objetivo de esta tcnica es amplificar el
nmero de copias de una secuencia de ADN especfica a partir de una muestra
templado (Lodish, et al., 2005). Una variante de esta tcnica es la reaccin en
cadena de la polimerasa con transcriptasa reversa (RT-PCR por sus siglas en
ingls), tcnica que tiene como base generar ADN complementario (cADN) a partir
de muestras de ARNm gracias a la accin de la enzima transcriptasa reversa. Esta
tcnica permite obtener genes individuales para su manipulacin independiente
(en el caso de eucariontes sin intrones; en caso de bacterias, genes individuales a
partir de un policistron; Lodish, et al., 2005).

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Unidad 1. Flujo de informacin gentica

Ligasas. Son enzimas que realizan enlace fosfodiester entre dos molculas de
ADN que estn cercanas y son un herramienta esencial en la unin de ADN
extrao (transgenes) en vectores de clonacin. Actualmente la ligasa ms usada
en la industria del ADN recombinante es la ligasa de ADN T4 derivada del
bacterifago T4 (virus que infecta a bacterias), y que es producida por mtodos
biotecnolgicos para su venta.

Vectores de clonacin. Como se mencion anteriormente, es una molcula de


ADN que contiene todos los elementos necesarios, es decir, un promotor de
transcripcin bacteriano, un gen que permita la seleccin de bacterias
transformadas, secuencia seal de inicio de la traduccin, y un sitio mltiple de
clonacin (Polylinker) conformado por sitios restriccin para diferentes enzimas.
stos se han derivado de genomas de virus o bacterianos. Los vectores pueden
clasificarse en: plsmidos, bacterifagos, cosmidos, fsmidos y cromosomas
artificiales de bacterias (BAC; Gmez, et al., 2006; Lodish, et al., 2008; mismos
que se describirn a detalle en la siguiente unidad).

Transformacin. Es el proceso por el cual se inserta el ADN recombinante a la


bacteria para que lo integre a su genoma y lo replique con alta eficiencia, lo cual
se abordar a detalle ms adelante. Sin embargo, se ha descrito a la
transformacin, transduccin y conjugacin, como mecanismos naturales de
integracin de ADN extrao dentro del genoma bacteriano. Por otra parte,
experimentalmente la integracin de ADN exgeno dentro de las bacterias se lleva
a cabo generando poros en la pared bacteriana por medio de agentes qumicos o
elctricos.

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Unidad 1. Flujo de informacin gentica

Actividad 2. Mutagnesis

Se revisaron trminos necesarios para la recombinacin de informacin gentica (ADN),


ya que son los conceptos tericos esenciales para realizar estrategias de biologa
molecular y tecnologa recombinante.

Para demostrar que puedes describir los conceptos revisados, debers realizar la
siguiente actividad:

1. Elabora un cuadro comparativo en el que describas los tipos de mutagnesis


revisados en esta seccin para su uso biotecnolgico.
2. Compara las ventajas de cada tipo de mutagnesis y describe el tipo de
metodologa experimental (endonucleasas de restriccin, PCR, RT-PCR) que
generara ms o menos mutaciones al amplificar un fragmento de ADN.
3. Guarda tu trabajo en un archivo de Word y envalo a la seccin Tareas con la
siguiente nomenclatura: BGMB_U1_A2_XXYZ. Espera la retroalimentacin de tu
Facilitador(a), quien aportar elementos importantes para perfeccionar tu trabajo.

Actividad 3. Flujo de informacin gentica

Con la finalidad de confirmar el aprendizaje de los conceptos revisados, debers discutir


con tus compaeros(as) sobre los distintos tipos de mutaciones que afectan el flujo de
informacin gentica.

1. Ingresa al foro destinado a la actividad y elabora una entrada que desarrolle los
siguientes puntos:
a) Cmo describiras el flujo de informacin gentica como proceso continuo?
(debes integrar los procesos descritos de manera concisa, conteniendo slo
las principales caractersticas y funciones de cada uno)
b) Identifica los tipos de mutagnesis para su uso biotecnolgico. Puntualiza las
estrategias consideradas como importantes para la aplicacin del
conocimiento en el rea biotecnolgica.

2. No olvides ser claro y breve en tus participaciones, abarcando slo los aspectos
que realmente consideres relevantes.

3. Lee con atencin el trabajo de tus compaeros(as) y realiza las aportaciones


que ayuden a mejorar su trabajo.

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Unidad 1. Flujo de informacin gentica

Autoevaluacin

Realiza el siguiente cuestionario de autoevaluacin para medir tu aprovechamiento de


los temas estudiados a lo largo de la unidad. Al finalizar, compara tus resultados.
Encontrars las respuestas correctas junto con los materiales de la asignatura.

1. Qu macromolcula contiene la informacin hereditaria?

a) Protenas
b) cido ribonucleico mensajero (ARNm)
c) cido desoxirribonucleico (ADN)
d) Pptido

2. De acuerdo al anlisis filogentico del ARNr 16, las bacterias pertenecen al


dominio:

a) Archea
b) Eucaria
c) Bacteria
d) Protistas

3. Cmo se define al flujo de informacin gentica?

a) Es el fenotipo de los organismos


b) La expresin un fenotipo a partir de un genotipo
c) Es el genotipo de los organismos
d) Son los genes de los organismos

4. Cules son las macromolculas involucradas en el flujo de informacin


gentica?

a) Nucletidos, aminocidos y enzimas


b) Protenas, lpidos y azcares
c) ADN, ARN y protenas
d) ADN, aminocidos y enzimas

5. Cmo es el genoma bacteriano?

a) Es ADN circular de doble cadena


b) Es ARN de cadena sencilla
c) Es ADN de cadena sencilla
d) Es un hibrido ADN ARN de doble cadena

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Unidad 1. Flujo de informacin gentica

6. A qu se refiere que la replicacin del ADN sea semiconservativa?

a) Ambas molculas de doble cadenas de ADN son sintetizadas de novo


b) Una de las dos molculas de ADN es sintetizada de novo y la otra doble hlice
conserve las cadenas parentales
c) Las cadenas generadas contienen una hebra de la cadena parental y una
recientemente sintetizada
d) Son molculas de ADN circular llamadas plsmidos

7. Cmo se define la transcripcin de ADN?

a) Es el proceso catalizado por la ARN polimerasa para sintetizar ARN de cadena


sencilla a partir de un fragmento de ADN
b) Es el proceso para generar dos molculas de ADN a partir de una doble hlice
parental
c) Es el proceso para sintetizar una protena partir de una molcula de ARNm
d) Es el proceso de reparacin del ADN genmico

8. Qu es la traduccin de protenas?

a) Es el proceso involucrado en la generacin de nucletidos


b) Es el proceso involucrado en la generacin de aminocidos
c) Es el proceso involucrado en la generacin de ARNr y ARNt
d) Es el proceso involucrado en la formacin de protenas a partir de un ARNm

9. Una mutacin a nivel molecular est definida como:

a) Errores de sntesis de protenas de un organismo


b) Cambios heredables en la secuencia de ADN de un organismo
c) Errores en la sntesis de ADN de un organismo
d) Reparacin de errores durante la replicacin de ADN

10. De acuerdo al efecto fenotpico, Cules son los dos tipos de mutaciones?

a) Mutaciones Selectivas y no selectivas


b) Mutaciones puntuales y silenciosas
c) Deleciones e inserciones
d) Prdida o ganancia de material gentico

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Evidencia de aprendizaje. Flujo de informacin gentica

Con la finalidad de integrar toda la informacin aprendida, lleva a cabo el siguiente


procedimiento:

1. Descarga el documento titulado Evidencia de aprendizaje. Flujo de informacin


gentica en la pestaa de la asignatura y resuelve los problemas que se te
presentan.
2. Descarga la rbrica de evaluacin para conocer los criterios con los que sers
evaluado.
3. Guarda tu documento con la nomenclatura BGMB_U1_EA_XXYZ y envalo a tu
Facilitador (a) mediante el Portafolio de evidencias para que lo revise y te
retroalimente.

*Recuerda que tu documento deber pesar menos de 4 MB.


**Slo debers enviar las respuestas de las preguntas, puntual y suficientemente
planteadas.

Nota: no olvides realizar tu ejercicio de autorreflexin. Recuerda que tambin cuenta


para la calificacin final. Para ello, entra al foro donde tu Facilitador(a) ingresar las
preguntas a responder, y, posteriormente, ingresa a la herramienta destinada a esta
labor para subir tu participacin.

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Unidad 1. Flujo de informacin gentica

Cierre de la Unidad

En esta primera unidad se recapitularon los procesos que definen al flujo de informacin
gentica como los eventos necesarios para observar un fenotipo (generacin de protena)
a partir de un genotipo (gen o genes contenidos en el genoma de las bacterias).
Particularmente se revis la replicacin del ADN como la generacin de dos hebras de
material gentico con base en una doble hlice parental de manera semiconservativa, es
decir, las dobles hlices hijas llevan una hebra de ADN parental y una recin sintetizada.
Se enfatiz que la generacin de una protena es un proceso continuo en bacterias, es
decir, la transcripcin de ARN mensajero (ARNm) y la traduccin de protenas estn
acopladas. La generacin de ARN mensajero (ARNm) a partir de una hebra de ADN se
inicia cuando el complejo enzimtico conocido como ARN Polimerasa se une a un
promotor; empieza a transcribir con direccin 5 3, y termina al encontrar una
secuencia de paro. Una caracterstica de este proceso es la incorporacin del nucletido
uracilo (U) en sustitucin a la timina (T). Por otra parte, la traduccin de protenas inicia
cuando la hebra de ARNm naciente es suficientemente grande para que se ensamble el
complejo de inicio que incluye a la unidad menor del ribosoma, el ARNfMet (ARN formil
metionina) en el sitio P y la unin al ARNm en la secuencia conocida como Shine-
Dalgarno para ubicar al codn AUG en el sitio P. Posteriormente se une la subunidad
mayor del ribosoma y el ARNt del siguiente condn en el sitio A, por lo tanto, se forma el
primer enlace peptdico con hidrlisis de GTP. Luego el pptido (secuencia naciente de
aminocidos) se elonga de acuerdo a la unin secuencial de aminocidos, segn la
secuencia del ARNm y su decodificacin con ARNt e hidrlisis de GTP (ver el cdigo
gentico). Este proceso termina cuando se encuentra un codn de paro y se libera el
complejo ARNm, ribosoma y protena.

Tambin se describieron los procesos involucrados en la variacin fenotpica bacteriana,


es decir, mutaciones, como una estrategia de sobrevivencia bacteriana. En esta unidad se
defini el trmino mutacin como cambios heredables en la secuencia de ADN de un
organismo, as como las herramientas esenciales en la ingeniera gentica como las
mutaciones espontneas y mutaciones inducidas. Asimismo, se describieron las
mutaciones selectivas (cambios que le dan ventajas adaptativas), mutaciones no
selectivas, y mutaciones puntuales (cambios en nucletidos individuales en el genoma), y
las prdidas o ganancias de fragmentos de ADN como deleciones e inserciones,
respectivamente.

La ltima parte de la unidad se encamin a las estrategias utilizadas en la ingeniera


gentica para la manipulacin del flujo de informacin en la generacin de productos de
inters particular. Se te refiri el concepto de clonacin como la insercin de un fragmento
de ADN en una herramienta molecular que consiste en un fragmento circular de ADN con
todos elementos para ser replicado por un microorganismo hospedero, denominado
vector de clonacin, lo cual se abordar a detalle en la siguiente unidad. Se ilustr una
estrategia para amplificar un gen de inters a partir de una muestra limitada con tcnicas

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Unidad 1. Flujo de informacin gentica

y herramientas experimentales, tales como la reaccin en enzimas de restriccin, cadena


de la polimerasa (PCR), reaccin en cadena de la polimerasa con transcriptasa reversa
(RT-PCR), unin de fragmentos de ADN con enzimas denominadas ligasas, los vectores
de clonacin y la transformacin bacteriana, es decir, la introduccin del gen de inters en
una cepa bacteriana. Se han descrito, adems, diferentes estrategias de transformacin
bacteriana que sern revisadas a detalle en la siguiente unidad, ya que son esenciales en
la gentica molecular para el diseo experimental ptimo en la obtencin de protenas en
cantidades industriales.

Felicidades, es momento de iniciar la segunda unidad de la asignatura: Transferencia de


material gentico y seleccin bacteriana.

Para saber ms

Revisin de los captulos (2 - 4):


- Fundamentos qumicos
- Estructura y funcin de las protenas
- Mecanismos genticos moleculares bsicos

Del libro de texto:


Lodish, H., Berk, A., Matsudaira, P., Kaiser, C. A., Krieger, M., Scott, M. P., Zipursky, L.,
Darnell, J. (2005). Biologa Celular y Molecular. 5 Edicin. Argentina: Ed. Mdica
Panamericana.

As como los captulos 4 6 del libro de texto:


Alberts, B. (2010). Biologa Molecular de la Clula. 5 Edicin. Espaa: Ediciones Omega.

- DNA, cromosomas y genomas.


- Replicacin reparacin y recombinacin de DNA.
- Cmo leen las clulas el genoma: Del DNA a la protena.

Por su parte, para entender la estructura molecular de los cidos nucleicos, se


recomienda visitar las pginas:

http://www.genomasur.com/lecturas/Guia02-2.htm
http://www.bioquimica.dogsleep.net/Teoria/archivos/Unidad81.pdf

A su vez, para entender la estructura molecular de las protenas, se recomienda visitar las
pginas:

http://www.ehu.es/biomoleculas/peptidos/pep2.htm

Ciencias de la Salud Biolgicas y Ambientales | Ingeniera en Biotecnologa 33


Gentica Molecular Bacteriana
Unidad 1. Flujo de informacin gentica

http://laguna.fmedic.unam.mx/~evazquez/0403/enlace%20peptidico.html
http://themedicalbiochemistrypage.org/es/protein-structure-sp.php

Bibliografa

Alberts, B. (2010). Biologa Molecular de la Clula. 5 Edicin. Espaa: Ediciones Omega.

Betancor, L., Gadea, P., Flores, K. (2006). Gentica Bacteriana. Temas de Bacteriologa y
virologa mdica. 2 Edicin. Uruguay: Universidad de la Republica.

Curtis, H., Shnek, A., Massarini, A., Aroz, J., Behrens, V. (2008). Biologa. 7 Edicin.
Argentina: Mdica Panamericana.

Gmez, M. y Echenique, V. (2010). Biotecnologa y Mejoramiento Vegetal I. Argentina:


Consejo Argentino para la Informacin y el Desarrollo de la Biotecnologa.

Lodish, H., Berk, A, Matsudaira, P., Kaiser, C. A., Krieger, M., Scott, M.P., Zipursky, L.,
Darnell, J. (2005). Biologa Celular y Molecular. 5 Edicin. Argentina: Ed. Mdica
Panamericana.

Murray, P. R., Rosenthal, K. S., Pfaller, M. A., (2009). Microbiologa Mdica. 6 Edicin.
Espaa: ElSevier.

Paap, D. (1996). Historia de las Ciencias. 1 Edicin. Chile: Editorial Andrs Bello.

Sobern, M. X. (1996). La ingeniera gentica y la nueva biotecnologa. Mxico: Fondo de


Cultura Econmica.

Videos

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video]. Recuperado de: http://www.youtube.com/watch?v=8xnmaj9m87s

Free Sciencie Lectures (abril, 2012). Transcripcin de ADN A ARN [archivo de video].
Recuperado de: https://www.youtube.com/watch?v=mFh9L-nu8Hk

Jack, T., Gross, B. (1987). Traduccin en procariotas [archivo de video. Traduccin del
texto y comentarios aadidos por Angel Herrez]. (Universidad de Alcal). Hanover, NH,
Dartmouth College. Recuperado de: http://www.dartmouth.edu/ artsci/bio/cbbc/courses/
bio23/bio23-1998/ index-b23-98.html

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