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Tema 6
1. El código genético. Características
2. Relación de apareamiento codón-anticodón
3. Activación de los aminoácidos
– Aminoacil-tRNA sintetasas
Dos clases de Aminoacil-Trna sintetasas
Sistema de edición o de corrección de pruebas de las aminoacil-tRNA sintetasas
Principales zonas de reconocimiento del t-RNA por las aa-tRNA sintetasas
Síntesis del f-Met-tRNAi
Síntesis de otros aa-tRNA
Ruta eucariotas
Ruta procariotas
Síntesis de Pyl-tRNA en las bacterias productoras de metano
4. Síntesis de proteínas en procariotas
– Fase de inicio de la síntesis de proteínas en procariotas
– Fase de elongación de la síntesis de proteínas en procariotas:
1) Entrada de aa-tRNA
2) Formación del enlace peptídico
3) Translocación
Semejanza entre el factor EF-Tu unido a un aminoacil-tRNA (izquierda) y el factor
EF-G (izquierda). En verde aparece la parte proteica (EF-Tu) y en rojo la
correspondiente al tRNA.
– Fase de terminación de la síntesis de proteínas en procariotas
5. Síntesis de proteínas en eucariotas
5.1. Fase de inicio de la síntesis de proteínas en eucariotas
a) Formación del complejo de iniciación
5.2 Fase de elongación de la síntesis de proteínas en eucariotas
5.3 Fase de terminación de síntesis de proteínas en eucariotas
a) Modelo de la terminación de traducción eucariótica y vías de reciclaje
b) Envío de las proteínas eucarióticas con la señal adecuada al retículo endoplásmico
6. Incorporación de Selenocisteina durante la síntesis de proteínas.
7. Control de calidad en la síntesis de proteínas
8. Regulación de la síntesis de proteínas en procariotas
Ejemplo de Regulación en trans de la traducción de un mRNA bacteriano por sRNA
Ejemplo de Regulación en cis de la traducción de un mRNA bacteriano
9. Regulación de la síntesis de proteínas en eucariotas (Regulación de la traducción)
10. Modificaciones postraduccionales
Modificaciones postraduccionales:
a) Modificaciones covalentes
b) Rotura de enlaces covalentes por proteólisis
c) Modificaciones en aminoácidos concretos
d) Glicosilación
e) Adición de lípidos
f) Corte y empalme proteínico
11. Degradación de proteínas en eucariotas
12. Inhibidores de la síntesis proteica
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1. El código genético. Características.
1. Cada codón especifica para un solo aminoácido y esta relación es casi universal.
2. Determinados codones especifican el inicio (AUG) y el fin (UAA, UAG y UGA) de la cadena
polipeptídica.
3. En ocasiones los codones de terminación UGA y UAG pueden especificar el inicio y el fin de la cadena
polipeptídica.
4. Carece de solapamiento, es decir los tripletes no comparten bases nitrogenadas
5. Es unidireccional, pues los tripletes se leen en el sentido 5´-3´
6. Un aminoácido puede estar especificado por más de un codón, se dice que el código genético es
degenerado.
El balanceo de la primera base del anticodón, permite que se den apareamientos no canónicos con la tercera base del codón.
Así G puede interaccionar con U, e Inosina con A
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La hipótesis del “balanceo” o “tambaleo” (wobbling) fue propuesta para explicar que un mismo
anticodón puede establecer interacción con distintos codones, que se diferencian en su tercera base.
Consiste en que las bases 3ª (3') y 2ª (central) del anticodón reconocen a las bases respectivas, 1ª (5')
y 2ª (central), del codón de forma estricta, según las reglas de emparejamiento de Watson y Crick (A-T,
C-G), mientras que la primera base del anticodón (5') es menos selectiva y puede establecer con la 3ª
base del codón (3') un par de Watson y Crick o, mediante un pequeño desplazamiento, un par distinto.
Esto permite
a G emparejarse con C o con U en el codón
a U emparejarse con A o con G en el codón
a I (inosina) emparejarse con A, C o U en el codón
Como excepción, en ocasiones se puede dar un par de bases no estándar G.U entre
la posición 3 del anticodón y la 1 del codón, lo que permite que 4 de los 6 codones de Leu sean reconocidos por el
mismo anticodón.
Aminoacil-tRNA sintetasas.
1. El grupo carboxilo del aminoácido ataca al fosfato α del ATP
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2 a) El grupo aminoacilo es transferido al OH-2’ del residuo 3’-A del tRNA y se libera AMP
2 b) El grupo aminoacilo es transferido directamente al OH-3’ del residuo 3’-A del tRNA produciéndose el aminoacil-tRNA
3 a) La transesterificación mueve el grupo aminoacilo desde el OH-2’ al OH-3’, lo que genera el aminoacil-Trna
Corrección de pruebas de la Ile-tRNA sintetasa. Posee un centro de edición con actividad hidrolítica en el que cabe Val pero no
Ile. De manera que el intermedio Val-AMP es hidrolizado por la sintetasa.
Corrección de pruebas de la Val-tRNA sintetasa. Posee un centro de edición en el que cabe Thr pero no Val. De manera que el
producto Thr-tRNAVal es hidrolizado por la sintetasa.
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Síntesis de otros aa-tRNA.
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El ribosoma posee tres sitios de unión para los aminoacil-tRNA.
Las secuencias de Shine-Dalgarno se aparean con una secuencia cerca del extremo 3’ del rRNA 16S
1. Los factores IF-1 e IF-3 se unen a la subunidad 30S, luego se les une el mRNA
2. Unión de IF-2*fMet-tRNAi al sitio P, se aparean las bases del anticodón con las del codón de inicio
3. IF-2 hidroliza el GTP, se liberan todos los factores de inicio y entra la subunidad 50S
1) Entrada de aa-tRNA
2) Formación del enlace peptídico
3) Translocación
Semejanza entre el factor EF-Tu unido a un aminoacil-tRNA (izquierda) y el factor EF-G (izquierda). En
verde aparece la parte proteica (EF-Tu) y en rojo la correspondiente al tRNA.
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5.1 Fase de Inicio de síntesis de proteínas en eucariotas.
1) Las subunidades ribosómicas se separan, y los factores de inicio eIF 1, 1A y 3 se unen a la subunidad pequeña impidiendo su
reasociación
2) El eIF2 con GTP unido se une al Met-tRNAi después complejo ternario se une a la subunidad ribosómica ayudado por el eIF5. El
tRNA queda localizado con el anticodón en el sitio P. El eIF2B es necesario para que el eIF2 intercambie GDP por GTP
3) Al mRNA se unen varios factores de inicio, tanto a 5’-CAP como a la cola poliA. El mRNA queda formando un círculo. El mRNA
activado se une a la subunidad pequeña del ribosoma y forman el complejo de iniciación 48S.
4) El complejo recorre el RNA hasta encontrar el codón de inicio, en un proceso que consume ATP
5) Se separan los factores de inicio y se une la subunidad grande formándose el complejo de iniciación 80S ATP
Figura 2: Modelo de la terminación de traducción eucariótica y vías de reciclaje. En este modelo, la gran subunidad ribosomal se
dibuja como transparente para visualizar los ARNt, los factores y la unión del ARNm al centro de decodificación en la interfaz
entre los grandes y los pequeños. A lo largo, GTP se representa como una bola verde y GDP como una bola roja; también, las
posiciones del ARNm, los ARNt y los factores se dibujan para mayor claridad y no están destinados a especificar sus lugares
exactos en el ribosoma. En el reconocimiento de un codón de parada, la eRF1: eRF3: GTP complejo ternario se une al sitio A del
ribosoma en un estado preaccommodated, se produce la hidrólisis de GTP, y eRF3 se libera. ABCE1 / Rli1 se une y facilita el
alojamiento de eRF1 en una configuración óptimamente activa.
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2. Por RNAs que pueden actuar en cis o en trans
3. Por proteínas que impiden la unión entre los factores eIF4E e eIF4G.
4. Por pequeños RNA de interferencia mi/siRNA (microRNA, small interference RNA), que son complementarios
con el mRNA, se unen a él y pueden impedir latraducción (miRNA) o provocar su destrucción (siRNA).
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d) Glicosilación.
Es una de las más importantes y más complejas, consiste en la adición de unidades glucídicas (glucosa, manosa,
galactosa, N-acetilglucosamina, Naacetilgalactosamina, fucosa y ácido siálico) a residuos de:
Ser o Thr
e) Adición de lípidos.
Isoprenilo
Ácido mirístico
Ácido palmítico
Glicolípido conteniendo fosfatidilinositol
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• Toxina diftérica
• Ricina
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