Universidad Nacional Autonoma de Las enzimas suelen ser mucho más
Mexico grandes que sus sustratos y en muchas
ocasiones requieren de la participación de Facultad de Estudios Superiores otras moléculas más pequeñas no poli Cuautitlan peptídicas como las coenzimas (biotina, NADH entre otros) o los iones metálicos Cinética química y catálisis llamados cofactores. I.Q. Adolfo Obaya Valdivia Algunas enzimas, como la pepsina y Nombre: Cervantes Rojo Blanca Areli la tripsina, que intervienen en la hidrólisis de muchos tipos de proteínas, controlan 2018-1 muchas reacciones diferentes, mientras que otras como la ureasa, son muy Enzimas: específicas y sólo pueden acelerar una Son moléculas de proteínas que tienen la reacción. Otras liberan energía para la capacidad de facilitar y acelerar contracción cardiaca y la expansión y las reacciones químicas que tienen lugar contracción de los pulmones. Muchas en los tejidos vivos, disminuyendo el nivel facilitan la conversión de azúcar y de la "energía de activación" propia de la alimentos en distintas sustancias que el reacción. organismo precisa para la construcción de tejidos, la reposición de células Una enzima es una proteína que actúa sanguíneas y la liberación de energía como catalizador de una reacción química para mover los músculos. química acelerándola. Las enzimas son protagonistas fundamentales en los Las enzimas son muy eficaces. Por ejemplo, unos 30g de pepsina cristalina procesos del metabolismo celular. Las pura son capaces de digerir casi dos enzimas unen su sustrato en el centro toneladas métricas de clara de huevo en reactivo o catalítico, que suele estar pocas horas. protegido del agua para evitar interacciones no deseadas. En el centro La cinética de las reacciones enzimáticas reactivo la disposición espacial y los tipos difiere de las reacciones inorgánicas de cadenas laterales de aminoácidos son simples. Cada enzima es específica de fundamentales para orientar forma selectiva para la sustancia sobre la que causa la reacción, y es más eficaz a correctamente el sustrato y poder una temperatura determinada. Aunque un interaccionar de la forma deseada para aumento de la temperatura puede llevar a cabo la catálisis de la reacción. acelerar una reacción, las enzimas son Las enzimas son muy selectivas en inestables cuando se calientan. La relación a los sustratos que modifican. actividad catalítica de una enzima está determinada sobre todo por su secuencia de aminoácidos y por la estructura terciaria, es decir, la estructura de plegamiento tridimensional de la macromolécula. Función de las enzimas Las enzimas son proteínas que catalizan todas las reacciones bioquímicas. Además de su importancia como catalizadores biológicos, tienen muchos para una respiración celular usos médicos y comerciales. adecuada. La mayoría de las reacciones de los sistemas vivos son reversibles, es decir, Clasificación de las enzimas según su que en ellas se establece el equilibrio actividad químico. Por lo tanto, las enzimas aceleran la formación de equilibrio Hidrolasas: Catalizan reacciones de químico, pero no afectan las hidrólisis. Rompen las biomoléculas concentraciones finales del equilibrio. con moléculas de agua. A este tipo pertenecen las enzimas digestivas. Isomerasas: Catalizan las reacciones en las cuales un isómero se transforma en otro, es decir, Clasificación de las enzimas según su reacciones de isomerización. complejidad: Ligasas: Catalizan la unión de moléculas. Simples: Formada por una o más Liasas: Catalizan las reacciones de cadenas polipeltídicas. adición de enlaces o eliminación, para producir dobles enlaces. Conjugadas: Contiene por lo menos Oxidorreductasas: Catalizan un grupo no proteico enlazado en la reacciones de óxido-reducción. cadena polipeltídica. Facilitan la transferencia de electrones de una molécula a otra. En las proteínas conjugadas podemos Ejemplo; la glucosa, oxidasa cataliza distinguir dos partes: la oxidación de glucosa a ácido glucónico. Tansferasas: Catalizan la Apoenzima: Es la parte polipeptídica transferencia de un grupo de una de la enzima. sustancia a otra. Ejemplo: la Cofactor: Es la parte no proteica de la transmetilasa es una enzima que enzima. cataliza la transferencia de un grupo metilo de una molécula a otra. La combinación de la apoenzima y el cofactor forman la holoenzima. Los cofactores pueden ser:
Iones metálicos: Favorecen la
actividad catalítica general de la enzima, si no están presentes, la enzima no actúa. Estos iones metálicos se denominan activadores. Ejemplos: Fe2+, Mg2+, Cu2+, K+, Na+ y Zn2+
La mayoría de los otros cofactores
son coenzimas las cuales generalmente son compuestos orgánicos de bajo peso molecular, por ejemplo, las vitaminas del complejo Reacciones de las enzimas “B” son coenzimas que se requieren La enzima acelera la reacción química disminuyendo la energía de activación. La enzima lleva a cabo esta disminución de la barrera energética interaccionando con los elementos que participan en la reacción química estabilizándolos en el centro reactivo. Así, aumenta enormemente la probabilidad de que se produzca la reacción química ya que El sitio activo la enzima (E) une al concentra y pone en contacto los substrato (S) formando un complejo elementos necesarios para la reacción. enzima-substrato (ES). En el complejo En algunas reacciones enzimáticas ES, E transforma a S en él o los participan coenzimas que permiten que productos, formando el complejo enzima- durante la reacción la enzima no sufra producto (EP), finalmente la enzima libera modificaciones químicas que le impidan del sitio activo a P, regenerándose. repetir el proceso. La actividad enzimática se restaura con sólo reemplazar la coenzima y el complejo enzimático queda listo para catalizar una nueva reacción. E + S ˭ ES ˭ E + P
Además de las enzimas
de naturaleza puramente proteica existen moléculas no proteicas capaces de catalizar reacciones como las ribozimas, PROTEINA: formadas por moléculas de ARN. Los nutrientes de gran importancia Usos de las enzimas: La fermentación biológica que son las proteínas, son alcohólica y otros procesos industriales macromoléculas que constituyen el importantes dependen de la acción de enzimas, sintetizadas por las levaduras y principal nutriente para la formación de los bacterias empleadas en el proceso de músculos del cuerpo. Además de la producción. Algunas enzimas se utilizan formación de tejidos, las proteínas con fines médicos. En ocasiones son también regulan varias funciones del útiles en el tratamiento de zonas de organismo. inflamación local; la tripsina se emplea para eliminar sustancias extrañas y tejido Una de la funciones de las muerto de las heridas y quemaduras. proteínas consiste en transportar las sustancias grasas a través de la sangre, elevando así las defensas de nuestro SITIO ACTIVO: organismo. Por lo tanto la ingesta diaria de estos nutrientes que son las Las moléculas de enzimas contienen proteínas es imprescindible para una hendiduras o cavidades denominadas dieta sana y saludable para todos siendo sitio activo. El sitio activo está formado por la ingesta de alimentos ricos en las cadenas laterales de residuos proteínas de especial importancia en específicos, lo que ocasiona que tenga un arreglo tridimensional particular, diferente la nutrición deportiva. al resto de la proteína. Este sitio es afín por la estructura tridimensional del sustrato: Las proteínas poseen una estructura química central que consiste en una cadena lineal de aminoácidos plegada de forma que muestra una estructura que es una proteína simple es la tridimensional, esto les permite a las ubiquitina. proteínas realizar sus funciones. Por otro lado, están proteínas que son proteínas conjugadas. Estas proteínas contienen además de su En las proteínas se codifica el material cadena polipeptídica un componente genético de cada organismo y en él se que no es un aminoácido, especifica su secuencia de denominado grupo prostético. Este aminoácidos. Estas secuencias de componente puede ser un ácido aminoácidos se sintetizan por los nucleico, un lípido, un azucar o ribosomas para formar las simplemente un ión inorgánico. macromoléculas que son las proteínas. Ejemplos de proteínas que son Existen 20 aminoácidos diferentes que proteínas conjugadas son la se combinan entre ellos de múltiples mioglobina, la hemoglobina y los maneras para formar cada tipo de citocromos. proteínas. Los aminoácidos pueden Según su forma, las proteínas se dividirse en 2 tipos: Aminoácidos clasifican en dos tipos que son proteínas esenciales que son 9 y que se obtienen fibrosas y proteínas globulares. de alimentos y aminoácidos no esenciales que son 11 y se producen en Si en un tipo de proteínas hay una nuestro cuerpo. dimensión mayor que las demás de dice que son proteínas fibrosas. Es La composición de las proteínas consta común que este tipo de proteínas, las de carbono, hidrógeno, nitrógeno y proteínas fibrosas, tengan además oxígeno además de otros elementos funciones estructurales. como azufre, hierro, fósforo y cinc. En las proteínas que son proteínas En las células, las moléculas orgánicas globulares su cadena polipeptídica más abundantes que son las proteínas, se encuentra enrollada sobre sí constituyen más del 50 % del peso seco misma. Esto da lugar a una de las mismas. estructura que es esférica y compacta en mayor o menor medida. Las proteínas son el principal nutriente para la formación de los músculos del cuerpo. AMINOACIDOS: Los aminoácidos son compuestos Clasificación de las proteínas: orgánicos que se combinan para formar proteínas. Los aminoácidos y las Según su composición, las proteínas se proteínas son los pilares fundamentales pueden clasificar en dos tipos que de la vida. son proteínas simples o proteínas Cuando las proteínas se digieren o se conjugadas. descomponen, los aminoácidos se acaban. El cuerpo humano utiliza Por un lado tenemos las aminoácidos para producir proteínas con proteínas que son proteínas el fin de ayudar al cuerpo a: simples y son aquellas que, por hidrolisis, producen solamente µ- Descomponer los alimentos, Crecer, aminoácidos. Un ejemplo de proteína Reparar tejidos corporales, Llevar a cabo muchas otras funciones corporales. El La célula es una estructura constituida cuerpo también puede usar los por tres elementos básicos: membrana plasmática, citoplasma y material aminoácidos como una fuente de energía. genético (ADN). Las células tienen la capacidad de realizar las tres funciones Los aminoácidos se clasifican en tres vitales: nutrición, relación y reproducción. grupos:
La forma de las células está
determinada básicamente por su función. La forma puede variar en AMINOÁCIDOS ESENCIALES función de la ausencia de pared celular rígida, de las tensiones de uniones a Los aminoácidos esenciales no los puede células contiguas, de la viscosidad del citosol, de fenómenos osmóticos y de producir el cuerpo. En consecuencia, tipo de citoesqueleto interno. deben provenir de los alimentos. El tamaño de las células es también extremadamente variable. Los factores Los 9 aminoácidos esenciales son: que limitan su tamaño son la capacidad histidina, isoleucina, leucina, lisina, de captación de nutrientes del medio metionina, fenilalanina, que les rodea y la capacidad funcional del núcleo. treonina, triptófano y valina. AMINOÁCIDOS NO ESENCIALES Cuando una célula aumenta de tamaño, aumenta mucho más su volumen (V) que No esencial significa que nuestros su superficie (S) (debido a que V = cuerpos producen un aminoácido, aun 4/3 r3 mientras que S = 4/3 r2). Esto implica que la relación superficie/volumen cuando no lo obtengamos de los disminuye, lo que es un gran alimentos que consumimos. inconveniente para la célula ya que la entrada de nutrientes está en función de Los aminoácidos no esenciales incluyen: su superficie y no del volumen. Por este alanina, asparagina, ácido aspártico y motivo, la mayoría de las células maduras ácido glutámico. son aplanadas, prismáticas e irregulares, y pocas son esféricas, de forma que así AMINOÁCIDOS CONDICIONALES mantienen la relación superficie/volumen constante. El aumento de volumen de la célula nunca va acompañado del aumento Los aminoácidos condicionales por lo de volumen del núcleo, ni de su dotación regular no son esenciales, excepto en cromosómica. momentos de enfermedad y estrés.
Los aminoácidos condicionales incluyen: TIPOS DE CÉLULAS
arginina, cisteína, glutamina, tirosina, Células eucariotas. Poseen un núcleo glicina, ornitina, prolina y serina. diferenciado de sus otras partes. En otras palabras, una célula eucariota posee citoplasma, mitocondrias, vacuolas, etcétera, que pueden identificarse CELULAS: plenamente en su interior. El ADN o material hereditario está contenido únicamente en el núcleo celular. Los en las células procariotas y en el núcleo de las células eucariotas, en el interior de organismos constituidos por células los cromosomas eucariotas son los seres eucariontes. El ADN tiene como función principalalmacenar información genética para la construcción de proteínas y ARN que es imprescindible para cualquier función vital de un organismo. El ADN almacena y transmite de generación en generación toda la información indispensable para el desarrollo de las funciones biológicas de un organismo. Los segmentos de ADN que transporta la Células procariotas. No poseen un núcleo información genética son conocidos y por consiguiente tampoco membrana como genes, pero las demás secuencias de ADN tienen como fin estructurales o nuclear. El ADN se encuentra esparcido toman parte en la regulación del uso de la por todo el citoplasma y éste no contiene información genética. En referencia a lo dicho anteriormente, se mitocondrias, lisosomas, centriolos ni puede observar el ADN codificante y el ADN no codificante. Asimismo, en un gen vacuolas. Los seres vivos formados por la secuencia de nucleótidos establecidas células procariotas reciben el nombre de en una hebra de ADN se transcribe a un ARN mensajero y, a su vez se traduce en organismos o seres procariontes. una proteína que un organismo sintetiza en uno o algunos momentos de su vida y, Una tipología más considera dos tipos de por último la replicación de ADN consiste células en función del organismo al que en obtener copias idénticas de una molécula de ADN fundamental para la pertenecen, en este sentido, existen transferencia de una generación a otra, células animales y células vegetales. base de la herencia.
Vea también ARN.
El ADN está formado por bandas
formadas por compuestos químicos llamados nucleótidos. A su vez, cada nucleótido está constituido por 3 unidades: una molécula de azúcar, es decir, desoxirribosa, un grupo fosfato y una de 4 bases: adenina, guanina, timina y citosina. En el centro del nucleótido está la molécula de desoxirribosa y está rodeada por un lado de un grupo fosfato y DNA el otro una base, la desoxirribosa-fosfato enlazadas forman lo que se conoce como los lados de la escalera. El ADN son las siglas de ácido El ADN de cada ser humano es exclusivo, desoxirribonucleico, es un compuesto cada ser humano posee 2 formas de cada orgánico que contiene la información gen, es decir, uno que recibe del padre y genética de un ser vivo y de algunos virus, el otro de la madre, pero a pesar de ser los genes iguales entre las personas En referencia a lo anterior, se puede algunas secuencias de ADN varían de distinguir la interacción de diversos tipos persona a persona. El ADN se de ARN en la expresión genética, entre caracterizapor la posición y cantidad de los cuales tenemos: estos nucleótidos a lo largo de las cadenas, esta secuencia se conoce como ARN mensajero (ARNm), conocido como código génico o genético. ARN codificante, posee el código genético La descripción del ADN fue publicada por que determina el esquema de los primera vez en el año 1953 por Jamen aminoácidos para formar una proteína; Watson y Francis Crick, ambos recibieron ARN transferencia (ARNt) se encarga de el Premio Nobel de Medicina en el año llevar los aminoácidos a los ribosomas 1962. con el fin de incorporarlos al proceso de síntesis proteica, asimismo, se encarga Por último, para obtener conocimientos de codificar la información que posee el sobre la paternidad de un infante se debe ARN mensajero a una secuencia de de realizar una prueba de ADN con el fin proteínas y, por último, de confirmar su origen genético. ARN ribosómico (ARNr) forma parte de los ribosomas y actúa en la actividad enzimática, el mismo se encarga de crear los enlaces peptídicos entre los ARN aminoácidos del polipéptido en el proceso El ARN son las siglas de Ácido de síntesis de proteínas. No obstante, los estudios del ARN se Ribonucleico, ácido que interviene junto al iniciaron en el año 1868 por Friedrich ADN en la síntesis de proteínas y del Miescher, asimismo, fue la primera traslado de la información genética del persona en investigar el ADN y promover ADN. Asimismo, la abreviación el estudio de los ácidos nucleicos. internacional es RNA que significa Ribonucleic Acid. El ARN está presente en células eucariotas y procariotas. Asimismo, el ARN está compuesto por una cadena simple que en ocasiones puede duplicarse.
El ARN está conformado por nucleótidos,
los cuales se unen por enlaces fosfodiester cargados negativamente y, cada nucleótido está constituido por: ribosa, fosfato y 4 compuestos El ADN significa ácido nitrogenados, conocidos como: adenina, desoxirribonucleico, posee azúcar de guanina, uracilo y citosina. desoxirribosa y su base nitrogenada está El ARN cumple con diversas compuesta de: adenina, timina, citosina y funcionessirve para intermediar en la guanina, asimismo, el ADN posee 2 información genética y de catalizador en hebras enrolladas juntas para formar una la síntesis de proteína, es decir, el ARN doble hélice. A su vez, el ARN, es decir, copia la información de cada gen del ADN y, luego pasa al citoplasma, donde se une ácido ribonucleico, contiene azúcar de al ribosoma para dirigir la síntesis ribosa, su base nitrogenada está formada proteica. de: adenina, uracilo, citosina y guanina y, el cual es el causante de numerosas por lo general, forma una sola hebra. enfermedades como: gripe, ébola, virus del papiloma humano, sida (VIH), entre otros. La palabra virus proviene del latín Bacteria “virus” que significa “toxina” o “veneno”.
La bacteria es un microbio unicelular y Los virus están conformado por: el
procarionte, lo que significa que su núcleo material genético que transporta la no se limita a una membrana nuclear. información hereditaria bien sea ADN o Las bacterias, junto con los protozoos, los ARN, cápside que es una cubierta proteica que protege los genes y una hongos y las algas, pertenecen a la envoltura vírica o bicapa lipídica que los categoría de los microbios, que son envuelve cuando se sitúan fuera de la formas de vida microscópica. célula. Hay bacterias que conviven dentro de otros organismos en relaciones Los virus necesitan de células huéspedes simbióticas llamadas endosimbiontes. El para poder reproducirse, dentro de las ejemplo más común es la flora células pueden obtener aminoácidos, bacteriana de nuestro tracto digestivo que ribosomas y otras sustancias que nos ayuda a procesar nutrimentos que no permitan la multiplicación de nuevos virus, somos capaces de digerir sin su ayuda. una vez el virus está dentro de la célula comienza a entorpecer el normal Las bacterias tienen las funcionamiento de las mismas siguientes características: ocasionando enfermedades. El proceso Son procariotas: su ‘núcleo’ está formado de replicación viral puede tardar horas por un único cromosoma y carece de como días, todo depende del virus. membrana celular. Tienen un ADN singular y circular: nadan La virología es la rama de la microbiología libres en el citoplasma. o la medicina que se encarga de estudiar Se reproducen mediante fisiones el comportamiento de los virus, su binarias o división celular: el ADN se estructura, clasificación, evolución, las divide y luego se divide también su técnicas para su aislamiento, entre otros. citoplasma para crear dos células hijas. Asimismo, el nombre genérico de las Posee una pared celular compuesta enfermedades originadas por virus de peptidoglicano: muy resistente por ser patógenos es virosis. de cadena recta y no ramificada. Tienen diferentes métodos de Retrovirus metabolismos y de hábitats. Tipo de virus que emplea el ARN como su Algunos tienen cilios o flagelos. material genético. Después de infectar Según su forma, las bacterias son una célula, un retrovirus emplea una generalmente clasificadas en: bacilos enzima llamada transcriptasa inversa (bastón), espirilos (espirales) para convertir el ARN en ADN. Luego, el o cocos (esféricos). retrovirus integra su ADN en el ADN de la célula huésped, que le permite multiplicarse. El VIH, causante del SIDA, Virus es un retrovirus. El virus es un parásito intracelular obligatorio, de pequeño tamaño, constituido por ácido nucleico y proteína, Virión En microbiología se denomina virión a la partícula vírica morfológicamente completa e infecciosa. Está compuesto por:
Ácido nucleico vírico: puede
ser ADN o ARN, solo uno de ellos, y de cadena doble o sencilla. Lo más Bases Púricas y Pirimidínicas: frecuente es ADN bicatenario, lineal o circular, o bien ARN monocatenario Las bases nitrogenadas que forman parte siempre lineal. de los ácidos nucleicos son de dos Proteínas víricas: forman la cubierta tipos, púricas y pirimidínicas. Las bases externa o cápside, compuesta por púricas derivadas de la purina (fusión de subunidades que se denominan un anillo pirimidínico y uno de imidazol) "capsómeros". Cada capsómero son la Adenina (6-aminopurina) y puede estar formado por una o más la Guanina (2-amino-6-hidroxipurina). Las subunidades proteicas que son bases pirimidínicas (derivadas de la constantes para cada virus. Los pirimidina) son la Timina (2,6-dihidroxi-5- capsómeros son proteínas metilpirimidina o también llamada 5- estructurales, pero el virión puede metiluracilo), Citosina (2-hidroxi-6- tener también proteínas enzimáticas y aminopirimidina) y Uracilo (2,6- aglutinantes. dihidroxipirimidina). Las bases La nucleocápside: una cápside interi nitrogenadas que forman normalmente or más el genoma (ARN o ADN), que parte del ADN son: Adenina (A), Guanina puede tener distintas formas. (G), Citosina y Timina (T). Las bases En algunos casos el virión (virus con nitrogenadas que forman parte de el ARN envoltura) contiene también son: Adenina (A), Guanina (G), Citosina una membrana lipídica que envuelve (C) y Uracilo (U). Por tanto, la Timina es a la nucleocápside y contiene específica del ADN y el Uracilo es proteínas de origen viral y algunas específico del ARN. proteínas de la célula infectada. Ejemplos de virus con envoltura son Las purinas que tienen un anillo de 5 el VIH (contiene las glicoproteínas miembros fusionado a uno de 6: gp120 y gp41 virales y algunas moléculas celulares) o el virus de la gripe (contiene la neuraminidasa y la hemaglutinina virales). Inhibidor Las pirimidínas que tienen un anillo de Los inhibidores seis miembros enzimáticos son moléculas que se unen a enzimas y disminuyen su actividad. Puesto que el bloqueo de una enzima puede matar a un organismo patógeno o corregir un desequilibrio metabólico, muchos medicamentos actúan como inhibidores enzimáticos. También son usados como herbicidas y pesticidas. Sin embargo, no todas las moléculas que se Número de recambio: kcat o k2 unen a las enzimas son inhibidores; los activadores enzimáticos se unen a las Se define como el máximo número enzimas e incrementan su actividad. de moléculas de un sustrato que una molécula de enzima puede convertir en producto por unidad de tiempo. Se calcula Mecanismos de inhibición del siguiente modo: 𝑉𝑚𝑎𝑥 𝐾𝑐𝑎𝑡. = [𝐸]𝑇 En la catálisis en química organometálica; el número de recambio (TON siglas de turnover number en inglés) posee un significado diferente: aquí es el número de moles de sustrato que un mol de catalizador puede convertir antes de quedar inactivado. Un catalizador ideal, tendría un número de recambio infinito, ya que no debería ser consumido; pero en la práctica este número oscila entre 100 moles de sustrato y 40 millones.
Unidad de Actividad Enzimática:
Se define la unidad de actividad enzimática (U) como la cantidad de enzima que cataliza la conversión de 1 µmol de sustrato en un minuto. La actividad específica es el número de unidades de enzima por miligramo de proteína (U/mg prot) o por mililitro de disolución (U/ml). Representacion de Lineweaver-Burk