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Exercice 1 :
Séquence 1 : AAGTCATTCGCACATCG
Séquence 2 : AACACATCG
Solution :
A A G T C A T T C G C A C A T C G
A x x x x x
A x x x x x
C x x x x x
A x x x x x
C x x x x x
A x x x x x
T x x x x
C x x x x x
G x x x
Exercice 7 :
Exemple d’alignement
Séquence 1: GENETICS
Séquence 2: GENESIS
Score=31
Solution de l’exercice
Séquence 1: HEAGAWGHEE
Séquence 2: PGAWHEAE
Score=17
Exercice 8:
Calculez la E-value et la P-value des alignements obtenus précédemment avec les paramètres λ = 1 et K= 0,25 et sachant que la
base de données contient 1.106 acides aminés.
Exemple : Alignement deuxième série de séquence : score=17 séquence sonde : HEAGAWGHEE
E-value= 0,25x10x1.106 x e-17= 0,10