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AIH - Flore commensale, opportuniste, saprophyte, les rservoirs de microorganismes lhpital, les infections nosocomiales

23/04/2014
ROZALEN William L2
Agents infectieux, hygine, aspects gnraux
Professeur P.E. Fournier
Relecteur 2
6 pages

Flore commensale, opportuniste, saprophyte, les rservoirs de microorganismes lhpital,


les infections nosocomiales

Plan

A. Flore bactrienne
I. Les bactries commensales ou rsidentes
II. Les bactries opportunistes
III. Les bactries saprophytes
B. Hygine hospitalire
I. Les infections nosocomiales
II. Le CLIN

Bonnes nouvelles : cette anne, pas de question point ngatif en AIH aux examens : les mauvaises rponses
rapportent un 0 au lieu de -1 ! En plus il n'y a qu'un petit rono de 6 pages en AIH cette semaine.
Danse de la victoire !

A. Flore bactrienne

I. Bactries commensales

Ce sont des bactries colonisant l'homme sans tre pathognes. Elles vivent au contact du revtement
cutano-muqueux d'un hte sans entraner d'infection. Elles jouent un rle dans les dfenses du corps humain.
Les bactries commensales proviennent soit de l'environnement, soit d'autres htes (ces bactries sont
incapables de survivre en dehors de l'hte).

Cette flore est diversifie et ces bactries ne sont pas pathognes sauf en cas de geste invasif. On les trouve :
dans la sphre oro-pharynge (Streptococcus sp.),
sur le revtement cutan (Staphylococcus sp. , Propionibacterium sp. , corynbactries)
dans le tube digestif : entrobactries (anarobies)
flore gnitale : Lactobacillus sp. (anarobies)

La composition de cette flore varie en fonction de lge.

Un tre humain c'est 1014 cellules eucaryotes pour 1015 cellules microbiennes. Vivre avec cette flore
commensale est une obligation et une ncessit. La flore commensale se localise en majorit dans le tube
digestif (109 1012 bactries par gramme de selle).

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II. Bactries opportunistes

Les bactries opportunistes ne donnent pas de maladie chez les sujets sains, mais peuvent devenir pathognes
chez les sujets immunodprims.
Ce sont des bactries environnementales ou commensales de la peau et des muqueuses de l'homme qui suite
une immunodpression ou antibiothrapie sont slectionnes et prolifrent.
Toute bactrie commensale ou environnementale peut devenir opportuniste : Pseudomonas sp., Acenetobacter
sp., Legionella pneumophilia...

III. Bactries saprophytes

Les bactries saprophytes vivent aux dpens d'un hte. Elles se nourrissent de matires organiques mortes et
participent leur dgradation. Un germe saprophyte vit habituellement dans l'organisme sans tre pathogne
(peau, tube digestif, flore vaginale).
Elles sont susceptibles de devenir pathognes en cas d'immunodpression. Certaines bactries (par ex :
staphyloccoque dor) peuvent tre la fois saprophytes, commensales et pathognes.

B. Hygine hospitalire

Semmelwels (mdecin hongrois) a pos les bases de l'hygine hospitalire au XIXme sicle. Au cours de ses
tudes de mdecine dans un service de gynco-obsttrique : il y avait 2 services ddis aux accouchements :
l'un tait assur par les sages-femmes tandis que l'autre tait assur par des tudiants en mdecine. Et selon le
service, les taux de mortalit taient trs diffrents : prs de 100% pour les tudiants en mdecine, contre des
taux plus normaux pour l'poque pour les sages-femmes. Il s'est aperu que les tudiants en mdecine faisaient
les accouchements juste aprs les autopsies de cadavres (alors que les sages-femmes ne faisaient pas d'autopsie,
d'o les mortalits plus basses). Il eut l'ide des solutions chlores base de citron pour les mains, ce qui
amliora bien les conditions d'accouchement dans cet hpital et lui apporta une certaine clbrit en jetant les
bases de l'antisepsie.

I. Les infections nosocomiales

Une infection nosocomiale est une infection acquise l'hpital, qui n'est ni en incubation, ni prsente
l'admission. Elle peut tre secondaire ou pas un acte invasif. Les infections nosocomiales concernent tout
soin mdical (celles survenant dans un cabinet de mdecine gnrale aussi par exemple).
Le dlai en hospitalisation d'apparition des signes d'une infection est gnralement de 48h.
2 particularits : Les patients oprs en chirurgie : en l'absence de matriel prothtique, on considre qu'une
infection est nosocomiale si elle se dveloppe jusqu' 30 jours aprs le geste. En cas de prothse ou d'implant,
l'infection nosocomiale peut se dvelopper 1 an aprs le geste (parfois beaucoup plus : un patient a dvelopp
une infection 6 ans aprs une opration, cause de plafonds imbibs d'eau et d'aspergillus dans la salle de
ranimation.)

Le taux de prvalence des infections nosocomiales en France est de 4-6%, avec environ 800 000 cas/an. On
dnombre 8000 9000 dcs/an, dont 4000 dont le pronostic vital n'tait pas engag avant (nombre
probablement sous-estim cause des bactrimies sur cathter).
A Marseille, il y a moins de 2000 infections nosocomiales par an (soit 1,7 cas pour 1000 admissions), ce qui
reprsente 20 30 dcs par an.

Ces infections nosocomiales sont essentiellement urinaires (40%), mais elles peuvent aussi tre pulmonaires
(20%), dpendantes du site opratoire (18%), sur cathter (6%), ou autre...
Ces chiffres ne sont pas retenir :il faut juste savoir que les infections urinaires sont les plus courantes.

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La gestion du risque infectieux hospitalier consiste connatre les acteurs, les rservoirs, les modes de
transmission, les facteurs de risque...
Les protagonistes sont les malades, le matriel mdical, l'quipe mdicale et l'hpital lui mme.

Les rservoirs des microorganismes : on distingue l'environnement inanim de l'environnement anim.

L'environnement inanim comprend :

Locaux : En pratique peu d'infections nosocomiales sont lies aux locaux eux-mmes, un dtail prs :
le travail sur faux plafond. Les faux plafonds ne sont pas bien entretenus. S'accumule ainsi une
poussire remplie de champignons filamenteux (surtout Aspergillus sp.).
On trouve aussi des bactries (P. aeruginosa, entrobactries) ou des virus (rotavirus, calicivirus,
astrovirus, adnovirus, virus respiratoire syncytial). Retenir surtout Aspergillus.

Matriel mdical : On tend utiliser le plus souvent possible du matriel strile usage unique. Le
problme qui persiste est sur le matriel non strilisable. Il y a des problmes avec les endoscopes (qui
ne peuvent pas tre striliss) et ncessitent des protocoles de dsinfection trs stricts qui ne sont pas
toujours respects : des problmes se posent en particulier avec les prions qui causent des maladies
neurodgnratives. Les prions sont trs contagieux et des mesures d'isolement sont prises en cas de
suspicion de prion.

Savon : Le Savodoux (flacon rose) utilis pendant longtemps n'tait pas antiseptique . Il a t l'origine
d'pidmie d'infection Serratia sp. (bactrie Gram-). Ce savon tait trs sale et contamin. Par
mesure d'conomie, on achetait 10 flacons pour une pompe. Ainsi, une pompe contamine transmettait
le germe tous les flacons...

Blouses : Pour que les choses soient bien faites, on devrait disposer d'une blouse par jour.
Malheureusement c'est impossible (sauf dans quelques services : bloc opratoire ou service de
ranimation). Ces blouses constituent un grand rservoir de micro-organismes.

Eau : Dans l'eau, les bactries trouvent un alli inattendu : les amibes qui se comportent un peu comme
des macrophages. Les bactries associes aux amibes sont multiples : Legionella pneumophilia surtout
et d'autres (moins importantes) La protection se fait par enkystement : la bactrie est l'intrieur de
l'amibe et la menace thermique ou chimique utilise habituellement pour purifier l'eau (Chlore ou
rchauffement) ne les atteint pas... Dans l'idal il faut qu'il y ait peu/pas de Legionella dans l'eau de la
ville. Hors il y en a beaucoup dans le rseau d'eau de l'hpital : rservoirs, eau chaude, rseau vieux
(tartre, biofilm), rseau mal conu (bras morts : l'eau ne circule pas et permet le dveloppement
d'amibes et de lgionelle), systme de dcontamination insuffisant (chlore)...

Air : Rservoir de champignons filamenteux. 2 pisodes malheureux : 2 cas d'infections Aspergillus


Marseille : une fois dans un bloc de chirurgie cardiaque cause d'une contamination de la ventilation.
Une autre lors de l'ouverture du pavillon toile, la ventilation n'tait pas correcte et plusieurs cas
d'aspergillose se sont dclars.
La secousse des draps peut propager des staphylocoques dors dans l'air.

Alimentation : La fabrication est standardise, des contrles rguliers sont effectus pour viter les
dfauts de prparation ou de conservation. Les pathognes disponibles dans lalimentation sont
Salmonella, Shigella, E. coli entropathogne, S. aureus, des calicivirus, des astrovirus, le virus de
l'hpatite A...

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L'environnement anim se compose des :

Patients non infects (porteurs d'une flore commensale sensible aux antibiotiques). Une colonisation
par la flore hospitalire s'effectue en 72h (aussi appele flore transitoire). Ces bactries portent des
gnes de rsistance aux antibiotiques. 30% de la population porte S. aureus (le plus souvent de faon
asymptomatique) dans le tube digestif, le nez, les aisselles, l'aine... Un malade porteur de S. aureus ne
prsente pas trop de risque en l'absence de chirurgie...
La vsicule biliaire peut porter Salmonella.
L'utilisation d'antibiotiques contribue la slection de microorganismes (C. difficille, P. aeruginosa).
Il y a aussi une augmentation de la charge bactrienne digestive.
Ces patients sont des rservoirs pour eux-mmes et pour les autres.

Patients infects : plaie infecte, grippe, CMV, rotavirus, tuberculose, Salmonella, Shigella, E. coli
entropathogne, etc.

Familles qui sont porteuses d'une flore communautaire. A condition qu'ils respectent les rgles
d'isolement il n'y a pas de souci... Certains sujets sont infects par le rhume, la grippe, la rougeole.

Le personnel soignant. Nous sommes porteurs de S. aureus, ainsi que d'une flore hospitalire. Il y a un
grand rle des mains (qui contribuent 90% des infections nosocomiales). Il y a des dfauts de
vaccination (grippe et rougeole ne sont pas des vaccins obligatoires).

Animaux, et en particulier la sangsue mdicinale (Hirudo medicinalis) utilise en microchirurgie (et


chirurgie plastique surtout) car elle produit l'un des plus puissants anticoagulants connus. Lors d'une
reconstruction d'un doigt par exemple, les chirurgiens ne peuvent pour des raisons pratiques mettre en
route que la circulation artrielle. Le greffon est alors suraliment en sang artriel et va gonfler
provoquant une ncrose de l'artriole. On peut scarifier ou utiliser la sangsue pour drainer le sang. Elle
n'est pas douloureuse et l'anticoagulant permet de ne pas ncroser le greffon. Le souci, c'est que
Aeromonas hydrophila se situe dans le tube digestif de la sangsue (ces 2 organismes sont symbiotes) et
il peut ainsi y avoir des infections du patient cette bactrie.

II. Le CLIN

Le Comit de Lutte contre les Infections Nosocomiales est obligatoire depuis 1988 dans toutes les structures
hospitalires prives ou publiques.

Les attributions essentielles de ce comit sont les suivantes :


Organisation de la surveillance permanente des infections dans lhpital, au moyen de mthodes
pidmiologiques adaptes,
Encouragement et encadrement des actions de prvention contre linfection hospitalire,
Diffusion de linformation sur les infections nosocomiales,
Recommandations de conduites tenir (protocoles de soins, protocoles dantibioprophylaxie ou
dantibiothrapie),
Expertise technique auprs de ladministration de lhpital (choix des quipements, avis sur les travaux,
mthodes et produits dentretien, choix du matriel usage mdical, ),
Ractivit, capacit dintervention en rponse aux rsultats, aux cas dmontrs, la demande des
services.

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Le CLIN publie les prcautions standards :

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Merci Prescillia d'avoir russi trouver l'amphi pour venir me soutenir, pour avoir patient jusqu' 11h que
le prof arrive et pour les photos qui au final taient inutiles :D

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