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el ratn
Estrategias de bsqueda de genes,
metodologa y usos
Estrategias de genoma ntegro en
gentica del ratn
El ratn como organismo modelo,
desarrollo bsico del ratn y
perspectivas histricas
Gentica del ratn I
Ventajas/Desventajas
Caractersticas
Cepas inbred/outbred
Estrategias de cruzamiento de
ratones
Porqu el ratn?
Es un mamfero!! Y uno de los ms pequeos (25-40g)
Cercano evolutivamente a humanos(60 millones de aos)
Corto tiempo de gestacin (20 das)
Entra a la pubertad relativamente temprano (6-8 semanas)
Camadas grandes
Largo perodo reproductivo
Machos no atacan a las cras
Dciles, fciles de manejar
Para estudios de desarrollo, los embarazos se planean fcilmente para
inseminacin (plugs vaginales)
Placentacin y desarrollo temprano son similares a los humanos
Sintenia conservada con el genoma humano ( filas de 10- 20 mb )
Caractersticas del ratn
Genoma
Cromosomas: 19 pares autosmicos + XY
Contenido de DNA diploide:~ 6pg
Unidades de recombinacin:1600 cM
Nmero aprox. de genes: 26000
Biologa reproductiva
Tiempo de gestacin 20 das
Edad al destete 3 semanas
Edad de madurez sexual 7 semanas
Tiempo de vida en el elab1.5-2.5 aos
Tamao promedio de camada 6-9
Camadas por hembra 4-8
Desventajas
No exactamente humano: diferencias en funcin cognitiva,
comportamiento, expresin gnica.
Dificultad para monitorear desarrollo in utero en comparacin
con otros organismos modelo
Diploide vs haploide mutaciones gnicas son letales menos
frecuentemente, pero los fenotipos son frecuentemente
suprimidos por heterocigosidad
Genoma grande es ms difcil trabajar en relacin a
organismos con genomas ms compactos
Perodo de gestacin largo en comparacin con otros
organismos modelo
La funcin celular est influenciada por estmulos endocrinos,
fisiolgicos y del medio ambiente
Se necesitan amplios espacios de almacenamiento
Origen de cepas
endogmicas (inbred)
Ms de 100 aos de uso de ratones en el estudio de herencia en
mamferos y seleccin natural
Fueron originalmente mantenidos por criadores que establecieron
lneas nicas seleccionadas por color del pelaje u otras caractersticas
externas
Alrededor del ao 1900, una profesora de escuela retirada Abbie
Lathrop cri y vendi ratones desde su hogar en Granby, MA
Entre sus clientes estaba William Castle de la Universidad de Harvard,
quien estableci algunas de las primeras lneas de cepas endogmicas
(ej. BALB/c)
Abbie Lathrop realiz tambin sus propios experimentos de crianza
dando lugar a cepas como C57BL/6 y C57BL/10
En 1929, los Laboratorios Jackson fueron establecidos como repositorio
para stocks de cepas inbred y lneas mutantes para uso experimental.
Fuentes y cepas de ratones
de laboratorio
http://www.informatics.
jax.org/silver/frames/fra
me3-2.shtml
Figure 3.2 Consequences of inbreeding up to 20 generations. This illustration of inbreeding is based
on the same simplifying assumptions described in the legend to Figure 3.1. Points on the solid line
indicate the portion of the genome that will be homozygous in any individual animal at each
generation. Points on the dashed line indicate the portion of the genome that will be fixed
identically in the two animals chosen to generate the following generation of animals.
http://www.informatics.jax.org/silver/figures/figure3-2.shtml
Lneas hbridas F1
Ratones inbred, aunque genticamente
uniformes son frecuentemente menos
fttiles, menosa sanos, menos resistentes a
enfermedad, etc.
Recursos tiles
Avances actuales
Figure 2. Infographic illustration of the
hierarchy between species level genomes,
genes (functional units), the sequence variation
which defines alleles, leading to individual
genotypes, which, when expressed dictate
phenotypes. See right for details. The bottom
photo shows an obese C57BL/6J- Lepob/Lepob
mouse on the right, with a heterozygous
Lepob/Lep+ lean littermate on the left.
Reference:
http://www.informatics.jax.org/mgihome/other/home
page_IntroMouse.shtml
Informacin genmica del ratn
Crom Tamao (kb) % secuencia Crom Tamao % Secuencia
completa (kb) completa
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Omim/Homology/
http://www.informatics.jax.org/
http://www.informatics.jax.org/silver
http://www-genome.wi.mit.edu/mouse_rh/index.html
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/guide/mouse/
http://www.mgu.har.mrc.ac.uk/
Historia de la gentica del ratn
en pastilla
Mutaciones espontneas
Mutaciones inducidas en genes conocidos
Adicin de genes exgenos/modificadores
Mutaciones tipo celular- especficas
Mutaciones temporo-especficas
Mutagnesis al azar seguida por seleccin
fenotpica
Toxinas, dieta, radiacin
Implantes tisulares, transplante
Estudios tempranos en
gentica del ratn
Observacin visual de caractersticas externas
y comportamiento
Constructs bsicos
Obteniendo clulas ES