CIB centro

de investigaciones
biológicas
CIB centro
de investigaciones
biológicas

Memoria de la Dirección | Director’s Report 2

Biología Físico-Química | Chemical and Physical Biology 6

Biología Medioambiental | Environmental Biology 34

Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine 56

Microbiología Molecular y Biología de las Infecciones

Molecular Microbiology and Infection Biology 94

Proliferación Celular y Desarrollo | Cell Proliferation and Development 116

Servicios Científicos | Scientific Facilities 138

Memoria Científica |
Scientific Report 2009-2010 Actividades y Datos | Activities and Data 148

ÍNDICE
 Memoria de la Dirección I+D+i y como consecuencia, un incremento de la competitividad a
la hora de obtener financiación para los diversos proyectos, el CIB ha
mantenido un más que digno nivel de financiación (Figura 4) y compite
con éxito, no solamente en las convocatorias nacionales, sino también
en las de la Unión Europea y de otros organismos internacionales
Fig. 1
Citaciones del CIB a lo largo de los últimos 18 años
Citations of the CIB over the past 18 years

producción científica en función de índices bibliométricos en general
sobrevalorados. El CIB es un centro de investigación multidisciplinar
y aplicando criterios propios de cada área de investigación, tres de
cada cuatro trabajos que publicamos se encuentra en el primer
cuartil de las revistas de su área correspondiente. Además, el trece
por ciento de los artículos científicos del CIB han sido publicados
en las mejores revistas de todas las áreas científicas. Así, las revistas
Nature, Science, EMBO Journal o los Proceedings de la Academia de
Ciencias de Estados Unidos se encuentran de una forma habitual en
las listas de publicaciones del CIB (ver bibliografía seleccionada en
página 152). Algunos de los hitos de años recientes, tanto científicos
como tecnológicos, se recogen en la Figura 2. Las actividades de
transferencia de la investigación, que incluyen generación de
patentes nacionales e internacionales, y su licencia, han continuado
muy activas en este bienio (Figura 3), habiéndose solicitado 19
patentes nacionales, 6 internacionales y licenciado 4 de ellas.
En este periodo el CIB continúa llevando a cabo un análisis crítico
de los departamentos de investigación para mejorar su eficiencia
Memoria de la Dirección | Director’s Report
y contratos con diferentes empresas de prestigio internacional (ver
proyectos especiales en página 155).
Sin embargo, el CIB ha sufrido durante estos años una reducción en
la incorporación de personal científico, de forma que sólo tres nuevos
científicos se han incorporado al Centro. Por ello, las cifras de personal en
plantilla son similares a las del bienio anterior (Fig. 5), mientras que hay un
importante aumento del personal científico contratado, actual­mente 186
personas (116 mujeres y 70 hombres) y ha disminuido solo ligeramente
el personal becado, 98 en la actualidad (66 mujeres y 32 hombres).
En el empeño de mejorar las prestaciones y servicios a los investigadores,
el año 2010 han comenzado las obras de un nuevo animalario que
duplicará las capacidad del actual y mejorará sensiblemente los
proyectos que necesitan experimentación animal. Se prevé que esta
gran instalación, esté terminada a mediados del año 2011.
Durante los dos últimos años el CIB ha continuado con su tarea
de hacer la ciencia más accesible al público, y recogemos
las actividades de Ciencia y Sociedad en un
nuevo apartado en esta memoria. Seguiremos

científica. En esta tarea contamos con la ayuda del Comité Científico

Asesor Externo, presidido por la Profesora Daniela Rhodes del MRC de encarando el futuro con optimismo puesto que el

U
na vez más, el Centro de Investigaciones Biológicas rinde
cuentas de su actividad durante los dos últimos años.
Durante este periodo, el CIB ha seguido en su línea de mejora
de su producción científica, tanto en cantidad como en calidad. El
incremento cuantitativo tiene que ser necesariamente modesto al
mantenerse casi constante el número de científicos. Sin embargo es
muy relevante el incremento en la calidad de las publicaciones en
las que se ha plasmado el trabajo científico realizado en este periodo
y también el crecimiento exponencial del número de citas de estos
trabajos (Figura 1). En la actualidad se da una tendencia a valorar la
la Universidad de Cambridge, y compuesto por científicos de primera personal que trabaja en el CIB sigue demostrando
línea internacional. Durante el año 2009 realizaron una visita al CIB para cada día que es capaz de sobreponerse a las
conocer de cerca el funcionamiento de los diferentes departamentos circunstancias menos favorables para conseguir
y para completar esta tarea nos visitarán de nuevo durante el año el mejor rendimiento y la mejor calidad en el
2011. Los informes emitidos por el Comité Científico Asesor Externo trabajo científico. 
son de gran utilidad a la hora de proponer medidas que potencien
y reorganicen los grupos existentes, para mejorar su eficiencia
ajustándose a las circunstancias, siempre cambiantes, de la ciencia
➌ 2005 2006 2007 2008
internacional. Durante este periodo, en el que la situación económica
internacional ha determinado una reducción de los fondos para la Creation of the spin-off,
ProRetina Therapeutics, based ➏ 2007 2008 2009 2010

Fig. 2
on patented knowledge of the Characterization of new drug
CIB-CSIC, to develop a treatment binding sites in essential ➐
Hitos recientes en el CIB | CIB recent milestones
2008 2009 2010
for Retinitis Pigmentosa with the protein assemblies: eukaryotic
Orphan Drug Proinsulin. tubulin and bacterial cell Identification of matrix metallo­proteinase-9
Enrique J. de la Rosa & division protein FtsZ. as a novel pathogenic factor in B-cell
➋ chronic lymphocytic leukemia, contributing
2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 Flora de Pablo Jose M. Andreu & to the progression of this malignancy by
Association of complement genes with disease: Identification of genetic J. Fernando Díaz enzymatic and non-enzymatic activities.
predisposition to atypical Hemolitic Uremic Syndrome and Dense Deposit Disease.
Angeles García-Pardo et al.
Santiago Rodríguez de Córdoba et al.

2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010

➊ 2002 2003 2004 2005 2006 2007
Advances in understanding the signal transduction pathway mediating
changes in gene expression in response to environmental pH in fungi.
Miguel A. Peñalva et al.
➊ Díez, E., Álvaro, J., Espeso, E.A., Rainbow, L., Suárez, T., Tilburn, J., Arst, H.N., Jr. and Peñalva,
M.A. EMBO J. 21: 1350-1359 (2002). | S. Herranz, J.M. Rodríguez, H.-J. Bussink, J.C. Sánchez-
Ferrero, H.N. Arst, Jr., M.A. Peñalva and O. Vincent. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102:12141-
12146 (2005). | Galindo, A., Hervás-Aguilar, A., Rodríguez-Galán, O., Vincent, O., Arst, H.N., Jr.,
Tilburn, J. and Peñalva, M.A. Traffic 8: 1346-1364 (2007). ➋ Sánchez-Corral P, Pérez-
Caballero D., Huarte, O., Simckes, A.M.,Goicoechea de Jorge, E., Lopez-Trascasa M. and
Rodríguez de Córdoba, S. Am. J. Human Genet. 71:1285-1295 (2002). | E. Goicoechea de
Jorge, C.L. Harris, J. Esparza-Gordillo, L. Carreras, E.Aller Arranz, C. Abarrategui Garrido, M.
López-Trascasa, P. Sánchez-Corral,B.P. Morgan and S. Rodríguez de Córdoba. Proc Natl.
Acad. Sci. USA 104:240-245 (2007). | Martínez-Barricarte R., Heurich M., Valdes-Cañero F.,
4 Vázquez-Martul E., Torreira E., Montes T., Tortajada A., Pinto S., López-Trascasa M., Morgan BP.,
Llorca O., Harris CL. and Rodríguez de Córdoba S. J Clin Invest.120:3702-3712 (2010).
4 5
➍ 2006 2007 ➎ 2006 2007 2008 2009 2010 ➑ 2010 Approval of Raloxifene as Orphan
Drug by the EMA and FDA for the treatment of
First characterization of the Large collaborative projects on biotechnology
Hereditary Haemorrhagic Telangiectasia (HHT).
molecular architecture of large for renewable plant resources funded by the EU
macromolecular complexes and Spanish demonstration programme. Mª Luisa Botella & Carmelo Bernabeu
assembled by the PI3-Kinase- Angel T. Martínez & Mª Jesús Martínez
related kinases (PIKK), involved
in DNA repair and cell growth.
➌ Mansilla, A, López-Sánchez, C., Oscar Llorca et al. ➎ BIORENEW EU-project on “BIOtechnology for added value products from RENEWable ➐ Redondo-Muñoz, J., Ugarte-Berzal, E., García-Marco, J.A., Hernández del Cerro, M., Van
de la Rosa, E.J., García-Martínez, V., plant polymers” (2006-10), coordinated by CIB , near 200 publications (www.biorenew.org). den Steen, P.E., Opdenakker, G., Terol, M.J., and Garcia-Pardo, A. Blood, 112: 169-178 (2008).
Martínez-Salas, E., De Pablo, F, Patent: (USA) 10080210393, (European) EP 1 908 876 A1 (licensed to Novozymes); - I+DEA | Ugarte-Berzal, E., Redondo-Muñoz, J., Eroles, P., Hernández del Cerro, M., García-Marco,
Hernández-Sánchez, C. EMBO Reports project on “Ethanol for automotion” (2007-10), Spanish CENIT programme, (coordinated by J.A., Terol, M.J., and García-Pardo, A. Blood, 115: 846-849 (2010). | Redondo-Muñoz, J.,
6, 11-82 (2005). | C. Hernández-Sánchez, A. Mansilla, E. J. de la Rosa, F. de Pablo. Abengoa-Bioenergy); | Demo E-2 project (2009-10), the first Spanish Demonstration Project Ugarte-Berzal, E., Terol, M.J., Van den Steen, P.E., Hernández del Cerro, M., Roderfeld, M.,
Diabetología 49,1142-50 (2006). Corrochano, R. Barhoum, P. Boya, A. I. Arroba, N. on second generation bioethanol (coordinated by Abengoa-Bioenergy). ➏ Buey RM, Roeb, E., Opdenakker, G., García-Marco, J.A., and Garcia-Pardo, A. Cancer Cell, 17: 160-172
Rodríguez-Muela, V. Gómez-Vicente, F. Bosch, F. de Pablo, P. de la Villa, E. J. de la Rosa. Calvo E, Barasoain I, Pineda O, Edler M.C., Matesanz R, Cerezo G, Vanderwal CD, Day BW, (2010). ➑ Comp Meeting EU/3/10/730, http://ec.europa.eu/health/documents/
Invest. Ophthalmol. Vis.Sci. 49:4188-94 (2008). ➍ Spagnolo, L., Rivera-Calzada, A., Pearl, Sorensen EJ, Lopez JA, Andreu JM, Hamel E, Díaz JF. Nature Chem. Biol., 3, 117-125 (2007); community-register/html/orphreg.htm (see raloxifene chlorhydrate), and approved by
L.H., Llorca, O. Molecular Cell 22:511-519 (2006). | Adami, A., García-Álvarez, B., Arias- | Andreu JM, Schaffner-Barbero C, Huecas S, Alonso D, Lopez-Rodriguez ML, Ruiz-Avila LB, FDA August 20, 2010. | Albiñana V, Bernabeu-Herrero ME, Zarrabeitia R, Bernabeu C,
Palomo, E., Barford, D., Llorca, O. Molecular Cell 27:509-516 (2007). | Llorca, O. Curr. Núñez-Ramírez R, Llorca O, Martín-Galiano AJ. J. Biol Chem. 285, 14239-14246 (2010); | Botella LM. Thromb. Haemost. 103: 525-534 (2010). Bernabeu C, Blanco FJ, Langa C,
Opinion Struct. Biol. 17 :215-220 (2007). Martín-Galiano AJ, Buey RM, Cabezas M, Andreu JM. J. Biol. Chem. 285, 22554-22565 (2010). Garrido-Martin EM, Botella LM. J. Applied Biomed. 8, 169-177 (2010). 5
 Director’s Report
O
nce again, the Biological Research Centre (CIB) undertakes
the task of reporting its activities over the past two years.
During this period, the CIB has continued improving the
scientific production both quantitatively and in the quality achieved.
The increase in the number of publications has necessarily been
modest, as the number of staff scientists has remained nearly the
same. However, the increasing number of publications in prestigious
journals by groups in the centre during this period is very relevant,
likewise is the rapid increase in the number of citations of these
articles (Figure 1). Today, the general tendency to evaluate scientific
production according to bibliometric indexes is overvalued. The
CIB is a multidisciplinary research centre and as a result of applying
Equipo de Dirección-Gerencia (de izda. a dcha) | Direction-Management team (from left to right): Ana Chao (Secretaria de Dirección), Mª Jesús Martínez (Vicedirectora), Vicente criteria specific to each field of research, three out of every four
Larraga (Director), Dolores Pérez-Sala (Vicedirectora), Encarnación Pueyo (Gerente).
articles published fall into the first quartile of journals corresponding
to their area. Moreover, thirteen percent of the scientific articles
from the CIB have been published in the best journals in all the
Fig. 3 25
scientific areas. Journals such as Nature, Science, EMBO Journal or
Patentes registradas en el CIB | Registered patents by the CIB the Proceedings of the US Academy of Sciences are regularly listed
23
Memoria de la Dirección | Director’s Report
departments, and will return again in 2011 to complete this task. The
reports issued by the Scientific Advisory Board are very helpful when
proposing measures to facilitate the reorganization of existing groups
to improve their efficiency in the face of ever-changing circumstances
in international science. During this period, in which the international
economic situation has led to a reduction in funding for research,
development and innovation, resulting in increased competition for
the available funds, the CIB has continued competing successfully
for funding (Figure 4) , not only at the national level, but also in the
European Union, and other international agencies and secured
contracts with different companies of international prestige (see
special projects in page 155). Nevertheless, it is true that the CIB has
suffered a decrease in the incorporation of new staff scientists, with
only three new investigators joining our center in this period. Thus,
the number of tenured scientists is similar to previous years (Figure 5),
while there is a significant increase in the number of scientists hired
under contract, presently 186 persons (116 women and 70 men)
and it has diminished only slightly the number of graduate students,

among CIB publications (see a selection of publications in page 152). presently 98 (66 women and 32 men).
A few recent scientific and technological milestones are depicted in In an effort to provide better resources and services for our
Figure 2. The activities of research translation, which include national researchers, work started in 2010 on the construction of a new
and international patents and their licence, have continued very animal facility which will double the current capacity and significantly
actively during the period 2009-2010 (Figure 3), with 19 national and 6 improve the resources for projects requiring animal experimentation.
international patent applications registered and licencing 4 of them. This large facility should be completed in 2011.
11 1997-2010
11 In this period the CIB has continued to carry out a critical analysis During the last two years, the CIB has continued to make science
of the research departments in order to improve their scientific more accessible to the general public and we have included a page
6 efficiency. In this task we have received help from the External on Science and Society in this report. We will continue to face the
7 Scientific Advisory Board of the MRC, Cambridge University, chaired future with optimism, knowing that the personnel who work in the
7 by Professor Daniela Rhodes and composed of internationally CIB will continue to demonstrate day by day their ability to overcome
recognized scientists. During 2009 a committee from this body less favourable circumstances in order to achieve greater efficiency
1997
visited the CIB to learn first-hand about the functioning of the various and the highest possible quality in their scientific work.
1998 1999
2000 2001
2002 2003
2004 Fig. 4
2005
2006
2007
2008
2009
Presupuesto CIB 2009-2010 | Budget CIB 2009-2010
2010

Fig. 5A Fig. 5B Presupuesto | Budget 2009 Financiación del CIB con presupuesto del CSIC
Personal científico de plantilla 23.873.030€ CIB funding from the CSIC budget
Personal en el CIB | CIB personnel
Scientific staff in the CIB Personal | Personnel
Presupuesto ordinario | Running cost
Mujeres | Women 11.902.377 € Inversiones | Investments
Hombres | Men Infrastructura | Infrastructure

58
1.172.324 €
Presupuesto | Budget 2010
427.735 € 25.965.039 €
218 1.829.182 € 11.812.960 €
160
Total=574
37

1.925.321 €
7.367.416 € 373.554 € 1.878.788 €
23
80 20 800.440 €
26
505.545 € 2.101.401 €

40
42 12 11
Personal Científico
Total Scientists 14 TOTAL PERSONAL Financiación externa External funding
(378)
Apoyo
EN PLANTILLA
| 7.241.024 €
Technicians Científicos
17 Tenured Scientists Staff Scientists 3 Proyectos | Competitive Grants
(120) Gestión 500.000 €
Administration 3 (95) (35) Investigadores
Contratos I+D privados | R+D contracts private sector
(56) Científicos
Mantenimiento Investigators Profesores de Contratos I+D públicos | R+D contracts public sector
6 Maintenance (31) Investigación 7
(20) Professors
(29)
 Biología Físico-Química
Chemical & Physical Biology
Biología Físico-Química | Chemical & Physical Biology

Jesús Jiménez Barbero · Javier Cañada 10

RMN y Reconocimiento Molecular | NMR and Molecular Recognition

Germán Rivas 12
Interacciones Macromoleculares: Bioquímica Citomimética
Macromolecular Interactions: Cytomimetic Biochemistry

Luis Rivas 14
Péptidos Antibióticos Eucarióticos | Eukaryotic Antibiotic Peptides

Fernando Díaz ·Isabel Barasoaín 16

Agentes Estabilizantes de Microtúbulos | Microtubule Stabilizing Agents

José Manuel Andreu 18

Tubulinas y FtsZ | Tubulins and FtsZ

Dolores Pérez-Sala 20
Modificación Postraduccional de Proteínas | Protein Posttranslational Modifications

Rafael Giraldo
Elena Fernández-Tresguerres 22
Ensamblajes Macromoleculares Microbianos Sintéticos
Synthetic Microbial Macromolecular Assemblies

Óscar Llorca 24
Microscopía Electrónica y Reconstrucción Tridimensional de Macromoléculas
Electron Microscopy and Three Dimensional Reconstruction of Macromolecules

Víctor Muñoz 26
Biofísica de Proteínas | Protein Biophysics

Antonio Romero · Guillermo Giménez-Gallego 28

Cristina Vega · Carlos Fernández Tornero
Cristalografía de Rayos-X e Ingeniería de Proteínas | X-Ray Crystallography and Protein Engineering

Rosa Lozano 30
Reconocimiento Célula-Biomaterial | Cell-Biomaterial Recognition

Eva de Alba (Grupo Emergente - New Group) 32

Biofísica y Biología Estructural de la Muerte Celular | Structural Biophysics of Cell Death
8
 Presentación
Biología
Físico-Química
Uno de los mayores retos de la biología del siglo XXI es
alcanzar el nivel cuantitativo de la física y la química.
D Chemical &
e acuerdo con esta tendencia, el principal objetivo científico de la línea
sobre biología físico-química (BFQ) es entender en términos cuantitativos
problemas biológicos específicos a distintos niveles de complejidad, des-
de la escala de molécula única hasta la de ensamblajes macromoleculares subcelulares.
Así, los diferentes grupos de investigación están centrados en diferentes aspectos de la
Biología Físico-Química, empleando una aproximación pluridisciplinar, que combina estra-
tegias integradas y métodos para estudiar dianas y problemas seleccionados, tales como
la replicación y reparación del DNA, la división celular, el cáncer, la angiogénesis, la acción
de antibióticos y la resistencia frente a los mismos, las modificaciones post-traduccionales, la
estructura de la cromatina,…, etc.
Cubrimos desde el gen hasta modelos de procesos celulares a través de la determinación de la
estructura y ensamblaje de biomoléculas, y la elucidación de mecanismos y modos de interacción,
con una resolución atómica y molecular. Muchos de los problemas emprendidos en este momento
se abordan mediante el esfuerzo cooperativo de distintos grupos dentro de BFQ o en estrecha co-
laboración con otros grupos del CIB.
La investigación en BFQ puede organizarse en tres temas diferentes de investigación: Complejos y
Estructuras Macromoleculares, Reconocimiento Molecular y Diseño de Fármacos y Biología Sintética
Cuantitativa. Los grupos que integran el departamento cuentan con un gran número de colaboracio-
nes internacionales con científicos de distintas áreas, y un número alto de publicaciones compartidas.
La investigación en BQF se basa en un polo tecnológico, que incluye distintas técnicas y metodo-
logías: Microscopía Electrónica, Cristalografía, Resonancia Magnética Nuclear, Biofísica, Química y
Biología Computacionales, Bioinformática y Bioquímica Mecanística.
El conocimiento generado permitirá predecir, controlar y manipular funciones biológicas esenciales,
lo que se traducirá en aplicaciones biomédicas y/o biotecnológicas.
Jesús Jiménez Barbero
Jefe de Departamento
10
Physical Biology
A major challenge for Biology in the 21st century is to reach the quan-
titative level of Physics and Chemistry.
F
ollowing this trend, the main research goal of CPB is to develop a quantitative unders-
tanding of specific biological problems at different levels of complexity, from the single
molecule level to sub-cellular macromolecular assemblies. Thus, the different research
teams focus on different aspects of Chemical and Physical Biology employing a multidiscipli-
nary approach, which combines novel integrated strategies and methods to study selected
targets and problems, such as DNA replication and repair, cell division, cancer, angiogenesis,
antibiotic action and resistance, programmed cell-death, post-translational modifications,
and chromatin structure.
We cover from the gene to models of cellular processes throughout the determination of
biomolecular structure and assembly, and the elucidation of key mechanisms and interac-
tion patterns, at atomic and molecular resolution. Many of the research problems tackled
at present are approached by the cooperative effort of different research groups within
CPB and/or in close collaboration with other groups within CIB and outside.
The research focus of the Department can be organized in three different research
topics: Macromolecular Structures and Complexes, Molecular Recognition and
Drug Design, and Quantitative Synthetic Biology. The integrating groups
display a large degree of collaborative projects, with most of the groups
showing collaborations worldwide with scientists working in different
areas of science, with a large number of shared publications.
Research at CPB is solidly based on a technological pole, which
comprises different techniques and methodologies: Electron
Microscopy, Crystallography, Nuclear Magnetic Resonance,
Biophysics, Computational Chemistry and Biology, Bioinfor-
matics and Mechanistic Biochemistry.
The gained knowledge will enable to predict, control
and engineer essential biological functions towards
biomedical and/or biotechnological applications.
Jesús Jiménez Barbero
Department HEAD
Overview 11
 Jesús Jiménez Barbero
Profesor de Investigación | jjbarbero@cib.csic.es
PhD, 1987.
Universidad Autónoma de Madrid.
Postdoctoral.
Universität Zürich (Suiza),
National Institute for Medical Research (Mill Hill, GB),
Carnegie Mellon University (Pittsburg, EEUU).
Científico Titular, 1988,
Investigador Científico, 1996.
IQOG, CSIC.
Profesor de Investigación, 2002.
CIB, CSIC.
RMN y Reconocimiento Molecular
El objetivo general de nuestra investigación es estudiar el reconocimiento
molecular de ligandos por receptores en sistemas de interés
Biología Físico-Química | Chemical & Physical Biology
biofarmacéutico, prestando atención especial a las interacciones entre
carbohidratos y proteínas. Este objetivo solamente puede alcanzarse
usando una aproximación multidisciplinar que está enfocada en dos
áreas generales: 1. Diseño y síntesis de moléculas con actividad biológica;
2. Caracterización de los elementos estructurales que gobiernan el
reconocimiento molecular de estos ligandos por biomoléculas.
E
l grupo de resonancia magnética
nuclear está interesado en el desarrollo
de los aspectos metodológicos
en general de la resonancia magnética
nuclear (RMN) y, más en particular, a sus
aplicaciones al estudio de la conformación
y dinámica de procesos de reconocimiento
molecular y determinación de la estructura
3D de proteínas, oligosacáridos y otras
biomoléculas en disolución.
También hemos estudiado las características
estructurales desde el punto de vista
conformacional y dinámico de distintos oligo
y polisacáridos de interés biológico usando
RMN y métodos de modelización molecular.
En particular, hemos prestado atención
al origen físico-químico de la interacción
entre carbohidratos y proteínas, haciendo
especial énfasis en el papel relativo de
las interacciones de apilamiento entre
carbohidratos y anillos aromáticos.
Merced a la colaboración con distintos
grupos de investigación de todo el mundo,
algunos sistemas estudiados incluyen
galectinas, dominios de heveína, ricina-B,
viscumina, lactasa, beta-galactosidasa de
E. coli, beta-glucosidasa de Strept. Sp.,
RNAsa B, DC-SIGN, factor de crecimiento
de fibroblastos ácido y su receptor, toxina
del cólera, el homeodominio HexS1, glyco-
mimeticos, compuestos C- y S-glycosídicos,
aminoglicósidos, antígenos basados en
carbohidratos, polisacáridos de hongos y
bacterias, etc.
El grupo también colabora con numerosos
laboratorios de investigación españoles y
extranjeros en muchos otros proyectos que
no están directamente relacionados con
estas líneas principales de investigación.
12
Francisco Javier Cañada Vicinay
Profesor de Investigación | jcanada@cib.csic.es
ChemBioChem. The picture shows a 3D model of the
mutual interaction in solution of the synthetically
prepared trisaccharide epitope of the marine sponge
Microciona prolifera and gold glyconanoparticles,
displaying the same sugar moiety, in the presence of
calcium. The saccharides are gathered together by
bridged calcium atoms and show a segmental type of
interaction that could explain the actual interaction in
Nature of the native g-200 acidic glycan present in the
MAFp3 glycoprotein, with the saccharide–saccharide
interaction taking place via the trisaccharide epitopes.
ChemBioChem. La figura muestra un modelo 3D de la
interacción en disolución del epitopo del trisacárido
de la esponja marina Microciona prolifera, preparado
sintéticamente, frente a gliconanopartículas de oro, en
presencia de calcio. Los azúcares del trisacárido y de
la gliconanopartícula están unidos mediante puentes
de iones calcio, y muestran una interacción de tipo
segmental, que podría explicar la interacción real que
tiene lugar en la Naturaleza en el glicano ácido g-200
de la glicoproteína MAFp3. La interacción carbohidrato-
carbohidrato involucra directamente los epitopos
trisacarídicos.
Otros miembros | Other lab members:
PhD, 1985.
Universidad del País Vasco.
Ana Ardá Freire Filipa Marcelo
Postdoctoral.
Centro de Biología Molecular, Álvaro Berbís Lidia Nieto
Harvard Medical School (EEUU) Instituto de Química Khouzaima el Biari Virginia Roldós
Orgánica General.
Luis P. Calle María Morando
Científico Titular, 1992.
Mª. Dolores Díaz Hernández Joao P. Ribeiro
IQOG, CSIC.
Blanca Domínguez
Investigador Científico, 2004,
Profesor de Investigación, 2009.
CIB, CSIC.
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=71
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
ChemMedChem. The picture shows the X-ray structure of viscumin as
surface representation (PBD code: 1PUM), with a schematic perspective
of the methods employed to screen a small library of lactose derivatives
as viscumin ligands with increased affinity. The protocol strategically
combines different experimental techniques, including organic synthesis
Hernández-Gay JJ, Ardá A, Eller S, Mezzato S,
and STD-NMR with solid-phase and cell-based assays.
Leeflang BR, Unverzagt C, Cañada FJ, Jiménez-
Barbero J. (2010) Insights into the dynamics and ChemMedChem. La figura muestra la estructura de cristalografía de
molecular recognition features of glycopeptides by Rayos-X de la viscumina, en representación de superficies (código PBD:
protein receptors: the 3D solution structure of hevein 1PUM), con una perspectiva esquemática de los métodos empleados para
cribar una biblioteca pequeña de derivados de lactosa como ligandos
bound to the trisaccharide core of N-glycoproteins.
Chemistry Eur. J. 16, 10715-10726.
de viscumina con alta afinidad. El protocolo combina estratégicamente
distintas técnicas experimentales, incliyendo síntesis orgánica y STD-RMN
Morando M, Yao Y, Martín-Santamaría S, Zhu con ensayos en fase sólida y celulares.
Z, Xu T, Cañada FJ, Zhang Y, Jiménez-Barbero
J. (2010) Mimicking chitin: chemical synthesis,
conformational analysis, and molecular recognition
of the beta(1-->3) N-acetylchitopentaose analogue.
Chemistry Eur. J. 16, 4239-4249.
NMR and Molecular Recognition
Caraballo R, Dong H, Ribeiro JP, Jiménez-Barbero J,
Ramström O. (2010). Direct STD NMR identification The overall goal of our research is the study the molecular recognition of ligands by receptors
of beta-galactosidase inhibitors from a virtual
in systems of biopharmaceutical interest, paying special attention to protein-carbohydrate
dynamic hemithioacetal system. Angew Chem Int
Ed Engl. 2010;49, 589-593. interactions. This goal may be only reached through a multidisciplinary approach that is
Ardá A, Venturi C, Nativi C, Francesconi O, Gabrielli focused on two main areas: 1. Design and synthesis of molecules with biological activity;
G, Cañada FJ, Jiménez-Barbero J, Roelens S. (2010). 2. Characterization of the structural elements that govern the molecular recognition of such
A chiral pyrrolic tripodal receptor enantioselectively
recognizes beta-mannose and beta-mannosides. ligands by biomolecules.
Chemistry Eur. J. 16, 414-418.
W
Bhunia A, Vivekanandan S, Eckert T, Burg-Roderfeld ith this objectives in mind, we are interested in relevant oligo and polysaccharides also using NMR and
M, Wechselberger R, Romanuka J, Bächle D, Kornilov
AV, von der Lieth CW, Jiménez-Barbero J, Nifantiev
the development of general methodological molecular dynamics. In particular, we have paid attention
NE, Schachner M, Sewald N, Lütteke T, Hans-Joachim aspects of the NMR techniques and, particularly, to the physico-chemical origin of the interaction between
G, Siebert HC. (2010) Why structurally different in their applications to the study of the conformation and carbohydrates and proteins, with special emphasis in the
cyclic peptides can be glycomimetics of the HNK-1 dynamics of the molecular recognition processes. During relative role of sugar-aromatic stacking interactions. Thanks
carbohydrate antigen. J Am Chem Soc. 132, 96-105.
the last few years we have determined the solution 3D to the collaboration with several research groups throughout
Ramírez-Gualito K, Alonso-Ríos R, Quiroz-García B, structure of different proteins using a protocol based on NMR the world, some studied systems include galectins, hevein
Rojas-Aguilar A, Díaz D, Jiménez-Barbero J, Cuevas spectroscopy, assisted by molecular mechanics and dynamics domains, ricin-B, viscumin, lactase, E. coli beta-galactosidase,
G. (2009) Enthalpic nature of the CH/pi interaction
calculations. This methodology has been applied to different Streptomyces Sp. beta-glucosidase, ribonuclease B, DC-SIGN,
involved in the recognition of carbohydrates
carbohydrate molecular complexes of wild type and mutant acidic fibroblast growth factor and its receptor, cholera toxin
by aromatic compounds, confirmed by a novel
interplay of NMR, calorimetry, and theoretical lectins, glycosidases, and to the elucidation of the structure B, HexS1 homeodomain, glycomimetics, C- and S-glycosyl
calculations. J Am Chem Soc. 131, 18129-18138. of other protein receptors of biomedical interest. We have compounds, aminoglycosides, carbohydrate antigens,
Diercks T, Ribeiro JP, Cañada FJ, André S, investigated protein complexes with natural ligands and with bacterial and fungal polysaccharides, etc. The group also
Jiménez-Barbero J, Gabius HJ. (2009) Fluorinated synthetically modified analogues. We have also investigated collaborates with numerous Spanish and foreign research
carbohydrates as lectin ligands: versatile sensors in the structural characteristics, both from the conformational laboratories in numerous other projects not directly
19F-detected saturation transfer difference NMR
and dynamical point of view of different biologically related with its main research goals.
spectroscopy. Chemistry Eur. J. 15, 5666-5668.
Marcelo F, He Y, Yuzwa SA, Nieto L, Jiménez-Barbero J,
Sollogoub M, Vocadlo DJ, Davies GD, Blériot Y. (2009)
Molecular basis for inhibition of GH84 glycoside
hydrolases by substituted azepanes: conformational
flexibility enables probing of substrate distortion. J
Am Chem Soc. 131, 5390-5392.
Ferrand Y, Klein E, Barwell NP, Crump MP, Jiménez-
Barbero J, Vicent C, Boons GJ, Ingale S, Davis AP. (2009)
A synthetic lectin for O-linked beta-N-acetyl­glu­cosa­
mine. Angew Chem Int Ed Engl. 48, 1775-1779.
Premio | Award
Jiménez-Barbero, J. (2010) International Whistler
Award in Carbohydrate Chemistry. Awarded by
the International Carbohydrate Organization.
13
 Germán Alejandro Rivas Caballero
Investigador Científico | grivas@cib.csic.es
Macromolecular Interactions:
Doctorado en Química, 1989.
Universidad Autónoma de Madrid.
Investigadora del equipo | Staff Scientist:
Mercedes Jiménez Sarmiento
Cytomimetic Biochemistry
Postdoctoral, 1990-1992.
NIH, Bethesda, USA.
Otros miembros | Other lab members:
Postdoctoral, 1993.
Biozentrum, Univ. Basilea, Suiza. Elisa Jiménez Cabré
Our ultimate goal is to reconstruct the minimum functional protein set needed to initiate
Investigador contratado, adscrito al CIB, 1994. Víctor Hernández Rocamora bacterial division (the proto-ring) in systems that reproduce the structural organization of the
CIB, CSIC.
Begoña Monterroso Marco divisome at the cell membrane. We combine biophysical, biochemical and imaging technologies.
Científico Titular, 1995, Estefanía Salvarelli Martín
Jefe de grupo, 1996, This novel approach (quantitave synthetic biology) will help to complete our understanding of
Rubén Ahijado Guzmán
Investigador Científico, 2006. cell division and to open new horizons for pharmacological applications.
CIB, CSIC. Ariadna Martos Sánchez
www.cib.csic.es/es/grupo.grivas

R
econstitution of minimal divisomes in biomimetic organization, energetics and dynamics of essential

Interacciones Macromoleculares: membrane systems: We study the biochemical

activities, interactions and assembly of proto-ring
macromolecular complexes.

Physical Biochemistry: We measure the stoichiometry,

Bioquímica Citomimética
elements (FtsZ, FtsA, and ZipA) using artificial and natural
affinity and reversibility of protein complexes by means of
membranes structured as nanodiscs, functionalized micro-
techniques of analytical ultracentrifugation, light scattering
beads, supported bilayers and giant vesicles (GUVs) (FIG.
and optical biosensing. We have focused on the study
Biología Físico-Química | Chemical & Physical Biology

1). We know the elements, the biological function, and a

Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Alcorlo M, Jiménez M, Ortega A, Minton AP,
Hermoso JM, Salas M, Rivas G [2009] Analytical
ultracentrifugation analysis of phage Ø29 protein
p6 – DNA complex formation. J. Mol. Biol.
385:1616-1629.
Jiménez M, Martos A, Vicente M, Rivas G [2011]
Nuestro objetivo es la reconstrucción del conjunto mínimo de proteínas
funcionales necesarias para iniciar la division bacteriana (el proto-anillo)
en sistemas que reproduzcan la organización estructural del divisoma en
la membrana celular. Combinamos tecnologías biofísicas, bioquímicas y
de imagen. Esta novedosa aproximación (biología sintética cuantitativa)
ayudará a completar nuestro conocimiento de la división celular y abrirá
nuevos horizontes para aplicaciones farmacológicas.
large part of their biochemistry; therefore it is reasonable
to expect that the application of this “bottom-up” synthetic
strategy to the construction of minimal divisomes in the test
tube is feasible and will yield functional assemblies, because.
We will apply these synthetic divisomes to design assays for
antimicrobial screening.
Protein reactivity in crowded environments: We
investigate the combined influence of excluded volume
and electrostatic effects in heterogeneous crowded media
of bacterial macromolecular assemblies, specially, the
interactions between proto-ring elements.
Collaborations 2009-2010: In specific aspects of these
research lines, we have established collaborations with
Miguel Vicente (CNB-CSIC, coordinator of the consortia on
synthetic biology of cell division in which we participate),
Rafael Giraldo (CIB-CSIC), Jesús Mingorance (IDIPAZ, HU La
Paz), Francisco Monroy (QF-UCM), Marisela Vélez (ICP-CSIC),
Silvia Zorrilla (IQFR-CSIC), all of them based in Madrid; Arturo

Reconstitution and organization of E. coli
proto-ring elements (FtsZ and FtsA) inside giant
unilamellar vesicles obtained from bacterial inner
membranes. J. Biol. Chem. (doi:10.1074/jbc.
M110.194365).
Luque D, Rivas G, Alfonso C, Carrascosa JL,
Rodríguez JF, Castón JR [2009] Infectious bursal
disease virus is an icosahedral polyploid dsRNA
virus. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 106:2148-2152.
Mohammadi T, Ploeger GE, Verheul J, Comvalius
AD, Martos A, Alfonso C, van Marle J, Rivas G,
den Blaauwen T [2009] The GTPase activity of
Escherichia coli FtsZ determines the magnitude
of the FtsZ polymer bundling by ZapA in vitro.
Biochemistry 48:11056-11066.
Martos A, López-Navajas P, Alfonso C, Mingorance
J, Vicente M, Minton AP, Rivas G [2010]
Characterization of self- and hetero-interactions
of bacterial cell division proteins FtsZ and sZipA
by composition gradient – static light scattering
(CG-SLS). Biochemistry (doi: 10.1021/bi101495x).
Mingorance J, Rivas, G, Vélez M, Gómez-Puertas
P, Vicente M [2010] Strong FtsZ is with the force:
mechanisms to constrict bacteria and organelles.
Trends Microbiol. 18:348-356.
Rivas G, Minton AP [2010] Beyond the second
virial coefficient: sedimentation equilibrium in
highly non-ideal solutions. Methods (doi:10.1016/j.
ymeth.2010.11.004)
R
econstitución de divisomas mínimos
en sistemas biomiméticos de
membrana: Estudiamos la actividad,
las interacciones y el ensamblaje de los
elementos del proto-anillo (FtsZ, FtsA, y ZipA)
usando membranas artificiales y naturales
estructuradas en nanodiscos, micro-esferas
funcionalizadas, bicapas y vesículas gigantes
(GUVs) (FIG. 1). Conocemos los elementos,
su función biológica y gran parte de su
bioquímica; por consiguiente, es razonable
esperar que la aplicación de esta estrategia
sintética ascendente (bottom-up) a la
construcción de divisomas mínimos en el
tubo de ensayo sea factible y dará lugar a
ensamblajes funcionales. Aplicaremos estos
divisomas sintéticos para diseñar ensayos
sistemáticos de búsqueda de nuevos
antimicrobianos.
Reactividad de proteínas en ambientes
aglomerados: Investigamos la influencia
combinada de los efectos de volumen
excluido y electrostáticos en medios
aglomerados heterogéneos (para
reproducir el citoplasma bacteriano) sobre
(to reproduce the bacterial cytoplasm) on the structural Muga (UPV-CSIC, Bilbao) and Allen Minton (NIH, Bethesda).
la organización estructural, la energética
y la dinámica de formación de complejos
macromoleculares esenciales.
Upper panel: Diagram illustrating the position
of essential divisome elements in the living
Bioquímica física: Medimos la
cell and reconstruction of proto-rings in
estequiometría, la afinidad y la reversibilidad biomimetic membrane systems. The proto-
de complejos de proteínas mediante ring components are colored while the
other elements of the divisome are shown
técnicas de ultracentrifugación analítica,
in dark grey. The light grey circles in the
dispersión de luz y biosensores ópticos. upper part of the diagram represent the
Nos hemos centrado en el estudio de macromolecules that contribute to the
crowding of the cytoplasm. Vesicles show
ensamblajes macromoleculares bacterianos,
the two alternative orientation of the
en especial, las interacciones entre los reconstructed proto-ring relative to the
elementos del proto-anillo. vesicle lumen. Scheme designed by
Germán Rivas and Miguel Vicente.
Colaboraciones 2009-2010: En aspectos Lower panel: Visualization of GTP-induced
FtsZ polymers reconstituted in different
específicos de estas líneas de investigación,
membrane systems. From left to right:
tenemos establecidas colaboraciones con ZipA-containing nanodiscs (transmission
Miguel Vicente (CNB-CSIC, coordinador de electron microscopy), micro-beads
coated with native inner membranes
los consorcios sobre biología sintética de
(scanning electron microscopy), GUVs
la división celular en los que participamos), with FtsZ assembled outside or inside
Rafael Giraldo (CIB-CSIC), Jesús Mingorance the vesicles (confocal microscopy). Rivas
laboratory (unpublished work, and
(IDIPAZ, HU La Paz), Francisco Monroy
Jiménez et al. 2011. J. Biol. Chem.,
(QF-UCM), Marisela Vélez (ICP-CSIC), Silvia in press).
Zorrilla (IQFR-CSIC), todos ubicados en
Madrid; Arturo Muga (UPV-CSIC, Bilbao) y
Allen Minton (NIH, Bethesda).

Panel superior: Diagrama que ilustra la posición de los elementos esenciales del divisoma en la célula y en
reconstrucciones del proto-anillo en sistemas biomiméticos de membrana. Los componentes del proto-anillo están
coloreados mientras que los otros elementos del divisoma se muestran en gris oscuro. Los círculos gris claro en
la parte superior del diagrama representan las macromoléculas que contribuyen a la exclusión de volumen en el
citoplasma. Las vesículas se muestran en las dos posibles orientaciones del proto-anillo reconstruido con respecto
al lumen de la vesícula. Esquema diseñado por Germán Rivas y Miguel Vicente.
Panel inferior: Visualización de polímeros de FtsZ formados en presencia de GTP en distintos sistemas de
membrana. De izquierda a derecha: nanodiscos con ZipA incorporada (microscopía electrónica de transmisión),
microesferas recubiertas de membrana nativa de E. coli (microscopía electrónica de barrido), GUVs con FtsZ
ensamblada fuera o dentro de las vesículas (microscopía confocal). Laboratorio de G. Rivas (trabajo no publicado, y
Jiménez et al. 2011. J. Biol. Chem., en prensa).

14 15
 Luis Ignacio Rivas López
Investigador Científico | luis.rivas@cib.csic.es
Doctorado CC Químicas (Bioquímica), 1984. Otros miembros | Other lab members:
Universidad Complutense de Madrid.
Postdoctoral 1984- 1986.
Weizmann Institute of Science , Yale University. Juan Román Luque-Ortega
Científico Titular, 1986, Maria Fernández Reyes Silvestre
Jefe de grupo, 1986,
Investigador Científico, 2006. Cristina Rueda Hernández
CIB,CSIC. Oscar Santos Calvo

www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=42

Péptidos Antibióticos Eucarióticos Eukaryotic Antibiotic Peptides

La interacción péptido-fosfolípido es aprovechada último mecanismo compartido con los péptidos Peptide-phospholipid interaction is exploited by eukaryotic antibiotic peptides, either to produce
por los péptidos antimicrobianos eucarióticos ya penetrantes de células, utilizados como herramienta an irreversible, lethal permeabilization of pathogen plasma membrane, or to gain access to their
Biología Físico-Química | Chemical & Physical Biology

para permeabilizar irreversiblemente la membrana nanotecnológica para vehicular fármacos conjugados intracellular targets. The last mechanisms is shared with cell-penetrating peptides ferrying drugs
plasmática de patógenos, o transitoriamente, sin requerir receptor farmacológico correspondiente. and other cargos conjugated to them into cells without a specific receptor/translocator.
para acceder a sus dianas intracelulares, este

M
embrane-active peptides as new leishmanicidal transduction by MAPK activation sequence decoys, able to

P
éptidos activos en membrana
como nuevos fármacos
leishmanicidas. Se ha continuado
la búsqueda y optimización estructural
de péptidos antibióticos actuando ya
por: i) Permeabilización irreversible de
la membrana plasmática, o ii) Mediante
dianas intracelulares. Los estudios
estructura-actividad se han focalizado en
la actividad leishmanicida de análogos
de IB-01212, un depsipéptido fúngico
con dianas intracelulares y actividad
microbicida de híbridos cecropina-melitina
y gramicidina S, mediante trimetilación de
lisinas e inversión de secuencia en el giro β,
respectivamente.
Péptidos penetradores de células
(PPCs) como vehiculadores de fármacos
leishmanicidas. Se han ensayado diversos
PPCs sobre Leishmania, con mejor resultado
para aquellos ricos en Arg. Su potencialidad
farmacológica en Leishmania se evidenció
por: i) Reversión de la resistencia a
miltefosina en cepas deficientes en
acumulación de dicho fármaco. ii) Inhibición
de la transducción de señales por MAPK
mediante péptidos señuelo basados
en secuencias de activación de MAPK ,
impermeables a la membrana del parásito
salvo conjugación a PPCs.
Mecanismo de acción de fármacos sobre el
metabolismo bioenergético de Leishmania.
Mediante ensayos funcionales se han
identificado las dianas en la fosforilación
oxidativa de Leishmania para fármacos en
uso clínico (tafenoquina, sitamaquina ), y
para nuevas cabezas de serie: derivados de
benzofenona-bifosfonio, con motivos de
importe mitocondrial. Para estilbenoides,
estudios de docking confirmaron los
resultados funcionales.
Nuestro grupo colabora activamente
con grupos nacionales e internacionales,
reseñados en las referencias. De especial
relevancia son las realizadas con D. Andreu
(Universitat Pompeu-Fabra), G. Späth
(Institute Pasteur , París) y A.U. Acuña, C.
Dardonville, F. Amat, CSIC).
drugs. We search and structurally optimize
antibiotic peptides acting by either i).-
irreversible permeabilization of the plasma membrane, or
ii) involvement of intracellular targets. SAR studies have
investigated the leishmanicidal activity of analogues of
IB-01212, a fungal depsipeptide with intracellular targets,
and the microbicidal activity of cecropin-melittin hybrids
and gramicidin S by, respectively, lysine ε-trimethylation and
sequence inversion at the β turn, acting through plasma
membrane permeabilization.
Cell penetrating peptides as vectors for leishmanicidal
drugs. We have tested different CPPs leads, with arginine-
rich peptide performing best. Potential for Leishmania
chemotherapy is supported by: i) abrogation of miltefosine
resistance by miltefosine-CPP conjugates on strains with
deficient uptake of this drug ii).-Inhibition of MAPK signal
access the parasite only through CPP-conjugation.
Mechanisms of action of leishmanicidal drugs on the
bioenergetic metabolism of the parasite. Functional
assays have unveiled the oxidative phosphorylation
targets in Leishmania for drugs in current clinical
use such as tafenoquine or sitamaquine, or for new
benzophenone-derived phosphonium surrogates with
import motifs for privileged mitochondrial accumulation.
For stilbenoids, docking studies support results from
functional assays.
We maintain active collaborations with national and
international groups, compiled in our contributions, being
of special relevance those with D. Andreu (Pompeu-Fabra
University), G. Späth (Institute Pasteur , París) and A.U Acuña,
C. Dardonville F. Amat, F. Gamarro, all of them belonging to
different CSIC institutes.

Microscopía confocal de fluorescencia de promastigotes de Leishmania resistentes a

Publicaciones Seleccionadas
miltefosina incubados por 1 h con el conjugado péptido penetrante-miltefosina T-BDPY.
En esta cepa, la resistencia es debida a acumulación nula del fármaco por mutación
Selected Publications
de su translocador, una aminofosfolípido translocasa, revertida tras conjugación del
fármaco a PPCs La parte peptídica del conjugado está marcada con el fluoróforo Fernandez-Reyes, M., M. Rodriguez-Falcon, C. Chiva, J. Pachon, D. Andreu, and trimethylation, a tool for improving the selectivity of antimicrobial peptides. J
Quasar 670 (fluorescencia roja) y la miltefosina lleva incorporado un grupo BODIPY en L. Rivas. (2009). The cost of resistance to colistin in Acinetobacter baumannii: a Med Chem 53:5587-96.
su cadena alifática (fluorescencia verde), unido mediante un enlace disulfuro al péptido. proteomic perspective. Proteomics 9:1632-45. Carvalho, L., J. R. Luque-Ortega, J. I. Manzano, S. Castanys, L. Rivas, and F.
Adicionalmente el parásito fue teñido con Hoechst 33342 (fluorescencia azul). Cruz, L. J., J. R. Luque-Ortega, L. Rivas, and F. Albericio. (2009). Kahalalide F, Gamarro. (2010). Tafenoquine, an antiplasmodial 8-aminoquinoline, targets
Confocal microscopy fluorescence pattern of miltefosine Leishmania-resistant promastigotes an antitumor depsipeptide in clinical trials, and its analogues as effective leishmania respiratory complex III and induces apoptosis. Antimicrob
after incubation for 1 hour with the CPP-miltefosine conjugate T-BDPY. Resistance in Leishmania antileishmanial agents. Mol Pharm 6:813-24. Agents Chemother 54:5344-51.
was due to a nil intracellular accumulation of miltefosine due to a loss-of-function mutation of Rivas, L., J. R. Luque-Ortega, and D. Andreu. (2009). Amphibian antimicrobial Luque-Ortega, J. R., L. J. Cruz, F. Albericio, and L. Rivas. (2010). The
its translocator, an aminophospholipid translocase, abrogated with CPP-drug conjugation. The
peptides and Protozoa: lessons from parasites. Biochim Biophys Acta Antitumoral Depsipeptide IB-01212 Kills Leishmania through
peptide moiety of the conjugate was labelled with Quasar 670 fluorophore (red fluorescence),
1788:1570-81. an Apoptosis-like Process Involving Intracellular Targets.
linked by a disulfide bond to BODIPY-miltefosine (green fluorescence). Parasites were
additionally stained with Hoechst 33342 (blue fluorescence). Fernandez-Reyes, M., Rodriguez-Falcon, M., Chiva, C., Pachon, J., Andreu, D. and Mol Pharm 7:1608-1617.
Rivas, L. (2009) The cost of resistance to colistin in Acinetobacter baumannii: a
proteomic perspective. Proteomics. 9: 1632-1645.
Solanas, C., B. G. de la Torre, M. Fernandez-Reyes, C. M. Santiveri, M. A. Jimenez,
L. Rivas, A. I. Jimenez, D. Andreu, and C. Cativiela. (2010). Sequence inversion
and phenylalanine surrogates at the β-turn enhance the antibiotic activity of
gramicidin S. J Med Chem 53:4119-29.
Luque-Ortega, J. R., P. Reuther, L. Rivas, and C. Dardonville. (2010). New
benzophenone-derived bisphosphonium salts as leishmanicidal leads
targeting mitochondria through inhibition of respiratory complex II. J Med
Chem 53:1788-98.
Luque-Ortega, J. R., and L. Rivas. (2010). Characterization of the leishmanicidal
Interacción del estilbenoide VP7 con su Diana en Leishmania, la subunidad γ de
la ATP sintasa mitocondrial. Docking realizado por el Prof. A. Romero, CIB. activity of antimicrobial peptides. Methods Mol Biol 618:393-420.

Interaction of the stilbenoid VP7 with its Leishmania target, the γ-subunit of Fernandez-Reyes, M., D. Diaz, B. G. de la Torre, A. Cabrales-Rico, M. Valles-
mitochondrial ATP synthase. Docking was carried out by Prof A. Romero, CIB. Miret, J. Jimenez-Barbero, D. Andreu, and L. Rivas. (2010). Lysine N(epsilon)-

16 17
 A
José Fernando Díaz Pereira Isabel Barasoain Blasco
Investigador Científico | fer@cib.csic.es Científica Titular | i.barasoain@cib.csic.es
PhD, 1993. PhD, 1976. Otros miembros | Other lab members:
Universidad Complutense de Madrid. Universidad Complutense de Madrid.
Becario Postdoctoral, 1994-1995. Postdoctoral, 1978-1980. Ruth Matesanz Rodríguez
Universidad Católica de Lovaina. Rosenstiel Basic Research Center, Brandeis University,
Sara Notararigo
Investigador Asociado, 1996-1997. Waltham, MA, USA.
Benet Pera Gresely
Universidad Católica de Lovaina. Postdoctoral, 1980-1981.
Investigador Contratado, 1998-2001, Center for Cancer Research, MIT, Cambridge, MA, USA. Javier Rodríguez Salarisch
Científico Titular, 2001-2008, Cientifica Titular, 1981. Chiara Trigili
Investigador Científico y Jefe de grupo, 2008. CIB, CSIC.
CIB, CSIC.

www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=68

Agentes Estabilizantes de Microtúbulos

Entendiendo a los antimitóticos: A pesar de los
muchos avances que se han registrado en tratamiento
nuestro grupo se centra en este problema buscando
nuevos sitios farmacológicos en tubulina, nuevas
Microtubule Stabilizing Agents
Biología Físico-Química | Chemical & Physical Biology

de cáncer, este continúa siendo uno de los mayores
problemas de salud de las sociedades desarrolladas.
Por tanto la búsqueda de nuevos y mejores agentes
antitumorales es un campo de la mayor importancia
en la investigación farmacológica. El interés de
cabezas de serie activas en esos sitios, desarrollando
estrategias para la optimización de los compuestos How do antimitotic drugs work?: Despite considerable B
conocidos y estudiando los mecanismos físico- progress in its treatment, cancer continues to be one of
químicos y celulares que utilizan los compuestos the major health problems of developed countries. The
antimitóticos. search for new anti-cancer drugs and their development
is a field of utmost importance in current drug research.

L
os agentes estabilizantes de
microtúbulos (MSA) se unen a tres
sitios conocidos. El sitio lumenal de
paclitaxel, al que se unen tanto los fármacos
de uso clínico paclitaxel y docetaxel, como
el nuevo fármaco Ixempra. El sitio de unión
de laulimalida, al que se unen Laulimalida y
y la sobreexpresión de isotipos de tubulina
con una menor sensibilidad a los taxanos
(ßtubulina III).
Nuestro grupo posee una de las mayores
bibliotecas mundiales de agentes
moduladores de microtúbulos, (con cerca de
500 compuestos diferentes dirigidos a todos
Our group works in this problem searching new
Publicaciones Seleccionadas pharmacological sites in tubulin, new leads against
Selected Publications
Díaz, J.F., Andreu, J.M. and Jiménez-Barbero, J [2009] these targets, optimization of know compounds and in
The interaction of microtubules with stabilizers the understanding of the physicochemical and cellular
characterized at biochemical and structural levels.
Topics in Current Chemistry 286, 121-149.
mechanisms employed by antimitotic compounds.
Li, X., Barasoain, I., Matesanz, R, Díaz, J.F. and Fang

Pelorusido y, por último, el sitio del poro al
que los MSAs del sitio de paclitaxel se unen
en su camino hacia el sitio lumenal. Por el
momento, solo el primero de estos sitios
es utilizado por los fármacos de uso clínico.
Aunque los MSAs del sitio de paclitaxel
son muy eficaces en tumores sólidos, su
eficacia está limitada por el desarrollo
de resistencias cuyas causas principales
son la sobreexpresión de proteínas de
membrana que expulsan la droga (fenotipo
de resistencia múltiple a fármacos (MDR)),
Es posible diseñar compuestos que se unan al sitio de unión descubierto en los poros de los microtubules, la unión de
estos compuestos al sitio produce los mismos efectos celulares que los antimitóticos clásicos.
The pore binding site of microtubules is a new druggable site and binding of drugs to this site produce the same effect on
celular microtubules as classical antimitotics.
los sitios de unión conocidos en tubulina), la
cual se emplea para abordar los problemas
de resistencia mediante el diseño de nuevos
agentes antitumorales dirigidos contra sitios
de unión alternativos al luminal de paclitaxel.
Para ello, estudia los mecanismos de
estabilizacion de los microtúbulos por estos
sitios y las características químicas necesarias
para la unión y activación de estos, además
de sus los efectos diferenciales en líneas
tumorales resistentes a los tratamientos con
MSA clásicos.
M
W-S [2009] Synthesis and biological activities of high
affinity taxane-based fluorescent probes. BMCL 19, icrotubule stabilizing agents (MSA) have three known binding
751-745. sites. The paclitaxel luminal site, to which the well known clinical
use drugs paclitaxel and docetaxel and the newly developed
Magnani, M., Maccari, G., Andreu, J.M., Díaz, J.F. and
Botta, M [2009] Possible binding site for Paclitaxel at
C
drug in clinical trials (Ixempra) bind. The laulimalide binding site, to which
microtubule pores. FEBS J. 276, 2701-2712.
Laulimalide and Peloruside bind, and finally the paclitaxel pore site to
Dietrich, S.A., Lindauer, R., Stierlin, C.. Gertsch, J., which microtubule stabilizing agents of the paclitaxel site bind in its way
Matesanz, R., Notararigo, S., Díaz, J.F. and Altmann, K.H.
to the luminal site. Only the first of these three sites is actually used for the
Epothilone Analogs with Benzimidazole and Quinoline
Side Chains: Chemical Synthesis, Antiproliferative development of clinical drugs. Although MSA of the paclitaxel site are quite
Activity, and Interactions with Tubulin (2009). effective against solid tumours, effectiveness at tumour regression is limited
Chemistry 15, 10144 – 10157. by the development of resistance. The two main causes of resistance
Barasoain, I., Díaz, J.F. and Andreu, J.M. Fluorescent are: Multi-drug resistance (MDR) due to over-expression of several trans-
Taxoid Probes for Microtubule Research [2010] membrane proteins with drug efflux activity, and over-expression of tubulin
Methods in Cell Biology, 95: 349-369.
isotypes with lower sensitivity to taxanes (ßIII tubulin).
Barasoain, I. García-Carril, A. M., Matesanz, R., Maccari,
G., Trigili, C, Mori, M. Shi, J.Z. Fang, W.S. Andreu, J.M. Our group of Centro de Investigaciones Biologicas have collected one of
Maurizio, B. and Díaz, J.F. [2010] Probing the pore drug the largest libraries of microtubule modulating agents, with nearly 500
binding site of microtubules with fluorescent taxanes: different compounds targeting all known binding sites in tubulin, we use
Evidence of two binding poses Chemistry and
it to address the resistance problems with the design new antitumoural
Biology, 17, 243-253.
agents targeting different binding sites. To do so, we study the Modelo de union de Pelorusido a α-tubulina.
Erdélyi, M., Navarro-Vázquez, A., Pfeiffer, B. Kuzniewski,
C Felser, A. Widmer,T. Gertsch, J. Pera, B. Díaz, J.F.
mechanisms underlying microtubule stabilizations by the other alternative Docking-based binding modes of
sites and the chemical features required for binding and activation of Peloruside to α-tubulin.
Altmann, K-H and Carlomagno, T [2010] The Binding
Mode of Side Chain- and C3-Modified Epothilones to these sites. Moreover, we also evaluate the differential effects of these
Tubulin. CHEMMEDCHEM 5(6)6, 911-920. compounds in tumoural cell lines resistant to classical MSA treatment by
Pera, B., Razzak, M., Trigili, C., Pineda, O., Canales, the mechanisms underlined above.
A., Buey, R.M., Jímenez-Barbero, J., Northcote, P.T.,
Paterson, I., Barasoain, I. and Díaz, J.F. [2010] Molecular
recognition of peloruside A by microtubules. The
C24 primary alcohol is essential for biological activity.
CHEMBIOCHEM 11, 1669-1678.
Bustamante, M., Campillo, N.E, García, E., Gallego, C.,
Pera, P., Diakun, G.P., Sáiz, J.L., García, P, Díaz, J.F, and
Menéndez, M. [2010] Cpl-7, a Lysozyme Encoded by a
Pneumococcal Bacteriophage with a Novel Cell Wall-
Binding Motif. J. Biol. Chem. 285, 33184-33196.

Premio | Award
Premio de la Sociedad Española de Proteómica 2009.

18 19

José Manuel Andreu
Profesor de Investigación | j.m.andreu@cib.csic.es
PhD, 1976.
Universidad Complutense de Madrid.
Científico visitante, 1976.
MPI Freiburg, Alemania.
Postdoctoral, 1978-1981.
Brandeis University, Waltham MA, USA.
Científico Titular, 1981,
Jefe de Grupo, 1983,
Profesor de Investigación, 1993.
CIB, CSIC.
www.cib.csic.es/tubulinas
Tubulinas y FtsZ
Modulación del ensamblaje de proteínas. La mayoría
Biología Físico-Química | Chemical & Physical Biology
de las células utilizan GTPasas que ensamblan
para segregar sus cromosomas o para dividirse. La
superfamilia de tubulina-FtsZ incluye la alfabeta-
tubulina, la proteína de división bacteriana FtsZ, la
tubulina bacteriana BtubA/B y las TubZs, entre otras.
Nuestro trabajo se centra en comprender como
funcionan estas máquinas de ensamblaje, explorar
nuevas tubulinas e inhibir FtsZ con pequeñas moléculas
que puedan conducir a nuevos antibióticos.
F
tsZ es una diana emergente de nuevos anitibióticos, que
ensambla formando filamentos y comparte el patrón estructural
de la tubulina, una diana conocida de agentes antitumorales.
Las proteínas de la superfamilia de tubulina-FtsZ incluyen también la
tubulina bacteriana, las TubZs implicadas en los sistemas tipo III de
partición de plásmidos y posiblemente nuevas TubZs que estamos
explorando. Todas estas proteínas unen GTP en sus interfases de
ensamblaje y lo hidrolizan para desensamblar. Se cree que FtsZ genera
fuerza de constricción para división mediante una combinación de
curvatura, condensación y reciclado de sus filamentos.
El GTP unido a FtsZ puede reemplazarse por varios análogos que
inhiben su ensamblaje pero promueven el de tubulina. Estas
caracteristicas revelan diferencias entre los sitios de unión de GTP de
ambas proteínas, cuyos mecanismos y potencial utilización terapeútica
estamos investigando. FtsZ tiene al menos otro sitio de unión de
pequeñas moleculas moduladoras. El derivado de difluorobenzamida
PC190723 se une probablemente en una larga hendidura lateral entre
los dominios N- y C-terminal de FtsZ, en una zona correspondiente al
sitio de unión de taxol en tubulina. Este compuesto inhibe la división
celular de bacterias susceptibles y proteje eficientemente a ratones
frente a sepsis bacteriana. Hemos encontrado que PC190723 modifica
el ensamblaje de FtsZ estabilizando sus polímeros. Utlizamos abordajes
bioquímicos, computacionales, NMR, cristalográficos, microscopía
electrónica y microbiología en el CIB para investigar como ensamblan
las FtsZs y tubulinas y desarrollar nuevos compuestos antibacterianos
dirigidos a cada una de los sitios de unión de ligandos de FtsZ.
20
Otros miembros | Other lab members:
Sonia Huecas Gayo
Maria A. Oliva Blanco
Antonio Javier Martín-Galiano
Claudia Schaffner-Barbero
Laura Ruiz Avila
David Juan Rodriguez
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Schlieper D, Oliva MA, Andreu JM, Löwe J (2005). Structure of bacterial
tubulin BtubA/B: Evidence for horizontal gene transfer. Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 102, 9170-9175. Selected by Faculty of 1000.
Lappchen T, Pinas, VA, Hartog AF, Goomen GJ, Schaffner-Barbero C, Andreu
JM, Trambaiolo D, Löwe J, Juhem A, Popov AV, den Blaauwen T (2008).
Probing FtsZ and tubulin with C-8-substituted GTP analogs reveals differences
in their nucleotide binding sites. Chemistry & Biology 15, 189-199.
Ferrer M, Golyshina OV, Beloqui A, Böttger LH, Andreu JM, Polaina J, López
de Lacey A, Trautwein AX, Timmis KN, Golyshin PN (2008). Purple ligase: a
novel acidophilic di-ferric DNA ligase from Ferroplasma. Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 105, 8878-8883. Selected by Faculty of 1000.
Barasoain I, Díaz JF, Andreu JM (2010) Fluorescent taxoid probes for
microtubule research. Meth. Cell Biol. 95:353-372.
Andreu JM, Schaffner-Barbero C, Huecas S, Alonso D, Lopez-Rodriguez
ML, Ruiz-Avila LB, Núñez-Ramírez R, Llorca O, Martín-Galiano AJ (2010) The
antibacterial cell division inhibitor PC190723 is an FtsZ polymer-stabilizing
agent that induces filament assembly and condensation. J. Biol. Chem.
285, 14239-14246.
Martín-Galiano AJ, Buey RM, Cabezas M, Andreu JM. (2010). Mapping
flexi­bility and the assembly switch of cell division protein FtsZ by compu­
tational and mutational approaches. J. Biol. Chem. 285, 22554-22565.
Barbier P, Dorleans A, Devred F, Sanz L, Allegro D, Alfonso C, Knossow M,
Peyrot V, Andreu JM. (2010). Stathmin and interfacial microtubule inhibitors
recognize a naturally curved conformation of tubulin dimers. J. Biol. Chem.
285, 31672-31681.
Schaffner-Barbero C, Gil-Redondo R, Ruiz-Avila L, Huecas S, Läppchen T, den
Blaauwen T, Diaz JF, Morreale A, Andreu JM (2010). Insights into nucleotide
recognition by cell division protein FtsZ from a mant-GTP competition
assay and molecular dynamics. Biochemistry, 49, 10458-10472.
Tubulins and FtsZ
Los sitios principales de unión de ligandos en un monómero de FtsZ
(arriba) comparados con beta-tubulina (abajo).
The main cavities for ligand binding in an FtsZ monomer (top) compared to
beta-tubulin (bottom).
Un esquema de posible evolución y las funciones de las
proteínas de la superfamilia tubulina/FtsZ.
The tubulin/FtsZ protein superfamily of assembling
GTPases: possible evolution and functions.
Targeting protein assemblies. Most cells use assembling
GTPases for DNA segregation or cytokinesis, including
microtubule alphabeta-tubulin and bacterial division
protein FtsZ. FtsZ is the organizer and possibly the
constriction machine of the bacterial divisome. The
tubulin-FtsZ superfamily includes recently discovered
TubZs and bacterial tubulin. We aim to understand
how these assembly machines work, to discover new
tubulins and to target FtsZ with small molecules that
may lead to new antibiotics.
F
tsZ is an emergent target for new antibiotics, a filament-
forming GTPase which shares the structural fold of eukaryotic
tubulin, itself a well known target of antitumor drugs.
New proteins of the tubulin-FtsZ superfamily include baterial
tubulin BtubA/B, the divergent TubZs involved in type III plasmid
segregation and new TubZ-like proteins that we are investigating.
Each of these proteins binds GTP at its assembly interface, and
depolymerizes upon GTP hydrolysis to GDP. It is possible that
they evolved from a primitive GTP-binding protein capable
of forming filaments, which bend to do work upon hydrolysis
to GDP. FtsZ is thought to generate constriction force by a
combination of bending, condensation and recycling of its
filaments.
It is known that several GTP analogues inhibit FtsZ
polymerization without poisoning tubulin assembly. This has
revealed exploitable differences between the GTP binding
sites of both proteins, with mechanisms that we are
investigating. FtsZ has at least one other site for binding
of small molecule modulators. The difluorobenzamide
derivative PC190723, probably binding at the long
side cleft between the N- and C-teminal domains
of FtsZ, which overlaps the taxol binding site
of tubulin, inhibits cell division of susceptible
bacteria and effectively protects mice
from infection. We have found that this
compound modulates FtsZ assembly
and stabilizes its polymers. We use
biochemical, computational, NMR,
crystallography, electron microscopy
and microbiological approaches at
the CIB, to investigate how the FtsZ and
tubulin assembly machines work and
to develop new antibacterial compounds
targeting each ligand binding site in FtsZ.
21
 Mª Dolores Pérez-Sala Gozalo
Investigadora Científica | dperezsala@cib.csic.es
MD, 1983. Otros miembros | Other lab members:
Universidad de Extremadura.
PhD, 1987.
Universidad Complutense de Madrid.
Beatriz Garzón Fernández
Postdoctoral.
Harvard University, Boston, USA.
Beatriz Díez Dacal
Científica Titular, 2000, Clara Lillian Oeste Villavieja
Jefa de Grupo, 2003, Ruth Ana Valero López
Investigadora Científica, 2006, Mª Jesús Carrasco Soto
Vicedirectora desde 2008.
CIB, CSIC.

www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=38

Modificación Postraduccional de Proteínas Protein Posttranslational Modifications

La modificación postraduccional de proteínas es un su papel en el mecanismo de acción de fármacos. Protein posttranslational modification is a key mechanism for the regulation of protein structure
mecanismo básico para la regulación de su estructura Nuestro trabajo aborda la caracterización estructural and function in response to endogenous mediators, toxins and therapeutic agents. Our group
Biología Físico-Química | Chemical & Physical Biology

y actividad por numerosos mediadores endógenos, y funcional de nuevos tipos de modificación studies the modification of proteins by lipids and reactive species, its importance in physiology and
toxinas y fármacos. Nuestro grupo estudia la postraduccional, la identificación de sus proteínas in the mechanisms of drug action. Our work deals with the structural and functional characterization
modificación de proteínas por lípidos y especies diana y sus repercusiones fisiopatológicas en el of novel types of prosttranslational modifications, the identification of their protein targets and their
reactivas, tanto su importancia fisiológica, como contexto de procesos inflamatorios y oncogénicos. pathophysiological consequences in the context of inflammation and tumorigenesis.

Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Pérez-Sala, D., Boya, P., Ramos, I., Herrera, M., and
Stamatakis, K. (2009) The C-terminal sequence of RhoB
directs protein degradation through an endo-lysosomal
pathway. PLoS ONE 4(12): e8117. doi:10.1371/journal.
pone.0008117.
Reytor, E.R., Pérez-Miguelsanz, J., Alvarez, L., Pérez-Sala,
D. and Pajares, M.A. (2009) Conformational signals in the
C-terminal domain of methionine adenosyltransferase I/
III determine its nucleocytoplasmic distribution. FASEB
J. 23, 3347-3360.
Garzón, B., Gayarre, J., Gharbi, S., Díez-Dacal, B., Sánchez-
Gómez, F.J., Timms, J.F., and Pérez-Sala, D. (2010) A
biotinylated analog of the antiproliferative prostaglandin
A1 allows assessment of PPAR-independent effects
and identification of novel cellular targets for covalent
modification. Chem. Biol. Interact. 183, 212-221.
Zorrilla, S., Garzón, B, Pérez-Sala, D. (2010) Selective
binding of the fluorescent dye 8-anilinonaphthalene-
1-sulfonic acid to PPAR allows ligand identification and
characterization. Anal. Biochem. 399, 84-92.
Díez-Dacal, B. and Pérez-Sala, D. (2010) Anti-
inflammatory prostanoids: focus on the interactions
between electrophile signalling and resolution of
inflammation ScientificWorldJournal. 10, 655-675.
Kim, H., Nakamura, F., Lee, W., Hong, C., Pérez-Sala, D.,
and McCulloch, C. (2010) Regulation of cell adhesion to
collagen via β1 integrins is dependent on interactions
of filamin A with vimentin and protein kinase C epsilon.
Exp. Cell Res. 316, 1829-1844.
Valero, R., Oeste, C.L., Stamatakis, K., Ramos, I., Herrera,
M., Boya, P., and Pérez-Sala, D. (2010) Structural
determinants allowing endo-lysosomal sorting and
degradation of endosomal GTPases. Traffic 11, 1221-
1233.
Sánchez-Gómez, F.J., Díez-Dacal, B., Pajares, M.A.,
Llorca, O., and Pérez-Sala, D. (2010) “Cyclopentenone
prostaglandins with dienone structure promote cross-
linking of the chemoresistance-inducing enzyme
Glutathione Transferase P1-1. Mol. Pharmacol. 78,
723-733.
Oeste, C.L., Díez-Dacal, B., Bray, F., García de Lacoba,
M., de la Torre, B.G., Andreu, D., Ruiz-Sánchez A.J.,
Pérez-Inestrosa, E., García-Domínguez, C.A., Rojas,
J.M. and Pérez-Sala, D. (2011) The C-terminus of
H-Ras as a target for the covalent binding of reactive
compounds modulating Ras-dependent pathways.
PLoS ONE 6(1): e15866.
Localización lisosomal de proteínas mediante
una secuencia específica de lipidación. Hemos
observado que la secuencia que determina la
isoprenilación y palmitoilación de la GTPasa
RhoB, CINCCKVL, que denominamos secuencia
Lys, es también responsable de la localización
endolisosomal y la degradación rápida de esta
proteína. Además, cuando esta secuencia se fusiona
al extremo carboxilo terminal de otras proteínas,
como GFP-RhoGDI, también provoca su localización
endolisosomal y su degradación. Estos efectos son
más obvios tras la inhibición de la acidificación y
proteólisis lisosomales con cloroquina, que induce
un aumento en el tamaño de los lisosomas.
Lysosomal protein targeting through a specific lipidation
motif. We have found that the sequence determining
isoprenylation and palmitoylation of the short-lived
GTPase RhoB, CINCCKVL, which we call Lys sequence,
also determines the endo-lysosomal targeting and rapid
degradation of this protein. Moreover, fusing sequence
to the C-terminal end of an unrelated protein, like GFP-
RhoGDI, also directs its endo-lysosomal localization
and degradation. These effects are more obvious after
inhibition of lysosomal acidification and proteolysis with
chloroquine (Pérez-Sala et al., 2009).
L T
a modificación postraduccional de
residuos de cisteína en proteínas
mediante isoprenilación o palmitoilación
juega un importante papel en la regulación
celular y en la acción de ciertos fármacos.
Las estatinas ejercen algunos de sus efectos
beneficiosos mediante la inhibición de
la isoprenilación de las proteínas Rho.
El estudio de estos mecanismos nos ha
permitido identificar una secuencia de ocho
aminoácidos que determina la localización
de la proteína RhoB en lisosomas y su rápida
degradación por este vía. Esta secuencia
es suficiente para provocar la degradación
lisosomal de proteínas quiméricas en pocas
horas. En la actualidad estamos explorando
las posibles aplicaciones biotecnológicas o
biomédicas de estos hallazgos.
Los residuos de cisteína son también
diana para la unión de lípidos electrófilos
endógenos, que se generan por oxidación
o deshidratación de lípidos insaturados.
Las prostaglandinas con estructura
ciclopentenona (cyPG) son eicosanoides
electrófilos con acciones antiinflamatorias
y antiproliferativas. Mediante abordajes de
proteómica hemos identificado proteínas
diana de cyPG, como las proteínas Ras
o el factor de transcripción NF-κB, cuya
modificación por estos compuestos juega
un papel clave en sus efectos biológicos.
Hemos observado que la unión de las
cyPG a proteínas es selectiva y depende
de la estructura de ambas. Determinadas
cyPG pueden unirse a dos residuos de
cisteína causando importantes cambios
conformacionales u oligomerizacón de
proteínas. Otras cyPG interaccionan con
ciertas proteínas de forma especialmente
favorable. Algunas de estas dianas selectivas
son enzimas implicadas en resistencia tumoral.
Estos hallazgos podrían proporcionar nuevas
perspectivas para el desarrollo de fármacos.
Inducción de la oligomerización de GST por prostaglandinas
ciclopentenonas. Las glutatión transferasas (GST) desempeñan un
importante papel en quimioprevención y quimiorresistencia. Las
prostaglandinas ciclopentenonas con estructura dienona, como la Δ12-
PGJ2, inducen una oligomerización irreversible de GST que se puede
observar en geles desnaturalizantes (panel izquierdo) y mediante
microscopía electrónica (EM, paneles centrales). La estructura del dímero
de GST se muestra a la derecha para su comparación con la imagen de EM.
La oligomerización de GST inducida por prostaglandinas ciclopentenonas
se asocia con la liberación y la activación sostenida de quinasas de estrés
y con la inducción de apoptosis, que podrían contribuir a los efectos
antiproliferativos de estas prostaglandinas.
Oligomerization of GST induced by cyclopentenone prostaglandins. Glutathione
transferases (GST) are key players in chemoprevention and chemoresistance.
Cyclopentenone prostaglandins with dienone structure, such as Δ12-PGJ2 cause
the irreversible oligomerization of GST, which can be evidenced by denaturing
gel electrophoresis (left panel) and by electron microscopy (EM, middle panels).
The structure of the GSTP1-1 dimer is shown on the right for comparison with
the EM image. GST oligomerization induced by cyclopentenone prostaglandins
is associated with release and sustained activation of stress kinases and
induction of apoptosis, which may be involved in the anti-proliferative effects of
these prostaglandins (Sánchez-Gómez et al., 2010).
he posttranslational modification of cysteine residues
in proteins by isoprenylation and palmitoylation
plays an important role in cell regulation and in
the mechanisms of action of certain drugs. Some of the
beneficial effects of statins on cardiovascular function
are mediated by the inhibition of isoprenylation of Rho
proteins. The detailed study of these mechanisms has led to
the identification of an eight amino acid sequence which
determines the lysosomal localization of the GTPase RhoB
and its rapid degradation through a lysosomal pathway.
This sequence is sufficient to promote the lysosomal
degradation of chimeric proteins in a few hours. We are
presently exploring the potential applications of these
findings in biotechnology and biomedicine.
Cysteine residues are also targets for the addition of
endogenous electrophilic lipids, which are generated
by oxidation or dehydration of unsaturated lipids.
Cyclopentenone prostaglandins (cyPG) are electrophilic
eicosanoids that display antiinflammatory and
antiproliferative effects. Using proteomic approaches we
have identified protein targets of cyPG, including Ras
proteins and the transcription factor NF-κB, and established
the key role of the modification in the biological effects of
cyPG. We have observed that protein modification by cyPG
is selective and depends on the structural features of both
the protein and the cyPG. Some cyPG can bind to two
cysteine residues causing important conformational
alterations or protein oligomerization. Others interact
favourably with certain proteins. Some of these
selective targets are enzymes involved in cancer
chemoresistance. These findings could open
novel perspectives for the development of
new chemotherapeutic compounds.
Patente
Patent
Dolores Pérez-Sala y Beatriz Díez Dacal. “Uso de compuestos con
estructura 2-ciclopentenona para la inhibición de enzimas de la familia
de las aldo-keto reductasas”.
Fecha: 25 de Marzo de 2010
Nº de solicitud Nacional: P201030449

22 23
 Rafael Giraldo Suárez
Profesor de Investigación | rgiraldo@cib.csic.es Synthetic Microbial Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Doctor en C.C. Biológicas, 1991.
Universidad Complutense de Madrid.
Postdoctoral, 1992-1994.
Investigadora del equipo | Staff Scientist:
M. Elena Fernández-Tresguerres Rodríguez-Vigil
Macromolecular Giraldo, R., (2007) Defined DNA sequences promote the
assembly of a bacterial protein into distinct amyloid

Assemblies
nanostructures. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104, 17388-17393.
División de Estudios Estructurales del Laboratorio
de Biología Molecular del MRC, Cambridge, Reino Otros miembros | Other lab members: Gasset-Rosa, F., Maté, M.J., Dávila-Fajardo, C., Bravo, J., and
Unido. Giraldo, R., (2008) Binding of sulphonated indigo derivatives
Ana María Serrano López
Investigador Contratado, 1995-1999. to RepA-WH1 inhibits DNA-induced protein amyloidogenesis.
MEC. María Moreno del Álamo Nucleic Acids Res. 36, 2249-2256.
Científico Titular, 2000-2008, Cristina Fernández Fernández Micro-organisms are versatile model systems
Gasset-Rosa, F., Díaz-López, T., Lurz, R., Prieto, A., Fernández-
Investigador Científico, 2008-2009, Fátima Gasset Rosa for studying the structure and assembly of Tresguerres, M.E., and Giraldo, R., (2008) Negative regulation
Profesor de Investigación, desde 2010, Laura Molina García
Miembro de la Academia Europea, 2010. natural protein complexes, allowing to attempt of pPS10 plasmid replication: Origin pairing by zipping-up
DNA-bound RepA monomers. Mol. Microbiol. 68, 560-572.
CIB, CSIC.
the reconstruction of these assemblies with
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=61 Moreno-del Álamo, M., Sánchez-Gorostiaga, A., Serrano,
altered or novel functionalities. In a bottom- A.M., Prieto, A., Cuellar, J., Martín-Benito, J., Valpuesta, J.M.,
up Synthetic Biology task, evolved from our and Giraldo, R., (2010) Structural analysis of the interactions
between Hsp70 chaperones and the yeast DNA replication
previous studies on the role of the RepA
Ensamblajes Macromoleculares Microbianos Sintéticos
protein Orc4p. J. Mol. Biol. 403, 24-39.
protein in the replication of pPS10 plasmid, Fernández-Tresguerres, M.E., Moreno-Díaz de la Espina, S.,
we are currently developing modules derived Gasset-Rosa, F., Giraldo, R., (2010) A DNA-promoted amyloid
proteinopathy in Escherichia coli. Mol. Microbiol. 77, 1456-1469.
from WH domains that allow for the control
Giraldo, R., (2010) Amyloid assemblies: Protein Legos at a
Biología Físico-Química | Chemical & Physical Biology

Los microorganismos ofrecen sistemas modelos replicación del DNA del plásmido pPS10, en nuestro and engineering of amyloid assembly under crossroads in bottom-up synthetic biology. ChemBioChem
de gran versatilidad para el estudio estructural y grupo estamos desarrollando, con aproximaciones quasi-physiological conditions. 11, 2347-2357.

la reconstrucción de complejos de proteínas con propias de la Biología Sintética, módulos derivados de

funcionalidades nuevas. Como evolución de nuestros dominios WH que permitan controlar el ensamblaje
anteriores estudios sobre la proteína RepA en la amiloide de proteínas en condiciones cuasi-fisiológicas.

N
uestro grupo estudia los
cambios conformacionales que
experimentan dominios del
tipo Winged-Helix (WH) al unirse al DNA,
facultándoles para iniciar la replicación de
plásmidos bacterianos (proteína RepA) o de
los cromosomas en levaduras (ORC, Origin

O
Recognition Complex). Hemos descubierto
ur group studies the conformational changes experienced
que el ensamblaje de complejos
by Winged-Helix (WH) protein domains upon binding
funcionales está modulado por secuencias
to DNA, which enable these proteins to initiate
específicas de DNA (en el caso de RepA),
DNA replication of bacterial plasmids (RepA protein) or yeast
que actúan como efectores alostéricos,
chromosomes (ORC, Origin Recognition Complex). We have
y por chaperonas de la familia Hsp70
discovered that the assembly of functional complexes is
(ORC). La interacción in vitro del dominio
modulated by specific DNA sequences (RepA), which thus act
N-terminal de RepA (WH1) con el DNA
as allosteric effectors, and by chaperones of the Hsp70 family
promueve el ensamblaje de la proteína
(ORC). In the case of the N-terminal domain in RepA (WH1),
en fibras amiloides, de manera análoga
its binding to DNA promotes the assembly of the protein as
a la transformación estructural amiloide
amyloid fibers in vitro, as reported for the proteins involved in
descrita en las proteínas implicadas en
spongiform encephalopathies and in Parkinson’s disease. We
las encefalopatías espongiformes y en la have found molecules that inhibit WH1 amyloidosis by binding
enfermedad de Parkinson. Hemos hallado to the amino acid residues in the protein which should interact
moléculas que inhiben la amiloidosis with DNA. Expression in E. coli of fusions between RepA-WH1
de WH1 al unirse en esta proteína a and a red fluorescent protein gives way to amyloid inclusions
los residuos que reconocen al DNA. in the cytoplasm, which are readily visualized under the
La expresión en E. coli de fusiones de microscope. These amyloid aggregates are stochastically
RepA-WH1 con una proteína marcadora transmitted to the daughter cells, coupled to cell
fluorescente roja da lugar a inclusiones division. RepA-WH1 thus behaves as a prionoid,
amiloides en el citoplasma observables constituting the simplest model available for the
al microscopio. La presencia de estos study of the molecular basis common to all
agregados amiloides genera un fenotipo amyloid proteinopathies and opening new
compatible con el envejecimiento de las perspectives to engineer protein amyloid
bacterias, que aumentan significativamente nano-scaffolds.
su tiempo de generación. Las inclusiones
amiloides se transmiten estocásticamente Las cinco subunidades homólogas (Orc1-5p) que forman el núcleo del
durante la división celular a las células hijas complejo iniciador de la replicación del DNA en S. cerevisiae interaccionan
Un derivado sulfonado del colorante azul índigo (esferas) reconoce el sitio de unión al ADN en la entre sí a través de un motivo Ile-Leu4 (en azul) localizado en sus dominios
resultantes. RepA-WH1 se comporta pues proteína RepA-WH1 (esquema de cintas rojas y amarillas), bloqueando así la polimerización de ésta AAA+, que también es reconocido por chaperonas Hsp70. El complejo
como un prionoide, siendo el modelo más en fibras amiloides (fondo, micrografía electrónica) similares a las formadas por el prion PrP. Cuando pre-replicativo se ensambla entorno al DNA en un origen de replicación
se expresa RepA-WH1 fusionada a un marcador fluorescente rojo en E. coli se forman inclusiones (ARS) y se estabiliza tras la captación de otra proteína homóloga, Cdc6p.
sencillo del que se dispone para el estudio
amiloides que disminuyen drásticamente la viabilidad celular (arriba).
de las bases moleculares comunes a las The five homologous subunits (Orc1-5p) that build the complex initiating DNA
A sulphonated derivative of the indigo blue stain (spheres) fits at the DNA binding site in the RepA-WH1 replication in S. cerevisiae interact with each other through an Ile-Leu4 motif (blue) in
proteinopatías amiloides y abriendo nuevas protein (red and yellow ribbons), thus blocking protein polymerization into amyloid fibres (electron micrograph their AAA+ domains, which is also bound by Hsp70 chaperones. Such a pre-replicative complex
perspectivas a la ingeniería de nano- at the background) similar to those built by the PrP prion. When expressed in E. coli as a fusion to a red assembles around DNA at a replication origin (ARS) and it is further stabilized after binding Cdc6p, an
ensamblajes amiloides. fluorescent protein marker, RepA-WH1 aggregates as amyloid inclusions that severely reduce cell fitness (top). Orc1-5p related protein.

24 25
 Oscar Llorca
Profesor de Investigación | ollorca@cib.csic.es Otros miembros | Other lab members:
Graduate in Biology, 1992. Martín Alcorlo Pagés
University of Navarre
Ernesto Arias Palomo
PhD in Molecular Biology, 1996.
Raquel Castaño Cobo
Autonomous University of Madrid
Begoña García Álvarez
1992-2000.
Centro Nacional de Biotecnología CNB, CSIC Andrés López Perrote
Marie Curie EU Fellow, 2000-2002. Roberto Melero del Río Estructura 3D del complejo entre las proteínas SMG-1:SMG-8:SMG-9 que regula
Institute of Cancer Research, London, UK Rafael Núñez Ramírez la degradación de RNA mensajeros en la ruta NMD, representado sobre una
composición de imágenes de este complejo obtenidas mediante microscopía
Team leader, 2002, María Ángeles Recuero Checa
Científico Titular, 2002, electrónica. La interacción de SMG-8 con SMG-1 regula la actividad quinasa
Profesor de Investigación, 2009. Cesar Rodríguez Gallego de SMG-1 y la ruta NMD mediante la inducción de grandes cambios
CIB, CSIC. Israel Sánchez Fernández conformacionales (ver modelo y figura en Arias-Palomo et al. Genes Dev 2011).
Trabajo en colaboración con Shigeo Ohno y Akio Yamashita (Universidad de
Eva María Torreira Ontiveros Yokohama, Japón).
www.cib.csic.es/en/grupo.php?idgrupo=47
3D structure of the SMG-1:SMG-8:SMG-9 complex that regulates mRNA
degradation in the NMD pathway, placed on a board composed of a

Microscopía electrónica y reconstrucción tridimensional collection of images of this complex obtained by electron microscopy. The
interaction of SMG-8 with SMG-1 down-regulates SMG-1 kinase activity
and NMD by inducing large-scale conformational changes (see model in

de macromoléculas Arias-Palomo et al. Genes Dev 2011). Work in collaboration with Shigeo
Ohno and Akio Yamashita (Yokohama City University, Japan).
Biología Físico-Química | Chemical & Physical Biology

Muchas funciones celulares son realizadas gracias a
la interacción dinámica de conjuntos de proteínas
formando grandes complejos macromoleculares.
Nuestro grupo está interesado en el estudio de
M
ediante el uso de Microscopía
Electrónica tridimensional
observamos estas macromoléculas
en distintos estados conformacionales,
combinando estudios funcionales y
bioquímicos para proporcionar información
sobre su estructura, sus movimientos y sus
funciones.
Nuestros intereses científicos actuales se
centran en la caracterizaron de la estructura,
los movimientos y las funciones de grandes
complejos macromoleculares en dos áreas:
1) Complejos macromoleculares que
manipulan DNA y RNA: reparación de
procesos biológicos controlados por estas grandes
“maquinarias macromoleculares” con especial
atención en complejos implicados en la manipulación
Electron microscopy and three dimensional
de DNA y RNA, o con relevancia en salud humana. reconstruction of macromolecules
otras patologías humanas. Recientemente SMG-1 controla un sistema de “vigilancia” Many cellular functions are performed by the dynamic in DNA replication, the DNA repair proteins Xrcc4 and Ligase
hemos caracterizado la estructura y los de errores en los RNA mensajeros interaction of many proteins in large macromolecular IV, and pontin/reptin, a component of the INO80 chromatin-
mecanismos de funcionamiento del causados por mutaciones terminadoras remodeling complex.
complexes. Our group is interested in biological
primosoma eucariota en la replicación del y que regula la expresión génica (NMD, Another link in most of our research is our interest in a family
processes performed by these large macromolecular
DNA, de Xrcc4 y Ligasa IV en reparación nonsense-mediated mRNA decay). Hemos of large kinases with homology to PI3K, known as PIKK (PI3K-
“machines” with special attention to those involved in related kinases). These kinases regulate DNA repair (ATM,
de DNA, y del complejo pontin/reptin, caracterizado la estructura y la función de
un componente del complejo INO80 de varios componentes de la ruta NMD. DNA and RNA transactions and those of relevance in ATR), cell growth (mTOR), chromatin remodeling (Trrap)
remodelación de cromatina. 2) Inmunología estructural del complemento
human diseases. We use 3D-Electron Microscopy to and RNA degradation (SMG-1). Over the years we have
Otro punto de conexión entre una buena en inmunidad innata: Existe un interés visualize large macromolecular complexes in several studied several PIKK members and recently we turned our
parte de nuestra investigación es nuestro renovado en definir las bases estructurales conformational states which, in combination with attention to SMG-1. SMG-1 controls a surveillance pathway
that degrades mRNAs containing premature termination
interés en una familia de quinasas de y moleculares del complemento en functional and biochemical studies, provide unique
codons and regulates gene expression (NMD, nonsense-
gran tamaño y con homología a PI3K salud humana. El complemento se regula information about their structure, motions and mediated mRNA decay). We have characterized the
denominada PIKK. Estas quinasas participan mediante la formación de complejos
functions. structure and regulation of several NMD components.
en reparación de DNA (ATM y ATR), proteicos inestables de corta vida,

daños en el DNA, replicación, remodelación
de cromatina y degradación de RNA.
Una característica común de todos estos
procesos es la formación de grandes
complejos que manipulan ácidos
nucleicos y su implicación en cáncer y
control de crecimiento celular (mTOR),
remodelación de cromatina (Trrap) y
degradación de RNA (SMG-1). Durante los
últimos años hemos caracterizado varios
miembros de la familia y recientemente
hemos centrado nuestro trabajo en SMG-1.
que estamos caracterizando mediante
microscopía electrónica en colaboración con
el grupo de Santiago Rodríguez de Córdoba
(CIB). Hemos caracterizado el ensamblaje de
C3 convertasa, así como la estructura de un
mutante de C3 asociado a enfermedad.
O
ur current research is devoted to characterizing the
structure, the motions and the functions of large
macromolecular complexes in two distinct fields:
1) Macromolecular machines in DNA and RNA transactions: DNA
repair, DNA replication, chromatin remodeling and RNA degradation.
A common feature of all these processes is the formation of large
complexes that manipulate nucleic acids and their link with cancer
and other human diseases. Recently we have characterized the
structure and functional mechanisms of the eukaryotic primosome
2) Structural immunology of complement (innate
immunity). There is renewed interest to define the
structural and molecular basis of complement
functions in human health. Complement is regulated
thorough the assembly of short-live unstable protein
complexes, which we are studying using electron
microscopy in collaboration with Santiago Rodriguez
de Córdoba (CIB). We have characterized the assembly
of the C3 convertase and the structure of a C3 mutant
associated with disease.

Estructura de un sub-complejo del primosoma
eucariota que contiene la subunidad catalítica de
la DNA polimerasa alpha (pol alpha, color verde)
y la subunidad B (color naranja). Un dominio
C-terminal no catalítico de pol alpha se proyecta
desde el dominio catalítico, funcionando como un
región de reconocimiento de otras subunidades
del primosoma. La conexión flexible entre las dos
regiones estructurales del primosoma permite el
movimiento de la molécula durante la síntesis de los
cebadores en replicación. Esta estructura se obtuvo
mediante la combinación de microscopía electrónica
de macromoléculas y cristalografía de rayos X en
colaboración con Luca Pellegrini (Universidad de
Cambridge, Reino Unido)(Klinge et al. EMBO J 2009).
Structure of a eukaryotic primosome sub-complex
containing the DNA polymerase catalytic subunit
(pol alpha, green colour) and the B-subunit (orange
colour). A non-catalytic C-terminal domain of pol alpha
(blue colour) projects from the catalytic core, acting
as a hub to recognise accessory subunits of the large
primosome complex. The flexible connection between
the two structural regions of the primosome may allow
movements of the molecule required to synthesize RNA-
DNA primers during DNA replication. The structure was
obtained by a combination of 3D-Electron Microscopy
and X-ray crystallography in collaboration with Luca
Pellegrini (University of Cambridge, UK) (Klinge et al.
EMBO J 2009).
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Arias-Palomo E, Yamashita A, Fernández IS, Núñez-Ramírez R, Bamba
Y, Izumi N, Ohno S, Llorca O [2011] Nonsense-Mediated mRNA
Decay SMG-1 kinase is regulated by larg e-scale conformational
changes controlled by SMG-8. Genes Dev 25:153-64.
Rehmann H, Arias-Palomo E, Hadders MA, Schwede F, Llorca O,
Bos JL [2008] Structure of Epac2 in complex with a cyclic AMP
analogue and RAP1B. Nature 455:124-7.
Recuero-Checa MA, Doré AS, Arias-Palomo E, Rivera-Calzada
A, Scheres SH, Maman JD, Pearl LH, Llorca O [2009] Electron
microscopy of Xrcc4 and the DNA ligase IV-Xrcc4 DNA repair
complex. DNA Repair (Amst) 8:1380-9.
de Córdoba SR, Harris CL, Morgan BP, Llorca O [2011] Lessons from
functional and structural analyses of disease-associated genetic
variants in the complement alternative pathway. Biochim Biophys
Acta-Molecular Basis of Disease 1812:12-22.
Klinge S&, Núñez-Ramírez R&, Llorca O,* Pellegrini L* [2009] 3D
architecture of DNA Pol alpha reveals the functional core of multi-
subunit replicative polymerases. EMBO J 28:1978-87. (&co-first
authors; *co-corresponding authors).
Torreira E*, Tortajada A*, Montes T*, Rodríguez de Córdoba S#,
Llorca O# [2009] Coexistence of closed and open conformations
of complement factor B in the alternative pathway C3bB(Mg2+)
proconvertase. J Immunol 183:7347-51. (*Equal first and last
author, # correspondence authors)
Fernández IS, Yamashita A, Arias-Palomo E, Bamba Y, Bartolomé RA,
Canales MA, Teixidó J, Ohno S, Llorca O [2011] Characterization of
SMG-9, an essential component of the nonsense-mediated mRNA
decay SMG1C complex. Nucleic Acids Res 39:347-358.
Torreira E*, Tortajada A*, Montes T*, Rodríguez de Córdoba S#, Llorca
O# [2009] 3D structure of the C3bB complex provides insights
into the activation and regulation of the complement alternative
pathway convertase. Proc Natl Acad Sci USA 106:882-7. (*Equal
first and last author, # correspondence authors)

26 27
 Victor Muñoz van den Eynde
Profesor de Investigación | vmunoz@cib.csic.es
PhD, 1995. Otros miembros | Other lab members:
Laboratorio Europeo de Biologia Molecular (EMBL) y
Universidad Autónoma de Madrid.
Postdoctoral, 1996-2000. Mourad Sadqi Satish Babu Moparthi
Institutos Nacionales de La Salud, Bethesda, Maryland,
EEUU. David de Sancho Sánchez Tanay Desai
Assistant Professor, 2000-2005, Michele Cerminara Lorenzo Sborgi
Associate Professor, 2005-2009, Athi Naganathan Ravishankar Ramanathan
Adjunct Professor, 2009. Luis Alberto Campos Prieto Jörg Schönfelder
Universidad de Maryland, College Park, Maryland, EEUU.
Abhinav Verma Nagalakhsmi T. Sooriyanarayanan
Profesor de Investigación, 2007.
CIB, SIC. Malwina Szczepaniak Celia Sánchez de Medina Revilla

www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=63 Análisis átomo por átomo del plegamiento

de proteínas tipo “downhill”. La superficie de
energía libre con un solo mínimo característica

Biofísica de Proteínas de proteínas “downhill” resulta en un proceso de

desplegamiento gradual que ha sido estudiado a
resolución atómica por RMN (parte superior). Los
resultados de estos experimentos llevan a obtener la
matriz de interacciones entre residuos que establizan la
Nuestro grupo investiga las conexiones entre molecular-celular. Empleamos técnicas de resonancia estructura nativa de la proteina (parte inferior).
Biología Físico-Química | Chemical & Physical Biology

estructura tridimensional de proteínas, plegamiento, magnética nuclear, cinética ultrarápida, experimentos Atom by atom analysis of downhill protein folding. The
single well free energy surface characteristic of downhill
diseño, evolución y función biológica. Nuestra en moléculas únicas, y supercomputación, con el proteins results in a gradual unfolding process that has been
aproximación es multidisciplinar, combinando física, objetivo de desarrollar métodos, herramientas y studied at atomic resolution using NMR (top). From these
results it is possible to obtain the residue-residue interaction
espectroscopía, química de proteínas, y biología nuevos conceptos en la biofísica de proteínas. matrix stabilizing the native protein structure (bottom).

P
legamiento de Proteínas
Experimental. Para explotar el
nuevo área de investigación
propiciado por el descubrimiento del
plegamiento sin barreras (downhill)
estamos investigando un catálogo de
patrones estructurales fundamentales
o arquetipos de plegamiento. Para
esto usamos RMN, técnicas de cinética
ultrarápida, de moléculas únicas, y
abordajes computacionales, a la vez que
desarrollamos nuevos métodos de análisis
experimental.
Plegamiento “Downhill” y Reostatos
Moleculares. Las proteínas con
plegamiento downhill podrían actuar
como reostatos moleculares a nivel celular,
funcionando como sensores, osciladores
de sincronización, y/o muelles ajustables.
Estamos investigando esta hipótesis en
el complejo multienzimático de la oxo-
glutarato deshidrogenasa, para el cual hemos
demonstrado teóricamente la viabilidad del
mecanismo oscilador, usando experimentos
de moléculas únicas por FRET y microscopía
de fuerza atómica.
Predicción de Estructura y Diseño de
Proteínas. Los abordajes tradicionales de
predicción-diseño se restringen a calcular
Protein Biophysics
la energía de cada conformación. Nuestra
alternativa es calcular superficies de baja
Our group investigates the structure and conformational behavior of proteins in the context
dimensionalidad para la energía libre de
plegamiento de cada conformación diana, con of folding, protein evolution, and biological function. The approach we use is multidisciplinary,
lo que podemos también estimar rápidamente borrowing from condensed matter physics, physical chemistry, computer science, protein
su estabilidad global y cinética de plegamiento. chemistry, and molecular and cell biology. We employ nuclear magnetic resonance, ultrafast
Este método lo hemos refinado usando datos kinetic techniques, single molecule studies and high performance computing to develop
experimentales de plegamiento, y en el futuro
methods, tools and new concepts in protein biophysics.
planeamos aplicarlo a predicción y diseño de
novo de proteínas.

E
xperimental Studies of Protein Folding
We have showed that proteins fold over small
barriers and even downhill, opening a new avenue
of biophysics research. We are exploiting this avenue
by studying a catalogue of basic folding patterns or
“archetypes” using NMR, ultrafast kinetic techniques, single
molecule, and computational approaches. In addition we
are developing new analytical tools to investigate folding.
Downhill Folding and Molecular Rheostats
Downhill folding proteins could act as molecular rheostats
performing cellular functions as sensors, oscillators to
synchronize multistep reactions, and tunable springs. To
test this hypothesis we are investigating the oxo-glutarate
dehydrogenase multienzyme complex. Recently we showed
theoretically the feasibility of the oscillator mechanism for
this complex. We are starting experimental studies using
single molecule FRET and atomic force microscopy.
Structure Prediction and de novo Design
Classical approaches to structure prediction-design rely
solely on energy calculated with approximate force-fields.
Instead, we calculate low-resolution folding free energy
surfaces for each target conformation, which allows us to
quickly estimate global stability and foldability. We are now
testing this method against experimental protein folding
rates and stabilities, and plan to apply it to ab initio structure
prediction and de novo design.

Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Li, P., Oliva, F.Y., Naganathan, A.N. and Muñoz, V. (2009) Dynamics of one-state downhill A.N. Naganathan, P. Li, R. Perez-Jimenez, J.M. Sanchez-Ruiz & V. Muñoz (2010) Navigating
the downhill proteína holding regime via structural homologues. J. Am. Chem. Soc. Una proteína artificial identificada
protein folding. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 106: 103-108.
recientemente como un modelo
132, 11183-11190.
D. DeSancho, U. Doshi & V. Muñoz (2009) Protein folding rates and stability: how much experimental de plegamiento primordial
is there beyond size? J. Am. Chem. Soc. 131, 21074-2075. T. Desai, M. Cerminara, M. Sadqi & V. Muñoz (2010) The effects of electrostatics on the (plegamiento en épocas prebióticas)
marginal cooperativity of an untrafast folding protein. J. Biol. Chem. 285, 34549-34556. cambia de exhibir dinámica conformacional
V. Muñoz & R. Ramanathan (2009) Waltzing a-helices. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 106,
L.A. Campos, j. Liu, X. Wang, R. Ramanathan, D.S. English & V. Muñoz (2011) A vidriosa (izquierda) a exhibir una cinética de
1299-1300.
photoprotection strategy for microsecond-resolution single-molecule fluorescence plegamiento simple y eficiente cuando la
M. Sadqi, E. de Alba, R. Perez-Jimenez, J.M. Sanchez-Ruiz & V. Muñoz (2009) A designed temperature alcanza 323 K.
spectroscopy. Nature Meth. 8, 143-146.
protein as experimental model of primordial folding. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 106: An artificial protein recently identified as an
4127-4132. experimental model of primordial folding
V. Muñoz (2009) Downhill protein folding under pressure. Nature Meth. 6, 490-491.
Premio (folding during pre-biotic evolution) switches
Award from glassy conformational dynamics (left) to
A.N. Naganathan & V. Muñoz (2010) Insights into protein folding mechanisms from
simple efficient folding kinetics (right) when
large-scale analysis of mutational data. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 107, 8611-8616. Victor Muñoz ha sido elegido miembro de EMBO en 2009 temperature reaches 323 K.

28 29
 Antonio Romero Garrido
Profesor de Investigación | romero@cib.csic.es
PhD, 1987.
Universidad Complutense de Madrid.
Postdoctoral.
Université de Rennes I, Francia y Max-Planck Institut
für Biochemie, Munich, RFA.
Científico Titular, 1990,
Jefe de grupo CIB, 1997,
Profesor de Investigación, 2008.
CIB, CSIC.
Investigadores del equipo | Staff Scientists:
Otros miembros | Other lab members:
Margarita Carrascosa Cebrián
Francisco José Fernández Pérez
Rocío González Corrochano
Biología Físico-Química | Chemical & Physical Biology
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=40
Cristalografía de Rayos-X e Ingeniería de Proteínas
Nuestro grupo está formado por un equipo
multidisciplinar con un interés común: el estudio
de las macromoléculas biológicas a nivel atómico.
Para ello, utilizamos la cristalografía de rayos X y la
microscopía electrónica como técnicas principales
y ocasionalmente la resonancia magnética nuclear
para determinar las estructuras tridimensionales de
las proteínas y sus complejos. Nuestros proyectos
científicos se enmarcan dentro de la Investigación
E
l objetivo de nuestra investigación
actual es caracterizar a nivel atómico
una serie de proteínas implicadas
en diferentes patologías humanas con el
objeto de comprender la naturaleza de
estas enfermedades. Guillermo Giménez y
Antonio Romero fueron pioneros en el área
de la Biología Estructural en el CIB en 1997.
Recientemente, dos nuevos científicos, M.
Cristina Vega Fernández y Carlos Fernández
Tornero se unieron al grupo con sus propios
proyectos.
Patologías Angio-dependientes y Resistencia
Antibiótica. Parte de nuestra investigación se
ha centrado en una serie de proteínas diana
que juegan un papel importante en procesos
30
Guillermo Giménez-Gallego
Profesor de Investigación | gimenez_gallego@cib.csic.es
PhD, 1977, UAM.
Premio Extraordinario de Licenciatura,
Premio Extraordinario de Doctorado
Académico de Número, Real Academia de Farmacia.
Director, Departamento de Biología, UAM
Profesor Agregado, UAM.
Investigador de Plantilla, Merck Institute for
Therapeutic Research (USA).
Director, Oct. 1993 - Oct. 97 y Mayo 2002 - Nov. 04.
CIB, CSIC.
Más de 160 artículos publicados en revistas
científicas de amplia difusión internacional.
Cristina Vega Fernández Carlos Fernández Tornero
Alejandra Herrera Morandé Fabiola Rodríguez Calviño
Miguel López Estepa Federico Martín Ruiz
María del Pilar López Navajas Marcel Rösinger
Francisco Javier Medrano Martín Elena Santillana Heras
Esther Peña Soler Mercedes Spínola
Médica Translacional y pretenden contribuir al
desarrollo de nuevas aplicaciones terapéuticas.
En concreto buscamos aplicar la caracterización
estructural a nivel atómico a los aspectos estáticos
y dinámicos de los procesos tumorales, las
enfermedades angiodependientes, las resistencias a
antibióticos, las interacciones huésped-patógeno y la
inmunidad innata, la modificación y remodelación de
cromatina, la transcripción y la reparación del ADN.
tumorales, enfermedades angio-dependientes, y el papel del sistema inmune innato. Una
resistencia antibiótica y virulencia bacteriana. segunda área de investigación se centra en
El grupo ha desempeñado un papel relevante complejos multisubunidad implicados en la
en la implicación de la amiloidosis en la modificación de cromatina.
transmisión del SIDA, el papel del FGF en el Caracterización estructural de ensamblados
control de patologías angio-dependientes, macromoleculares implicados en
y en la comprensión del mecanismo de transcripción y reparación del ADN. Los
resistencia a carbapenemas. procesos celulares esenciales son llevados a
Interacciones huésped-patógeno e cabo por complejos multi-proteicos más que
inmunidad innata/Modificación de por proteínas individuales. Nuestro objetivo es
cromatina. Estamos interesados en la comprender cómo funcionan la transcripción
biología estructural en la interfase entre los y la reparación del ADN desde un punto de
tejidos humanos y las vastas comunidades vista estructural. Para ello, caracterizamos una
microbianas que los habitan (el microbioma), serie de ensamblados macromoleculares
especialmente en los mecanismos de combinando la cristalografía de rayos X y la
reconocimiento y eliminación de patógenos microscopía electrónica.
(a) Superficie accesible al solvente del péptido
de fusión FP1-23 de la proteína gp41 del virus
del SIDA (color rojo) y del péptido VIR-576 (color
cian) en el complejo VIR-576:FP1-23, resuelto por
RMN. (b) Reconstrucción tridimensional de la ARN
polimerasa III a 10 Å de resolución, obtenida mediante
criomicroscopía electrónica.
(a) Solvent-accessible surface of VIR-576 (cyan) and the
FP1-23 fusion peptide of the VIH gp41 protein (red) in the
complex VIR-576:FP1-23 solved by NMR (See Forssmann
et al. (2010) Science Translational Medicine 2, 63re3 for
details). (b) Electron cryomicroscopy reconstruction of
RNA polymerase III at 10 Å resolution (See Fernández-
Tornero et al. (2010) EMBO J. 29, 3762-3672 for details).
X-Ray Crystallography and Protein Engineering
Our group is composed by a multidisciplinary team joining a common interest: the study of
biological macromolecules at the atomic level. Accordingly, we use X-ray crystallography and
electron microscopy as primary techniques, and nuclear magnetic resonance when necessary,
to determine the three-dimensional structure of proteins and their complexes. Our scientific
projects move within the frame of the Translational-Medicine Research with the aim of contributing
to the development of new therapeutic approaches. Particularly, we pursue the application of the
high resolution structural approaches to the dynamical aspects of tumoral processes, angiogenic
dependent pathologies, antibiotic resistance, host-pathogen interactions and innate immunity,
chromatin modification and remodelling, transcription and DNA repair.
T
he aim of our current research is to characterize, at the atomic a structural perspective. We employ a combination of X-ray
level, a series of proteins involved in different human pathologies crystallography and electron microscopy to characterize large
at atomic resolution in order to understand the basis of these macromolecular assemblies involved in these processes.
diseases. Guillermo Giménez and Antonio Romero pioneered the
field of Structural Biology at the CIB in 1997. Very recently, two new
scientists, M. Cristina Vega Fernández and Carlos Fernández Tornero,
joined the group leading their own scientific projects.
Angiogenic dependent pathologies and Antibiotic resistance.
Current research focuses on target proteins that play an important
role in tumor processes, angiogenic dependent pathologies,
antibiotic resistance and bacterial virulence. The group has played
a leading role highlighting the importance of amyloidosis in the
AIDS and HIV transmission, the relevance of FGF for controlling
pathological angiogenesis as well as in the understanding of the
mechanism in carbapenem resistance.
Host-pathogen interactions and innate immunity/Chromatin
modification. We are interested in the structural biology at the
interface between human tissues and the vast microbial communities
(a) Modo de unión de inhibidores derivados de penicilin sulfonas
that inhabit us (the microbiome), with an emphasis on pathogen en el sitio activo de la β-lactamasa OXA-24. (b) Arquitectura
recognition/targeting mechanisms and the role of the innate immune molecular de la L-ascorbato-6P lactonasa Mn2+-dependiente UlaG
de E. coli a 2.6 Å de resolución mediante cristalografía de rayos-X
system. A second area of research is on multi-subunit complexes
(en cartoon; Mn2+ en violeta).
involved in chromatin modification.
(a) Binding mode of the substituted penicillin sulfone inhibitors in
Structural characterization of macromolecular assemblies involved the active site of OXA-24 β-lactamase (See Bou et al. (2010) JACS
132, 13320-13331 for details). (b) Molecular architecture of the
in transcription and DNA repair. Most essential cellular processes
E. coli L-ascorbate-6P lactonase UlaG at 2.6-Å resolution by X-ray
are carried out by multi-subunit complexes rather than individual crystallography (in cartoon; Mn2+ in violet) (See Garces et al. (2010)
proteins. Our aim is to shed light on transcription and DNA repair from J. Mol. Biol. 398, 715-729).
Publicaciones Seleccionadas and studies on W164Y, W164H, and W164S variants. J. Biol. Ständker, Frank Kirchhoff, Reinhold E. Schmidt. (2010) Short-
Selected Publications Chem. 284, 7986-7994. Term Monotherapy In Hiv-Infected Patients With A Virus
Entry Inhibitor Against The Gp41 Fusion Peptide. Science
Hernández, A., Maté, M.J., Sánchez, P., Romero, A., Rojo, F. Fernández, I.S., Cuevas, P., Angulo, J., López-Navajas, P., Canales-
Mayordomo, A., González-Corrochano, R., Lozano, R.M., Translational Medicine 2, 63re3.
and Martínez, J.L. (2009) Structural and functional analysis
Valverde, S., Jiménez-Barbero, J., Romero, A. and Giménez- Fernández-Tornero C, Böttcher B, Rashid UJ, Steuerwald
of SmeT, the represor of the Stenotrophonomas maltophilia
Gallego, G. (2010) Gentisic-acid, a compound associated with U, Flörchinger B, Devos DP, Lindner D, Müller CW. (2010)
multidrug efflux pump SmeDEF. J. Biol. Chem. 284, 14428-
plant defense and a metabolite of aspirin, heads a new class of Conformational flexibility of RNA polymerase III during
14438.
in vivo Fibroblast Growth Factor Inhibitors. J. Biol. Chem. 285, transcriptional elongation. EMBO J. 29:3762-72.
Solís, D., Romero, A., Menéndez, M., and Jiménez-Barbero, J. 11714-11729. Bou, G., Santillana, E., Sheri, A., Beceiro, A., Sampson, J., Kalp,
(2009) Protein carbohydrate-interactions: Basic concepts and
Gallego O, Betts MJ, Gvozdenovic-Jeremic J, Maeda K, Matetzki M., Bethel, C.R., Distler, A.M., Drawz, S.M., Pagadala, S.R.R., van
methods for analysis, In The Sugar Code. Fundamentals of
C, Aguilar-Gurrieri C, Beltran-Alvarez P, Bonn S, Fernández- den Akker, F., Bonomo, R.A., Romero, A. and Buynak, J.D. (2010)
Glycosciences (Gabius, H.-J. Ed.), WILEY-VCH Verlag GmbH &
Tornero C, Jensen LJ, Kuhn M, Trott J, Rybin V, Müller CW, Bork Design, Synthesis, and Crystal Structures of 6-Alkylidene-2’-
Co. KgaA.
P, Kaksonen M, Russell RB, Gavin AC. (2010) A systematic screen substituted penicillanic acid sulfones as potent inhibitors of
Stacklies, W, & Vega, MC, Wilmanns, M, and Grater, F. (2009) for protein-lipid interactions in Saccharomyces cerevisiae. Mol. Acinetobacter Baumannii OXA-24 carbapenemase. JACS 132,
Force distribution overlaps with coevolutionary network in Syst. Biol. 2010 Nov 30; 6:430. 13320-13331.
immunoglobulin. PLoS Comput. Biology 5(3), e1000396.
Wolf-Georg Forssmann, Yu-Han The, Matthias Stoll, Knut Garces, F., Fernández, F.J., Montella, C., Peña-Soler, E., Pérez-
Ruiz-Dueñas, F.J., Pogni, R., Morales, M., Giansanti, S., Mate, Adermann, Uwe Albrecht, Kleomenis Barlos, Annette Luque, R., Aguilar, J., Baldoma, L., Coll, M., Badía, J., and Vega,
M.J., Romero, A., Martínez, M.J., Basosi, R. and Martínez, Busmann, Angeles Canáles-Mayordomo, Guillermo M.C. (2010) Molecular architecture of the Mn2+ dependent
A.T. (2009) Protein radicals in fungal versatile peroxidases: Giménez-Gallego, Jochen Hirsch, Jesus Jiménez-Barbero, lactonase UlaG reveals an RNase-like metallo-β-lactamase fold
Catalytic tryptophan radical in both compound I and II Dirk Meyer-Olson, Jan Münch, Javier Pérez-Castells, Ludger and a novel quaternary structure. J. Mol. Biol. 398, 715-729.
31
 Rosa Mª Lozano Puerto
Científica Titular | rlozano@cib.csic.es
PhD, 1990.
Universidad Autónoma de Madrid.
Postdoctoral, 1991-1993.
University of California, Berkeley.
Científica Titular, 2001,
Jefa de Grupo, 2008.
CIB, CSIC.
www.cib.csic.es/en/grupo.php?idgrupo=67
Reconocimiento Célula-Biomaterial
El objetivo de nuestra investigación es estudiar la
Biología Físico-Química | Chemical & Physical Biology
interacción y el proceso de reconocimiento que
tiene lugar entre la célula y los materiales metálicos
de base magnesio en condiciones fisiológicas con
E Cell-Biomaterial Recognition
l Mg y sus aleaciones se presentan como biomateriales
biodegradables muy interesantes para reparación de tejido
óseo debido a las propiedades que presentan: sus módulos
elástico y densidad son semejantes a los del hueso, son reabsorbibles,
son ligeros, sus productos de corrosión no son tóxicos y son
excretados en la orina. Sin embargo, la principal limitación reside en
que la velocidad de degradación de éstos es mayor que la velocidad
necesaria para la regeneración del tejido lo que hace necesaria la
aplicación de métodos de protección del material. Nuestro grupo
ha abordado esta limitación mediante un tratamiento de conversión
química en ácido fluorhídrico combinado con la aplicación de
diferentes rutas de procesado del material y con la presencia de
elementos aleantes. La capa de fluoruro de magnesio que se forma
sobre la superficie del material tras el tratamiento, combinada con
el procesamiento del magnesio puro por colada así como con
la aleación AZ31 da lugar a nuevos materiales cuya cinética de
biodegradación es biocompatible con el crecimiento de células
osteoblásticas, lo que permite proponer a estos materiales como
posibles candidatos para la reparación de hueso para implantes
temporales. El análisis del perfil proteómico de células osteoblásticas
crecidas sobre las superficies de estos materiales recubiertos ha
permitido identificar proteínas que podrían ser marcadores de
biocompatibilidad osteoblástica y de regeneración ósea.
Se han diseñado nuevos materiales biomiméticos por pretratamiento
y funcionalización con distintas moléculas bioactivas para aumentar la
32
Otros miembros | Other lab members:
María Ángeles Fidalgo Fernández
Víctor Martín Honrubia
el propósito de diseñar nuevos materiales metálicos
biocompatibles con una biodegradación sincronizada
con la regeneración del tejido óseo a reparar.
biocompatibilidad y añadir actividades biológicas deseables al material
que aumentan de forma controlada la proliferación osteoblástica
necesaria para la reparación del hueso.
Proliferación de células osteoblásticas MC3T3-E1 sobre magnesio puro colado
con recubrimiento de fluoruro de magnesio (Tinción del DNA con Hoechst
33258. Imagen obtenida en el microscopio multidimensional AF6000 LX Leica).
MC3T3-E1 osteoblastic cells cultured on fluoride-coated cast magnesium (Hoechst
33258 DNA staining. Image obtained by multidimensional AF6000 LX Leica
microscopy).
Células osteoblásticas MC3T3-E1 sobre la superficie
del magnesio puro colado con recubrimiento de
fluoruro de magnesio (Imagen obtenida por SEM).
Osteoblastic cells MC3T3-E1 cultured on the surface
of the magnesium fluoride-coated cast pure
magnesium (SEM image).
Current research focuses on the study of the interaction and recognition process between cell and
biodegradable Mg-based-metallic materials in physiological conditions with the final purpose to design
new biocompatible biomaterials with a biodegradation kinetic rate similar to bone tissue regeneration.
M
g and its alloys have been considered strongly as
possible biodegradable biomaterials for bone tissue
repair because of theirs following properties: theirs
elastic modulus and density are similar to that of bone, are
reabsorbables, are lights, theirs corrosion products are not toxic
and are easily excreted in the urine. However, the principal
limitation is the fact that theirs degradation rates are greater
than the rate of tissue repair that makes necessary to apply
protection methods. Our group has approached the magnesium
limitation by chemical conversion treatment in hydrofluoric
acid of the metallic surface combining this with manufacturing
process and with the presence of alloying elements. Using this
experimental approximation, our results have revealed that
magnesium fluoride-coated cast pure magnesium and AZ31
alloy have shown a good osteoblastic biocompatibility and a
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Lozano, R.M. (2010) Diseño de Superficies Citomiméticas para
Ingeniería de Tejidos. Acta Científica y Tecnológica 16, 34-38.
García-Fernández, L., Aguilar, MR, Fernández MM, Lozano
R.M., Giménez-Gallego, G. and San Román J. (2010) “Structure,
morphology and bioactivity of biocompatible systems derived
from functionalized acrylic polymers based on 5-amino-2-
naphthalene sulfonic acid”. Biomacromolecules 11, 1763-1772.
Sánchez-Fernández, I., Cuevas, P., Angulo, J., López-Navajas,
P., Canales-Mayordomo, A., González-Corrochano, R.,
Lozano, R.M., Valverde, S., Jiménez-Barbero, J., Romero, A.
and Giménez-Gallego G. (2010) “Gentisic acid, a compound
associated with plant defense and a metabolite of aspirin,
heads a new class of in vivo fibroblast growth factor
inhibitors”. J. Biol. Chem. 285, 11714-11729.
García-Fernández, L., Aguilar, MR, Fernández MM, Lozano R.M.,
biodegradation kinetic compatible with cell culture, making
both materials as promising candidates for biodegradable
temporary implants for bone repair. In our aim to
understand the mechanism of cell/biomaterial interaction,
protein expression profile of osteoblastic cells cultured
on these coated magnesium-based materials has been
analyzed and some protein-markers have been identified
that could indicate osteoblastic biocompatibility and
bone regeneration.
Some advances has been done in the development
of new biomimetic materials by pretreatment and
functionalization with different bioactive molecules to
increase biocompatibility and to add new biological
properties to material in order to increase a controlled
cell stimulation for tissue repair.
Giménez, G. and San Román J. (2010) “Antimitogenic polymer
drugs based on AMPS: microstructure-bioactivity relationship
of water soluble macromolecules”. Biomacromolecules 11,
626-634.
Feito, M.J., Lozano, R.M., Alcalde, M., Ramírez-Santillán,
C., Arcos, D., Vallet-Regí, M. and Portolés, M.T. (2010)
“Immobilization and bioactivity evaluation of FGF-1 and
FGF-2 on powdered silicon-doped hydroxyapatite and their
scaffolds for bone tissue engineering”. J.Mater. Sci: Mater.
Med. DOI: 10.1007/s10856-010-4193-3
Feito, M.J, Jiménez, M., Fernández-Cabrera, C., Rivas, G.,
Giménez-Gallego, G and Lozano R.M. (2010) “Strategy for
fluorescent labeling of human aFGF without impairment of
its mitogenic activity: A bonafide tracer”. Anal. Biochem. DOI:
10.1016/j.ab2010.12.029.
33
 Structural Biophysics
iología
B físico Physical
grupo emergente

&
Eva de Alba
Científica Titular | dealbae@cib.csic.es
Doctora en CC. Químicas, 1997.
of Cell Death
Chemicalquímica
CSIC-Universidad Complutense.
Postdoctorado, 1998-2002.
National Institutes of Health. Maryland-USA.

Biology
Staff Scientist, 2002-2007. In the Laboratory of Cell Death Biophysics
National Institutes of Health. Maryland-USA. we aim at gaining an in-depth
Científica Titular, 2009.
CIB-CSIC. understanding on the molecular bases
of programmed cell death using an
Otros miembros | Other lab members:
approach based on Structural Biology
Susana Barrera Vilarmau
Patricia Obregón Calderón and Biophysics.
Clara María Santiveri Martín Varés

T
www.cib.csic.es/Cell_Death_Biophysics his cellular process, also known as apoptosis,
induces unwanted or damaged cells to commit

Biofísica y Biología Estructural suicide and is thus essential for the correct
development of multi-cellular organisms. As a result,

de la Muerte Celular the dysfunction of apoptotic pathways derives in

several pathologies including cancer, autoimmune
Biología Físico-Química | Chemical & Physical Biology

and neurodegenerative disorders.

Apoptosis es una forma de muerte celular que induce la Apoptotic mechanisms are significantly intricate
destrucción de células dañadas o enfermas. Al ser un proceso with several molecular cascades activated by
either internal or external stimuli. Different protein
esencial para el funcionamiento adecuado de los organismos
families are involved by performing a large variety
multicelulares, su disfunción da lugar a graves enfermedades como of functions such as protein-protein interaction
el cáncer y las enfermedades neurodegenerativas y autoinmunes. and oligomerization, protein and DNA cleavage,
membrane interaction and permeabilization.

E
stímulos internos o externos activan los eventos apoptóticos que derivarán
en la muerte celular. Nuestro laboratorio pretende entender en
profundidad las bases moleculares de estos mecanismos utilizando
un abordaje estructural y biofísico, con el objetivo de ayudar al diseño de
estrategias clínicas que permitan tratar enfermedades.
Los caminos apoptóticos son significativamente complejos debido a su
interrelación y al elevado número de moléculas implicadas y que desarrollan
una gran variedad de funciones, incluyendo procesos de interacción
proteína-proteína, oligomerización, degradación de proteínas y DNA, unión y
perturbación de la membrana.
En nuestro laboratorio se investigan los mecanismos apoptóticos a un nivel
atómico-molecular combinando el análisis estructural y dinámico por RMN
con otras técnicas como microscopía de fuerza atómica, dicroísmo circular,
fluorescencia, ELISA. Una característica relevante de nuestra investigación
es que los aspectos moleculares básicos en apoptosis son comunes a
muchos otros procesos celulares. Así, nuestro laboratorio estudia la estructura,
dinámica y función de proteínas multidominio, interacciones proteína-proteína,
reconocimiento, oligomerización, comportamiento conformacional heterogéneo Interacciones entre proteínas de la familia Bcl-2 y procesos de
y función de proteínas intrínsecamente desestructuradas, el plegamiento asociado oligomerización mediados por miembros de la super-familia
Death Domain.
a la unión, la interacción entre proteínas y membranas… Esta variedad estructural,
Understanding interactions within Bcl-2 family members and Death
dinámica y de función la encontramos en proteínas de las familias Death Domain y
Domain oligomerization processes.
Bcl-2, que son en la actualidad nuestros objetivos principales.

The main thrust of our laboratory is to decipher

Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
L. Sborgi, S. Barrera-Vilarmau, P. Obregón and E.
de Alba. Characterization of a novel interaction
between Bcl-2 members Diva and Harakiri.
2010. PLoS ONE. 5, e15575. DOI: 10.1371/
journal.pone.0015575.
L. Sborgi and E. de Alba. Sequence-specific
1H, 13C, and 15N resonance assignments of
Diva (Boo), an apoptosis regulator of the Bcl-2
NEW group
experimental model of primordial folding. 2009.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 106, 4127-4132.
DOI: 10.1073/pnas.0812108106.
E. de Alba. 1H, 15N, 13C backbone and side
chain chemical shifts of human ASC (Apoptosis-
associated speck-like protein containing a CARD
domain). 2007. Biomol. NMR Assign. 1, 135-
137. DOI: 10.1007/s12104-007-9036-x.
E. de Alba* and N. Tjandra. On the accurate
measurement of amide one-bond 15N-1H
couplings in proteins: Effects of cross-correlated
apoptotic mechanisms at the atomic/molecular level
combining structural analysis by high-resolution
NMR with other techniques, such as atomic force
microscopy, circular dichroism, fluorescence
spectroscopy, ELISA. An additional advantage of
our research is that the basic molecular aspects
of apoptosis are common to many other cellular
processes. For instance we study multi-domain
protein structure and dynamics, protein interactions,
recognition and oligomerization, connections
between order/disorder and function in natively

family. 2010. Biomol. NMR Assign. 4, 65-8. DOI:
10.1007/s12104-010-9208-y.
E. de Alba. Structure and interdomain dynamics
of apoptosis-associated speck-like protein
containing a CARD (ASC). 2009. J. Biol.
Chem. 284, 32932-32941. DOI: 10.1074/jbc.
M109.024273.
M. Sadqi, E. de Alba, R. Pérez-Jiménez, J. M.
Sánchez-Ruiz, V. Muñoz. A designed protein as
34
relaxation, selective pulses and dynamic
frequency shifts. 2006. J. Magn. Reson. 183,
160-165. *corresponding author. DOI: 10.1016/j.
jmr.2006.08.003.
E. de Alba* and N. Tjandra. Interference between
cross-correlated relaxation and the measurement
of scalar and dipolar couplings by Quantitative J.
2006. J. Biomol. NMR. 35, 1-16. *corresponding
author. DOI: 10.1007/s10858-006-0028-4.
unfolded proteins, coupled folding and binding,
protein-membrane binding and protein membrane
structure. These diverse structural and dynamic
characteristics are found within the Death Domain
Superfamily and Bcl-2 family members, which are
currently our specific research targets.
 Biología Medioambiental
Environmental Biology
Biología Medioambiental | Environmental Biology

Julio salinas 38
Laboratorio de Biología Molecular de Plantas | Plant Molecular Biology Laboratory

angel Martínez · María jesús martínez 40

Alicia Prieto · Susana Camarero
Biotecnología para la Biomasa Lignocelulósica
Biotechnology for Lignocellulosic Biomass

josé luis garcía 42

Eduardo Díaz · Mª Auxiliadora Prieto
Biotecnología Medioambiental | Environmental Biotechnology

mª del carmen risueño · pilar sánchez-testillano 44

Desarrollo en Plantas y Arquitectura Nuclear
Plant Development and Nuclear Architecture

pedro castañera · félix ortego 46

Pedro Hernández · Gema Mª Pérez
Interacciones Planta-Insecto | Insect-Plant Interactions

Francisco javier medina 48

Nucleolo, Proliferación Celular y Microgravedad en Plantas
Plant Cell Nucleolus, Proliferation and Microgravity

Francisco Tenllado · José Ramón Díaz-Ruiz 50

Interacciones Moleculares Planta/Virus/Vector: Determinación de Rutas
Celulares Implicadas en Susceptibilidad a la Enfermedad de Virus de Plantas
Molecular Plant/Virus/Vector Interactions: Determination of Cellular Pathways
Involved in Susceptibility to Plant Viral Diseases

César Llave · Tomás Canto 52

Interacciones Moleculares Planta/Virus/Vector:
Aproximaciones Proteómicas y de Silenciamiento por RNA
Molecular Plant/Virus/Vector Interactions: Proteomic and RNA Silencing Approaches

Isabel García Luque · Mª Teresa Serra 54

Patógenesis de Virus de Plantas y Mecanismos de Resistencia en Plantas
Plant Viral Pathogenesis and Plant Defence Mechanisms

36
 Overview
Environmental Biology
The main challenge for the society in the 21st century
is to achieve a global sustainable development in an
environment exposed to the climate change threat.

I
n accordance to this challenge, the aim of our Department is to
provide a multidisciplinary entourage in which to advance the un-
derstanding of basic biological processes involved in the interac-
tions between the environment and living organisms, in particular
plants and microorganisms.  Using microorganisms, together with
biochemical and molecular approaches, we are developing differ-
ent strategies to eliminate environmental pollutants, and designing
biological procedures to produce chemicals from biomass or indus-
trial wastes in biorefineries, within a context of green or sustainable
chemistry. On the other hand, we are also studying the interac-
tions between plants and their biotic and abiotic environment by
analyzing the effects caused by climate change in order to reduce
its negative impact on agroecosystems and to develop a more
sustainable agriculture capable of ensuring food production. In
summary, the Department of Environmental Biology aims at de-
signing and implementing eco-efficient production processes
with a lower environmental impact in a development context
based on the novel concepts of biotechnology and bioeconomy.

JULIO SALINAS
Presentación

Biología Medioambiental
Department HEAD

El principal desafío que se plantea en la sociedad del siglo XXI es conseg-

uir un desarrollo sostenible del planeta en un medio ambiente sometido
a la amenza que supone el cambio climático.

D
e acuerdo con este reto, el objetivo fundamental de nuestro Departamento es proporcionar
un entorno pluridisciplinar para avanzar en el conocimiento de los procesos biológicos bási-
cos implicados en las interacciones entre el medio ambiente y los seres vivos, en particular
plantas y microorganismos. Utilizando microorganismos junto con tecnologías de biología molecu-
lar y bioquímica, estudiamos la manera de eliminar contaminantes medioambientales y diseñamos
procesos biológicos para la obtención de sustancias químicas en bio-refinerías a partir de biomasa o
de diferentes residuos industriales, dentro del marco de la química verde o sostenible. Por otro lado,
estudiamos las interacciones de las plantas con su medio ambiente, tanto biótico como abiótico,
analizando las alteraciones que causa el cambio climático con el objetivo de disminuir sus conse-
cuencias negativas en los agroecosistemas y lograr nuevos modelos de desarrollo para una agricul-
tura más sostenible que garantice la producción de alimentos. En definitiva, en el Departamento de
Biología Medioambiental pretendemos diseñar e implementar procesos productivos eco-eficientes
con el menor impacto ambiental posible en el marco de un desarrollo basado en los nuevos con-
ceptos de la biotecnología y la bioeconomía.

JULIO SALINAS
Jefe de Departamento

38 39
 Julio Salinas
Profesor de Investigación | salinas@cib.csic.es
PhD, 1983. Otros miembros | Other lab members:
Universidad Complutense de Madrid.
Postdoctoral, 1983-1986.
Institut Jacques Monod, Paris, Francia.
Javier Barrero Gil
Scientist, 1986-2006.
INIA.
Rafael Catalá Rodríguez
Visiting scientist, 1989-1991. Raúl Huertas Ruz
The Rockefeller University, New York, USA. Teresa Domínguez López
Profesor de investigación, 2006. Tamara Hernández Verdeja
CIB, CSIC.
Carlos Perea Resa

www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=62

Laboratorio de Plant Molecular Biology Laboratory

Biología Molecular de Plantas Adaptation is the way sessile organisms have to cope with adverse environmental conditions such
as extreme temperatures, water availability or salinity. In the case of plants, these abiotic stresses
Adaptarse es la manera que tienen los organismos sesiles de superar generar herramientas moleculares que are major factors that determine their natural geographical distribution and limit the productivity
Biología Medioambiental | Environmental Biology

condiciones ambientales adversas tales como temperaturas extremas, puedan ser utilizadas en programas de and quality of important crops. To adapt and survive, plants have evolved elaborate molecular
mejora. Hace algún tiempo identificamos
sequía o salinidad. En el caso de las plantas, estas condiciones programs to sense and rapidly respond to their ever changing environment. Understanding these
proteínas involucradas en señalización y
determinan su distribución geográfica y limitan la productividad y factores de transcripción que juegan un reprogramming events constitutes the subject of interest in our laboratory.
calidad de las cosechas. Para adpatarse y sobrevivir, las plantas han papel fundamental en la regulación de la

desarrollado sofisticados programas moleculares que las permiten expresión génica en respuesta a estrés. Estos
percibir y responder adecuadamente a los cambios que se producen resultados contribuyeron a comprender
en su entorno. El interés en nuestro laboratorio es comprender como se mejor como las plantas adquieren tolerancia
a estreses abióticos reprogramando la
ejecutan esos programas. expresión génica. Más recientemente, hemos
puesto de manifiesto que otros mecanismos
W
e are using Arabidopsis as a model and a combination of genetic, molecular and
biochemical approaches to look for components of signal transduction pathways Publicaciones Seleccionadas
involved in plant responses to abiotic stresses. Most of our effort focuses on the cold Selected Publications
acclimation process, an adaptive response whereby some plants from temperate regions increase
Novillo, F., Medina, J. and Salinas, J. (2007).
in freezing tolerance upon exposure to low nonfreezing temperatures. Plant responses to different Arabidopsis CBF1 and CBF3 have a different

E
stamos utilizamos Arabidopsis como
sistema modelo y una combinación
de abordajes genéticos, moleculares y
bioquímicos para identificar componentes
de las vías de señalización que median la
respuesta de las plantas a distintos tipos
de estrés abiótico. La mayor parte de
nuestro esfuerzo se centra en el proceso
de aclimatación a las temperaturas bajas,
una respuesta adaptativa mediante la
cual algunas especies incrementan su
tolerancia a las heladas después de estar
expuestas a temperaturas entre 0 y 10ºC.
Las respuestas de las plantas a estreses
abióticos como las temperaturas extremas, la
sequía y la salinidad están muy relacionadas
y comparten vías de señalización. La
identificación de intermediarios del proceso
de aclimatación, por tanto, además de
proporcionar información sobre como las
plantas integran de manera coordinada las
repuestas a distintas condiciones ambientales
adversas para desarrollarse y reproducirse,
tiene el potencial biotecnológico para
de regulación, a nivel posttranscripcional,
traduccional y posttraduccional, también
están implicados en la respuesta de las
plantas a estreses abióticos. Los resultados
sugieren que modulan finamente los niveles
y la actividad de tránscritos y proteínas ya
existentes relacionadas con la tolerancia
a situaciones ambientales adversas. En
la actualidad, nuestro primer objetivo es
identificar y caracterizar los componentes
de estos mecanismos que funcionan en
condiciones de estrés y sus moléculas diana.
abiotic stresses, including extreme temperatures, drought and salinity are related and share function than CBF2 in cold acclimation and
common signaling pathways. Therefore, the identification of signaling components mediating define different gene classes in the CBF regulon.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104: 21002-21007.
cold acclimation should provide essential information on how plants coordinately integrate
Cuevas, J.C., López-Cobollo, R. Alcazar, R., Zarza,
responses to different unfavourable environments to develop and reproduce correctly, and has the
X., Koncz, C., Altabella, T. Salinas, J., Tiburcio, A.F.
biotechnological potential to generate molecular tools to improve crop tolerance to abiotic stresses. and Ferrando, A. (2008). Putrescine is involved in
Prior work in our lab allowed to identify signaling proteins and transcription factors having a key role Arabidopsis freezing tolerance and cold acclimation
in regulating stress-induced gene expression. These findings contributed to better understand how by regulating Abscisic acid levels in response to low
plants acquire tolerance to adverse environmental conditions by reprogramming gene expression. temperature. Plant Physiol. 148: 1094-1105.
More recent data have revealed that other levels of regulation based on posttranscriptional, Schapire, A.L., Voigt, B., Jasik, J., Rosado, A., Lopez-
Cobollo, R., Menzet, D., Salinas, J., Mancuso, S.,
translational and posttranslational mechanisms are also implicated in abiotic stress responses.
Valpuesta, V., Baliska, F. and Botella, M.A. (2008).
The emerging picture is that they constitute regulatory systems to finely modulate the amount Arabidopis Synaptotagmin 1 is required for the
and activity of preexisting transcripts and proteins involved in plant tolerance to abiotic stresses. maintenance of plasma membrane integrity and
Currently, our major aim is to identify and functionally characterize the crucial components of these cell viability. Plant Cell 20: 3374-3388.
mechanisms that function under challenging environments as well as their target molecules. Rodriguez-Milla, M.A. and Salinas, J. (2009).
Prefoldins 3 and 5 play an essential role in
Arabidopsis tolerance to salt stress. Mol. Plant
Distribución tisular y localización 2: 526-534.
subcelular de la proteína RCI8 Cuevas, J.C., López-Cobollo, R. Alcazar, R., Zarza,
de Arabidopsis implicada en el X., Koncz, C., Altabella, T. Salinas, J., Tiburcio, A.F.
metabolismo de mRNAs. Imágenes
and Ferrando, A. (2009). Putrescine as a signal to
de microscopia confocal de plántulas
modulate the indispensable ABA incerase under
de Arabidopsis transformadas con
una fusión RCI8:GFP. Cotiledones e cold stress. Plant Signal Behav. 4: 219-220.
hipocotilo (panel superior), raices Catala, R. and Salinas, J. (2010). Temperature-
secundarias (panel intermedio), ápice perception, molecules and mechanisms. J. Appl.
radicular (panel inferior). Biomed. 8: 189-198.
Medina, J., Catala, R. and Salinas, J. (2011). The
CBFs: three Arabidopsis transcription factors to
cold acclimate. Plant Sci. 180: 3-11.
Alcazar, R., Cuevas, J.C., Planas, J., Zarza, X., Bortolotti,
C., Carrasco, P., Salinas, J., Tiburcio, A.F. and Altabella,
T. (2011). Integration of polyamins in the cold
acclimation response. Plant Sci. 180: 31-38.

Tissue distribution and subcellular

Mutantes de Arabidopsis afectados en el procesamiento de RNAs
mensajeros muestran alteraciones en la tolerancia a distintos tipos de
estrés abiótico. Mutantes sensibles a deshidratación (panel izquierdo), a
temperaturas bajas (panel central) y a estrés salino (panel derecho). En
todos los casos, las plantas de genotipo silvestre se presentan en la parte
izquierda de los paneles y las plantas mutantes en la parte derecha.
Arabidopsis mutants affected in mRNA processing show alterations in their localization of Arabidopsis RCI8, a protein
tolerance to different abiotic stresses. Mutants with reduced tolerance to involved in mRNA metabolism. Confocal
dehydration (left panel), chilling (central panel) and salt stress (right panel). In laser scanning micrographs of transgenic
all cases, wild-type plants are on the left part of the panels and mutants are on Arabidopsis seedlings containing
the right. a RCI8:GFP fusion. Cotyledons and
hypocotyl (upper panel), secondary roots
(intermediate panel), root tip (lower panel).

40 41
 Angel T. Martínez Ferrer María Jesús Martínez Hernández Investigadoras del equipo | Staff Scientists: Otros miembros | Other lab members:
Profesor de Investigación | atmartinez@cib.csic.es Investigadora Científica | mjmartinez@cib.csic.es
PhD, 1976. PhD, 1980.
Universidad de Navarra. Universidad Complutense de Madrid.
Alicia María Prieto Orzanco Javier Ruiz Dueñas Elda Sabino da Silva Elena Fernández Fueyo
Postdoctoral, 1977-78. Postdoctoral, 1980-1986.
CNRS, Vandoeuvre-les-Nancy, Francia. Instituto Jaime Ferrán de Microbiología, CSIC, Madrid.
Susana Camarero Fernández Miguel Jurado García-Posadas Aitor Hernández Ortega Verónica Sáez Jiménez
Centraalbureau voor Schimmelcultures, 1978-79. Científica Titular, 1986-2006.
Marta Pérez Boada Ángeles Martínez-Alcalá García Isabel Pardo
Baarn y Delft, Países Bajos. CIB, CSIC. Yuta Miki Beatriz Casas Veiga Mª Eugenia Vaquero
Científico Titular, 1981-1990, Consejo de Dirección, desde el 2006. Úrsula Fillat Davinia Salvachúa Rodríguez Jesús Gil Muñoz
Investigador Científico, 1990-2003. Círculo de Biotecnología de la Comunidad de Madrid. Craig Faulds Elvira Romero Guzmán Deborah Waters
CIB, CSIC.
Vicedirectora del CIB, desde el 2004. Leandro Papinutti Eva García Ruiz María José Tobajas
Elected member, 2000.
International Academy of Wood Sciences. Loida López Fernández Víctor Barba Cedillo

www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=3

Biotecnología para la Biomasa Lignocelulósica Biotechnology for Lignocellulosic Biomass

La lignina es un polímero aromático localizado en las
paredes celulares de las plantas, donde protege a los
polisacáridos de la degradación. Para poder utilizar la
celulosa, el mayor reservorio del carbono fijado por
Biología Medioambiental | Environmental Biology
es necesario alterar o eliminar la lignina. Entender Lignin is an aromatic polymer located in the plant cell-wall that protects polysaccharides towards
los mecanismos de transformación o degradación degradation. The use of cellulose, the main reservoir of the carbon fixed by photosynthesis, as
microbiana de este polímero, y otros compuestos a renewable industrial raw-material requires a previous modification or removal of lignin. Better
recalcitrantes, permitirá desarrollar aplicaciones understanding of the mechanisms of microbial transformation or degradation of this complex

fotosíntesis, como materia prima industrial renovable biotecnológicas para un desarrollo sostenible. polymer, and other recalcitrant compounds, will permit to develop biotechnological applications for
future sustainable development.

E
l grupo ha conseguido importantes Estos estudios se han llevado a cabo en el nuevas oxidorreductasas (peroxidasas,

T
avances en el actual conocimiento de marco de grandes proyectos nacionales lacasas y oxidasas) y estudios estructura- he group has significantly contributed to the current
la degradación fúngica de la lignina, (incluyendo un proyecto CENIT sobre función de estas enzimas; ii) caracterización understanding of the mechanisms of fungal degradation
y otros compuestos recalcitrantes. En los Bioetanol, y el proyecto BIOCAT2ndOL y aplicaciones de una nueva esterol esterasa of lignin, and other recalcitrant compounds. During
últimos años ha enfocado su actividad financiado por el PlanE) e internacionales y otras esterasas fúngicas; iii) diseño de recent years we focused our activity on different uses of plant
hacia diferentes usos de la biomasa con el (como el proyecto Biorenew sobre biocatalizadores oxidativos “a la carta” por biomass to develop sustainable environmental processes
fin de desarrollar procesos ambientalmente biocatalizadores industriales “a la carta”, diseño racional y no racional de enzimas; y iv) (“Biotechnology for new Lignocellulose Biorefineries”). These
sostenibles (“Biotecnología para las nuevas coordinado por el CIB), y otros proyectos bioetanol de segunda generación, incluyendo activities are performed from two complementary points
Biorrefinerías de la Lignocelulosa”). Estas (como los Europeos Lignodeco y Peroxicats, el pretratamiento de residuos de cereales con of view: i) basic studies on biochemical and structural-
actividades se realizan desde dos puntos de éste último también coordinado por el CIB, hongos y la búsqueda de nuevas celulasas. functional characterization of enzymes; and ii) more applied
vista complementarios: i) estudios básicos y varios proyectos Nacionales y Regionales) Todos estos estudios pretenden contribuir studies related to the use of fungi and their enzymes in
sobre caracterización bioquímica y estructura- cuyos detalles pueden encontrarse en la al uso de la biotecnología microbiana en industrial and environmental applications. These studies
función de las enzimas; y ii) estudios más página web. Durante el periodo 2009-10, los sectores químico, papelero y de los were performed in the frame of large national (like a CENIT
aplicados, relacionados con el uso de hongos el grupo ha publicado más de 40 artículos/ biocombustibles, con el fin de desarrollar project on Bioethanol, and the BIOCAT2ndOL project
y/o enzimas en diferentes aplicaciones patentes internacionales (enlaces disponibles procesos más sostenibles y respetuosos con funded by PlanE) and international projects (like the
industriales y medioambientales. desde la página web), que describen: i) el medio ambiente. Biorenew project on tailor-made industrial biocatalysts,
Plegamiento tridimensional de las variantes de las lacasas de alto coordinated by CIB) and other projects (like the European
potencial redox de Pycnoporus cinnabarinus (verde) y el basidiomiceto Lignodeco and Peroxicats, the latter also coordinated by
Publicaciones Seleccionadas P. Ferreira, F. J. Ruiz-Dueñas, A. T. Martínez, et al. 2009. Genome, transcriptome,
PM1 (magenta) obtenidas por evolución molecular dirigida, donde se CIB, and several National and Regional projects) whose
Selected Publications and secretome analysis of wood decay fungus Postia placenta supports unique
mechanisms of lignocellulose conversion. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 106 :1954-1959.
muestra la localización de los residuos mutados en las proteínas maduras.
details are available at the web-page. During the 2009-
Calero-Rueda, O., V. Barba, E. Rodriguez, F. Plou, A. T. Martínez, and M. J. Martínez. 2009. 3D-folding of the high redox potential laccase variants from Pycnoporus
Maté D, García-Burgos C, García-Ruiz E, Ballesteros A, Camarero S, Alcalde M (2010). cinnabarinus (green) and PM1 basidiomycete (magenta) engineered by 10 period, over 40 international articles/patents were
Study of a sterol esterase secreted by Ophiostoma piceae: Sequence, model and Laboratory evolution of high redox potential laccases. Chem.Biol. 17,1030-1041.
biochemical properties. Biochim. Biophys. Acta 1794:1099-1106.
directed evolution showing the localization of the mutated residues in the produced by the group (links available at the web-page)
Romero, E., P. Ferreira, A. T. Martínez, and M. J. Martínez. 2009. New oxidase from mature proteins. describing: i) new oxidoreductases (peroxidases, laccases
Cañas, A. I. and S. Camarero. 2010. Laccases and their natural mediators: biotechnological Bjerkandera arthroconidial anamorph that oxidizes both phenolic and nonphenolic
tools for sustainable eco-friendly processes. Biotechnol. Adv. 28:694-705. and oxidases) and structure-function analyses in these
benzyl alcohols. Biochim. Biophys. Acta 1794:689-697.
Jurado, M., A. Prieto, M. A. Martínez-Alcalá, A. T. Martínez, and M. J. Martínez. 2009. proteins; ii) characterization and applications of a new
Ruiz-Dueñas, F. J., R. Pogni, M. Morales, S. Giansanti, M. J. Mate, A. Romero, M. J.
Laccase detoxification of steam-exploded wheat straw for second generation sterol-esterase and other fungal esterases; iii) design
Martínez, R. Basosi, and A. T. Martínez. 2009. Protein radicals in fungal versatile
bioethanol. Bioresource Technol. 100:6378-6384. peroxidase: Catalytic tryptophan radical in both Compound I and Compound II and of tailor-made oxidative biocatalysts
Leal, J. A., Prieto, A., Bernabé, M., and Hawksworth, D. (2010). An assessment of fungal studies on W164Y, W164H and W164S variants. J. Biol. Chem. 284:7986-7994. by both rational and non-rational
wall heteromannans as a phylogenetically informative character in ascomycetes. FEMS design of enzymes; and iv) second
Microbiol.Rev. 34: 986-1014.
Patente | Patent generation bioethanol, including
Martínez, A. T., F. J. Ruiz-Dueñas, M. J. Martínez, J. C. del Río, and A. Gutiérrez. 2009. Enzymatic García, E., M. J. Martínez, F. J. Ruiz-Dueñas, A. T. Martínez, and M. Alcalde. 2010. pretreatment of cereal wastes
delignification of plant cell wall: from nature to mill. Curr. Opin. Biotechnol. 20:348-357. High redox potential peroxidases designed by directed evolution. with fungi and search for new
Martínez, D., J. Challacombe, I. Morgenstern, D. S. Hibbett, M. Schmoll, C. P. Kubicek, Patent WO/2010/130862.
cellulases. The aim of the above
studies is promoting the use
of microbial biotechnology,
by the chemical, paper and
biofuel industries, to develop
more sustainable and
environmentally-friendly
bioprocesses.

Esquema de la producción de bioetanol de segunda

generación (2G) a partir de paja de trigo.
Secheme showing the production of second generation
(2G) bioethanol from wheat straw.

42 43

José Luis García López
Profesor de Investigación | jlgarcia@cib.csic.es
Licenciado Farmacia, 1978,
Doctor CC. Químicas, 1980,
Profesor no numerario, 1978.
Universidad Complutense de Madrid.
Posdoctoral, 1982. Antibióticos S.A.
y University of Stony Brook New York, USA.
Científico Titular, 1986,
Investigador Científico, 1990,
Profesor de Investigación, 2001,
Subdirector General de Programación
Científica, 2003, CSIC.
Presidente, 2006, Sociedad Española de
Biotecnología.
Representante Español, 2007, IDEAS-ERC
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=11
Investigadores del equipo | Staff Scientists:
Eduardo Díaz Fernández
Otros miembros | Other lab members:
Manuel Carmona Pérez
Beatriz Galán Sicilia
Mª Teresa Zamarro Molina
María del Valle Morales Ruiz
Ana Valencia Hernando
Javier García Hidalgo
Laura Isabel De Eugenio Martínez
Gonzalo Durante Rodríguez
Isabel Fernández Escapa
Javier Fernández Juárez
Esther García Fernández
Esquema del circuito regulador que controla
la expresión de los genes bzd involucrados
en la degradación anaeróbica de benzoato
María Auxiliadora Prieto Jiménez
en Azoarcus sp. CIB. Además del circuito de
regulación específica mediada por el sistema
regulador benzoil-CoA (inductor)/BzdR (represor
Virginia Martínez López transcripcional), el promotor catabólico Pn está
Juan Nogales Enrique sujeto a una regulación cruzada por el represor
BoxR, así como a una represión catabólica y a un
Iria Uhía Castro
control por oxígeno que dependen del sistema
Jonathan Andrés Valderrama Traslaviña de dos componentes AccSR y del activador
Blas Blázquez Castiñeira AcpR, respectivamente.
Julio Miguel Rubio Aranda
Nina Dinjaski Scheme of the global regulatory circuit that
Loreine Joselyn Agulló Carvajal controls expression of the bzd genes involved in
Julia García Fernández the anaerobic degradation of benzoate in Azoarcus
sp. CIB. In addition to the specific regulation
Zaira Martín Moldes carried out by the benzoyl-CoA (inducer)/BzdR
Carmen Felpeto Santero (transcriptional regulator) regulatory system, the
Pn catabolic promoter is under cross- regulation
by the BoxR repressor, and is also under carbon
catabolite repression and oxygen control by the
two-component regulatory AccSR system and the
AcpR activator, respectively.

Environmental Biotechnology
Biología Medioambiental | Environmental Biology

The Environmental Biotechnology group was created to investigate the ability of bacteria both for
degrading pollutants and for synthesizing bio-sustainable chemical compounds (e. g., biopolymers
Biotecnología Medioambiental Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
and biofuels), thereby reducing the environmental impact generated by human activity. We have
made pioneering research on characterizing the degradative pathways of aromatic compounds
El grupo de Biotecnología Medioambiental fue creado con el Nogales J, Canales A, Jiménez-Barbero J, Serra B, Pingarrón by analyzing their genes, their enzymes and their regulation. Other biotransformation processes
JM, García JL, Díaz E [2011] Unravelling the gallic acid
objetivo de investigar sobre la capacidad de las bacterias tanto degradation pathway in bacteria: the gal cluster from
such as biodesulfurization, or hydrolysis of beta-lactam compounds and carbohydrates are also
para degradar contaminantes como para sintetizar compuestos Pseudomonas putida. Mol Microbiol 79: 359-374. targets of our research activities.
químicos biosostenibles (e. g., biopolímeros o biocarburantes), Galán B, De Eugenio, LI, Escapa IF, Maestro B, Sanz JM,

García JL, Prieto MA [2011] Nucleoide associated PhaF
contribuyendo así a reducir el impacto medioambiental que genera phasin drives intracellular location and segregation of poly-
la actividad humana. Estamos realizando investigaciones pioneras hydroxyalkanoate granules in Pseudomonas putida KT2442.
Mol Microbiol 79: 402–418.
sobre la caracterización de las rutas de degradación de compuestos
De Eugenio LI, Galan B, Escapa IF, Maestro B, Sanz JM, Garcia JL,
aromáticos analizando sus genes, sus enzimas y su regulación. Prieto MA [2010] The PhaD regulator controls the simultaneous
Otros procesos de biotransformación como la biodesulfuración, o la expression of the pha genes involved in polyhydroxyalkanoate
metabolism and turnover in Pseudomonas putida KT2442.
hidrólisis de compuestos beta-lactámicos y de hidratos de carbono
Environ Microbiol 12:1591-1603.
son también objetivos de nuestra investigación.
Durante-Rodríguez G, Mancheño JM, Rivas G, Alfonso C,
Arias-Palomo E, Llorca O, García JL, Díaz E, Carmona M
T
he analysis of the aerobic and anaerobic catabolism of
pollutants (e. g., aromatic compounds and steroids) in
model organisms such as Escherichia coli, Pseudomonas
putida, Mycobacterium smegmatis or Azoarcus sp. strain CIB
is one of our main research activities. To remediate more
efficiently the polluted environments we develop new bacteria,
by manipulating their genes/pathways through genetic
and metabolic engineering. We devote special attention,
at both genetic and biochemical levels, to the anaerobic
bioplastics (polyhydroxyalkanoates) by using different
metabolic engineering approaches. By exploiting the
new tools of genomics and Systems Biology we are
deciphering the complexity of the metabolic processes
to increase the production efficiency of the model
strains. We are reprogramming cell metabolism for
environmental purposes by constructing artificial
genetic regulatory circuits. In order to isolate new genes
and enzymes useful for different biotechnological

E
l análisis del catabolismo aeróbico
y anaeróbico de contaminantes
(e. g., compuestos aromáticos
y esteroides) en organismos modelo
como Escherichia coli, Pseudomonas
putida, Mycobacterium smegmatis
y Azoarcus sp. cepa CIB, es una de
nuestras tareas de investigación
más importantes. Para remediar de
manera más eficiente los ambientes
contaminados desarrollamos nuevas
bacterias, mediante la manipulación de
sus genes/rutas por ingeniería genética
y metabólica. Estamos dedicando
especial atención al catabolismo
anaeróbico de compuestos aromáticos
en Azoarcus tanto a nivel genético como
bioquímico. Nuestro conocimiento
del metabolismo bacteriano es útil
también para el diseño de procesos
industriales de biotransformación para
producir productos químicos verdes,
como intermedios farmacéuticos,
biopolímeros, biocarburantes, etc. Con
este propósito tenemos en curso la
secuenciación, anotación y el análisis
funcional del genoma completo de
Azoarcus sp. CIB. En este sentido, también
estamos aprovechando nuestra gran
experiencia en la manipulación de P.
putida para producir nuevos bioplásticos
funcionalizados (polihidroxialcanoatos)
mediante diferentes enfoques de
ingeniería metabólica. Mediante las
nuevas herramientas genómicas y la
Biología de Sistemas estamos tratando
de descifrar la complejidad de estos
procesos a fin de aumentar la eficiencia
de la producción en las bacterias modelo.
Con fines medioambientales estamos
reprogramando el metabolismo celular
para construir circuitos artificiales
de regulación genética. Para aislar
nuevos genes y enzimas útiles para
diferentes aplicaciones biotecnológicas
exploramos la diversidad bacteriana
utilizando las tecnologías de la
metagenómica. La colaboración con
empresas biotecnológicas en el campo
de los bioplásticos, biocarburantes, la
biocatálisis/biotransformación (Química
Sostenible) facilita la puesta en práctica
de nuestros estudios para contribuir a la
sostenibilidad del planeta.
[2010] Biochemical characterization of the transcriptional
regulator BzdR from Azoarcus sp. CIB. J Biol Chem 285:
35694-35705.
Juárez JF, Zamarro MT, Barragán MJL, Blázquez B, Boll M,
Kuntze K, García JL, Díaz E, Carmona M [2010] Identification
of the Geobacter metallireducens BamVW two-component
system, involved in transcriptional regulation of aromatic
degradation. Appl Environ Microbiol 76: 383-385.
de Eugenio LI, Escapa IF, Morales V, Dinjaski N, Galán B,
García JL, Prieto MA [2010] The turnover of medium-chain
length polyhydroxyalkanoates in Pseudomonas putida
KT2442 and the fundamental role of PhaZ depolymerase for
the metabolic balance. Environ Microbiol 12: 207-221.
Sierra C, Elvira L, García, J L, Resa P, Galán B [2010]
Monitoring Escherichia coli growth in M63 media by
ultrasonic noninvasive methods and correlation with
spectrophotometric and HPLC techniques. Appl Microbiol
Biotechnol 85:813-821.
Manso I, Torres B, Andreu JM, Menéndez M, Rivas
G, Alfonso C, Díaz E, García JL, Galán B [2009]
3-Hydroxyphenylpropionate and phenylpropionate are
synergistic activators of the MhpR transcriptional regulator
from Escherichia coli. J Biol Chem 284:21218-21228.
Calzada J, Zamarro MT, Alcón A, Santos VE, Díaz E, García JL,
García-Ochoa F [2009] Analysis of the dibenzothiophene
desulfurization in a recombinant Pseudomonas putida
strain. Appl Environ Microbiol 75: 875-877.
Carmona M, Zamarro MT, Blázquez B, Durante-Rodríguez G,
Juárez JF, Valderrama JA, Barragán MJL, García JL, Díaz E [2009]
The anaerobic catabolism of aromatic compounds: a genetic
and genomic view. Microbiol Mol Biol Rev 73: 71-133.
catabolism of aromatics in Azoarcus. Our knowledge of applications we are exploring the bacterial diversity
bacterial metabolism is also very useful to design industrial by metagenomic technologies. By collaborating with
biotransformation processes for producing green chemicals biotechnological companies in the field of bioplastics,
such as pharmaceutical intermediates, biopolymers, fuels, etc. biofuels, biocatalysis/biotransformation (Sustainable
In this sense, we are taking advantage of our large experience Chemistry) we are paving the way for our future
on the manipulation of P. putida to produce new functionalized contributions to planet sustainability.
Uno de nuestros objetivos fundamentales es estudiar y
mejorar la producción de polihidroxialcanoatos (PHA).
Localización in vivo mediante microscopia confocal del
dominio C-terminal de PhaF (verde), los gránulos de
PHA (rojo) y nucleoide (azul) en la cepa salvaje P. putida
KT2442 y su mutante PhaF defectivo. (A-D). Células de
la cepa salvaje (A, B) y mutante PhaF (C, D) obtenidas
de cultivos en LB que expresan la proteína de fusión
GFP::C-PhaF; GFP (A, C), DAPI (B, D). (E-J). Las células de
la cepa salvaje (E-G) y mutante PhaF (H-J) cultivadas en
condiciones de producción de gránulos de PHA que
expresan la proteína de fusión GFP::C-PhaF; GFP (E, H),
DAPI (F, I) y Rojo Nilo (G, J).
One of our major aims is to study and develop the
production of polyhydroxyalkanoates (PHAs). In vivo
localization of the C-terminal domain of PhaF (green),
PHA granules (red) and nucleoid (blue) in the wild type
strain P. putida KT2442 and its PhaF minus mutant (A-D).
Cells of wild type (A, B) and PhaF mutant (C, D) grown
overnight in LB expressing GFP::C-PhaF fusion protein:
GFP (A, C), DAPI (B, D). (E-J). Cells of wild type (E-G) and
PhaF mutant (H-J) grown in PHA granule producing
conditions expressing GFP::C-PhaF fusion protein; GFP (E,
H), DAPI (F, I) and Nile Red (G, J).

44 45
 María del Carmen Risueño Almeida Pilar Sánchez-Testillano Otros miembros | Other lab members: www.cib.csic.es/es/grupo_publicaciones.php?idgrupo=33
Profesora de Investigación | risueno@cib.csic.es Investigadora Científica | testillano@cib.csic.es
PhD, 1967. PhD, 1991.
Universidad Complutense de Madrid. Universidad Complutense de Madrid.
María Rodríguez Serrano
Postdoctoral, Postdoctoral,
Universidad de Marseille-Luminy, CNRS/INSERM, CNRS, Villejuif, Francia y CSHL, NY, USA.
Deepak Prem
Villejuif, Francia, DKFZ, Heildelberg, Alemania.
Científica Titular, 1996,
Ivett Bárány
Científica Titular, 1968, Investigadora Científica, 2008. Mohammad Faisal
Jefa de grupo CIB, 1979, CIB,CSIC. María Teresa Solís
Investigadora Científica, 1988,
Profesora de Investigación, 2002. Héctor Rodríguez Sanz
CIB, CSIC. Ahmed-Abdalla El-Tantawy
Elena Casado

Desarrollo en Plantas y Arquitectura Nuclear Plant Development and Nuclear Architecture

La reprogramación celular hacia embriogénesis más eficiente en agricultura sostenible, selección The stress-induced cell reprogramming towards embryogenesis of the pollen is a powerful
inducida por estrés en el polen es una potente y conservación de recursos forestales y control biotechnological tool for plant breeding, as the fastest way for rapid generation of new varieties
herramienta biotecnológica en mejora vegetal para ambiental. También estudiamos nuevas posibilidades through double haploid plants. The characterization of its regulating mechanisms (genetic,
Biología Medioambiental | Environmental Biology

generación rápida de nuevas variedades mediante para el tratamiento de fitopatologías mediante epigenetic, molecular, cellular) will permit to exploit the process more efficiently for sustainable
plantas doble-haploides. La caracterización de sus nanotecnología, usando nanopartículas magnéticas y agriculture, selection of forest resources and environment control. Also, we are studying new
mecanismos reguladores (genéticos, epigenéticos, “Quantum Dots” para diagnóstico y tratamientos con possibilities for the treatment of phytopathologies with nanobiotechnology approaches, by using
moleculares y celulares) permitirá su explotación mínimas dosis. magnetic nanoparticles and Quantum Dots for diagnosis and treatments with minimum doses.

R S
eprogramación del polen a
embriogénesis inducida por estrés
para mejora vegetal: fisiología y
epigenética.
Analizamos los mecanismos que controlan
la reprogramación y adquisición de
competencia embriogénica del polen
mediante un estudio multidisciplinar
e integrado de la fisiología de sucesos
clave que limitan la eficiencia y correcta
progresión del proceso en diferentes
etapas, empleando especies herbáceas
modelo y plantas de interés agroforestal
(hortícolas, cereales, árboles frutales y
forestales). Nuestros principales objetivos
son: a) Análisis de la respuesta al estrés, en
relación al estrés oxidativo y muerte celular
programada, b) Búsqueda e identificación
de marcadores moleculares de competencia
embriogénica, especialmente de núcleo y
de pared celular, c) Análisis transcriptómico
y caracterización de genes implicados,
d) Dinámica de marcas epigenéticas y
patrones de organización nuclear, e)
Identificación de factores reguladores
endógenos y exógenos, f ) Desarrollo y
caracterización de nuevos sistemas in vitro
de embriogénesis de polen en especies
de interés (árboles frutales y forestales), g)
Desarrollo y puesta a punto de técnicas
de identificación molecular in situ y
microscopía correlativa.
Nanopartículas (NPs) para diagnóstico y
tratamiento de fitopatologías:
Estudiamos los mecanismos de
internalización y transporte de NPs
magnéticas y Quantum Dots (QDs) in planta,
su posible citotoxicidad y el potencial de
adquisición de NPs y QDs por la planta.
También analizamos cómo cambia la
dinámica de entrada y movilización de
NPs cuando se unen a biomacromoléculas
marcadoras de patógenos (para diagnóstico)
o a herbicidas, fertilizantes y pesticidas (como
sistemas de liberación controlada para
tratamientos). Empleamos Medicago, como
modelo, y diferentes plantas cultivadas como
calabaza, guisante, tomate, girasol y trigo
tress-induced pollen reprogramming to
embryogenesis: biotechnology tool for plant
breeding: Physiology and epigenetics.
We analyze the mechanisms that control the
reprogramming and embryogenic competence acquisition
of the pollen through a multidisciplinary and integrative
study of the physiology of key events that limit the
efficiency and correct progression of the process at different
stages. We use model herbaceous species and plants of
agroforest interest (horticultural, cereals, fruit and forest
trees). Our main objectives are: a) Analysis of the stress
response, related to oxidative stress and programmed cell
death, b) Search and identification of molecular markers
of embryogenic competence, specially in the cell nucleus
and cell wall, c) Transcriptomic analysis and characterization
of involved genes, d) Dynamics of epigenetics marks
and patterns of nuclear organization, e) Identification
of endogenous and exogenous regulating factors, f )
Development and characterization of new in vitro systems
of pollen embryogenesis in interesting species (fruit and
forest trees), g) Development and set up of techniques for
in situ molecular identification and correlative microscopy.
Nanoparticles (NPs) for diagnosis and treatments in crop
protection:
We study the mechanisms of internalization and transport
in planta of magnetic NPs and Quantum Dots (QDs), as
well as their possible cytotoxicity, and the potential uptake
of NPs and QDs by the plant. Moreover, we analyze how
the dynamics of NPs entrance and movility changes when
NPs are functionalized with biomacromolecules that label
pathogens (for diagnosis) or with herbicides, fertilizers
and pesticids (as controlled delivery systems for plant
treatments). We use Medicago, as model, and different
crops like pumpkin, pea, tomate, sunflower and wheat.

Penetración de nanopartículas magnéticas de Fe-C en células de raíz de tomate
a través de la pared celular (W) visualizadas en microscopía electrónica de
transmisión. V: vacuola, Ct: Citoplasma, Ex: espacio extracelular.
Penetration of Fe-C magnetic nanoparticles in tomato root cells through the cell
wall (W), as seen by transmission electron microscopy. V: vacuole, Ct: Cytoplasms, Ex:
Extracellular space.
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications Bárány I, Fadón B, Risueño MC, Testillano PS. (2010) Microspore
reprogramming to embryogenesis induces changes in cell wall
Corredor E, Testillano PS, Coronado MJ, González-Melendi P, Fernández-Pacheco R, and starch accumulation dynamics associated with proliferation
Marquina C, Ibarra MR, De La Fuente JM, Rubiales D, Pérez-De-Luque A, Risueño MC. and differentiation events. Plant Signalling and Behavior, 5 (4),
(2009) Penetration and transport of nanoparticles in living plants as a tool for directed 341-345.
delivery: in situ detection into plant cells. BMC Plant Biology, 9: 45. Germanà MA, Chiancone B, Padoan D, Bárány I, Risueño MC,
Rodríguez-Serrano M, Romero-Puertas MC, Testillano PS, Risueño MC, Del Río LA, Testillano PS. (2010). Induction of pollen embryogenesis in seven
Expresión in situ de
Sandalio LM. (2009) Reactive oxygen species, nitric oxide and calcium, cross-talk cultivars of Prunus armeniaca l. Acta Hort. 862:273-278.
Pectin Metil Esterasa,
in the cellular response against cadmium toxicity. Plant Physiol. 150: 229-243. Corredor E, Risueño MC, Testillano PS. (2010) Carbon-iron BnPME1, en cotiledón
Seleccionada foto de portada. magnetic nanoparticles for agronomic use in plants, promising de embrión derivado de
Meijón M, Valledor L, Santamaría E, Testillano PS, Risueño MC, Rodríguez R, Feito I, but still a long way to go. Plant Signaling and Behavior 5 (10), polen de Brassica napus,
Cañal MJ. (2009) Epigenetic characterization of the vegetative and floral stages of 1295-1297. colza, mediante FISH y
azalea buds: dynamics of DNA methylation and histone H4 acetylation. J. Plant análisis confocal. Señal
Seguí-Simarro JM, Corral-Martínez P, Corredor E, Raska I, Testillano
Physiol. 166, 1624-1636. de hibridación en verde y
PS, Risueño MC. (2010) A change of developmental program
núcleos (DAPI) en azul.
Bárány I, Fadón B, Risueño MC, Testillano PS. (2010) Cell wall components and pectin induces the remodeling of the interchromatin domain during
esterification levels as markers of proliferation and differentiation events during microspore embryogenesis in Brassica napus L. J Plant Physiol. In situ expression of Pectin
Methyl Esterase, BnPME1, in
pollen development and embryogenesis. J. Exp. Bot. 61, 1159-1175. DOI: 0.1016/j.jplph.2010.10.014.
cotyledon of pollen-derived
Testillano PS, Coronado MJ, Thierry AM, Matthys-Rochon E, Risueño MC. (2010) In situ Germanà MA, Chiancone B, Padoan D, Bárány I, Risueño MC, embryo of Brassica napus, by
detection of Esr protein secretion during maize microspore embryogenesis and their Testillano PS. (2010) First stages of microspore reprogramming FISH and confocal analysis.
secretion blockage show effects on the culture progression. Funct. Plant Biol. 37, to embryogenesis through anther culture in Prunus armeniaca L. Hybridization signal in green
985-994. Env. Exp. Bot. DOI: 10.1016/j.envexpbot.2010.11.011. and nuclei (DAPI) in blue.

46 47
 Pedro Castañera Félix Ortego Otros miembros | Other lab members:
Profesor de Investigación | castan@cib.csic.es Investigador Científico | ortego@cib.csic.es Investigadores del equipo | Staff Scientists:
M.Sc. Entomology, 1977. PhD Entomology, 1993.
University of London, UK. University of Arizona, Tucson, USA.
Pedro Hernández Crespo Matías García García María Arias Martín Joel González Cabrera
PhD Ingeniero Agrónomo, 1981. Postdoctoral, 1994-1997,
Universidad Politécnica de Madrid. Científico Titular, 1997, Gema María Pérez Farinós Amelia Cervera Olaguer María Luisa Ruiz Serra Victoria San Andrés
Profesor de Investigación, 1989, CIB, CSIC.
Investigador Científico, 2003, Francisco Couso Ferrer Beatriz Beroiz Remírez Natalia A. Perera González
Vicedirector, 2008-2009. César Monzó Ferrer Ángel Luis Garvía Rodríguez Nuria Arranz de Pablo
Visiting professor, 1992-1993. CIB, CSIC.
Cornell University, Ithaca, USA. Rabeh Arouri Carolina Navas Jiménez Laura Carrillo Gil
Vocal Comisión de Ciencias Agrarias, desde 2008.
Coordinador Científico Técnico del Área de CSIC. Noureddin Bouayad Olga Claudia Sáenz Bocanegra
Ciencias Agrarias, 1991-1992,
Vocal Comisión de Ciencias Agrarias, 1993-2004.
CSIC.
Vicedirector, 2002-2008.
CIB, CSIC.
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=36

Interacciones Planta-Insecto
El objetivo del grupo, atendiendo a los retos planteados y la calidad ambiental. Otro objetivo significativo es
a la producción agrícola por la globalización y el cambio facilitar a las administraciones públicas y empresas las
Biología Medioambiental | Environmental Biology

climático, es aportar conocimiento para desarrollar herramientas necesarias para evaluar los potenciales
nuevas estrategias en el control integrado de plagas impactos ecológicos derivados de la implantación de
que contribuyan a incrementar la seguridad alimentaria nuevos cultivos.

L Insect-Plant Interactions
as líneas de trabajo en curso son: a)
El desarrollo de nuevas estrategias
para el control de plagas
agrícolas; b) La evaluación del posible
impacto ambiental de cultivos The aim of the group, on line with the new agricultural challenges related to globalization and
transgénicos; y c) La detección y
climatic change, is to supply scientific knowledge to develop new pest control strategies, which
manejo de resistencia a insecticidas.
Dentro de la primera, realizamos
would contribute to increase food security and environmental quality. Another important goal
estudios sobre la fisiología digestiva Artrópodos epígeos recogidos en campos de maíz. Adulto de Pardosa occidentalis is to assist public administration and stakeholders by developing the biotechnological tools
de plagas de importancia económica (Araneae: Lycosidae) y de Poecilus cupreus (Coleoptera: Carabidae). required to assess the potential ecological impacts derived from the deployment of new crops.
y de insectos beneficiosos, con el objeto Ground dwelling arthropods collected in maize crops. Adults of Pardosa occidentalis
(Araneae: Lycosidae) and Poecilus cupreus (Coleoptera: Carabidae).

O
de desarrollar herramientas de control
ur current research is focused along three lines: Monitoring of insect resistance to Bt maize is essential
basadas en proteínas insecticidas. Desde el
“New strategies for pest control”; “Environmental for early detection of control failures and the rapid
inicio del cultivo del maíz transgénico (maíz seguimiento de la resistencia de taladros al conocimiento para el desarrollo de técnicas
risk assessment of transgenic plants”; and implementation of resistance management strategies.
Bt) en España realizamos el seguimiento maíz Bt. Por otra parte, estamos evaluando, de detección precoz de la resistencia que
“Detection and management of insecticide resistance”. Our expertise in this field makes us one of the reference
de su potencial impacto ambiental. El en un escenario real, los efectos a medio permitan orientar la decisión de tratamiento
In reference to the first of these, we study the digestive laboratories in Europe for resistance monitoring of
seguimiento de la resistencia de plagas y largo plazo del cultivo continuado del en campo y la selección del insecticida más
physiology of economically important insect pests corn borers to Bt maize. In addition, we evaluate,
diana al maíz Bt es fundamental para una maíz Bt sobre la fauna auxiliar, habiendo apropiado. Hemos descrito el primer caso
and beneficial insects. Our aim is to develop control under real scenario conditions, the medium and long
detección precoz de la misma y planear de contribuido a establecer las especies de de resistencia a malatión en poblaciones
strategies based on insecticidal proteins. Coincident term effects of the continuous cultivation of Bt maize
forma rápida el manejo adecuado. Nuestras depredadores indicadoras para la evaluación de campo de C. capitata, determinado el
with the beginning of the commercial cultivation of on natural enemies, contributing also to establish the
aportaciones nos acreditan como uno de los de riesgos ambientales. Los trabajos sobre mecanismo de resistencia y desarrollado un
transgenic maize (Bt maize) in Spain, we participate in use of some predator species as suitable indicators
laboratorios de referencia en Europa para el resistencia a insecticidas pretenden generar sistema de detección del alelo de resistencia.
the assessment of its potential environmental impacts. for environmental risk assessment. Our work on
insecticide resistance mainly aims to establish the
basis to develop early detection techniques for
Publicaciones Seleccionadas insecticide resistance that may orientate decisions
Selected Publications on field treatments and the selection of the most
useful insecticides. Thus far, we have reported
Sánchez-Ramos, I. and Castañera, P. (2009). Chemical and physical methods for the Revuelta, L., Piulachs, M.D., Bellés, X., Castañera, P., Ortego, F., Díaz-Ruíz, J.R., Hernández-
the first case of malathion resistance in field
control of the mite Acarus farris on Cabrales cheese. J. Stored Prod. Res. 45, 61-66. Crespo, P. and Tenllado, F. 2009. RNAi of ace1 and ace2 in Blattella germanica reveals
their differential contribution to acetylcholinesterase activity and sensitivity to populations of C. capitata, the mechanism
Urbaneja, A., Chueca, P., Monton, H., Pascual-Ruiz, S., Pina, T., Vanaclocha, P., Abad, R.,
insecticides. Insect Biochem. Mol. Biol. 39, 913-919. of resistance and developed a method to
Pina, T., and Castañera, P. (2009). Chemical alternatives to malathion for controlling
Ceratitis capitata, and their side-effects on natural enemies in Spanish citrus orchards. García, M., Ortego, F., Castañera, P. and Farinós, G.P. (2010). Effects of exposure to the detect the resistance allele.
J. Econ. Entomol. 102, 144-151. toxin Cry1Ab through Bt maize fed-prey on the performance and digestive physiology
Pascual-Ruiz, S., Carrillo, L., Álvarez-Alfageme, F., Ruíz, M., Castañera, P. and Ortego, F of the predatory rove beetle Atheta coriaria. Biological Control 55, 225-233.
(2009). The effects of different prey regimes on the proteolytic digestion of nymphs of Perry, J.N., Devos, Y., Arpaia, S., Bartsch, D., Gathmann, A., Hails, R.S., Kiss, J., Lheureux,
the spined soldier bug, Podisus maculiventris (Hemiptera: Pentatomidae). Bull. Entomol. K., Manachini, B., Mestdagh, S., Neemann, G., Ortego, F., Schiemann J. and Sweet, J.B.
Res. 99, 487-491. (2010). A mathematical model of exposure of non-target Lepidoptera to Bt-maize
Álvarez-Alfageme, F., Ortego, F., and Castañera, P. (2009). Bt maize fed-prey mediated pollen expressing Cry1Ab within Europe. Proc. Roy. Soc. B 277, 1417-1425.
effect on fitness and digestive physiology of the ground predator Poecilus cupreus L. Monzó, C., Sabater-Muñoz, B., Urbaneja, A., and Castañera, P. (2010). Tracking medfly
(Coleoptera: Carabidae). J. Insect Physiol. 55, 143-149. predation by the wolf spider, Pardosa cribata Simon, in citrus orchards using PCR-based
gut-content analysis. Bull. Entomol. Res. 100, 145-152. Mosca mediterránea de la fruta, Ceratitis
San Andrés, V., Pérez-Panadés, J., Carbonell, E., Castañera. P., and Urbaneja. A. (2009).
capitata, ovipositando en melocotón.
Effects of post-teneral nutrition and ginger root oil exposure on longevity and Vidal-Quist, J.C., Castañera, P. and González-Cabrera, J. (2010). Cyt1Aa protein from
attraction to bait treatments of sterile male Ceratitis capitata (Diptera: Tephritidae). Bacillus thuringiensis (Berliner) serovar israelensis is active against the Mediterranean Mediterranean fruit flies, Ceratitis capitata,
Entomol. Exp. Appl. 132, 256­263. fruit fly, Ceratitis capitata (Wiedemann). Pest Manag. Sci. 66, 949–955. ovipositing on peach fruit.

48 49
 Francisco Javier Medina Díaz
Investigador cientifico | fjmedina@cib.csic.es
Licenciado en Ciencias, 1974.
Universidad Complutense de Madrid.
Profesor Ayudante, 1974-1976.
Universidad Complutense de Madrid.
Doctor en Ciencias Biológicas, 1979.
Universidad Complutense de Madrid.
Colaborador Científico/Científico Titular,
1981-2003 y Jefe de grupo, desde 1997.
CIB, CSIC.
Investigador Científico, desde 2003.
CIB, CSIC.
Plant Cell Nucleolus, Proliferation and Microgravity
Otros miembros | Other lab members:
Plant growth in space is a prime objective of the major space agencies of the world. Furthermore,
Raúl Herranz Barranco gravity is an essential factor of the terrestrial environment and weightlessness produces a serious
Mercedes Carnota Romero stress for plants. We investigate alterations in cell proliferation and growth induced by changes in
Ana Isabel Manzano Pérez
the environmental gravitational conditions. With this purpose, we evaluate cell cycle and nucleolus
Antonio Manrique Campaña
Miguel Ángel Valbuena Crespo
parameters in seedlings grown in space or in ground-based devices simulating microgravity.
Khaled Youssef Kamal

http://www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=32 Publicaciones Seleccionadas

Selected Publications

Nucleolo, Proliferación Celular y

Manzano, A.I., Matía, I., González-Camacho, F.,
Carnero-Díaz, E., van Loon, J.J.W.A., Dijkstra, C.,
Larkin, O., Anthony, P., Davey, M.A., Marco, R.,

Microgravedad en Plantas Medina, F.J. (2009) Germination of Arabidopsis

seed in space and in simulated microgravity:
alterations in root cell growth and proliferation.
Microgravity Sci. Technol. 21, 293-297.
Herranz, R., Laván, D.A., Medina, F.J., van Loon,
Biología Medioambiental | Environmental Biology

El crecimiento de plantas en el espacio es un proliferación y el crecimiento celular inducidas J.J.W.A., Marco, R. (2009) Drosophila GENE
experiment in the Spanish Soyuz Mission to the
objetivo prioritario de las principales agencias por cambios en las condiciones gravitatorias

S
ISS: II. Effects of the containment constraints.
eedling growth or cell culture under real or simulated microgravity have shown important
espaciales mundiales. Además, la gravedad es un medioambientales. Para ello evaluamos parámetros Microgravity Sci. Technol. 21, 299-304.
alterations in Arabidopsis root meristematic cell growth and proliferation. Cell proliferation
factor esencial del medio ambiente terrestre y del ciclo celular y del nucleolo en plántulas crecidas is enhanced and cell growth is depleted (Fig. 1). Consequently, cell cycle is deregulated,
Matía, I., González-Camacho F., Herranz, R., Kiss,
J.Z., Gasset, G., van Loon, J.J.W.A., Marco, R.,
la ingravidez produce un importante stress para en el espacio o en dispositivos simuladores de la showing alterations in cell cycle phases and altered expression of cyclin and CDK genes; specifically, Medina, F.J. (2010) Plant cell proliferation and
las plantas. Investigamos las alteraciones en la microgravedad. cyclin B1 gene is repressed, contrary to the established correlation of this gene with cell proliferation. growth are altered by microgravity conditions in
In seedlings, the loss of meristematic competence (coordination of cell growth and proliferation) is spaceflight. J. Plant Physiol. 167 (3), 184-193.

related to a disturbed auxin polar transport. Medina, F.J. Herranz, R. (2010) Microgravity

E
environment uncouples cell growth and cell
l crecimiento de plántulas o de cultivos de auxinas. Estas alteraciones ocurren en un en clinostato; c) la identificación de These alterations occur in a context of massive changes in gene expression, as detected in proliferation in root meristematic cells: the
celulares en microgravedad real o contexto de grandes cambios en la expresión genes específicos de la respuesta al stress microarray experiments. In addition, we have advanced in the knowledge of the functional role of mediator role of auxin. Plant Sign. Behavior. 5
simulada ha mostrado alteraciones génica, detectados en experimentos con gravitatorio; d) el análisis del papel de las the nucleolar protein nucleolin in ribosome biogenesis, and we are complementing and concluding (2), 176-179.
importantes en la proliferación y el microarrays. Además, hemos avanzado en auxinas en la regulación de la proliferación y the investigations on Drosophila development and behavior in microgravity initiated under the Herranz, R., Benguría, A., Lavan, D.A., López-
el conocimiento del papel funcional de la direction of the late Professor Roberto Marco. Vidriero, I., Gasset, G., Medina, F.J., van Loon, J.
crecimiento de las células meristemáticas el crecimiento de las células meristemáticas
Marco, R. (2010) Spaceflight-related suboptimal
de la raíz de Arabidopsis. La proliferación nucleolina en la biogénesis de ribosomas, y y su influencia en el programa de desarrollo Our current projects, in cooperation with European and American groups, consist of: a) further conditions can accentuate the altered gravity
celular es estimulada y el crecimiento celular, estamos complementando y concluyendo de la planta; y e) los efectos de la acción progress on the topics mentioned above; b) the study of the cell cycle on in vitro cultures grown in a response of Drosophila transcriptome. Molecular
reprimido (Fig. 1). Consiguientemente, el las investigaciones sobre el desarrollo combinada de la luz y la gravedad en la clinostat; c) the identification of specific responsive genes for the gravitational stress; d) the analysis Ecology. 19, 4255-4264.
ciclo celular es desregulado, observándose y el comportamiento de Drosophila en modulación del desarrollo mediante la of the role played by auxin in the regulation of meristematic cell proliferation and growth and its Medina, F.J., González-Camacho, F., Manzano,
alteraciones en sus fases y expresión alterada microgravedad, iniciadas bajo la dirección del alteración de funciones celulares esenciales. A.I., Manrique, A., Herranz, R. (2010) Nucleolin,
influence on the plant developmental program; and e) the combined effects of light and gravity on
a major conserved multifunctional nucleolar
de los genes de ciclinas y CDKs; el gen de la Profesor Roberto Marco, lamentablemente Los experimentos de las partes a) y b) the modulation of development through alteration of essential cellular functions. Experiments from phosphoprotein of proliferating cells. J. Appl.
ciclina B1 es reprimido, contrariamente a la fallecido. se están llevando a cabo en dispositivos parts a) and b) are being carried out on ground-based facilities; from part c), an experiment has been Biomed. 8, 141-150.
correlación establecida de este gen con la Nuestros proyectos actuales, en colaboración terrestres; sobre la parte c) se ha ejecutado executed in the International Space Station (ISS) (Fig. 2); and parts d) and e) are in the definition Pontvianne, F., Abou-Ellail, M., Douet, J., Comella,
proliferación celular. En plántulas, la pérdida con grupos europeos y norteamericanos, un experimento en la Estación Espacial phase for their execution in the ISS from 2012 to 2014. P., Matía, I., Chandrasekhara, C., DeBures, A.,
de competencia meristemática (coordinación consisten en: a) el progreso en los temas Internacional (ISS) (Fig. 2); las partes d) y e) Blevins, T., Cooke, R., Medina, F.J., Tourmente, S.,
Pikaard, C.S., Sáez-Vásquez, J. (2010) Nucleolin
de crecimiento y proliferación celular) se mencionados anteriormente; b) el estudio se encuentran en fase de definición para su
is required for DNA methylation state and the
asocia a la alteración del transporte polar del ciclo celular en cultivos in vitro crecidos ejecución en la ISS entre 2012 y 2014. expression of rRNA gene variants in Arabidopsis
thaliana. PLoS Genet 6(11), e1001225.
doi:10.1371/journal.pgen.1001225
Medina, F.J. (2010) Sensing of gravity by plant
Alteraciones en el crecimiento de las células meristemáticas de la raíz de Arabidopsis en el Alterations in Arabidopsis root meristematic cell growth after spaceflight
espacio, inferidas de datos estructurales, morfométricos e inmunocitoquímicos del nucleolo. inferred from structural, morphometric and immunocytochemical data of the cells and its effects on plant growth and
Imágenes ultraestructurales de nucleolos de plántulas de 4 días crecidas en la Estación Espacial nucleolus. Ultrastructural images of nucleoli from 4 day-old seedlings grown development. In: “Cell Mechanochemistry”,
Internacional (A) y, en paralelo, en la Tierra (B), mostrando la localización de la proteína nucleolar in the International Space Station (A) and, in parallel, in the Earth (B) showing J.J.W.A. van Loon, M. Monici (eds.), pp. 97-112.
nucleolina mediante inmuno-oro. Los nucleolos de las muestras crecidas en el espacio son más the immunogold localization of the nucleolar protein nucleolin. Nucleoli Transworld Research Network/Research Signpost.
pequeños y sus niveles de nucleolina son menores que los de la muestra control. La nucleolina se from the space-grown sample are smaller and have lower levels of nucleolin Medina, F.J. (Guest Editor) (2010) Journal
localiza alrededor de los centros fibrilares (flechas) en la muestra control (B), pero aparece dispersa than the ground control. The distribution of nucleolin is concentrated around of Applied Biomedicine, vol. 8, numbers
en el nucleolo en la muestra fibrillar centers (arrows) in the 3-4. Monographic issue containing review
espacial (A). La proporción ground control sample (B),
papers written by members of the Centro de
de componente granular but gold particles appear
Investigaciones Biológicas.
(GC) es menor en la dispersed throughout
muestra espacial que en the nucleolus in the flight Medina, F.J. (2010) The Centro de Investigaciones
la muestra control (C). sample (A). The proportion Biológicas (Center for Biological Research) in
Todos estos parámetros of granular component (GC) Madrid, Spain: 50 years of excellent fundamental
indican una reducción is lower in the flight sample Experimento denominado “Genara A”, en la Estación Espacial Internacional (ISS), cuyo objetivo es la identificación de genes multidisciplinary biological research. J. Appl.
en la tasa de síntesis than in the ground control de respuesta al stress gravitatorio en plántulas de Arabidopsis. A: Lanzamiento del transbordador espacial “Atlantis”, Biomed. 8 (4), 227.
de ribosomas causada (C). All these parameters conteniendo las muestras del experimento “Genara A”, desde Cabo Cañaveral, el 14 de mayo de 2010. B: Imagen enviada
por la microgravedad y, indicate a reduction in the desde la ISS el 19 de julio de 2010 mostrando las plántulas crecidas en el espacio durante 10 días. Las plántulas se
consiguientemente, un rate of ribosome biogenesis congelaron en la ISS a -80ºC para su transporte a Tierra en la siguiente misión del transbordador espacial. El análisis de
nivel menor de síntesis produced by weightlessness las muestras (en progreso) consiste en métodos genómicos y proteómicos.
de proteínas, lo cual, en and, consequently, a lower Experiment called “Genara A” in the International Space Station (ISS), with the objective of identifying responsive genes of the
estas células, significa level of protein synthesis, gravitational stress in Arabidopsis seedlings. A: Launch of the space shuttle “Atlantis”, containing “Genara A” samples, from Cape
una reducción en el which, in these cells, means Canaveral, the 14th of May 2010. B: Image downlinked from ISS the 19th of July 2010, showing seedlings grown in space
crecimiento celular. La a reduction of cell growth. for 10 days. Seedlings were frozen at -80ºC in the ISS for download to the Earth in the next space shuttle mission. Postflight
barra indica 1 µm. Bar indicates 1 µm. sample analysis (in progress) consists of genomic and proteomic methods.

50 51
 Francisco Tenllado Peralo
Científico Titular | tenllado@cib.csic.es
PhD, 1995.
Universidad Autónoma de Madrid.
Postdoctoral,
Universidad de Leiden, Paises Bajos.
Científico Titular, 2003,
Jefe de grupo, 2003.
CIB, CSIC.
Otros miembros | Other lab members:
Interacciones Moleculares Planta/Virus/Vector:
Determinación de Rutas Celulares Implicadas en
Susceptibilidad a Enfermedades de Virus de Plantas
Biología Medioambiental | Environmental Biology
Los virus de plantas inducen en los huéspedes
susceptibles una serie de modificaciones morfológicas
y fisiológicas junto a una alteración del patrón de
expresión de los genes del huésped. Algunas de estas
alteraciones no producen, necesariamente, una ventaja
L Publicaciones Seleccionadas
a expresión de síntomas representa
la suma de cambios moleculares,
celulares y fisiológicos inducidos por
el virus, que al menos en parte implica una
respuesta del transcriptoma del huésped.
Estos procesos están siendo estudiados
en nuestro grupo utilizando herramientas
moleculares, genómicas y genéticas.
Los genes del huésped con perfiles de
expresión alterados permiten profundizar
dentro de las rutas de señalización y de los
cambios bioquímicos que están modulados
por la infección viral, y que finalmente se
manifiestan como síntomas de enfermedad.
52
José Ramón Díaz-Ruiz Alba
Profesor de Investigación | jrdiazruiz@cib.csic.es
Alberto García Marcos Remedios Pacheco Piña
para el virus, pero pueden tener efectos adversos
en el huésped. Para dilucidar los factores y procesos
que determinan la enfermedad causada por virus
patógenos, estudiamos las interacciones virus-planta
desde una aproximación de genómica funcional.
Mediante el uso de microarrays, hemos
identificado varios conjuntos de genes
cuya expresión cambia como respuesta a la
infección viral (Fig. 1). Los genes alterados
parecen estar distribuidos en varias rutas
metabólicas, lo que indica que la respuesta
del huésped a la infección por virus
compatibles incluye una reorganización
coordinada de un amplio grupo de procesos
celulares, mas que una simple inducción
de genes de respuesta a estrés (Fig. 2). Es
más, estamos empezando a comprender
los eventos moleculares implicados en la
necrosis sistémica, uno de los síntomas más
severos de las infecciones virales en plantas
susceptibles que resulta en la muerte de la
planta. Resultados recientes sugieren que
la base genética de la necrosis sistémica
inducida por interacciones planta-virus
compatibles se asemeja en algunos aspectos
a la muerte celular programada inducida por
patógenos incompatibles en respuestas de
defensa mediadas por genes de resistencia.
Para identificar los genes y los circuitos
celulares involucrados en la expresión de
síntomas, estamos usando herramientas
de transformación genética de plantas y
aproximaciones de genética reversa, basadas
en silenciamiento génico inducido por virus
(VIGS).
Análisis de agrupamiento jerárquico de perfiles de
expresión génica diferencial en plantas de Nicotiana
benthamiana infectadas con PVX, PVY o doblemente
infectadas con PVX+PVY.
Hierarchical cluster analysis of differential expression
profiles in Nicotiana benthamiana plants infected with PVX,
PVY or PVX+PVY double infection.
PhD, 1971, Universidad Complutense de Madrid.
Postdoctoral, 1972.
Instituto Investigaciones Fitopatológicas, Wageningen NL.
1973. John Innes Institute, Norwich UK.
1974-1976. Plant Protection Institute, Beltsville MD USA.
Investigador contratado, 1976-1978.
Virginia Polytechnical Institute and State University.
Blacksburg VA USA.
Científico Titular, 1979,
Jefe de grupo, 1980,
Investigador Científico, 1986,
Profesor de Investigación, 1989.
CIB, CSIC.
Montserrat Llorente de Mingo
Selected Publications
Revuelta, L., Piulachs, M.D., Bellés, X., Castañera,
P., Ortego, F., Díaz-Ruíz, J.R., Hernández-Crespo, P.,
Tenllado, F. (2009). RNAi of ace1 and ace2 in Blattella
germanica reveals their differential contribution
to acetylcholinesterase activity and sensitivity to
insecticides. Insect Biochemistry and Molecular
Biology 39, 913-919.
García-Marcos, A., Pacheco, R., Martiáñez, J.,
González-Jara, P., Díaz-Ruíz, J.R., and Tenllado, F.
(2009). Transcriptional changes and oxidative stress
associated with the synergistic interaction between
Potato virus X and Potato virus Y and their relationship
with symptom expression. Mol. Plant-Microbe
Interaction 22, 1431-1444.
Díaz-Ruíz JR [2008] 20 años de RNA: de intermediario
pasivo a primer actor dinámico. Phytoma 199: 68-71
Vargas M, Martinez-Garcia B, Díaz-Ruíz JR, Tenllado F
[2008] Transient expression of homologous hairpin
RNA interferes with PVY transmission by aphids.
Virology Journal 5, 42.
Tenllado, F., Llave, C. and Díaz-Ruíz, J.R. [2007] Nuevas
aplicaciones biotecnológicas basadas en interferencia
por RNA (RNAi) para el control de las enfermedades
virales en plantas. En: Herramientas Biotecnológicas
en Fitopatología. Eds. V. Pallás et al. Ediciones
MundiPrensa pp 391-407.
Tenllado F., Díaz-Ruíz, J.R. [2001] Double-stranded
RNA-mediated interference with plant virus infection.
Journal of Virology 75, 12288-12297.
Patente
Patent
Tenllado, F., and Díaz-Ruiz, J.R.
Fecha de prioridad: Licencia de Patente 2005.
Un método para interferir con la infección de virus en
plantas/A method for interfering with virus infection
in plants.
Número de solicitud Nacional: 200101593.
Número de solicitud Internacional: PCT/
ES02/00319.
www.cib.csic.es/es/grupo_publicaciones.php?idgrupo=35
Molecular Plant/Virus/Vector Interactions:
Determination of Cellular Pathways Involved in
Susceptibility to Plant Viral Diseases
In susceptible hosts, plant viruses typically induce a number of morphological and physiological
modifications in combination with an altered expression pattern of host genes. Some of these
alterations do not necessarily provide an advantage to the virus but nevertheless may have
adverse effects on the host. To elucidate factors and processes contributing to disease response to
pathogenic viruses, plant-virus interactions are studied under a functional genomic perspective.
E
xpression of symptoms represents the sum of virus- involved in stress responses (Fig. 2). Moreover, we have
induced molecular, cellular, and physiological changes just begun to understand the molecular events involved
that at least in part involve a host transcriptome in systemic necrosis, one of the most severe symptoms
response. These processes are being studied in our group elicited by virus in susceptible plants that eventually results
using molecular, genomic and genetic tools. Host genes in plant death. Recent findings suggest that the genetic
with altered expression profiles provide insight into basis for the systemic necrosis induced by compatible
the signaling pathways and biochemical changes that plant-virus interactions resembles in some aspects
are modulated by viral infection, which are ultimately the programmed cell death induced by incompatible
manifested as symptoms. Using microarrays, we have pathogens in resistance gene-mediated defense
identified several sets of genes that change in expression in responses. We are using plant genetic transformation
response to virus infection (Fig. 1). Altered genes appear to and reverse genetic approaches based on virus-induced
be scattered among several metabolic pathways, confirming gene silencing (VIGS) to identify plant genes and cellular
that the host response to compatible virus infection circuits involved in symptom expression.
includes a coordinated rearrangement of a wide array of
cellular processes, rather than a simple induction of genes
Una representación simplificada de los
cambios transcripcionales inducidos en
plantas de N. benthamiana doblemente
infectadas con PVX y PVY. Se representan
genes (ovalos) o grupos funcionales
de genes (resaltados en amarillo) que
resultan inducidos (flecha hacia arrriba)
o reprimidos (flecha hacia abajo)
exclusivamente por la infección doble
y no por la infección con PVX o PVY. Las
flechas discontinuas indican vías de
regulación hipotéticas.
A simplified representation of transcription
changes induced in Nicotiana benthamiana
by PVX+PVY double infection. Genes (ovals)
or functional groups of genes (highlighted
in yellow) that are induced (upward
arrow) or repressed (downward arrow)
by PVX+PVY double infection but not by
infection with PVX or PVY. Dotted arrows
indicate hypothetical regulatory pathways.
53
 César Llave Correas Tomás Canto Ceballos
Cientifico Titular | cesarllave@cib.csic.es Cientifico Titular | tomas.canto@cib.csic.es
PhD, 1999. PhD, 1994. Investigador del equipo | Staff Scientist:
Universidad Complutense de Madrid. Universidad Complutense de Madrid.
Dionisio López Abella (Doctor ad Honorem)
Postdoctoral, 2000-2003. Postdoctoral, 1995-1996.
Institute of Biological Chemistry, Washington State College of Agriculture, Cornell University, Ithaca,
University, Pullman, USA; Center for Gene Research New York, USA; Scottish Crop Research Institute,
and Biocomputing, Oregon State University, Corvallis, Invergowrie, Dundee, UK.
Otros miembros | Other lab members:
USA.
Investigador de plantilla, 1997-2007. Paula Doblas Ignacio Hamada Gómez-Landero
Investigador Ramón y Cajal, 2003. Scottish Crop Research Institute, Invergowrie, Dundee, Livia Donaire Segarra Virginia Ruíz-Ferrer
CIB. CSIC UK.
Lourdes Fernández Calvino Francisco Javier del Toro Serna
Científico Titular, 2004. Científico Titular, 2007. Inmaculada González
CIB, CSIC. CIB, CSIC.

www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=35

Interacciones Moleculares Planta/Virus/Vector: Molecular Plant/Virus/Vector Interactions:

Aproximaciones Proteómicas y de Silenciamiento por RNA Proteomic and RNA Silencing Approaches
Durante una infección, los virus vegetales usurpan procesos celulares y neutralizan las complejas estrategias To successfully complete their infectious cycles, plant viruses usurp multiple cellular processes and
Biología Medioambiental | Environmental Biology

defensivas de la planta. Además necesitan dispersarse horizontalmente a otros huéspedes, frecuentemente counteract the complex defensive strategies of the plant. They also need to spread horizontally to
mediante insectos vectores. Nuestro grupo estudia las interacciones entre la planta, el virus y el vector desde suitable hosts, in most cases thorough insect vectors. Our group studies these plant/virus/vector
una perspectiva genómica y proteómica, con objeto de identificar los factores y mecanismos que determinan el interactions from a genomic and a proteomic perspective, with the aim of identifying the factors
curso y propagación de las infecciones virales y de sus enfermedades. and mechanisms that determine the course of viral infections and their diseases.

M M
ultifuncionalidad en proteínas
determinantes de patogenicidad
de poty- y cucumovirus: Bases
moleculares y estrategias de interferencia
(TC). Nuestro grupo persigue la identificación
y estudio funcional de interacciones entre
factores virales y del huésped o insecto
vector durante el ciclo infectivo viral. En
particular, estudiamos proteínas supresoras del
silenciamiento o involucradas en la transmisión
por insectos vectores. También estudiamos el
papel de componentes nucleares de la planta
en el ciclo infectivo de virus de RNA+. Estas
interacciones moleculares están constreñidas
por la compartimentalización subcelular y por
los complejos moleculares de orden superior
en que participan. A través del uso combinado
de técnicas de Biología Celular para estudios
in vivo y de herramientas moleculares in vitro
pretendemos establecer una relación causal
entre interacción y función biológica
Biogénesis y función reguladora de los
pequeños RNAs de origen viral y su impacto
en las interacciones planta-virus (CL). Nuestro
grupo estudia la influencia del silenciamiento
génico inducido por el virus en el desarrollo
de la infección, investigando el potencial
regulador de pequeños RNAs virales (vsRNAs)
sobre moléculas diana (RNA y DNA). En
los dos últimos años hemos empleado
diversos virus de RNA y DNA, viroides y
Arabidopsis como sistema modelo para
estudiar molecularmente los requerimientos
genéticos y estructurales para la formación
de vsRNA durante una infección así como el
origen y la composición de sus poblaciones
mediante técnicas de ultra secuenciación.
También hemos desarrollado herramientas
genómicas para la identificación global de
moléculas diana de silenciamiento que nos
permiten posteriores estudios funcionales en
un contexto infectivo.
(A) Nuestros estudios de Biología Celular han
determinado que la proteína no estructural 2b del
Virus del mosaico del pepino, supresora de defensas
antivirales de la planta basadas en silenciamiento génico,
localiza en Nucleolo y Cuerpos de Cajal. También hemos
determinado que interacciona en vivo consigo misma y
con proteínas Argonauta (AGO) 1 y 4 (no se muestra). (B)
Utilizando una batería de ocho mutantes de 2b, hemos
encontrado que pérdida de función correlaciona con
falta de unión a RNAs pequeños en vitro, mostrada aquí
en un experimento de geles de retardo, más que con
incapacidad de unir AGO o de localizar en el Nucleolo
(González et al, 2010. MPMI 23, 294). (C) También
tenemos evidencia preliminar de la unión de otro
supresor, el HCPro del Virus Y de la patata, a AGO 4 en
corpúsculos nucleares (verde) diferentes del Nucleolo o
Cuerpos de Cajal (rojo).
ultifunctionality in pathogenicity determinant Biogenesis and regulatory functions of virus-derived
proteins from poty- and cucumoviruses: small interfering RNAs and their impact on plant-virus
molecular basis and strategies of interference (TC). interactions (CL). We investigate the influence of RNA
Our group aims at the identification and functional study of silencing in the development of viral infections by studying
interactions between viral factors and factors from the host the regulatory potential of viral small RNAs (vsRNAs) on
or insect vector during the viral infectious cycle. In particular, target molecules (RNA or DNA). Over the past two years,
we study proteins involved in suppression of gene sllencing we used several RNA and DNA viruses and viroids, and
or in the horizontal transmission of viruses by insects. We Arabidopsis as a model genetic system to investigate the
also study the role of plant nuclear components in the structural and genetic requirements of vsRNA biogenesis.
infectious cycle of RNA+ viruses. These molecular interactions The origin and composition of the vsRNA transcriptome
are constrained by subcellular compartimentalisation and in infected tissues has been studied by using deep-
by the higher order molecular structures they belong to. By sequencing and home-made bioinformatics. Genomic
combining Cell and Molecular Biology tools and techniques tools based on silencing target enrichment and
for studies in vivo and in vitro, we pursue to establish a causal microarray hybridization have been developed for the
link between interaction and biological function. identification of vsRNA mRNA targets, which enables
further functional studies in an infectious context.
Silenciamiento génico transcripcional y post-transcripcional inducido
por virus vegetales. Los virus producen RNAs bicatenarios durante
la infección que sirven como activadores del silenciamiento al ser
sustrato de enzimas Dicer (DCL) para la formación de pequeños RNAs
(A) Our Cell Biology studies have determined that the virales (vsRNAs). Los vsRNAs se asocian con proteínas AGO para guiar
la degradación ot la inhibición de la traducción del RNA diana, o la
non-structural 2b protein from Cucumber mosaic virus,
a suppressor of plant gene silencing defenses to viruses, metilación del DNA complementario. En este escenario, el genoma
localises to Nucleolus and Cajal Bodies. We have also del virus y del huésped están sujetos a regulación negativa por
vsRNAs (Modificada de Llave, Trends Plant Sci. (2010), 15, 701-707).
shown that the protein self-interacts and interacts also
with Argonaute (AGO) proteins 1 and 4 in vivo (not shown). Trancriptional and post-transcriptional RNA silencing induced by
(B) Using a battery of eight 2b mutants, we have found plant viruses. Upon infection, viruses produce double-stranded
that loss-of function correlates to lack of binding to small RNA by a variety of mechanisms, which in turn is processed
RNAs in vitro, shown here in a retarding gel experiments, by Dicer (DCL) into viral small RNAs (VsRNAs). These vsRNAs
rather than to inability to bind to AGO proteins or to keep associate with AGO proteins to guidesequence-specific
nucleolar targeting (González et al, 2010. MPMI 23, 294). degradatyion or translational arrest of cognate RNA, or
(C) We have also found evidence of the binding of another the methylation of homologous DNA. vsRNAs have the
suppressor of gene silencing, HCPro from Potato virus potential to perform autosilencing of viral genomes or
Y, with AGO 4 in nuclear corpuscles (green), different to negative-regulation of host gene expression (Modified
Nucleolus or Cajal Bodies (red). from Llave, Trends Plant Sci. (2010), 15, 701-707).

Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Donaire, L., Barajas, D., Martínez-García, B., Martínez-
Priego, L. and Llave, C. (2008). Structural and genetics
requirements for the biogenesis of Tobacco rattle virus-
derived small interfering RNAs. J. Virol. 82, 5167-77.
Canto, T., Aranda, M.A., and Fereres, A. (2009). Climate
change effects on physiology and population processes of
hosts and vectors that influence the spread of hemipteran-
borne plant viruses. Global Change Biol. 15, 1884-1894.
Lewsey, M., Surette, M., Robertson, F., Ziebell, H., Choi, S.,
Ryu, K., Canto, T., Palukaitis, P., Payne, T., Walsh, J., and Carr,
J. (2009). The Cucumber mosaic virus 2b protein both
induces symptoms and sustains symptoms induced by
other viral gene products. Mol. Plant-Microbe Interact.
22, 642-654.
González-Jara, P., Fraile, A., Canto, T., and García-Arenal,
F. (2009). Multiplicity of infection of a virus varies during
colonisation of its eukaryotic host. J. Virol. 83, 7487-7494.
Franco-Zorrilla, J.M., Toro, F.J., Godoy, M., Pérez-Pérez, J.,
López-Vidriero, I., Oliveros, J.C., García-Casado, G., Llave, C.
and Solano, R. (2009). Genome-wide identification of small
RNA targets based on target enrichment and microarray
hybridizations. Plant J. 59:840-850.
Donaire, L., Wang, Y., Gonzalez-Ibeas, D., Mayer, K.F., Aranda,
M.A. and Llave, C. (2009). Deep-sequencing of plant viral
small RNAs reveals effective and widespread targeting of viral
genomes. Virology 392, 203-214.
Lewsey, M.G., González, I., Kalinina, N.O., Palukaitis, P., Canto,
T., and Carr, J. (2010) Symptom induction and RNA silencing
suppression by the cucumber mosaic virus 2b protein. Plant
Signalling & Behavior 5, 1-4.
González, I., Martínez, Ll., Rakitina, D., Lewsey, M.G., Atienzo, F.A.,
Llave, C., Kalinina, N., Carr, J.P., Palukaitis, P., and Canto, T (2010).
Cucumber Mosaic Virus 2b Protein Subcellular Targets and
Interactions: Their Significance to RNA Silencing Suppressor
Activity. Mol. Plant-Microbe Interact. 23, 294-303.
Martínez, G., Donaire, L., Llave, C., Pallás, V. and Gómez, G.
(2010). High-throughput sequencing of Hop stunt viroid-
derived small RNAs from cucumber leaves and phloem. Mol.
Plant Pathol. 11, 347-359.
Llave C (2010). Virus-derived small interfering RNAs at the
core of plant-virus interactions. Trends Plant Sci. 15, 701-
707.

54 55
 Isabel García Luque Mª Teresa Serra Yoldi
Investigadora Cientifica | igarcia@cib.csic.es Cientifica Titular | mserra@cib.csic.es
Dra CC Biológicas, 1984. Dra Farmacia, 1971. Otros miembros | Other lab members:
Universidad Complutense Madrid. Universidad Complutense Madrid.
Científica Titular, 1987. Científica titular, 1981.
CIB, CSIC. CIB, CSIC.
Fátima Tena Fernández
Investigadora Científica, 2007.
CIB, CSIC.
Saravanakumar Mariyappan
Irene Culsán Izquierdo
Josefa Fernández-Cabrera Bazán

www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=34

Patógenesis de Virus de Plantas Plant Viral Pathogenesis

y Mecanismos de Resistencia en Plantas and Plant Defence Mechanisms
El interés de nuestro grupo se centra en la responsables de la gama de huéspedes de los Our group is aimed to get a deeper understanding of virus-plant interaction in order to
Biología Medioambiental | Environmental Biology

profundización en el conocimiento de la interacción tobamovirus en solanáceas. 2.- el análisis del efecto de find new tools for the development of durable and sustainable antiviral defence strategies.
virus-planta con el fin de conseguir nuevas la temperatura en la infección viral y en la resistencia To achieve these goals, our ongoing research is focused on: 1.- getting insights into the
herramientas para el desarrollo de estrategias de antiviral, y 3.- la caracterización de genes del huésped molecular mechanisms involved in the host range of tobamoviruses in Solanaceae plants.
defensa antiviral duradera. Para conseguir estos que contribuyen a disminuir el daño provocado por la 2.-Analyzing the effect of temperature changes on viral infection and plant virus resistance and
objetivos, nuestra investigación se centra en: 1.- infección viral y cuya expresión se ve modificada tras 3.-Characterization of host genes that might contribute to diminish the damage inflicted by the
la dilucidación de los mecanismos moleculares la infección viral. viral infection and that are up-regulated upon viral infection.

H W
emos establecido que una única
substitución aminoacídica en el
dominio de la helicasa de la proteína
126K codificada por la cepa española del virus
del moteado suave del pimiento (PMMoV-S)
es la responsable de su termoresistencia, de
forma que la introducción de una Gln en
la posición 898 de la proteína 126 K en el
contexto del genoma de PMMoV-S hace al
virus quimera PMMoV-SGln termosensible.
También hemos establecido que si bien
el movimiento a larga distancia no está
afectado, el movimiento a corta distancia y la
replicación de los RNAs de ambas polaridades
está notablemente disminuido tanto en
PMMoV-I como en el virus quimera PMMoV-
SGln. La termoresistencia de PMMoV-S puede
ser la responsable de la mayor incidencia de
esta cepa en los cultivos de pimiento a pesar
de su menor patogenicidad respecto a los
genes de resistencia L de Capsicum spp. frente
a los tobamovirus.
Por otro lado, hemos determinado que
la reducida invasiòn de plantas de N.
benthamiana por PMMoV-I en los estadíos
tardios de la infección a 21 y 28 d.p.i. y que se
traduce en una recuperación de las plantas
infectadas es debida presumiblemente a
la activación de mecanismos de defensa
de la planta asociadas a un incremento en
la producción de SA, etileno, NO y ROS, así
como a una incrementada acumulación
de proteínas PRs pero no al silenciamiento
génico postranscripcional. Además, hemos
establecido que la reducida acumulación de
PMMoV-I en estadíos tardíos de la infección
de plantas de N. benthamiana que expresan
constitutivamente una glutaredoxina
cloroplastídica de Capsicum chinense (L3L3)
ya sea dirigida al cloroplasto o al núcleo es
debida a un menor nº de células infectadas y
no a una reducida replicación o movimiento
a corta distancia viral, lo que conlleva a pensar
que en estas plantas están previsiblemente
activados los mecanismos de defensa a
través del estado redox celular. Finalmente,
hemos demostrado que la proteina PR-4
de C. chinense cuya expression se activa en
procesos necrogénicos tales como la HR
posee no solo actividad RNAsa como había
sido previamente descrito para otras PR-4,
sino adicionalmente actividad DNAsa siendo
la primera vez que se describe esta actividad
para una proteina PR.
e have determined that a single aa at position
898 of the 126K protein from the Spanish strain
of Pepper mild mottle virus is responsible for
its thermoresistance such that the introduction of a Gln
at that position renders the chimera virus PMMoV-SGln
thermosusceptible. The thermoresistance is associated to an
enhanced accumulation of RNA of both polarities and cell-
to-cell viral movement but it is not associated to changes
in long-distance viral movement with respect to those from
PMMVo-I and PMMoV-SGln. Thermoresistance might be a
determinant for the wider spread of PMMoV-S in pepper
cultivars all over the world vs the Italian strain, in spite of that
this strain is more aggressive towards the pepper L resistance
genes against the tobamoviruses.
We have also determined that the recovery phenotype
of N. benthamiana plants at later stages of infection
(21 and 28 d.p.i.) that it is associated to a diminished
PMMoV-I accumulation is putatively due to the activation
of host defence mechanisms associated to an increased
accumulation of SA, ethylene, NO and ROS associated to
an enhanced accumulation of PR proteins, but not to the
activation of PTGS. In addition, we have established that
the reduced PMMoV-I accumulation at latest stages of
infection in N. benthamiana transgenic plants constitutively
expressing a glutaredoxin protein from C. chinense (L3L3)
plants either targeted to the nuclei or to the chloroplast is
due to a reduced number of infected plant cells, and not
to a diminished viral replication/accumulation within the
plant cells or reduced viral cell-to-cell movement. The data
thus indicate that the reduced viral accumulation is due to
an increased defence mechanisms in these plants through
the cellular redox poise. Finally, we have established that
the PR-4 protein that it is induced during necrogenic viral-
induced processes in Capsicum chinensehas a dual activity
as an RNAse and DNAse being for the first time that it is
described a DNAse activity for a PR protein.

Publicaciones Seleccionadas Patente

Selected Publications
Guevara-Morato, M. A., García de Lacoba, M.,
García-Luque, I. and Serra, M. T. Characterization of
a pathogenesis-related protein 4 (PR-4) induced in
Capsicum chinense L3 plants with dual RNase and
DNase activities. J. Exp. Bot. 61: 3250-3271 (2010).
de María, Elvira, M. I., Molina Galdeano, M., Gilardi,
P., García-Luque, I. and Serra, M. T. Proteomic
analysis of Pathogenesis-related proteins (PRs)
induced by compatible and incompatible
interactions of pepper mild mottle virus (PMMoV)
in Capsicum chinense L3 plants. J. Exp. Bot. 59:
1253-1265 (2008).
de María, N., Guevara, A., Serra M. T., García-Luque,
I., González-Sama, A., García de Lacoba M., de
Felipe, M. R., and Fernández-Pascual, M. Putative
porin of Bradyrhizobium sp. (Lupinus) bacteroids
induced by glyphosate. App. Env. Microbiol. 73:
5075-5082 (2007).
Movimiento célula a célula de los virus quimeras
PMMoV-S-GFP (izquierda); PMMoV-SGln-GFP (centro) y
PMMoV-I-GFP (derecha) observados en el microscopio
confocal.
Confocal laser microscopy observation of the cell-to- Patent
cell movement of the chimeric viruses PMMoV-S-GFP Proteína de Capsicum chinense con actividad RNAsa y DNAsa.
(left); PMMoVGln-GFP (center) and PMMoV-I-GFP Oficina Española de Patentes y Marcas.Fecha de solicitud:
(right).
15 de Marzo de 2010.
Nº de solicitud: 201030375
Acumulación de la proteína PR-1b de C. chinense
fusionada a la proteína GFP en el espacio
extracelular de plantas de N. benthamiana
agroinfiltradas y observadas en el microscopio
confocal.
Confocal laser microscopy observation of
the extracellular localization of the PR-1b
protein from C. chinense fused to the GFP in
agroinfiltrated N. benthamiana plants.

56 57
 Medicina Celular y Molecular
Cellular & Molecular Medicine
Ignacio Casal 60
Medicina Celular y Molecular | Cellular & Molecular Medicine

Proteómica Funcional | Functional Proteomics

Miguel Ángel Peñalva · Eduardo Espeso 62

Genética Molecular de Aspergillus | Aspergillus Molecular Genetics

José Alberto García · Augusto Silva 64

Genética del Cáncer y de las Células Madre del Cáncer | Cancer Genetics and Cancer Stem Cells

Joaquin Teixidó 66
Quimioquinas y Migración Celular | Chemokines and Cell Migration

María Ángeles García Pardo 68

Integrinas en Fisología y Patología | Integrins in Physiology and Disease

Patricio Aller 70
Mecanismos de Acción de Drogas Antitumorales | Mechanisms of Action of Antitumour Drugs

Eduardo Rial 72
Bioenergética Mitocondrial | Mitochondrial Bioenergetics

Santiago Rodríguez de Córdoba 74

Patología Molecular / Genética del Complemento | Molecular Pathology / Complement Genetics

José María Sánchez-Puelles 76

El Factor Inducible de Hipoxia (HIF); Mecanismos de Actuación en los Procesos de
Autorrenovación y Diferenciación Celular
Role of the Hypoxia Inducible Factor (HIF) in Self Renewal and Differentiation

Jose María Rojo 78

Activación de Linfocitos T | T Cell Activation

Flora de Pablo · Enrique J. de la Rosa 80

Catalina Hernández · Teresa Suárez
Laboratorio 3D: Desarrollo, Diferenciación, Degeneración
3D Lab: Development, Differentiation, Degeneration

Ángeles Martín Requero 82

Bases Celulares y Moleculares de la Enfermedad de Alzheimer y otras Demencias
Cellular and Molecular Basis of Alzheimer´s Disease and other Dementias

Ángela Casado 84
Biomarcadores de Estrés Oxidativo y Procesos de Envejecimiento
Oxidative Stress Biomarkers and Aging Processes

Roberto Parrilla · Matilde Sánchez Ayuso 86

Fisiopatología de los Trastornos Hemostáticos | Physiopathology of Hemostatic Disorders

Consuelo González Manchón 88

Receptores de Membrana Plaquetarios | Platelet Membrane Receptors

carmelo Bernabeu · Mª Luisa Botella 90

Receptores de TGF-β en Células Endoteliales | TGF-β Receptors in Endothelial Cells

sANTIAGO LAMAS (Grupo en Transición - Moving on Group) 92

Fisiopatología Molecular de la Pared Vascular | Molecular Pathophysiology of the Vascular Wall

58
 Presentación
Medicina Celular y Molecular
La investigación de los 16 grupos adscritos al departamento de Medici-
na Celular y Molecular pretende profundizar en las bases moleculares
de la patología humana.

A
sí, tiene como objetivos la identificación de dianas diagnósticas y terapéuticas y la imple-
mentación de estrategias encaminadas al descubrimiento de nuevos fármacos en diversas
patologías humanas como cáncer (melanoma, leucemia, adenocarcinoma de colon…),
patologías relacionadas con la pared vascular y el miocardio y estados alterados del sistema de
complemento y de la hemostasia. Por otro lado, abordamos el estudio de procesos de desarro-
llo, degeneración y envejecimiento para entender los mecanismos patogénicos de enferme-
dades como la retinitis pigmentosa, enfermedad de Lafora o el Alzheimer, además de la ge-
nética molecular de hongos. En los últimos años se ha hecho un esfuerzo particularmente
importante en la introducción de tecnologías de alto rendimiento (Proteómica, Genómi-
ca, Farmacología Molecular…) cada vez más necesarias en el ámbito de la Biomedicina.
El Departamento impulsa activamente las colaboraciones entre sus miembros, así como
Cellular and
con grupos de otros Departamentos del CIB, para desarrollar una investigación bio-
médica interdisciplinaria de alta calidad que aumente la competitividad nacional e
internacional de los grupos de investigación individuales. Nuestro programa apoya,
incluso en tiempos restrictivos, la incorporación de nuevas tecnologías e infraestruc-
Molecular Medicine
turas experimentales y el desarrollo de investigaciones pioneras en biomedicina
mediante la incorporación y promoción de investigadores jóvenes. El Departa-
mento también participa en iniciativas de transferencia de tecnología y anima
The research performed by the 16 groups of the Department of Cellular
a la creación de valor añadido para la investigación translacional, protegiendo and Molecular Medicine aims to the characterization of the molecular
adecuadamente los resultados y reactivos producidos por los grupos de inves- basis of human physiopathology.
tigación. Ese valor añadido ha dado ya lugar a, y facilitará, la generación de

“spin-off” biotecnológicas. Por último, el Departamento desea reconocer y
agradecer la fructífera y extensa labor investigadora realizada por Santiago
Lamas y Augusto Silva en nuestro Centro y que finalizó el pasado bienio.
Nuestros mejores deseos a ambos en su nueva andadura.
Ignacio Casal
Jefe de Departamento
A
s main objectives, we can mention the identification of diagnostic markers and the im-
plementation of targeted strategies for the discovery of new drugs. Diverse human pa-
thologies are being characterized, such as cancer (melanoma, leukemia, colon adeno-
carcinoma …), pathologies related with the vascular wall and the myocardium and disturbed
states of the complement system and hemostasia. Also, the processes involved in Develop-
ment, Degeneration and Aging are being studied to understand the molecular mechanisms
of pathogenesis of human disorders like retinitis pigmentosa, Lafora disease or Alzheimer’s
disease, together with the molecular genetics of fungi. Moreover, in the last years, a particu-
larly important effort has been made to introduce high-throughput technologies such as Pro-
teomics, Genomics or Molecular Pharmacology, increasingly relevant in the Biomedicine field.
Collaborations across laboratories and with other Departments within the CIB are actively encoura-
ged to strengthen high quality interdisciplinary biomedical research in the Centre and to increase
the national and international competitiveness of the individual research groups. Our program seeks
the incorporation of the highest level of technological developments and experimental infrastruc-
tures, even in this restrictive period, and the promotion of pioneering research by attracting bright
young researchers in Biomedicine. The Department also promotes technology transfer initiatives
and encourages the creation of added value for translational research through the adequate pro-
tection of the scientific results and reagents produced by the individual groups. Such added value
has already resulted in the generation of biotechnology spin-offs, and will continue supporting new
ones. Last, our Department would like to recognize and acknowledge the fruitful and extensive
research work carried out by Santiago Lamas and Augusto Silva in our Centre, which finalized last
biennium. Our best wishes to both in their new venture.

Ignacio Casal
Department HEAD

60
Overview 61
 José Ignacio Casal Alvarez
Investigador Científico | icasal@cib.csic.es
PhD, 1984, Otros miembros | Other lab members:
Centro de Biología Molecular, CSIC-Universidad
Autónoma de Madrid. Rodrigo Barderas
Post-doctoral Fellow (1985-1986), Massachusetts Ingrid Babel
Institute of Technology (MIT), Cambridge, MA, USA. Alberto Peláez
Jefe de Proyecto, 1986-1997, Roi Villar
Director de Investigación, 1997-2001,
INGENASA. María Fernandez
Director Programa de Biotecnología, 2001-2008,
Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas
(CNIO).
Investigador Científico 2007, CSIC.
Incorporación 2008, CIB.
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=66

Proteómica Funcional
Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine

Nuestro grupo utiliza las tecnologías proteómicas Esto incluye el análisis de patrones de proteínas y
como herramienta para i) la identificación de
biomarcadores diagnósticos y ii) el estudio de
la caracterización de vías de señalización y rutas
metabólicas alteradas durante la metástasis hepática.
Functional Proteomics
los mecanismos moleculares implicados en la El laboratorio participa en una activa transferencia
metástasis de cáncer colorrectal y su relación con tecnológica, particularmente en el campo del
el componente inflamatorio asociado a tumores. diagnóstico molecular.
Our group uses the proteomic technologies as a Publicaciones Seleccionadas
tool for i) the identification of diagnostic biomarkers Selected Publications
and ii) the study of the molecular mechanisms Babel, I., Barderas R., Diaz-Uriarte, R., Martínez-Torrecuadrada JL,

I
dentificación de marcadores diagnósticos
en cáncer colorrectal mediante
detección de autoanticuerpos y/o
antígenos asociados a tumores (AATs).
Existen claras evidencias de la existencia
de una respuesta inmune a cáncer en
humanos, como se ha demostrado por la
presencia de autoanticuerpos en sueros
de pacientes con cáncer. Nuestro grupo
utiliza diversas estrategias proteómicas
para la identificación de AATs específicos
de los AATs identificados, nuestro grupo
está desarrollando inmunoensayos tipo
ELISA para el diagnóstico, preferentemente
temprano, del cáncer de colon. Los
resultados han sido patentados y licenciados.
Efecto del estroma en progresión tumoral
y caracterización de la metástasis en
cáncer de colon. El proceso de invasión
tumoral va acompañado por cambios
en la morfología y fenotipo celular, este
tanto en células tumorales como estromales
adyacentes.
Por otro lado, estamos utilizando proteómica
cuantitativa para estudiar y caracterizar
el proteoma de dos líneas de cáncer de
colon, KM12C y KM12SM, que difieren
en propiedades metastáticas. Hemos
identificado alteraciones tanto en moléculas
implicadas en adhesión y migración celular
como en los patrones de quimioquinas
involved in colorectal cancer metastasis and their
relationship with the inflammatory component
associated to tumors. This includes the analysis of
protein expression patterns and the characterization
of signalling and metabolic pathways altered during
the metastasis in liver. The laboratory participates
actively in technology transfer, particularly in the
field of molecular diagnosis.
Sánchez-Carbayo M and JI Casal [2009]. Identification of tumor-
associated autoantigens for the diagnosis of colorectal cancer in
serum using high-density protein microarrays. Mol Cell Proteomics
8, 2382-2395.
Casado-Vela, J., Martinez-Torrecuadrada JL and JI Casal [2009].
Differential phosphorylation patterns between the Cyclin-a2/CDK2
complex and their monomers. Protein Expr Purif 66, 15-21.
Timmerman P, Barderas R, Desmet J, Altschuh D, Shochat S, Hollestelle
MJ, ßHöppener JWM, Monasterio A, Casal JI*, Meloen RH [2009].
A combinatorial approach for the design of complementarity
determining regions (CDR)-derived peptidomimetics with in vitro
anti-tumoral activity. J Biol Chem 284: 34126-34134 (*, corresponding
author).

de cáncer colorrectal. La caracterización de
los mecanismos que subyacen la inducción
de la respuesta de anticuerpos frente a
tumores y los tipos de mutaciones presente
en los AATs están siendo analizados. A partir
Estrategias proteómicas empleadas para la identificación de biomarcadores
en cáncer de colon. Para detalles ver Barderas et al. Proteomics Clin Appl. 2010
Feb;4(2):159-78.
Proteomic strategies used for the identification of colon cancer biomarkers. See
Barderas et al. Proteomics Clin Appl. 2010 Feb;4(2):159-78 for details.
I
proceso es conocido como transición asociadas a metástasis. Hemos analizado su
epitelio-mesénquima. Actualmente estamos relación con el componente inflamatorio dentification of diagnostic markers in colorectal cancer
estudiando las alteraciones proteómicas y el reclutamiento de células mielocíticas. by autoantibody and/or tumor-associated antigens (TAAs)
detection. There is mounting evidence of the existence of
inducidas por factores clave en la regulación Finalmente, hemos detectado cambios
de la proliferación celular y el fenotipo a nivel metabólico que están siendo an immune response to cancer in humans, as demonstrated by
epitelial como SNAIL, TWIST o Vitamina D caracterizados actualmente. the presence of autoantibodies in cancer sera. Our group uses
different proteomic strategies for the identification of colorectal
cancer-specific TAAs. The characterization of the mechanisms that
underlie the induction of autoantibodies in cancer and the type of
mutations present in the AATs are being characterized. Based on
the identified TAAs, our group is developing ELISA immunoassays
for the, preferentially early, diagnosis of colon cancer. The results
have been patented and licensed .
Effect of the stroma in tumoral progression and characterization
of the metastasis in colon cancer. The invasion process in cancer is
accompanied by changes in cell morphology and phenotype, this
process is known as epithelium-mesenchymal transition. Currently,
we are studying proteomic alterations induced by key factors in
the regulation of cell proliferation and epithelial phenotype, such
as SNAIL, TWIST or 1,25 dihydroxyvitamin D3 in cancer cells and
adjoining stromal cells.
In addition, we are using quantitative proteomics to study and
ADH-GFP ADH-SN
characterize the proteome of two colon cell lines, KM12C and
KM12SM, differing in metastatic properties. We have identified
alterations in adhesion and cell migration-related molecules as
Imagen representativa de un microarray de citoquinas incubado con medio well as in chemokine expression patterns associated to metastasis.
condicionado procedente de células de cáncer de colon transformadas con SNAIL y sus
We have analyzed their relationship with the inflammatory
correspondientes controles. Para detalles ver Peña et al. Oncogene 2009 28, 4375-4385.
component and the recruitment of mielocytic cells. Finally, we
Representative image of a cytokine microarray incubated with conditioned medium from
SNAIL-transformed and mock colon cancer cells. See Peña et al. Oncogene 2009 28, 4375- have detected changes at the metabolic level that are being
4385 for details. currently characterized.
Peña C, García JM, Larriba MJ, Barderas R, Garcia V, Silva J, Dominguez
G, Rodriguez R, Cuevas J, Garcia de Herreros A., Casal JI, Muñoz A,
Bonilla F [2009]. SNAI1 expression in colon cancer related with CDH1
and VDR downregulation in normal adjacent tissue. Oncogene 28,
4375-4385.
Barderas R, Babel I and Casal JI [2010]. Colorectal cancer proteomics,
molecular characterization and biomarker discovery. Proteomics Clin
Appl 4, 159-178.
Luque-Garcia JL, Martínez-Torrecuadrada JL, Epifanio C, Cañamero
M, Babel I and Casal JI [2010]. Differential protein expression on the
cell surface of colorectal cancer cells associated to tumor metastasis.
Proteomics 10, 940-952.
Larriba MJ, Casado-Vela J, Pendás-Franco N, Peña R., García de Herreros
A, Berciano MT, Lafarga M, Casal JI, Muñoz A [2010]. Novel Snail1 Target
Proteins in Human Colon Cancer Identified by Proteomic Analysis.
PLOS One 5, e10221.
Guillou E, Ibarra A, Coulon V, Casado J, Rico D, Casal I, Schwob S,
Losada A and Méndez J [2010]. Cohesin organizes chromatin loops at
DNA replication factories. Genes Dev 24, 2812-2822.
Patentes
Patents
Babel, R. Barderas y J.I. Casal [2009]. Método de obtención de datos útiles
para el diagnóstico o el pronóstico del cáncer colorrectal.
Patent Number: P200930203. PCT-Treaty. Licensed.
Babel, R. Barderas y J.I. Casal [2010]. Método de diagnóstico/pronóstico
del cáncer colorrectal basado en la detección en suero de anticuerpos
frente a autoantígenos tumorales.
Patent Number: P201030708. PCT-Treaty. Licensed.

62 63
 Miguel A. Peñalva
Profesor de Investigación | penalva@cib.csic.es
PhD, 1982.
Universidad Autónoma de Madrid.
Postdoctoral,
Antibióticos SA (Madrid) e Institut de Genetique et
Microbiologie, Universidad de París, Orsay.
Científico Titular y Jefe de grupo, 1987,
Profesor de Investigación desde 2001.
CIB, CSIC.
Visiting Scientist, 2005-2006.
MRC Laboratory of Molecular Biology, Cambridge UK.
Elegido miembro de EMBO en 2000.
Eduardo A. Espeso
Científico Titular | eespeso@cib.csic.es
PhD, 1989. Otros miembros | Other lab members:
Universidad Complutense de Madrid.
Postdoctoral, 1997-1999,
Dr. Areti Pantazopoulou Dr. Antonio Galindo Revilla
EMBO-Postdoctoral Fellow. Dr. Mario Pinar Sala Elena Reoyo
Imperial College London. Juan Francisco Abenza Martínez Laura Cobeño Fariñas
Contratado Ramón y Cajal, 2001-2004, Ane Marquina Iñarrairaegui Erika Herrero García
Científico Titular y Jefe de grupo, 2004.
CIB, CSIC.
Laura Mellado Maroñas Daniel Lucena Agell.
Secretario, 2004-2008. Patricia Hernández Ortiz
Grupo Especializado de Hongos Filamentosos y
Levaduras (SEM).

www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=8

Genética Molecular de Aspergillus Fotografías que

muestran la carioferina
kapH-GFP (en verde)
Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine

asociada al uso mitótico

durante mitosis cerrada. La
A. nidulans es un modelo genético para el estudio multinucleadas en las que el tráfico intracelular está proteina Nud1-mCherry (en
magenta) marca la posición del
del crecimiento celular polarizado y el transporte adaptado a las grandes distancias existentes entre “spindle-pole-body” (centrosoma
a larga distancia (http://en.wikipedia.org/wiki/ distintas regiones o núcleos de la célula. La regulación fúngico). Parte inferior izquierda una
placa maestra con diferentes cepas
Model_organism). Sus hifas crecen exclusivamente de la transcripción por pH ambiental media la y mutantes en el color de esporas en
Aspergillus. Centro y derecha, imágenes
por extensión apical, formando células tubulares adaptación de los hongos a ambientes con distinto pH. de las portadas en Microbiology y Trends in
Microbiology que ilustran el ejemplar donde se
han publicado parte del trabajo realizado en el

U
bienio 09-10.
n aspecto clave de los hongos Una gran variabilidad genética permite
Insets showing the association of GFP tagged
es su invasividad, asociada con a los hongos la capacidad de medrar en kariopherin KapH (in green) with the mitotic spindle
Publicaciones Seleccionadas su rápido crecimiento apical. ambientes extremos. La eficiente regulación during the closed mitosis. Protein Nud1-mCherry (in magenta) labels the position of the spindle pole body, the fungal centrosome. Lower left panel shows different
Selected Publications Combinando abordajes genéticos con transcripcional y la perfecta comunicación Aspergillus strains carrying mutations affecting the colour of conidiospores. Centre and right, cover pages of Microbiology and Trends in Microbiology issues, respectively,
where part of our work has been published during years 2009 and 2010.
microscopía multidimensional, estudiamos entre el núcleo y el citoplasma, donde se
Abenza JF, Pantazopoulou A, Rodríguez JM, Galindo la organización de Golgi y endosomas sintetizan los factores transcripcionales

Aspergillus Molecular Genetics

A, Peñalva MA [2009] Long-distance movement of
Aspergillus nidulans early endosomes on microtubule
tracks. Traffic 10: 57-75.
Rodríguez-Galán O, Galindo A, Hervás-Aguilar A, Arst
HN, Jr., Peñalva MA [2009] Physiological involvement
in pH signalling of Vps24-mediated recruitment of
Aspergillus PalB cysteine protease to ESCRT-III. J Biol
Chem 284: 4404-4412.
Pantazopoulou A, Peñalva MA [2009] The
organization and dynamics of the Aspergillus
nidulans Golgi during apical extension and mitosis.
Mol Biol Cell 20: 4335-4337.
Hervás-Aguilar A, Galindo A, Peñalva MA [2010]
Receptor-independent Ambient pH signaling by
ubiquitin attachment to fungal arrestin-like PalF. J
Biol Chem 285: 18095-18102.
Abenza JF, Galindo A, Pantazopoulou A, Gil C, de
Los Ríos V, Peñalva MA [2010] Aspergillus RabB/Rab5
Integrates Acquisition of Degradative Identity with
the Long Distance Movement of Early Endosomes.
en el contexto del tráfico intracelular
polarizado, centrándonos en GTPasas
Rab y sus efectores. El Golgi de Aspergillus
está formado por cisternas dispersas
(Golgi equivalents) que pueden resolverse
por microscopía óptica. Los endosomas
tempranos son característicamente mótiles
a grandes distancias sobre microtúbulos.
La internalización endocítica y la
maduración endosomal son esenciales.
Pretendemos comprender los mecanismos
de maduración de cisternas del Golgi, las
rutas entre éste y los endosomas y el papel
no canónico que los complejos ESCRT
tienen en la organización de complejos
de transducción de señal de pH en la
membrana plasmática.
y concurren muchos de los sistemas de
señalización, aseguran la correcta expresión
de aquellos genes cuyos productos se
necesitan para que el hongo se desarrolle
en estas condiciones ambientales.
Estudiamos la maquinaria molecular que
participa en la homeostasis de cationes,
mono y divalentes, y la que asegura el
transporte núcleo-citoplásmico de factores
transcripcionales de alta jerarquía que
permiten afrontar los diferentes estreses
abióticos. Así mismo, pretendemos
establecer la forma en la que estos procesos
participan en la diferenciación celular que
ocurre durante el ciclo de reproducción
asexual en Aspergillus y en la patogenicidad
de este hongo en mamíferos.
A. nidulans is a genetic model for studying polarised
cell growth and long distance transport (http://
en.wikipedia.org/wiki/Model_organism). Hyphal tip
cells grow exclusively by apical extension, leading
to tubular multinucleated cells where intracellular
traffic is tailored to the needs imposed by the
relatively large distances between apical and distal
regions and between the different nuclei of the
cell. Regulation of gene expression by ambient pH
mediates fungal adaptation to environments with
different values of pH.
can be resolved by optical microscopy. Early endosomes are
characteristically motile for long distances, riding on microtubules.
Endocytic internalization and the maturation of EEs are essential.
We are trying to understand the mechanisms of cisternal
maturation in the Golgi, the pathways connecting Golgi and
endosomes and the ‘non-endosomal’ role that ESCRT complexes
play in scaffolding ambient pH signal transduction complexes at
the plasma membrane.
The genetic versatility of fungi allows growth of these organisms in
extreme environments. An efficient transcriptional regulation and
a correct communication between nucleus and cytoplasm, where
transcription factors are synthesised and most of signalling pathways
play their roles, ensure the proper expression of those genes
whose products are needed by the fungus to develop under such

Mol Biol Cell. 21:2756-2769.
Etxebeste O, Markina-Iñarrairaegui A, Garzia A,
Herrero-García E, Ugalde U, Espeso EA. [2009] KapI, a
non-essential member of the Pse1p/Imp5 karyopherin
family, controls colonial and asexual development in
Aspergillus nidulans. Microbiology. 155:3934-45.
Etxebeste O, Herrero-García E, Araújo-Bazán L,
Rodríguez-Urra AB, Garzia A, Ugalde U, Espeso EA.
[2009] The bZIP-type transcription factor FlbB regulates
distinct morphogenetic stages of colony formation in
cisternae of the non-
Aspergillus nidulans. Mol Microbiol. 73:775-89.
Garzia A, Etxebeste O, Herrero-García E, Ugalde U,
Espeso EA. [2010] The concerted action of bZip and
cMyb transcription factors FlbB and FlbD induces
brlA expression and asexual development in microscopy, allowing
Aspergillus nidulans. Mol Microbiol. 75:1314-24.
cisternal maturation.
Etxebeste O, Garzia A, Espeso EA, Ugalde U. [2010]
Aspergillus nidulans asexual development: making the
most of cellular modules. Trends Microbiol. 18:569-76.
Etxebeste O, Ugalde U, Espeso EA. [2010] Adaptative
and developmental responses to stress in Aspergillus
nidulans. Curr Protein Pept Sci. 11:704-18.
A
key aspect of fungi is their invasiveness, associated with extreme ambient conditions. We study the molecular machineries
rapid apical extension. By combining genetic approaches participating in the homeostasis of mono and divalent cations, and
with multidimensional microscopy, we are studying the in nucleo-cytoplasmic trafficking of high hierarchy transcription
organization of the Golgi and endosomal systems in the context factors which allow the fungus to confront diverse abiotic stresses. In
Las cisternas tempranas y tardías del Golgi no apilado de Aspergillus nidulans pueden
of polarized traffic, focusing on membrane domain-organising addition, we attempt to establish how these processes contribute to
resolverse por microscopía de fluorescencia in vivo, lo que permite investigar la
maduración de cisternas. Rab GTPases and their effectors. The Aspergillus Golgi is formed the cellular differentiation during the asexual reproductive cycle of
by scattered ‘Golgi equivalents’, such that early and late cisternae Aspergillus and to its pathogenicity in mammals.
Early and late
stacked Golgi os
Aspergillus. nidulans
can be resolved by
in vivo fluorescence
investigation of
Pantazopoulou
& Peñalva,
“Characterization of
Arpergillus nidulans
RabC/Rab6’ Traffic
12:386 (2011).

64 65
 José Alberto García-Sanz Augusto Silva González
Científico Titular | jasanz@cib.csic.es Investigador Científico | asilvagonzalez@celgene.com
PhD, 1987. PhD, 1981, Group Leader, 1984. Otros miembros | Other lab members:
Universidad de Barcelona. Clinica Puerta de Hierro, UCM.
Visiting Fellow 1978 NIH, 1979, UCLA. Gema Elvira Serrano
Postdoctoral,
1987-1989, ISREC, Postdoctoral Fellow, 1981, ISREC. Patricia Pérez Arnaiz
1989-1991, Universidad de Miami, Colaborador Científico, 1986, Alejandro Armesilla Díaz
1991-1996, Miembro Científico Basel Institute for Investigador Científico, 2008.
Immunology.
Rolando Vernal Astudillo
CIB, CSIC.
Investigador contratado, 1997-2003. Subdirector Gral. ISCIII, 1992,
Eva Díaz Guerra
Mª Angeles Lillo Osuna Tinción de neuroesferas con
CNB, CSIC. Director General Terapias Avanzadas y
los mAbs Nilo. (A). Neuroesferas
Investigador, 2003-2008. Transplantes, 2008, Ministerio de Sanidad. Silvia Santamaría García-Minguillán derivadas de la ZSV se tiñieron
Ramon y Cajal. Director of Biological Science, Celgene Institute doblemente con Nilo 1 o Nilo 2
of Translational Research Europe. (En excedencia
Científico Titular, 2008. temporal del CIB). y anticuerpos para Nestina o GFAP.
CIB, CSIC. (B) Análisis de citometría de flujo de
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=26 una suspensión de células derivadas de
neuroesferas y teñidas con anticuerpos
Nilo1-FITC y Nilo2-PE. (C) Células individuales

Genética del Cancer y de las Células Madre del Cáncer Cancer Genetics and
derivadas de neuroesferas y depositadas en
Matrigel® fueron posteriormente fijadas y teñidas
con anticuerpos Nilo1-FITC y Nilo2-PE y analizadas al

Cancer Stem Cells

Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine

microscopio confocal.
Neurosphere staining with Nilo mAbs. (A) SVZ-derived
La homeostasis de los tejidos durante la vida de estamos analizando aspectos de las células madre de neurospheres were double stained with Nilo1 or Nilo2
un individuo es mantenida por las células madre glándula mamaria, sistema nerviosos central y células antibodies and either nestin or GFAP antibodies. (B) FACS analysis
of a neurosphere-derived single cell suspension labeled with
adultas. Estamos interesados en comprender varios mesenquimales (este trabajo se ha llevado a cabo Tissue homeostasis through an individual’s life Nilo1-FITC and Nilo2-PE antibodies. (C) Neurosphere-derived single
aspectos de la biologia de dichas células y su dentro de la red de terapia celular del ISCIII). is maintained by tissue-specific stem cells. We cell suspensions seeded in Matrigel® were fixed and stained with Nilo1-
FITC and Nilo2-PE antibodies and analyzed by confocal microscopy.
relación con las células madre del cáncer. Para ello are interested on understanding several aspects
of adult stem cell biology and their possible

C
élulas Madre de Gándula mamaria:
(E. Diaz-Guerra, Mª A. Lillo, Jose A.
Garcia-Sanz). La glándula mamaria
tiene la mayor parte de su desarrollo tras el
nacimiento, donde ocurren grandes cambios
en arquitectura durante la pubertad y con
cada ciclo reproductivo. Lás células madre
de glándula mamaria tienen un fenotipo
del modelo en tumorigenesis mamaria.
Characterización de anticuerpos
monoclonales frente a células madre y
progenitores neurales tempranos. (G.
Elvira, P. Perez, A. Silva, Jose A. Garcia-
Sanz). Hemos generado nuevos anticuerpos
monoclonales que identifican células
madre neurales y progenitores tempranos
determinar su dinámica de migración en
respuesta a daño.
Characterización de células madre
mesenquimales humanas para
regeneración periodontal (S. Santamaria,
Jose A. Garcia-Sanz, en colaboración con
M. Sanz, UCM). Estamos usando células
madre mesenquimales humanas para
relation with cancer stem cells. For this purpose
we are currently analyzing different aspects of
adult stem cells from the mammary gland, the
nervous central system and mesenchymal stem
cells (this work has been done in the context of
the ISCIII network of Cell Therapy).

M
CD24+CD29+ y una sola célula con dicho (Nilo1, 2, 3 y 8). Estamos trabajando en la caracterizar la población de células madre
ammary Stem Cells: (E. Diaz-Guerra, Mª A.
fenotipo es capaz, al ser transplantada, de identificación de los antigenos reconocidos dentro de esa población compleja, en
Lillo, Jose A. Garcia-Sanz). The mammary gland
regenerar una glándula mamaria funcional. por dichos anticuerpos, su distribución particular su capacidad de autorenovación y
undergoes most of its development after birth,
Hemos analizado la celularidad y numero en distinas poblaciones de células madre diferenciación a hueso, cartilago y grasa, así
and large remodeling and architectural changes occur
de células madre durante la pubertad y y progenitores, así como en su efecto como caracterizar las divisiones simétricas
with each reproductive cycle. The mammary stem cells are
preñez. Los datos obtenidos nos llevaron a inhibidor bloqueando la diferenciación de las y asimétricas de las mismas intentando
CD24+CD29+ cells, and a single CD24+CD29+ cell is able,
proponer un modelo de control de tamaño células madre. Dichos anticuerpos unidos a comprender mejor la biologia de dichas
after transplantation to regenerate a functional mammary
del órgano con importantes implicaciones nanoparticulas paramagnétics se han usado celulas y determinar las posiblidades de su
gland. We have analyzed mammary gland cellularity and stem
en tumorigenesis mamaria. Actualmente para identificar in vivo las células madre uso para regeneración de tejido oseo para
cell number during puberty and the reproductive cycle. The
intentamos verificar in vivo las implicaciones y progenitores endógenos en su nicho, y regeneraciones periodontales.
data obtained allowed us to propose a model for organ size
control with clear implications for mammary tumorigenesis.
Our current efforts aim to verify in vivo the implications of this
model on mammary tumorigenesis.
Characterization of new antibodies recognizing neural stem
and early progenitor cells. (G. Elvira, P. Perez, A. Silva and
Jose A. Garcia-Sanz). We have generated new monoclonal
antibodies identifying adult neural stem and early progenitor
cells (Nilo1, 2, 3 and 8). We are working on the identification
of the antigens recognized by these antibodies, their
distribution in several stem and early progenitor cell
populations and their inhibitory effect blocking neural
stem cell differentiation. These antibodies, coupled to
Publicaciones Seleccionadas magnetic nanoparticles have been used to in vivo identify
Selected Publications the endogenous stem and early progenitor cell niches,
Vernal, R., Leon, R., Silva, A., van Winkelhoff, A.J., Garcia-Sanz, J.A., and Sanz, M. (2009).
determining their dynamics during pathological transitions.
Armesilla-Diaz, A., Bragado, P., Del Valle, I., Cuevas, E., Lazaro, I., Martin, C., Cigudosa, Differential cytokine expression by human dendritic cells in response to different
J.C., and Silva, A. (2009). p53 regulates the self-renewal and differentiation of neural Porphyromonas gingivalis capsular serotypes. J Clin Periodontol 36, 823-829. Characterization of human mesenchymal stem cells for
precursors. Neuroscience 158, 1378-1389. Del Valle, I., Elvira, G., Garcia-Benzaquen, L., Armesilla-Diaz, A., Kremer, L., Garcia-Sanz, J.A., periodontal regeneration (S. Santamaria and Jose A. Garcia-
Armesilla-Diaz, A., Elvira, G., and Silva, A. (2009). p53 regulates the proliferation, differentiation Martinez, S., and Silva, A. (2010). Characterization of novel monoclonal antibodies able Sanz, in collaboration with M. Sanz, UCM). We are using
and spontaneous transformation of mesenchymal stem cells. Exp Cell Res 315, 3598-3610. to identify neurogenic niches and arrest neurosphere proliferation and differentiation. human mesenchymal stem cells to characterize the stem cells
Dutzan, N., Gamonal, J., Silva, A., Sanz, M., and Vernal, R. (2009). Over-expression of Neuroscience 169, 1473-1485.
on this complex population, in particular their self renewal
forkhead box P3 and its association with receptor activator of nuclear factor-kappa García-Gómez, I., Elvira, G., Zapata, A.G., Lamana, M.L., Ramírez, M., Garcia Castro, J., García
ability and their ability to differentiate into bone, cartilage and
B ligand, interleukin (IL) -17, IL-10 and transforming growth factor-beta during the Arranz, M., Vicente, A., Bueren, J., and García-Olmo, D. (2010). Mesenchymal stem cells:
progression of chronic periodontitis. J Clin Periodontol 36, 396-403. biological properties and clinical applications. Expert Opin Biol Ther 10, 1-16. fat, as well as to characterize their type of divisions (symmetric
Juanes, M.E., Elvira, G., Garcia-Grande, A., Calero, M., and Gasset, M. (2009). Biosynthesis of Elvira, G., Moreno, B., delValle, I., Garcia–Sanz, J.A., Canillas, M., Chinarro, E., Jurado, J.R., and
and asymmetric), aiming as a long term goal to better
prion protein nucleocytoplasmic isoforms by alternative initiation of translation. J Biol Silva, A. (2010). Targeting Neural Stem Cells with Titanium Oxide Nanoparticles Coupled understand this cell population and determine the possibilities
Chem 284, 2787-2794. to Specific Monoclonal Antibodies. J Biomat Appl DOI: 10.1177/0885328210393294. to use it to regenerate bone tissue for periodontal regeneration.

66 67
 Joaquin Teixidó Calvo
Profesor de Investigación | joaquint@cib.csic.es
PhD, 1985, Otros miembros | Other lab members:
Max Plank Institute für Molekulare Genetik, Berlin,
and Centro de Biología Molecular, Universidad Rubén A. Bartolomé Conde
Autónoma de Madrid.
David García Bernal
Postdoctoral,
University of Massachusetts; Dana Farber Cancer
Georgina P. Colo
Institute, Boston, USA. Pablo Hernández Varas
Científico Titular 1992, Ana Dios Esponera
Incorporación, 1994, Ana Serrano Somavilla
Jefe Grupo, 1994,
Investigador Científico, 2003, Nohemí Arellano Sánchez
Profesor de Investigación, 2007, Soledad Isern de Val
CIB, CSIC.

www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=27

Quimioquinas y Migración Celular Chemokines and Cell Migration

Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine

Nuestra investigación se centra en la caracterización patologías tales como inflamación y cáncer, están Our main research concerns the characterization are governed by chemokines.
de la señalización intracelular requerida para controlados por quimioquinas. Tras su unión a sus of intracellular signalling required for cell adhesion Upon binding to their G protein-
la adhesión y migración celular en respuesta a receptores acoplados a proteínas G, las quimioquinas and migration in response to chemokines. coupled receptors, chemokines
quimioquinas. Procesos fisiológicos que comportan activan moléculas señalizadoras para migración Physiologic processes involving cell migration activate signalling pathways for
migración y activación celular, tales como respuesta celular, expresión génica y proliferación, como and activation including immune response and cell migration, gene expression and
inmune y recirculación linfocitaria, así como diferentes GTPasas y fosfatidilinositol 3-quinasa. lymphocyte surveillance, as well as pathologic proliferation, including GTPases and
conditions such as inflammation and cancer, phosphatidylinositol 3-kinases.

L C
a caracterización de la señalización
inducida por quimioquinas es clave
para relacionar activación y respuestas
celulares, tanto en condiciones fisiológicas
como en procesos patológicos. Nuestros
modelos celulares incluyen la migración y
activación de linfocitos T y células tumorales.
En el primer modelo estudiamos moléculas
activadas por quimioquinas requeridas para
la estimulación de la adhesión de células
T mediada por la integrina α4β1, un paso
clave en el tráfico linfocitario hacia lugares
de inflamación durante la respuesta inmune.
Nuestro modelo propone que cambios
dinámicos estimulados por quimioquinas en
una plataforma de señalización compuesta
por talin y Vav1 es esencial en este proceso.
Los resultados se han obtenido utilizando
linfocitos T humanos, y el siguiente paso
utilizaremos modelos inflamatorios en
ratón y diferentes ratones knock-out para
investigar de un modo más fisiológico el
papel de esta plataforma de señalización
durante la respuesta inmune mediada por
linfocitos T.
En el segundo modelo, estamos estudiando
el papel de las quimioquinas en el tráfico
de células de mieloma y en la metástasis
de células de melanoma. La caracterización
de los mecanismos que controlan la
migración de las células de mieloma hacia la
médula ósea y la metástasis de melanoma
es importante para un futuro desarrollo
de mejores terapias. Nuestros resultados
han demostrado que la activación de Vav-
Rho y de MT1-MMP, así como de la vía de
activación dependiente de Gα13-regula la
invasión de células de melanoma. Asimismo,
nuestros resultados recientes indican que el
lípido S1P controla el tráfico de las células
de mieloma a la médula ósea en respuesta
a quimioquinas. Basándonos en nuestros
presentes resultados, estudiaremos el
papel de Src quinasas y de proteínas de las
adhesiones focales en la invasión de células
de melanoma, y analizaremos en detalle los
mecanismos que controlan el tráfico de las
células de mieloma.
haracterization of chemokine-induced signalling is proteins in melanoma cell invasion, and will further dissect the
fundamental to relate cell activation with cell responses, mechanisms required for the trafficking of myeloma cells.
both in physiologic and pathologic processes. Our cellular
models are T lymphocyte and tumor cell migration and activation.
In the first model, we study the molecules activated by chemokines
that lead to α4β1 integrin activation and upregulation of T cell
adhesion, a key step in lymphocyte trafficking to inflammatory sites
during the immune response. Our work proposes that chemokine-
promoted dynamic changes in a signalling platform formed by Vav1
and talin are essential in this process. This has been achieved using
human T lymphocytes, and our next step is to use mouse models
of inflammation and already available knock-out mice to further
investigate in a more physiologic set-up the role of this signalling
platform during T lymphocyte-mediated immune response.
In the second model, we are studying the role of chemokines
in the homing and metastasis of myeloma and melanoma
cells. Characterization of mechanisms controlling myeloma cell
homing to bone marrow and the metastasis of melanoma cells
is important for development of improved therapies. Our work
has demonstrated that activation of Vav-RhoGTPase and MT1-
MMP, as well as Gα13-dependent signalling pathways, regulate
melanoma cell invasion. Furthermore, our recent data indicate that Modelo de la regulación dependiente de Rho de la invasión de células de melanoma
the lipid S1P controls chemokine-stimulated homing of myeloma en respuesta a estimulación de receptores acoplados a proteínas G. (Para detalles ver
cells to the bone marrow. Based on our present results, we will Bartolomé et al. Cancer Res. 68, 8221-8230, 2008).
next study the involvement of Src kinases and focal adhesion Model for Rho-dependent regulation of melanoma cell invasion in response to G-protein
coupled receptor stimulation. (See Bartolomé et al. Cancer Res. 68, 8221-8230, 2008, for
details).

La plataforma de señalización Publicaciones Seleccionadas Molina-Ortiz, I., Bartolomé, RA, Hernández-Varas, P. Colo, GP and Teixidó, J.

Vav1/talina juega un papel
clave en la estimulación por
quimioquinas de la adhesión
de linfocitos T humanos
dependiente de α4β1. (Para
detalles, ver García-Bernal
et al., 2009. Immunity 31,
953-964 ).
The Vav1/talin signaling
platform plays a crucial role
for chemokine-stimulated
human T lymphocyte adhesion
mediated by α4β1. (See García-
Bernal et al., 2009. Immunity 31,
953-964, for details).
Selected Publications
Bartolomé, RA., Wright, N., Molina-Ortiz, I., Sánchez-Luque, FJ. and Teixidó, J. Activated
Gα13 impairs cell invasiveness through p190RhoGAP-mediated inhibition of RhoA
activity. 2008. Cancer Res. 68, 8221-8230.
Marrero-Diaz, R., Bravo-Cordero, JJ., Megías, D., García, MA., Bartolomé, RA., Teixido, J,
and Montoya, MC. Polarized MT1-MMP-CD44 interaction and CD44 cleavage reveals
an essential role for MT1-MMP in CD44-mediated invasion. 2009, Cell Motility
Cytosk. 66:48-61.
Bartolomé, RA, Ferreiro,S., Miquilena-Colina, ME., Martínez-Prats, L., Soto-Montenegro,
MJ., García-Bernal, D., Vaquero, JJ., Agami, R., Delgado, R., Desco, M., Sánchez-Mateos,
P. and Teixidó, J. The chemokine receptor CXCR4 and the metalloproteinase mt1-
mmp are mutually required during melanoma metastasis to lungs. 2009. Amer. J.
Pathol. 174:602-12.
Overexpression of E-cadherin on melanoma cells inhibits chemokine-promoted
invasion involving p190RhoGAP/p120ctn-dependent inactivation of RhoA. 2009. J.
Biol. Chem. 284: 15147-57.
Estecha, A., Sánchez-Martín, L., Puig-Kröger, A., Bartolomé, RA, Teixido, J., Samaniego,
R. and Sánchez-Mateos, P. Moesin orchestrates cortical polarity of melanoma tumour
cells to initiate 3D. 2009, J. Cell Sci. 122, 3492-3501.
García-Bernal, D., Parmo-Cabañas, M., Dios-Esponera-A, Samaniego, R., Hernán-P de
la Ossa, D. and Teixidó, J. Chemokine-induced Zap70 kinase-mediated dissociation of
the Vav1-Talin complex activates α4β1 integrin for T cell adhesion. 2009. Immunity
31, 953-964.
Gonzalo, P., Guadañillas, MC, Hernández-Riquer, MV, Pollán, A., Grande-García, A.,
Bartolomé, RA., Vasanji, A., Ambrosio, C., Chiarle, R., Teixido, J., Risteli, J., Apte, SS., del
Pozo, MA and Arroyo, AG. MT1-MMP is required for myeloid cell fusion via regulation
of Rac1 signaling. 2010. Dev. Cell. 18, 77-89.

68 69
 Maria Ángeles García Pardo
Profesora de Investigación | agarciapardo@cib.csic.es
PhD, 1976.
Fundación Jiménez Díaz, UAM.
Assistant Research Scientist 1974-76.
New York University Medical Center, NY, USA.
Research Associate 1977-78
Massachusetts Institute of Technology,
Cambridge, MA, USA y New York University
Medical Center, NY, USA.
Adjunto, 1978-81.
Fundación Jiménez Díaz, Madrid.
Research Assistant Professor 1981-86.
New York University Medical Center, NY, USA
Assistant Investigator 1986-89.
The New York Blood Center, NY, USA
Integrinas en Fisiología y Patología
Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine
Un objetivo esencial del laboratorio ha sido la
caracterización del papel de las integrinas (expresión,
regulación, interacción con ligandos, señalización
intracelular) en la fisiología y patología de los
linfocitos. Nos hemos centrado en el papel de la
N
uestro objetivo general es caracterizar los mecanismos
implicados en la progresión de la LLC-B, la leucemia más
común en países occidentales. En concreto estudiamos: 1)
moléculas implicadas en adhesión y migración, particularmente la
metaloproteinasa de matriz-9 (MMP-9); moléculas que contribuyen
a la supervivencia de células LLC-B; 3) nuevos agentes inductores
de apoptosis que pudieran servir para el tratamiento de la LLC-B.
Hemos mostrado previamente que la MMP-9 está regulada por
moléculas implicadas en adhesión y migración cellular (integrina
α4β1, quimioquinas CXCL12/CCL21, VEGF) (Fig. 1) y se une a células
LLC-B via α4β1 y CD44v, un nuevo complejo de anclaje para MMP-9.
Recientemente, hemos establecido que la interacción de la MMP-9
con sus receptores celulares inhibe la migración celular, y estamos
confirmando este aspecto con ensayos in vivo en ratones. Otra función
de la MMP-9 asociada a superficie cellular es la inducción de una ruta
de señalización que conduce a supervivencia celular (Fig. 2). Esta ruta es
operativa en pacientes con LLC-B, sugiriendo que la MMP-9 contribuye
a la patología de la LLC-B y constituye una diana terapéutica para esta
enfermedad. Actualmente estamos caracterizando los dominios de
MMP-9 implicados en estos procesos y probando compuestos que
modulen la función de MMP-9 en la LLC-B.
El mieloma múltiple se caracteriza por la acumulación de células
plasmáticas malignas en la médula ósea, produciendo lesiones
osteolíticas e inmunodeficiencia. En colaboración con el Dr. Joaquín
70
Integrins in
Assistant Professor 1990. Columbia
University, NY, USA
Científica Titular, 1987,
Otros miembros | Other lab members:
Ma Irene Amigo Jiménez Physiology and Disease
Elvira Bailón Fernández
Incorporación CIB, 1991,
Investigadora Científica, 1993, Mercedes Hernández del Cerro A major focus of the laboratory has been to characterize the role
Profesora de Investigación, 2007. Javier Redondo Muñoz
CIB, CSIC.
of integrins (expression, regulation, ligand interaction, intracellular
Estefanía Ugarte Berzal
signaling), in the physiology and pathology of lymphocytes. We have
focused on the role of α4β1 integrin and other molecules involved
in adhesion and migration events on B-cell malignancies, mostly B cell
chronic lymphocytic leukemia (B-CLL) and multiple myeloma.
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=24
O
ur general aim is to characterize the mechanisms involved
in the progression of B-CLL, the most common leukemia
in Western countries. We focus on the following aspects: 1)
molecules involved in cell adhesion and migration, particularly matrix
metalloproteinase-9 (MMP-9); 2) molecules contributing to the survival
integrina α4β1 y de otras moléculas implicadas en of B-CLL cells; 3) novel apoptosis-inducing compounds which might
be useful in the clinical treatment of B-CLL. We previously showed
procesos de adhesión y migración en patologías de
that MMP-9 is regulated by molecules involved in cell adhesion and
células B, fundamentalmente la leucemia linfocítica migration (α4β1 integrin, CXCL12/CCL21 chemokines, VEGF) (Fig.
crónica B (LLC-B) y el mieloma múltiple. 1), and binds to B-CLL cells via α4β1 integrin and CD44v, a novel
docking complex for MMP-9. We have recently established that MMP-9
Teixidó estamos estudiando los mecanismos moleculares implicados
en estos procesos, con énfasis en los ejes CXCR4/CXCL12 y S1P/S1P1.
El mejor conocimiento de estos mecanismos ayudará a diseñar dianas
apropiadas en el myeloma.
Regulación dual de MMP-9 inducida por la ligación de la integrina α4β1, de
receptores de quimioquinas, o de VEGF en células LLC-B, que se traduce en efectos
opuestos en migración celular. Ver también Blood 115, 846-849 (2010).
Dual regulation of MMP-9 by α4β1 integrin, chemokine receptors, or VEGF in B-CLL cells,
leading to opposite effects on cell migration. See also Blood 115, 846-849 (2010).
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Redondo-Muñoz, J., Ugarte-Berzal, E., Terol, M.J., Van den Steen, P.E., Hernández del Cerro,
M., Roderfeld, M., Roeb, E., Opdenakker, G., García-Marco, J.A., and Garcia-Pardo, A. (2010).
Matrix metalloproteinase-9 (MMP-9) promotes chronic lymphocytic leucemia B-cell survival
through its hemopexin domain. Cancer Cell 17, 160-172.
Ugarte-Berzal, E., Redondo-Muñoz, J., Eroles, P., Hernández del Cerro, M., García-Marco,
J.A., Terol, M.J., and García-Pardo, A. (2010). VEGF/VEGFR2 interaction downregulates
matrix metalloproteinase-9 via STAT1 activation and inhibits B chronic lymphocytic
leukemia cell migration. Blood, 115, 846-849.
Kamarajan, P., García-Pardo, A., D´Silva N.J., and Kapila, Y. (2010). The CS1 segment of
fibronectin is involved in human OSCC pathogenesis by mediating OSCC cell spreading,
migration and invasion. BMC Cancer 10, 330.
Redondo-Muñoz, J*., Escobar-Díaz, E*., Hernández del Cerro, M., Pandiella, A., Terol,
M.J., García-Marco, A., and García-Pardo, A. (2010). Induction of B-chronic lymphocytic
interaction with its surface
receptors inhibits cell migration,
and we are confirming this by
doing in vivo studies in mice.
Another function of surface-bound
MMP-9 is the induction of a signaling
pathway that leads to cell survival (Fig.
1). This pathway operates in B-CLL patients,
suggesting that MMP-9 contributes to B-CLL
pathology and constitutes a therapeutic target
for this disease. We are currently characterizing
the MMP-9 domains involved in these events and
testing compounds which may modulate the function
of MMP-9 in B-CLL.
Multiple myeloma is characterized by the accumulation
of malignant plasma cells in the bone marrow, leading
to osteolytic bone lesions and immunodeficiency. In
collaboration with Dr. Joaquín Teixidó we are studying the
molecular mechanisms involved in these events, with a major
focus on the CXCR4/CXCL12 and S1P/S1P1 axes. A better
knowledge of these mechanisms should help designed
appropriate targets for myeloma.
Ruta de señalización inducida tras la interacción de MMP-9 con la
integrina α4β1 en células LLC-B. Comparación con la ruta inducida por
VCAM-1, otro ligando de α4β1. Para detalles ver Cancer Cell 17, 160-172
(2010).
Cell survival signaling pathway induced by MMP-9 interaction with α4β1
integrin in B-CLL cells. Comparison with the pathway induced by VCAM-1,
another α4β1 ligand. See Redondo-Muñoz et al., Cancer Cell 17, 160-172
(2010) for details.
leukemia cell apoptosis by arsenic trioxide involves suppression of the PI3K/Akt
pathway via JNK activation and PTEN upregulation. Clin. Cancer Res. 16: 4382-
4391. *equal contribution. Editorial comment: Goussetis, D.J., and Platanias, L.C.
(2010). Arsenic trioxide and the phosphoinositide 3-kinase/Akt pathway in chronic
lymphocytic leukemia. Clin. Cancer Res. 16, 4311.
Redondo-Muñoz, J., Terol, M.J., García-Marco, J.A., and Garcia-Pardo, A. (2008). MMP-9 is
upregulated by CCL21/CCR7 interaction via ERK1/2 signaling and is involved in CCL21-
driven B-CLL cell invasion and migration. Blood, 111: 383-386.
Redondo-Muñoz, J., Ugarte-Berzal, E., García-Marco, J.A., Hernández del Cerro, M., Van
den Steen, P.E., Opdenakker, G., Terol, M.J., and Garcia-Pardo, A. (2008). α4β1 integrin
and 190 kDa CD44v constitute a cell surface docking complex for gelatinase-B/MMP-9
in chronic leukemic but not in normal B cells. Blood, 112: 169-178. Editorial comment:
Nowakowski, G.S. (2008). Gang of 3 in aggressive CLL? Blood, 112: 5-6.
71
 Patricio Aller Tresguerres
Profesor de Investigación | aller@cib.csic.es
PhD, 1979.
Universidad Complutense de Madrid.
Postdoctoral, 1983.
Department of Pathology, Temple University,
Philadelphia, USA.
Profesor Titular, 1985.
Universidad de Córdoba.
Científico Titular, 1986,
Investigador Científico, 2002,
Profesor de Investigación, 2009.
CIB, CSIC.
Mecanismos de Acción de Drogas Antitumorales
Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine
El laboratorio se constituyó hace aproximadamente
veinte años, para el estudio de aspectos relativos
al control de la diferenciación, muerte, y respuesta
de estrés celular. Nuestro interés actual se centra en
los mecanismos de regulación de la proliferación
N
uestro interés se centra
especialmente en la acción
del trióxido de arsénico (ATO,
TrisenoxTM), droga usada clínicamente
frente a la leucemia promielocítica aguda,
y objeto de gran investigación frente a
otras neoplasias. Estudiamos también la
acción de otras drogas mitocondriotóxicas
como la lonidamina, ya utilizada frente
algunos tumores sólidos. Como objetivo
general, intentamos diseñar estrategias
de sensibilización que incrementen la
eficacia apoptótica y reduzcan la toxicidad
colateral de estos compuestos. Entre
otros aspectos, investigamos: (1) Acción
quimio-sensibilizadora de agentes fenólicos
72
Otros miembros | Other lab members:
Yolanda Sánchez Delgado
Eva Calviño Venegas
Gloria Pilar Simón García de Mora
Mª Cristina Estañ Omaña
Elena de Blas Brotons
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=13
y muerte celular (apoptosis y necrosis) inducida
por agentes antitumorales, especialmente el
trióxido de arsénico (TRISENOX) y otras drogas
mitocondriotóxicas, y en el diseño de estrategias que
podrían mejorar su eficacia clínica.
dietéticos (p.e., flavonoides, curcumina, IκB-NF-κB. (5) Mecanismos de activación/
resveratrol), en su capacidad de afectar el ejecución de la muerte celular, incluyendo
ciclo de proliferación, potenciar apoptosis, y estrés de retículo endoplásmico, activación
ocasionalmente favorecer la diferenciación. de la vía apoptótica intrínseca (mitocondrial)
(2) Acción quimio-sensibilizadora (pro- y secundariamente extrínseca (mediada
apoptótica) de agentes anti-glucolíticos. por receptor), y selección entre muerte
(3) Correlación entre apoptosis y estrés apoptótica y necrótica. Empleamos modelos
oxidativo, medido por sobre-producción de de células leucémicas humanas mieloides
especies reactivas de oxígeno y alteraciones (p.e. U937, HL60, NB4) y linfoides (p.e.,Jurkat),
en glutation intracelular, y acción protectora que extenderemos a células leucemicas
de agentes anti-oxidantes. (4) Señalización primarias, y ocasionalmente modelos de
por proteínas quinasas tales como JNK y cáncer de próstata (PC3 y LNCaP). Asimismo
p38-MAPK, ruta Raf-1/MEK/ERK, ruta PI3K/ mantenemos colaboración con el laboratorio
Akt/mTOR, AMPK, JAK/STAT; efecto de del Dr. E. Rial (CIB), en su investigación sobre
moduladores farmacológicos y siRNAs frente la proteína mitocondrial UCP2 como diana
a estas quinasas; y alteraciones en la ruta IKK/ terapéutica.
La figura ilustra algunos efectos de la
isoflavona de soja genisteína en modelos de
células leucémicas mieloides agudas (AML)
humanas. A concentraciones subcitotóxicas,
la genisteína (Gen) potencia fuertemente la
acción apoptótica de la droga antileucémica
trióxido de arsénico (ATO) (A); provoca sobre-
producción de especies reactivas de oxigeno
(ROS), medida con la sonda fluorescente
H2DCFDA (B), y provoca fosforilación/
activación de las proteínas quinasas p38-
MAPK, AMPK y ERK (C). La producción de ROS
y activación de p38-MAPK y AMPK median la
producción de apoptosis, según demuestra el
efecto protector del anti-oxidante N-acetil-L-
cisteína (NAC) y de los inhibidores de quinasas
SB203580 (SB) y “compound C” (CC), mientras
que la activación de MEK/ERK probablemente
ejerce un efecto protector, a juzgar por el
incremento en toxicidad provocado por los
inhibidores PD98059 (PD) y U0126 (U) (A) o
siRNAs específicos para dichas quinasas (no
mostrado). Por otro lado la genisteína inhibe
la transición G2 – M en el ciclo de proliferación
(D) y altera la expresión o fosforilación/
activación de proteínas reguladoras de dicha
transición (E), y asimismo induce diferenciación
celular, medida por sobre-expresión en
superficie celular de CD11b/CD18 (F). Ambos
Mechanisms of
Action of Antitumour Drugs
The laboratory was established approximately twenty years ago,
to investigate different aspects of the control of cell differentiation,
cell death, and the stress response. Our present interest is mainly
focussed on the mechanism of regulation of cell proliferation and death
(apoptotic and necrotic) induced by arsenic trioxide (TRISENOX) and other
mitochondriotoxic drugs, and the generation of strategies which might
allow to improve their clinical efficacy.
O
ur research is mainly focussed on the action of arsenic
trioxide (ATO, TrisenoxTM), clinically used in the cure
of acute promielocítica leukaemia and under intensive
investigation in other neoplastic diseases. Nonetheless, we are also
interested on the action of other mitochondriotoxic drugs such
as lonidamine, used against some solid tumours. The major goal
consists in the generation of strategies to improve the apoptotic
efficacy and decrease the side toxicity of those agents. Among
other aspects, we investigate: (1) Chemo-sensitization by dietary
phenolic agents (such as flavonoides, curcumin, resveratrol),
measured by alterations in cell growth cycle, death generation
(apoptosis, necrosis), and occasionally differentiation induction.
(2) Chemo-sensitization by glycolytic inhibitors. (3) Relationship
between apoptosis and oxidative stress, as determined by reactive
oxygen species (ROS) over-production, alterations in intracellular
glutathione, and protection by antioxidant agents. (4) Signalling
by protein kinases such as JNK and p38-MAPK, Raf-1/MEK/ERK and
efectos, parada de ciclo y diferenciación, son regulados por MEK/ERK, a juzgar
por la atenuación provocada por PD9859 y U0126 o siRNAs apropiados (no
mostrado), pero son independientes de ROS y de p38-MAPK, a juzgar por la
falta de efecto de NAC y SB203580 ((G) y resultados no mostrados). Un esquema
integrador de los efectos de la genisteína sobre apoptosis, ciclo celular y
diferenciación, y sus interacciones, se muestra en (H). Estos resultados avalan el
potencial interés clínico de la genisteína (y quizás otros flavonoides) en terapias
basadas en apoptosis y diferenciación celular.
The figure shows several effects of the soy isoflavone genistein in human acute
myeloid leukaemia (AML) cell models. At sub-cytotoxic concentrations, genistein
(Gen) greatly potentiates apoptosis induction by the anti-leukaemic agent arsenic
trioxide (ATO) (A); causes reactive oxygen species (ROS) over-production, as measured
by fluorescent probe H2DCFDA (B), and stimulates phosphorylation/activation
of protein kinases p38-MAPK, AMPK and ERKs (C). ROS and p38-MAPK and AMPK
activation mediates apoptosis generation, as indicated by the protective action
of the antioxidant N-acetyl-L- cysteine (NAC) and the kinase inhibitors SB203580
(SB) and “compound C” (CC), while MEK/ERK activation likely exerts a protective
action, as judged by increase in toxicity caused by kinase inhibitors PD98059 (PD)
and U0126 (U) (A) or appropriate specific siRNAs (not shown). In addition, genistein
inhibits G2 – M cell cycle transition (D) and alters the expression or phosphorylation/
activation of transition regulatory proteins (E), and also promotes cell differentiation,
as measured y cell surface expression of CD11b/CD18 (F). Both effects, cycle arrest
and differentiation, are regulated by MEK/ERK, as judged by the attenuation caused
by PD98059 or U0126 or by appropriate siRNAs (not shown), but are ROS- and
p38-MAPK-independent, as judged by the lack of effects of NAC and SB203580 ((G)
and not-shown results). An integrative scheme showing the effects of genistein on
apoptosis, cell cycle and differentiation, and their interactions, is shown in (H). These
results support the potential interest of genistein (and perhaps other flavonoides) for
apoptosis- and differentiation- based anti-tumour therapies.
PI3K/Akt/mTOR pathways, AMPK;
effects pharmacologic modulators
and siRNAs; and alterations in IKK/IκB/
NF-κB pathway. (5) Events responsible
for cell death activation and execution,
including endoplasmic reticulum stress,
activation of the “intrinsic” (mitochondrial)
executioner pathway, and secondarily of the
“extrinsic” (death receptor-mediated) pathway, and
selection between apoptotic and necrotic modes
of death. We currently use human myeloid (e.g., HL60,
U937, NB4) and lymphoid (e.g., Jurkat) leukaemia cell
models, which will be extended to primary leukaemia cells,
and occasionally cancer prostate-derived cells (LNCaP and
PC3). As a complement, we maintain collaborative work with Dr.
E. Rial’s laboratory, focused on the mitochondrial protein UCP2 as
a therapeutic target.
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Rial, E., Rodríguez-Sánchez L., Aller, P., Guisado, A., González-Barroso, M., Gallardo-Vara,
E., Redondo-Horcajo, M., Castellanos, E., Fernández de la Pradilla, R., and Viso, A. (2010).
Development of chromanes as novel inhibitors of the uncoupling proteins. Chem.
Biol. DOI: 10.1016/j.chembiol.2010.12.012.
Sánchez, Y., Simón, G.P., Calviño, E., de Blas, E., and Aller, P., (2010). Curcumin stimulates
reactive oxygen species production and potentiates apoptosis induction by the
antitumour drugs arsenic trioxide and lonidamine in human myeloid leukaemia cell
lines. J. Pharmacol. Exp. Ther. 335, 114-123.
Sánchez Y, Amrán D., de Blas, E., and Aller, P., (2010). Arsenic trioxide as an anti-tumour
agent. Mechanisms of action and strategies of sensitization. J. Appl. Biomed. 8, 199-208.
Sánchez, Y., Calle, C., de Blas, E., and Aller, P., (2009). Modulation of arsenic trioxide-
induced apoptosis by genistein and functionally related agents in U937 human
leukaemia cells. Regulation by ROS and mitogen-activated protein kinases. Chem.
Biol. Interact. 182, 37-44.
Rodríguez-García, M.E., Quiroga, A.G., Castro, J., Ortiz, A., Aller, P., and Mata, F., (2009).
Inhibition of p38-MAPK potentiates cisplatin-induced apoptosis via GSH depletion
and increased intracellular drug accumulation in growth-arrested kidney tubular
epithelial cells. Toxicol. Sci. 111, 413-423,
Sánchez, Y., Amrán, D., de Blas, E., and Aller, P., (2009). Regulation of genistein-induced
differentiation in human acute myeloid leukaemia cells (HL60, NB4). Protein kinase
modulation and reactive oxygen species generation. Biochem. Pharmacol. 77, 384-396.
73
 Eduardo Rial Zueco
Investigador Científico | rial@cib.csic.es
Doctor en Ciencias Biológicas, 1984.
Facultad de Ciencias, Universidad del País Vasco.
Estudiante Doctorado , 1982-1984.
Universidad de Dundee (Escocia).
Research Assistant, 1984-1987.
Universidad de Dundee (Escocia).
Científico Titular, 1988,
Investigador Científico, 2004.
CIB, CSIC.
Publicaciones Seleccionadas
Otros miembros | Other lab members:
Selected Publications
María del Mar González Barroso
Eva Moyano Blázquez Rial, E., and Zardoya, R. (2009) Oxidative stress, thermogenesis and evolution of uncoupling proteins. J.
Mariano Redondo Horcajo Biol. 8: 58.1-58.5.
Leonor Rodríguez Sánchez Delás, J., Notari, M., Forés, J., Pechuan, J., Porcar, M., Navarro, E., Montagud, A., Baguena, M., Peretó, J., Córdoba,
Andrea Anedda P.F., González-Barroso, M.M., Rial, E., Moya, A., and Urchueguía, J. (2009) Yeast cultures with UCP1 uncoupling
Eunate Gallardo Vara activity as a heating device. N. Biotechnol. 26: 300-306.
Pilar Zaragoza Jiménez Luévano-Martínez, L.A., Moyano, E., García de Lacoba, M., Rial, E., and Uribe-Carvajal, S. (2009) Identification of the
mitochondrial carrier that provides Yarrowia lipolytica with a fatty acid-induced nucleotide-sensitive uncoupling
protein-like activity. Biochim. Biophys. Acta Bioenerg. 1797: 81-88.
Alonso-Monge, R., Carvaihlo, S., Nombela, C., Rial, E., and Pla, J. (2009) The Hog1 MAP kinase controls respiratory metabolism
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=39 in the fungal pathogen Candida albicans. Microbiology - SGM 155: 413-23.
González-Barroso, M.M., and Rial, E. (2009) The role of fatty acids in the activity of the uncoupling proteins. Curr. Chem. Biol. 3:
180-188.

Bioenergética Mitocondrial Redondo-Horcajo, M., Romero, N., Martínez-Acedo, P., Martínez-Ruiz, A., Quijano, C., Lourenço, C.F., Movilla, N., Enríquez, J.A., Rodríguez-
Pascual, F., Rial, E., Radi, R., Vázquez, J., and Lamas, S. (2010) Cyclosporine A-induced nitration of tyrosine 34 MnSOD in endothelial cells:
Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine

role of mitochondrial superoxide. Cardiovasc Res 87: 356-365.

Rial, E., Rodríguez-Sánchez, L., Gallardo-Vara, E., Zaragoza, P., Moyano, E., and González-Barroso, M.M. (2010) Lipotoxicity, fatty acid uncoupling
Las proteínas desacoplantes (UCPs) son del oxígeno. Nuestro grupo investiga el papel and mitochondrial carrier function. Biochim. Biophys. Acta Bioenerg. 1797: 800-806.
transportadores mitocondriales implicadas en fisiológico y regulación de las UCPs y desarrolla Rial, E., Rodríguez-Sánchez, L., Aller, P., Guisado, A., González-Barroso, M.M., Gallardo-Vara, E., Redondo-Horcajo, M., Castellanos, E., Fernández de la
Pradilla, R., and Viso, A. (2011) Development of chromanes as novel inhibitors of the uncoupling proteins. Chemistry & Biology 18: 264-274.
procesos tan diversos como la termogénesis nuevos reguladores que podrían utilizarse para tratar
adaptativa, la regulación de la secreción de insulina patologías como la diabetes o la resistencia a la
o el control de la producción de especies reactivas quimioterapia de células tumorales.

L Mitochondrial Bioenergetics
as UCPs disminuyen la eficiencia
energética de la fosforilación oxidativa
mitocondrial permitiendo la reentrada
a la matriz de los protones bombeados
durante la respiración. La UCP1 es exclusiva
del tejido adiposo pardo de mamíferos y su
papel fisiológico es la producción de calor
como mecanismo de defensa frente al frío o
para eliminar un exceso de calorías ingeridas.
Desde hace más de dos décadas, trabajamos
en el esclarecimiento de su estructura,
compuestos que puedan modular la
actividad de las UCPs.
El grupo estudia también la UCP2, proteína
que se expresa en muchos tejidos y cuyo
papel principal parece ser la defensa frente al
estrés oxidativo, disminuyendo la producción
mitocondrial de especies reactivas. La
investigación se centra en su papel en las
células tumorales aunque adipocitos blancos
y células β-pancreáticas son también objeto
sistemas de defensa antioxidante, entre los
que se encuentra la UCP2. Niveles elevados
de UCP2 se han asociado incluso con la
resistencia a la quimioterapia. El grupo está
interesado en el papel fisiológico de la UCP2 The uncoupling proteins (UCPs) are mitochondrial transporters involved in processes such as the regulation
en líneas celulares tumorales centrándose en of insulin secretion, adaptive thermogenesis or the control of the production of reactive oxygen species.
los efectos que causa su inhibición actividad. Our group investigates the physiological role and regulation of the UCPs and works on the development of
El programa de búsqueda de nuevos
new regulators that could be used to treat pathologies like diabetes or the chemoresistance of tumour cells.
reguladores ha llevado a la identificación
de derivados de cromano que inhiben la
UCP2 y sensibilizan a la célula tumoral frente

mecanismo molecular de transporte y
regulación. Además, mantenemos un
activo programa de búsqueda de nuevos
de estudio. Las células tumorales presentan a drogas que causan estrés oxidativo. Se
un alto estrés oxidativo intrínseco y se analiza el uso de estos compuestos como
adaptan a esta situación aumentando los nuevos agentes antitumorales.
The uncoupling proteins (UCPs) catalyze the reentry into the matrix of the
protons that have been pumped by the respiratory chain. The activity of the
UCPs lower the energetic efficiency of the oxidative phosphorylation, dissipating
the energy of the proton gradient as heat and lowering the mitochondrial
production of reactive oxygen species. Chromane derivatives inhibit the UCPs.
Las proteínas desacoplantes (UCPs) catalizan la reentrada a la matriz de
los protones que han sido bombeados por la cadena respiratoria. La
actividad de las UCPs disminuye la eficiencia de la fosforilación
oxidativa, disipando la energía del gradiente de protones en
forma de calor y reduciendo la producción mitocondrial de
especies reactivas del oxígeno. Determinados derivados de
cromano inhiben las UCPs.
U
CPs decrease the efficiency of mitochondrial oxidative
phosphorylation by allowing the reentry into the matrix
of the protons pumped during respiration. UCP1 is only
expressed in the brown adipose tissue of mammals and its
physiological role is the production of heat either as a mechanism
of defense against cold or to eliminate excess calories ingested. For
over two decades, the group has been working on the structure,
molecular mechanism of transport and regulation of UCP1. We have
an active program to search for new chemical compounds that may
modulate the activity of the UCPs.
The group is also working on UCP2, a UCP expressed in many tissues
and whose main role appears to be the defence against oxidative
stress by decreasing the mitochondrial production of reactive species.
Our research focuses mainly on its role in tumour cells although
white adipocytes and pancreatic β-cells are also investigated. Tumour
cells present elevated intrinsic oxidative stress (probably responsible
for their oncogenic transformation) and cells adapt to this situation
by increasing the antioxidant defence mechanisms, including
the upregulation of UCP2. Increased UCP2 levels have even been
associated with resistance to chemotherapeutic agents. The group
is interested in the physiological role of UCP2 in cancer cell lines
and analyzes the consequences of its inhibition. Thus, the search
for new UCP regulators has led to the identification of chromane
derivatives that inhibit UCP2 and sensitize tumour cells to drugs that
cause oxidative stress. We are analyzing the potential use of these
compounds as novel anticancer agents.

74 75
 Santiago Rodríguez de Córdoba
Profesor de Investigación | srdecordoba@cib.csic.es
Molecular Pathology /
PhD, 1981.
Hospital Ramón y Cajal, UCM.
Otros miembros | Other lab members:
Tamara Montes Fernández Laura Blanco Sobero
Complement Genetics
Visiting Scientist 1981,
Associate Investigator 1985.
Silvana Mouron Javier Gayarre Navarro
The New York Blood Center, NY, USA. Arturo Jiménez Periañez Lara Durán Trío We perform research in genomics and molecular genetics with
Científico Titular, 1986, Rubén Martínez Barricarte Sonia Alejo Martín a specific interest in the molecular bases of human disease.
Incorporación CIB, 1989, Agustín Tortajada Alonso Our activities involve gene identification, mutation detection and
Investigador Científico, 1990.
CIB, CSIC.
Olga Criado García biochemical, cellular and structural analysis of the proteins encoded by
Sheila Pinto García
Director Unidad de Patología Molecular, 1996-2002. the disease-associated genes. A major objective is generating in vitro and
Fundación Jiménez Díaz, Madrid. Ángela Ruiz Sánchez
Profesor de Investigación, 2000.
in vivo models to increase our understanding of pathogenic mechanisms, to
CIB, CSIC.
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=21
improve diagnostics and to develop preventive and therapeutic strategies.

A
fter previous successes in mapping and identifying various regulates glycogen metabolism

Patología Molecular / Genética del Complemento disease-causing genes our current work focused on:

Disorders due to dysregulation of the complement system.

by a novel mechanism involving
the ubiquitinilation and proteosomal
degradation of GS and PTG proteins
Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine

Utilizamos técnicas genómicas y de biología molecular
con el objetivo de descifrar las bases moleculares de
enfermedades humanas. Nuestra actividad incluye
identificar los genes que las causan y caracterizar
funcionalmente sus variantes patogénicas mediante
el análisis bioquímico, celular y estructural de
las proteínas que codifican. Además, generamos
modelos in vitro e in vivo de estas enfermedades con
el objetivo de entender los mecanismos patogénicos
y desarrollar estrategias diagnósticas y terapéuticas.
Complement is central to innate immunity with roles in bacterial killing, and have provided evidence that laforin
apoptotic cell clearance, immune complex handling and modulating has a role in autophagy. Using a collection
adaptive immunity. Complement is a double-edged sword, with of animal models generated in our lab we are
uncontrolled activation contributing to pathology in many diseases. currently exploring the pathogenic mechanisms
However, the precise way in which complement shifts from protective underlying LD.
to destructive roles is not completely understood. Using in vitro and Technology transfer. Our expertise in DNA
in vivo models, we are currently addressing the study of the functional sequencing and its applications contributed to

T
ras identificar varios genes causantes
de enfermedades, nuestro trabajo
actual se centra en:
Complemento y enfermedad. El
complemento es esencial en la inmunidad
innata con papeles fundamentales en la
infección, la eliminación de restos celulares
y complejos inmunes y la modulación de la
inmunidad adquirida. Sin embargo, es una
espada de doble filo ya que su activación
descontrolada se asocia con muchas
enfermedades. La manera exacta por la
que el complemento cambia de proteger
a destruir no se entiende totalmente. Para
comprenderlo estamos caracterizando las
consecuencias funcionales de variaciones interacciona con proteínas del metabolismo
genéticas de los genes del complemento del glucógeno, hemos demostrado
asociados al síndrome hemolítico urémico que el complejo laforina-malina regula
atípico, a la enfermedad por depósitos la síntesis del glucógeno a través de la
densos y a la degeneración macular asociada ubicuitinilación y degradación proteosomal
a la edad. de glucógeno Sintasa y de PTG. También
hemos demostrado que laforina juega un
Enfermedad de Lafora (LD). LD es una
papel en autofagia. Usando una colección
enfermedad neurodegenerativa fatal y la
causa más frecuente de epilepsia progresiva de modelos animales generados en
mioclónica en Europa meridional. Dos el laboratorio estamos descifrando los
genes causan LD, EPM2A, que codifica una mecanismos patogénicos de la LD.
tirosina-fosfatasa dual denominada laforina Transferencia de tecnología. Hemos
y EPM2B, que codifica una E3-ubicuitina generado una compañía spin-off del CIB
ligasa llamada malina. Después de “clonar” (www.secugen.es) dedicada a secuenciación
el gen EPM2A y mostrar que laforina de DNA y diagnóstico molecular.
La figura muestra el árbol genealógico del primer caso de enfermedad
por depósitos densos (EDD) debido a una mutación en el gen de C3.
La caracterización funcional de esta mutación ha aportado pruebas
concluyentes en humanos indicando que la desregulación del complemento
en plasma, con la generación continua de C3b, juega un papel importante
en la patogénesis de EDD. El análisis de esta excepcional mutación ha
mostrado además algunos de los requisitos estructurales que subyacen en
el reconocimiento del sustrato y a los mecanismos de regulación por fH, DAF
y MCP, aumentando nuestro conocimiento de la activación y la regulación
de la convertasa del C3 de la vía alternativa (Véase Martínez-Barricarte et al.,
J Clin Invest. 120:3702-3712 (2010) para más detalles).
The figure shows the pedigree of the first case of dense deposit disease
(DDD) due to a mutation in the C3 gene. The functional characterization of
this mutation provided conclusive evidence in humans indicating that fluid
phase-restricted AP dysregulation, resulting in the continuous generation of
C3b in plasma, plays a major role in DDD pathogenesis. Furthermore, analysis
of this exceptional C3 mutation illustrates some of the structural requirements
underlying the substrate recognition and regulatory activities of fH, DAF and
MCP, advancing our understanding of the activation and regulation of the
AP C3 convertase. See Martínez-Barricarte et al., J Clin Invest. 120:3702-3712
(2010) for details.
consequences of different genetic variations of the complement
genes associated to atypical hemolytic uremic syndrome, dense
deposit disease and age-related macular degeneration.
Lafora Disease (LD). LD is a fatal neurodegenerative disorder and
the most frequent cause of progressive myoclonus epilepsy in
Southern Europe. Two genes cause LD, EPM2A encoding laforin, a
dual protein tyrosine phosphatise and EPM2B encoding malin, a
E3-ubiquiting ligase. We cloned EPM2A and later demonstrated that
laforin interacts with proteins implicated in glycogen metabolism.
Recently we showed that the complex formed by laforin and malin
La figura muestra el análisis mediante microscopia confocal de las proteínas asociadas
a los Cuerpos de Lafora (LB) en ratones Epm2B -/-, un modelo de Enfermedad de
Lafora. Los ratones Epm2B -/- presentan dos tipos de LBs, grandes redondos y
uniformes y pequeños e irregulares. La reconstrucción con imágenes seriadas de
los LBs en el tronco cerebral de estos ratones demuestra que los LBs irregulares
pequeños se tiñen uniformemente para laforina y ubiquitina (A), tal vez sugiriendo
un intento de eliminar los LBs en su etapa inicial de formación. La ubiquitina está
ausente en los LBs grandes donde, además de laforina, está presente la glucógeno
sintasa (MGS) (B). En estos LBs, laforina se localiza predominantemente en el centro
y MGS está en la superficie (C), lo que podría indicar que el glucógeno se acumula
continuamente manteniendo estas estructuras en crecimiento.
The figure shows the confocal microscope analysis of proteins associated with Lafora
Bodies (LB) in the Epm2B-/- mouse, a model of Lafora Disease. Epm2B-/- mice present
two different types of LBs, big round uniform structures and small irregular ones. Confocal
serial reconstruction of the LBs in the brainstem of these mice demonstrates that the
small irregular LBs stain uniformly for laforin and ubiquitin (A), perhaps suggesting an
attempt to eliminate the LBs at this early stage of formation. Ubiquitin is absent in the
round LBs, where, in contrast skeletal muscle glycogen synthase (MGS) is present (B). In
these LBs, laforin localizes predominantly at the core and MGS is in the surface (C), perhaps
suggesting that glycogen is continuously accumulating in these growing structures.
generate a spin-off company in the CIB (www.secugen.es)
dedicated to DNA sequencing and molecular diagnostics.
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Martínez-Barricarte R.*, Heurich M.*, Valdes-Cañero F., Vázquez-Martul E.,
Torreira E., Montes T., Tortajada A., Pinto S., López-Trascasa M., Morgan BP.,
Llorca O., Harris CL. and Rodríguez de Córdoba S. Human C3 mutation
reveals a mechanism of Dense Deposit Disease pathogenesis and provides
insights into complement activation and regulation. J Clin Invest.
120:3702-3712 (2010). (*Equal first author).
Hakobyan S*, Tortajada A*, Harris CL, Rodríguez de Córdoba S and
Morgan PB. Variant-specific quantification of factor H in plasma identifies
null alleles associated with atypical Hemolytic Uremic Syndrome. Kidney
Int. 78:782-788 (2010). (*Equal first author).
Rodríguez de Córdoba S. aHUS: a disorder with many risk factors. Blood.
115:158-160 (2010).
Moreno-Navarrete JM, Martínez-Barricarte R, Catalán V, Sabater M, Gómez-
Ambrosi J, Ortega FJ, Ricart W, Blüher M, Frühbeck G, Rodríguez de Córdoba
S and Fernández-Real JM. Complement Factor H is expressed in adipose
tissue in association with insulin resistance. Diabetes 59:200-9 (2010).
Torreira E*, Tortajada A*, Montes T*, Rodríguez de Córdoba S (*#) and Llorca
O (*#). Coexistence of closed and open conformations of complement factor
B in the alternative pathway C3bB (Mg2+) proconvertase. J. Immunol.
183:7347-7351 (2009) (*Equal first and last author, # correspondence author).
Abarrategui-Garrido C*, Martínez Barricarte R*, López-Trascasa M,
Rodríguez de Córdoba S and Sánchez-Corral P. Characterization of
complement factor H-related (CFHR) proteins in plasma reveals novel
genetic variations of CFHR1 associated with atypical Hemolytic Uremic
Syndrome. Blood. 114: 4261-4271 (2009). (*Equal first author).
Tortajada A, Montes T, Martínez-Barricarte R, Morgan PB, Harris CL and
Rodríguez de Córdoba S. The disease-protective complement factor
H allotypic variant Ile62 shows increased binding affinity for C3b and
enhanced cofactor activity. Hum Mol Genet. 18:3452-61 (2009).
Montes T, Tortajada A, Morgan BP, Rodríguez de Córdoba S and Harris CL.
Functional basis of protection against age-related macular degeneration
conferred by a common polymorphism in complement factor B. Proc.
Natl. Acad Sci USA. 106:4366-4371 (2009).
Torreira E*, Tortajada A*, Montes T*, Rodríguez de Córdoba S (*#) and
Llorca O (*#). 3D structure of the C3bB complex provides insights into
the activation and regulation of the complement alternative pathway
convertase. Proc. Natl. Acad Sci USA. 106:882-887 (2009). (*Equal first
and last author, # correspondence author).
Premio
Award
Premio Nacional de Genética por las contribuciones en investigación
de la genética humana y sus aplicaciones (2009).

76 77
 José María Sánchez-Puelles González-Carvajal
Investigador Científico | jmspuelles@cib.csic.es
Role of the Hypoxia
Doctor en C.C. Biológicas, 1886, UCM.
Investigador Postdoctoral, 1987-1988,
Otros miembros | Other lab members:
Inmaculada Royo González
Inducible Factor (HIF) in
Instituto Max-Plank en Tuebingen, Alemania.
1988-1990, CSIC.
Investigador Senior, 1990-1992.
Almudena Garrido Gallardo
Nagore Marín Ramos
self-renewal and differentiation
Merck, Sharp & Dohme. Ana Isabel Muro
Director de Microbiología, 1992-1999. Hypoxia factors are commonly associated with bad prognosis in several
SmithKline Beecham
cancer diseases. Recent literature endow HIF2α a pivotal role in the
Director de Investigación, 1999-2003. Pharmamar.
Jefe de Dpto. de Farmacología Molecular y
undifferentiated status of stem cells, thus expanding its biology from the
Coordinador de Descubrimiento de Fármacos, 2004- normal angiogenic function, to the maintenance, the progression and the
2008. Centro de Investigación Príncipe Felipe.
Investigador Científico 2008, CIB, CSIC.
aetiology of tumor subpopulations known as cancer initiating cells or cancer
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=65
stem cells. Our group focus on the role of HIF2α in the control of the self-renewal
and differentiation processes, dissecting the connections with other pathways to
El Factor Inducible de Hipoxia (HIF); mecanismos approach pharmacological-oriented research

de actuación en los procesos de autorrenovación y

Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine

H
IFα, Cancer & Stemness. availability of novel HIFα modulators permits to

diferenciación celular Hypoxia is associated with the undifferentiated status

El objetivo del grupo de Farmacología Molecular
es el estudio de las conexiones entre las proteínas
HIFα y más específicamente HIF2α, con las rutas
de señalización celular que controlan las funciones
de troncalidad y diferenciación celular. Nuestros
resultados deben permitir la indicación de nuevos
mecanismos para la actuación farmacológica
sobre las isoformas α, que tutelan los procesos de
progresión tumoral por la generación o expansión de
las células iniciadoras del tumor o cancer stem cells.
of stem cells and the function of HIFα proteins in
maintaining multipotency was only found quite recently. We
further characterize the use of epSPCs model in
the spinal cord injury regeneration under the strict
regulatory rules.
have recently demonstrated that Sox-2 is a target gene of HIF2α
and this result put this isoform in the upper hierarchy of the
factors that govern pluripotency. Our recent results show that
Los resultados obtenidos por el análisis FatiGO en las células de rata
HIF2α regulates the differentiation of ependymal neural stem
madre ependimarias (epSPC) después del tratamiento con 0.5 μM
cells (epSPCs) through direct regulation of Sox-2 and Oct4 and, FM19G11. Los genes que participan en dos grupos relacionados funcionales
undirectly, of Nanog and Tgf-α. We have recenlty described a que incluyen procesos como el ciclo celular o división celular, así como la
respuesta al daño del ADN/replicación del ADN se activaron encélulas epSPC
novel family of HIFα inhibitors with a novel mode of action,
tratadas con el fármaco. La intensidad del color de las barras se representa según
based on the triggering of the DNA damage response (DDR), el tipo de puntuación obtenida.

Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Fernández Jimenez F.J., Moreno Manzano V., Lucas
Dominguez R, Sánchez-Puelles J.M. “Hypoxia causes
down-regulation of Mismatch Repair System and
genomic instability in Stem Cells” 2008, Stem Cells
26,8, 2052- 2062.
Moreno Manzano V., Fernández Jimenez F.J., García-
Roselló M., Laínez S., Erceg S., Calvo M.T., Lloret M.,
Planell-Cases R., Sánchez-Puelles J.M., Stojkovic, M.
“Activated spinal cord ependymal stem cells rescue
neurological function”. 2009, Stem Cells. 27(3):733-
743.
Moreno Manzano V., Fernández Jimenez F.J., Aceña
J.L., Fustero-Lardies, S., Erceg Dopazo J., Montaner
D., Stojkovic, M., Sánchez-Puelles J.M. “FM19G11, a
new HIF modulator, affects Stem Cell differentiation
status” 2010, J. Biol. Chem. 285: 1333-1342.
Fernández Jimenez F.J., Moreno Manzano V.,
Mateos-Gregorio P., Royo I. Ercerg S., Murguía J.R.,
Sánchez-Puelles J.M. “ FM19G11: A new modulator
of HIF that links mTOR activation with the DNA
damage checkpoint pathways”. 2010, Cell Cycle 9,
14, 2803-2813.
H
IFα, Cancer y Troncalidad.
Nuestros resultados demuestran
que HIF2α controla la diferenciación
de células troncales neurales de rata, por
la regulación directa de Sox-2 y de Oct-4 e
indirecta de Nanog y Tgf-α, posicionando
esta isoforma de HIF en la más alta jerarquía
de la troncalidad celular (stemness). La
demostrada inducción específica de estos
factores de troncalidad por HIF2α pudiera
explicar los resultados que asocian esta
isoforma con las subpoblaciones tumorales
mas indiferenciadas, que son los que
presentan mayor resistencia frente a los
tratamientos con quimio y radioterapias y
son objeto de nuestro presente proyecto.
associated with G1/S-phase arrest in a p53-dependent manner Influence of FM19G11, the new modulator of HIF, in cells grown under normoxia.
El cabeza de serie FM19G11 de una nueva
and due to rapid hyper-activation of the growth signaling Over/under term representation in gene ontology biological processes obtained by
familia de inhibidores de HIFα, favorece
la diferenciación de células neurales
pathway through mTOR. The discovery of new drugs that microarray technology. Results obtained by FatiGO analysis in rat ependymal stem
modulate this novel mTOR/DDR pathway may contribute to the
cells (epSPC) after treatment with 0.5 μM FM19G11. Genes involved in two related
functional groups including processes such as cell cycle/cell division as well as DNA
ependimarias de rata (epSPCs) utilizadas en
better understanding of the molecular mechanisms openings damage response/DNA replication were upregulated in epSPC treated with the drug.
el modelo preclínico de reparación del daño
up new strategies for anti-tumor therapies. In addition, the The color intensity of bars is depicted according to the obtained score rate.
en la medula espinal. FM19G11 muestra un
novedoso modo de acción ya que induce
la apoptosis celular tras la parada en la fase
G1/S y la rápida activación de mTOR a partir
de la vía de señalización del daño a ADN
(DDR), en células tumorales de colon p53
proficientes. Esperamos que estos fármacos
sean pronto objeto de licencia al sector
privado, para completar su estudio en fases
más avanzadas bajo estrictras condiciones
regulatorias.

Patentes
Patents
Garijo R. (11 inventores), Sánchez-Puelles J.M.
Composición farmacéutica para inhibir el factor de
transcripción inducible por hipoxia, moduladores de
procesos patológicos de angiogénesis, oncogénesis,
inflamación, apoptosis y terapia celular. PCT
ES2009/000135, propiedad Centro de Investigación
Príncipe Felipe /ISCIII.
Rodríguez-Jimenez F.J., Stojkovic M., Sánchez-Puelles
J.M., Moreno-Manzano V. Utilización de composición
farmacéutica para el tratamiento de diabetes, obesidad
y lesiones en el sistema nervioso central. P201000373,
Fecha de prioridad Mayo 2010, propiedad Centro de
Investigación Principe Felipe /ISCIII.

78 79
 Jose María Rojo Hernández
Investigador Científico | jmrojo@cib.csic.es
Doctorado, 1978.
Universidad Complutense de Madrid.
Otros miembros | Other lab members:
Maria Luisa del Pozo del Campillo
T cell activation
Postdoctoral Fellow, 1980-81.
Institute of Animal Physiology, A.R.C. Cambridge, U.K. Yenny Acosta
Research Associate and Fulbright Fellow, 1986-88. Maria Paz Zafra Our interest focuses on the activation of T lymphocytes, as a
Yale University School of Medicine, New Haven, CT, U.S.A.
population essential to the development of effective cell- and
Científico Titular y Jefe de grupo, 1988,
Investigador Científico, 1990. antibody-mediated adaptive immune responses to foreign antigens,
CIB, CSIC.
but also in autoimmune diseases. We have analyzed the structure and
functional mechanisms of the antigen receptor complex of T cells (TCR/CD3
complex) as well as the effects of surface molecules of T lymphocytes, like
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=25 ICOS, that enhance and/or modifiy TCR/CD3 complex signals.

O
ur main interest is determining the role of the Inducible
Costimulator (ICOS, H4) in T lymphocyte activation
and adhesion, as well as its impact on autoimmune
Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine
In cooperation with other groups,
we have continued our studies on
the variability of the CD3ε chains within

inflammatory diseases including experimental autoimmune
encephalitis (EAE), or its interest as a therapeutic target (Grant
AES, PI10/00650 IS Carlos III). ICOS is expressed by activated T cells,
taking part in the differentiation of effector T lineages, particularly
Th2 and Tfh. It also plays a role in the homeostasis of lymphocyte
subpopulations including FoxP3+ Treg and other regulatory T cells.
ICOS and CD28 are structurally and functionally similar, sharing
sequence motifs (YMxM) involved in PI3-kinase binding and
signaling. Our recent results show that the p110α PI3-kinase
catalytic subunits play a major role in ICOS downstream signaling,
while confirming previous data on the role of p110δ catalytic
subunits. With these data in mind, our aim is to develop models that
selectively express ICOS in defined functional populations. At the
same time, we are interested in exploring the p110α PI3-kinase as a
target to control immune responses.
the TCR/CD3 antigen receptor complex
of T lymphocytes. We have recently shown
that this is general phenomenon in different
vertebrate species including humans, and
will go on to determine its role in effector T cell
lineage differentiation. Last, we have made further
contributions to our previous studies on the role of
complement regulatory proteins (MCP (CD46), Crry/p65)
as costimulators of CD4+ T lympocytes and receptors of
pathogenic bacteria.

Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Bensi, T., Mele, F., Ferretti, M., Norelli, S., El Daker, S.,
Chiocchetti, A., Rojo, J.M., Cauda, R., Dianzani, U.,
Savarino, A. (2009) Evaluation of the antiretroviral
effects of a PEG-conjugated peptide derived from
human CD38. Expert Opin Ther. Tar. 14, 141-152.
Bello, R., Feito, M.J., Ojeda, G., Portolés, P., and Rojo,
J.M. (2009) N-terminal negatively charged residues
in CD3ε chains is a phylogenetically conserved
trait potentially yielding isoforms with different
isoelectric points: Analysis of human CD3ε chains.
Immunol. Lett. 126, 8-15.
Activación de Linfocitos T Los ligandos de la molécula coestimuladora
ICOS adsorbidos a una matriz sólida inducen un
alargamiento marcado de linfocitos T CD4+ICOS+ con
aparición de numerosas microespículas o filopodios
Los linfocitos T son una población esencial para el desarrollo de claramente detectables al teñir los filamentos de actina
respuestas inmunitarias celulares y humorales efectivas normales y (A). Tanto el alargamiento celular como la aparición de
microespículas dependen de la actividad PI3-cinasa,
autoinmunes. Nuestro grupo analiza la activación de estos linfocitos, y concretamente, dependen de la isoforma catalítica
estudiando la estructura y función del complejo del receptor para p110α , pero no de la isoforma p100δ, como se
muestra en la figura empleando inhibidores específicos
antígeno de los linfocitos T (complejo TCR/CD3), y de moléculas de la de p110α (B) y p110δ (C) (Acosta et al., 2010).
superficie de los linfocitos T como ICOS, capaces de aumentar y modificar Ligands of the T lymphocyte costimulatory molecule
ICOS adsorbed to solid surfaces induce a marked
las señales del complejo TCR/CD3. elongation of CD4+ICOS+ T cells, together with abundant
microspikes or filopodia clearly detectable upon stining
of polymerized actin (A). Both cell elongation and

Mahtout, H., Chandad, F., Rojo, J.M., and Grenier,
D. (2009) Porphyromonas gingivalis mediates the
shedding and proteolysis of complement regulatory
protein CD46 expressed by oral epithelial cells. Oral
Microbiol. Immunol. 24, 396-400.
Portolés, P., and Rojo, J.M. (2009) The TCR/
CD3 complex: Opening the gate to successful
vaccination. Curr. Pharm. Design 15, 3290-3300.
Dianzani, D., Minelli, R., Mesturini, R., Chiocchetti, A.,
Barrera, G., Sblattero, D., Yagi, J., Rojo, J.M., Fantozzi,
R., and Dianzani, U. (2010) B7h triggering inhibits
umbilical vascular endothelial cell adhesiveness to
colon carcinoma cell lines and polymorphonuclear
cells. J. Immunol. 185, 3970-3979.
Mahtout, H., Chandad, F., Rojo, J., and Grenier,
D. (2010) Fusobacterium nucleatum binding to
complement regulatory protein CD46 modulates
the expression and secretion of cytokines and
metalloproteinases by oral epithelial cells. J.
Periodontol (doi:10.1902/jop.2010.100458).
Acosta, Y.Y., Zafra, M.P., Ojeda, G., Seren-Bernardone, I.,
Dianzani, U., Portolés, P., and Rojo, J.M. (2010) Biased
binding of Class IA phosphatidyl inositol 3-kinase
subunits to Inducible Costimulator (CD278). Cell.
Mol. Life Sci. (doi: 10.1007/s00018-010-0606-1).
E
stamos analizando el papel del
coestimulador ICOS (H4, Inducible
Costimulator, CD278) en la activación
y adhesión de linfocitos T, su impacto en
enfermedades inflamatorias autoinmunes
como la encefalomielitis alérgica
experimental (EAE) y su interés como diana
terapéutica (Proyecto AES, PI10/00650 IS
Carlos III). ICOS se expresa típicamente en
células T activadas e interviene la generación
de células T efectoras de diferentes linajes,
especialmente Th2 y Tfh. Además, interviene
en la homeostasis de subpoblaciones de
linfocitos, incluyendo las células Treg FoxP3+,
y otros linfocitos T reguladores. ICOS y CD28
son estructural y funcionalmente semejantes,
conservando motivos de secuencia YMxM
implicados en la señalización celular por
medio de PI-3 cinasa. Recientemente hemos
observado que las subunidades catalíticas
p110α de la PI3 cinasa son preponderantes
microspike formation are dependent on PI3-kinase
en las señales de ICOS, aunque confirmando activity, and specifically on p110α (but not p110δ)
la función de p110δ en la activación de catalytic subunits, as shown in the figure using specific
linfocitos T descrita previamente. Para pharmacological inhibitors of p110α (B) and p110δ (C)
isoforms (Acosta et al., 2010).
profundizar en las funciones de ICOS
estamos desarrollando, por un lado, modelos
de expresión génica controlada en distintas
subpoblaciones, por otro, el papel de la PI3
cinasa p110α como diana para el control de
respuestas inmunitarias.
En colaboración con otros grupos,
continuamos estudiando la variabilidad de
las cadenas CD3ε del complejo TCR/CD3
de linfocitos T (un fenómeno que hemos
observado en distintas especies incluyendo
la humana) en la señal del receptor para
antígeno, y en la diferenciación de linajes
efectores de linfocitos T. Por último,
nos interesa el papel de reguladores de
Complemento (MCP (CD46), Crry/p65) como
coestimuladores de linfocitos T CD4+ o
receptores de bacterias patógenas.

80 81
 Flora de Pablo Enrique J. de la Rosa Investigadoras del equipo | Staff Scientists:
Profesora de Investigación | fdepablo@cib.csic.es Investigador Científico | ejdelarosa@cib.csic.es  Patricia Boya (Grupo emergente 2011) Catalina Hernández Sánchez Teresa Suárez
MD, 1975, PhD, 1979. Universidad de Salamanca. PhD en Ciencias Biológicas, 1984.
Universidad Autónoma de Madrid y CBM, CSIC. Otros miembros | Other lab members:
MIR Endocrinología y Nutrición. Salamanca.
Postdoctoral, 1986-1989. José Mª Adrover Violeta Gómez Vicente Cayetana Murillo
Adjunta, Servicio de Endocrinología, 1982-84.
Instituto Max-Planck de Biología del Desarrollo.
Hospital Sta. Cruz y San Pablo. Barcelona. Noemí Álvarez-Lindo Alberto Hernández-Pinto Ana Mª Robles
Tübingen, Alemania.
Postdoctoral Visiting Fellow, 1980-82 & Ana I Arroba Esther Hernández Natalia Rodríguez Muela
Postdoctoral, 1989-1992.
Visiting, Scientist, 1984-91. Instituto Cajal. CSIC, Madrid.
National Institutes of Health. Bethesda, U.S.A. Jimena Baleriola Enrique Martínez Campos Patricia Vázquez
Científico Titular, 1993, Marta Fierro José Luis Martínez
Visiting Scientist, 1996. California Institute of
Investigador Científico, 2002.
Technology. Pasadena, California, U.S.A. Ane Garciandía Mª Ángeles Mellén
CIB, CSIC, Madrid.
Directora General, 2007.
Instituto de Salud Carlos III, Madrid.
Investigadora Científica, 1991,
Profª. de Investigación, 2003. CIB, CSIC.
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=20

Laboratorio 3D:
Desarrollo, Diferenciación, Degeneración
Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine

Abordamos problemas biológicos básicos en sistemas fisiológicos de regulación de la proliferación, la

modelo del desarrollo, con el objetivo de entender diferenciación, la competición y la muerte celulares,
los mecanismos que subyacen a la formación de
varios tejidos. Utilizando diversos vertebrados
así como su desregulación en situaciones patológicas.
En particular, hemos planteado la posible traslación 3D Lab: Development, of insulin) is a potent antiapoptotic factor during
development, capable of activating several cell survival

(pollo, ratón), un eucariota inferior (Dictyostelium) y
células pluripotentes, estudiamos los mecanismos
Differentiation, Degeneration
pathways and, thus, we have started to study its possible
biomédica de nuestras observaciones en modelos de
use in human therapy. Proinsulin delays photoreceptors
degeneración del sistema nervioso. apoptosis in a mouse model of Retinitis Pigmentosa and
prolongs visual function. The spin-off created by our group,

L
a muerte celular programada es un
proceso fisiológico en el desarrollo que
se encuentra alterado en numerosas
patologías. Hemos caracterizado su
incidencia y regulación en el desarrollo del
sistema nervioso, especialmente en la retina.
Procesos de generación y reparación de
roturas de doble hebra en el DNA subyacen
a la incidencia de apoptosis entre neuronas
recién generadas. Por su parte, la proinsulina
es un potente factor antiapoptótico durante
el desarrollo, capaz de activar varias vías de
supervivencia, por lo que hemos iniciado el
estudio de su posible aplicación terapéutica.
visual. ProRetina Therapeutics S.L. (ver pag. 160),
spin-off  impulsada por nuestro grupo, está
desarrollando una posible terapia aplicable
en clínica. También hemos abordado el
papel de la autofagia durante el desarrollo y
la diferenciación neuronal. El trabajo en esta
línea ha sido liderado por Patricia Boya que,
recientemente, ha sido promovida a Grupo
emergente (ver pag. 136). Por otro lado,
empleamos D. discoideum para encontrar
nuevas proteínas implicadas en los
mecanismos universales de diferenciación
celular. Hemos identificado un nuevo gen
que codifica un co-represor transcripcional,
en colaboración con físicos y químicos del
CSIC y la UAB,  introducir microdispositivos
de silicio en el interior de células de diversos
linajes sin interferir con la supervivencia.
Finalmente, utilizando células madre
embrionarias de ratón, hemos demostrado
que la dopamina tiene efecto estimulante
de la diferenciación durante la cardiogénesis
y, en el embrión in vivo, el enzima iniciador
de la síntesis de catecolaminas, la Tirosina
Hidroxilasa, participa en la formación  y
regionalización de las cámaras cardiacas. En
la actualidad estamos analizando a través
de qué receptores y rutas de señalización
We address basic biological problems in model
systems of development with the aim to understand
the underlying mechanisms of formation of various
tissues. We use vertebrate models (chick, mouse), a
lower eukaryote (Dictyostelium) and pluripotent cells
to study the physiological mechanisms of regulation
of cell proliferation, differentiation, competition and
death, together with the alteration of these processes
in pathological situations. We have additionally
given a translational focus to the study of models of
nervous system degeneration.
ProRetina Therapeutics S.L. (see page 160) is developing a
possible therapy applicable in clinic. We have also analyzed the
role of autophagy during neural development and differentiation.
This research line has been coordinated by Patricia Boya who,
recently, has been promoted to new emerging Group (see page 136).
Additionally, we use D. discoideum to find new proteins involved in
the universal mechanisms of cell differentiation. We have identified a
new gene that codifies a transcriptional co-represor, PadA, and we
are identifying the molecular mechanisms implicated in cellular
competition. We have succeeded, in collaboration with physicists
and chemists of the CSIC and the Autonomous University of
Barcelona, in introducing silicon microdevices intracellularly (in
various types of cells) without interfering with cell survival. Finally,
using mouse stem cells, we have demonstrated that dopamine has a

La proinsulina retrasa la apoptosis de
fotorreceptores en ratones modelo de
retinosis pigmentaria y prolonga su función
PadA y estamos identificando los
mecanismos moleculares que intervienen en
la competición celular. Hemos conseguido,
P
puede actuar la dopamina y la función de la rogrammed cell death is a physiological process of development
TH en otros órganos en desarrollo, como es that is also altered in different diseases. We have characterized
el páncreas. its incidence and regulation in the development of the nervous
system, especially in the retina. Double DNA strand brakes are
generated and repaired, and this process impacts on the newly
generated neurons death. In turn, proinsulin (the molecular precursor
stimulatory effect in cardiomyocites differentiation; in vivo, in chick
embryos. Tyrosine Hydroxylase (TH, the rate limiting enzyme of
catecholamines synthesis) participates in the regionalization of
cardiac chambers. Now, we are studying through which receptor and
intracellular signaling pathways may be acting dopamine, as well as
the function of TH in other developing organs, such as the pancreas.

Publicaciones Seleccionadas Gómez-Martínez R/ Vázquez P, Duch M, Muriano A, Pinacho D, Sanvicens N, Sánchez-

Roturas de doble banda del DNA, y su reparación
activa, coexisten con la muerte celular en la retina
embrionaria de ratón de E14.5. Las retinas recién
disociadas se montaron en plano y se hizo co-tinción
para la histona γH2AX y los marcadores de apoptosis
TUNEL (a) o Anexina V (b). Las células doblemente
marcadas están indicadas con una flecha. La
distribución focal nuclear de γH2AX (c y f ), DNA-PK
(d) y pATM (e y f ) se visualizó en células de retina
disociada.
DNA double strand breaks, their active repair and
programmed cell death, coexist in the E14.5 mouse
Nuestro grupo se creó en 1991, inicialmente con el retina. Freshly dissected retinas were flat mounted and
nombre de “Factores de Crecimiento en el Desarrollo costained for γH2AX and for the apoptotic markers
de Vertebrados”, y pasó a llamarse “Lab 3D” en 2007, TUNEL (a) or Annexin V (b). Double-stained cells are
al consolidarse nuevas líneas  temáticas. La foto indicated with an arrow. The focal nuclear distribution
corresponde a la Memoria del CIB 1991-92.
of γH2AX (c and f ), DNA-PK (d) and pATM (e and f ) was
Our group was created in 1991, initially with the name visualized in retinal dissociated cells.
of “Growth Factors in vertebrate development” and was
renamed “3D Lab” in 2007 when new research lines
got consolidated. The picture corresponds to the CIB
Scientific Report of 1991-92.
Selected Publications
López-Sánchez C/ Bártulos O, Martínez-Campos E, Gañán C, Valenciano AI, García-
Martínez V, De Pablo F, Hernández-Sánchez C [2010] Tyrosine hydroxylase is expressed
during early heart development and is required for cardiac chamber formation.
Cardiovasc. Res. 88:111-120. Editorial Comment: Thomas Brandt. Exciting news:
Catecholamines in induction and regionalization of the heart. Cardiovasc. Res. 88,1-2.
Galardi-Castilla M, Garciandía A, Suárez T, Sastre L [2010] The Dictyostelium discoideum
acaA gene is transcribed from alternative promoters during aggregation and
multicellular development. PLOS One 5(10):e13286.
Baleriola J, Suárez T, de la Rosa EJ [2010] DNA-PK promotes the survival of young
neurons in the embryonic mouse retina. Cell Death Differ. 17:1697-1706.
Mellén MA, de la Rosa EJ/Boya P [2009] Autophagy is not universally required
for phosphatidyl-serine exposure and apoptotic cell engulfment during neural
development. Autophagy 5:964-972.
Salazar M, Carracedo A, Salanueva IJ, Hernández-Tiedra S, Lorente M, Egia A, Vázquez
P, Blázquez C, Torres S, García S, Nowak J, Fimia GM, Piacentini M, Cecconi F, Pandolfi
PP, González-Feria L, Iovanna JL, Guzmán M, Boya P, Velasco G [2009] Cannabinoid
action induces autophagy-mediated cell death through stimulation of ER stress in
human glioma cells. J. Clin. Invest. 119: 1359-1372.
Baeza F, Boya P, de la Rosa EJ, Esteve J, Suárez T/ Plaza JA [2010] Intracellular Silicon
Chips in Living Cells. Small 6:499-502.
Hurtado-Chong A, Yusta-Boyo MJ, Vergaño-Vera E, Bulfone A, De Pablo F, Vicario-Abejón
C [2009] IGF-I promotes neuronal migration and positioning in the olfactory bulb and
the exit of neuroblasts from the subventricular zone. Eur. J. Neurosci. 30:742-755.
Patentes y Premios | Patents & Awards
C. Hernández-Sánchez, F. De Pablo Dávila, O. Bártulos Encinas and A. Aránega. Use of
catecholamine for stem cell differentiation to cardiomyocites.
International priority number: PCT ES09/070339.
E. J. de la Rosa Cano, F. de Pablo Dávila, P. Boya Tremoleda, S. Corrochano Sánchez, P.
de la Villa Polo, R. Barhoum Tannous and F. Bosch Tubert. Uso de la proinsulina para la
elaboración de una composición farmacéutica neuroprotectora, composición terapéutica
que la contiene y sus aplicaciones.
Número de patente Española: ES2331342B1. Concedida 21.9.2010. Solicitud de
extensión de PCT a EU, EEUU, Japón, Australia en 2009. En explotación por ProRetina S.L.
Premio FIN-RETINA 2010 otorgado anualmente por la Asociación Retina Navarra a
ProRetina S.L. Se ha premiado la apuesta de la empresa (www.proretina.com) por la
investigación en la búsqueda de soluciones farmacológicas para la retinosis pigmentaria.

82 83
 Ángeles Martín Requero
Investigadora Científica | amrequero@cib.csic.es
PhD. 1978.
Universidad Complutense de Madrid.
Postdoctoral, 1979-1982.
University of Pennsylvania, Philadelphia, USA.
Profesora Titular, 1982-1983.
Universidad de Extremadura.
Científica Titular, 1985. CIB, CSIC.
Visiting Scientist ,1996-1997.
Medical School, University of California (UCLA),
Los Angeles USA.
Investigadora Científica, 2008.
CIB, CSIC.
Bases celulares y Moleculares de la Enfermedad de
Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine
Alzheimer y otras Demencias
Nuestro grupo pretende desvelar la posible
contribución de fallos en el control del ciclo celular a
la neurodegeneración en la enfermedad de Alzheimer
y otras demencias, así como en otros trastornos
neurodegenerativos como la Esclerosis Lateral
Amiotrófica o Parkinson. Este campo de investigación
se inició hace solamente unos pocos años pero se
admite hoy en día que una entrada aberrante en ciclo
B
ases celulares y  moleculares de
la enfermedad de  Alzheimer.
Alteraciones extraneurales.
Una de las características de la enfermedad
de Alzheimer (EA) es la degeneración
neuronal en regiones del cerebro asociadas
con las funciones cognitivas. En los
últimos años se ha considerado que la
entrada aberrante de ciertas neuronas en
el ciclo celular induce muerte neuronal.
Nos proponemos estudiar algunos de los
mecanismos de control del ciclo celular y/o
supervivencia, que pueden contribuir a la
patología de EA, utilizando como modelo
experimental linfocitos inmortalizados de
EA. Tratamos de demostrar que los cambios
que se observan en proteínas reguladoras
del ciclo celular en linfoblastos de pacientes
de EA tienen interés diagnóstico. Por otra
parte, utilizamos ratones dobles transgénicos
(APP/PS1) para investigar 1) si los cambios
funcionales observados en linfocitos son
reflejo de alteraciones similares en células
neuronales y 2) si los cambios en proteínas
reguladoras del ciclo celular ocurren antes
del deterioro cognitivo y/o la aparición de
placas de amiloide.
Déficit de progranulina y demencia
frontotemporal (FTLD-TDP).
La degeneración del lóbulo frontotemporal
(FTLD) designa a un grupo heterogéneo
de procesos neurodegenerativos que
comportan deterioro cognitivo asociado
a sintomatología motora o de lenguaje,
84
Otros miembros | Other lab members:
Noemí Esteras Gallego
Carolina Alquezar Burillo
Fernando Bartolomé Robledo
Javier Eizaguirre Ruiz
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=57
celular, por parte de ciertas neuronas, es una causa
importante de la pérdida neuronal por apoptosis.
La originalidad de nuestra propuesta radica en la
utilización de células extraneurales de pacientes para
estudiar los procesos de proliferación y apoptosis
asociados a la neurodegeneración. Estos estudios se
complementan con cultivos de células neuronales y
modelos murinos.
trastornos de comportamiento y cambios causan generalmente la haploinsuficiencia
de personalidad con preservación inicial de de PGRN. Estamos tratando de desvelar la
la memoria. La forma más común de FTLD influencia patogénica de  mutaciones en
se caracteriza por presentar inclusiones el gen PGRN, en la degeneración neuronal
neuronales citoplásmicas tau-negativas asociada a FTLD-TDP. Para este fin, utilizamos
y ubiquitin-positivas, compuestas por células periféricas de pacientes portadores
la proteína TDP-43. La mayor parte de de una mutación en PGRN, así como células
los casos con historia familiar de FTLD- neuronales de ratones deficientes en PGRN y
TDP presentan mutaciones en el gen de células SH-S5Y5 después de haber silenciado
Progranulina (PGRN). Estas mutaciones el gen PGRN.
Publicaciones Seleccionadas | Selected Publications
C. Alquezar, N. Esteras, F. Bartolomé, J.J. Merino, A. Alzualde, A. López
de Munaín, A. Martin-Requero. Alteration in cell cycle-related proteins
in lymphoblasts from Carriers of the c.709-1G>A PGRN mutation
associated with FTLD-TDP dementia. Neurobiol. Aging, 2011
doi:10.1016/j.neurobiolaging.2010.11.020.
F. Bartolomé, U. Muñoz, N. Esteras N, C. Alquezar, A. Collado, F. Bermejo-
Pareja, A. Martín-Requero . Simvastain overcomes the resistance to
serum withdrawal-induced apoptosis of lymphocytes fro Alzheimer’s
disease patients. Cell Mol Life Sci. 67:4257-4268 (2010).
N. Cuevas, U. Muñoz, Bartolomé F., N. Esteras, C. Alquezar, A. Martín-
Requero. Cell cycle and Alzheimer¡s disease. Studies in nonneuronal
cells. (Review). J. Appl. Biomed. 8:121-130 (2010).
T. Vargas, MJ Bullido, A. Martinez-Garcia, D. Antequera, J. Clarimon, M,
Rosich-Estrago, A. Martin-Requero, I. Mateo, E. Rodriguez-Rodriguez, E.
Vilella-Cuadrada, A. Frank A, A- Lleo, L. Molina-Porcel, P. Blesa, O. Combarros,
T. Gomez-Isla, F. Bermejo-Pareja, F. Valdivieso F, E. Carro. A megalin
polymprphism associated with promoter activity and Alzheimer’s disease
risk. Am J Med Genet B Neuropsychiatr Genet. 153 (B) 895-902 (2010).
Cellular and Molecular Basis of Alzheimer´s
Disease and other Dementias
Our group is engaged in a research project aimed
at evaluating the potential contribution of cell cycle
control failure to neurodegeneration in Alzheimer’s
disease and other dementias, as well as in other
neurodegenerative disorders such as Amiotrophic
Lateral Sclerosis or Parkinson disease. The innovative
aspect of this work is to consider non-neuronal
cells from patients, as suitable model to study
cell proliferation and apoptosis events associated
with neurodegenerative pathogenesis. In addition
neuronal cultures and murine models are used as
experimental models.
C
ellular and molecular basis of of Alzheimer’s disease.
Relevance of studies in non-neuronal cells.
One of the characteristics of Alzheimer’s disease (AD) is a
progressive neuronal loss in certain brain regions associated with
cognitive functions. In the last years, it has been considered the
hypothesis that the attempt of certain neurons to enter the cell
cycle might cause neuronal death. The main goal of our research is
to study some of the mechanisms that control cell cycle progression
and cell survival using immortalized lymphocytes from control and
AD patients, as experimental model. We will try to demonstrate that
changes in cell cycle related proteins found in human lymphocytes
Esquema de las vias de señalización alteradas en linfoblastos de pacientes
de Alzheimer.
En los linfoblastos derivados de pacientes de Alzheimer, el aumento en los
niveles de CaM coopera con la estimulación por el suero produciendo la
hiperactivación de PI3K/Akt, que a su vez induce la degradación de p27,
favoreciendo mediante este mecanismo la progresión de las células a través del
ciclo de division cellular. La CaMKII bloquea la activación de NF-κB y de ERK1/2,
inducidas por la privación de suero, lo cual parece proteger a estas células de la
apoptosis en ausencia de factores tróficos.
Depiction of the proposed signaling pathways altered in AD lymphoblasts.
In AD cells, increased levels of CaM synergy with serum stimulation and promote
overactivation of PI3K/Akt leading to enhanced p27 degradation, and activation of
cyclin/CDK/pRb/E2F, therefore favoring, the progression of cells through the cell
cycle. In the absence of serum, the Ca2+/CaM-binding protein, CaMKII, decreased
the serum-deprivation induced NF-κB and ERK1/2 activation in comparison with
control cells, and increased the cellular content of p21, which then seems to protect
AD lymphoblasts from apoptosis induced by the absence of trophic support.
F. Bartolomé, U. Muñoz, N.
Esteras, J. Esteban, F. Bermejo-
Pareja, A. Martín-Requero. Distinct
regulation of cell cycle and survival
in lymphocytes from patients with
Alzheimer’s disease and amyotrophic
lateral sclerosis. Int. J. Clin. Exp. Pathol.2,
390-398 (2009).
U. Muñoz, F. Bartolomé, F. Bermejo, A. Martín-
Requero. Enhanced proteasome-dependent
degradation of the CDK inhibitor p27kip1 in
immortalized lymphocytes from Alzheimer dementia
patients. Neurobiol. Aging 29, 1474-1484 (2008).
F. Bartolomé, N. Cuevas, U. Muñoz, F. Bermejo, A. Martín-
Requero. Impaired apoptosis induced by withdrawal of
throphic factors in immortalized lymphocytes from Alzheimer’s
disease patients. Cross-talk of ca2+/Calmodulin and ERK1/2
signaling pathways. Cell. Mol. Life Sci. 64, 1437-1448 (2007).
have diagnostic value. Moreover, we are using double
transgenic mice (APP/PS1) to investigate: 1) whether
functional changes in lymphocytes mirror similar changes
in neuronal cells, and 2) whether cell cycle-related functional
changes in lymphocytes and neurons appear before cognitive
impairment and/or amyloid plaque deposition.
Progranulin haploinsufficiency and Frontotemporal Lobar
Degeneration (FTLD-TDP).
Frontotemporal lobar degeneration (FTLD) is a genetically
complex neurodegenerative disorder. The clinical symptoms
associated with FTLD include behavior and personality changes,
language disorders of expression and comprehension, with early
preservation of memory. The most common neuropathology
associated with this type of dementia is FTLD with ubiquitin and
TAR DNA-binding protein 43 (TDP-43) positive inclusions (FTLD-
TDP). Mutations in the Progranulin (PGRN) gene are the major cause
of familial FTLD-TDP. Most of the pathogenic mutations described
result in null allele, suggesting that PGRN haploinsufficiency is a
major pathogenic mechanism.
The main goal of this research project is to evaluate the pathogenic
influence of mutations on the progranulin (PGRN) gene, leading
to haploinsufficiency of the protein, to neurodegeneration in
frontotemporal lobar degeneration (FTLD-TDP). Peripheral cells from
carriers of PGRN mutations, as well as neuronal cells from PGRN
deficient mice or SH-S5Y5 after silencing PGRN gene will be used as
experimental models.
85
 Ángela Casado Moragón
Científica Titular | acasado@cib.csic.es
PhD, 1972. Otros miembros | Other lab members:
Universidad Complutense de Madrid.
Mª Encarnación López Fernández
Licenciada en Farmacia.
Universidad Complutense de Madrid. Rodrigo Guzmán Martínez
Científica Titular, 1972. Carlos Campos Vaquero
CIB,CSIC. Rebeca López Froilán
Jefa del Grupo de Radicales Libres y Procesos
de Envejecimiento,1986.

www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=55

Biomarcadores de Estrés Oxidativo Oxidative Stress Biomarkers and Aging

y Procesos de Envejecimiento Processes
Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine

Nuestro grupo determina, utilizando diversos
marcadores de estrés oxidativo, el daño oxidativo
al DNA, proteínas y lípidos producido por especies
reactivas de oxígeno (ROS) y su implicación en el
proceso de envejecimiento y patologías relacionadas
(Alzheimer, Down). También analizamos en que
medida la ingesta de antioxidantes (dieta o
suplementos) puede paliar el efecto nocivo de ROS, y
el papel del SH2 en los efectos antioxidantes de aguas
mineromedicinales sulfuradas y sulfatadas.
We perform research in aging processes with a
specific interest in end products resulting from
oxidation of mitochondrial and nuclear DNA,
lipid peroxidation, protein oxidation, and free
radicals and ROS effects in human lymphocytes
of Down syndrome and Alzheimer’s patients. We
also determine whether the intake of antioxidants
may prevent from the risk of different age-related
Down’s syndrome (DS). DS is a genetic
abnormality associated with the presence of three
copies of chromosome 21 (HSA21) and the presence
of premature aging due to elevated oxidative stress
caused by overexpression of Cu/ZnSOD gene (according
to what we have demonstrated years ago), that is encoded
on chromosomal region 21q22.1. As oxidative/nitrosative
stress markers we analysed: 8OHdG (DNA damage); MDA and
8-isoprostane (lipids); total nitrite and nitrate (NOx), DiTyr and

L
as especies reactivas de oxígeno (ROS)
formadas durante el metabolismo
celular están implicadas en el proceso
de envejecimiento ya que provocan
una cadena de lesiones oxidativas en el
interior celular, afectando a proteínas, DNA
ROS. Hemos valorado marcadores de estrés
oxidativo en linfocitos y la respuesta a
diferentes tratamientos antioxidantes
mediante electroforesis en gel de células
individuales.
Efectos protectores de aguas minero­ carbonyls (protein), as well as AGES and antioxidant capacity.
medicinales sulfuradas. Analizamos los efectos
diseases, and the role of hydrogen sulphide in
antioxidants effects of crenotherapic treatment with Alzheimer Dementia (AD). Oxidative stress in AD focused on the
antioxidantes de aguas minero­medicinales con
sulphured and sulphated mineral waters. following premise: brain requires elevated oxygen consumption,
niveles elevados de SH2 en diversas patologías
brain has a high content of easily peroxidizable unsatured
relacionadas con el envejecimiento.
fatty acids, brain is relatively poor in many antioxidants, such as

y lípidos. Se ha postulado que existe un
equilibrio dinámico entre generación de
ROS y actividad de sistemas de defensa
antioxidante. Los antioxidantes protegen las
estructuras celulares de la acción nociva de
ROS, de ahí su implicación en el proceso de
envejecimiento.
Síndrome de Down (SD). SD, una alteración
genética asociada a la presencia de
tres copias del cromosoma 21 (HSA21),
presenta envejecimiento prematuro
debido a la presencia de estrés oxidativo
elevado, causado por sobreexpresión
(como demostramos hace años) del gen
Cu/ZnSOD codificado en cromosoma
21, región 21q22.1. Como marcadores de
estrés oxidativo se analizan: 8OHdG (daño
oxidativo a DNA); MDA, 8-isoprostanos
(lípidos); total de nitritos y nitratos (NOx),
Ditirosina y grupos carbonilo (proteínas), y
capacidad antioxidante.
Demencia Alzheimer (DA). El estrés oxidativo
en DA es debido a que el sistema nervioso
central es particularmente vulnerable al
efecto de ROS por su elevado consumo de
oxígeno, su abundante contenido de ácidos
grasos poliinsaturados y la relativa precariedad
de algunos enzimas antioxidantes, unido a la
presencia (en cerebros de pacientes con DA)
de hierro, mercurio y aluminio, que son
potentes catalizadores para la producción de
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Ángela Casado, Mª Encarnación López-Fernández,
Rocío Ruíz. (2007). Lipid peroxidatión in Down
syndrome caused by regular trisomy 21, trisomy 21
by Robertsonian translocation and mosaic trisomy
21. Clin Chem Lab Med. 45:59-62.
Ángela Casado, Mª Encarnación López-Fernández,
Mª Concepción Casado, Rosario de la Torre. (2008).
Lipid peroxidatión and antioxidant enzyme activities
in Vascular and Alzheimer dementias. Neurochem
Res. 33:450-458.
Ángela Casado, Alberto Castellanos, Mª Encarnación
López-Fernández, Rocío Ruíz, C García Aroca, F
Noriega. (2008). Relationship between oxidative
and occupational stress and aging in nurses of an
intensive care unit. AGE. 30:229-239
Carlos Campos, Rodrigo Guzmán, Mª Encarnación
López-Fernández, Ángela Casado. (2009).
Evaluation of the copper(II) reduction assay using
bathocuproinedisulfonic acid disodium salt for the
total antioxidant capacity assessment: The CUPRAC-
BCS assay. Analytical Biochem.392:37-44.
Ramón Giménez JR, Hernández Torres A,
Casado Moragón A, Avellaneda Fernández A.
Biogerontología Médica. Capítulo: VITAMINAS Y
OTROS ANTIOXIDANTES. Sastre J, Pamplona R,
Ramón JR Editores. Editorial Ergon, 2009. Pgs:
313-326.
Hernández Torres A, Ramón Giménez JR, Casado
Moragón A, Cuenca Giralde E, Polo De Santos Mª M.
Biogerontología Médica. Capítulo: AGUAS MINERO
R
catalase and this together with a high content of metals such as
eactive oxygen species (ROS) generated during cellular
Fe, Hg or Al, which are strong catalytic for ROS production. We
metabolism are involved in the aging process. ROS are
have evaluated oxidative stress markers in lymphocytes and the
unstable compounds which exert toxic effects by reacting
response to antioxidant treatments using the comet assay.
with lipids, proteins and nucleotides to produce oxidiced
compounds. It has been postulated that a dynamic equilibrium Antioxidant effects of sulphurous waters. We analyse the protective
exists between the generation of ROS and the level of antioxidant effects of the administration of sulphurous mineral-medicinal waters
MEDICINALES Y EFECTOS ANTIOXI-DANTES EN EL
defences. Antioxidants protect biological system from oxidants and against ROS damage in age-related diseases. Sulphurous waters may
ENVEJECIMIENTO. Sastre J, Pamplona R, Ramón JR
Editores. Editorial Ergon, 2009. Pgs: 327-343. have been considered to act delaying aging. be valuable in preserving and enhancing antioxidant status.
Carlos Campos, Rodrigo Guzmán, Mª Encarnación
López-Fernández, Ángela Casado. (2010). Urinary
uric acid and antioxidant capacity in children
Microscopy visualization in peripheral lymphocytes of DNA damage using the
and adults with Down syndrome. Clin. Biochem. Visualización microscópica del daño al DNA en linfocitos utilizando
Single Cell Gel Electrophoresis or Comet Assay (SCGE). A) Lymphocytes with DNA
43:228-233. electroforesis en gel de células individuales (comet assay). A) linfocitos con daño damage: the overall structure resembles a comet with a circular head corresponding
Ángela Casado, Alberto Castellanos, Mª Encarnación en DNA: la estructura parece un cometa con una cabeza circular que corresponde to the undamaged DNA that remains in the cell cavity and a tail of damaged DNA. B)
López-Fernández, Rocío Ruiz, Eulalia López Imedio, al DNA sin daño que permanece en la cavidad celular y una cola con DNA dañado. Lymphocytes without DNA damage: undamaged supercoiled DNA remains within the
Carmen Castillo, Ana María Fernández Prieto. B) linfocitos sin daño: el DNA enrollado permanece dentro de la célula. confines of the cell membrane.
Determination of oxidative and occupational stress A B
in palliative care workers. Clin. Chem. Lab. Med.
DOI 101515 CCLM. 2010061.
Patentes
Patents
Ángela Casado, Mª Encarnación López-Fernández,
Ántonio Hernández- Torres, Mar Polo de Santos,
José Ramón Ramón, Mª Luisa Pérez. Procedimiento
para determinar poder antioxidante en agua
mineromedicinal.
Fecha concesión 07/04/2010.
Carlos Campos Vaquero, Rodrigo Guzmán Martínez,
Mª Encarnación López-Fernández, Ángela Casado
Moragón. Método para valorar la concentración y la
capacidad antioxidante del ácido úrico.
Solicitud P201030674. Fecha 07/05/2010.

86 87
 Roberto Parrilla Sánchez
Profesor de Investigación | rparrilla@cib.csic.es
MD, 1964 y PhD, 1968.
Universidad Complutense de Madrid.
Postdoctoral, 1969-1971 y 1971-1973.
Universidad de Harvard y Universidad de
Pennsylvania, EE UU.
Científico Titular, 1971,
Investigador Científico, 1975.
CSIC.
Profesor Agregado Numerario, 1977.
Universidad Autónoma de Madrid.
Catedrático Numerario de Fisiología, 1981.
Universidad de Extremadura.
Profesor de Investigación, 1992. CIB, CSIC.
Matilde Sánchez Ayuso Otros miembros | Other lab members:
Investigadora Científica | msayuso@cib.csic.es
PhD, 1969, Universidad Complutense de Madrid. Darío Fernandez
Postdoctoral, 1969-1971 y 1971-1973. Tomás Fontela Casado
Universidad de Harvard y Universidad de Elena García Arias-Salgado
Pennsylvania, EE UU.
Adela García Martín
Científica Titular, 1973
Investigadora Científica, 1979. CSIC. Adam Nowakowski
Subdirectora Gral. Relaciones Internacionales, Miguel Pericacho
1996-2002. CSIC. Victor Fernández Soria
Subdirectora Gral. Organismos y Programas
Internacionales, 2002-2003. CSIC.
Directora Gral. de Investigación, 2003-2004.
Ministerio de Ciencia y Tecnología. www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=80
Vocal Asesora, 2004. CSIC.

Fisiopatología de los Trastornos Hemostáticos Physiopathology of Hemostatic Disorders

Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine

Las plaquetas son fragmentos anucleados de megacariocitos, presentes The platelets are anucleated fragments of mega­karyo­ The functional analysis of these groups of
en el torrente circulatorio, con actividades multifuncionales. En cytes circulating in the blood stream, exhibiting animals support the following conclusions:

condiciones normales, tanto el endotelio vascular como las plaquetas multifunctional activities. Under normal conditions,
producen factores pro- y anti-coagulantes de cuya proporción depende the patency of blood vessels depends on the balanced
la luidez del torrente circulatorio. Las plaquetas, además de su función proportion of pro- and anti-coagulant factors produced
hemostática, tienen un papel importante en inflamación, trombosis, in the vascular endothelium and the platelets. Besides
reconocimiento celular, reendotelización de células vasculares o la unión their hemostatic function, the platelets play an
a células tumorales, contribuyendo a la formación de metastasis. important role in inflammation, thrombosis, cellular
recognition, reendotheliasation of damaged
• Transgenic mice expressing Cre recombinase
specifically in megakaryocytes and platelets
under the control of the glucoprotein αIIb
promoter (mαIIb-cre) have sufficient recombinase
activity to excise floxed genes. This was verified by
crossing our floxed mice with ROSA26-LacZ reporter
and floxed CD40L mice confirming the excision of the
corresponding genes restricted to megakaryocytes.

D
urante los últimos años nuestro • PODXL-null mice in:
endothelial vascular cells or in binding tumour cells
trabajo se ha centrado en la
manipulación genética de
contributing to the formation of metastasis. - Neural tissue show dilated ventricular spaces, engrossment of
the main carotid artery and increased number of the choroidal
animales con el objetivo fundamental de a) Esquema de la construcción del transgén mαIIb-cre de 4.1
Kb, microinyectado en zigotos. b) Identificación de Cre en capillaries in the ventricular spaces.
emular procesos patológicos humanos.

Recientemente hemos dedicado nuestra
atención preferente al estudio funcional
de la podocalicina (PODXL) plaquetaria.
La PODXL es una mucoproteína tipo
I de membrana, de la familia CD34 de
proteínas. Con tal fin, hemos modificado
genéticamente ratones para producir la
ablación especifica de tejido del gen de la
podxl, mediante el sistema Cre-loxP.
Hemos generado y analizado los siguientes
tipos de animales:
• Ratones con expresión plaquetaria
restringida del transgén recombinasa cre.
• Ablación de PODXL restringida a plaquetas,
células del endotelio vascular y/o tejido
neural.
• Ratones con sobreexpresión de PODXL en
megacariocitos y plaquetas
Algunas de las conclusiones del análisis
funcional de estos animales han sido las
siguientes:
• Los ratones transgénicos con expresión
restringida de recombinasa Cre en
megacariocitos y plaquetas bajo el control
del promotor del gen de la glucoproteína
αIIb (mαIIb-cre) muestraron suficiente
actividad recombinasa para producir
la ablación de genes floxed, verificada
mediante cruce con ratones Rosa26-LacZ y
con ratones CD40L-floxed.
• Los animales con ablación específica de
podocalicina en:
• El tejido neural muestran un aumento
significativo de los volúmenes ventriculares,
megacariocitos y plaquetas. Los paneles superiores muestran
frotis de medula ósea obtenidos de ratones doble transgénicos
mαIIb-cre(A or B) / Rosa26. Para identificar la presencia de
β-galactosidasa los frotis de medula ósea se tiñeron con X-Gal.
Las preparaciones se analizaron en un microscopio Olympus
IX50 provisto de una cámara digital DP70. Las fotografías se
tomaron con objetivo 40X. Los paneles inferiores muestran la
tinción con X-Gal de plaquetas obtenidas de ratones mαIIb-
cre(A or B) / Rosa26.
a) Scheme of the 4.1Kb mαIIb-cre transgene construct
microinjected into zygotes. b) Identification of Cre in
megakaryocytes. The upper panels depict bone marrow smears
prepared from mαIIb-cre (A or B) / Rosa26 double transgenic mice.
To indentify the presence of β-galactosidase, bone marrow smears
were stained with X-Gal. The preparations were examined in an
Olympus microscope IX50 provided with a digital DP70 camera.
Pictures were taken at 40X magnification. The lower panels show
the X-Gal staining of platelets smears from mαIIb-cre (A or B) /
Rosa26 mice.
engrosamiento de la arteria carótida
principal y de los capilares coroideos de los
espacios ventriculares.
• La ablación de PODXL en el endotelio
vascular produjo trastornos hemostáticos
manifestados principalmente en una
disminución del 50% en el tiempo de
hemorragia y disminución de similar del
tiempo de oclusión de la arteria carótida
inducido por Cl3Fe.
• El análisis funcional de animales con
sobreexpresión de PODXL en megacariocitos
y plaquetas sugiere que la PODXL podría
actuar como coestimulador de agonistas en
la activación de plaquetas y la formación de
trombos estables.
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Nowakowski A, Alonso-Martín S, Arias-Salgado EG,
Fernández D, Vilar M, Ayuso MS, Parrilla R (2011)
Megakaryocyte gene targeting mediated by
restricted expression of recombinase Cre. Thromb.
Haemost., 105:138-144.
Larrucea S, Butta N, Arias-Salgado EG, Alonso-
Martin S, Ayuso MS, Parrilla R (2008) Expression of
podocalyxin enhance the adherence, migration, and
intercellular communication of cells, Exp. Cell Res.
314: 2004-2015.
Nowakowski A, Alonso S, González-Manchón C,
Larrucea S, Fernández D, Vilar MP, Cerdán S, Ayuso
MS, Parrilla R (2010) Ventricular Enlargement
associated with the Panneural Ablation of the
Podocalyxin Gene. Mol. Cell Neurosci. 43; 90-97.
D
- Vascular endothelium shows a 50% decrease of vascular
uring the last few years, our work has been devoted to
the genetic manipulation of experimental animals aiming occlusion induced by Cl3Fe and bleeding time.
at reproduce patterns of human diseases. More recently • The analysis of mice overexpressing PODXL in megakaryocytes
we focus our attention at analyzing the function of podocalyxin and platelets indicates that this protein acts as a co-stimulator
(PODXL) in megakaryocytes and platelets. PODXL is a type I of agonists in the processes of platelets activation and thrombus
membrane mucoprotein, member of the CD34 family of membrane formation.
proteins. To carry out this study we have generated mice with
tissue restricted ablation of PODXL by the Cre-loxP gene targeting
methodology.
We have developed and analyzed the following genetically
modified animals:
• Mice with restricted expression of recombinase cre transgene in
megakaryocytes and platelets,
• Null-PODXL mice restricted to megakaryocytes, vascular
endothelial cells or neural tissue.
• Mice overexpressing PODXL in megakaryocytes and platelets.
Imágenes de resonancia
Alonso-Martin S, Nowakowski A, Larrucea S,
Fernández D, Vilar-Egea MP, Ayuso MS, Parrilla
magnética de ratones normales
y Podxl-/-. A) Imágenes de
R. (2010) Overexpression of podocalyxin in resonancia magnética (MR)
megakaryocytes and platelets decreases the de cerebros de ratón; B) Los
bleeding time and enhances the agonist-induced tamaños ventriculares se
aggregation of platelets. Thrombosis Res. Mar 9 determinaron utilizando el
(DOI: 10.1016/j.thromres.2010.02.008). programa Image J. Las cifras
representan la proporción entre
Wei C, Möller CC, Altintas MM, Li J, Schwarz K,
el área ventricular y la del cerebro
Zacchigna S, Xie L, Henger A, Schmid H, Rastaldi MP,
total. Se analizaron al menos 8
Cowan P, Kretzler M, Parrilla R, Bendayan M, Gupta
animales de cada grupo y los
V, Nikolic B, Kalluri R, Carmeliet P, Mundel P, Reiser J valores son medias ±SEM.
(2008) Modification of kidney barrier function by the
Magnetic resonance images of
urokinase receptor. Nature Medicine;14:55-63.
normal and null-Podxl mouse
Larrucea, S., Butta, N., Rodriguez, R.B., Alonso-Martin, brains. A) Representative magnetic
S., Arias-Salgado, E.G., Ayuso, M.S., Parrilla, R. (2007) resonance (MR) images of mouse
Podocalyxin enhances the adherence of cells to brains; B) The ventricular sizes have been determined using the software package Image J. The figures represent the
platelets. Cell. Mol. Life Sci. 64: 2965-2974. ventricular to total brain area ratios. At least eight animals of each group were examined and the values are means ±SEM.

88 89

Consuelo González Manchón
Científica Titular | cgmanchon@cib.csic.es
MD, 1983.
Universidad de Extremadura.
PhD, 1987.
Universidad Complutense de Madrid.
Postdoctoral, 1988.
Salk Institute, la Jolla, CA, USA.
Contratada, 1991,
Científica Titular, 1999,
Jefa de Grupo, 2005.
CIB, CSIC.
Receptores de
Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine
Membrana Plaquetarios
El objetivo de nuestro trabajo es aclarar las bases
genéticas y moleculares de trastornos hemostáticos
humanos debidos a alteraciones de las plaquetas.
Utilizando plaquetas y modelos celulares y
animales diseñados en el laboratorio, investigamos
las consecuencias funcionales de los cambios
estructurales de receptores de membrana y otras
moléculas plaquetarias, con el fin de avanzar en el
conocimiento de los mecanismos implicados en la
fisiopatología de la hemostasia.
R M
eceptores de membrana. Nuestro
grupo ha realizado la caracterización
molecular y funcional de la integrina
αIIbβ3 (principal receptor de fibrinógeno)
y el complejo GPIb-IX (receptor del factor
de von Willebrand) en numerosos casos de
tromboastenia de Glanzmann y síndrome de
Bernard-Soulier, respectivamente, desvelando
importante información sobre la biología
de dichos receptores. En la actualidad,
estamos investigando los mecanismos
moleculares por los que determinadas
mutaciones dominantes en estas moléculas
dan lugar a síndromes no bien definidos
fenotípicamente que se asocian a
alteraciones en el número y tamaño de las
plaquetas. Uno de los principales objetivos
de este trabajo es aclarar si la integrina
normal participa en la formación de las
plaquetas a partir del megacariocito maduro
o, alternativamente, sólo determinadas
mutantes pueden alterar este proceso. Otro
objetivo a destacar es descifrar el papel del
reagrupamiento (“clustering”) de receptores
en la señalización mediada por la integrina
αIIbβ3 y su relevancia in vivo.
Factor XIII celular (FXIIIc). Además del
factor XIII plasmático de la coagulación
(heterodímero A2B2), existe una forma
celular (homodímero A2) abundante en
plaquetas y monocitos cuya función no
se conoce bien. Utilizando células de
pacientes con deficiencia de FXIII-A, hemos
90
Otros miembros | Other lab members:
Pedro Lastres Varo
Isabel Conde Martín
Juan Quintana Alcalá
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=59
desvelado que la actividad transglutaminasa
del FXIII-A tiene un importante papel en la
regulación de las funciones de las plaquetas
y en la motilidad de las células dendríticas
derivadas de monocitos. Actualmente,
estamos investigando si estos efectos
están relacionados con un posible papel
de la actividad “crosslinking” del FXIIIc en la
oligomerización de receptores de agonistas
plaquetarios.
Efecto de la sobreexpresión de FXIII-A en la
migración de células CHO. (A) Microfotografías
de un ensayo representativo de “cierre de
herida” donde se observa que la tasa de
cierre es mayor en las poblaciones celulares
que sobreexpresan FXIII-A. (B) Protrusiones
de membrana tipo “blebs” en células con
sobreexpresión de FXIII-A migrando sobre una
superficie recubierta con suero.
Effect of FXIII-A overexpression on migration of
CHO cells. (A) Microphotographs of a scratch-
wound assay showing that the rate of scratch
closure is higher in clonal cell populations
expressing FXIII-A. (B) Membrane bleb-like
protrusions in FXIII-A-transfected cells migrating
on a serum-coated surface.
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Jayo, A., Conde, I., Lastres, P., Jiménez-Yuste, V., and González-Manchón, C. (2009) New insights
into the expression and role of platelet factor XIII-A. J. Thromb. Haemost. 7, 1184-1191.
Jayo, A., Arnold, E., González-Manchón, C., Green, D., and Lord, S.T. (2009) Hypodysfibrinogenemia
causing mild bleeding and thrombotic complications in a compound heterozygote of AαIVS4+1G>T
and Aa4841DelC truncation (AaPerth). Thromb. Haemost. 101, 770-772.
Jayo, A., Conde, I., Lastres, P., Jiménez-Yuste, V., and González-Manchón, C. (2009) Possible role of cellular FXIII
in monocyte-derived dendritic cell motility. Eur. J. Cell Biol. 88, 423-431.
Nowakowski, A., Alonso-Martín, S., González-Manchón, C., Larrucea, S., Fernández, D., Vilar, M., Cerdán, S., Ayuso,
M.S., and Parrilla, R. (2010) Ventricular enlargement associated with the panneural ablation of the podocalyxin gene.
Mol. Cell. Neurosci. 43, 90-97.
Conde, I., Pabón, D., Jayo, A., Lastres, P., and González-Manchón, C. (2010) Involvement of ERK1/2, p38 and PI3K in
megakaryocytic differentiation of K562 cells. Eur. J. Haematol. 84, 430-40.
Jayo, A., Conde, I., Lastres, P., Martínez, C., Rivera, J., Vicente, V., and González-Manchón, C. (2010) L718P mutation in the membrane-
proximal cytoplasmic tail of β3 promotes abnormal αIIbβ3 clustering and lipid microdomain coalescence, and associates with
thrombasthenia-like phenotype. Haematologica-The Hematology Journal. 95, 1158-1166.
Platelet Membrane Receptors
Our research is aimed at clarifying the genetic
and molecular basis of haemostatic disorders,
specifically those related to platelet dysfunctions.
Using platelets and designing cellular and animal
models, we investigate the functional consequences
of structural changes in membrane receptors and
other platelet molecules, in order to gain insights
into the molecular mechanisms involved in the
pathophysiology of haemostasis.
embrane receptors. Our group has previously performed
the molecular and functional analysis of the αIIbβ3
integrin (the main receptor for fibrinogen) and the GPIbIX
complex (von Willebrand factor receptor) in a number of cases
of Glanzmann thrombasthenia and Bernard-Soulier syndrome,
respectively, providing important new information about the
biology of these receptors. We are now studying the molecular
mechanisms by which some mutant receptors give rise to not
well-defined disorders associated to thrombocytopenia and
alterations in platelet size. One of the main goals of this project is to
clarify whether normal αIIbβ3 participates in platelet formation or,
alternatively, only some mutant integrins might disturb that process.
Another important objective is to elucidate the role of receptor
clustering on αIIbβ3-mediated signalling as well as its relevance in
vivo.
Cellular factor XIII (cFXIII). The A subunit of plasma FXIII is highly
expressed in platelets and monocytes, but the function of this
cellular form of FXIII is not well known. By using platelets and
monocytes obtained from FXIII-A-deficient patients we have
provided evidence for the direct involvement of FXIII-A-derived
transglutaminase activity in the regulation of platelet functions
and motility of monocyte-derived dendritic cells. Currently, we
are investigating whether these effects may be mediated by FXIIIc
crosslinking activity on platelet agonist receptor oligomerization.
Detección de la interacción de la quinasa Src con αIIbβ3 mediante
ensayo de ligación por proximidad (PLA) in situ. Las células con
expresión estable de αIIbβ3 se transfectaron de forma transitoria con
c-Src y la interacción αIIbβ3-Src en el lado interno de la membrana
plasmática se analizó mediante microscopía confocal.
Detection of αIIbβ3-Src interaction using in situ proximity ligation
assay (PLA). Cells expressing αIIbβ3 were transiently transfected with
c-Src and the interaction αIIbβ3-Src on the inner side of the plasma
membrane was analyzed by confocal microscopy.
91
 Carmelo Bernabeu Quirante Luisa-María Botella Cubells Otros miembros | Other lab members:
Profesor de Investigación | bernabeu.c@cib.csic.es Investigadora Científica | cibluisa@cib.csic.es
PhD, 1977. PhD, 1985. Francisco Javier Blanco Lopez
Universidad Autónoma de Madrid. Universidad de Valencia. Elisa Rossi
Postdoctoral Scholar, 1980-1981. Visiting Scientist, post-doc, 1986-1988. Eva María Garrido Martin
Molecular Biology Institute, University of California, Genetiska Institutionen, Wallenberg Laboratory,
Los Angeles, USA. Universidad de Lund, Suecia.
Ana Cristina Valbuena Díaz
Research Fellow, 1982-1983. Científica Titular, 1989, María Luisa Ojeda Fernández
Dana-Farber Cancer Institute, Harvard Medical Investigadora Científica, 2007. Virginia Albiñana Díaz
School, Boston, Massachusetts, USA. CIB, CSIC.
Mikel Aristorena San Adrian
Científico Titular, 1985, Carmen Langa Poza
Jefe de grupo, 1988,
Investigador Científico, 1987, Lucia Recio Poveda
Profesor de Investigación, 2003.
CIB, CSIC. www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=22

Receptores de TGF-β en Células Endoteliales TGF-β Receptors in frequent epistaxis, gastrointestinal

hemorrhages, cutaneous telangiectasis

Endothelial Cells and arteriovenous malformations in

Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine

lung, liver and brain (OMIM #187300).

Endoglina y ALK1 son miembros del complejo receptor de TGF-β en células
Expression studies of mutant proteins
endoteliales con implicaciones en la fisiopatología vascular. Mutaciones Publicaciones Seleccionadas have demonstrated that the mechanism of
en los genes de endoglina o ALK1 (ACVRL1) son responsables de la Selected Publications haploinsufficiency accounts for the clinical
Telangiectasia Hemorrágica Hereditaria (HHT), una enfermedad vascular Endoglin and ALK1 are components of the TGF-β manifestations of HHT because most of the
autosómica dominante. Endoglina y ALK1 regulan la angiogénesis y Bernabeu C, Lopez-Novoa JM, Quintanilla M. receptor complex in endothelial cells that are mutant proteins are either not expressed or are
homeostasis vascular, y una forma soluble de endoglina tiene un papel
(2009). The emerging role of TGF-beta superfamily involved in vascular physiopathology. Mutations in non functional. Among the scientific aims of our
coreceptors in cancer. Biochim. Biophys. Acta.
patogénico en preeclampsia. Además, endoglina es un marcador de la 1792, 954-973. endoglin or ALK1 (ACVRL1) genes give rise to the group are: i) To carry out the molecular diagnosis of
Hereditary Hemorrhagic Telangiectasia (HHT), a HHT by sequencing endoglin and ALK1 exons from the
neoangiogénesis tumoral y es un supresor de tumores epiteliales. Botella LM, Sanz-Rodriguez F, Komi Y, Fernandez-L
Spanish HHT patients; ii) To search for new biomarkers in
A, Varela E, Garrido-Martin EM, Narla G, Friedman SL, dominant autosomic vascular dysplasia. Endoglin
HHT; iii) Analyze the mechanisms of transcriptional regulation

N
uestro laboratorio estudia la expresión
génica, estructura y función de los
receptores de TGF-β endoglina y
ALK1, tanto en la fisiología normal como en
el contexto de la patología humana, y en
especial en HHT. Mutaciones en los genes de
endoglina o ALK1 dan lugar a HHT1 y HHT2,
respectivamente, las cuales están asociadas
ii) Buscar nuevos biomarcadores en HHT;
iii) Analizar los mecanismos de regulación
transcripcional de los genes de endoglina y
ALK1; iv) Obtener cultivos primarios de células
endoteliales y monocitos activados a partir
de sangre periférica de pacientes HHT para
estudios de expresión genica, bioquímicos, de
señalización celular y para ensayos de terapias
Kojima S. (2009). TGF-beta regulates the expression
of transcription factor KLF6 and its splice variants
and promotes co-operative transactivation of
common target genes through a Smad3-Sp1-KLF6
interaction. Biochem J. 419, 485-495.
Cristobal I, Blanco FJ, Garcia-Orti L, Marcotegui
N, Vicente C, Rifon J, Novo FJ, Bandres E,
Calasanz MJ, Bernabeu C, Odero MD. (2010).
SETBP1 overexpression is a novel leukemogenic
mechanism that predicts adverse outcome in
and ALK1 regulate angiogenesis and vascular
homeostasis, and a soluble form of endoglin has
a pathogenic role in preeclampsia. In addition,
endoglin is a marker of tumor neoangiogenesis and
is a suppressor of epithelial tumors.
of endoglin and ALK1 genes; iv) To generate primary cultures
of endothelial cells and activated monocytes derived from
blood samples of HHT patients for studies on gene expression,
biochemistry, cellular signalling and assays of cellular-genetic
therapies in mice; v) To analyze the function and gene expression
patterns of transfectant cells overexpressing the two endoglin
isoforms; vi) To generate transgenic mice overexpressing soluble
endoglin and analyze the impact on arterial hypertension; vii) To

con frecuentes epistaxis, hemorragias
gastrointestinales, telangiectasias cutáneas, y
malformaciones arteriovenosas en pulmón,
hígado y cerebro (OMIM #187300). Los estudios
de expresión de las proteínas mutantes han
establecido que la haploinsuficiencia explica
las manifestaciones clínicas de la HHT, ya que
la mayoría de las proteínas mutantes o bien
no se expresan en la superficie celular, o no
son funcionales. Entre los objetivos científicos
del grupo se incluyen: i) Llevar a cabo el
diagnóstico molecular de HHT mediante
secuenciación de los exones de endoglina y
ALK1 en la población de pacientes españoles;
Estructura tridimensional de endoglina y ALK1
y sus mutaciones en HHT. Las mutaciones
missense y nonsense descritas para la parte
extracelular de endoglina y la parte intracelular
de ALK1 se muestran como esferas verdes
y segmentos rojos, respectivamente. El
volumen de las esferas verdes está relacionado
exclusivamente con el tamaño del residuo
mutado en la cadena. El bucle L45, el dominio
GS y el sitio de union de caveolina-1 en ALK1
tambien se indican. Adaptado de Bernabeu et
al. (2010) J. Applied. Biomed. 8: 169-177.
Endoglin and ALK1 three dimensional structure
and HHT mutations. The missense and nonsense
mutations described for the extracellular part
of endoglin and the intracellular part of ALK1
are shown as green spheres and red segments,
respectively. The volume of the green spheres
is exclusively related to the size of the mutated
residue side chain. The L45 loop, the GS domain
and the caveolin-1 binding motif of ALK1 are also
indicated. Adapted from Bernabeu et al. (2010) J.
Applied. Biomed. 8: 169-177.
92
célulo-génicas en ratones; v) Analizar la función
y los patrones de expresión génica de celulas
transfectantes que sobreexpresan las dos
isoformas de endoglina; vi) generar ratones
transgénicos que sobreexpresen endoglina
soluble y analizar el impacto en la hipertensión
arterial; vii) generar ratones KO condicionales
de endoglina en el linaje mieloide para analizar
el impacto de HHT en el sistema inmune; viii)
Buscar medicamentos huérfanos con posible
aplicación en HHT y estudiar su mecanismo
de acción; y ix) Estudiar la estructura
tridimensional de los complejos de endoglina,
ALK1 y miembros de la familia del TGF-β.
O
elderly patients with acute myeloid leukemia.
ur laboratory studies the gene expression, structure and generate a conditional Endoglin KO mice in the myeloid lineage to
Blood. 115, 615-625.
function of the TGF-β receptors endoglin and ALK1, in analyze the impact of HHT on the immune system; viii) To search
Albiñana V, Bernabeu-Herrero ME, Zarrabeitia R,
Bernabeu C, Botella LM. (2010). Estrogen therapy normal physiology and in the context f human pathology, for orphan drugs with potential application in HHT and study of
for Hereditary Haemorrhagic Telangiectasia with special emphasis in HHT. Mutations in endoglin or ALK1 genes their mechanisms of action; ix) To study the three dimensional
(HHT): Effects of Raloxifene, on Endoglin and give raise to HHT1 or HHT2, respectively, which are associated with structure of endoglin, ALK1 and members of the TGF-β family.
ALK1 expression in endothelial cells. Thromb.
Haemost. 103, 525-534.
Ojeda-Fernandez L, Barrios L, Rodriguez-Barbero
A, Recio-Poveda L, Bernabeu C, Botella LM. (2010).
Reduced plasma levels of Ang-2 and sEng as novel Modelo hipotético del papel de endoglina en la apoptosis de la célula apoptosis en las células endoteliales, donde la función de endoglina es
biomarkers in Hereditary Hemorrhagic Telangiectasia endotelial y su relevancia en las lesiones vasculares de HHT. En presencia de requerida para la supervivencia, conduciendo a una regresión de los capilares.
(HHT). Clin. Chim. Acta. 411, 494-499. determinados estímulos, tales como TGF-β e hipoxia, las células endoteliales Se muestra una sección transversal de un vaso individual con celulas
sufren un proceso de apoptosis que es prevenido por la expresión endoteliales en rojo, pericitos en azul y células endoteliales apoptóticas en
Garrido-Martin EM, Blanco FJ, Fernandez-L A, inducida de endoglina en los individuos sanos. En los pacientes HHT, la rosa. Adaptado de Lopez-Novoa & Bernabeu (2010) Am. J. Physiol. Heart Circ.
Langa C, Vary CP, Lee UE, Friedman SL, Botella LM, haploinsuficiencia de endoglina puede conducer a una apoptosis masiva Physiol. 299: H959-974.
Bernabeu C. (2010). Characterization of the human
Activin-A receptor type II-like kinase 1 (ACVRL1) Hypothetical model for the role of
promoter and its regulation by Sp1. BMC Mol. endoglin in EC apoptosis, and its relevance
Biol. 11(1): 51 (22 pags). in HHT vascular lesions. Under certain
stimuli, such as TGF-β and hypoxia, ECs
Bernabeu C, Blanco FJ, Langa C, Garrido-Martin
undergo apoptosis that is prevented
EM, Botella LM. (2010). Involvement of the TGF-
by the induced expression of endoglin
beta superfamily signalling pathway in hereditary in healthy subjects. In HHT patients,
haemorrhagic telangiectasia. J. Applied Biomed. endoglin haploinsufficiency may lead to a
8, 169-177. massive apoptosis in ECs where endoglin
Lopez-Novoa JM, Bernabeu C. (2010). function is required for survival leading
The physiological role of endoglin in the to capillary regression. A cross-section of
an individual vessel is depicted with ECs
cardiovascular system. Am. J. Physiol. Heart Circ.
in red, pericytes in blue and apoptotic
Physiol. 299, H959-974.
ECs in pink. Adapted from Lopez-Novoa &
Santibanez JF, Perez-Gomez E, Fernandez-L A, Bernabeu (2010) Am. J. Physiol. Heart Circ.
Garrido-Martin, EM, Carnero A, Malumbres M, Physiol. 299, H959-974.
Vary CPH, Quintanilla M, Bernabeu C. (2010). The
TGF-beta co-receptor endoglin modulates the
expression and transforming potential of H-Ras.
Carcinogenesis. 31, 2145-2154.
Perez-Gomez E, Del Castillo G, Santibañez JF, Lopez-
Novoa JM, Bernabeu C, Quintanilla M. (2010). The
role of the TGF-beta coreceptor endoglin in cancer.
ScientificWorldJournal. 10, 2367-2384.
93
 Santiago Lamas
GRUPO EN TRANSICIÓN

Profesor de Investigación | slamas@cbm.uam.es

MD, 1981. UAM, Spain. Investigador del equipo | Staff Scientist:
Especialista en Nefrologia, 1986.
Fernando Rodríguez Pascual
Ministerio de Sanidad y Consumo.
PhD, 1989 (Premio Extraordinario).
UAM, Spain. Otros miembros | Other lab members:
Fellow of Renal and Cardiovascular Division at Mariano Redondo Horcajo Patricia Rodríguez Perez
Brigham & Women’s Hospital, 1990-1992.
Harvard Medical School, Boston, USA. Maria Angeles Higueras López Óscar Busnadiego Prieto
Cientifico Titular, 1993, Clara López Jiménez David Lagares Salto
Investigador Cientifico, 2000, Rosa Bretón Romero M. Estrella Soria López
Profesor de Investigación, 2005.
CIB, CSIC.

www.rosasnet.org/consolider/11

Fisiopatología Molecular de la Pared Molecular

Vascular Pathophysiology of
Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine

the Vascular Wall

N
uestro grupo investiga los proceso consustancial al desarrollo de

m
mecanismos moleculares, diversas patologías vasculares como

edicina
cellular
bioquímicos y celulares que la aterotrombosis, la hipertensión o la

&
subyacen a la fisiopatología de la pared diabetes. En el desarrollo de las mismas,

O
vascular. La disfunción endotelial es un es fundamental la descompensación ur group investigates the molecular,
entre depósito y degradación de matriz biochemical, and cellular mechanisms
Este grupo se trasladó el 1 de enero de 2010 al Centro extracelular que se produce en los procesos that underlie the pathophysiology of

de Biología Molecular Severo Ochoa (CSIC, Madrid).
This group moved to the Centro de Biología Molecular
Severo Ochoa (CSIC, Madrid) on January 1st, 2010.
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Tello D, Tarin C, Ahicart P, Bretón-Romero R,
Lamas S, Martinez-Ruiz A. A “fluorescence switch”
technique increases the sensitivity of proteomic
detection and identification of S-nitrosylated
proteins. Proteomics. 2009, 9:5359-70
Redondo-Horcajo M, Romero N, Martínez-Acedo
P, Martínez-Ruiz A, Quijano C, Lourenço CF, Movilla
N, Enríquez JA, Rodríguez-Pascual F, Rial E, Radi
R, Vázquez J, Lamas S. Cyclosporine A-Induced
Nitration of Tyrosine 24 MnSOD in Endothelial
Cells: Role of Mitochondrial Superoxide.
Cardiovasc. Res. 2010, 87: 356-65.
Lagares D, García-Fernández R.A., López Jiménez
C, Magán-Marchal N, Busnadiego O, Lamas S,
Rodríguez-Pascual F. Endothelin-1 contributes to
the effect of transforming growth factor-β1 on
wound repair and skin fibrosis. Arthritis Rheum.
2010, 62: 878-89.
Patente
Patent
Santiago Lamas, Patricia Rodriguez, M. Ángeles
Higueras, Jorge Laborda. (CSIC y Universidad de
Castilla-La Mancha). Uso de Dlk-1 como inhibidor de
angiogénesis.
Nº de solicitud española: P201031547 (21-10-2010)
MOVING ON GROUP
fibróticos. Parte de los mecanismos
moleculares que llevan al desarrollo de estos
procesos están bien establecidos, pero no se
sabe como detener o suprimir este proceso.
Para comprender el papel de los agentes
profibróticos y vasoconstrictores en el daño
vascular hemos desarrollado modelos de
animales genéticamente modificados en
relación con el eje TGFβ/ET-1. Estamos
también interesados en la búsqueda de
nuevos mecanismos de regulación del gen
de la endotelina-1 a través de mecanismos
de regulación postraduccional sensibles
al estado redox. Nuestro laboratorio ha
contribuido también durante este periodo
a la identificación de modificaciones
post-traduccionales especificas
(S-glutationilación, S- nitrosilación y nitración
de tirosinas) en células endoteliales y en
proteínas aisladas. Finalmente, estamos
interesados en la búsqueda de nuevas
estrategias antiangiogénicas con el fin de
reducir el crecimiento tumoral. En este
sentido hemos identificado al ligando no
canónico de la ruta de Notch, dlk-1/Pref1,
como un potente inhibidor de angiogénesis.
Queremos aplicar estos conocimientos a
modelos in vivo fisiopatológicos utilizando
células, animales y pacientes.
celular molecular
the vascular wall. Endothelial dysfunction is an
event inherently related to the development of
vascular pathology in humans and associated
to disease entities such as atherotrombosis,
hypertension or diabetic vascular disease. In the
development of vascular disease the balance
between extracellular matrix degradation
and deposition which ultimately leads to the
establishment or resolution of a fibrotic process.
Even when part of the molecular mechanisms
leading to it are well known, no clues are
available to effectively defer or suppress this
process. In order to understand the role of
pro-fibrotic and vasoconstrictive agents in
vascular damage we are developing genetically
modified animals addressing the role of the
TGFβ-endothelin-1 axis. Our laboratory has
contributed extensively to identify specific
posttranslational modifications promoted
by reactive oxygen and nitrogen species in
endothelial cells and in isolated proteins.
Finally, we are interested in developing new
antiangiogenic strategies in order to halt tumor
growth. In this regard, we have identified the
non canonical Notch ligand, dlk-1/Pref1, as a
potent angiogenesis inhibitor. We would now
like to apply the relevance of this knowledge to
in vivo pathophysiological models of disease,
using cells, animals and patients.

95
94
 Microbiología Molecular
Microbiología Molecular y Biología de las Infecciones | Molecular Microbiology & Infection Biology

y Biología de las Infecciones

Molecular Microbiology
& Infection Biology

Paloma López 98
Biología Molecular de Bacterias Gram-positivas | Molecular Biology of Gram-positive Bacteria

Manuel Espinosa · Alicia Bravo 100

Expresión Génica y Transferencia Genética en Bacterias
Bacterial Gene Expression and Gene Transfer

Ramón Díaz Orejas 102

Sistemas Toxina-Antitoxina Bacterianos | Bacterial Toxin-Antitoxin Systems

Gloria del Solar 104

Replicación y Expresión del DNA en Bacterias Gram-positivas
Replication and Expression of DNA in Gram-positive Bacteria

Vicente Larraga 106

Parasitología Molecular | Molecular Parasitology

Sara I. Pérez Prieto · Sylvia RodrÍguez 108

Virología en acuicultura | Viruses in reared fish

Ernesto García · Pedro García 110

Genética Bacteriana | Bacterial Genetics

José Luis Rodríguez 112

Funciones y Mecanismos Moleculares Reguladores de las Funciones
de los Receptores de Quimiotácticos | Functions and Molecular Mechanisms
Regulating the Functions of Chemokine Receptors

Ángel Corbí · Miguel Ángel Vega 114

Biología de células mieloides | Myeloid Cell Biology
96
 Presentación
Microbiología
Molecular y Biología de
las Infecciones
Los microorganismos puede ser patógenos, comensa-
les o simbióticos de los organismos eucarióticos, de-
pendiendo de las interacciones entre las células pro-
carióticas y eucarióticas. Caracterizar este mundo de
interacciones entre organismos es un reto de los inves-
tigadores del siglo XXI.
Molecular
P
or este motivo, en 2008 se creó el Departamento de Microbiología
Molecular y Biología de las Infecciones (MMBI) que aglutina grupos

Microbiology
de investigación previamente existentes en el Centro, y que debido
a sus diferentes especialidades, pudieran realizar en colaboración, estudios
de interacción procariotas-eucariotas así como análisis de sus mecanismos
moleculares de supervivencia, ataque, defensa y coexistencia. Dichos grupos
de investigación son expertos en bioquímica, biofísica, inmunología, micro-
biología, biología molecular, fisiología, virología, bioinformática y biología
estructural.
& Infection Biology
Esta complementariedad de los investigadores integrantes del MMBI, ha crea-
do un entorno que potencia la transferencia de conocimiento y tecnología y Microorganisms can be pathogens, commensals or symbionts of eukaryo-
que facilita el abordaje de nuevos proyectos que requieren una aproximación
tic organisms depending on the “molecular cross-talk” between the prokar-
multidisciplinar para alcanzar sus objetivos.
yotic and eukaryotic cells. To unravel this fascinating world of interactions
Actualmente el MMBI está constituido por 9 grupos de investigación, que between organisms is a challenge for the researchers of the XXI century.
estudian los mecanismos de infección, patogénesis, parasitismo y comensa-

lismo, así como la transferencia y la expresión génica en bacterias, protozoos
y virus. Además, la investigación realizada en el Departamento tiene como
objetivo desarrollar vacunas e inhibidores contra estos microorganismos, así
como estudiar la respuesta inmune del hospedador.
Paloma López
JefA de Departamento
T
herefore, in 2008 the Department of Molecular Microbiology and Infection Biology (MMIB) was
created at the CIB to bring together research teams already established in the centre, which, due to
their various expertises, could carry out interactomic studies as well as determine the fine detail of
the prokaryotic and eukaryotic evolutionary molecular mechanisms involved in survival, attack, defence
or coexistence. These teams have accredited experience by themselves or by their collaborations in
biochemistry, biophysics, immunology, microbiology, molecular biology, physiology, virology, bioinfor-
matics, and structural biology.
This unification within the MMBI has created an environment that facilitates the efficient transfer of
knowledge and technology, and encourages the creation of projects that require multiple scientific skills
in order to reach their objectives.
Currently, the MMIB consists of 9 research groups, which approach the study of mechanisms of infection,
pathogenesis, parasitism and commensalism as well as gene transfer and expression in microorganisms
including bacteria, protozoa and viruses. Moreover, the research performed at the Department has the
objective of developing vaccines and inhibitors against these microorganisms as well as the study of the
immune response of the host.

Paloma López
Department HEAD

98
Overview 99
 Paloma López García
Investigadora Científica | plg@cib.csic.es
PhD, 1978. Investigadora del equipo | Staff Scientist:
Universidad Complutense de Madrid.
Pilar Fernández de Palencia Delgado
Postdoctoral, 1979-1980.
Institute of Biochemistry and Biophysics, Polish
Academy of Science, Varsovia, Poland.
Otros miembros | Other lab members:
Postdoctoral, 1981.
Brookhaven National Laboratory, Upton, USA. Mª Luz Mohedano Bonillo Mª Laura Werning
Microbiología Molecular y Biología de las Infecciones | Molecular Microbiology & Infection Biology

Research Associate, 1983. Sara Notararigo Gaiser Rogier Aaron

Brookhaven National Laboratory, Upton, USA. Mª Angeles Corrales González Cristina Quevedo Sierra
Científica Titular, 1985,
Jefa de grupo, 1987,
Investigadora Científica, 1992.
CIB, CSIC
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=41

Biología Molecular de Bacterias Gram-positivas

Las bacterias lácticas son de interés en la elaboración
de alimentos fermentados por sus rutas metabólicas
que a veces pueden generar compuestos tóxicos.
Dichas bacterias tienen además un potencial como
micro­orga­nismos probióticos y/o sintetizadores de
compuestos prebióticos con efectos beneficiosos
para la salud humana. Estamos caracterizando rutas
metabólicas de bacterias lácticas y sus interacciones
con células intestinales humanas con el objetivo
de desarrollar alimentos funcionales y mejorar la
seguridad de éstos.

E
stamos purificando y caracterizando
exopolisacáridos (EPS), del tipo
β-glucanos, producidos por bacterias
lácticas (BAL) con el objetivo de realizar
estudios inmunológicos en colaboración
con el Prof. Angel Corbí y la Dra. Alicia
Prieto (CIB). Asimismo, hemos identificado y
estamos analizando nuevas BAL productoras
de otros EPS, valorando su viabilidad en el
tracto digestivo, resistencia al estrés gástrico
y su interacción con células intestinales
humanas. Esta investigación se enmarca en
los proyectos nacionales (AGL2006-11932-C05,
AGL2009-12998-C03) coordinados por el CIB.
En ellos se promueve el estudio de EPS y
de sus bacterias productoras, incluyendo la
evaluación de sus propiedades prebióticas
y probióticas así como su comportamiento
durante la elaboración de alimentos
funcionales (Fig. 1).
También, en colaboración con el grupo
del Prof. Corbí, estamos estudiando BAL
productoras de histamina, tiramina y
putrescina (aminas biógenas, AB), aisladas
de productos lácteos y de fermentaciones
alcohólicas. Los resultados obtenidos
indican una activación funcional de las rutas
bacterianas biosintéticas de AB en el tracto
digestivo humano. Esta activación depende
de la estirpe y provoca un incremento de la
resistencia bacteriana al estrés gastrointestinal
y de su capacidad de adhesión a células
epiteliales humanas, junto con una
inmunomodulación de dichas células.
Esta línea de trabajo está enmarcada en el
proyecto internacional KBBE-CT-2007-2114
financiado por la Unión Europea en el VII
Programa Marco, que tiene como objetivo
determinar los mecanismos de control de la
producción de estos compuestos así como
su efecto sobre la salud humana al ingerir las
bacterias productoras.
Molecular Biology of Gram-positive Bacteria
Lactic acid bacteria are of interest for the preparation cells was evaluated by use of in vitro models. This research falls within
of foodstuffs due to their metabolic pathways, Spanish projects (AGL2006-11932-C05 and AGL2009-12998-C03)
coordinated by the CIB. This work promotes study of EPS, and of their
although some can generate toxic compounds,
producing bacteria isolated from food and beverages, including the
They have potential as probiotic organisms, and/ evaluation of their prebiotic and probiotic properties as well as their
or synthesisers of prebiotic compounds, that behaviour during elaboration of functional food (Fig. 1).
could benefit human health. Therefore, our group
is characterizing lactic acid bacteria and their We are also studying, in collaboration with the group of Prof. Corbí,
metabolism with the aims of improving food quality histamine, tyramine and putrescine (biogenic amines, BA) producing
LAB isolated from dairy products and alcoholic beverages in the
and safety, and developing probiotic bacteria and
simulated gastrointestinal environment. The results obtained so far
prebiotic agents for preparation of functional food. indicate a functional activation of the BA biosynthetic pathways
upon digestive tract stress. This activation has different consequences
depending on the producer strain and usually results in increased

W
e are purifying and characterising exopolysaccharides
(EPS), a new type of β-glucan, produced by lactic acid
bacteria (LAB) with the aim of providing substrates for
immunological testing in collaboration with Prof. Angel Corbí and
Dr. Alicia Prieto (CIB). In addition, our group is analyzing new EPS-
producing LAB. The viability in the digestive tract and resistance to
this stress of LAB as well as their interaction with human epithelial
bacterial survival to gastrointestinal stress, potentiation of bacterial
adhesion to epithelial human cells and immunomodulation of
these cells. This research line falls within the multinational Project
KBBE-CT-2007-2114 supported by the VII Framework program of the
European Union with the objective of determining the mechanisms
controlling production of BA and the effect of the producing bacteria
after ingestion in human health.

Fig. 1. Producción y caracterización de β-glucanos y evaluación de las bacterias lácticas
productoras. Estirpes de Pediococcus parvulus aisladas de sidra y estirpes recombinates
de L. lactis han sido utilizadas para producir un 2-sustituido (1,3)-β-D-glucano. Análisis
fisicoquímico del EPS purificado ha confirmado su estructura primaria. Análisis de las
interacciones, con líneas celulares humanas, de las estirpes isogénicas, de P. parvulus,
2.6R y 2.6NR productora y no productora del β-glucano sugieren funciones de este
EPS. En P. parvulus 2.6, su presencia parece contrarrestar la actividad proinflamatoria
de los macrófagos M1 en respuesta a la bacteria. Además incrementa la capacidad
bacteriana para adherirse a células Caco-2 epiteliales.
Production and characterization of β-glucans and evaluation of producing lactic acid
bacteria. Pediococcus parvulus strains isolated from cider and L. lactis recombinant
bacteria have been used as a source of 2-substituted (1,3)-β-D-glucan. Physicochemical
analyses of the purified EPS confirmed their expected primary structure. Analysis of
interactions with human cell lines of P. parvulus 2.6R and 2.6NR isogenic β-glucan
producing and non-producing strains suggest roles of this EPS. In P. parvulus 2.6, its
presence seems to counteract the proinflammatory activation of M1 macrophages
in response to the bacterium. Moreover, it increases its capability to adhere to Caco-2
epithelial cells.
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Fernández de Palencia, P., Fernández, M., Mohedano, M.L., Ladero, V., Quevedo, C.,
Alvarez, M.A. and López, P. (2011). The role of tyramine synthesis by food-borne
Enterococcus 1 durans in the adaptation to 2 the gastrointestinal tract environment.
Appl. Environ. Microbiol. 77, 699–702.
Garai-Ibabe, G., Dueñas, M.T., Irastorza, A., Sierra-Filardi, E., Werning, M.L., López, P., Corbí,
A.L., and Fernández de Palencia, P. (2010). Naturally occurring 2-substituted (1,3)-β-D-
glucan producing Lactobacillus suebicus and Pediococcus parvulus strains with potential
utility in the production of functional foods. Bioresource Technology 101, 9254–9263.
G Spano, G.,Russo, P., Lonvaud-Funel, A., Lucas, P., Alexandre, H., Grandvalet, C., Coton,
E., Coton, M., Barnavon, L., Bach, B., Rattray, F., Bunte, A., Magni, C., Ladero, V., Alvarez, M.,
Fernandez, M., López, P., P., Fernández de Palencia, P., Corbi, A., Trip, H. and Lolkema, J.S.
(2010) Biogenic amines in fermented foods. European J. Clin. Nutrition 64, S95–S100.
Ibarburu, I., Aznar, R., Elizaquivel, P., García-Quintans, N., López, P., Munduate, A., Irastorza,
A., and Dueñas, M.T. (2010). A real-time PCR assay for detection and quantification of
2- branched (1,3)-beta-D-glucan producing lactic acid bacteria in cider. Int. J. Food
Microbiol. 93, 335-347.
Fernández de Palencia, P., Werning, M.L., Sierra-Filardi, E., Dueñas, M.T., Irastorza, A., Corbí,
A.L., and López, P. (2009). Probiotic properties of the 2-substituted (1,3)-β-D-glucan
producing Pedioccus parvulus 2.6 . Appl. Environ. Microbiol. 75, 4887-4891.
Molecular aspects of lactic acid bacteria for traditional and new applications(2008),
edited by by B. Mayo, P. López, and G. Pérez-Martín. Research Signpost, Kerala, India.
Werning, M.L., Corrales, M.A., Prieto, A., Fernández de Palencia, P., Navas, J., and López,
P., (2008) Heterologous expression of a 2-substituted-(1→3)-β-D-glucan in Lactococcus
lactis. Appl. Environ. Microbiol. 74, 5259-5262.

100 101
 Manuel Espinosa
Profesor de Investigación | mespinosa@cib.csic.es
PhD in Sciences, 1969. UCM.
Postdocs in:
The Netherlands, Poland and USA.
Group leader, 1984,
Research Professor, since 1990,
Director of the CIB, 1992-1993.
Microbiología Molecular y Biología de las Infecciones | Molecular Microbiology & Infection Biology
EMBO member, since 1996.
Coordinator of the Grant CONSOLIDER
(INTERMODS, till 2013) and of the Spanish
Network of Extrachromosomal Elements
(REDEEX, till 2011)
141 papers in scientific journals
Expresión Génica y Transferencia Genética en Bacterias
El leit motif del grupo INTERMODS (Consolider CSD2008-00013) es “Days
of wonder for years to come”.
M
etas: 1.- Herramientas genéticas
plasmídicas para Streptococcus
pneumoniae y Enterococcus faecalis.
Diseño de plásmidos derivados de pMV158
con el gen gfp (proteína fluorescente verde);
vectores, movilizables o no, con expresión
constitutiva o inducible de gfp. Plásmidos
para ensayar la actividad de promotores o
terminadores, e identificación de promotores
de pneumococos y enterococos que
aumentan, hasta diez veces, la expresión
génica. 2.- Transferencia conjugativa de
pMV158 mediada por la proteína MobM
(codificada por pMV158) y por proteínas
codificadas por plásmidos auxiliares. Hemos
Ensayos de relajación del DNA de pMV158. Muestras de DNA
plasmídico fueron tratadas con la proteína MobM purificada.
Los productos resultantes fueron visualizados por dos métodos:
electroforesis en geles de agarosa (centro) y microscopía
electrónica (derecha e izquierda). En el gel de agarosa, las
formas covalentemente cerradas y superenrolladas (CCC) tienen
una migración electroforética diferente de las formas relajadas
(OC). Las micrografías electrónicas muestran moléculas de DNA
de pMV158 superenrolladas (izquierda) y relajadas (derecha).
La flecha indica la posición donde la proteína permanece
unida a su DNA diana. (F. Lorenzo-Díaz, A. Bravo, R. Lurz and M.
Espinosa, sin publicar).
102
Alicia Bravo
Científica Titular | abravo@cib.csic.es
definido el origen de transferencia (oriT,
tres secuencias palindrómicas parcialmente
solapantes) que contiene los sitios de
unión y corte de MobM. Hemos purificado
MobM y MobMN199 (conserva los primeros
199 aminoácidos) y hemos estudiado sus
parámetros biofísicos, requerimientos de
cationes, características hidrodinámicas
y estructuras secundarias. 3.- Sistemas
cromosómicos de Toxinas-Antitoxinas
(TAS) de S. pneumoniae. Hemos clonado,
secuenciado y caracterizado tres TAS. El
primero, relBE1Spn, resultó no ser funcional.
Se estudia la funcionalidad de los sistemas
relBE2Spn y yefMyoeBSpn y las características
PhD in Biology, 1988, UCM.
Postdoc, 1988-1990.
Max-Planck Institut für molekulare Genetik, Berlin,
Germany.
Post-doc, 1991-2005.
Centro de Biología Molecular ‘Severo Ochoa’ and
tenure track contract ‘Ramón y Cajal’ at CBMSO.
Tenure track contract, 2005-2007.
Ramón y Cajal at the CIB.
Staff Scientist, since 2007.
Group leader and PI of projects, since 2006.
de unión de las proteínas a su DNA diana.
4.- Reguladores globales de virulencia en
S. pneumoniae y E. faecalis. El IP de esta
línea es A. Bravo. Ambas bacterias causan
infecciones de importancia sanitaria debido
a la emergencia y prevalencia de estirpes
con múltiples antibiótico-resistencias.
Hemos encontrado que los genomas
de estas bacterias codifican reguladores
transcripcionales que, probablemente,
controlan la expresión de genes
relacionados, directa o indirectamente, con
virulencia. La caracterización molecular de
estos reguladores y la identificación de sus
genes diana son dos de nuestros retos.
Colaboraciones: M. Coll, F.G. del Portillo, R.
Díaz-Orejas, J. Casadesús, C.C.Yeo, J. Schildbach,
R. Lurz, M. Menéndez, A. Juárez, E. Medina.
Relaxation of plasmid pMV158 DNA. Plasmid DNA
samples were treated with purified MobM protein and
the products were visualized by two methods: agarose
gel electrophoresis (centre) and electron microscopy
(left and right). In the agarose gels, the covalently-closed
circular forms (CCC) are separated from the relaxed
open circles (OC) due to the different migration abilities.
Electron micrographs show supercoiled (left) and
relaxed (right) plasmid DNA molecules. Arrow points to
the position where the protein remained attached to
its target DNA (F. Lorenzo-Díaz, A. Bravo, R. Lurz and M.
Espinosa, unpublished).
Otros miembros | Other lab members:
Luis Fabián Lorenzo Díaz
Inmaculada Moreno Córdoba
Wai Ting Chan
Cristina Fernández López
Virtudes Solano Collado
Sofía Ruiz Cruz
Lorena Rodríguez González
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=45
Bacterial Gene Expression
and Gene Transfer
The leit motif of the INTERMODS’ group (Consolider
CSD2008-00013) is “Days of wonder for years to come”.
G
oals: 1.- Construction of plasmid genetic tools for Strep-
tococcus pneumoniae and Enterococcus faecalis. We have
designed plasmids based on the pMV158 replicon that
harbour the gfp gene (green fluorescent protein). In these plasmids,
mobilizable or not, gfp expression is inducible or constitutive. We
have constructed promoter- and terminator-probe vectors, and we
have identified pneumococcal and enterococcal promoters that
increase, up to ten times, the gene expression. 2.- Conjugal transfer
of pMV158. This plasmid can be mobilized between different hosts
by means of the plasmid-encoded MobM protein and other proteins
encoded by auxiliary plasmids. We have defined the pMV158-origin
of transfer (oriT, three palindromic sequences partially overlap-
ping) where the binding- and cleavage sites of MobM are located.
We have purified MobM and MobMN199 (first 199 residues) and
their biophysical and biochemical parameters have been studied.
3.- Chromosomally-encoded Toxin-Antitoxin Systems (TAS) from S.
pneumoniae. We have cloned, sequenced and characterized three
TAS. relBE1Spn was shown to be non-functional, whereas relBE2Spn
and yefMyoeBSpn are bona fide TAS. Their toxicity features and their
DNA-binding ability are being studied. 4.- Global virulence regulators
of S. pneumoniae and E. faecalis. The PI of this line is A. Bravo. These
bacteria are causal agents of serious infections, which are relevant
because of the appearance of strains resistant to multiple antibiotics.
Both bacterial genomes encode transcriptional regulators that, most
likely, control the expression of genes involved, directly or indirectly,
in virulence. The molecular characterization of these regulators and
the identification of their target genes are our challenging goals.
Collaborations: M. Coll, F.G. del Portillo, R. Díaz-Orejas, J. Casadesús,
C.C.Yeo, J. Schildbach, R. Lurz, M. Menéndez, A. Juárez, E. Medina.
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Lorenzo-Díaz, L.F. and Espinosa, M. (2009). Large-scale filter
mating assay for intra- and inter-specific conjugal transfer of the
promiscuous plasmid pMV158 in Gram-positive bacteria. Plasmid
61: 65-70.
Lorenzo-Díaz, L.F. and Espinosa, M. (2009). Lagging strand DNA
replication origins are required for conjugal transfer of the
promiscuous plasmid pMV158. J. Bacteriol. 191: 720-727.
Boer, D.R., Ruíz-Masó, J.A., López-Blanco, J.R. Blanco, A.G., Vives-Llàcer,
M. Chacón, P., Usón, I., Gomis-Rüth, F.X., Espinosa, M., Llorca, O., del
Solar, G. and Coll, M. (2009). Plasmid replication initiator RepB forms
a hexamer reminiscent of ring helicases and has mobile nuclease
domains. EMBO J. 28: 1666-1678.
Hernández-Arriaga, A.M., Rubio-Lepe, T. S., Espinosa, M. and del Solar,
G. (2009). Repressor CopG prevents access of RNA polymerase to
promoter and actively dissociates open complexes. Nucleic Acids
Res. 37: 4799-4811.
Díaz-Orejas, R., Diago-Navarro, E., Hernández-Arriaga, A.M., López-
Villarejo, J., Lemonnier, M., Moreno-Córdoba, I., Nieto, C. and Espinosa,
M. (2010). Bacterial toxin-antitoxin systems targeting translation. J.
Appl. Biomed. 8: 179-188 (DOI 10.2478/v10136-009-0021-9.
Nieto, C., Sadowy, E., de la Campa, A.G., Hryniewicz, W. and
Espinosa, M. (2010). The relBE2Spn Toxin-Antitoxin System of
Streptococcus pneumoniae: Role in Antibiotic Tolerance and
Functional Conservation in Clinical Isolates. PLoS ONE 5(6): e-11289.
doi:10.1371/journal.pone.0011289.
Ruiz-Cruz, S., Solano-Collado, V., Espinosa, M. and Bravo, A. (2010).
Novel plasmid-based genetic tools for the study of promoters and
terminators in Streptococcus pneumoniae and Enterococcus faecalis.
J. Microb. Meth. 83: 156-163.
Patente
Patent
S. Ruiz Cruz, V. Solano Collado, M. Espinosa y A. Bravo.
“Nuevas herramientas genéticas plasmídicas para bacterias Gram-
positivas”. 2010. Patente Nº 201030841.
103
 Ramón Díaz Orejas
Profesor de Investigación | ramondiaz@cib.csic.es
PhD en CC. Químicas (Bioquímica), 1977.
Universidad Complutense de Madrid.
Posdoctorales, 1975-1981.
Universidad de Leicester (UK), Universidad de
Odense (DK) e Instituto Max-Planck de Genética
Molecular, Berlin, (Alemania)
Científico Titular, 1979,
Microbiología Molecular y Biología de las Infecciones | Molecular Microbiology & Infection Biology
Jefe de Grupo,1981,
Investigador Científico,1989,
Profesor de Investigación, 2004.
CIB, CSIC
Sistemas Toxina-Antitoxina bacterianos
Nuestro grupo estudia la regulación, función y
aplicaciones de los sistemas toxina-antitoxina
(TA) bacterianos con foco en el sistema parD
(kis,kid) del factor de resistencias a antibióticos de
enterobacterias R1. Este sistema fue encontrado en
L
os sistemas TA son biosensores basados
en el juego de una antitoxina inestable
y una toxina estable. La inactivación
selectiva de la antitoxina por las proteasas
celulares (sistemas tipo II) o por RNasas
(sistemas tipo I) activa la toxina y resulta en
una interferencia con crecimiento/viabilidad
celular que está asociada a sus efectos
en estabilidad plasmídica y en respuesta
a estrés. El origen, función, relaciones de
estos sistemas y sus incidencia clínica y
biotecnológicas atraen un interés creciente
en la comunidad científica.
Focalizamos nuestros estudios en el sistema
parD del factor de resistencia R1 que
descubrimos y localizamos en la región
adyacente al replicón básico de R1. Este
sistema se activa y estabiliza el plásmido
en condiciones de replicación ineficiente.
En colaboración con grupos nacionales
e internacionales definimos la estructura,
actividad y mecanismo de acción de la
toxina del sistema, una endoribonucleasa
específica que puede romper RNA en
solución y que inhibe síntesis de proteínas
en procariotas y eucariotas. Hemos definido
la actividad diferencial de los complejos
toxina-antitoxina en la neutralización de
la toxina y en la regulación del sistema
y hemos establecido el potencial de la
toxina Kid para inducir muerte celular en
células embrionarias o somáticas y el de la
antitoxina para proteger de estos efectos.
Estos resultados suponen el punto de
partida para los estudios que realizamos
actualmente y que exploran aspectos
singulares relacionados con la regulación
transcripcional del sistema, el acoplamiento
con el modulo replicativo del plásmido
R1, la inhibición de crecimiento/viabilidad
modulada por la dosis relativa de toxina
y antitoxina, las interrelaciones con otros
sistemas TA y su utilización en la búsqueda
de nuevos antimicrobianos y antitumorales.
104
Otros miembros | Other lab members:
Alicia Rodríguez Bernabé
Ana María Hernández-Arriaga
Elizabeth Diago Navarro
Juan López Villarejo
Damian Lobato Márquez
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=9
nuestro laboratorio. El sistema ccd de F (el primer
sistema TA descrito), el sistema parD de R1 y el
sistema relBE de E. coli, establecieron el campo,
ahora en rápida expansión, de los sistema TA tipo II
en microbiología.
A B
C
Fig. 1. Residuos de la ribotoxina
Kid implicados en corte (A) y Unión
específica al RNA (B). (C) Efectos
en el crecimiento/cultivabilidad
celular de mutaciones de la toxina
en residuos del sitio de corte o de
unión específica al RNA.
Residues of the Kid ribotoxin envolved
in RNA cleavage (A) and in specific
RNA binding (B). (C) Effects on cell
growth/cultivability of mutations
affected in residues of Kid involved in
RNA cleavage or RNA binding.
Bacterial
Toxin-Antitoxin systems
Our group studies the regulation, function and
biotechnological applications of bacterial (TA) systems
are focused on singular aspects of the transcriptional regulation of
the system, its coupling with the basic replication functions of the
plasmid, the modulation of cell growth mediated by the concerted
with a focus in the parD (kis, kid) TA system of plasmid
action of the toxin and the antitoxin, the interrelations of parD with
R1. This system, discovered in our laboratory, was other TA systems and its applications in the search of novel antimicro-
the second type II TA system described; The ccd of F bials or anti-tumourals.
(the first TA system described), the parD
system of R1 and the relBE system
of E.coli, established the flourishing
and fast expanding field of type II TA
systems in microbiology.
T
A systems are stress biosensors which action is based
in the interplay of an unstable antitoxin and a stable
toxin. Decay of the antitoxin activates the toxin and
this results in interference with cell growth /viability of the
host; this activation is related to complex effects of these
systems on plasmid stability and stress response. The origin,
function and relationships of these systems and their
clinical and biotechnological implications are actively being
explored.
We are focussing in the parD (kis-kid) TA system of plasmid
R1. This system, which is adjacent to the basic replicon of R1, can
rescue inefficient replication of the plasmid. We discovered this
system and in collaboration with national and international groups,
we defined the structure, activity and mechanism of action of the
toxin of the system as a specific endoribonuclease that can cleave
Fig. 2. Complejos toxina-antitoxina e interacciones implicadas en la regulación
RNA in the absence of ribosomes and inhibit protein synthesis. The transcripcional del sistema parD del plásmido R1. Sólo el heterooctámero Kis-Kid
differential roles of toxin-antitoxin complexes in neutralization of the promueve una regulación eficiente (flecha curva contínua) al permitir la interacción en
Kid toxin and in regulation of the system have been defined as well fase de dos dímeros de la antitoxina con las repeticiones invertidas de los sitios I y II.
as the potential of Kid RNase to induce cell death in embryonic or Toxin-antitoxin interactions involved in transcripcional regulation of the parD system of
plasmid R1. Only the Kis-Kid heterooctamer promotes an efficient regulation (curved
somatic cell lines and of the Kis antitoxin to neutralize these effects. and continuous arrow) mediated by the in phase interactions of two dimers of the
These results define the starting point for our present studies that antitoxin on the specific promoter-operator sequences.
Publicaciones Seleccionadas Kamphuis MB, Monti MC, van den Heuvel RH, Santos Sierra S, Lemnnier M, Diaz-Orejas R,
Selected Publications Heck AJ and Boelens R. (2007) Interactions between the toxin Kid of the bacterial parD
system and the antitoxins Kis and MazE. Proteins 67, 219-231.
Kamphuis MB, Bovin AM, Monti MC, Lemonnier M, Munoz-Gomez A, van den Heuvel RH,
Diago-Navarro E, Hernandez-Arriaga AM, López-Villarejo J, Muñoz-Gómez AJ, Kamphuis
Diaz-Orejas R and Boelens R (2006). Model for RNA binding and the catalytic site of the
MB, Boelens R, Lemonnier M, Díaz-Orejas R. (2010). parD toxin-antitoxin system of
plasmid R1--basic contributions, biotechnological applications and relationships with RNase Kid of the bacterial parD toxin-antitoxin system. J. Mol. Biol. 357, 115-126.
closely-related toxin-antitoxin systems. FEBS J. 277: 3097-117. Muñoz-Gómez AJ, Lemonnier M, Santos-Sierra S, Berzal-Herranz A, Diaz-Orejas R (2005).
Diago-Navarro E, Kamphuis MB, Boelens R, Barendregt A, Heck AJ, van den Heuvel RH, RNase/anti-RNase activities of the bacterial parD toxin-antitoxin system.J. Bacteriol. 187,
Díaz-Orejas R. (2009). A mutagenic analysis of the RNase mechanism of the bacterial Kid 3151-3157.
toxin by mass spectrometry. FEBS J. 276: 4973-86. Giraldo R, Fernández-Tornero C, Evans PR, Díaz-Orejas R, Romero A (2003) A
Diago-Navarro E, Mora L, Backingham R, Diaz-Orejas R, Lemonier M (2009). Novel E. coli conformational switch between transcriptional repression and replication initiation in
RF1 mutants with decreased translation termination activity and increased sensitivity to the RepA dimerization domain. Nat. Struct. Biol. 10, 565-571
the citotoxic effect of the bacterial toxins Kid and RelE. Mol Microbiol. 71, 66-78. Maestro, B., Sanz, J.M., Díaz-Orejas, R., Fernández-Tresguerres, M.E. (2003) Modulation of
pPS10 host range by plasmid-encoded RepA initiator protein. J. Bacteriol. 185, 1367-1375.
Monti MC, Hernández-Arriaga AM, Kamphuis MB, López-Villarejo J, Heck AJR, Boelens R, Díaz-
Orejas R and van den Heuvel RHH (2007). Interactions of Kis-Kid toxin-antitoxin complexes de la Cueva-Méndez, G., Mills, A.D., Clay-Farrace, L., Díaz-Orejas, R., Laskey, R.A. (2003).
with the parD operator-promoter region of plasmid R1 are piloted by the Kis antitoxin and Regulatable killing of eukaryotic cells by the prokaryotic proteins Kid and Kis. EMBO J.
tuned by the stoichiometry of Kid-Kis oligomers. Nucl. Acids Res. 35, 1737-1749. 22, 246-251.
105
 Gloria del Solar
Investigadora Científica | gdelsolar@cib.csic.es
PhD, 1991.
Universidad Complutense de Madrid.
Científica Titular, 2002,
Jefa de grupo, 2003,
Investigadora Científica, 2009.
CIB, CSIC.
Microbiología Molecular y Biología de las Infecciones | Molecular Microbiology & Infection Biology
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=50
Replicación y Expresión
del DNA en Bacterias Gram-positivas
PMV158 es el prototipo de una familia de plásmidos
promiscuos que replican por “círculo rodante”. La
singularidad de esta familia reside en las estructuras
del origen de replicación y de la proteína iniciadora
R
epB
RepB es el único iniciador de la
replicación plásmídica por círculo
rodante cuya estructura atómica ha sido
resuelta. La proteína presenta un dominio
N-terminal con actividad endonucleolítica
y de unión al origen (OBD), y un dominio
C-terminal implicado en la hexamerización
de la proteína (OD). Ambos dominios de
RepB se han purificado por separado. El
OBD es un monómero que conserva la
actividad catalítica y la capacidad de unirse
al DNA del origen. Mutantes en este dominio
demuestran que la α-hélice 2 está implicada
106
Otros miembros | Other lab members:
José Ángel Ruiz-Masó
Celeste López Aguilar
Tania Samir Rubio Lepe
Marta Sanz Pérez
RepB, así como en el control dual de la replicación
mediado por dos elementos que inhiben la síntesis
de RepB: el represor transcripcional CopG, y el RNA
“antisense” que actúa a nivel postranscripcional.
en la interacción con el DNA específico. Por establecer interacciones cooperativas,
su parte, el OD mantiene la configuración CopGA30E se une con alta cooperatividad a la
hexamérica y no presenta actividad mitad derecha del operador, pero es incapaz
endonucleolítica ni de unión al DNA (Fig. 1). de unirse a la mitad izquierda (Fig. 2).
CopG “Antisense”
La unión cooperativa de CopG a los 4 sitios El análisis de la interacción entre una serie
que constituyen su operador determina la de RNAs “antisense” mutantes y su diana en
alta afinidad y especificidad de la proteína. el mRNArep muestra que la formación de
CopGG25E y CopGA30E, que tienen cambios un “kissing complex” por apareamiento de
en residuos localizados en la superficie de los lazos de estructuras complementarias
interacción dímero-dímero, son defectivas en en ambos RNAs no se requiere para unión e
la unión al operador, y presentan alteraciones inhibición eficientes. El apareamiento entre
diferenciales en su patrón de cooperatividad: inhibidor y diana parece progresar hacia
mientras que CopGG25E es incapaz de arriba por dichas estructuras.
Fig. 1. El estado de asociación de los
dominios OBD y OD de RepB se analizó
mediante ultracentrifugación analítica.
La estructura 3D de los dominios OBD
(verde) y OD (morado) se muestra junto
con el correspondiente gradiente de
sedimentación.
Fig. 1. The association state of the separate
OBD and OD RepB domains was analyzed
by analitycal ultracentrifugation. The 3D
structure of the domains OBD (green)
and OD (cyan) is shown together with the
corresponding sedimentation gradient.
Replication and Expression of DNA in Gram-positive Bacteria
PMV158 is the prototype of a family of promiscuous
plasmids replicating by the rolling-circle mechanism.
The singularity of this plasmid family lies in the
structures of the replication origin and of the RepB
initiator, as well as in a dual control of replication
mediated by two elements that inhibit RepB synthesis:
transcriptional repressor CopG, and antisense RNA
acting at a posttranscriptional level.
Fig. 2. Las proteínas mutantes CopGG25E y CopGA30E. A, Superficie de interacción de los
dos dímeros de CopG unidos al Elemento Simétrico del DNA operador. Los círculos
indican la posición de los aminoácidos alterados en los mutantes CopGG25E (amarillo)
y CopGA30E (rosa). B, Alteraciones en la unión cooperativa de los dos mutantes de
CopG al DNA operador.
Fig. 2. CopGG25E and CopGA30E mutants. A, Interaction surface of the two CopG dimers
bound to the Symmetric Element of the operator DNA. Circles indicate the position of
altered amino acids in CopG mutants CopGG25E (yellow) and CopGA30E (pink). B, Impaired
cooperativity in binding of the two CopG mutants to the operator DNA.
R
epB
The atomic structure of RepB is the first example among the
plasmid-encoded initiators of rolling-circle replication. RepB
shows an N-terminal domain with origin binding and endonuclease
activities (OBD) and a C-terminal domain involved in protein hexam-
erization (OD). Both RepB domains have been separately purified.
OBD is monomeric and retains the catalytic activity and the ability to
bind to the specific origin DNA. OBD mutants have shown that helix
α-2 of the protein is involved in the interaction with the specific DNA.
Conversely, OD retains the hexameric configuration and lacks the
DNA binding and endonucleolytic activities (Fig. 1).
CopG
Cooperative binding of CopG to the 4 sites composing its operator
determines the high affinity and specificity of the protein. CopGG25E
and CopGA30E, having changes in residues located in the dimer-
dimer interaction surface, are severely impaired in binding to the
operator and exhibit cooperativity patterns differentially altered:
whereas CopGG25E is unable to establish cooperative interactions,
CopGA30E binds with high cooperativity to the right half of the
operator but cannot accomplish binding to the left half of it (Fig. 2).
“Antisense”
Analysis of the interaction between a battery of antisense RNA
mutants and the rep mRNA target shows that formation of a “kissing
complex” by pairing through the loops of complementary structures
in both RNAs is not required for efficient binding and inhibition. In
fact, pairing between inhibitor and target RNAs seems to progress
upward on these structures.
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
del Solar,G., Giraldo,G., Ruiz-Echevarría,M.J., Espinosa,M. and Díaz-Orejas,R.
(1998). Replication and control of circular bacterial plasmids. Microbiol. Mol.
Biol. Rev. 62: 434-464.
Álvarez-Martín, P., Flórez, A. B., Margolles, A. del Solar, G., and Mayo, B. (2008).
Improved cloning vectors for bifidobacteria based on the Bifidobacterium
catenulatum pBC1 replicon. Appl. Environ. Microbiol. 74: 4656-4665.
Boer, D. R., Ruíz-Masó, J. A., López-Blanco, J. R., Blanco, A. G., Vives-Llàcer,
M., Chacón, P., Usón, I., Gomis-Rüth, F. X., Espinosa, M., Llorca, O., del Solar,
G*., and Coll, M*. (*, co-corresponding authors) (2009). Plasmid replication
initiator RepB forms a hexamer reminiscent of ring helicases and has mobile
nuclease domains. EMBO J. 28: 1666-1678.
Hernández-Arriaga, A. M., Rubio-Lepe, T. S., Espinosa, M. and del Solar, G.
(2009). Repressor CopG prevents access of RNA polymerase to promoter and
actively dissociates open complexes. Nucl. Acids Res. 37: 4799-4811.
Porrúa, O., Platero, A. I., Santero, E., del Solar, G. and Govantes, F. (2010).
Complex interplay between the LysR-type regulator AtzR and its binding
site mediates atzDEF activation in response to two distinct signals. Mol
Microbiol. 76: 331-347.
107
 Vicente Larraga
Profesor de Investigación | vlarraga@cib.csic.es
MD y PhD, 1974. Investigadora del equipo | Staff Scientist:
Universidad Complutense de Madrid
María Colmenares
Postdoctoral, 1974-1978.
Faculty of Medicine. Hebrew University, Weizman
Institute of Science. Dept of Biology The John´s Otros miembros | Other lab members:
Hopkins University.
Dra. Ana Mª Alonso Ayala
Microbiología Molecular y Biología de las Infecciones | Molecular Microbiology & Infection Biology

1994-95. Department of Pathology. School of

Medicine. New York University. Dr. Pedro J.Alcolea Alcolea
Profesor de Investigación, 1991.
Abel Fernadez Orgiler
CIB, CSIC. Miguel A. Moreno Izquierdo

www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=44

Parasitología Molecular
Se están determinando genes relacionados con la
diferenciación/infectividad en Leishmania infantum
durante la infección experimental en el perro. Para
ello se han definido los genes que muestran una
expresión diferencial a lo largo de las distintas fases
de diferenciación del parásito tanto infectivas como
no infectivas. Asi mismo, se está obteniendo el
patrón de expresión génica entre células de ganglio
linfático procedentes de animales protegidos frente
a la infección, por la vacuna basada en el gen de la
proteína LACK de L.infantum y animales enfermos.
Molecular Parasitology
The genes related to the differentiation/infectivity
processes along the experimental infection in dogs
by L.infantum are being studied. The comparison
between the gene expression profiles from infective
and not infective forms of the parasite along its
differentiation process allowed us to determine
clusters of genes related to L.infantum infectivity. At
in axenic culture, obtaining, depending upon the pH, temperature,
time of culture of the media and aggregation by peanut agglutinin
(PNA), the different forms of the parasite. The use of DNA microarrays
has been used in the study of the factors influencing the differentiation
process towards the amastigote intracellular form.That is, acidic pH,
and temperature (37ºC). The expresion profile resulting from the effect
of these factors on the parasite, separately and together, allowed us to
determine different gene variations that correlate with the effect of the
considered factors. The use of hierarchic clustering method indicated
that the effect of temperature is determinant in the triggering of the
differentiation process from promastigote to amastigote.
We are analyzing the different gene exprssion profiles at the promas-

L
a leishmaniasis es un conjunto
de enfermedades parasitarias
producidas por protozoos del género
Leishmania, perteneciente a la familia de los
Tripanosomátidos. La leishmaniasis visceral
causada por L. infantum es endémica en la
cuenca mediterránea, donde el principal
reservorio es el perro. La organización
mundial de la salud estima una incidencia
de diferenciación que alternan fases
infectivas y no infectivas. Se ha realizado la
comparación de los transcriptomas de los
diferentes estadíos mediante microarrays
de ADN construidos en nuestro laboratorio
a partir de una genoteca obtenida por
fragmentación al azar que representa el
genoma completo de L. infantum. Esto ha
permitido detectar clusters de genes que
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Alcolea, P.J., Alonso, A., Gómez, M.J., Moreno,
I., Domínguez, M., Parro, V., Larraga, V.
Transcriptomics throughout the life cycle of
Leishmania infantum: high down-regulation rate
the same time, gene expression profiles of lymphm
node cells obtained from dogs protected and not
protected against infection by the LACK vaccine
provided information about genes related to the
triggering of the protective immune response in the
mammalian host of the parasite.
tigotes obtained from the gut of the insect vector Phebotomus
pernicosus (Dr.Ricardo Molina, Instituto de Salud Carlos III) with those
obatined from the axenic culture. This will provide reliable data about
the differences between the parasites usually used at the laboratories
with those obtained from nature.
The data obatined so far allowed us to obtain two sets of genes that
either present sub or overexpression correlating with the different
phases of the L.infantum differentiation and their infective or not

anual mundial de 2 millones de casos en
88 países tropicales y subtropicales, de
los cuales 0,5 millones corresponden a la
leishmaniasis visceral con una mortalidad de
aproximadamente 60.000 personas.
Nuestro laboratorio viene trabajando desde
hace años en el desarrollo de una vacuna
de ADN frente a la leishmaniasis canina.
En primer lugar, se desarrolló una vacuna
basada en el gen del análogo del receptor
de la proteína quinasa C activada (LACK)
utilizando dos vehículos recombinantes
para su administración, el vector plasmídico
pCI-neo (pCI-neo-LACK) y el virus vaccinia
(VV-LACK) en un régimen heterólogo.
En colaboración con el laboratorio de la
Dra. Rossi-Bergman del Instituto Carlos
Chagas de Brasil, se llevó a cabo un
estudio de protección en ratones con la
utilización de la vacuna pCI-neo-LACK/
pCI-neo-LACK vía intranasal obteniendo
también buenos resultados de protección
(Oliveira y cols., 2007). Actualmente estamos
estudiando los perfiles de expresión génica
diferencial de los procesos fundamentales
muestran una expresión génica diferencial
durante las fases infectivas del parásito,
promastigotes metacíclicos y amastigotes
con respecto a las no infectivas. Actualmente,
se están analizando las diferencias entre los
promastigotes de L. infantum obtenidos
de la parte anterior del tubo digestivo del
vector Phlebotomus perniciosus (Dr. Ricardo
Molina, Centro Nacional de Microbiología,
Virología e Inmunología Sanitarias, Instituto
de Salud Carlos III), vector responsable de la
enfermedad, y los promastigotes en cultivo
axénico, con el fin de describir las limitaciones
de este modelo usado de forma generalizada.
Actualmente nos hemos planteado
desarrollar una nueva vacuna frente a la
leishmaniasis canina que incluya genes
candidatos que codifiquen antígenos
responsables de la activación de tipo
protector (Th1). Por tanto se seleccionarán
aquellos genes que induzcan un nivel de
protección mayor en el modelo de ratón,
modelo en el que se evaluarán previamente
con la colaboración del grupo del Dr
Valladares de la Universidad de la Laguna.
in the amastigote stage. Int J Parasitol, 2010a,
40 (13):1497-516.
Alcolea, P.J., Alonso, A., Gómez, M.J., Sánchez-
Gorostiaga, A., Moreno-Paz, M., González-
Pastor, E., Toraño, A., Parro, V., Larraga, V.
Temperature increase prevails over acidification
in gene expression modulation of amastigote
differentiation in Leishmania infantum. BMC
Genomics, 2010b, 14, 11:31.
Dujardin, J.C., Herrera, S., do Rosario, V., Arevalo,
J., Boelaert, M., Carrasco, H.J., Correa-Oliveira,
R., García, L., Gotuzzo, E., Gyorkos, T.W., Kalergis,
A.M., Kouri, G., Larraga, V., et al., et. al. Research
priorities for neglected infectious diseases in
Latin America and the Caribbean Region. PLoS
Negl Trop Dis, 2010, 4(10):e780.
Alcolea P.J., Alonso, A., Sánchez-Gorostiaga, A.,
Moreno-Paz, M., Gómez, M.J., Ramos, I., Parro,
V., Larraga, V. Genome-wide analysis reveals
increased levels of transcripts related with
infectivity in peanut lectin non-agglutinated
promastigotes of Leishmania infantum.
Genomics, 2009, 93 (6):551-64.
Ramos, I., Alonso, A., Peris, A., Marcen, J.M.,
Abengozar, M.A., Alcolea, P.J., Castillo, J.A., Larraga, V.
Antibiotic resistance free plasmid DNA expressing
LACK protein leads towards a protective Th1
response against Leishmania infantum infection.
Vaccine, 2009, 27(48):6695-703.
Patente
Patent
”Vaccine to protect animals against Leishmania”
Patente  Europea nº EP1371375B1.
T
infective ability.
he Molecular Parasitology Laboratory is presently working in
Our laboratory is developping a new protective vaccine against
two main reseach lines based on the study of the immune
L.infantum infection in dogs. This vaccine will include genes able
response elicited by the mammalian host against the infection by
to elicit an immune response through the Th1 pahtway. At present
L.infantum to develop protective vaccines against the parasite. These
we are screening different genes at the mouse model before check
studies are based on the knowledge of the molecular biology of Leish-
them in dogs.
mania sp. and the use of functional genomics to study the activation
of the immune system to control the infection. Visceral leishmanasis is
endemic at the Mediterranean basin is caused by L.infantum and the
Imagen de microarray del genoma completo de L.infantum. Insertos: Promastigotes
main host is the dog.WHO considers leishmaniasis as an emmergent metacíclicos (infectivos) y procíclicos (no infectivos).
disease with an incidence of two millions people (five hundred Picture of a microarray corresponding to the whole L.infantum genomic DNA. Insets:
thousand of the visceral type) and with a mortality of 60,000 per year. In Procyclic (no infective) and metacyclic (infective) L.infantum promastigotes.
mice, it has been determined that the protective response is of cellular
type with the T lymphocites involved.In the mice the immune answer
shows a dichotomy which relates protection with a Th1 response and
progress of the infection with a Th2 response. This is not the case of the
dog in which there is a delicate balance between the two T cell popula-
tions that goes towards Th1 or Th2 pathways by still unknown reasons.
The laboratory has been working in the development of a DNA
vaccine which elicits protection gainst the experimental infection by
Leishmnaia infantum in dogs. Initially we developped a vaccine based
on the gene which encodes for the receptor for activated protein
kinase C. The gene was inoculated through two different recom-
binant vehicles: 1) a plasmid of the type pCI-neo (pCI-neo-LACK)
and 2) a vaccinia virus (VV-LACK) following a heterologous regime of
inoculation. The inoculation through the mucosa also elicited good
protective results. (Oliveira et al., 2007).
Along the biological cycle of the parasite there are two main different
forms. The extracellular form or promastigote at the gut of the insect
vector and the intracellular form inside the phagocyte cells of the host
called amastigote. At the extracellular form there are two phases: one
unable to carry out the infection (procyclic phase) and one able to infect
when reaches the vector proboscidae (metacyclic promastigote). The
amastigote form is highly infective. These processes can be mimmicked

108 109
 Sara Isabel Pérez Prieto
Investigadora Titular de OPI | saraip@cib.csic.es
Doctora en CC Biológicas, 1978.
Universidad Complutense de Madrid.
Contratada CSIC, 1978-1980,
Titulada Superior Especializada, 1981-2002.
Iº Jaime Ferrán de Microbiología y CIB.
Jefa de Grupo, 1995,
Investigadora Titular de OPI, 2002.
Microbiología Molecular y Biología de las Infecciones | Molecular Microbiology & Infection Biology
Sylvia Rodriguez Saint-Jean
Investigadora Titular de OPI | sylvia@cib.csic.es
Doctora en Veterinaria, 1994. Otros miembros | Other lab members:
Universidad Complutense de Madrid.
Mercedes Sánchez Carmona
Tec. Médica. Licenciada en Análisis Clínico, 1973.
Luis Guaita
Universidad de Chile.
Ana Isabel de las Heras
Contratada CSIC, 1982-1991,
Titulada Superior Especializada, 1991,

Iº Jaime Ferrán de Microbiología y CIB.

CIB, CSIC.
Investigadora Titular de OPI, 2002.
CIB, CSIC.

www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=51

Virología en Acuicultura
La consecución de vacunas eficaces y económicas la respuesta inmune, e implementar ensayos
frente a virus aun no se ha logrado en la industria experimentales para determinar la eficacia y seguridad
de la acuicultura. Las vacunas DNA son las más de la vacunación. Se precisa además la investigación
prometedoras, pero es preciso conocer la respuesta de nuevas rutas y formas de administración, factibles
inmune de los peces vacunados, identificar para grandes cantidades de peces.
los antígenos involucrados en la inducción de

l
virus de la necrosis pancreática infecciosa capaces de inducir persistencia y en Nuestros estudios más recientes se han
(IPNV) es un Birnavirus de salmónidos animales supervivientes a la infección centrado en vacunas y búsqueda de

Viruses in reared fish

de alta mortalidad en alevines de se produce un estado de portador antivíricos, en los modelos trucha arco has a role in the maintenance of viral persistence. These results define
trucha y en juveniles de salmón cuando asintomático (“carrier”). Esta característica iris y trucha común. Hemos ensayado the starter points for studies about the protection potential of DNA
son transferidos desde instalaciones implica una mayor dificultad para la vacunas DNA frente al virus IPNV y evaluado vaccines against co-infections. We are going to evaluate plasmids
continentales al mar. Es el virus de mayor erradicación del virus y se desconocen casi antivíricos no tóxicos de origen alimentario. expressing genes that codify for antigenic proteins from each of the
prevalencia en nuestro país. Tanto IPNV todos los aspectos de su instauración en el Se construyeron plásmidos de expresión con Obtaining economic and effective vaccines has proven viruses, as well as their synergy if they are delivered together, their
como otros virus de salmónidos son hospedador y las posibilidades de curación. el inserto del gen VP2 o de la poliproteína
difficult in aquaculture industry. DNA vaccines are ability to eliminate/reduce the viral persistence state, and thus, the
de IPNV y se utilizaron como vacunas. Se presence of carriers in fish populations. Moreover, genes up-expressed
estudió y cuantificó la expresión de genes
the most promising but it is necessary to assess the
in vaccinated rainbow-trout will be determined by microarray
de inmunidad como IFN y Mx. Hemos significance of the innate immunity, to identify the technology, now available for this species. The idea is to find protector
demostrado la producción de anticuerpos antigens involved in the induction of specific immune- genes that could be inserted in plasmid constructions and work as
neutralizantes y niveles de protección response, and to implement the experimental assays coadyuvants. These studies are being developed in collaboration with
Localización de la proteína VP2 de IPNV en células BF-2 transfectadas
altos en infecciones programadas a los to determine the security and efficacy of vaccination. researchers from Instituto Nacional de Investigaciones Agrararias (INIA)
con el plásmido de expresión pcDNA-VP2. Las células transfectadas y 15 y 30 días postvacunación. Uno de los and Universidad Autonoma de Mexico.
teñidas por inmunofluorescencia indirecta se analizaron por citometría
It is also necessary to explore alternative and mass-
problemas técnicos con vacunas en peces
de flujo. Este plasmido se utilizó como vacuna DNA. Para detalles ver
es la ruta de administración. Nuestro grupo delivery methods for high fish numbers.
De las Heras et al. (2009), 27: 120-129.
ha publicado la primera descripción de
Localization of transiently expressed VP2 protein after transfection of BF-2

cells with the PcDNA-VP2 plasmid. IFA-stained cells: (1) Control cells, (2)
Transfected cells. The IFA-stained cells were assayed by flow cytometry. The
plasmid has been used as DNA vaccine. See De las Heras et al. (2009), 27:
120-129 for details.
Vacuna DNA oral (pcDNA-VP2) frente
a IPNV, en trucha. Expresión de
genes IFN y Mx en riñón de peces
vacunados (qRT-PCR).Mortalidades
acumulativas en vacunados y control
tras el desafío con IPNV. Para detalles
ver: De las Heras et al (2010) Fish &
Shellfish Immunol. 28, 562-570.
Oral vaccination of rainbow trout with
a DNA vaccine (pcDNA-VP2) against
the IPNV. The expression of IFN and
Mx genes in kidneys of vaccinated fish
was recorded. Cumulative mortalities
in vaccinated and control fish
challenged with IPNV. See De las Heras
et al (2010) Fish & Shellfish Immunol.
28, 562-570, for details.
una vacuna DNA oral para el IPNV, una
herramienta prometedora para su futuro
uso en acuicultura. Además comprobamos
que el IFN interviene en el mantenimiento
de la persistencia vírica. Estos resultados
suponen el punto de partida para estudiar
el potencial protector frente a coinfecciones.
Evaluaremos plásmidos de expresión que
codifican las proteínas antigénicas de
cada virus, su sinergia si son administrados
conjuntamente y su capacidad para
eliminar/reducir los estados de persistencia
viral y por tanto, la aparición de “carriers”.
Por otra parte, la sobre-expresión génica
inducida en trucha arco iris vacunadas
se determinará mediante “micro arrays”
ahora disponibles para esta especie. La
idea es encontrar genes protectores que
pudiesen ser insertados en plasmidos de
expresión y funcionar como coadyuvantes,
y se realizará en colaboración con
investigadores del INIA y de la universidad
autónoma de Mexico.
T
he infectious pancreatic necrosis virus (IPNV) is a Birnavirus
affecting reared salmonid fish and causing high mortalities
in fingerling populations of trout and young salmons when
they are transferred from fresh to sea water. It is a world-wide spread
virus and the most prevalent in our country. IPNV, as well as other
salmonid viruses is able to induce persistence, thus the survivors of
infection become asymptomatic carriers. This characteristic implies
an increased difficulty in the eradication of the virus. Almost all the
aspects of the instauration of persistence in fish hosts are unknown,
as well as the possibility of viral clearance in carriers.
Our recent works have focused on vaccines and screening for antivirals
using the rainbow trout and brown trout models. We have assayed
DNA vaccines against IPNV and have evaluated non-toxic antivirals
from an alimentary origin. Expression plasmids with the VP2 gene
insert or the IPNV-polyprotein insert were constructed and used
as vaccines. The expression of immunogenes as IFN and Mx was
determined and quantified. We have demonstrated the production of
neutralizing antibodies and high levels of protection in challenges of
14 and 30 days post-vaccination. One of the technical problems with
fish vaccination is the route of administration. Our team has published
the first description of an oral DNA vaccine for IPNV, a promising tool
for future use in piscine aquaculture. Moreover, we proved that IFN
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
De las Heras, A., Pérez Prieto, S.I., Rodríguez Saint-Jean, S. (2009). In vitro and in
vivo immune responses induced by a DNA vaccine encoding the VP2 gene of the
infectious pancreatic necrosis virus. Fish and Shellfish Immunology 27: 120-129.
Cuesta, A., Chaves-Pozo, E., de las Heras A.I., Rodríguez Saint-Jean S., Pérez-Prieto
S.I.., Tafalla, C. (2010). An effective fish DNA vaccine against infectious pancreatic
necrosis virus (IPNV) with a different mode of action than rhabdovirus DNA
vaccines Vaccine 28: 3291-3300.
De las Heras, A, Rodriguez Saint-Jean, S and Pérez-Prieto, S.I. (2010).
Immunogenic and protective effects of an oral DNA vaccine against infectious
pancreatic necrosis virus in fish. Fish and Shellfish Immunology 28:562.
Rodríguez Saint-Jean, S, de las Heras, AI., Perez-Prieto S.I. (2010). The persistence
of infectious pancreatic necrosis virus and its influence on the early immune
response. Veterinary Immunology & Immunopathology, 31; 535-546.
Patente
Patent
Recio Sánchez, Isidra; Rodríguez Saint-Jean, Sylvia;  Pérez-Prieto, Sara Isabel; 
López-Expósito, Iván; de las Heras Sanchez, Ana Isabel;  Gómez Ruiz, Jose Angel; 
Ramos González, Mercedes.
Fecha de prioridad: 2010
“Uso de hidrolizados de caseínas como antivirales”,
Número de solicitud Nacional: P201030675.

110 111
 Ernesto García López
Profesor de Investigación | e.garcia@cib.csic.es
PhD, 1974.
Universidad Complutense de Madrid.
Posdoctoral.
Centre d’Étude de l’Energie Nucleaire, Mol (Bélgica).
Científico Titular, 1979,
Investigador Científico, 1986,
Profesor de Investigación, 1990.
Microbiología Molecular y Biología de las Infecciones | Molecular Microbiology & Infection Biology
CIB, CSIC.
Genética Bacteriana
Streptococcus pneumoniae (neumococo) ocupa un
lugar primordial entre los micro­organismos
patógenos y es responsable destacado de
enfermedades tales como la meningitis,
neumonía, bacteremia y otitis media.
Además, en la actualidad, numerosos
aislados clínicos presentan una gran
resistencia a muchos antibióticos. El
trabajo de nuestro laboratorio se
centra en el estudio de diversos
factores de virulencia y en la
búsqueda de nuevas dianas
terapéuticas para combatir la
enfermedad neumocócica.
112
Pedro García González
Investigador Científico | pgarcia@cib.csic.es
PhD, 1982.
Universidad Complutense de Madrid.
Posdoctoral.
Centre National de la Recherche Scientifique.
Université Paul Sabatier, Toulouse (Francia).
Científico Titular, 1986,
Investigador Científico, 2002.
CIB, CSIC.
L
a colonización del tracto respiratorio
superior por neumococo y el
desarrollo posterior de la enfermedad,
como neumonía, sepsis y meningitis
tienen lugar mediante el establecimiento
de complejas interrelaciones entre la
bacteria patógena y el huésped humano.
Entre ellas destacan las interacciones
entre proteínas de la superficie bacteriana
y receptores específicos localizados en
la célula eucariótica, así como entre
aquellas y diversos componentes de la
respuesta inmune. En nuestro laboratorio
se estudian los genes responsables de la
formación de biofilmes y la composición
de la matriz de los mismos, imprescindible
para la integridad estructural del biofilm
y el establecimiento de la colonizacion
nasofaríngea. Asimismo, se analizan las
interacciones de las mureín-hidrolasas de
la pared celular de S. pneumoniae con los
componentes del sistema del complemento
y el papel de tales hidrolasas en la virulencia
de la bacteria. Para ello se utilizan mutantes
en diversas hidrolasas de pared y se
estudian en diversos sistemas modelo
(biofilmes, cultivos celulares y ensayos de
opsonización y fagocitosis) así como en
modelos animales. Las mureín-hidrolasas,
tanto de S. pneumoniae como de los fagos
que le infectan, son proteínas de unión a
colina, componente de la pared bacteriana,
que se estudian desde el punto de vista
de su estructura y su función fisiológica.
También se está ensayando el potencial
terapéutico de diversas enzimas líticas de
pared, dependientes o no de colina, en
biofilmes así como en modelos animales de
infección.
Modelo tridimensional de la lisozima de neumococo LytC unida al ácido teicoico del
peptidoglicano. Las residuos de colina se representan como esferas.
Three-dimensional model of pneumococcal lysozyme LytC bound to peptidoglycan
teichoic acid. The docked choline moieties are represented as spheres.
Otros miembros | Other lab members:
Eloísa Cano Congosto María Morales Areizaga
Miriam Moscoso Naya Mirian Domenech Lucas
Susana Campuzano Ruiz Elisa Ramos Sevillano
José Yuste Lobo María del Mar Esteban Torres
Violeta Rodríguez Cerrato Beatriz Piñeiro Garrido
Ana González Moreno Roberto Díez Martínez
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=7
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Bustamante, N., Campillo, N.E., García, E., Gallego, C., Pera, B., Diakun, G.P.,
Saiz, J.L., García, P., Díaz, F., and Menéndez, M. (2010). Cpl-7, a lysozyme
encoded by a pneumococcal bacteriophage with a novel cell wall-
binding motif. J. Biol. Chem. 285, 33184-33196.
Cafini, F., Yuste, J., Giménez, M-J., Sevillano, D., Aguilar, L., Alou, L., Ramos-
Sevillano, E., Torrico, M., González, E., García, E., Coronel, P., and Prieto, J.
(2010). Enhanced in vivo activity of cefditoren in pre-immunized mice
against penicillin-resistant S. pneumoniae (serotypes 6B, 19F and 23F) in a
sepsis model. PLoS One 5, e12041.
Moscoso, M., Domenech, M., and García, E. (2010) Vancomycin tolerance
in clinical and laboratory Streptococcus pneumoniae isolates depends
on reduced enzyme activity of the major LytA autolysin or cooperation
between CiaH histidine kinase and capsular polysaccharide. Mol.
Microbiol. 77, 1052-1064.
Bacterial Genetics
Morales, M., García, P., de la Campa, A.G., Liñares, J., Ardanuy, C., and
García, E. (2010). Evidence of localized prophage-host recombination in
the lytA gene encoding the major pneumococcal autolysin. J. Bacteriol. Streptococcus pneumoniae (the pneumococcus) is
192, 2624-2632. a leading human pathogen and frequent cause of
Pérez-Dorado, I., González, A., Morales, M., Sanles, R., Striker, W., Vollmer, meningitis, pneumonia, bacteremia, and otitis media
W., Mobashery, S., García, J.L., Martínez-Ripoll, M., García, P., and Hermoso,
J.A. (2010). Insights into pneumococcal fratricide from the crystal worldwide. Currently, many pneumococcal clinical
structures of the modular killing factor LytC. Nat. Struct. Mol. Biol. 17, isolates are resistant to most avaliable antibiotics.
576-581.
Our laboratory focuses on the study of virulence
Rodríguez-Cerrato, V., del Prado, G., Huelves, L., Naves, P., Ruiz, V., García,
E., Ponte, C., and Soriano, F. (2010). Comparative efficacy of novobiocin factors of S. pneumoniae and on the search of novel
and amoxicillin in experimental sepsis caused by beta-lactam- bacterial targets with therapeutic potential to fight the
susceptible and highly resistant pneumococci. Int. J. Antimicrob.
Agents 35, 544-549. pneumococcal disease.
Domenech, M., García, E., and Moscoso, M. (2009). Versatility of the
capsular genes during biofilm formation by Streptococcus pneumoniae.
T
Environ. Microbiol. 11, 2542-2555. he colonization of the upper respiratory tract by pneumococcus
Hernández-Rocamora, V.M., Maestro, B., de Waal, B., Morales, M., García, and the eventual development of diseases such as pneumonia,
P., Meijer, E.W., Merkx, M., and Sanz, J.M. (2009). Multivalent choline sepsis and/or meningitis, take place through the establishment of
dendrimers as potent inhibitors of pneumococcal cell-wall hydrolysis.
a complex interplay between the pathogen and the human host. Most
Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 48, 948-951.
of these interactions involve bacterial surface proteins on one hand,
Molina, R., González, A., Stelter, M., Pérez-Dorado, I., Kahn, R., Morales,
M., Moscoso, M., Campuzano, S., Campillo, N.E., Mobashery, S., García, and cellular receptors and host defense mechanims on the other hand.
J.L., García, P., and Hermoso, J.A. (2009). Crystal structure of CbpF, a In our laboratory we study the genes responsible of biofilm formation
bifunctional choline-binding protein and autolysis regulator from and the biochemical composition of the intercellular matrix that is
Streptococcus pneumoniae. EMBO Rep. 10, 246-251. much needed for the structural integrity of biofilm and the onset of
nasopharyngeal colonization. Moreover, we also examine the interac-
tions between the pneumococcal cell wall hydrolases and various
components of the complement system, as well as the role of these
Patente hydrolases on pathogenesis. For these approaches we use S. pneumo-
Patent niae mutants deficient in one or more cell wall hydrolases tested in
several model systems (e.g., biofilms, cell cultures, and opsonophago-
García, E., García, P., García, J.L., Campuzano, S., Morales, M., Ardanuy, C.,
Pingarrón, J.M. and Pedrero, M. (2009).
cytic assays), as well as in animal models of infection. Murein hydrolases,
Fecha de prioridad: 16 diciembre 2009. encoded by S. pneumoniae and its phages, are choline binding proteins
“Detección de Streptococcus pneumoniae mediante genosensores (choline is a key aminoalcohol of the bacterial cell wall), which are
magneto-amperométricos empleando cebadores y sondas específicas being studied both from the structural and physiological viewpoints.
del gen lytA / Detection of Streptococcus pneumoniae with magneto-
Moreover, the therapeutic potential of some cell wall hydrolases, either
amperometric genosensors using lytA-specific primers and probes”.
Número de solicitud Nacional: P200931177. from the bacterium or from its phages, is being tested using biofilms as
Extensión Internacional PCT: PCT/ES2010/070836 (16 diciembre 2010). well as animal models of pneumococcal infection.
113
 José Luis Rodríguez-Fernández
Investigador Científico | rodrifer@cib.csic.es
MSc (Life Sciences), 1989,
PhD (Life Sciences), 1993.
The Weizmann Institute of Science. Rehovot, Israel.
Postdoctoral, 1994-1997.
Imperial Cancer Research Fund, Londres, GB.
Contrato de Reincorporación, 1997-2001.
Microbiología Molecular y Biología de las Infecciones | Molecular Microbiology & Infection Biology
Universidad Complutense de Madrid.
Contratado FIS, 2001-2003.
Hospital Gregorio Marañón, Madrid.
Ramón y Cajal program, 2003-2006,
Científico Titular, 2006,
Investigador Científico, 2010.
CIB, CSIC.
Funciones y Mecanismos Moleculares Reguladores de las
Funciones de los Receptores de Quimiotácticos
Las CDs expresan los receptores quimiotácticos CCR7
(ligandos CCL19 y CCL21) y CXCR4 (ligando CXCL12).
En los ganglios las CDs forman sinapsis inmunológicas
con los linfocitos T. En nuestro grupo estudiamos
L
as células dendríticas (CDs) son potentes células presentadoras
de antígenos que desempeñan un papel clave en la iniciación
de la respuesta inmune. Las CDs son importantes tanto en la
protección del organismo frente a diferentes patógenos como para
el mantenimiento de la tolerancia frente a los antígenos propios
y la prevención de la autoinmunidad. Durante su ciclo vital estas
células están expuestas a los ligandos CCL19 y CCL21 (receptor para
ambos CCR7) y CXCL12 (receptores CXCR4 y CXCR7), que se expresan
en los vasos linfáticos, los conductos a través de los cuales las CDs
llegan hasta los ganglios linfáticos, y en los propios ganglios. Las CDs
migran a los ganglios, las regiones donde activarán a los linfocitos
T, dirigidas por los receptores quimiotácticos CCR7 y CXCR4. Para
activar a los linfocitos T, las CDs deben formar en la zona de contacto
entre estas dos células, tanto en la célula T como en la CD, unas
complejas estructuras denominadas sinapsis inmunológicas (SI). A
pesar de su importancia para la respuesta inmune, se conoce poco
sobre los mecanismos moleculares mediante los cuales los receptores
de quimioquinas CCR7 y CXCR4 y la SI regulan las funciones de las
CDs. El conocimiento de estos mecanismos es importante para un
mejor conocimiento del papel de la CD en la respuesta inmune y
para permitir el desarrollo de estrategias que permitan modular su
respuesta en los múltiples procesos (en condiciones normales y
patológicas) en los que participan.
Funciones y moléculas de señalización que regulan las funciones del receptor de
quimoquinas CCR7 en células dendríticas.
114
Otros miembros | Other lab members:
Cristina Delgado Martín María Laura Deguiz Lasso
Laura Gómez Cabañas Luis Ivan González Bethencourt
Jaime Fernández Barrera Mairena González González
Verónica Gomes Suárez Sheyla Vanesa Gara Huayllas
María Gemma Pérez Rivero
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=60
los mecanismos moleculares mediante los cuales los
receptores quimioquinas CCR7 y CXCR4 y la sinapsis
inmunológica modulan las funciones de las CDs.
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Riol-Blanco L, Delgado-Martín C, Sánchez-Sánchez N, Alonso-C
LM, Gutiérrez-López MD, Del Hoyo GM, Navarro J, Sánchez-Madrid
F, Cabañas C, Sánchez-Mateos P, Rodríguez-Fernández JL. (2009)
Immunological synapse formation inhibits, via NF-κB and FOXO1, the
apoptosis of dendritic cells. Nat. Immunol. 10: 753-760.
Rodríguez-Fernández JL, Riol-Blanco L, Delgado-Martín C, Escribano C
(2009) The dendritic cell side of the immunological synapse: Exploring
terra incognita. Discovery Medicine 8: 108-112.
Escribano, C, Delgado-Martín C., Rodríguez-Fernández JL (2009) CCR7-
dependent stimulation of survival in dendritic cells involves inhibition
of GSK3β. J. Immunol. 183: 6282-6295.
Rodríguez-Fernández JL, Riol-Blanco, L., Delgado-Martín C (2010) What
is the function of the dendritic cell side of the immunological synapse?
Sci. Signal. 3: re2.
Rodríguez-Fernández JL, Riol-Blanco, L., Delgado-Martín C (2010) What
is an immunological synapse? Microbes Infect. 12, 438-445.
Functions and signalling regulating the functions of chemokine receptor CCR7 in
dendritic cells.
Functions and Molecular Mechanisms Regulating the
Functions of Chemokine Receptors
DCs express chemokine receptors CCR7 (ligands
CCL19 and CCL21) and CXCR4 (ligand CXCL12).
In the lymph nodes DCs form immunological
synapses with T cells. In our group we study
the molecular mechanism whereby chemokine
receptors CCR7 and CXCR4 and the immunological
synapse control the functions of DCs.
D
endritic cells (DCs) are potent antigen presenting cells
that play a key in initiation of the immune response.
DCs are important both for the protection of the
organism in the face of different pathogens and to keep the
tolerance to self antigens and the prevention of autoimmune
responses. During their life cycle in the immune system these
cells are exposed to chemokines CCL19 and CCL21 (receptor
for both of them CCR7) and CXCL12 (receptors CXCR4 y
CXCR7), that are expressed in lymphatic vessels, the conduits
through which DCs migrate to the lymph nodes (LNs), and
in the LNs proper. DCs migrate to the LNs, the regions where
they will activate T cells, guided by chemokine receptors CCR7
and CXCR4. To activate T cells, DCs should form at the zone
of contact between these two cells, in both T cells and DCs,
complex structures called immunological synapses (IS). Despite
their importance for a proper immune response, there is sparse
information on the mechanisms whereby chemokine receptors
CCR7 and CXCR4 and the IS control DCs functions. The Una célula dendrítica establece contactos con varias células T. Las células se
knowledge of the mechanisms involved is important to better tiñeron con un anticuerpo anti-fosfotirosina. Se observa una tinción intensa en la
understand the role of DCs during the immune response and zona de contacto entre la célula dendrítica y la célula T, lo que sugiere señalización
en esta región.
for the development of strategies to modulate their response in
Dendritic cells (DCs) making contact with several T cells. Cells are stained with
the multiple processes (under normal and pathological condi-
an anti-phospho-tyrosine antibody. Intense staining is observed at the DC-T cell
tions) in which they are involved. contact zone suggesting signalling at this region.
115
 Ángel Luis Corbí López
Profesor de Investigación | acorbi@cib.csic.es
PhD, 1985.
Universidad Complutense de Madrid.
Postdoctoral, 1985-1987. Dana Farber Cancer
Institute, Harvard Medical School, Boston, USA.
Postdoctoral, 1987-1989. Center for Blood
research, Harvard Medical School, Boston, USA.
Microbiología Molecular y Biología de las Infecciones | Molecular Microbiology & Infection Biology
Miguel Ángel Vega Palacios
Investigador Científico | mavega@cib.csic.es
PhD, 1987. Otros miembros | Other lab members:
Universidad Complutense de Madrid.
Noemí Aguilera Montilla Sonia Chamorro Pérez
Postdoctoral, 1988-1990.
Dana Farber Cancer Institute Harvard Medical María Escribese Alonso Carmen Sánchez Torres
School, Boston, USA. Angeles Domínguez Soto Laura Aragoneses Fenoll
Postdoctoral, 1991. Elena Sierra Filardi Angela Rey Gallardo
Centro de Biología Molecular UAM-CSIC , Madrid,

Postdoctoral, 1989-1990. Servicio de Inmunologia, Mateo de las Casas Engel Concepción Nieto Mazarrón
España.
Hospital de la Princesa Madrid, España.
Adjunto, 1992-1994.
Adjunto, 1991-1994. Unidad de Biología
Unidad de Biología Molecular, Hospital de la
Molecular, Hospital de la Princesa Madrid, España.
Princesa Madrid, España.
Científico Titular, 1994. IPBLN.
Científico Titular, 1994. IPBLN.
Investigador Científico, 2001,
Investigador Científico, 2008. CIB, CSIC.
Profesor de Investigación, 2003. CIB, CSIC. www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=51

Biología de Células Mieloides Myeloid Cell Biology O

ur current research lines aim at determining the molecular
basis that underlie 1) the ability of macrophages and dendritic
cells to sense and capture pathogenic microorganisms; 2)
the ability of macrophages and dendritic cells to contribute to the
Los macrófagos y las células dendríticas son específicas. Los macrófagos, además, son células Dendritic cells and macrophages are antigen- resolution of inflammatory processes and to the maintenance of tissue
células presentadoras de antígeno “profesionales” efectoras finales de la inmunidad adaptativa, presenting cells which initiate and resolve homeostasis in the steady state; and 3) the migratory activity of both
cell types in response to pathogenic and inflammatory stimuli. To
cuya actividad es fundamental para la iniciación contribuyendo tanto a la eliminación de agentes inflammatory processes, and critically contribute
address these issues, our group 1) analyzes the regulated expression,
y resolución de procesos inflamatorios y para la infecciosos como al mantenimiento de la integridad y to the generation of antigen-speficic immune ligand specificity and signaling capability of the DC-SIGN family of
generación de respuestas inmunitarias antígeno- la homeostasis tisular. responses. Macrophages are also the ultimate C-type lectin pathogen receptors, which mediate the sensing and
effector cells of the adaptive immunity, and capture of clinically relevant viral (HIV), bacterial (Mycobacterium), fungal

L
as líneas de investigación actuales
del grupo pretenden contribuir
a la determinación de la base
molecular de 1) el reconocimiento y la
captura de microorganismos patógenos
por células dendríticas y macrófagos; 2)
la participación de células dendríticas y
macrófagos en la resolución de procesos
inflamatorios y el mantenimiento de la
homeostasis celular; y 3) los procesos
de migración de ambos tipos celulares
en respuesta a estímulos inflamatorios y
patogénicos. Para ello, nuestro grupo 1)
analiza la expresión tejido-específica, la
especificidad de ligandos y la capacidad
señalizadora de la familia de receptores
de patógenos relacionados con DC-SIGN,
que media la detección y captura de
numerosos patógenos de relevancia clínica
(HIV, Mycobacterium, Candida, Aspergillus,
Leishmania); 2) disecciona los mecanismos
transcripcionales que gobiernan los
procesos de maduración de células
dendríticas y la activación de macrófagos,
con objeto de diseñar herramientas
diagnósticas que permitan definir el
poder pro- y anti-inflamatorio de las
células mieloides tisulares en condiciones
homeostáticas y patológicas; y 3) investiga
el papel de la adición post-traduccional
de ácido polisiálico sobre las funciones
efectoras esenciales de células dendríticas
maduras (migración hacia nódulos
linfáticos secundarios, formación de
sinapsis inmunológica y activación y
polarización de linfocitos T ).
contribute to elimination of infectious and harmful
material and the re-establishment of the tissular
integrity and homeostasis.
(Candida, Aspergillus) and parasite (Leishmania) pathogens; 2) dissects
the transcriptional mechanisms that govern the dendritic cell matura-
tion and macrophage activation processes, with the aim of designing
diagnostic genomic tools that will allow the definition of the inflamma-
tory state of tissue myeloid cells under homeostatic and pathological
conditions; and 3) investigates the role of post-translational addition
of polysialic acid on critical effector functions of mature dendritic cells
(migration to lymphoid organs, formation of immunological synapses
with T lymphocytes, T cell activation and polarization).

Publicaciones Seleccionadas Rey-Gallardo A, Escribano C, Delgado-Martín C, Rodriguez-Fernández JL, Gerardy-

Selected Publications
Martín-Gayo, E., Sierra-Filardi, E., Corbí, A.L., Toribio, M.L. Plasmacytoid dendritic cells resident
in human thymus drive natural Treg cell development. Blood, 115:5366-5375, 2010.
Sierra-Filardi, E., Vega, M.A., Sánchez-Mateos, P., Corbí, A.L. *, Puig- Kröger, A. *. Heme
Oxygenase-1 expression in M-CSF-polarized M2 macrophages contributes to LPS-
induced IL-10 release. Immunobiology, 215:788-795, 2010.
Puig-Kröger, A., Aguilera-Montilla, N., Martínez-Nuñez, R., Domínguez-Soto, A., Sánchez-
Cabo, F., Martín-Gayo, E., Zaballos, A., Toribio, M.L., Groner, Y., Ito, Y., Dopazo, A., Vega,
M.A., Corbí, A.L. The novel RUNX3/p33 isoform is induced upon monocyte-derived
dendritic cell maturation and downregulates IL-8 expression. Immunobiology,
215:812-820, 2010.
Schahn R, Rutishauser U, Corbi A.L., Vega MA. Polysialylated neuropilin-2 enhances
human dendritic cell migration through the basic C-terminal region of CCL21.
Glycobiology, 20:1139-1146, 2010.
Domínguez-Soto, A., Aragoneses-Fenoll, L., Corcuera, M., Miquilena-Colina, M.E., García-
Monzón, C., Gömez-Aguado, F., Bustos, M., Corbí A.L. LSECtin is expressed in Kupffer
cells and its expression is regulated by PU.1. Hepatology, 49:287-296, 2009.
Sierra-Filardi E, Serrano-Gómez D, Estecha A, Abengózar MA, Samaniego R, Sánchez-
Mateos P, Colmenares M, Steinman RM, Granelli-Piperno A, Corbí A.L. Epitope mapping
on the DC-SIGN pathogen-attachment factor. Mol Immunol, 47:840-848, 2009.
Sierra-Filardi, E., Puig-Kröger, A., Vega, M.A., Sánchez-Mateos, P., Corbí, A.L. Identification
of markers and molecular strategies for the opposite functions of pro-inflammatory and
anti-inflammatory macrophages. Cancer Res, 69:9395-9403, 2009.

116 117
 Proliferación Celular y Desarrollo
Cell Proliferation & Development
Proliferación Celular y Desarrollo | Cell Proliferation & Development

J. Bernardo Schvartzman 120

Dora B. Krimer · Pablo Hernández Valenzuela
Biología Molecular de los Cromosomas | Molecular Biology of the Chromosomes

Miguel Ángel Vidal 122

El sistema Polycomb de Regulación Epigenética | Epigenetic Control by the Polycomb Group of Genes

Clara Goday 124

Eliminación de Cromosomas en Insectos | Chromosome Elimination in Insects

Susana Moreno 126

Matriz Nuclear y Regulación de la Organización y Funcionalidad Nuclear
Nuclear Matrix and Regulation of the Nuclear Organization and Function

Pedro Esponda · j. Francisco Giménez 128

Reproducción Celular y Animal | Cell and Animal Reproduction

José Luis Barbero 130

Dinámica Cromosómica en Meiosis | Chromosomal Dynamics in Meiosis

Lucas Sánchez 132

Evolución de los Mecanismos de Determinación Sexual en Insectos
Evolution of Sex Determining Mechanisms in Insects

Jesús del Mazo 134

Biología Molecular de la Gametogénesis | Molecular Biology of Gametogenesis

Patricia Boya (Grupo Emergente | New Group) 136

Autofagia en Desarrollo y en Fisiopatología | Autophagy in Development and Disease
118
 Cell Proliferation
and Development

Overview
The cell is the basic unit of life and furthering our knowledge of Biology requires
a fundamental understanding of cellular structure and function.

T
he Department of Cell Proliferation and Development comprises a group of independent and highly
interactive laboratories aiming at an understanding of important processes in cell replication and di-
versification. Cell proliferation is an attribute of all life forms closely linked to processes of growth and
division, and in multicellular organisms is also linked to the appearance of specialized cell types. A variety of

Proliferación regulatory mechanisms have been evolutively selected to ensure regulated cell proliferation and generation
of cell diversity during embryonic and adult phases of life cycles. Alterations in these regulatory networks are
a hallmark of major human disorders. Research topics tackled by the different labs focus on chromosome
stability and dynamic and genetic as well as epigenetic regulation of cell identity, using a variety of model

Celular y Desarrollo organisms, e.g. mammals, flies, plants, yeast, bacteria, etc. A unifying feature that brings strength and coher-
ence to this Department is our conviction that the answer to these fundamental curiosity-driven questions
of basic cell and molecular biology lies at the heart of the potential applications that may arise from the
knowledge obtained. However, while our pursuit is stimulated and guided by the goal of understanding
basic processes, we do not stray from furthering our discoveries as potential mechanisms that may lead to
La célula es la unidad básica de la vida y una comprensión more technical applications.
Presentación

cabal de la Biología requiere conocer a fondo la estructura

y función de las células. J. Bernardo Schvartzman

E
Department HEAD
l Departamento de Proliferación Celular y Desarrollo lo conforman un gru-
po de laboratorios independientes que colaboran estrechamente con el
objetivo de avanzar en el conocimiento de procesos básicos como la re-
plicación y diversificación celular. La proliferación celular es atributo de todas
las formas de vida, está íntimamente asociada con los procesos de crecimiento
y división y, en los organismos multicelulares, también está ligada al desarrollo
de tipos celulares especializados. Un gran número de mecanismos reguladores
fueron evolutivamente seleccionados para asegurar la proliferación celular y la
diversificación de distintos tipos celulares durante la embriogénesis y distintas
fases de la vida adulta. La alteración de algunas de estas redes de regulación ca-
racterizan importantes enfermedades humanas. Los problemas abordados por
los laboratorios de este Departamento están enfocados al estudio de la dinámi-
ca y estabilidad de los cromosomas y a la regulación genética y epigenética de
la identidad celular. Para ello se utilizan una gran variedad de sistemas modelo:
mamíferos, insectos, plantas, levaduras, bacterias, etc. Un elemento que unifi-
ca y da fuerza y coherencia a este Departamento es la convicción de que en
las respuestas a estas preguntas fundamentales, cuyo objetivo es avanzar en
el conocimiento en biología celular y molecular, están las bases de las posibles
aplicaciones que se pueden derivar de este conocimiento. Aunque el objeti-
vo primario es la comprensión de procesos biológicos básicos, ello no implica
renunciar al estudio de mecanismos que pueden tener aplicaciones prácticas.

J. Bernardo Schvartzman
Jefe de Departamento

120 121
 Jorge Bernardo Schvartzman Blinder
Profesor de Investigación | schvartzman@cib.csic.es
PhD, 1979.
Universidad Politécnica de Madrid.
Estancias Postdoctorales.
Brookhaven National Laboratory, New York, USA y
Albert Einstein College of Medicine, New York, USA.
Científico Titular, 1985,
Jefe de grupo, 1989,
Investigador Científico, 2002,
Profesor de Investigación, 2007.
CIB, CSIC.
Biología Molecular
Proliferación Celular y Desarrollo | Cell Proliferation & Development
de los Cromosomas
Nos interesa la interrelación y coordinación entre los procesos biológicos
en los que el DNA está involucrado: replicación, transcripción, reparación
y recombinación, cómo están regulados y cómo se modifican o son
afectados por factores genéticos, epigenéticos y ambientales como la
topología del DNA, la organización de la cromatina y el estrés nutricional.
A) Análisis del superenrollamiento y encadenamiento
de minicromosomas de Saccharomyces cerevisiae
por electroforesis bidimensional en geles de
agarosa de alta resolución en presencia del agente
intercalante cloroquina. La introducción controlada
de roturas de cadena sencilla permite distinguir
las formas monoméricas con distinto grado de
superenrollamiento y los encadenados de tipo A, B y C.
B) Molécula de DNA parcialmente replicada con
una rotura de cadena sencilla correspondiente al
plásmido bacteriano pBR18-TerE@AatII, visualizada por
microscopía de fuerza atómica (AFM).
C) Diagrama de la molécula parcialmente replicada
visualizada a la izquierda en el que se muestran la
doble hélice parental en azul y verde y las cadenas
nacientes en rojo.
122
Investigadores del equipo | Staff Scientists:
Pablo Hernández Valenzuela Dora Beatriz Krimer Smunis
Otros miembros | Other lab members:
María Luisa Martínez Robles Zaira García Fernández
Doris Gómez Flores Virginia López Martínez
María Estefanía Monturus de Carandini María Rodríguez López
María Tenorio Gómez
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=2
Supercoiling and catenation of minichromosomes of
Saccharomyces cerevisiae analyzed by high resolution
two-dimensional agarose gel electrophoresis in the
presence of the intercalating agent chloroquine.
Controlled nicking allows to identify supercoiled
monomeric forms as well as types A, B and C
catenanes.
B) Partially replicated and nicked molecule
corresponding to the bacterial plasmid pBR18-
TerE@AatII visualized by means of Atomic Force
Microscopy (AFM).
C) Cartoon of the partially replicated molecule
shown to the left where the parental duplex is
shown in blue and green whereas nascent DNA
appears in red.
1
Topología de la replicación del DNA.
Estudiamos el superenrollamiento y
encadenamiento del DNA durante la
segregación post-replicativa de plásmidos
bacterianos. La electroforesis bidimensional
de alta resolución y la simulación de
MonteCarlo nos permitieron demostrar
que el superenrollamiento (-) que introduce
la DNA girasa juega un papel activo en el
desencadenamiento del DNA por la Topo IV.
Estamos estudiando este mismo fenómeno
en minicromosomas de células sincronizadas
en Saccharomyces cerevisiae. Estos
conocimientos son escenciales para lograr
nuestro objetivo a largo plazo: construir
cromosomas artificiales que puedan ser
utilizados como vectores estables para
transformar células de plantas y animales;
2. Diferenciación en células
eritroleucémicas. La integración del
complejo vírico Friend cercana al promotor
del gen Sfpi provoca la activación del factor
de transcripción PU.1, probable causa del
fenotipo eritroleucémico. Estudiamos la
expresión de PU.1 y cambios en el patrón
de replicación del DNA en líneas parentales
y resistentes a agentes inductores tanto en
células proliferantes como a lo largo de la
diferenciación inducida;
3. Barreras para las horquillas de
replicación e inestabilidad del DNA. La
parada accidental de las horquillas de
replicación es una causa importante de
inestabilidad genómica. También existen
paradas naturales de las horquillas en sitios
específicos, como en los genes del rRNA,
cuya alta conservación indica que juegan un
papel relevante aún no muy bien conocido.
Estudiamos la regulación de estas barreras
naturales y su papel en la recombinación
homóloga, la progresión del ciclo celular y su
relación con la respuesta al estrés nutricional.
Molecular Biology
of the Chromosomes
We are interested in the relationships and coordination between biological processes
where DNA is involved: replication, transcription, repair and recombination, how are they
regulated and how they alter or are affected by genetic, epigenetic and environmental
factors such as DNA topology, chromatin organization and nutritional stress.
1
DNA Topology during Replication. We characterized the A) Moléculas de DNA aisladas de células MEL DS19 sin tratar (MEL 0 hr) o tratadas con
HMBA durante 24 (MEL 24 hr) o 48 horas (MEL 48 hr) extendidas mediante la técnica de
interplay of supercoiling and decatenation during the
peinado molecular. La detección de tramos marcados secuencialmente con IdU (en rojo)
segregation of sister duplexes in bacterial plasmids. We used seguido de CldU (en verde) y sin marcar (en azul) permite demostrar que la distancia
high resoluction two-dimensional agarose gel electrophoresis and entre orígenes se acorta a medida que progresa la diferenciación celular inducida. B) En
ausencia de Reb1, mutantes termosensibles wee1-50 de Schizosaccharomyces pombe
MonteCarlo numerical simulations to show that the (-) supercoiling
no son capaces de alargar la fase G1 y entran prematuramente en la fase S (análisis por
introduced by DNA gyrase plays an active role during the progressive citometría de flujo de la izquierda). Como consecuencia, las células mutantes dobles
decatenation of newly replicated DNA molecules by Topo IV. We are reb1∆ wee1-50 muestran hasta cuatro núcleos (teñidos con DAPI) y múltiples septos
(teñidos con calcofluor), indicando que las células desarrollan la mitosis antes de que se
currently studying the same phenomena in minichromosomes of
haya completado la citocinésis (micrografías de la derecha). Abajo se muestran células
synchyronized cells in Saccharomyces cerevisiae. We firmly believe this silvestres (barra de escala: 5 µm).
knowledge is essential to accomplish our long-term goal: to build- A) Selected DNA molecules isolated from MEL DS19 untreated cells (MEL 0 hr) or treated
up artificial chromosomes that could be used as stable vectors to with HMBA for 24 (MEL 24 hr) or 48 hr (MEL 48 hr) stretched by DNA combing. Detection
of sequential labelled tracks with IdU (red) followed by CldU (green) and unlabeled
transform plant and animal cells;
(blue) allowed us to show that the replication interorigin distance becomes shorter as
2. Terminal Differentiation in Erythroleukemia Cells. Integration differentiation progresses. B) Wee1-50 thermosensitive S. pombe mutants lacking Reb1 are
of the Friend complex virus upstream of the promoter of the Sfpi- unable to lengthen G1 phase and enter prematurely into the S phase (left flow cytometry
analysis). Consequently, reb1∆ wee1-50 double mutant cells show up to four nuclei (strained
1 gene leads to the activation of the transcription factor PU.1. This
with DAPI) and multiple septa (stained with calcofluor), indicating that cells undergo mitosis
could be responsible for the transformed phenotype. We analyze the before cytokinesis is completed (right micrographs). Micrograph at the bottom corresponds
expression of PU.1 and changes in the DNA replication pattern in to wild-type cells (scale bar: 5 µm).
parental and resistant cell lines during proliferation as well as along
the cell differentiation process;
3. Replication Fork Barriers and DNA Instability. Accidental arrest of
replication forks is an important cause of genome instability. Natural
barriers have also been identified at specific sites, like the rRNA-
coding genes. Their high conservation indicates they play a relevant
role, which is still poorly understood. We study the regulation of these
natural barriers and their role in homologous recombination, cell
cycle progression and cell response to nutritional stress.
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Schvartzman, J.M. and J.B. Schvartzman: How do we ask for money? A view of
funding for basic research. EMBO reports 9: 216-220 (2008).
Martínez-Robles, M.L., G. Witz, P. Hernández, J.B. Schvartzman, A. Stasiak and D.B.
Krimer: Interplay of DNA supercoiling and catenation during the segregation of
sister duplexes. Nucleic Acids Res 37: 5126-5137 (2009).
Schvartzman, J.B., M.L. Martínez-Robles, P. Hernández and D.B. Krimer: Plasmid
DNA replication and topology as visualized by two-dimensional agarose gel
electrophoresis. Plasmid 63: 1-11 (2010).
Ferrándiz, M.J., A.J. Martín-Galiano, J.B. Schvartzman and A.G. de la Campa: The
genome of Streptococcus pneumoniae is organized in topology-reacting gene
clusters. Nucleic Acids Res 38: 3570-3581 (2010).
Rodríguez-Sánchez, L., M. Rodríguez-López, Z. García, M. Tenorio-Gómez, J.B.
Schvartzman, D.B. Krimer and P. Hernández: Fission yeast rDNA-binding protein Reb1
regulates G1 phase under nutritional stress. J Cell Science doi:10.1242/jcs.070987.
Baxter J., N. Sen, V. López-Martínez, M.E. Monturus de Carandini, J.B. Schvartzman, J.F.X.
Diffley and L. Aragón: Positive supercoiling of mitotic DNA drives decatenation by
topoisomerase II in eukaryotes. Science doi: 10.1126/science.1201538.
123
 Miguel Ángel Vidal Caballero
Investigador Científico | mvidal@cib.csic.es
PhD, 1985. Otros miembros | Other lab members:
Universidad Complutense.
Postdoctoral.
Mónica Román-Trufero
Medical Research Council, London, UK. Inés Sánchez Navas Parejo
Científico Titular,1991, Friederike Zweynert
Jefe de grupo, 1991,
Investigador Científico, 2008.
CIB, CSIC.

www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=14

El Sistema Polycomb de Regulación Epigenética Epigenetic Control by the observed distinct, mild, phenotypes
Proliferación Celular y Desarrollo | Cell Proliferation & Development

associated to inactivation of individual

Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Hirabayashi, Y., Suzki, N., Tsuboi, M., Endo, T.A.,
Toyoda, T., Shinga, J., Koseki, H., Vidal, M. Gotoh,
El grupo investiga la actividad epigenética del grupo de genes Polycomb Polycomb Group of Genes Ring1 genes. In contrast, their concurrent
inactivation leads to bone marrow failure
and death, primarily resulting from severe
(PcG). Los genes PcG codifican proteínas evolutivamente conservadas
anemia, showing functional redundancy.
que forman complejos con actividad modificadora de cromatina.
Aunque inicialmente considerados sólo como reguladores del desarrollo
The lab is interested in epigenetic control by the Polycomb group The subyacent defects lie in proliferative
(PcG) of genes, some of which were identified here for the first time. impairment of immature cells and decreased
embrionario, recientemente su ámbito funcional se ha ampliado para survival of mature cells.
PcG products constitute an evolutionary conserved set of proteins
incluir el control de la impronta genómica, la autorenovación de células In an alternative model, we investigate
assembled in complexes endowed with chromatin modifying activities.
madre y el desarrollo tumoral. Ring1A/Ring1B functions in fetal and adult
Initially known as developmental regulators, over time their functions
neural stem/progenitor cells. The results
have expanded to include a wide range of processes such as genomic

N
Y. (2009) Polycomb limits the neurogenic uestro estudio de la función de la inactivación doble se de be a una unveiled a function in timely differentiation
competence of neural precursor cells to promote imprinting, maintenance of stem cell and cancer development. of neurons and glial derivatives, as well as
Polycomb se centra en las combinación de supervivencia disminuida
astrogenic fate transition. Neuron 63: 600-613. a positive role in cell proliferation and self-
subunidades Ring1A y Ring1B, de células maduras y de proliferación
Vidal, M. (2009) Role of Polycomb proteins Ring1A renewal of stem cells. Ongoing work pursues

O
and Ring1B in the epigenetic regulation of gene identificadas originalmente en el laboratorio limitada de células inmaduras.
y esenciales para la monoubiquitinación de ur research concerns the function(s) of Ring1A and Ring1B, PcG subunits the identification of targets deregulated in
expression. Int. J. Dev. Biol. 53:355-370. Utilizando un modelo de células madre/
identified in our lab and that act as E3 ligases in histone H2A monoubiquitylation, mutant cells.
Román-Trufero, M., Méndez-Gómez, H., Pérez, C., la histona H2A (una modificación asociada a progenitoras neurales investigamos funciones
Hijikata, A., Fujimura, Y., Endo, T., Koseki, H., Vicario- represión transcripcional). Utilizamos ratones a chromatin mark associated to transcriptional repression. These studies rely on Finally, in a complementary study, we use
de los genes Ring1A y Ring1B en células fetales
Abejón, C. and Vidal, M. (2009). Maintenance genetic analysis using mouse models of constitutive/conditional loss of function of the proteomic approaches to characterize
con mutaciones constitutiva/inducible, y adultas. En células fetales hemos observado
of undifferentiated state and self-renewal of Ring1A and Ring1B genes. We are also characterizing the expanding variety of Ring1A/ Ring1A-Ring1B complexes, with an emphasis
en los genes Ring1A y Ring1B. También que las proteínas Ring1 reprimen el programa
embryonic neural stem cells by Polycomb protein Ring1B-containing complexes.
Ring1B. Stem Cells 27: 1559-1570. estudiamos la diversidad de complejos que de diferenciación neuronal y promueven la in those containing as a subunit RYBP whose
contienen Ring1A/Ring1B. proliferación y autorenovación de células Collaborating with C. Calés (IIB and CSIC-UAM, Madrid) we are investigating contributions inactivation in the germ line results in
Neira, J., Román-Trufero, M., Prieto, J., Singh,
G., Barrera, F., Renart, M. and Vidal, M. (2009). indeferenciadas. Actualmente pretendemos of Ring1 proteins to cell homeostasis in the adult hematopoietic compartment. We have embryonic lethality.
En colaboración con C. Calés (IIB y UAM)
The transcriptional repressor RYBP is a natively deducir mecanismos que median estas
estamos investigando las contribuciones
unfolded protein which folds upon binding to
relativas de Ring1A y Ring1B, así como su funciones a través de la identificación de
DNA. Biochemistry 48: 1348-1360.
actividad conjunta en la hematopoiesis reguladores esenciales alterados en células
Sánchez, C., Sánchez, I., Demmers, J.A., Rodriguez,
P., Strouboulis, J. and Vidal, M. (2007). Proteomic adulta. Mientras que la inactivación madre/progenitoras neurales deficientes en
analysis of Ring1B/Rnf2 interactors identifies a individual de cada uno de los genes Ring1A y/o Ring1B.
novel complex with the Fbxl10/Jhdm1B histone muestra fenotipos suaves, aunque distintos, Un estudio complementario persigue
demethylase and the BcoR corepressor. Mol. Cell.
Proteomics 6: 820-834.
la inactivación de los dos genes resulta en una mejor caracterización bioquímica de
un defecto hematopoyético insuperable los complejos de los que forman parte
causado, primariamente, por anemia severa. Ring1A y Ring1B, con un énfasis en aquellos Aplasia medular resultante de la inactivación
Los resultados muestran redundancia que contienen la subunidad RYBP, cuya de Ring1A y Ring1B en el compartimento
hematopoyético de ratones adultos.
funcional de los dos parálogos. La letalidad inactivación resulta en letalidad embrionaria. Secciones de esternón de ratones
deficientes sólo en Ring1A (izquierda) y de
Ring1A y Ring1B reprimen el programa de diferenciación neuronal de células ratones deficientes en Ring1A y Ring1B a
madre/progenitoras neurales. Células constitutivamente deficientes en Ring1A Ring1A and Ring1B repress neuronal differentiation of neural stem/progenitor cells. las dos-tres semanas de la inactivación de
(izquierda) o doble deficientes en Ring1A y Ring1B (tras deleción inducida del alelo Ring1A-/- cells (left panel) or double Ring1A and Ring1B-deficient cells (after deletion Ring1B teñidas con hematoxilina-eosina
Ring1Bf/f; centro y derecha) crecidas en condiciones de no diferenciación y teñidas of a floxed Ring1B allele; center and right panels) growing under non-differentiation mostrando depleción masiva de células
con anticuerpos que detectan filamentos específicos de neuronas (NF-m y Tuj1). conditions were stained with antibodies that detect neuronal markers NF-m and Tuj1 hematopoyéticas. Las barras corresponden a
Los nucleos celulares están teñidos con DAPI. La expresión de dichos marcadores and with DAPI that marks cell nuclei. The expression of these markers and morphological 200 (arriba) o 20 (abajo) micras.
y las alteraciones morfológicas (neuritas) indican derepresión del programa de alterions (neurite extensions) are consistent with the derepression of a neuronal Bone marrow aplasia following hematopoietic
diferenciación neuronal. Las barras corresponden a 50 micras. differentiation program in double mutant cells. Bars equal 50 microns. compound inactivation of Ring1A and Ring1B
genes. Hematoxylin-eosin staining of sternum
sections of single (Ring1A-/-, left) and double
(Ring1A, Ring1B) mice 2-3 weeks after Ring1B
inactivation showing massive depletion of
hematopoietic cells. Bars equal 200 microns
(top) or 20 microns (bottom).

124 125
 Clara Goday Baylina
Investigadora Científica | claragoday@cib.csic.es
PhD, 1980.
Universidad Complutense de Madrid.
Postdoctoral.
Universidad de “La Sapienza” Roma. Italia.
Científica Titular, 1986,
Investigadora Científica, 2008.
CIB, CSIC.
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=15
Eliminación de Cromosomas en Insectos
Proliferación Celular y Desarrollo | Cell Proliferation & Development
El díptero Sciara constituye un ejemplo clásico
de eliminación programada de cromosomas y de
impronta genómica, ya que durante el desarrollo
cromosomas de origen paterno son selectivamente
eliminados del genoma. Sciara es un sistema
M
odificaciones epigenéticas de
la cromatína y eliminación de
cromosomas en Sciara.
Los procesos biológicos inusuales en
Sciara son: (1) eliminación selectiva de
cromosomas paternos del soma embionario
(2) eliminación del set paterno en meiosis
I masculina y (3) no-disyunción del
cromosoma X materno durante la meiosis
II masculina. Investigamos modificaciones
covalentes de la cromatína asociadas al
origen parental de los cromosomas y a la
eliminación cromosómica durante la meiosis.
En S. ocellaris y S. coprophila modificaciones
en las histonas H3/H4 (acetilación/metilación/
fosforilación) marcan diferencialmente los
126
Otros miembros | Other lab members:
María del Carmen Escribá Pérez
Cecilia Giardini
excelente para analizar el comportamiento
cromosómico y en particular, investigar
modificaciones epigenéticas de la cromatína
implicadas en alteraciones en la segregación
cromosomica, tanto en mitosis como en meiosis.
cromosomas según su origen parental y regulados por un “elemento controlador”
en relación a su eliminación en meiosis I. (CE) que actua en cis. El “CE”, todavía
Además, hemos analizado la fosforilación de desconocido, se localiza en la heterocromatina
la histona H3 (serinas 10/28; treoninas 3/11) adyacente al centrómero del cromosoma X.
durante la no-disyunción del cromosoma Investigamos la organización molecular de la
X materno en meiosis II. Nuestros datos heterocromatina de la región centromérica
demuestran que modificaciones en los del cromosoma X. Se han caracterizado
patrones de fosforilación de H3 están dos nuevas proteínas heterocromáticas
directamente implicadas en la inactivación localizadas en los centrómeros/telómeros
functional del centrómero del cromosoma X. de los cromosomas. Tras microdiseccionar
Caracterización citológica y molecular de la regiones cromosómicas heterocromáticas
heterocromatina en Sciara. del centrómero del cromosoma X y generar
En Sciara, la no-disyunción del cromosoma librerias genómicas se han localizado (FISH)
X materno en los espermatocitos y la y caracterizado tres sequencias de DNA
eliminación de los cromosomas X paternos repetido y un elemento transponible RTE
del soma embrionario son procesos (colaboración con A Villasante, CBM).
Meiosis II en espermatocitos
de Sciara ocellaris (metafase
a la izquierda y anafase
temprana a la derecha).
Anticuerpos anti-histona
H3S10ph (verde), anti-
tubulina (azul) y tinción de
cromosomas con DAPI (rojo).
El cromosoma X materno
carece de fosforilación H3S10
en la región terminal del
centrómero (flechas) por
la que permanece unido al
polo de la primera división
meiótica.
Sciara ocellaris spermatocytes
at meiosis II (methaphase at
the left and early anaphase
at the right). Antibodies
against H3S10ph (green) and
tubulin (blue) and chromatin
DAPI staining. Maternal X
chromosome lacks histone
H3S10 phosphorylation at
the centromeric end (arrows)
that remains associated to the
spindle pole of the first male
meiotic division.
Chromosome
Elimination in Insects
A classic example of programmed chromosome germline, histone H3/H4 modifications (acetylation/methylation/
elimination and genomic imprinting is found in phosphorylation) differently mark chromosomes depending on their
parental origin during paternal chromosomes elimination at male
sciarid flies (Diptera, Sciaridae), where chromosomes
meiosis I. We also analyzed histone H3 phosphorylation patterns
of paternal origin are selectively discarded from the (serines 10/28; threonines 3/11) during non-disjunction of the maternal
genome during development. Sciara constitutes X-chromosome at male meiosis II. Our results demonstrate that the
an excellent system to analyze chromosome functional inactivation of the X-chromosome centromere is linked to
behavior and, in particular, to study the epigenetic histone H3 phosphorylation deficiencies.
modifications of chromatin involved in chromosome Cytological and molecular characterization of heterochromatin in
Sciara.
segregation alterations, both at mitosis and meiosis.
A cis-acting “controlling element” (CE) regulates Sciara maternal X
chromosome non-disjunction in the spermatocyte and paternal
X-chromosome/s elimination in the embryo soma. The CE, still
E
pigenetic chromatin modifications and chromosome undetermined, locates at the heterochromatin adjacent to the
elimination in Sciara. X- centromere. We are investigating the molecular organization of
Among the unusual biological processes found in sciarids heterochromatin at the X-centromere region. We have characterized
there are: (1) the selective elimination of paternal X-chromosome/s two novel heterochromatic proteins located at Sciara centromeres/
from the embryo soma (2) the elimination of the paternal set at male telomeres. Following microdissection of specific X-centromere
meiosis I and (3) the non-disjunction of the maternal X-chromosome heterochromatin and the generation of DNA libraries, we
at male meiosis II. We investigated covalent chromatin modifications characterized localized (FISH) and characterized three DNA repeated
associated to the parental origin of chromosomes and to chromosome sequences and one transposable element RTE (collaboration with A
elimination in Sciara male meiosis. In S. ocellaris and S. coprophila Villasante, CBM).
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Greciano, P.G, Ruiz, MF, Kremer, L and Goday, C.
Two new chromodomain-containing proteins that
associate to heterochromatin in Sciara coprophila
chromosomes. Chromosoma. 118(3): 361-76 (2009).
Goday, C. and Pigozzi, M.I. Heterochromatin
and histone modifications in the germline-
restricted chromosome of the zebra finch
undergoing elimination during spermatogenesis.
Chromosoma. 119(3):325-36 (2010).
Escribá, M.C, Cecilia Giardini, C. and Goday, C.
Histone H3 phosphorylation and non-disjunction
of maternal X chromosome during male meiosis
in sciarid flies. J. Cell Sci. (2011).
doi: 10.83022/JCS.063458
127
 Susana Moreno Díaz de la Espina
Investigadora Científica | smoreno@cib.csic.es
PhD, 1975. Investigadora del equipo | Staff Scientist:
Universidad Complutense Madrid.
Consuelo de la Torre García Quintana (Ad Honorem)
Postdoctoral.
DKFZ, Heidelberg, Alemania y NCI/NIH. Frederick.
MD. USA. Otros miembros | Other lab members:
Científica Titular, 1979,
Malgorzata Ciska
Investigadora Científica, 2002.
CIB, CSIC. Mª Candelaria Pérez Munive
Carlos Gaona López
Mercedes Carnota Romero Nuclear Matrix
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=31
and Regulation
of the Nuclear
Matriz Nuclear y Regulación de la Organización y Organization and
Proliferación Celular y Desarrollo | Cell Proliferation & Development

Funcionalidad Nuclear Function

Estamos interesados en el análisis del como MFP1 y NMCP1 y análogos de proteínas del Our main interest is the analysis of the
núcleoesqueleto vegetal, principalmente en la núcleoesqueleto animal. Actualmente estamos plant nucleo­skeleton, focussed in the
caracterización de su proteoma y el ensamblaje analizando las características y funcionalidad de la characterization of its proteome and
de sus estructuras básicas. Hemos efectuado una actina nuclear y sus proteínas asociadas, y proteínas the assembly of its basic structures.
contribución importante con la caracterización de estructurales específicas de plantas como NIFs y We have contributed a substantial
proteínas específicas del núcleoesqueleto de plantas NMCP1. advance with the characterization of
plant specific proteins such as MFP1

E and NMCP1, and analogues of proteins

l núcleo de Allium cepa contiene formas
de actina con diferente solubilidad y
distribución intranuclear, que están
asociadas con los focos de transcripción y
los filamentos del núcleoesqueleto (NSK)
(Cruz and Moreno Díaz de la Espina, 2009). La
actina nuclear está modulada por diferentes
proteínas nucleares de unión a actina (ABP).
Además de la miosina nuclear I (NMI) (Cruz
and Moreno Díaz de la Espina, 2009), hemos
colocalizan con actina en el núcleo, se
localizan en la envoltura nuclear y los
dominios pericromatínicos y están asociadas
al núcleoesqueleto (Fig. 1; Pérez Munive and
Moreno Diaz de la Espina, 2010).
Los genomas vegetales carecen de
ortólogos de los genes de las principales
proteínas estructurales del NSK animal y
parecen tener proteínas específicas para
el control de la organización nuclear. En
en una AcNIF de 65 kDa de la lámina y
endoesqueleto que se asocia con espectrina,
asi como en la proteína NMCP1 codificada
por la familia génica LINC en Arabidopsis que
controla la forma y organización nuclear y el
número y distribución de los cromocentros.
AcNMCP1 presenta conservación de
secuencia con las proteínas NMCP1 de
otras especies pero diferente tamaño. Se
distribuye en la periferia e interior nuclear y
of the animal nucleoskeleton. Currently
we are investigating the characteristics
and functionality of nuclear actin and
its actin binding proteins, and plant
specific nuclear structural proteins such
as NIFs and NMCP1.
Caracterización de AcNMCP1. (A) Diferencias en el tamaño molecular entre las proteínas NMCP1 de cebolla
(Ac), arabidopsis (At), trigo (Ta) y centeno (Sc) reveladas con un anticuerpo contra la proteína de cebolla. (B)
Electroforesis bidimensional que revela un pI de 5.5 para AcNMCP1. (C) Distribución nuclear de AcNMCP1 en
una sección confocal. (D) Superposición de los canales verde (AcNMCP1) y azul (DAPI) de la misma sección
confocal. (E) Western blot demostrando la presencia de la proteína en el núcleo (N) y las fracciones nucleares
insolubles (F1, F2 y F3 o núcleoesqueleto) pero no en las solubles (S1, S2, S3). (F) Distribución de AcNMCP1 en
una sección confocal del núcleoesqueleto. Barras = 10 μm.
Characterization of AcNMCP1. (A) Differences in molecular size of the NMCP1 proteins from onion (Ac), Arabidopsis
(At), wheat (Ta) and rye (Sc) revealed with an antibody against the onion protein. (B) 2D electrophoresis revealing
a pI value of 5.5 for AcNMCP1. (C) Nuclear distribution of AcNMCP1 in a confocal section. (D) Overlay of AcNMCP1
(green) and DAPI (blue) stainings of the same confocal section. (E) Western blot displaying the presence of the

descubierto una nueva clase de ABPs
nucleares en plantas, las proteínas semejantes
a espectrina que coinmunoprecipitan y
Asociación de las proteínas
semejantes a espectrina y actina
en el núcleo de Allium cepa. (A)
Coinmunoprecipitación de actina
y las proteínas semejantes a
espectrina tras inmunoprecipitación
de las proteínas nucleares con el
anticuerpo anti α-espectrina 1622.
Se detecta una banda de actina en la
fracción nuclear inmunoprecipitada
(flecha). Cadena pesada de la IgG
(*). La banda de actina detectada
en la fracción nuclear (N) con el
mismo anticuerpo se muestra como
control. (B-F) Colocalización de las
proteínas semejantes a espectrina y
actina en secciones confocales tras
incubación con el anticuerpo anti
espectrinas α y β S1390 (D: rojo) y el
anti actina AC15 (E: verde). Tinción
con DAPI del mismo campo (F). (C)
Superposición de los canales rojo y
verde mostrando la colocalización
de ambas proteínas en las regiones
intercromatínicas y en algunos focos.
(B) Los perfiles de intensidad lineal
de los canales verde y rojo a lo largo
de la línea seleccionada enfatizan
la colocalización en algunos
focos así como en los dominios
intercromatínicos. Barra = 10 μm.
A
este campo nos hemos concentrado en
es parte del núcleoesqueleto. Su expresión llium cepa nuclei contain actin forms with protein in the nucleus (N) and the insoluble nuclear fractions (F1, F2 and F3 or nucleoskeleton) but not in the
el estudio de proteínas de tipo filamentos soluble ones (S1, S2, S3). (F) Distribution of AcNMCP1 in a confocal section of the nucleoskeleton. Bars = 10 μm.
intermedios nucleares (NIFs) principalmente está regulada en el desarrollo (Fig 2). different solubility and intranuclear topology
that associate with transcription foci and also
with the filaments of the nucleoskeleton (NSK) (Fig.
1; Cruz and Moreno Díaz de la Espina, 2009). Nuclear
actin is modulated by different actin binding
proteins (ABP). Besides NMI (Cruz and Moreno Díaz
de la Espina, 2009), we have discovered a new class
of structural nuclear ABPs in plants, the spectrin-like
proteins that co-immunoprecipitate and co-localize
with actin in onion nuclei. They localize in the
nuclear envelope and perichromatin domains and
are associated with the NSK (Fig. 1; Pérez Munive
and Moreno Diaz de la Espina, 2010).
The plant genomes lack orthologs of the genes of
the main structural proteins of the animal NSK and
they appear to have evolved specific proteins for
Publicaciones Seleccionadas
the control of nuclear and genome organization. Selected Publications Cruz, J.R., Moreno Diaz de la Espina, S. (2009)
In this field we concentrate in the investigation
Pérez Munive, C., Moreno Díaz de la Espina, S. (2010) Subnuclear compartmentalization and function of
of nuclear intermediate filament proteins (NIFs)
Nuclear Spectrin-like proteins are structural actin actin and nuclear myosin I in plants. Chromosoma
mainly in a 65 kDa AcNIF of the lamina and 118, 193-207.
binding proteins in plants. Biol Cell (doi: 10.142/
endoskeleton that associates with spectrin, and BC20100083). Moreno Díaz de la Espina, S. (2009) The
also in NMCP1 proteins codified by the gene Nucleoskeleton. In: Functional Organization of the
Henriques R., Magyar Z., Monardes A., Khan S., Zalejski
family LINC in Arabidopsis that control nuclear size C., Orellana J., Szabados L., De la Torre C., Koncz C., Plant Nucleus. Plant Cell Monogr 14, edited by I.
and organization and chromocentre number and Bögre L. (2010) Arabidopsis S6 kinase mutants display Meier, Springer, Heidelberg, Germany, 79-100.
Association of spectrin-like proteins and actin in onion nuclei. (A) Co-immunoprecipitation of actin and spectrin-like proteins after
distribution. AcNMCP1 presents sequence similarity chromosome instability and altered RBR1-E2F pathway Moreno Díaz de la Espina, S. de la Torre, C. (2008) Coiled
immunoprecipitation of nuclear proteins with 1622 anti α-spectrin antibody. A band of actin was detected in the immunoprecipitated nuclear
activity. EMBO J. 29, 2979-2993. coil and intermediate filament proteins in the Plant
fraction (arrow). IgG heavy chain (*). The actin band detected in the nuclear fraction (N) with the same anti actin antibody is shown as control. with NMCP1 from other species, but have a different
(B-F) Co-localization of spectrin-like proteins and actin in confocal sections after incubation with S1390 anti-spectrin antibody (red: D) and AC15 Fernández Tresguerres, M.E., Moreno Díaz de la Nucleoskeleton. The Plant Cytoskeleton: Genomic and
size. It distributes in the periphery and inside Bioinformatic Tools for Biotechnology and Agriculture,
anti-actin antibody (green: E). DAPI staining of the same field (F). (C) Overlay of the corresponding green and red channels showing the co- Espina, S., Gasset Rosa, F., Giraldo, R. (2010) A DNA-
localization of spectrin-like proteins and actin in the interchromatin network, as well as in some spots. (B) The line-intensity profiles of the green the nucleus and is a component of the NSK. Its edited by Y.B. Blume, W.V. Baird, A.I. Yewets, D. Breviario,
promoted amyloid proteinopathy in Escherichia coli.
and red channels across the selected line emphasized the co-localization in some foci, as well as in the interchromatin network. Bar = 10 μm. expression is developmentally regulated (Fig. 2). Mol Microbiol 77, 1456-1469. Springer, Dordercht, The Netherlands, 45-69.

128 129
 Pedro Esponda Fernández
Investigador Científico | esponda@cib.csic.es
PhD, 1979.
Universidad de Córdoba
Profesor Agregado Contratado, 1973-1981,
Universidad Autonoma Madrid.
Investigador Científico, 1981.
CIB, CSIC.
Research Associate, 1982-1985.
Cornell University Medical College, USA.
Profesor Asociado, 1990-1999.
Universidad de Alcalá de Henares.
Juan F. Giménez Abián
Científico Titular | gimenezjf@cib.csic.es 
PhD, 1992.
Universidad Autónoma de Madrid.
Postdoctoral, 1992-1994.
University of Cambridge, UK.
Guest Scientist, 2001-2003.
IMP Viena, Austria.
Guest Scientist, 2004-2006.
University of Minnesota (Minneapolis, USA).
Científico Titular, 2008.
CIB, CSIC.

Otros miembros | Other lab members: Ascensión González Díaz www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=19

Cell and
Animal
& Development

Reproducción Celular y Animal las secreciones de este órgano también

Reproduction
Medicine

podían modificarse. Esto es importante

ya que estas secreciones controlan la
capacidad fértil del espermatozoide de
Nuestro grupo estudia diferentes aspectos de los mecanismos de mamíferos. Por otra parte, se observó que Different aspects of Cell and Animal
reproducción tanto a nivel celular como a nivel animal (organismo el éxito de la transfección en el epidídimo (whole organism) Reproduction are
and Molecular

depende directamente de la actividad

completo). Hemos estudiado la aparición de apoptosis y proteínas de currently being analyzed by our group.
de los receptores de andrógenos, ya que
stress en el tracto genital masculino. Además, mediante transfecciones in Changes in Apoptosis and Stress
| Cell Proliferation

la Flutamida (droga que bloquea dichos

vivo, se han originado células y secreciones genéticamente modificadas receptores) provoca una disminución de Proteins have been analyzed in the
en el epidídimo. Respecto a proliferación celular hemos analizado los las células transfectadas, mientras que en male genital tract. On the other hand
mecanismos de cohesión y segregación cromosómica. machos tratados con testosterona este in vivo transfections of the epididymis
número se incrementa. have shown that cells and secretions

R
eproducción Animal. los receptores de andrógenos, induce una Reproducción Celular. can be modified. On the subject of (Panel izquierdo) Dos túbulos (A y B) de la cauda (Left panel) Two sections of epididymal tubules (A and
| Cellular

Se estudian diversos aspectos del onda de apoptosis en las células principales Estudiamos los diferentes mecanismos de epididimaria de un órgano transfectado. En los B) from a transfected organ. Numerous cells express
Cell Proliferation we focuss on the túbulos numerosas células aparecen expresando la the Green Fluorescent Protein (GFP). (Right panel) A
proceso reproductivo en algunos del epidídimo, así como alteraciones en cohesión entre cromátidas hermanas y su Proteína Verde Fluorescente (GFP). (Panel derecho) free cell from the cauda epididymis of a transfected
animales. Estos estudios se han centrado la proteína de Stress HSP70, de forma pérdida regulada en la anafase mitótica. mechanisms for chromosome cohesion Una célula libre de la cauda epididimaria espresando organ. The cell express the Green Fluorescent Protein
en dos temas: 1) Cambios apoptóticos y semejante a lo provoca una castración. Analizamos tanto la ruta de liberación de and segregation. la proteína GFP. La expresión es citoplasmática y el in the cytoplasm, but the nucleus (N) appears non-
núcleo no fluoresce (N). fluorescent.
Desarrollo

de algunas proteínas de Stress provocados 2) Transferencia génica in vivo del tracto cohesinas y su dependencia del punto de
por cambios hormonales en el tracto reproductor masculino. Se transfectó in chequeo del huso, como los mecanismos de
Celulary yMolecular

reproductor masculino de mamíferos. La
Flutamida, un anti-andrógeno que simula
los efectos de la castración bloqueando
Medicina Celular
vivo el epidídimo del ratón. Se observó
que numerosas células principales del
epitelio expresaban el transgen, y que
A
control celular del proceso de decatenación
nimal Reproduction.
de cromátidas hermanas por parte de la
Studies on the reproductive mechanism
topoisomerasa II.
of some animals has been focussed in two
different topics.
1) Apoptotic changes and stress proteins are induced
by hormonal changes in the male reproductive tract.

We have analyzed the Testosterone dependence

of apoptotic changes and the presence of Stress
Protein HSP70 in the male reproductive tract. The
anti-androgen Flutamide which affect androgen
Proliferación

receptors produces apoptosis and an increase in

HSP70 in the epididymal epithelial cells. 2) In vivo
gene transfer to the mammalian reproductive tract.
The mouse epididymis was transfected. Numerous
epithelial cells and secretions were transfected.
Modifications of secretion proteins is important
because they regulate sperm fertility. On the other
hand, transfection efficiency depends on the activity
of androgen receptors. Flutamide, a drug that
block androgen receptors produces a decrease in Publicaciones Seleccionadas Esponda, P. (2010) Gene transfer to the mammalian
the number of transfected cells, but Testosterone Selected Publications reproductive tract: A Review. Zygote 13, 1-9.
treated males showed a notorious increase of the Díaz-Martínez, L.A., Beauchene, N.A., Furniss, K.,
transfection rate. Esponda, P., Carballada, R. (2009) In vivo gene transfer Esponda, P., Giménez-Abián, J.F., and Clarke, D.J.
induces transgene expression in cells and secretions (2010) Cohesin is needed for bipolar mitosis in human
Cell Reproduction. of the mouse cauda epididymis. Molec. Human cells. Cell Cycle, 9(9), 1764-1773.
Metafase control bipolar en Different mechanisms for sister chromatid Reprod 15, 355-361. Beauchene NA, Díaz-Martínez LA, Furniss K, Hsu WS,
células Hela (A). Metafases cohesion and the regulation of loss of cohesion Bustos Obregón, E., Esponda, P. (2009) Increase in Tsai HJ, Chamberlain C, Esponda P, Giménez-Abián JF,
multipolares tras la at anaphase onset are studied. We analyze the apoptosis and of the Stress Protein HSP70 in the Clarke DJ. (2010) Rad21 is required for centrosome
depleción de la cohesina mouse epididymis produced by the antiandrogen integrity in human cells independently of its role in
Rad21 (B y C).
biochemical pathway which removes cohesin from
Flutamide. Int. J. Morphol. 27, 463-468. chromosome cohesion. Cell Cycle, 9(9), 1774-1780.
Control bipolar metaphase
chromosomes depending on the spindle assembly
Giménez-Abián JF, Clarke DJ. (2009) Cytological Giménez-Abián JF, Díaz-Martínez LA, Beauchene NA,
in Hela cells (A). Multipolar checkpoint as well as the cell cycle mechanisms
analysis of chromosome structural defects that result Hsu WS, Tsai HJ, Clarke DJ. (2010) Determinants of
metaphases after depletion of which regulates topoisomerase II-mediated from topoisomerase II dysfunction. Methods Mol Rad21 loacalization at the centrosome in human cells.
cohesin Rad21 (B and C).
decatenation of sister chromatids. Biol. 582, 189-207. Cell Cycle, 9(9), 1759-1763.

130 131
 José Luis Barbero Esteban
Investigador Científico | jlbarbero@cib.csic.es
PhD, 1981. Otros miembros | Other lab members:
Universidad Complutense de Madrid.
Associate Researcher, 1984.
Adela Calvente Arroyo
NYU Medical Center. New York. USA. Ana Cuadrado García
Researcher, 1983-1996.
Pharmacia/Antibioticos Pharma.
Group Leader, 1996-2006.
Pharmacia/Department of Immunology and
Oncology. Centro Nacional de Biotecnología.
Investigador Científico, 2006.
CIB, CSIC.

www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=64

Dinámica Cromosómica en Meiosis

Proliferación Celular y Desarrollo | Cell Proliferation & Development

Inmunolocalización de la cohesina SMC3 durante la profase I

en células meioticas de saltamontes.
SMC3 location during prophase I in grasshopper meiotic cells.

El complejo de cohesinas y las proteínas que regulan meiosis. Errores en los mecanismos moleculares que
la dinámica de asociación/disociación de dicho controlan dicho proceso conducen a la muerte celular
complejo a la cromatina son esenciales para la o al desarrollo de patologías como el síndrome de
correcta segregación de los cromosomas en mitosis y Down, la formación de tumores o la infertilidad.

Publicaciones Seleccionadas

L
a investigación actual de nuestro Modelo propuesto para la Selected Publications
regulación de la apertura/cierre
grupo se centra en el estudio de del anillo de cohesinas durante Suja, J. A. and Barbero, J. L. (2009) Cohesin complexes and
diferentes proteínas denominadas el establecimiento de la cohesión y
sister chromatid cohesion in mammalian meiosis In: Genome
“cohesin-interacting proteins” que regulan ejemplo de dicho mecanismo usando
Dynamics, vol. 5, pp. 94-116, Benavente, R. and Volff, J.N. (ed).
la dinámica del complejo de cohesinas, no
solo durante la segregación cromosómica,
herramientas de escalada.
Chromosomal Karger, Basel.
Robles P, Roig I, García R, Brieno M, Martin M, Barbero JL,
sino también en procesos de control
de la expresión génica en los que las
cohesinas actúan modelando la estructura
Dynamics in Meiosis Cabrero Ll, García-Caldés M [2009] Analysis of recombination
along chromosome 21 during human female pachytene stage.
RBMOnline 18:784-794.
Barbero JL [2009] Review: Cohesins: Chromatin architects in
de ciertas regiones de los cromosomas.
Are there link between human syndromes with physical and chromosome segregation,control of gene expression and much
Entre estas proteínas cabe resaltar la more. Cellular and Molecular Life Sciences 66:2025-2035
familia de shugoshinas SGO1 y SGO2, la mental problems, a tumor growing out of control and the Viera A, Rufas JS, Martínez I, Barbero JL, Ortega S, Suja JA [2009]
acetiltransferasa Eco 1 en levadura, ESCO1 incapability to contribute to next generation? This question can CDK2 is required for proper homologous pairing, recombination
y ESCO2 en mamíferos, y las proteínas PDS5 be answered if we look at the biological functions of a protein and sex-body formation during male mouse meiosis. J. Cell. Sci.
y WAPL (Figura 1), que controlan diferentes 122, 2149-2159.
complex, named cohesin, which is the main protagonist
etapas del proceso de asociación/ Prieto I, Koutnetsova A, Fütterer A, Trachana B, Leonardo E,
disociación del complejo de cohesinas a los of sister chromatid cohesion control during chromosome Guerrero AA, Gamero MC, Pacio-Bras C, Leh H, Buckle M, García-
Gallo M, Kremer L, Serrano A, Roncal F, Albar JP, Barbero JL,
cromosomas. segregation in cell division. The establishment, maintenance
Martínez-A C, van Wely KHM [2009] Synaptonemal complex
En colaboración con el grupo de JA and removal of sister chromatid cohesion is one of the most assembly and H3K4Me3 demethylation determine DIDO3
Suja (Universidad Autónoma de Madrid) fascinating and dangerous processes in the life of a cell. localization in meiosis. Chromosoma 118:617-632.
hemos mostrado que la shugoshina del Cacho E, Pagés M, Gallego M, Barbero JL, Monteagudo,
Sánchez-Acedo C [2010] Meiotic chromosome pairing and

W
SGOL2, ortólogo de Sgo2 de S. pombe,
e previously isolated and characterized a family of very conserved bouquet formation during Eimeria tenella sporulation. Intern. J.
actúa como protector de la cohesión Parasitol. 40:453-462.
centrómerica a lo largo de la meiosis I y proteins STAG which are subunits of the cohesin complexes.
Molina-Jiménez F, Benedicto I, Murata M, Martín-Vílchez S, Seki
que redistribuye su localización durante Using antibodies generated against STAG proteins from different
T, Antonio Pintor-Toro J, Tortolero M, Moreno-Otero R, Okazaki
la meiosis II en dependencia de la tensión organisms (fly, mouse and man) we studied the contribution of distinct cohesin K, Koike K, Barbero JL, Matsuzaki K, Majano PL, López-Cabrera
Proposed model for
de los microtúbulos proponiendo un regulation of opening/ complexes to arm and centromeric sister chromatid cohesion in different insect M. [2010] Expression of pituitary tumor-transforming gene
closing cohesin ring during and mammalian models. Now, we focus our work on the study of cohesin- 1 (PTTG1)/securin in hepatitis B virus (HBV)-associated liver
mecanismo por el que SGOL2 controla la
cohesion establishment and diseases: Evidence for an HBV X protein-mediated inhibition of
cohesión en los centrómeros en meiosis interacting proteins, which regulate the cohesin dynamic during the different
example of this mechanism PTTG1 ubiquitination and degradation. Hepatology, 51:777-787.
de mamíferos. Además hemos analizado using locking carabiners
cellular processes in which cohesin ring modulate chromatin structure
Lucena J, Pezzi S, Aso E, Valero MC, Carreiro C, Dubus P, Sampaio
la función de SGOL2 in vivo determinando and ropes employed in We recently reported (in collaboration with Dr. JA Suja laboratory) that A, Segura M, Barthelemy I, Zindel MY, Sousa N, Barbero JL,
mountain climbing.
su papel esencial en meiosis en ratones shugoshin SGOL2, the mammalian orthologue of yeast Sgo2, is a protector of Maldonado R, Perez-Jurado LA, Campuzano V [2010] Essential
deficientes en SGOL2, modelo generado en centromere cohesion throughout meiosis I and that during metaphase II, SGOL2 role of the N-terminal region of TFII-I in viability and behavior.
BMC Med. Genet. 11:61.
el laboratorio de AM Pendás (colaboración relocalizes in a tension-dependent manner in mouse spermatocytes, suggesting
con los grupos de JA Suja y AM Pendás). Barbero JL [2010] Review: Cohesin and cohesin-regulator
that shugoshins are also components of the tension-sensing machinery during
complexes: from cell division to gene expression control. In:
Actualmente estamos analizando la función mitosis and meiosis II. In addition, we characterized the function of SGOL2 in Cell Division: Theory, Variants and Degradation. Eds: Y.N. Golitsin
biológica de las proteínas PDS5A y PDS5B, mammalian meiosis in vivo studying the phenotype of the SGOL2 deficient and M.C. Krylov. pp.117-126. Nova Science Publisher, Inc. New
WAPL y las acetiltranferasas ESCO1 y 2 mouse generated in the AM Pendás laboratory (collaborative research with JA York. USA.

en la meiosis de ratón para determinar Suja and AM Pendas groups). Garcia-Cruz R, Brieño MA, Roig I, Grossmann M, Velilla E, Pujol A,
Cabero L, Pessarrodona A, Barbero JL, Garcia Caldés M. [2010]
el mecanismo molecular que controla Currently, we are studying the role of cohesin-regulators PDS5A,PDS5B, WAPL
Dynamics of cohesin proteins REC8, STAG3, SMC1{beta} and
la cohesión y segregación cromosómica and the acetyltransferases ESCO1 and ESCO2 in mouse meiosis in order to SMC3 are consistent with a role in sister chromatid cohesion
durante la generación de las células understand the molecular mechanisms that control chromosome segregation during meiosis in human oocytes. Human Reproduction.
germinales en mamíferos. during mammalian germ cell development. 25,2316-2327.

132 133
 Lucas Sánchez Rodríguez
Profesor de Investigación | lsanchez@cib.csic.es
MD, 1973. Otros miembros | Other lab members:
PhD, 1976.
Universidad Complutense de Madrid. M. Fernanda Ruiz Lorenzo
Postdoctoral, 1977-1979. Iker Martín Sánchez
Investigador Asociado, 1979-1981. Francesca Sarno
Zoological Institute, University of Zürich, Suiza.
Dolores Mateos Moya
Jefe de grupo, 1981-1984.
European Molecular Biology Laboratory (E.M.B.L.),
Heidelberg, Alemania.
Científico Titular, 1985,
Investigador Científico, 1989,
Profesor de Investigación, 2004.
CIB, CSIC.
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=17

Publicaciones Seleccionadas
Evolución de los Evolution of Sex Selected Publications
Proliferación Celular y Desarrollo | Cell Proliferation & Development

Mecanismos de Determinación Determining Mechanisms

Alvarez, M., Ruiz, M.F. and Sánchez, L. (2009) Effect of the gene doublesex of
Anastrepha on the somatic sexual development of Drosophila. PLoS ONE
4(4), e5141.

Sexual en Insectos in Insects Ruiz, M.F. and Sánchez, L. (2010) Effect of the gene transformer of Anastrepha
on the somatic sexual development of Drosophila. Int J Dev Biol 54, 627-633.
Sarno, F., Ruiz, M.F., Eirín-López, J.M., Perondini, A.L.P., Selivon, D. and Sánchez,
La determinación sexual es un proceso de desarrollo evolucionado. Debido a que todos los mecanismos Sex determination is the developmental process that L. (2010) The gene transformer-2 of Anastrepha fruit flies (Diptera, Tephritidae)
and its evolution in insects. BMC Evolutionary Biology 10, 140.
que da lugar a hembras y machos, los cuales son de determinación sexual están representados en los gives rise to males and females, which are different at
Sánchez, L. (2010) Sciara as an experimental model for studies on the
distintos desde el punto de vista morfológico, insectos, éstos constituyen un modelo experimental the morphological, physiological, and behavioural levels. evolutionary relationships between the zygotic, maternal and environmental
fisiológico y de conducta. Nuestro proyecto analiza excepcional para el estudio evolutivo de dichos The goal of our project is the knowledge of how the sex primary signals for sexual development. J Genetics 89, 325-331.

cómo los mecanismos de determinación sexual han mecanismos. determination mechanisms evolved. Due to the plethora
of different mechanisms controlling sex determination Transformer (Tra), Transformer2 (Tra2) and the Doublesex proteins of

L
os resultados obtenidos durante el
bienio 2009-2010 son los siguientes:
(1) se ha aislado y caracterizado el gen
transformer-2 de Anastrepha obliqua (Diptera,
y caracterizado el gen transformer-2 de Sciara
ocellaris (Diptera, Sciaridae); (3) la proteína
Transformer (Tra), la proteína Transformer2
(Tra2) y las proteínas Doublesex de hembra
proteínas Tra de Anastrepha y Tra2 de
Drosophila, así como entre las proteínas
Doublesex y sus genes diana de cito-
diferenciación sexual. Dicha alteración sería
in insects, these are a particularly favourable group of
animals in which to study this problem.
Anastrepha obliqua and the Transformer2 (Tra2) of Sciara ocellaris provide
a partial function in Drosophila melanogaster sexual development; (4)
this partial function appears to be the consequence of an alteration
in the interaction between the Tra protein of Drosophila and the Tra2

Tephritidae); la microinyección de su dsARN
en embriones de Anastrepha ha demostrado
que dicho gen está involucrado en el control
de la determinación sexual de estos insectos,
participando en el control del procesamiento
tipo hembra de los transcritos primarios de
los genes transformer (y por lo tanto en su
autorregulación) y doublesex; (2) se ha aislado
y de macho de Anastrepha obliqua, y la
proteína Transformer2 (Tra2) de Sciara
poseen función parcial en la determinación
sexual de Drosophila melanogaster; (4) esta
función parcial parece ser consecuencia
de una alteración en la interacción entre
las proteínas Tra de Drosophila y Tra2 de
Anastrepha y Tra2 de Sciara, y entre las
debido a los cambios genéticos que se
produjeron una vez que se separaron los
linajes evolutivos que dieron lugar a los
tefrítidos, a los ciáridos y a los drosofilidos.
Colectivamente, estos resultados apoyan la
idea de una coevolución entre las proteínas
Tra y Tra2, así como entre las proteínas
Doublesex y sus genes diana.
T
he results corresponding to the 2009-2010 period are: (1) it
has been isolated and characterised the gene transformer-2
of Anastrepha obliqua (Diptera, Tephritidae); the injection of its
dsRNA into Anastrepha embryos showed that this gene is involved
in sex determination in Anastrepha by participating in the female-
specific splicing of the transformer (and then in its auto-regualtion)
and doublesex pre-mRNA; (2) it has been isolated and characterised
the gene transformer-2 of Sciara ocellaris (Diptera, Sciaridae); (3) the
protein of Anastrepha and the Tra2 protein of Sciara, and between the
Doublesex proteins and their targets, the cyto-differentiation genes.
These anomalous interactions are probably due to the accumulation
of genetic changes once the drosophilid, the tephritid and the sciarid
phylogenetic lineages separated. Collectively, these results indicate
the existence of co-evolution between the Tra and Tra2 proteins, as
well as between the Doublesex proteins and their target, the cyto-
differentiation genes.

Expresión del gen yolk protein 2 (yp2) en moscas de
Drosophila melanogaster transgénicas para el gen
doublesex (dsx) de Anastrepha obliqua. Ensayos de
PCR. FAo#2 indica pUAS-dsxFmRNA (transcripto dsxF
de hembra) de Anastrepha obliqua; MAo#10 indica
pUAS-dsxMmRNA (transcripto dsxM de macho) of
Anastrepha obliqua; yp2 y rp49 indican yolk protein 2
y gen ribosomal 49, respectivamente, de Drosophila
melanogaster. Se utilizó HS-GAL4 para la expresión de
los transgenes. “25ºC” indica que las moscas fueron
mantenidas a 25ºC y “HS” indica que las moscas fueron
sometidas a choque térmico a 37ºC..
Expression of Drosophila yolk protein 2 gene in
Anastrepha dsx transgenic Drosophila flies. PCR
amplification. FAo#2 stands for pUAS-dsxFmRNA (female
dsxF transcript) of Anastrepha obliqua; MAo#10 stands for
pUAS-dsxMmRNA (male dsxM transcript) of Anastrepha
obliqua; yp2 and rp49 stand for the yolk protein 2 and
ribosomal protein 49 genes, respectively, of Drosophila
melanogaster. The inducible HS-GAL4 driver was used
to express the Anastrepha dsx transgene. ‘25ºC’ indicates
that the flies were maintained at this temperature
whereas “HS” indicates that they were subject heat shock
pulses (37ºC).
Análisis del procesamiento de los transcritos primarios de los
genes transformer (tra) (A) y doublesex (dsx) (B) de Anastrepha
sp.1 aff. fraterculus en seudomachos XX que se desarrollan de
huevos que fueron inyectados con dsARN del gen transformer-
2(tra-2) de Anastrepha obliqua. F y M indican hembra (XX) y
macho (XY) normales, respectivamente; traF y traM indican los
ARNm del gen tra de hembra y de macho, respectivamente; dsxF
y dsxM indican los ARNm del gen dsx de hembra y de macho,
respectivamente. Los esquemas de las Figura A y B muestran la
organización molecular de los genes tra y dsx de Anastrepha,
respectivamente. Las flechas muestran la localización de los
cebadores usados en los ensayos de PCR..
Analyses of the splicing pattern of transformer (tra) (A) and
doublesex (dsx) (B) pre-mRNAs of Anastrepha sp.1 aff. fraterculus
in XX pseudomales developed from eggs injected with Aotra2
(Anastrepha obliqua transformer-2) dsRNA. F and M indicates normal
female (XX) and male (XY), respectively. traF and traM stand for the
female and male tra mRNA isoforms, respectively; dsxF and dsxM
stand for the female and male dsx mRNA isoforms. The schemes
show the molecular organisation of genes tra (in A) and dsx (in B) of
Anastrepha. The arrows indicate the locations of the primers used in
the PCR reactions.

134 135
 Jesús del Mazo Martínez
Investigador Científico | jdelmazo@cib.csic.es
PhD, 1978.
Universidad Complutense de Madrid.
Postdoctoral.
CALTECH, Pasadena L.A. , California USA.
Científico Titular, 1981,
Jefe de Grupo CIB, 1984
Investigador Científico, 2006.
CIB, CSIC.
Proliferación Celular y Desarrollo | Cell Proliferation & Development
Biología Molecular de la Gametogénesis
El complejo control de la diferenciación celular
terminal para generar gametos esta mediado por
regulación de la expresión génica que interacciona
con múltiples factores endocrinos paracrinos y
autocrinos.
E
n mamíferos, la diferenciación de
las células germinales se inicia en
el periodo fetal, prosiguiendo en
diversas etapas de la vida postnatal. Ello
requiere un alto nivel de coordinación
celular y molecular, regulada por expresión
génica diferencial. Nuestro grupo estudia
el papel y regulación de genes implicados
tanto en la gametogenesis en ambos sexos
y su contribución al desarrollo cigótico
preimplantacional y como su desregulación
puede ser potencialmente responsable de
alteraciones en la fertilidad. En este sentido,
una de nuestras líneas de trabajo pretende
identificar mecanismos de acción a nivel
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
E. González-González, P. P. López-Casas and J. del Mazo “The
expression patterns of genes involved in the RNAi pathways
are tissue-dependent and differ in the germ and somatic cells
of mouse testis” Biochim. Biophys. Acta - Gene Reg. Mech.
1779/5:306-311 (2008).
E. González-González, P. P. López-Casas and J. del Mazo “Gene
silencing by RNAi in mouse Sertoli cells”. Reprod. Biol. Endoc.
6:29 (BioMed Central) doi:10.1186/1477-7827-6-29 (2008). http://
www.rbej.com/content/6/1/29.
A.M. Mejía-Jaramillo, S. Arboleda-Sánchez, I.B. Rodríguez, C.
Cura, A. Salazar, J. del Mazo, O. Triana-Chávez, A.G. Schijman
“Geographical clustering of Trypanosoma cruzi I groups from
Colombia revealed by low-stringency single specific primer-PCR
of the intergenic regions of spliced-leader genes”. Paras. Res.
104:399-410 (2009).
E. Bonilla and J. del Mazo “Deregulation of Sod1 and Nd1 genes
in mouse fetal oocytes exposed to Mono (2-ethylhexyl) Phthalate
(MEHP)”. Reprod. Toxicol. 30/3: 387-392 (2010).
136
Nuestro laboratorio está enfocado en la caracterización
de mecanismos moleculares que, a través de expresión
génica, tanto de mRNAs como sRNAs (small RNAs),
controlan la diferenciación y desarrollo de ovocitos y
espermatozoides y primeras etapas postzigóticas.
génico, epigenético y celular de compuestos estudiando el efecto de diversos compuestos
contaminantes ambientales capaces de reprotóxicos en relación con su nivel o
inducir disfunciones reproductivas. Usando periodo de exposición durante el desarrollo;
ratón como modelo experimental y diversos tanto durante la gametogenesis de los
abordajes como microarrays de DNA de individuos directamente expuestos como su
alta densidad, secuenciación masiva de posible efecto transgeneracional asociado a
RNAs, análisis celular o mediante modelos mecanismos epigenéticos.
de ratones mutantes nulos para genes de Nuestro grupo está prestando especial
expresión especifica estudiamos regulaciones interés a la biogénesis y el papel funcional de
génicas funcionales y redes de interacción RNAs no codificantes de pequeño tamaño,
génica o proteica en distintos tipos celulares específicamente a microRNAs y piRNAs
gametogénicos durante el desarrollo, desde (especificos de línea germinal), actuando
células primordiales germinales (PGCs) a como reguladores postranscripcionales,
gametos maduro. Además de los patrones tanto en gametogénesis como en cigotos
normales de expresión génica, estamos preimplantacionales.
Predicción de la estructura secundaria del
precursor de un nuevo microRNA que hemos
identificado en espermatozoides de ratón.
Prediction of secondary structure of the
precursor of a new microRNA that we
identified in mouse spermatozoa.
Otros miembros | Other lab members:
Sergio Martínez Fernández
David B. Cárdenas Sanjur
Juand e Dios Hourcade Bueno
Jesús García López
Macarena Quesada
www.cib.csic.es/es/grupo.php?idgrupo=18
Molecular Biology of
Gametogenesis
The complex control of terminal cell differentiation how their deregulation can be potentially responsible for impaired
to produce gameta is mediated by mechanisms of fertility. In this sense, one of our current interest is to identify
mechanisms of action, at genetic, epigenetic and cellular level,
gene expression regulation interacting with multiple
potentially caused by environmental contaminants compounds
endocrine, paracrine and autocrine factors. able to induce reproductive disorders. Using mouse as experimental
model and various approaches such as: high-density DNA
Our laboratory focuses on the study of molecular microarrays, deep sequencing of RNAs, cell analysis or null mutant
mechanisms that, trough differential gene expression mouse models for specific genes, we are studying functional gene
regulatory expression and genetic networks during development
of both mRNAs and sRNAs (small RNAs), controling
of different gametogenic cell types from primordial germ cells
the development of oocytes, spermatozoa and early (PGCs) to mature gametes. In addition to the normal patterns of
postzygotic stages. gene expression, we are studying the effects of various compounds
considered as reprotoxicants in relation to their level or period of
exposure during development, both during the gametogenesis of
individuals directly exposed as possible transgenerational effects
I
n mammals, differentiation of germ cells starts in the fetal period, associated with epigenetic mechanisms.
progressing in various stages of postnatal life. This requires a Our group is particularly focussed on the study of biogenesis
high level of molecular and cellular coordination, regulated and functional role of noncoding small RNAs, specifically
by differential gene expression. Our group studies the role and microRNAs and piRNAs (germline specific) and their action as
regulation of genes involved in gametogenesis in both sexes and post-transcriptional regulators, both in gametogenesis and in
their contribution to zygotic preimplantation development and preimplantation zygotes.
Localizacion de la proteina Tudor-SN
Premio
(que interactua con miRNAs)
(fluorescencia verde) en cigoto en
Award
divisón. Inmunofluorescencia y
microscopia confocal. Cromatina teñida
en azul con Hoechst 33258. En Marzo de 2009 Jesús del Mazo fué
nombrado por la Comisión Europea miembro
Location of Tudor-SN protein (interacting
with miRNAs) (green fluorescence) in del panel “Scientific Advisors on Risk Assesment
dividing zygote. Immunofluorescence by and Public Health”
confocal microscopy. Chromatin stained (Commission Decision 2008/721/EC).
in blue by Hoechst 33258.
137

Patricia Boya
grupo emergente
Científica Titular | pboya@cib.csic.es
PhD, 2000.
Universidad de Navarra.
Postdoctoral, 2001-2004.
CNRS, París, Francia.
Postdoctoral, 2005.
University of Cambridge, UK.
Contrato Ramón y Cajal, 2005-2009,
Científica Titular, 2009.
CIB, CSIC.
Otros miembros | Other lab members:
Proliferación Celular y Desarrollo | Cell Proliferation & Development
Natalia Rodríguez-Muela Lorena Esteban Martínez Lucía García Ledo
Enrique Iglesias Jareño Ester Seco Martín
www.cib.csic.es/en/grupo.php?idgrupo=73
Autofagia en Desarrollo y en
Fisiopatología
En nuestro laboratorio utilizamos modelos celulares y
animales para comprender el papel de la autofagia en
la fisiología y la patología de los organismos.
L
a autofagia es un proceso de degradación intracelular que
permite el reciclaje de componentes celulares en situaciones
de estrés. Nuestro interés se centra en estudiar la autofagia
durante el desarrollo y comprender su implicación en procesos
esenciales como la proliferación, diferenciación y la muerte celular.
Por otro lado queremos entender cómo defectos en autofagia
pueden estar implicados en situaciones patológicas como el cáncer
y las enfermedades neurodegenerativas. Hemos demostrado que la
inducción de autofagia ejerce un papel citoprotector en modelos
animales de nuerodegeneración y que es esencial para el efecto
antitumoral de agentes quimioterápicos. Además y en colaboración
con varias compañías farmacéuticas estamos testando nuevos
compuestos moduladores de la autofagia que puedan ser utilizados
como nuevas terapias para enfermedades humanas.
NEW group
Tinción para autofagosomas con GFP-LC3 (verde) retículo endoplásmico con PDI (rojo) y
núcleos con DAPI (azul) en condiciones basales y de inducción de autofagia.
Cells stained for autophagosomes with GFP-LC3 (green), endoplasmatic reticulum with
PDI (red) and nuclear staining with DAaPI (blue) under control conditions and after
autophagy induction.
138
Autophagy in
pCELL
&
roliferación
celular
Development and Disease
prolifDevelopment
desarrollo
eración
Our lab uses cellular and animal models to
understand the physiological roles of autophagy
and its implications during disease.
A
utophagy is an essential intracelullar degradation
pathway that recycles cell components to maintain
cellular homeostasis under stress conditions. 
We are
interested in the implication of autophagy during development
and in the relationship of autophagy with basic processes such
as proliferation, differentiation and cell death.
Moreover we want to understand how autophagy deregulation
may play a role in several pathological situations such as cancer
and neurodegenerative conditions. We have demonstrated that
autophagy plays a cytoprotective role during neurodegeneration
and that is essential for antitumoral action. In addtion we have
several projects with pharmaceutical companies to screen for
new drugs that modulate autophagy with the aim to find new
treatments for human diseases.
Publicaciones Seleccionadas
Selected Publications
Dehay B, Bové J, Rodríguez-Muela N, Perier C, Recasens A, Boya P*, Vila
M*. Pathogenic lysosomal depletion in Parkinson’s disease. J Neurosci.
2010;30(37):12535-44.
Mauvezin C, Orpinell M, Francis VA, Mansilla F, Jordi Duran J, Boya P, Ribas V,
Palacín M, Teleman AA, Zorzano A The nuclear cofactor DOR regulates autophagy
in mammalian and Drosophila cells. EMBO Rep. 2010;11(1):37-44.
Valero RA, Oeste CL, Stamatakis K, Ramos I, Herrera M, Boya P, Pérez-Sala D.
Structural determinants allowing endolysosomal sorting and degradation of
endosomal GTPases. Traffic. 2010 Sep;11(9):1221-33.
Aguado C, Sarkar S, Korolchuk VI, Criado O, Vernia S, Boya P, Sanz P, de Córdoba SR,
Knecht E, Rubinsztein DC. Laforin, the most common protein mutated in Lafora
disease, regulates autophagy. Hum Mol Genet 2010;19: 2867-76.
Fuster JJ, González JM, Edo MD, Viana R, Boya P, Cervera J, Verges M, Rivera J,
AndrésV. The tumor suppressor p27Kip1 undergoes endo-lysosomal degradation
through its interaction with sorting nexin 6. FASEB J. 2010 24(8):2998-3009.
Pérez-Sala D*, Boya P*, Ramos I, Herrera M, Stamatakis K. The C-terminal Sequence
of RhoB Directs Protein Degradation through an Endo-lysosomal Pathway. PLoS
One. 2009;4(12):e8117.
Mellén MA, de la Rosa EJ, Boya P. Autophagy is not universally required for
phosphatidyl-serine exposure and apoptotic cell engulfment during neural
development. Autophagy. 2009:18;5(7).
Salazar M, Carracedo A, Salanueva IJ, Hernández-Tiedra S, Lorente M, Egia A,
Vázquez P, Blázquez C, Torres S, García S, Nowak J, Fimia GM, Piacentini M,
Cecconi F, Pandolfi PP, González-Feria L, Iovanna JL, Guzmán M, Boya P, Velasco G.
Cannabinoid action induces autophagy mediated cell death through stimulation
of ER stress in human glioma cells. J Clin Invest. 2009;119(5):1359-72.
Mellén MA, de la Rosa EJ, Boya P. The autophagic machinery is necessary for
removal of cell corpses from the developing retinal neuroepithelium. Cell Death
Differ. 2008;15(8):1279-90.
139
 Servicios Científicos
Scientific Facilities
Servicios Científicos | Scientific Facilities

Animalario | Animal Facility 140

Biblioteca | Library 140
Citometría de Flujo | Flow Cytometry 141
Cromatografía de Gases | Gas Chromatography 142
Esterilización y Cocina de Medios | Sterilization & Culture Media Preparation 142
Cultivo de Células | Cell Culture 143
Microscopía Electrónica | Electron Microscopy 143
Microscopía Láser Confocal y Multidimensional in vivo 144
Confocal and in vivo Multidimensional Microscopy

Protección Radiológica | Radiation Safety 145

Ultracentrifugación Analítica e Interacciones Macromoleculares en Disolución 146
Analytical Ultracentrifugation and Macromolecular Interaction in Solution

Química de Proteínas | Protein Chemistry 146

Proteómica y Genómica | Proteomics and Genomics 147
Secuenciación de DNA proporcionada por SECUGEN | DNA Sequencing provided by SECUGEN 161

140
 Responsable Científico | Head Scientist: Otros miembros | Other unit members:
Dr. Jesús del Mazo Martínez Jorge Huertas Latorre
María Herrera Hernández
Responsable Técnico | Head Technician: Esther López Mimbela
Manuel Moreno Calle Esther Sánchez Jiménez
Daniel del Olmo Fernández
Isabel González Fernández
Marta Cereceda Díaz
Andrés Rodríguez Moreno
Responsable Científico | Head Scientist:
Dr. Pedro Lastres Varo
Responsable Técnico | Head Technician:
Amadeo Cañaza Soto

Animalario | Animal Facility Citometría de Flujo | Flow Cytometry

C onsta de 3 áreas: zona de barrera
(SPF), zona de investigación y zona de
cuarentena dedicadas a la producción y el
mantenimiento de animales de laboratorio,
siguiendo procedimientos acordes a
regulaciones española y comunitaria. En ellas,
además del mantenimiento de las diferentes
cepas de ratón, el personal especializado
del Servicio participa en procedimientos
de inoculación, extracción de fluidos y
toma de muestras. Paralelamente se llevan
a cabo rederivación de líneas mediante
transferencia de embriones, criopreservación
de embriones y producción de anticuerpos
policlonales y monoclonales. Se han
Servicios Científicos | Scientific Facilities

iniciado técnicas de fecundación in vitro y

criopreservación de esperma de ratón.

I t consists of 3 areas: specified-pathogen free (SPF), an area of research and quarantine com-

E T
mitted to laboratory animal husbandry and breeding, following Spanish and EU regulations. In l servicio de citometría de flujo fue creado en 1988 como
addition to keeping the different mouse strains the qualified staff is involved in inoculation proce- instrumento de apoyo a la comunidad científica en el campo de
dures, fluid removal and sampling. In parallel, staff carries out embryo transfer rederivation, embryo la biología celular. Actualmente el servicio está equipado con dos
cryopreservation and production of both polyclonal and monoclonal antibodies. In vitro fertilization analizadores, modelos EPIC XL y FC500 y un cell sorter modelo FACS
techniques and cryopreservation of mouse sperm have also been recently implemented. Vantage, además de medios para el manejo de muestras y el análisis
de resultados (microscopio de epifluorescencia, de contrate de fases,
campana de flujo laminar, sofware de análisis, etc.). Las aplicaciones
más frecuentes que se llevan a acabo son:
• Inmunofenotipaje celular.
• Estudios de viabilidad celular.
• Análisis del potencial de membrana mitocondrial.
• Análisis del ciclo celular.
• Señalización celular.
• Detección de especies reactivas del oxígeno (ROS).
• Estudios de pH intracelular y flujos de Ca .
2+
• Separación celular en las aplicaciones descritas anteriormente.
he flow cytometry service started in 1988 aimed to support the
needs of the scientific community in the field of cellular biology.
Presently, the service is equipped with two analysers, EPICS XL and
FC500 and a FACS Vantage cell sorter, as well as complementary
facilities for samples and results management (epifluorescence and
phase contrast microscopes, tissue culture hood, analytical software,
etc). The most frequent applications carried out are:
• Cellular immunophenotyping.
• Cell viability studies.
• Analysis of mitochondrial membrane potential.
• Cell cycle analysis.
• Cellular signaling.
• Detection of reactive oxygen species (ROS).
• Monitoring of intracellular Ca2+ fluxes.
• Cell sorting in the applications described above.

Biblioteca | Library
Responsable Científico | Head Scientist:
Pilar Sánchez Testillano
Responsable Técnico | Head Technician:
Olvido Partearroyo Lacaba
Otros miembros | Other unit members:
Nieves Fonturbel Cabañas
Angeles Sacristán Martín
Victoria Ortiz Rodríguez
Milagros Rodríguez Bueno
Miguel Soto Estébanez
Mª Jesús Garabito Seco
L a Biblioteca y Servicio de Documentación del CIB sigue siendo una referencia en el área
de Biología y Biomedicina en España por la calidad y extensión de su fondo bibliográfico
(10.870 libros, 1.364 revistas). Pertenece a la red de Bibliotecas del CSIC y a su catálogo: http://
• Búsquedas bibliográficas, bibliométricas y
documentales. T he Library and Documentation Service
of CIB continues to be a reference in the
area of Biology and Biomedicine in Spain for
of their current and historical collections,
providing different services:
• Apoyo al repositorio institucional, Digital. Consultation and literature reading room (25
aleph.csic.es/F?func=file&file_name=find-b. Su actividad se centra prioritariamente en el CSIC. the quality and extension of their collections seats, wi-fi).
apoyo a la investigación en el CIB, así como en la gestión, mantenimiento y difusión de una and archive (10.870 books, 1.364 journals). It
• Puesta en valor del Legado Bibliográfico Access to e-resources within and off-campus
gran colección de fondos actuales e históricos, proporcionando diferentes servicios: belongs to the CSIC Libraries Network and
del Prof. Gregorio Marañón: digitalización, (PAPI).
• Consultas bibliográficas y lectura en sala (25 puestos, wi-fi). catalog: http://aleph.csic.es/F?func=file&file_
reencuadernación, consulta bajo Management of the acquisition,
name=find-b
• Acceso a recursos-e dentro y fuera del campus (PAPI). autorización, préstamo de originales para classification, cataloguing, lending books and
Its activity is mainly focused to support
• Gestión de adquisición, clasificación, catalogación, préstamo de libros y revistas (papel, exposiciones. journals (print, electronic) interlibrary loan,
the research in the CIB, as well as to the
electrónicos) e interbibliotecario, preservación de fondos. • Reprografía y encuadernación. preservation of funds.
management, maintenance and diffusion
• Literature searches, bibliometric and
documentaries.
• Support to the institutional repository,
Digital.CSIC.
• Adding value to the Legacy of Prof. Gregorio
Marañón: digitization, rebinding, policy
consultation with permission, loan of original
books and documents for exhibitions.
• Copying and binding.

142 143
 Responsable Científico | Head Scientist:
Dra. Alica Prieto Orzanco
Cromatografía de gases | Gas Chromatography
E l Servicio de Cromatografía atiende las demandas de usuarios internos y externos
para la separación, identificación y cuantificación de compuestos orgánicos en
mezclas complejas por GC y GC-MS. Se ofrece al investigador un apoyo integral, lo que
incluye asesoramiento sobre la manipulación y preparación de muestras, generación
de métodos de análisis y soporte para la interpretación de los resultados.
Servicios Científicos | Scientific Facilities
El servicio dispone de:
• Cromatógrafo de gases 7890A (Agilent) con detector FID, inyector automático Split/
Splitless y automuestreador para 150 viales.
• Cromatografo de gases 7890A acoplado a detector de masas cuadrupolar MSD
5975C (Agilent) con inyector Split/Splitless e ionización por impacto electrónico.
Esterilización y Cocina de Medios | Sterilization & Culture Media Preparation
Responsable Científico | Head Scientist:
Dr. Eduardo Díaz Fernández
Responsable Técnico | Head Technician:
Mª Rosa Díaz López Gabino García Amaya
144
Otros miembros | Other unit members:
Rafael Benítez Serrano
Ramón García Hernández
Mónica Gómez Patiño
T
he Gas Chromatography facility fulfils
the needs of CIB and external users for
separation, identification and quantification of
volatile analytes. We try to give total support
to researchers to carry on these analyses, even
setting up new protocols on users demand.
Our facility is equipped with: 
• Gas chromatograph 7890A (Agilent) equipped
with a flame ionisation detector Split/Splitless
injector and autosampler.
• Gas chromatography-mass spectrometry
system (GC-MS) 7890A-5975C (Agilent) Split/
Splitless injector and electron impact ionization.
E l Servicio de Esterilización del CIB es el encargado de esterilizar,
mediante calor seco (160ºC/230ºC) o húmedo (120ºC/110ºC),
el material de trabajo o de desecho (residuos biológicos o de otro
tipo), de los distintos grupos de investigación. Para ello dispone de
dos hornos (Memmert), dos autoclaves 490 L y dos autoclaves 165 L
(Matachana).
El servicio de Cocina de Medios está asociado al servicio de
Esterilización y cuenta con todo el equipamiento necesario para la
preparación y almacenamiento de medios de cultivo, tampones y
soluciones estériles, incluyendo soluciones libres de RNasas para el
trabajo con RNA.
T he Sterilization Service of the CIB is devoted to sterilize,
through dry (160ºC/230ºC) or wet heat (120ºC/110ºC), the
working material and wastes (biological residues, etc.) of the
different research groups. The Sterilization Service has two ovens
(Memmert), two autoclaves 490 L and two autoclaves 165 L
(Matachana).
The Culture Media Preparation Service is associated to the
Sterilization Service and it has all the necessary equipment for
preparation and storage of culture media, buffers, and sterile
solutions, including RNase-free solutions for working with RNA.
Responsable Técnico | Head Technician:
Dra. Blanca T. Pérez Maceda
Otros miembros | Other lab members:
Virginia Quesada Guerrero
Cultivo de Células
Cell Culture
E l Servicio de Cultivo de Células Animales del CIB es un servicio
que proporciona apoyo científico-técnico en cultivo de células
humanas y animales tanto a usuarios del CIB como a usuarios externos.
En el servicio se llevan a cabo las siguientes actividades:
• Banco de células animales y humanas, que se encuentran a
disposición de la comunidad científica, pudiendo ser solicitadas al
servicio cuando se precisen.
• Detección de micoplasmas en líneas celulares y medios de cultivo,
mediante tinción DNA-Hoescht utilizando la línea celular Vero
como indicadora (Figura A y B).
• Eliminación de micoplasmas de cultivos contaminados.
• Selección de Suero Fetal Bovino por un período entre 18–24 meses
para la reserva general del CIB.
A) Control negativo tinción micoplasmas. Se observan sólo los núcleos
teñidos de las cétlulas Vero.
A) Vero cells mycoplasma free. Negative control.
B) Detección de micoplasmas en sobrenadante contaminado utilizando la línea
Vero como célula indicadora.
B) Mycoplasma positive Vero cells..
T he Animal Cell Culture facility of the CIB is a scientific and
technical support in human and animal cell culture for CIB and
external users. This laboratory offers the following activities:
• The human and animal cell Bank: this human and animal cell
collection has been established to make the cells available to the
scientific community.
• Mycoplasma testing: Cell lines and culture media can be tested for
mycoplasma contamination by Hoescht-DNA stain using Vero cells
as indicators (Figure A and B).
• Mycoplasma elimination from contaminated cell lines.
• Fetal Bovine Serum Selection: the laboratory selects general batch/
batches of FBS for the research community of CIB and for a period
of 12-24 months.
Responsable Científico | Head Scientist:
Prof. Óscar Llorca
Responsable Técnico | Head Technician:
José Fernando Escolar Antunez
Otros miembros | Other lab members:
María Amparo Cerrajero Hernández
Microscopía Electrónica
Electron Microscopy
E l servicio de microscopía electrónica (SME) proporciona apoyo
científico-técnico a los grupos de investigación mediante
métodos de análisis ultraestructural, inmuno-detección y crio-
microscopía. El SME está equipado con un microscopio electrónico
de transmisión JEOL JEM-1230 con capacidad de operar a 120 Kv.
Se dispone de una cámara CCD GATAN Bioscan 702, un crio-brazo
y sistema de anticontaminación de GATAN, así como un sistema de
preparación de crio-muestras de GATAN (“Cryoplunge”). Además
disponemos de un sistema de crio-sustitución Reichert AFS, un
ultra-microtomo Reichert, un ultra-microtomo LKB, un vaporizador
Polaron Turbo y un laboratorio fotográfico. Recientemente, el
SME ha adquirido una cámara digital CMOS, TemCam-F416 TVIPS,
de 16 MegaPixel. Durante estos dos años (2009-2010) más de 20
grupos del CIB han utilizado el SME, así como usuarios de otras
instituciones (CNIO, CNIC, Universidad Complutense), alcanzándose
1141 horas de observación.
T he Electron Microscopy Facility (EMF) at the CIB provides
scientific and technical support to research groups applying
methods of ultra-structural analysis, immune-detection and cryo-
electron microscopy. The EMF is equipped with a JEOL transmission
electron microscope JEM-1230 with capacity to operate at 120 kV.
The facility has a GATAN Bioscan CCD camera, a GATAN cryo-holder
and anti-contamination device, as well as a GATAN system for cryo-
sample preparation (“Cryoplunge”). In addition, the EMF has an AFS,
a Reichert ultra-microtome, a LKB ultra-microtome, and a Polaron
Turbo vaporizer. Recently, the EMF has purchased a digital camera
CMOS TVIPS TemCam-F416, 16 mega pixels. During these two years
(2009-2010) the EM facility has been used by more than 20 groups
of the CIB, as well as by groups from other institutions (CNIO, CNIC,
Complutense University), reaching 1141 hours of observation.
Campo de una micrografía correspondiente a complejos
liposomas-ADN observados mediante crio-microscopía
electrónica a temperatura de nitrógeno líquido, en
colaboración con el grupo de Elena Junquera y Emilio
Aicart (Universidad Complutense de Madrid).
Field of a micrograph corresponding to liposome-DNA
complexes observed using cryo-electron microscopy at
liquid nitrogen temperatures, in collaboration with the
group of Elena Junquera and Emilio Aicart (Complutense
university of Madrid).
145
 Responsable Científico | Head Scientist:
Prof. Mª del Carmen Risueño Almeida
Responsable Técnico | Head Technician:
Mª Teresa Seisdedos Domínguez
Microscopía Confocal y Multidimensional in vivo
Confocal and in vivo Multidimensional Microscopy
M icroscopio Laser Confocal espectral (CLSM) Leica TCS SP5
equipado con 8 líneas de láser, AOTF, AOBS y sistema de barrido
en tándem: convencional y resonante de utilización alternativa,
generando posibilidad de trabajo a alta resolución o alta velocidad lo
cual disminuye la fototoxicidad y por tanto el daño biológico, siendo
muy adecuado para material in vivo.
• CLSM Leica TCS SP2 equipado con 9 líneas de láser y sistemas AOTF
y AOBS. Facilidad de observación para UV y amplio rango GFPs,
realización de FRET, FRAP y otros análisis dinámicos.
• CLSM BioRad MCR 1024 sobre MO Axiovert 135 Zeiss.
• Cámara CCD Leica DFC350 FX sobre MO Zeiss Axioplan
• Sistema multidimensional de microscopía avanzada de fluorescencia
Servicios Científicos | Scientific Facilities
de alta velocidad para observación in vivo Leica AF6000 LX. Equipado
con microscopio invertido DMI6000B con cámara de cultivo
termostatizada, control de CO2 y cámara CCD Hamamatsu 9100-O2
EM-CCD de alta sensibilidad y alta velocidad, (hasta 30 imágenes por
segundo). Adquisición de imágenes multidimensionales en XY, Z, T,
multiposicionamiento y generación de imágenes compuestas. FRET
y estudios ratiométricos de calcio in vivo y otros estudios dinámicos.
Deconvolución y generación de imágenes 3D.
Todo ello nos ha permitido aportar resultados a 46 grupos de
investigación del CIB y 9 grupos de otros Centros Públicos de
Investigación.
Las horas utilizadas por los usuarios son: en el caso de los equipos
confocal 3700 h, en el equipo de de microscopía multidimensional
2000 h y en el microscopio de epifluorescencia con cámara CCD
alrededor de 1000 h. Se ha intentado mantener un bajo coste de
tarifas para lo cual se ha establecido un sistema de adquisición y pago
por bloques de horas.
El Servicio mantiene un stock bastante amplio de fluorocromos que
adquiere sobre la base de las necesidades de los usuarios y facilita
alícuotas a bajo costo. El número de alícuotas proporcionadas por
este servicio ha sobrepasado el centenar. Estas facilidades están
destinadas a generar fondos destinados a la autofinanciación.
El Servicio ha colaborado en la formación de personal técnico
especializado en mantenimiento, manejo de los equipos y
programas de análisis de imagen, en diversos cursos de doctorado
y de especialización, y muy especialmente en la organización de
actividades para acercamiento a las múltiples posibilidades de estas
técnicas de biología analítica. En 2009-10 se ha colaborado con el
departamento de formación del CSIC con la impartición del curso
“Microscopía Confocal : Fundamentos y aplicaciones” en 3 ediciones.
146
Otros miembros | Other unit members:
Fernando González Camacho
Oscar Hidalgo Blanco
Roberto Encinar Calvo
Begoña Pou Alonso
C onfocal Laser Scanning Microscope (CLSM) LEICA TCS SP5 fitted
with eight excitation lines, AOTF and AOBS System Tandem-
scanning system SP5 II standard and resonant scanner, which reduces
the phototoxicity and therefore the damage of the biological material
being very convenient for in vivo samples.
• Leica CLSM TCS SP2 with 9 laser lines and AOTF and AOBS systems
(for UV emission and wide range of GFPs observation, FRET, FRAP
and other dynamic analysis).
• BioRad CLSM MCR 1024 on an inverted LM Zeiss Axiovert 135.
• Leica CCD camera DFC350 FX on a LM Zeiss Axioplan.
• Widefield Multidimensional Microscopy System advanced in
fluorescence and transmitted light Leica AF6000 LX for live cell
imaging. It is equipped with inverted microscope DMI6000B an
incubation camera with CO2 and temperature controlled. High
resolution and ultrafast Hamamatsu 9100-02 EM CCD camera
(until 30 images per second), controlled by hardware and software
for multiple acquisition XY, Z, T, juxtaposition experiments and
generation of composite overview images. FRET and ratio metrics
calcium in vivo and other dynamic studies. Deconvolution analysis
and creation of 3D images.
The service is used by 46 research groups of the CIB and 9 from other
institutes.
The confocal microscopes have been used for 3000 hours, the
Widefield Microscopy System has been used 2000 hours and the
epifluorescence microscope equipped with a CCD camera for 1000
hours. A low-cost fee system has been established by pre-paid blocks
of a limited number of hours.
The service keeps a wide range stock of fluorochromes to cover
the needs of the users at a low-cost aliquots basis. Over a hundred
aliquots were sold. The revenue obtained by the use of these facilities
is aimed to self-funding.
The service has contributed to the training of technicians for the
maintenance and handling of the equipments and the use of image
analysis software packages. Also contributes to the organisation of
courses for PhD students and specialists and lectures to promote the
techniques of analytical biology. In the years 2009-10, we colaborated
with the training department of the CSIC in the course “Confocal
Microscopy : Fundamentals and applications” in three editions.
Patrón de distribución nuclear de la
metilación del DNA genómico en embrión
de polen de colza. 5-metil-citosina (5mdC) en
verde y núcleos (DAPI) en azul; DIC: imagen
por contraste interferencial.
Nuclear distribution pattern of genomic DNA
methylation in pollen embryo of rapeseed.
5-mtheyl-citosine (5mdC) in green and nuclei
(DAPI) in blue; DIC: diferencial interference
contrast.
Estudio de la dinámica de las adhesiones focales en células de melanoma humano
mediante FRAP. Células control y RIAM Knock-Down (KD) fueron trasnfectadas con
un vector para la expresión de Paxilina en Rojo. Coló G. y Teixidó J.
FRAP analysis of focal adhesion turnover in human melanoma cells. Mock and RIAM
KD cells were transfected with paxillin-DsRed2 and subjected to FRAP analyses targeting
peripheral focal adhesions (green squares). Coló G.and Teixidó J.
Inmunofluorescencia de células de melanoma MV3 mediante IRM (Interference of
the reflection microscopy): Las adhesiones focales de células MV3 fueron marcadas
con anticuerpos anti-paxilina (rojo). El plano focal fue seleccionado por reflexión. Se
muestran las fibras de estrés (faloidina, verde) y el núcleo (DAPI, azul). Hernandez-
Vara P y Teixidó J.
MV3 melanoma cells Immunofluorescence by Interference of the reflection
microscopy (IRM): MV3 cells focal adhesions were stained using anti-paxillin antibodies.
The focal plan was selected using reflection.Stress fibres (phalloidin, green) and the
nucleus (DAPI, blue) are also shown. Hernandez-Vara P and Teixidó J.
Responsable Científico | Head Scientist:
Dra. Marta Cebrián Echarri
Responsable Técnico | Head Technician:
Mª del Carmen Doñoro Vázquez
Servicio de Protección
Radiológica (SPR)
Radiation Safety (RS)
E l SPR controla la entrada y utilización de material
radiactivo en el Centro, las zonas autorizadas para su
manipulación, los aparatos generadores de radiaciones
ionizantes, la gestión de los residuos radiactivos, la formación
del personal usuario y el cumplimiento de las normas
exigidas por el Consejo de Seguridad Nuclear (CSN).
La instalación radiactiva consta de una cámara caliente con
zonas para el trabajo con isótopos emisores de radiación
ß y Υ, zona de cultivos celulares y zona de electroforésis;
laboratorios autorizados para la manipulación de cantidades
limitadas de compuestos marcados radiactivamente; equipo
generador de Rayos X; difractor de Rayos X y contadores
de centelleo. Se pueden realizar técnicas con compuestos
marcados con los siguientes radioisótopos: 14C, 3H, 33P, 45Ca, 35S,
P, I, Cr, 86Rb y Sales de uranilo.
32 125 51
Las normas de utilización del SPR están recogidas en el
Manual de Protección Radiológica del CIB. La gestión del SPR
es evaluada anualmente por el Consejo de Seguridad Nuclear.
T he RSS controls the entry and disposal of radioactive
isotopes in the CIB, their manipulation in the authorized
areas, the use of X-ray equipment and disposal of radioactive
waste. The RSS performs all radiological safety measurements.
The RSS also trains new users in radiological protection
protocols and on the implementation of the regulations of
the Spanish Nuclear Council (CSN).
The radioactive facility consist of a central hot room with
specific areas to manipulation of ß and Υ radioisotopes,
cellular cultures and electrophoresis area; authorized
areas in ordinary laboratories to use limited activities of
radioactive isotopes; X-Ray equipment ; X-Ray difractometer
and scintillation counters. It is possible to realize techniques
with 14C, 3H, 33P, 45Ca, 35S, 32P, 125I, 51Cr, 86Rb and 235U-labeled
radiochemicals.
There is a comprehensive Radiological Protection Guide
for users of the CIB. Once a year the CSN supervises the RS
management.
147
 Responsable Científico | Head Scientist:
Dr. German Rivas Caballero
Dr. Carlos Alfonso Botello (Julio 2010)
Ultracentrifugación Analítica e Interacciones Macromoleculares en Disolución
Servicios Científicos | Scientific Facilities
Analytical Ultracentrifugation and Macromolecular Interaction in Solution
Responsable Científico | Head Scientist:
Prof. Guillermo Giménez Gallego
Responsable Técnico | Head Technician:
Javier Varela Espinosa
Química de Proteínas | Protein Chemistry
E l servicio de Química de Proteínas tiene
como función principal prestar apoyo
científico y técnico a todos los laboratorios
de investigación que lo soliciten, tanto
.
de carácter público como privado, en la
purificación, cuantificación, identificación y
caracterización de proteínas. Cuenta son el
siguiente equipamiento:
Dos secuenciadores de proteínas (Applied
Biosystems, Procise 494). Permiten
establecer la secuencia amino terminal de
148
Responsable Técnico | Head Technician:
David González López
Otros miembros | Other unit members:
Emilia Aporta Sosa
Beatriz Piñeiro Garrido
Guaditoca Cháves Aguión
péptidos y proteínas mediante degradación
secuencial de Edman.
Sintetizador de péptidos (AAPPtec, Focus
XC). Trabaja con química Fmoc y puede
realizar hasta 6 síntesis simultáneamente en
un rango de escalas variable entre 0.05-5
mmoles.
Sintetizador de oligonucleótidos (Applied
Biosystems 3400).
Analizador de aminoácidos (Biochrom 30).
Permite determinar cuantitativamente la
Otros miembros | Other unit members:
Juan Román Luque Ortega
Noelia Ropero
composición de aminoácidos de hidrolizados
de péptidos y proteínas.
Cromatógrafos de líquidos. Equipo de alta
presión (0-25 MPa) HPLC (ÄKTA, Amersham
Pharmacia Biotech), equipo de media presión
(0-5 MPa) FPLC (Pharmacia) y equipo de baja
presión (0-1 MPa), (ÄKTA prime, Amersham
Pharmacia Biotech).
LC-MS. HPLC (Surveyor Plus) acoplado a un
espectrómetro de masas de trampa de iones
(Thermo Scientific).
Responsable Científico | Head Scientist: Otros miembros | Other unit members:
N
uestro laboratorio está Dr. José Ignacio Casal Álvarez Vivian de los Ríos
especializado en la caracterización Francisco García Tabares
biofísica cuantitativa de interacciones Maria Iluminada Fernandez
macromoleculares reversibles en disolución. Tamar San Hipolito Marín
Para su estudio contamos con dos
ultracentrífugas analíticas y equipos de
dispersión de luz estática y dinámica.
La ultracentrifugación analítica es
especialmente útil para la detección
y cuantificación de especies
macromoleculares, así como para el análisis
cuantitativo (estequiometría, afinidad,
reversibilidad) de interacciones que
conducen a la formación de complejos
del tipo proteína-proteína, proteína-DNA y
receptor-ligando. Los nuevos métodos de
dispersión de luz, con una adquisición de
datos muy rápida, permiten caracterizar las
Proteómica y Genómica
interacciones reversibles en el equilibrio, así Proteomics and Genomics
como ver su evolución a lo largo del tiempo.
E
Certificación ISO 9001 desde Marzo de 2009. l servicio de Proteómica y Genómica del CIB ofrece los siguientes servicios básicos.
En el área de genómica: i) Determinación de calidad de muestras de RNA y/o DNA
(sistema Experion (Bio-Rad), ii) PCR cuantitativa (iQ5, Bio-Rad) y iii) sistema de impresión
O ur group is specialized in
the quantitative biophysical
characterization of reversible
y análisis de chips de DNA y proteínas (Bio-Rad). En proteómica: i) geles bidimensionales
en diferentes tamaños y con diferentes tinciones (Bio-Rad), ii) determinación de masa
molecular de péptidos y proteínas y iii) identificación de proteínas por determinación de
macromolecular interactions in solution.
huella peptídica y secuenciación por espectrometría de masas MALDI-TOF-TOF (Autoflex
For that purpose our facility operates two
III. Bruker). In 2010, el servicio incorporó un espectrómetro de masas/masas LTQ Velos-
analytical ultracentrifuges and static and
Orbitrap (Thermo) acoplado a un equipo nano-HPLC (Proxeon) dotado con una fuente
dynamic light scattering.
de nano-electrospray para la realización de proteómica cuantitativa e identificación
Analytical ultracentrifugation is a powerful de modificaciones post-transduccionales en proteínas. La unidad es miembro de la
method for macromolecular species plataforma Proteored (Instituto de Salud Carlos III).
detection and quantification, as well as the
quantitative analysis (stoichiometry, affinity,
reversibility) of interactions leading to the
formation of macromolecular complexes,
T he genomics and Proteomics Service at the CIB offers the following basic services.
In the Genomics area: i) Determination of RNA and DNA sample quality (Experion
system. Bio-Rad), ii) Quantitative PCR (iQ5, Bio-Rad) and iii) a system for printing and
including protein-protein, DNA-protein,
analyzing DNA and protein chips (Bio-Rad). In Proteomics: i) Two-dimensional gels in
and receptor-ligand. New light scattering
different sizes and different stainings (Bio-Rad), ii) molecular mass determination in
methods permit extremely rapid acquisition
peptides and proteins and iii) protein identification by peptide mass fingerprinting and
and may be used to characterize reversible
sequencing using MALDI-TOF-TOF spectrometry (Autoflex III. Bruker). In 2010, the facility
associations evolving with time and at
incorporated a LTQ Velos-Orbitrap (Thermo) mass spectrometer coupled to a nano-
equilibrium. ISO 9001 Certification since
HPLC (Proxeon) equipped with a nano-electrospray source for quantitative proteomics
March 2009.
and post-translational modification analysis in proteins. The unit is a member of the
proteomic platform “Proteored” (Instituto de Salud Carlos III).
T he Protein Chemistry Core Facility is a state-of-
the-art laboratory designed to aid researchers
Amino acid analizer (Biochrom 30). It determines
quantitatively the amino acid composition of peptide
in the separation, quantitation, identification and
characterization of proteins from any biological
sample using the following equipment:
and protein hydolysates.
Liquid chromatography. High pressure (0-25 MPa)
equipment HPLC (ÄKTA, Amersham Pharmacia
Two protein sequencers (Applied Biosystems, Procise Biotech), medium pressure (0-5 MPa) equipment FPLC
494). It can identify the amino terminal sequence (Pharmacia) and low pressure (0-1 MPa) equipment
of peptides and proteins by means of Edman´s (ÄKTA prime, Amersham Pharmacia Biotech).
sequential degradation. LC-MS. Surveyor plus HPLC system coupled to an LXQ
Peptide synthesizer (AAPPtec, Focus XC). It works with linear ion trap mass spectrometer (Thermo Scientific).
Fmoc chemistry and it can synthesize from one to six The LXQ is designed for drug discovery, proteomics,
peptides at a time in a scale range of 0.05-5 mmol. forensics, and a variety of industrial applications.
Oligonucleotide synthesizer (Applied Biosystems 3400).
149
 Actividades y Datos
Activities and Data
Tesis Doctorales | Ph.D. Theses 150

Bibliografía | Publications 152

Proyectos Especiales | Special Projects 155

Actividades y Datos | Activities and Data

Ciencia y Sociedad | Science and Society 156

Spin-offs | Spin-offs 160

Servicios Generales | General Facilities Personnel 162

Servicios Técnicos | Technical Services Unit 164

Organigrama | CIB Structure 166

Localización CIB | Location CIB 167

Directorio CIB | CIB Directory Encarte | Inset

148 149
148
 Tesis Doctorales | Ph.D. Theses
Oscar Bártulos Encinas. Adam Nowakowski.
“Regulación de la expresión de tirosina hidroxilasa por transcritos quimera y función de Generación de ratones transgénicos con expresión de recombinasa Cre exclusivamente
la dopamina en la cardiogénesis”. Universidad Complutense de Madrid. Marzo 2009 en megacariocitos y plaquetas. Universidad Complutense de Madrid. Abril 2010

Biología Físico-Química | Chemical and Physical Biology

Directora: Catalina Hernández Sánchez Director: Roberto Parrilla
Andrea Anedda. Alejandro Armesilla Díaz.
“Papel de la proteína desacoplante UCP2 en el estrés oxidativo provocado por la “La proteína p53 regula la proliferación, autorrenovación y diferenciación de las células
Joao P. Ribeiro. Ruth Matesanz Rodríguez. metformina en el adipocito blanco”. Universidad Complutense de Madrid. Enero, 2010. adreneurales y mesenquimales”. Universidad Complutense de Madrid. Abril, 2009.
“Studies on the Molecular Recognition of Carbohydrates by Receptor Proteins. New Optimización de la Interacción Microtúbulo-taxano: Diseño de taxanos de alta afinidad. Directora: María del Mar González-Barroso Director: Augusto Silva González
Methods and Applications of NMR”. Universidad Autónoma de Madrid. Julio 2010. Universidad Autonoma de Madrid, 2009. Ingrid Babel. Rolando Vernal Astudillo.
Director: Jesús Jiménez Barbero Director: Fernando Díaz “Uso de microarrays de proteínas para la definición de firmas moleculares de “Respuesta inmune durante la periodontitis: variabilidad de la respuesta de células
María Morando. María Ángeles Recuero Checa. autoanticuerpos en cáncer colorrectal”. Universidad Autónoma de Madrid. Octubre, dendríticas y linfocitos T frente a bacterias periodontales”. Universidad Complutense de
“Molecular Recognition of Synthetic Oligosaccharides: A 3D view by NMR and Molecular Caracterización estructural mediante microscopía electrónica del complejo Xrcc4-DNA 2010. Madrid. Enero, 2010.
Modelling”. Universidad Autónoma de Madrid. Julio 2010. Ligasa IV, implicado en reparación de roturas del DNA. Universidad Complutense de Directores: José Ignacio Casal Álvarez y Rodrigo Barderas Manchado Directores: Jose A. García-Sanz, Augusto Silva González y Mariano Sanz (Fac. Odontología,
Directores: Jesús Jiménez Barbero y F. Javier Cañada Madrid. Junio 2010. Laura Cobeño Fariñas. UCM)
María Fernández-Reyes Silvestre. Director: Oscar Llorca Identificación de la quinasa HalA y el estudio de su papel en la regulación de la Eva Díaz Guerra.
“Bases moleculares de actividad y resistencia de péptidos membrano-activos en Claudia Schaffner-Barbero. homeostasis de cationes en Aspergillus nidulans. Diciembre 2010. UCM, Facultad de “Células madre de glándula mamaria: caracterización e implicaciones en el control del
procariotas. Comparación con Leishmania como modelo procariota”. Facultad de Interacciones de la proteína de división celular FtsZ con nucleótidos e inhibidores. En Biología. tamaño del órgano”. Universidad Complutense de Madrid. Diciembre, 2010.
Ciencias Biológicas. Universidad Complutense de Madrid. Junio, 2009. busca de nuevos antibióticos. Universidad Complutense de Madrid, Diciembre 2010. Director: Miguel Angel Peñalva Director: Jose A. García-Sanz
Director: Luis I. Rivas López Director: Jose Manuel Andreu Antonio Galindo Revilla. Javier Redondo Muñoz.
Tanay M. Desa. Las proteínas con dominio Bro1 de la ruta pal: su papel en la transducción de señal de Regulación y función de la metaloproteinasa de matriz-9 (MMP-9) en la leucemia
“Thermodynamic characterization of the protein unfolded conformational ensemble”, pH en Aspergillus nidulans. Marzo, 2009, UCM, Facultad de Biología. Premio Extraordinario linfocítica crónica B y su papel en la patogénesis de la enfermedad. Universidad
Febrero 2010, University of Maryland, College Park, Maryland, EEUU. de Doctorado. Complutense de Madrid. Marzo 2010.
Director: Víctor Muñoz Director: Miguel Angel Peñalva Directora: María de los Angeles García Pardo
Actividades y Datos | Activities and Data

Biología Medioambiental | Environmental Biology Microbiología Molecular | Molecular Microbiology

Fernando Novillo Zaragoza.
“Identificación de señales que median el proceso de aclimatación y la tolerancia a la
congelación en plantas”. Universidad Complutense de Madrid. Noviembre 2009.
Director: Julio Salinas
María Morales Esteban.
“Caracterización de diferentes sitios de oxidación de sustratos en la peroxidasa versátil
de Pleurotus eryngii.” Universidad Complutense de Madrid. Marzo 2009.
Directores: Angel T. Martínez y Francisco J. Ruiz-Dueñas
Ana Isabel Cañas Portilla.
“Diseño de nuevos sistemas lacasa-mediador: empleo de mediadores de origen natural
y mejora de lacasas por evolución dirigida.” Universidad de Alcalá de Henares. Julio 2009.
Directores: Susana Camarero y Angel T. Martínez
Elvira Romero Guzmán.
“Degradación de discos compactos por un anamorfo de Bjerkandera adusta:
Caracterización bioquímica y molecular de una aril-alcohol oxidasa con nuevas
propiedades catalíticas.” Universidad Complutense de Madrid. Julio 2010.
Directora: Mª Jesús Martínez
Isabel María Manso Cobos.
“Bases moleculares de la regulación transcripcional de la ruta del ácido 3-hidroxifenilpro-
piónico en Escherichia coli”. Universidad Complutense de Madrid. Febrero 2009.
Directores: José Luis García y Beatriz Galán
Laura Isabel de Eugenio.
“Estudio bioquímico, genético y fisiológico de la degradación intracelular de
polihidroxialcanoatos en Pseudomonas putida: aplicaciones biotecnológicas”.
Universidad Complutense de Madrid. Junio, 2009.
Directores: María Auxiliadora Prieto y Pedro García
Blas Blázquez Castiñeira.
“Caracterización molecular de la degradación anaeróbica de tolueno y m-xileno en
Azoarcus sp. CIB”. Universidad Complutense de Madrid. Junio, 2009.
Directores: Eduardo Díaz y Manuel Carmona
Gonzalo Durante Rodríguez.
“Estudios moleculares del sistema regulador de la degradación anaeróbica de benzoato
en Azoarcus sp. CIB”. Universidad Complutense de Madrid. Julio, 2009.
Directores: Eduardo Díaz y Manuel Carmona
Juan Nogales Enrique.
“Caracterización molecular de la ruta de degradación de ácido gálico en Pseudomonas
putida”. Universidad Complutense de Madrid. Julio, 2009.
Director: Eduardo Díaz
Julio Miguel Rubio Aranda.
“Avances en el metabolismo del ácido fenilacético en Pseudomonas sp Y2: aproximación
Genética y Proteómica”. Universidad Complutense de Madrid. Julio 2009.
Directores: Julián Perera y José Luis García
Iria Uhía Castro.
“Caracterización molecular del catabolismo del colesterol en Mycobacterium smegmatis”.
Universidad Complutense de Madrid. Junio 2010.
Directores: José Luis García y Beatriz Galán
Laura Carrillo Gil.
“Cistatinas de cebada: proteínas de defensa contra artrópodos”. Universidad Politécnica
de Madrid. Junio 2009. “Premio Extraordinario”.
Directores: Isabel Diaz y Félix Ortego Alonso
Loïc Revuelta Luis.
“Análisis comparativo de la expresión e interferencia génica de dos acetilcolinesterasas
en Blatella germanica (L) (Dyctioptera, Blattellidae) y en Leptinotarsa decemlineata (Say)
(Coleoptera, Chrysomelidae)”. Universidad Politécnica de Madrid. Enero 2010
Directores: Pedro Hernández y Francisco Tenllado
Cesar Monzó Ferrer.
“Artrópodos depredadores potenciales de Ceratitis capitata (Wiedemann) presentes en
el suelo de cítricos”. Universidad Politécnica de Valencia. Abril 2010
Directores: Pedro Castañera Domínguez y Alberto Urbaneja García
Cristian Vidal Quist.
“Estrategias para la utilización de la bacteria entomopatógena Bacillus thuringiensis
(Berliner) en el control de Ceratitis capitata (Wiedemann)”. Universidad Politécnica de
Valencia. Mayo 2010
Directores: Joel González Cabrera y Pedro Castañera Domínguez
Ana González Moreno. Ana Isabel de las Heras Sánchez.
“Avances en el conocimiento del papel de la colina en Streptococcus pneumoniae”. Modelos de estudio de interacciones virus-hospedador en salmónidos. Características
Universidad Complutense de Madrid. Julio, 2009 del virus de la necrosis pancreática infecciosa y nuevos métodos de control. Universidad
Directores: Pedro García González y José Luis García López Complutense de Madrid. Julio 2010
Elizabeth Diago Navarro. Directoras: Sylvia Rodríguez Saint-Jean y Sara Isabel Pérez Prieto
Evaluación del mecanismo de corte del RNA por la toxina bacteriana Kid y de su Pedro J. Alcolea Alcolea.
actividad inhibidora de la traducción. Noviembre de 2009 en la Facultad de Ciencias de “Análisis de los perfiles de expresión génica en los procesos de diferenciación
la Universidad Complutense de Madrid. Tesis con Mención Europea. de Leishmania infantum mediante microarrays de ADN”. Junio 2010. Universidad
Director: Ramón Díaz Orejas Complutense de Madrid.
Cristina Escribano Díaz. Director: Vicente Larraga
Implicación de la quinasa GSK3 en la regulación de la supervivencia inducida por el Mª Ángeles Abengózar Infantes.
receptor de quimioquinas CCR7 en las células dendríticas. Universidad Autónoma de Caracterización Bioquímica y Funcional de DC-SIGN canino. 2009. Universidad
Madrid. Diciembre 2009. Complutense de Madrid.
Director: José Luis Rodríguez Fernández Directora: María I. Colmenares Brunet
María de la Luz Mohedano Bonillo. Elena Sierra Filardi.
Caracterización funcional del regulador esencial YycF de Streptococcus pneumoniae. “Regulación de la expresión y función de DC-SIGN y marcadores de polarización de
Universidad: Universidad Complutense de Madrid, Facultad de Biología. Julio 2009. macrófagos”. Universidad Complutense de Madrid. Mayo 2010.
Directora: Paloma López Director: Angel Luis Corbí López
Mª Laura Werning. Laura Aragoneses Fenoll.
Caracterización molecular del gen gtf de Pediococcus parvulus 2.6 y su aplicación para la “Caracterización estructural y funcional de mLSECtin”. Universidad Complutense de
detección por PCR de bacterias ácido lácticas productoras de β-D-glucano. Universidad: Madrid. Noviembre 2010.
Autónoma de Madrid. Facultad / Escuela: Facultad de Biología. Junio 2010. Director: Angel Luis Corbí López
Directoras: Paloma López y Pilar Fernández de Palencia
Luis Fabián Lorenzo Díaz.
“Interacciones moleculares en la transferencia conjugativa del plásmido pMV158”.
Universidad Complutense de Madrid. Facultad de CC. Biológicas. Noviembre, 2009.
Director: Manuel Espinosa
Proliferación Celular y Desarrollo | Cell Proliferation & Development
Mónica Román Trufero. Francesca Sarno.
“Las proteínas Polycomb RING1A y RING1B en la homeostasis de células madre y El gen transformer-2 de Anastrepha (Díptera, Tephritidae). Complutense de Madrid,
progenitoras”. Universidad Complutense de Madrid. Julio 2009. Facultad de Biología. 2010
Director: Miguel Angel Vidal Caballero Co-dirección: Lucas Sánchez y María Fernanda Ruiz Lorenzo

Medicina Celular y Molecular | Cellular and Molecular Medicine Inés Sánchez.

Fernando Bartolomé Robledo.
Control de la supervivencia/muerte celular en la patología de Alzheimer. Estudios en
células extraneurales. Universidad Complutense de Madrid. Junio de 2009.
Directora: Ángeles Martín Requero
Eva Maria Garrido Martin.
“Estudio de la regulación transcripcional de ALK1, receptor tipo I de TGF-beta, en la
célula endotelial”. Departamento de Bioquímica y Biología Molecular I. Facultad de
Ciencias Biológicas, Universidad Complutense de Madrid. Diciembre, 2010.
Directores: Carmelo Bernabéu Quirante y Luisa-María Botella Cubells
Cristina Castañares Carromolino.
Rutas de señalización implicadas en el eje TGF -beta- endotelina en el endotelio
vascular. Universidad Complutense de Madrid Junio 2009.
Directores: Santiago Lamas y Fernando Rodríguez
Yolanda Sánchez Delgado.
“Acción pro-apoptótica y diferenciadora de la isoflavona genisteína en modelos de
células leucémicas humanas. Mecanismos de Regulación”. Universidad Complutense de
Madrid. Junio, 2009.
Director: Patricio Aller Tresguerres
“Nuevos complejos Polycomb con actividad monoubiquitin ligasa definidos por las
subunidades Fbxl10 y Wdr68”. Universidad Complutense de Madrid. Julio 2010.
Director: Miguel Angel Vidal Caballero
Mercedes Alvarez García.
El gen doublesex de Sciara (Díptera, Nematocera, Sciaridae). Universidad: Complutense
de Madrid, Facultad de Biología. 2009.
Co-dirección: Lucas Sánchez y María Fernanda Ruiz Lorenzo
Iker Martín Sánchez.
El gen transformer-2 de Sciara (Díptera, Nematocera, Sciaridae). Complutense de Madrid,
Facultad de Biología. 2010.
Co-dirección: Lucas Sánchez y María Fernanda Ruiz Lorenzo
Antonia Monardes Muñoz.
Las S6Ks actúan en la ruta de chequeo G2 en Arabidopsis thaliana. Universidad
Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias. Julio 2010.
Co-dirección: Consuelo de la Torre y Juan Orellana
(Escuela de Ingenieros Agrónomos de la Universidad Politécnica de Madrid)
María Angeles Mellén Rodríguez.
“Función de la autofagia en el desarrollo de la retina de vertebrados”. Universidad
Complutense de Madrid. Diciembre 2009.
Directora: Patricia Boya

150 151
 Bibliografía | Publications
Artículos por factor de impacto de revistas (WoS y Scopus)
2009
1. Riol-Blanco, L., Delgado-Martin, C., Sanchez-Sanchez, N., Alonso, L.M., Gutierrez-Lopez,
M.D., del Hoyo, G.M., Navarro, J., Sanchez-Madrid, F., Cabanas, C., Sanchez-Mateos, P., and
Rodriguez-Fernandez, J.L. (2009). Immunological synapse formation inhibits, via NF-kappa
B and FOXO1, the apoptosis of dendritic cells. Nature Immunology 10: 753-U110.
2. García-Bernal, D., Parmo-Cabañas, M., Dios-Esponera-A, Samaniego, R., Hernán-P de
la Ossa, D. and Teixidó, J. Chemokine-induced Zap70 kinase-mediated dissociation of
the Vav1-Talin complex activates 41 integrin for T cell adhesion. 2009. Immunity 31:
953-964.
3. Carmona, M., Zamarro, M.T., Blazquez, B., Durante-Rodriguez, G., Juarez, J.F.,
Valderrama, J.A., Barragan, M.J.L., Garcia, J.L., and Diaz, E. (2009). Anaerobic Catabolism
of Aromatic Compounds: a Genetic and Genomic View. Microbiology and Molecular
Biology Reviews 73: 71-+.
4. Salazar, M., Carracedo, A., Salanueva, I.J., Hernandez-Tiedra, S., Lorente, M., Egia, A.,
Vazquez, P., Blazquez, C., Torres, S., Garcia, S., Nowak, J., Fimia, G.M., Piacentini, M., Cecconi,
F., Pandolfi, P.P., Gonzalez-Feria, L., Iovanna, J.L., Guzman, M., Boya, P., and Velasco, G. (2009).
Cannabinoid action induces autophagy-mediated cell death through stimulation of ER
Actividades y Datos | Activities and Data
stress in human glioma cells. Journal of Clinical Investigation 119: 1359-1372.
5. Hirabayashi, Y., Suzki, N., Tsuboi, M., Endo, TA., Toyoda, T., Shinga, J., Koseki, H., Vidal, M.
and Gotoh, Y. (2009). Polycomb Limits the Neurogenic Competence of Neural Precursor
Cells to Promote Astrogenic Fate Transition. Neuron 63: 600-614.
6. Dominguez-Soto, A., Aragoneses-Fenoll, L., Gomez-Aguado, F., Corcuera, M.T., Claria,
J., Garcia-Monzon, C., Bustos, M., and Corbi, A.L. (2009). The Pathogen Receptor Liver and
Lymph Node Sinusoidal Endotelial Cell C-Type Lectin Is Expressed in Human Kupffer
Cells and Regulated by PU.1. Hepatology 49: 287-296.
7. Vazquez-Chantada, M., Ariz, U., Varela-Rey, M., Embade, N., Martinez-Lopez, N.,
Fernandez-Ramos, D., Gomez-Santos, L., Lamas, S., Lu, S.C., Martinez-Chantar, M.L., and
Mato, J.M. (2009). Evidence for LKB1/AMP-Activated Protein Kinase/Endothelial Nitric Oxide
Synthase Cascade Regulated by Hepatocyte Growth Factor, S-Adenosylmethionine, and
Nitric Oxide in Hepatocyte Proliferation. Hepatology 49: 608-617.
8. Ferrand, Y., Klein, E., Barwell, N.P., Crump, M.P., Jimenez-Barbero, J., Vicent, C.,
Boons, G.J., Ingale, S., and Davis, A.P. (2009). A Synthetic Lectin for O-Linked beta-N-
Acetylglucosamine. Angewandte Chemie International Edition 48: 1775-1779.
9. Hernandez-Rocamora, V.M., Maestro, B., de Waal, B., Morales, M., Garcia, P., Meijer, E.W.,
Merkx, M., and Sanz, J.M. (2009). Multivalent Choline Dendrimers as Potent Inhibitors of
Pneumococcal Cell-Wall Hydrolysis. Angewandte Chemie International Edition 48:
948-951.
10. Abarrategui-Garrido, C., Martinez-Barricarte, R., Lopez-Trascasa, M., de Cordoba, S.R.,
and Sanchez-Corral, P. (2009). Characterization of complement factor H-related (CFHR)
proteins in plasma reveals novel genetic variations of CFHR1 associated with atypical
hemolytic uremic syndrome. Blood 114: 4261-4271.
11. Menchen, L., Marin-Jimenez, I., Arias-Salgado, E.G., Fontela, T., Hernandez-Sampelayo,
P., Rodriguez, M.C.G., and Butta, N.V. (2009). Matrix metalloproteinase 9 is involved in
Crohn’s disease-associated platelet hyperactivation through the release of soluble CD40
ligand. Gut 58: 920-928
12. Lia, P., Oliva, F.Y., Naganathan, A.N., and Munoz, V. (2009). Dynamics of one-state downhill
protein folding. Proceedings of the National Academy of Science USA 106: 103-108.
13. Luque, D., Rivas, G., Alfonso, C., Carrascosa, J.L., Rodriguez, J.F., and Caston, J.R. (2009).
Infectious bursal disease virus is an icosahedral polyploid dsRNA virus. Proceedings of
the National Academy of Science USA 106: 2148-2152.
14. Martinez, D., Challacombe, J., Morgenstern, I., Hibbett, D., Schmoll, M., Kubicek,
C.P., Ferreira, P., Ruiz-Duenas, F.J., Martinez, A.T., Kersten, P., Hammel, K.E., Wymelenberg,
A.V., Gaskell, J., Lindquist, E., Sabat, G., BonDurant, S.S., Larrondo, L.F., Canessa, P., Vicuna,
R., Yadav, J., Doddapaneni, H., Subramanian, V., Pisabarro, A.G., Lavin, J.L., Oguiza, J.A.,
Master, E., Henrissat, B., Coutinho, P.M., Harris, P., Magnuson, J.K., Baker, S.E., Bruno,
K., Kenealy, W., Hoegger, P.J., Kues, U., Ramaiya, P., Lucash, S., Salamov, A., Shapiro, H.,
Tu, H., Chee, C.L., Misra, M., Xie, G., Teter, S., Yaver, D., James, T., Mokrejs, M., Pospisek,
M., Grigoriev, I.V., Brettin, T., Rokhsar, D., Berka, R., and Cullen, D. (2009). Genome,
transcriptome, and secretome analysis of wood decay fungus Postia placenta supports
unique mechanisms of lignocellulose conversion. Proceedings of the National
Academy of Science USA 106: 1954-1959.
15. Montes, T., Tortajada, A., Morgan, B.P., de Cordoba, S.R., and Harris, C.L. (2009).
Functional basis of protection against age-related macular degeneration conferred
by a common polymorphism in complement factor B. Proceedings of the National
Academy of Science USA 106: 4366-4371.
16. Sadqi, M., de Alba, E., Perez-Jimenez, R., Sanchez-Ruiz, J.M., and Munoz, V. (2009).
A designed protein as experimental model of primordial folding. Proceedings of the
National Academy of Science USA 106: 4127-4132.
152
17. Torreira, E., Tortajada, A., Montes, T., de Cordoba, S.R., and Llorca, O. (2009). 3D
structure of the C3bB complex provides insights into the activation and regulation
of the complement alternative pathway convertase. Proceedings of the National
Academy of Science USA 106: 882-887.
18. Babel, I., Barderas R., Diaz-Uriarte, R., Martínez-Torrecuadrada JL, Sánchez-Carbayo M
and JI Casal (2009) Identification of tumour-associated autoantigens for the diagnosis
of colorectal cancer in serum using high-density protein microarrays. Molecular and
Cellular Proteomics 8, 2382-2395.
19. Boer, D.R., Ruiz-Maso, J.A., Lopez-Blanco, J.R., Blanco, A.G., Vives-Llacer, M., Chacon,
P., Uson, I., Gomis-Ruth, F.X., Espinosa, M., Llorca, O., del Solar, G., and Coll, M. (2009).
Plasmid replication initiator RepB forms a hexamer reminiscent of ring helicases and has
mobile nuclease domains. EMBO Journal 28: 1666-1678.
20. Klinge, S., Nunez-Ramirez, R., Llorca, O., and Pellegrini, L. (2009). 3D architecture of
DNA Pol alpha reveals the functional core of multi-subunit replicative polymerases.
EMBO Journal 28: 1978-1987
21. De Sancho, D., Doshi, U., and Munoz, V. (2009). Protein Folding Rates and Stability: How
Much Is There Beyond Size? Journal of the American Chemical Society 131: 2074-+.
22. Marcelo, F., He, Y., Yuzwa, S.A., Nieto, L., Jimenez-Barbero, J., Sollogoub, M., Vocadlo,
D.J., Davies, G.D., and Bleriot, Y. (2009). Molecular Basis for Inhibition of GH84 Glycoside
Hydrolases by Substituted Azepanes: Conformational Flexibility Enables Probing of
Substrate Distortion. Journal of the American Chemical Society 131: 5390-5391.
23. Ramírez-Gualito K, Alonso-Ríos R, Quiroz-García B, Rojas-Aguilar A, Díaz D, Jiménez-
Barbero J, Cuevas G. (2009) Enthalpic nature of the CH/pi interaction involved in the
recognition of carbohydrates by aromatic compounds, confirmed by a novel interplay
of NMR, calorimetry, and theoretical calculations. Journal of the American Chemical
Society 131:18129-18138.
24. Moreno-Manzano V. Fernandez-Jimenez F.J., Garcia-Roselló M., Laínez S., Erceg S., Calvo
M.T., Lloret M., Planell-Cases R., Sánchez-Puelles J.M., Stojkovic, M. (2009) “Activated spinal
cord ependymal stem cells rescue neurological function”. Stem Cells 27(3):733-743.
25. Roman-Trufero, M., Mendez-Gomez, H.R., Perez, C., Hijikata, A., Fujimura, Y., Endo, T.,
Koseki, H., Vicario-Abejon, C., and Vidal, M. (2009). Maintenance of Undifferentiated State
and Self-Renewal of Embryonic Neural Stem Cells by Polycomb Protein Ring1B. Stem
Cells 27: 1559-1570.
26. Saland JM, Ruggenenti P, Remuzzi G, Consensus Study Group (Bekassy Z, Bensman
A, Bresin E, Colledan M, Camilla R, Coppo R, Cruzado-Garrit JM, Daina E, Fremeaux-
Bacchi V, Goodship TJ, Gridelli B, Hugo C, Karpman D, Jalanko H, Loirat C, Melgosa Hijosa
M, Mc Kiernan PJ, Noris M, Remuzzi G, Rodríguez de Córdoba S, Rota G, Ruggenenti
P, Sanchez-Corral P, Skerka C, Tartufari A, Zipfel PF. (2009) Liver-kidney transplantation
to cure atypical hemolytic uremic syndrome. Journal of the American Society of
Nephrology 20:940-49.
27. Puig-Kröger A, Sierra-Filardi E, Domínguez-Soto A, Samaniego R, Corcuera MT,
Gómez-Aguado F, Ratnam M, Sánchez-Mateos P, Corbí AL. (2009) Folate receptor beta
is expressed by tumor-associated macrophages and constitutes a marker for M2 anti-
inflammatory/regulatory macrophages. Cancer Research 69:9395-403.
28. Martinez, A.T., Ruiz-Duenas, F.J., Martinez, M.J., del Rio, J.C., and Gutierrez, A. (2009).
Enzymatic delignification of plant cell wall: from nature to mill. Current Opinion in
Biotechnology 20: 348-357.
29. Tortajada, A., Montes, T., Martinez-Barricarte, R., Morgan, B.P., Harris, C.L., and de
Cordoba, S.R. (2009). The disease-protective complement factor H allotypic variant
Ile62 shows increased binding affinity for C3b and enhanced cofactor activity. Human
MolecularGenetics 18: 3452-3461.
30. Molina, R., Gonzalez, A., Stelter, M., Perez-Dorado, I., Kahn, R., Morales, M.,
Campuzano, S., Campillo, N.E., Mobashery, S., Garcia, J.L., Garcia, P., and Hermoso, J.A.
(2009). Crystal structure of CbpF, a bifunctional choline-binding protein and autolysis
regulator from Streptococcus pneumoniae. EMBO Reports 10: 246-251.
31. Reytor, E., Perez-Miguelsanz, J., Alvarez, L., Perez-Sala, D., and Pajares, M.A. (2009).
Conformational signals in the C-terminal domain of methionine adenosyltransferase I/III
determine its nucleocytoplasmic distribution. FASEB Journal 23: 3347-3360.
32. Baquero, F., and Lemonnier, M. (2009). Generational coexistence and ancestor’s
inhibition in bacterial populations. FEMS Microbiology Reviews 33: 958-967.
33. Hernandez-Arriaga, A.M., Rubio-Lepe, T.S., Espinosa, M., and del Solar, G. (2009).
Repressor CopG prevents access of RNA polymerase to promoter and actively
dissociates open complexes. Nucleic Acids Research 37: 4799-4811.
34. Martinez-Robles, M.L., Witz, G., Hernandez, P., Schvartzman, J.B., Stasiak, A., and
Krimer, D.B. (2009). Interplay of DNA supercoiling and catenation during the segregation
of sister duplexes. Nucleic Acids Research 37: 5126-5137.
Articles by Journal Impact Factor (WoS and Scopus)
35. Peña C, García JM, Larriba MJ, Barderas R, Garcia V, Silva J, Dominguez G, Rodriguez
R, Cuevas J, Garcia de Herreros A., Casal JI, Muñoz A, Bonilla F [2009] SNAI1 expression
in colon cancer related with CDH1 and VDR downregulation in normal adjacent tissue.
Oncogene 28, 4375-4385.
36. Cruzado JM, Rodríguez de Córdoba S, Melilli E, Bestard O, Rama I, Sánchez-Corral
P, López-Trascasa M, Navarro I, Torras J, Goma M and Grinyó JM. (2009) Successful renal
transplantation in a patient with atypical hemolytic uremic syndrome carrying mutations
in both Factor I and MCP (CD46). American Journal of Transplantation 9:1477-1483.
37. Franco-Zorrilla, J.M., del Toro, F.J., Godoy, M., Perez-Perez, J., Lopez-Vidriero, I., Oliveros,
J.C., Garcia-Casado, G., Llave, C., and Solano, R. (2009). Genome-wide identification of
small RNA targets based on target enrichment and microarray hybridizations. Plant
Journal 59: 840-850.
38. Jayo, A., Conde, I., Lastres, P., Jimenez-Yuste, V., and Gonzalez-Manchon, C. (2009). New
insights into the expression and role of platelet factor XIII-A. Journal of Thrombosis and
Haemostasis 7: 1184-1191.
39. Viera A, Rufas JS, Martínez I, Barbero JL, Ortega S, Suja JA (2009) CDK2 is required
for proper homologous pairing, recombination and sex-body formation during male
mouse meiosis. Journal of Cell Science 122: 2149-2159.
40. Estecha, A., Sanchez-Martin, L., Puig-Kroger, A., Bartolome, RA., Teixido, J., Samaniego,
R. and Sanchez-Mateos, P. (2009). Moesin orchestrates cortical polarity of melanoma
tumour cells to initiate 3D invasion. Journal of Cell Science 122:3492-3510.
41. Rodriguez-Serrano, M., Romero-Puertas, M.C., Pazmino, D.M., Testillano, P.S., Risueno,
M.C., del Rio, L.A., and Sandalio, L.M. (2009). Cellular Response of Pea Plants to Cadmium
Toxicity: Cross Talk between Reactive Oxygen Species, Nitric Oxide, and Calcium. Plant
Physiology 150: 229-243.
42. Escribano, C., Delgado-Martín, C., Rodríguez-Fernández JL (2009) CCR7-dependent
stimulation of survival in dendritic cells involves inhibition of GSK3b. Journal of
Immunology 183: 628-6295
43. Torreira, E., Tortajada, A., Montes, T., de Cordoba, S.R., and Llorca, O. (2009). Coexistence
of Closed and Open Conformations of Complement Factor B in the Alternative Pathway
C3bB(Mg2+) Proconvertase. Journal of Immunology 183: 7347-7351.
44. Canto, T., Aranda, M.A., and Fereres, A. (2009). Climate change effects on physiology
and population processes of hosts and vectors that influence the spread of hemipteran-
borne plant viruses. Global Change Biology 15: 1884-1894.
45. Stacklies, W, & Vega, MC, Wilmanns, M, and Grater, F. (2009) Force distribution
overlaps with coevolutionary network in immunoglobulin. PLoS Computational
Biology 5,e1000396.
46. Abenza, J.F., Pantazopoulou, A., Rodriguez, J.M., Galindo, A., and Penalva, M.A. (2009).
Long-Distance Movement of Aspergillus nidulans Early Endosomes on Microtubule
Tracks. Traffic 10: 57-75.
47. Bartolomé, RA, Ferreiro,S., Miquilena-Colina, ME., Martínez-Prats, L., Soto-
Montenegro, MJ.,García-Bernal, D., Vaquero, JJ., Agami, R., Delgado, R., Desco, M.,
Sánchez-Mateos, P. and Teixidó, J. (2009) The chemokine receptor CXCR4 and the
metalloproteinase mt1-mmp are mutually required during melanoma metastasis to
lungs. American Journal of Pathology 174:602-12.
48. Pantazopoulou, A., and Penalva, M.A. (2009). Organization and Dynamics of the
Aspergillus nidulans Golgi during Apical Extension and Mitosis. Molecular Biology of
the Cell 20: 4335-4347.
49. de Alba, E. (2009). Structure and Interdomain Dynamics of Apoptosis-associated
Speck-like Protein Containing a CARD (ASC). The Journal of Biological Chemistry 284:
32932-32941.
50. Ferreira, P., Hernandez-Ortega, A., Herguedas, B., Martinez, A.T., and Medina, M.
(2009). Aryl-alcohol Oxidase Involved in Lignin Degradation. A mechanistic study based
on steady and pre-steady state kinetics and primary and solvent isotope effects with
tow alcohol substrates. The Journal of Biological Chemistry 284: 24840-24847.
51. Hernández, A., Maté, M.J., Sánchez, P., Romero, A., Rojo, F. and Martínez, J.L. (2009)
Structural and functional analysis of SmeT, the represor of the Stenotrophonomas
maltophilia multidrug efflux pump SmeDEF. The Journal of Biological Chemistry 284:
14428-14438.
52. Manso, I., Torres, B., Andreu, J.M., Menendez, M., Rivas, G., Alfonso, C., Diaz, E., Garcia,
J.L., and Galan, B. (2009). 3-Hydroxyphenylpropionate and Phenylpropionate are
Synergistic Activators of the MhpR Transcriptional Regulator from Escherichia coli. The
Journal of Biological Chemistry 284: 21218-21228.
53. Molina-Ortiz, I., Bartolomé, RA, Hernández-Varas, P. Colo, GP and Teixidó, J. (2009)
Overexpression of E-cadherin on melanoma cells inhibits chemokine-promoted
invasion involving p190RhoGAP/p120ctn-dependent inactivation of RhoA. The Journal
of Biological Chemistry. 284: 15147-57
54. Olmos, Y., Valle, I., Borniquel, S., Tierrez, A., Soria, E., Lamas, S., and Monsalve, M.
(2009). Mutual Dependence of Foxo3a and PGC-1 alpha in the Induction of Oxidative
Stress Genes. The Journal of Biological Chemistry 284: 14476-14484.
55. Rodriguez-Galan, O., Galindo, A., Hervas-Aguilar, A., Arst, H.N., and Penalva, M.A.
(2009). Physiological Involvement in pH Signaling of Vps24-mediated Recruitment of
Aspergillus PalB Cysteine Protease to ESCRT-III. The Journal of Biological Chemistry
284: 4404-4412.
56. Ruiz-Duenas, F.J., Pogni, R., Morales, M., Giansanti, S., Mate, M.J., Romero, A., Martinez,
M.J., Basosi, R., and Martinez, A.T. (2009). Protein Radicals in Fungal Versatile Peroxidase.
Catalytic Tryptophan radical in both compound I and compound II and studies on W164Y,
W164H, and W164S variants. The Journal of Biological Chemistry 284: 7986-7994.
57. Timmerman P, Barderas R, Desmet J, Altschuh D, Shochat S, Hollestelle MJ, Höppener
JWM, Monasterio A, Casal JI, Meloen RH [2009] A combinatorial approach for the design
of complementarity determining regions (CDR)-derived peptidomimetics with in vitro
anti-tumoral activity. The Journal of Biological Chemistry 284: 34126-34134.
58. Vernia S, Solaz-Fuster MC, Gimeno-Alcañiz JV, Rubio T, García-Haro L, Foretz M,
Rodríguez de Córdoba S and Sanz P. (2009).MP-activated protein kinase phosphorylates
R5/PTG, the glycogen targeting subunit of the R5/PTG-PP1 holoenzyme and accelerates
its downregulation by the laforin-malin complex. The Journal of Biological Chemistry
284:8247-8255.
59. Cruz LJ, Luque-Ortega JR, Rivas L, Albericio F. (2009) Kahalalide F, an antitumor
depsipeptide in clinical trials, and its analogues as effective antileishmanial agents.
Molecular Pharmaceutics. 6:813-824.
60. Barbero, J.L. (2009). Cohesins: chromatin architects in chromosome segregation,
control of gene expression and much more. Cell Mol Life Sci 66: 2025-2035.
61. Mellen, M.A., de la Rosa, E.J., and Boya, P. (2009). Autophagy is not universally
required for phosphatidyl-serine exposure and apoptotic cell engulfment during neural
development. Autophagy 5: 964-972.
62. Salazar, M., Carracedo, A., Salanueva, I.J., Hernandez-Tiedra, S., Egia, A., Lorente, M.,
Vazquez, P., Torres, S., Iovanna, J.L., Guzman, M., Boya, P., and Velasco, G. (2009). TRB3 links
ER stress to autophagy in cannabinoid anti-tumoral action. Autophagy 5: 1048-1049.
63. Cubo, L., Casini, A., Gabbiani, C., Mastrobuoni, G., Messori, L., Jimenez-Barbero, J.,
Navarro-Ranninger, C., and Quiroga, A.G. (2009). Solution Behaviour and Biomolecular
Interactions of Two Cytotoxic trans-Platinum(II) Complexes Bearing Aliphatic Amine
Ligands. Chem-Eur J 15: 9139-9146.
64. Diercks, T., Ribeiro, J.P., Canada, F.J., Andre, S., Jimenez-Barbero, J., and Gabius, H.J.
(2009). Fluorinated Carbohydrates as Lectin Ligands: Versatile Sensors in F-19-Detected
Saturation Transfer Difference NMR Spectroscopy. Chem-Eur J 15: 5666-5668.
65. Dietrich, S.A., Lindauer, R., Stierlin, C., Gertsch, J., Matesanz, R., Netararigo, S., Diaz,
J.F., and Altmann, K.H. (2009). Epothilone Analogues with Benzimidazole and Quinoline
Side Chains: Chemical Synthesis, Antiproliferative Activity, and Interactions with Tubulin.
Chem-Eur J 15: 10144-10157.
66. Fernandez-Tejada, A., Corzana, F., Busto, J.H., Jimenez-Oses, G., Jimenez-Barbero, J.,
Avenoza, A., and Peregrina, J.M. (2009). Insights into the Geometrical Features Underlying
beta-O-GlcNAc Glycosylation: Water Pockets Drastically Modulate the Interactions
between the Carbohydrate and the Peptide Backbone. Chem-Eur J 15: 7297-7301.
67. Jimenez-Barbero, J., Dragoni, E., Venturi, C., Nannucci, F., Arda, A., Fontanella, M.,
Andre, S., Canada, F.J., Gabius, H.J., and Nativi, C. (2009). alpha-O-Linked Glycopeptide
Mimetics: Synthesis, Conformation Analysis, and Interactions with Viscumin, a
Galactoside-Binding Model Lectin. Chem-Eur J 15: 10423-10431.
68. Kolympadi, M., Fontanella, M., Venturi, C., Andre, S., Gabius, H.J., Jimenez-Barbero,
J., and Vogel, P. (2009). Synthesis and Conformational Analysis of (alpha-D-Galactosyl)
phenylmethane and alpha-,beta-Difluoromethane Analogues: Interactions with the
Plant Lectin Viscumin. Chem-Eur J 15: 2861-2873.
69. Gonzalez-Jara, P., Fraile, A., Canto, T., and Garcia-Arenal, F. (2009). The Multiplicity of
Infection of a Plant Virus Varies during Colonization of Its Eukaryotic Host. J Virol 83:
7487-7494.
70. Diaz, J.F., Andreu, J.M., and Jimenez-Barbero, J. (2009). The Interaction of Microtubules
with Stabilize.rs Characterized at Biochemical and Structural Levels. Top Curr Chem 286:
121-149.
71. Diago-Navarro, E., Mora, L., Buckingham, R.H., Diaz-Orejas, R., and Lemonnier, M.
(2009). Novel Escherichia coli RF1 mutants with decreased translation termination
activity and increased sensitivity to the cytotoxic effect of the bacterial toxins Kid and
RelE. Mol Microbiol 71: 66-78.
72. Etxebeste, O., Herrero-Garcia, E., Araujo-Bazan, L., Rodriguez-Urra, A.B., Garzia, A.,
Ugalde, U., and Espeso, E.A. (2009). The bZIP-type transcription factor FlbB regulates
distinct morphogenetic stages of colony formation in Aspergillus nidulans. Mol
Microbiol 73: 775-789.
73. Garzia, A., Etxebeste, O., Herrero-Garcia, E., Fischer, R., Espeso, E.A., and Ugalde, U. (2009).
Aspergillus nidulans FlbE is an upstream developmental activator of conidiation functionally
associated with the putative transcription factor FlbB. Mol Microbiol 71: 172-184.
153
 Bibliografía cont. | Publications cont.’d
74. Cruz, L.J., Luque-Ortega, J.R., Rivas, L., and Albericio, F. (2009). Kahalalide F, an
Antitumor Depsipeptide in Clinical Trials, and Its Analogues as Effective Antileishmanial
Agents. Mol Pharmaceut 6: 813-824.
75. Cruz, J.R., and de la Espina, S.M.D. (2009). Subnuclear compartmentalization and
function of actin and nuclear Myosin I in plants. Chromosoma 118: 193-207.
76. Greciano, P.G., Ruiz, M.F., Kremer, L., and Goday, C. (2009). Two new chromodomain-
containing proteins that associate with heterochromatin in Sciara coprophila
chromosomes. Chromosoma 118: 361-376.
77. Prieto, I., Kouznetsova, A., Futterer, A., Trachana, V., Leonardo, E., Guerrero, A.A.,
Gamero, M.C., Pacios-Bras, C., Leh, H., Buckle, M., Garcia-Gallo, M., Kremer, L., Serrano,
A., Roncal, F., Albar, J.P., Barbero, J.L., Martinez-A, C., and van Wely, K.H.M. (2009).
Synaptonemal complex assembly and H3K4Me3 demethylation determine DIDO3
localization in meiosis. Chromosoma 118: 617-632.
78. Arsequell, G., Salvatella, M., Valencia, G., Fernandez-Mayoralas, A., Fontanella,
M., Venturi, C., Jimenez-Barbero, J., Marron, E., Rodriguez, R.E. (2009). Synthesis,
Conformation, and Biological Characterization of a Sugar Derivative of Morphine that is
a Potent, Long-Lasting, and Nontolerant Antinociceptive. J Med Chem 32: 535-541.
79. Solanas, C., de la Torre, B.G., Fernandez-Reyes, M., Santiveri, C.M., Jimenez, M.A., Rivas,
L., Jimenez, A.I., Andreu, D., and Cativiela, C. (2009). Therapeutic Index of Gramicidin S is
Strongly Modulated by D-Phenylalanine Analogues at the beta-Turn. J Med Chem 52:
664-674.
Actividades y Datos | Activities and Data
80. Vidal-Quist, J.C., Castanera, P., and Gonzalez-Cabrera, J. (2009). Diversity of Bacillus
thuringiensis Strains Isolated from Citrus Orchards in Spain and Evaluation of Their
Insecticidal Activity Against Ceratitis capitata. J Microbiol Biotechn 19: 749-759.
81. Sanchez, Y., Amran, D., de Blas, E., and Aller, P. (2009). Regulation of genistein-induced
differentiation in human acute myeloid leukaemia cells (HL60, NB4) Protein kinase
modulation and reactive oxygen species generation. Biochem Pharmacol 77: 384-396.
82. Domenech, M., Garcia, E., and Moscoso, M. (2009). Versatility of the capsular genes
during biofilm formation by Streptococcus pneumoniae. Environ Microbiol 11: 2542-2555.
83. Fernandez-Reyes, M., Rodriguez-Falcon, M., Chiva, C., Pachon, J., Andreu, D.,
and Rivas, L. (2009). The cost of resistance to colistin in Acinetobacter baumannii: a
proteomic perspective. Proteomics 9: 1632-1645.
84. Arias-Palomo, E., Recuero-Checa, M.A., Bustelo, X.R., and Llorca, O. (2009).
Conformational rearrangements upon Syk auto-phosphorylation. Bba-Proteins
Proteom 1794: 1211-1217.
85. Calero-Rueda, O., Barba, V., Rodriguez, E., Plou, F., Martinez, A.T., and Martinez, M.J.
(2009). Study of a sterol esterase secreted by Ophiostoma piceae: Sequence, model and
biochemical properties. Bba-Proteins Proteom 1794: 1099-1106.
86. Romero, E., Ferreira, P., Martinez, A.T., and Martinez, M.J. (2009). New oxidase from
Bjerkandera arthroconidial anamorph that oxidizes both phenolic and nonphenolic
benzyl alcohols. Bba-Proteins Proteom 1794: 689-697.
87. Munoz, F.J., Perez, J., Rumbero, A., Santos, J.I., Canada, F.J., Andre, S., Gabius, H.J.,
Jimenez-Barbero, J., Sinisterra, J.V., and Hernaiz, M.J. (2009). Glycan Tagging to Produce
Bioactive Ligands for a Surface Plasmon Resonance (SPR) Study via Immobilization on
Different Surfaces. Bioconjugate Chem 20: 673-682.
88. Munoz, F.J., Perez, J., Rumbero, A., Santos, J.I., Canada, F.J., Andre, S., Gabius, H.J.,
Jimenez-Barbero, J., Sinisterra, J.V., and Hernaiz, M.J. (2009). Glycan Tagging to Produce
Bioactive Ligands for a Surface Plasmon Resonance (SPR) Study via Immobilization on
Different Surfaces. Bioconjugate Chem 20: 673-682.
89. Bernabeu, C., Lopez-Novoa, J.M., and Quintanilla, M. (2009). The emerging role of
TGF-beta superfamily coreceptors in cancer. Bba-Mol Basis Dis 1792: 954-973.
90. Perez-Rodriguez, R., Roncero, C., Olivan, A.M., Gonzalez, M.P., and Oset-Gasque, M.J.
(2009). Signaling mechanisms of interferon gamma induced apoptosis in chromaffin
cells: involvement of nNOS, iNOS, and NF kappa B. J Neurochem 108: 1083-1096.
91. Jurado, M., Prieto, A., Martinez-Alcala, A., Martinez, A.T., and Martinez, M.J. (2009).
Laccase detoxification of steam-exploded wheat straw for second generation
bioethanol. Bioresource Technol 100: 6378-6384.
92. Rodriguez-Garcia, M.E., Quiroga, A.G., Castro, J., Ortiz, A., Aller, P., and Mata, F. (2009).
Inhibition of p38-MAPK Potentiates Cisplatin-Induced Apoptosis via GSH Depletion and
Increases Intracellular Drug Accumulation in Growth-Arrested Kidney Tubular Epithelial
Cells. Toxicol Sci 111: 413-423.
93. Portoles, P., and Rojo, J.M. (2009). The TCR/CD3 Complex: Opening the Gate to
Successful Vaccination. Curr Pharm Design 15: 3290-3300.
94. Botella, L.M., Sanz-Rodriguez, F., Komi, Y., Fernandez-L, A., Varela, E., Garrido-Martin,
E.M., Narla, G., Friedman, S.L., and Kojima, S. (2009). TGF-beta regulates the expression
of transcription factor KLF6 and its splice variants and promotes co-operative
transactivation of common target genes through a Smad3-Sp1-KLF6 interaction.
Biochem J 419: 485-495.
154
95. Garzon, J.I., Lopez-Blanco, J.R., Pons, C., Kovacs, J., Abagyan, R., Fernandez-Recio, J.,
and Chacon, P. (2009). FRODOCK: a new approach for fast rotational protein-protein
docking. Bioinformatics 25: 2544-2551.
96. Rodriguez-Pulido, A., Martin-Molina, A., Rodriguez-Beas, C., Llorca, O., Aicart, E.,
and Junquera, E. (2009). A Theoretical and Experimental Approach to the Compaction
Process of DNA by Dioctadecyldimethylammonium Bromide/Zwitterionic Mixed
Liposomes. J Phys Chem B 113: 15648-15661.
97. Rivas, L., Luque-Ortega, J.R., and Andreu, D. (2009). Amphibian antimicrobial
peptides and Protozoa: Lessons from parasites. Bba-Biomembranes 1788: 1570-1581.
98. Alcorlo, M., Jimenez, M., Ortega, A., Hermoso, J.M., Salas, M., Minton, A.P., and Rivas,
G. (2009). Analytical Ultracentrifugation Studies of Phage phi 29 Protein p6 Binding to
DNA. J Mol Biol 385: 1616-1629.
99. Lopez-Lucendo, M.F., Solis, D., Saiz, J.L., Kaltner, H., Russwurm, R., Andre, S., Gabius,
H.J., and Romero, A. (2009). Homodimeric Chicken Galectin CG-1B (C-14): Crystal
Structure and Detection of Unique Redox-Dependent Shape Changes Involving Inter-
and Intrasubunit Disulfide Bridges by Gel Filtration, Ultracentrifugation, Site-Directed
Mutagenesis, and Peptide Mass Fingerprinting. J Mol Biol 386: 366-378.
100. Garcia-Marcos, A., Pacheco, R., Martianez, J., Gonzalez-Jara, P., Diaz-Ruiz, J.R., and
Tenllado, F. (2009). Transcriptional Changes and Oxidative Stress Associated with the
Synergistic Interaction Between Potato virus X and Potato virus Y and Their Relationship
with Symptom Expression. Mol Plant Microbe In 22: 1431-1444.
101. Bensi, T., Mele, F., Ferretti, M., Norelli, S., El Daker, S., Chiocchetti, A., Rojo, J.M., Cauda,
R., Dianzani, U., and Savarino, A. (2009). Evaluation of the antiretroviral effects of a PEG-
conjugated peptide derived from human CD38. Expert Opin Ther Tar 13: 141-152.
102. Corredor, E., Testillano, P.S., Coronado, M.J., Gonzalez-Melendi, P., Fernandez-
Pacheco, R., Marquina, C., Ibarra, M.R., de la Fuente, J.M., Rubiales, D., Perez-De-Luque,
A., and Risueno, M.C. (2009). Nanoparticle penetration and transport in living pumpkin
plants: in situ subcellular identification. Bmc Plant Biol 9: -.
103. Lora, J., Testillano, P.S., Risueno, M.C., Hormaza, J.I., and Herrero, M. (2009). Pollen
development in Annona cherimola Mill. (Annonaceae). Implications for the evolution of
aggregated pollen. Bmc Plant Biol 9: -.
104. Ruiz-Duenas, F.J., Morales, M., Garcia, E., Miki, Y., Martinez, M.J., and Martinez,
A.T. (2009). Substrate oxidation sites in versatile peroxidase and other basidiomycete
peroxidases. J Exp Bot 60: 441-452.
105. Jayo, A., Conde, I., Lastres, P., Jimenez-Yuste, V., and Gonzalez-Manchon, C. (2009).
Possible role for cellular FXIII in monocyte-derived dendritic cell motility. Eur J Cell Biol
88: 423-431.
106. Tony, K.A., Dabideen, D., Li, J.L., Diaz-Hernandez, M.D., Jimenez-Barbero, J., and
Mootoo, D.R. (2009). Olefin Metathesis-Iodoetherification-Dehydroiodination Strategy for
Spiroketal Subunits of Polyether Antibiotics. J Org Chem 74: 7774-7780.
107. Armesilla-Diaz, A., Elvira, G., and Silva, A. (2009). p53 regulates the proliferation,
differentiation and spontaneous transformation of mesenchymal stem cells. Exp Cell
Res 315: 3598-3610.
108. Apostolaki, A., Erpapazoglou, Z., Harispe, L., Billini, M., Kafasla, P., Kizis, D., Penalva,
M.A., Scazzocchio, C., and Sophianopoulou, V. (2009). AgtA, the Dicarboxylic Amino
Acid Transporter of Aspergillus nidulans, Is Concertedly Down-Regulated by Exquisite
Sensitivity to Nitrogen Metabolite Repression and Ammonium-Elicited Endocytosis.
Eukaryot Cell 8: 339-352.
109. Jayo, A., Arnold, E., Gonzalez-Manchon, C., Green, D., and Lord, S.T. (2009).
Hypodysfibrinogenemia causing mild bleeding and thrombotic complications in a
compound heterozygote of A alpha IVS4+1G > T mutation and A alpha 4841 delC
truncation (A alpha(Perth)). Thromb Haemostasis 101: 770-772.
110. Calzada, J., Zamarro, M.T., Alcon, A., Santos, V.E., Diaz, E., Garcia, J.L., and Garcia-
Ochoa, F. (2009). Analysis of Dibenzothiophene Desulfurization in a Recombinant
Pseudomonas putida Strain. Appl Environ Microb 75: 875-877.
111. Campuzano, S., Serra, B., Llull, D., Garcia, J.L., and Garcia, P. (2009). Cloning,
Expression, and Characterization of a Peculiar Choline-Binding beta-Galactosidase from
Streptococcus mitis. Appl Environ Microb 75: 5972-5980.
112. de Palencia, P.F., Werning, M.L., Sierra-Filardi, E., Duenas, M.T., Irastorza, A., Corbi,
A.L., and Lopez, P. (2009). Probiotic Properties of the 2-Substituted (1,3)-beta-D-Glucan-
Producing Bacterium Pediococcus parvulus 2.6. Appl Environ Microb 75: 4887-4891.
113. Gomez-Toribio, V., Garcia-Martin, A.B., Martinez, M.J., Martinez, A.T., and Guillen,
F. (2009). Induction of Extracellular Hydroxyl Radical Production by White-Rot Fungi
through Quinone Redox Cycling. Appl Environ Microb 75: 3944-3953.
114. Gomez-Toribio, V., Garcia-Martin, A.B., Martinez, M.J., Martinez, A.T., and Guillen, F.
(2009). Enhancing the Production of Hydroxyl Radicals by Pleurotus eryngii via Quinone
Redox Cycling for Pollutant Removal. Appl Environ Microb 75: 3954-3962.
115. Romero, P., Garcia, E., and Mitchell, T.J. (2009). Development of a Prophage Typing
System and Analysis of Prophage Carriage in Streptococcus pneumoniae. Appl Environ
Microb 75: 1642-1649.
116. Loaiza, O.A., Campuzano, S., Pedrero, M., Garcia, P., and Pingarron, J.M. (2009).
Ultrasensitive detection of coliforms by means of direct asymmetric PCR combined with
disposable magnetic amperometric genosensors. Analyst 134: 34-37.
117. Lorenzo-Diaz, F., and Espinosa, M. (2009). Lagging-Strand DNA Replication Origins
Are Required for Conjugal Transfer of the Promiscuous Plasmid pMV158. J Bacteriol 191:
720-727.
118. Moscoso, M., and Garcia, E. (2009). Transcriptional Regulation of the Capsular
Polysaccharide Biosynthesis Locus of Streptococcus Pneumoniae: a Bioinformatic
Analysis. DNA Res 16: 177-186.
119. Palacin, A., Varela, J., Quirce, S., del Pozo, V., Tordesillas, L., Barranco, P., Fernandez-
Nieto, M., Sastre, J., Diaz-Perales, A., and Salcedo, G. (2009). Recombinant lipid transfer
protein Tri a 14: a novel heat and proteolytic resistant tool for the diagnosis of baker’s
asthma. Clin Exp Allergy 39: 1267-1276.
120. Armesilla-Diaz, A., Bragado, P., del Valle, I., Cuevas, E., Lazaro, I., Martin, C., Cigudosa,
J.C., and Silva, A. (2009). p53 REGULATES THE SELF-RENEWAL AND DIFFERENTIATION OF
NEURAL PRECURSORS. Neuroscience 158: 1378-1389.
121. Donaire, L., Wang, Y., Gonzalez-Ibeas, D., Mayer, K.F., Aranda, M.A., and Llave, C.
(2009). Deep-sequencing of plant viral small RNAs reveals effective and widespread
targeting of viral genomes. Virology 392: 203-214.
122. Arroba, A.I., Wallace, D., Mackey, A., de la Rosa, E.J., and Cotter, T.G. (2009). IGF-I
maintains calpastatin expression and attenuates apoptosis in several models of
photoreceptor cell death. Eur J Neurosci 30: 975-986.
123. Hurtado-Chong, A., Yusta-Boyo, M.J., Vergano-Vera, E., Bulfone, A., de Pablo, F., and
Vicario-Abejon, C. (2009). IGF-I promotes neuronal migration and positioning in the
olfactory bulb and the exit of neuroblasts from the subventricular zone. Eur J Neurosci
30: 742-755.
124. Mohammadi, T., Ploeger, G.E.J., Verheul, J., Comvalius, A.D., Martos, A., Alfonso, C.,
van Marle, J., Rivas, G., and den Blaauwen, T. (2009). The GTPase Activity of Escherichia
coli FtsZ Determines the Magnitude of the FtsZ Polymer Bundling by ZapA in Vitro.
Biochemistry-Us 48: 11056-11066.
125. Neira, J.L., Roman-Trufero, M., Contreras, L.M., Prieto, J., Singh, G., Barrera, F.N.,
Renart, M.L., and Vidal, M. (2009). The Transcriptional Repressor RYBP Is a Natively
Unfolded Protein Which Folds upon Binding to DNA. Biochemistry-Us 48: 1348-1360.
126. Santos, J.I., de Souza, A.C., Canada, F.J., Martin-Santamaria, S., Kamerling, J.P., and
Jimenez-Barbero, J. (2009). Assessing Carbohydrate-Carbohydrate Interactions by NMR
Spectroscopy: The Trisaccharide Epitope from the Marine Sponge Microciona prolifera.
Chembiochem 10: 511-519.
127. Perez, M.M., Prenafeta, A., Valle, J., Penades, J., Rota, C., Solano, C., Marco, J., Grillo,
M.J., Lasa, I., Irache, J.M., Maira-Litran, T., Jimenez-Barbero, J., Costa, L., Pier, G.B., de
Andres, D., and Amorena, B. (2009). Protection from Staphylococcus aureus mastitis
associated with poly-N-acetyl beta-1,6 glucosamine specific antibody production using
biofilm-embedded bacteria. Vaccine 27: 2379-2386.
128. Ramos, I., Alonso, A., Peris, A., Marcen, J.M., Abengozar, M.A., Alcolea, P.J., Castillo,
J.A. and Larraga, V. (2009). Antibiotic resistance free plasmid DNA expressing LACK
protein leads towards a protective Th1 response againts Leishmania infantum infection.
Vaccine 27: 6695-6699.
129. Roncero, I., Sanz, C., Alvarez, E., Vazquez, P., Barrio, P.A., and Blazquez, E. (2009).
Glucokinase and Glucokinase Regulatory Proteins are Functionally Coexpressed before
Birth in the Rat Brain. J Neuroendocrinol 21: 973-981.
130. Dutzan, N., Gamonal, J., Silva, A., Sanz, M., and Vernal, R. (2009). Over-expression
of forkhead box P3 and its association with receptor activator of nuclear factor-kappa
B ligand, interleukin (IL)-17, IL-10 and transforming growth factor-beta during the
progression of chronic periodontitis. J Clin Periodontol 36: 396-403
131. Vernal, R., Leon, R., Silva, A., van Winkelhoff, A.J., Garcia-Sanz, J.A., and Sanz, M.
(2009). Differential cytokine expression by human dendritic cells in response to different
Porphyromonas gingivalis capsular serotypes. J Clin Periodontol 36: 823-829.
132. de las Heras, A.I., Prieto, S.I.P., and Saint-Jean, S.R. (2009). In vitro and in vivo
immune responses induced by a DNA vaccine encoding the VP2 gene of the infectious
pancreatic necrosis virus. Fish Shellfish Immun 27: 120-129.
133. Campos, C., Guzman, R., Lopez-Fernandez, E., Casado, A. (2009). Evaluation of the
copper(II) reduction assay using bathocuproinedisulfonic acid disodium salt for the total
antioxidant capacity assessment: The CUPRAC-BCS assay. Analyt Biochem 392: 37-44.
134. Sanchez, Y., Calle, C., de Blas, E., and Aller, P. (2009). Modulation of arsenic trioxide-
induced apoptosis by genistein and functionally related agents in U937 human
leukaemia cells. Regulation by ROS and mitogen-activated protein kinases. Chem-Biol
Interact 182: 37-44.
135. Alcolea, P.J., Alonso, A., Sanchez-Gorostiaga, A., Moreno-Paz, M., Gomez, M.J.,
Ramos, I., Parro, V., and Larraga, V. (2009). Genome-wide analysis reveals increased levels
of transcripts related with infectivity in peanut lectin non-agglutinated promastigotes of
Leishmania infantum. Genomics 93: 551-564.
136. Araujo-Bazan, L., Dhingra, S., Chu, J., Fernandez-Martinez, J., Calvo, A.M., and Espeso,
E.A. (2009). Importin alpha is an essential nuclear import carrier adaptor required for
proper sexual and asexual development and secondary metabolism in Aspergillus
nidulans. Fungal Genet Biol 46: 506-515.
137. Harris, S.D., Turner, G., Meyer, V., Espeso, E.A., Specht, T., Takeshita, N., and Helmstedt,
K. (2009). Morphology and development in Aspergillus nidulans: A complex puzzle.
Fungal Genet Biol 46: S82-S92.
138. Wortman, J.R., Gilsenan, J.M., Joardar, V., Deegan, J., Clutterbuck, J., Andersen, M.R.,
Archer, D., Bencina, M., Braus, G., Coutinho, P., von Dohren, H., Doonan, J., Driessen,
A.J.M., Durek, P., Espeso, E., Fekete, E., Flipphi, M., Estrada, C.G., Geysens, S., Goldman,
G., de Groot, P.W.J., Hansen, K., Harris, S.D., Heinekamp, T., Helmstaedt, K., Henrissat, B.,
Hofmann, G., Homan, T., Horio, T., Horiuchi, H., James, S., Jones, M., Karaffa, L., Karanyi, Z.,
Kato, M., Keller, N., Kelly, D.E., Kiel, J.A.K.W., Kim, J.M., van der Klei, I.J., Klis, F.M., Kovalchuk,
A., Krasevec, N., Kubicek, C.P., Liu, B., MacCabe, A., Meyer, V., Mirabito, P., Miskei, M., Mos,
M., Mullins, J., Nelson, D.R., Nielsen, J., Oakley, B.R., Osmani, S.A., Pakula, T., Paszewski,
A., Paulsen, I., Pilsyk, S., Pocsi, I., Punt, P.J., Ram, A.F.J., Ren, Q.H., Robellet, X., Robson, G.,
Seiboth, B., van Solingen, P., Specht, T., Sun, J.B., Taheri-Talesh, N., Takeshita, N., Ussery, D.,
Vankuyk, P.A., Visser, H., de Vondervoort, P.J.I.V., de Vries, R.P., Walton, J., Xiang, X., Xiong, Y.,
Zeng, A.P., Brandt, B.W., Cornell, M.J., van den Hondel, C.A.M.J.J., Visser, J., Oliver, S.G., and
Turner, G. (2009). The 2008 update of the Aspergillus nidulans genome annotation: A
community effort. Fungal Genet Biol 46: S2-S13.
139. Babel, I., Barderas, R., Diaz-Uriarte, R., Martinez-Torrecuadrada, J.L., Sanchez-Carbayo,
M., and Casal, J.I. (2009). Identification of Tumor-associated Autoantigens for the
Diagnosis of Colorectal Cancer in Serum Using High Density Protein Microarrays. Mol
Cell Proteomics 8: 2382-2395.
140. Robles, P., Roig, I., Garcia, R., Brieno, M., Martin, M., Barbero, J.L., Cabero, L.I., and
Garcia-Caldes, M. (2009). Analysis of recombination along chromosome 21 during
human female pachytene stage. Reprod Biomed Online 18: 784-794.
141. Fernandez, I.S., Ruiz-Duenas, F.J., Santillana, E., Ferreira, P., Martinez, M.J.,
Martinez, A.T., and Romero, A. (2009). Novel structural features in the GMC family of
oxidoreductases revealed by the crystal structure of fungal aryl-alcohol oxidase. Acta
Crystallogr D 65: 1196-1205.
142. Martin-Fernandez, B., Miana, M., De las Heras, N., Ruiz-Hurtado, G., Fernandez-
Velasco, M., Bas, M., Ballesteros, S., Lahera, V., Cachofeiro, V., and Delgado, C. (2009).
Cardiac L-type calcium current is increased in a model of hyperaldosteronism in the rat.
Exp Physiol 94: 675-683.
143. Bello, R., Feito, M.J., Ojeda, G., Portoles, P., and Rojo, J.M. (2009). N-terminal
negatively charged residues in CD3 epsilon chains as a phylogenetically conserved trait
potentially yielding isoforms with different isoelectric points: Analysis of human CD3
epsilon chains. Immunol Lett 126: 8-15.
144. Alonso-Monge, R., Carvaihlo, S., Nombela, C., Rial, E., and Pla, J. (2009). The Hog1
MAP kinase controls respiratory metabolism in the fungal pathogen Candida albicans.
Microbiol-SGM 155: 413-423.
145. Etxebeste, O., Markina-Inarrairaegui, A., Garzia, A., Herrero-Garcia, E., Ugalde, U. and
Espeso, E.A. (2009). Kapl, a non-essential member of the Pse1p/Imp5 karyopherin family,
controls colonial and asexual development in Aspergillus nidulans. Microbiology-SGM
155: 3934-44.
146. Marrero-Diaz, R., Bravo-Cordero, J.J., Megias, D., Garcia, M.A., Bartolome, R.A., Teixido,
J., and Montoya, M.C. (2009). Polarized MT1-MMP-CD44 Interaction and CD44 Cleavage
During Cell Retraction Reveal an Essential Role for MT1-MMP in CD44-Mediated
Invasion. Cell Motil Cytoskel 66: 48-61.
147. Palacin, M., Rodriguez-Pascual, F., Reguero, J.R., Rodriguez, I., Avanzas, P., Lozano, I.,
Moris, C., Alvarez, V., Cannata-Andia, J.B., Lamas, S., Garcia-Castro, M., and Coto, E. (2009).
Lack of Association between Endothelin-1 Gene Variants and Myocardial Infarction. J
Atheroscler Thromb 16: 388-395
148. Gutierrez, A., del Rio, J.C., and Martinez, A.T. (2009). Microbial and enzymatic control
of pitch in the pulp and paper industry. Appl Microbiol Biot 82: 1005-1018.
149. del Rio, J.C., Rencoret, J., Marques, G., Li, J.B., Gellerstedt, G., Jimenez-Barbero, J.,
Martinez, A.T., and Gutierrez, A. (2009). Structural Characterization of the Lignin from
Jute (Corchorus capsularis) Fibers. J Agr Food Chem 57: 10271-10281.
150. Arman, M., Aguilera-Montilla, N., Mas, V., Puig-Kroger, A., Pignatelli, M., Guigo, R.,
Corbi, A.L., and Lozano, F. (2009). The human CD6 gene is transcriptionally regulated by
RUNX and Ets transcription factors in T cells. Mol Immunol 46: 2226-2235.
151. Li, X., Barasoain, I., Matesanz, R., Diaz, J.F., and Fang, W.S. (2009). Synthesis and
biological activities of high affinity taxane-based fluorescent probes. Bioorg Med Chem
Lett 19: 751-754.
 Bibliografía cont. | Publications cont.’d
152. Salazar, N., Prieto, A., Leal, J.A., Mayo, B., Bada-Gancedo, J.C., de los Reyes-Gavilan,
C.G., and Ruas-Madiedo, P. (2009). Production of exopolysaccharides by Lactobacillus
and Bifidobacterium strains of human origin, and metabolic activity of the producing
bacteria in milk. J Dairy Sci 92: 4158-4168.
153. Meijon, M., Valledor, L., Santamaria, E., Testillano, P.S., Risueno, M.C., Rodriguez, R.,
Feito, I., and Canal, M.J. (2009). Epigenetic characterization of the vegetative and floral
stages of azalea buds: Dynamics of DNA methylation and histone H4 acetylation. J
Plant Physiol 166: 1624-1636.
154. Valls, C., Molina, S., Vidal, T., del Rio, J.C., Colom, J.F., Martinez, A.T., Gutierrez, A., and
Roncero, M.B. (2009). Influence of operation conditions on laccase-mediator removal of
sterols from eucalypt pulp. Process Biochem 44: 1032-1038.
155. Martinez-Ruiz, A., and Lamas, S. (2009). Two Decades of New Concepts in
Nitric Oxide Signaling: From the Discovery of a Gas Messenger to the Mediation of
Nonenzymatic Posttranslational Modifications. IUBMB Life 61: 91-98.
156. Moscoso, M., Garcia, E., and Lopez, R. (2009). Pneumococcal biofilms. Int Microbiol
12: 77-85.
157. Diaz-Gil, J.J., Garcia-Monzon, C., Rua, C., Martin-Sanz, P., Cereceda, R.M., Miquilena-
Colina, M.E., Machin, C., Fernandez-Martinez, A., and Garcia-Canero, R. (2009). Liver
growth factor antifibrotic activity in vivo is associated with a decrease in activation of
hepatic stellate cells. Histol Histopathol 24: 473-479.
Actividades y Datos | Activities and Data
158. Alvarez-Alfageme, F., Ortego, F., and Castanera, P. (2009). Bt maize fed-prey
mediated effect on fitness and digestive physiology of the ground predator Poecilus
cupreus L. (Coleoptera: Carabidae). J Insect Physiol 55: 143-149.
159. Blazquez-Castro, A., Stockert, J.C., Sanz-Rodriguez, F., Zamarron, A. and Juarranz, A.
(2009). Photochem Photobiol Sci 8: 371-376.
160. Mahtout, H., Chandad, F., Rojo, J.M., and Grenier, D. (2009). Porphyromonas
gingivalis mediates the shedding and proteolysis of complement regulatory protein
CD46 expressed by oral epithelial cells. Oral Microbiol Immun 24: 396-400.
161. Padilla, D., Acosta, F., Garcia, J., Real, F., and Vivas, J.R. (2009). Temperature influences
the expression of fimbriae and flagella in Hafnia alvei strains: an immunofluorescence
study. Arch Microbiol 191: 191-198.
162. Barrientos, A.G., de la Fuente, J.M., Jimenez, M., Solis, D., Canada, F.J., Martin-Lomas,
M., and Penades, S. (2009). Modulating glycosidase degradation and lectin recognition
of gold glyconanoparticles. Carbohyd Res 344: 1474-1478.
163. Siebert, H.C., Lu, S.Y., Wechselberger, R., Born, K., Eckert, T., Liang, S.P., von der Lieth,
C.W., Jimenez-Barbero, J., Schauer, R., Vliegenthart, J.F.G., Lutteke, T., and Kozar, T. (2009).
A lectin from the Chinese bird-hunting spider binds sialic acids. Carbohyd Res 344:
1515-1525.
164. Monzo, C., Molla, O., Castanera, P., and Urbaneja, A. (2009). Activity-density of
Pardosa cribata in Spanish citrus orchards and its predatory capacity on Ceratitis
capitata and Myzus persicae. Biocontrol 54: 393-402.
165. Carrillo, E., and Moreno, J. (2009). Cytokine profiles in canine visceral leishmaniasis.
Vet Immunol Immunop 128: 67-70.
166. Leal, J.A., Gimenez-Abian, M., Canales, A., Jimenez-Barbero, J., Bernabe, M., and
Prieto, A. (2009). Cell wall polysaccharides isolated from the fungus Neotestudina rosatii,
one of the etiologic agents of mycetoma in man. Glycoconjugate J 26: 1047-1054.
167. Rencoret, J., Marques, G., Gutierrez, A., Nieto, L., Jimenez-Barbero, J., Martinez, A.T.,
and del Rio, J.C. (2009). Isolation and structural characterization of the milled-wood
lignin from Paulownia fortunei wood. Ind Crop Prod 30: 137-143.
168. Alvarez-Garcia, E., Garcia-Ortega, L., De los Rios, V., Gavilanes, J.G., and Martinez-del-
Pozo, A. (2009). Influence of key residues on the heterologous extracellular production
of fungal ribonuclease U2 in the yeast Pichia pastoris. Protein Expres Purif 65: 223-229.
169. Miki, Y., Morales, M., Ruiz-Duenas, F.J., Martinez, M.J., Wariishi, H., and Martinez,
A.T. (2009). Escherichia coli expression and in vitro activation of a unique ligninolytic
peroxidase that has a catalytic tyrosine residue. Protein Expres Purif 68: 208-214.
170. Casado-Vela, J., Martinez-Torrecuadrada, J.L., and Casal, J.I. (2009). Differential
phosphorylation patterns between the Cyclin-A2/CDK2 complex and their monomers.
Protein Expres Purif 66: 15-21.
171. Acosta, F., Vivas, J., Padilla, D., Vega, J., Bravo, J., Grasso, V., and Real, F. (2009).
Invasion and survival of Photobacterium damselae subsp piscicida in non-phagocytic
cells of gilthead sea bream, Sparus aurata L. J Fish Dis 32: 535-541.
172. Garcia-Coiradas, L., Angulo-Cubillan, F., Mendez, S., Larraga, V., de la Fuente, C.,
Cuquerella, M., and Alunda, J.M. (2009). Isolation and immunolocalization of a putative
protective antigen (p26/23) from adult Haemonchus contortus. Parasitol Res 104: 363-369.
173. Mejia-Jaramillo, A.M., Arboleda-Sanchez, S., Rodriguez, I.B., Cura, C., Salazar, A.,
del Mazo, J., Triana-Chavez, O., and Schijman, A.G. (2009). Geographical clustering of
Trypanosoma cruzi I groups from Colombia revealed by low-stringency single specific
primer-PCR of the intergenic regions of spliced-leader genes. Parasitol Res 104: 399-410.
156
174. Pascual-Ruiz, S., Carrillo, L., Alvarez-Alfageme, F., Ruiz, M., Castanera, P., and Ortego,
F. (2009). The effects of different prey regimes on the proteolytic digestion of nymphs
of the spined soldier bug, Podisus maculiventris (Hemiptera: Pentatomidae). B Entomol
Res 99: 487-491.
175. Urbaneja, A., Chueca, P., Monton, H., Pascual-Ruiz, S., Dembilio, O., Vanaclocha, P.,
Abad-Moyano, R., Pina, T., and Castanera, P. (2009). Chemical Alternatives to Malathion
for Controlling Ceratitis capitata (Diptera: Tephritidae), and Their Side Effects on Natural
Enemies in Spanish Citrus Orchards. J Econ Entomol 102: 144-151.
176. Eibes, G.M., Lu-Chau, T.A., Ruiz-Duenas, F.J., Feijoo, G., Martinez, M.J., Martinez, A.T.,
and Lema, J.M. (2009). Effect of culture temperature on the heterologous expression of
Pleurotus eryngii versatile peroxidase in Aspergillus hosts. Bioproc Biosyst Eng 32: 129-134.
177. Vidal-Quist, J.C., Castanera, P., and Gonzalez-Cabrera, J. (2009). Simple and Rapid
Method for PCR Characterization of Large Bacillus thuringiensis Strain Collections. Curr
Microbiol 58: 421-425.
178. Andres, V.S., Perez-Panades, J., Carbonell, E.A., Castanera, P., and Urbaneja, A. (2009).
Effects of post-teneral nutrition and ginger root oil exposure on longevity and mortality
in bait treatments of sterile male Ceratitis capitata. Entomol Exp Appl 132: 256-263.
179. Nousiainen, P., Maijala, P., Hatakka, A., Martinez, A.T., and Sipila, J. (2009). Syringyl-
type simple plant phenolics as mediating oxidants in laccase catalyzed degradation of
lignocellulosic materials: Model compound studies 10(th) EWLP, Stockholm, Sweden,
August 25-28, 2008. Holzforschung 63: 699-704.
180. Rencoret, J., Marques, G., Gutierrez, A., Nieto, L., Santos, J.I., Jimenez-Barbero, J.,
Martinez, A.T., and del Rio, J.C. (2009). HSQC-NMR analysis of lignin in woody (Eucalyptus
globulus and Picea abies) and non-woody (Agave sisalana) ball-milled plant materials
at the gel state 10(th) EWLP, Stockholm, Sweden, August 25-28, 2008. Holzforschung
63: 691-698.
181. Speranza, M., Gutierrez, A., del Rio, J.C., Bettucci, L., Martinez, A.T., and Martinez, M.J.
(2009). Sterols and lignin in Eucalyptus globulus Labill. wood: Spatial distribution and
fungal removal as revealed by microscopy and chemical analyses. Holzforschung 63:
362-370.
182. Lorenzo-Diaz, F., and Espinosa, M. (2009). Large-scale filter mating assay for
intra- and inter-specific conjugal transfer of the promiscuous plasmid pMV158 in Gram-
positive bacteria. Plasmid 61: 65-70.
183. Canete, M., Stockert, J.C., and Villanueva, A. (2009). Preclinical photodynamic
therapy research in Spain. 3. Localization of photosensitizers and mechanisms of cell
death in vitro. J Porphyr Phthalocya 13: 544-551.
184. Stockert, J.C., Vanzulli, S.I., Canete, M., Villanueva, A., Juarranz, A., Nonell, S., and
Colombo, L.L. (2009). Regression of the murine LM3 tumor by repeated photodynamic
therapy with meso-tetrakis-(4-N,N,N-trimethylanilinium)porphine. J Porphyr
Phthalocya 13: 560-566.
185. Eugenio, M.E., Carbajo, J.M., Martin, J.A., Gonzalez, A.E., and Villar, J.C. (2009). Laccase
production by Pycnoporus sanguineus under different culture conditions. J Basic
Microb 49: 433-440.
186. Sanchez-Ramos, I., and Castanera, P. (2009). Chemical and physical methods for the
control of the mite Acarus farris on Cabrales cheese. J Stored Prod Res 45: 61-66.
187. Rodriguez-Milla, M.A., and Salinas, J. (2009). Prefoldins 3 and 5 Play an Essential Role
in Arabidopsis Tolerance to Salt Stress. Mol Plant 2: 526-534.
188. Herranz, R., Lavan, D.A., Medina, F., van Loon, J.J.W.A., and Marco, R. (2009).
Drosophila GENE Experiment in the Spanish Soyuz Mission to the ISS: II. Effects of the
Containment Constraints. Microgravity Sci Tec 21: 299-304.
189. Manzano, A.I., Matia, I., Gonzalez-Camacho, F., Carnero-Diaz, E., van Loon, J.J.W.A.,
Dijkstra, C., Larkin, O., Anthony, P., Davey, M.R., Marco, R., and Medina, F.J. (2009).
Germination of Arabidopsis Seed in Space and in Simulated Microgravity: Alterations in
Root Cell Growth and Proliferation. Microgravity Sci Tec 21: 293-297.
190. Matia, I., van Loon, J.W.A., Carnero-Diaz, E., Marco, R., and Medina, F. (2009). Seed
Germination and Seedling Growth under Simulated Microgravity Causes Alterations in
Plant Cell Proliferation and Ribosome Biogenesis. Microgravity Sci Tec 21: 169-174.
2010
De 210 nº total / From 210 total No.
1. Gale, D.P., de Jorge, E.G., Cook, H.T., Martinez-Barricarte, R., Hadjisavvas, A., McLean,
A.G., Pusey, C.D., Pierides, A., Kyriacou, K., Athanasiou, Y., Voskarides, K., Deltas, C., Palmer,
A., Fremeaux-Bacchi, V., de Cordoba, S.R., Maxwell, P.H., and Pickering, M.C. (2010).
Identification of a mutation in complement factor H-related protein 5 in patients of
Cypriot origin with glomerulonephritis. The Lancet 376: 794-801.
2. Redondo-Muñoz, J., Ugarte-Berzal, E., Terol, M.J., Van den Steen, P.E., del Cerro, M.H.,
Roderfeld, M., Roeb, E., Opdenakker, G., Garcia-Marco, J.A., and Garcia-Pardo, A. (2010).
Matrix Metalloproteinase-9 Promotes Chronic Lymphocytic Leukemia B Cell Survival
through Its Hemopexin Domain. Cancer Cell 17: 160-172.
3. Martínez-Barricarte R.*, Heurich M.*, Valdes-Cañero F., Vázquez-Martul E., Torreira E.,
Montes T., Tortajada A., Pinto S., López-Trascasa M., Morgan BP., Llorca O., Harris CL. and
Rodríguez de Córdoba S. (2010). Human C3 mutation reveals a mechanism of Dense
Deposit Disease pathogenesis and provides insights into complement activation and
regulation. Journal of Clinical Investigation 120:3702-3712
4. Gonzalo, P., Guadamillas, M.C., Hernandez-Riquer, M.V., Pollan, A., Grande-Garcia, A.,
Bartolome, R.A., Vasanji, A., Ambrogio, C., Chiarle, R., Teixido, J., Risteli, J., Apte, S.S., del
Pozo, M.A., and Arroyo, A.G. (2010). MT1-MMP Is Required for Myeloid Cell Fusion via
Regulation of Rac1 Signaling. Developmental Cell 18: 77-89.
5. Perez-Dorado, I., Gonzalez, A., Morales, M., Sanles, R., Striker, W., Vollmer, W.,
Mobashery, S., Garcia, J.L., Martinez-Ripoll, M., Garcia, P., and Hermoso, J.A. (2010).
Insights into pneumococcal fratricide from the crystal structures of the modular killing
factor LytC. Nature Structure and Molecular Biology 17: 576-U572.
6. Gallego O, Betts MJ, Gvozdenovic-Jeremic J, Maeda K, Matetzki C, Aguilar-Gurrieri C,
Beltran-Alvarez P, Bonn S, Fernández-Tornero C, Jensen LJ, Kuhn M, Trott J, Rybin V, Müller
CW, Bork P, Kaksonen M, Russell RB, Gavin AC. (2010) A systematic screen for protein-lipid
interactions in Saccharomyces cerevisiae. Molecular Systems Biology 6:430.
7. Caraballo R, Dong H, Ribeiro JP, Jiménez-Barbero J, Ramström O. (2010) Direct
STD NMR identification of beta-galactosidase inhibitors from a virtual dynamic
hemithioacetal system. Angewandte Chemie International Edition 49:589-593.
8. Molina-Jimenez, F., Benedicto, I., Murata, M., Martin-Vilchez, S., Seki, T., Pintor-Toro,
J.A., Tortolero, M., Moreno-Otero, R., Okazaki, K., Koike, K., Barbero, J.L., Matsuzaki, K.,
Majano, P.L., and Lopez-Cabrera, M. (2010). Expression of Pituitary Tumor-Transforming
Gene 1 (PTTG1)/Securin in Hepatitis B Virus (HBV)-Associated Liver Diseases: Evidence
for an HBV X Protein-Mediated Inhibition of PTTG1 Ubiquitination and Degradation.
Hepatology 51: 777-787.
9. Aguado, C., Sarkar, S., Korolchuk, V.I.,Criado O., Vernia, S., Boya, P., Sanz, P., Rodriguez
de Córdoba, S., Cristobal, I., Blanco, F.J., Garcia-Orti, L., Marcotegui, N., Vicente, C., Rifon,
J., Novo, F.J., Bandres, E., Calasanz, M.J., Bernabeu, C., and Odero, M.D. (2010). SETBP1
overexpression is a novel leukemogenic mechanism that predicts adverse outcome in
elderly patients with acute myeloid leukemia. Blood 115: 615-625.
10. Buil A., Trégouët DA., Souto JC., Saut N., Germain M., Rotival M., Tiret L., Cambien F.,
Lathrop M., Zeller T., Alessi MC., Rodríguez de Córdoba S., Münzel T., Wild P., Fontcuberta
J., Gagnon F., Emmerich J., Almasy L., Blankenberg S., Soria JM., Morange PE. (2010)
C4BPB/C4BPA is a new susceptibility locus for venous thrombosis with unknown protein
S-independent mechanism: results from genome-wide association and gene expression
analyses followed by case-control studies. Blood 115:4644-50.
11. Martin-Gayo, E., Sierra-Filardi, E., Corbi, A.L., and Toribio, M.L. (2010). Plasmacytoid
dendritic cells resident in human thymus drive natural Treg cell development. Blood
115: 5366-5375.
12. Ugarte-Berzal, E., Redondo-Muñoz, J., Eroles, P., del Cerro, M.H., Garcia-Marco, J.A.,
Terol, M.J., and Garcia-Pardo, A. (2010). VEGF/VEGFR2 interaction down-regulates matrix
metalloproteinase-9 via STAT1 activation and inhibits B chronic lymphocytic leukemia
cell migration. Blood 115: 846-849.
13. Leal, J., Prieto, A., Bernabe, M., and Hawksworth, D.L. (2010). An assessment of fungal
wall heteromannans as a phylogenetically informative character in ascomycetes. FEMS
Microbiology Reviews 34: 986-1014.
14. Pontvianne, F., Abou-Ellail, M., Douet, J., Comella, P., Matia, I., Chandrasekhara, C.,
DeBures, A., Blevins, T., Cooke, R., Medina, F.J., Tourmente, S., Pikaard, C.S., and Saez-
Vasquez, J. (2010). Nucleolin is Required for DNA Methylation State and the Expression
of rRNA Gene Variants in Arabidopsis thaliana. PloS Genetics 6: e1001225.
15. Naganathan, A.N., and Munoz, V. (2010). Insights into protein folding mechanisms
from large scale analysis of mutational effects. Proceedings of the National Academy
of Sciences USA 107: 8611-8616.
16. Moreno-Navarrete JM, Martínez-Barricarte R, Catalán V, Sabater M, Gómez-Ambrosi
J, Ortega FJ, Ricart W, Blüher M, Frühbeck G, Rodríguez de Córdoba S. and Fernández-
Real JM. Complement Factor H is expressed in adipose tissue in association with insulin
resistance. Diabetes 59:200-9 (2010).
17. Fernández-Tornero C, Böttcher B, Rashid UJ, Steuerwald U, Flörchinger B, Devos DP,
Lindner D, Müller CW. (2010) Conformational flexibility of RNA polymerase III during
transcriptional elongation. EMBO Journal. 29:3762-72.
18. Henriques, R., Magyar, Z., Monardes, A., Khan, S., Zalejski, C., Orellana, J., Szabados,
L., De la Torre, C., Koncz, C., and Bogre, L. (2010). Arabidopsis S6 kinase mutants display
chromosome instability and altered RBR1-E2F pathway activity. EMBO Journal 29:
2979-2993.
19. Bhunia A, Vivekanandan S, Eckert T, Burg-Roderfeld M, Wechselberger R, Romanuka
J, Bächle D, Kornilov AV, von der Lieth CW, Jiménez-Barbero J, Nifantiev NE, Schachner
M, Sewald N, Lütteke T, Gabius H-J, Siebert H-C. (2010) Why structurally different
cyclic peptides can be glycomimetics of the HNK-1 carbohydrate antigen. Journal of
American Chemical Society. 132:96-105.
20. Bou, G., Santillana, E., Sheri, A., Beceiro, A., Sampson, J.M., Kalp, M., Bethel, C.R.,
Distler, A.M., Drawz, S.M., Pagadala, S.R.R., van den Akker, F., Bonomo, R.A., Romero, A.,
and Buynak, J.D. (2010). Design, Synthesis, and Crystal Structures of 6-Alkylidene-2
‘-Substituted Penicillanic Acid Sulfones as Potent Inhibitors of Acinetobacter baumannii
OXA-24 Carbapenemase. Journal of American Chemical Society 132: 13320-13331.
21. Naganathan, A.N., Li, P., Perez-Jimenez, R., Sanchez-Ruiz, J.M., and Munoz, V. (2010).
Navigating the Downhill Protein Folding Regime via Structural Homologues. Journal of
American Chemical Society 132: 11183-11190.
22. Moreno-Navarrete JM, Martínez-Barricarte R, Catalán V, Sabater M, Gómez-Ambrosi
J, Ortega FJ, Ricart W, Blüher M, Frühbeck G, Rodríguez de Córdoba S. and Fernández-
Real JM. Complement Factor H is expressed in adipose tissue in association with insulin
resistance. Diabetes 59:200-9 (2010).
23. Cañas, A.I., and Camarero, S. (2010). Laccases and their natural mediators:
Biotechnological tools for sustainable eco-friendly processes. Biotechnoly Advances
28: 694-705.
24. Baleriola, J., Suarez, T., and de la Rosa, E.J. (2010). DNA-PK promotes the survival of
young neurons in the embryonic mouse retina. Cell Death and Differentiation 17:
1697-1706.
25. Peñalva, M.A. (2010) Endocytosis in filamentous fungi: Cinderella gets her reward.
Current Opinion in Microbiology 13: 684-692.
26. Ferrandiz, M.J., Martin-Galiano, A.J., Schvartzman, J.B., and de la Campa, A.G. (2010).
The genome of Streptococcus pneumoniae is organized in topology-reacting gene
clusters. Nucleic Acids Research 38: 3570-3581.
27. Aguado, C., Sarkar, S., Korolchuk, V.I., Criado, O., Vernia, S., Boya, P., Sanz, P., Rodriguez
de Cordoba, S. Knecht, E., and Rubinsztein, D.C. (2010). Laforin, the most common
protein mutated in Lafora disease, regulates autophagy. Human Molecular Genetics
19: 2867-2876.
28. Lagares, D., Garcia-Fernandez, R.A., Jimenez, C.L., Magan-Marchal, N., Busnadiego,
O., Lamas, S., and Rodriguez-Pascual, F. (2010). Endothelin 1 Contributes to the Effect of
Transforming Growth Factor beta 1 on Wound Repair and Skin Fibrosis. Arthritis and
Reumatism 62: 878-889.
29. Dehay, B., Bove, J., Rodriguez-Muela, N., Perier, C., Recasens, A., Boya, P., and
Vila, M. (2010). Pathogenic Lysosomal Depletion in Parkinson’s Disease. Journal of
Neuroscience 30: 12535-12544.
30. Mauvezin, C., Orpinell, M., Francis, V.A., Mansilla, F., Duran, J., Ribas, V., Palacin, M.,
Boya, P., Teleman, A.A., and Zorzano, A. (2010). The nuclear cofactor DOR regulates
autophagy in mammalian and Drosophila cells. EMBO Reports 11: 37-44.
31. Mingorance, J., Rivas, G., Velez, M., Gomez-Puertas, P., and Vicente, M. (2010). Strong FtsZ
is with the force: mechanisms to constrict bacteria. Trends in Microbiology 18: 348-356.
32. Knecht E., Aguado C., Sarkar S., Korolchuk VI., Criado-Garcia O., Vernia S., Boya P., Sanz
P., Rodríguez de Córdoba S. and Rubinsztein DC. (2010). Impaired autophagy in Lafora
disease. Autophagy. 6:991-993.
33. Redondo-Muñoz, J., Escobar-Diaz, E., del Cerro, M.H., Pandiella, A., Terol, M.J., Garcia-
Marco, J.A., and Garcia-Pardo, A. (2010). Induction of B-Chronic Lymphocytic Leukemia
Cell Apoptosis by Arsenic Trioxide Involves Suppression of the Phosphoinositide
3-Kinase/Akt Survival Pathway via c-jun-NH2 Terminal Kinase Activation and PTEN
Upregulation. Clinical Cancer Research 16: 4382-4391.
34. Barasoain, I., Garcia-Carril, A.M., Matesanz, R., Maccari, G., Trigili, C., Mori, M., Shi,
J.Z., Fang, W.S., Andreu, J.M., Botta, M., and Diaz, J.F. (2010). Probing the Pore Drug
Binding Site of Microtubules with Fluorescent Taxanes: Evidence of Two Binding Poses.
Chemistry and Biology 17: 243-253.
35. Mate, D., Garcia-Burgos, C., Garcia-Ruiz, E., Ballesteros, A.O., Camarero, S., and Alcalde,
M. (2010). Laboratory Evolution of High-Redox Potential Laccases. Chemistry and
Biology 17: 1030-1041.
 Bibliografía cont. | Publications cont.’d
36. Gallego, R., Giraldo, R., Martinez, C., Llop, E., Vicente, V., and Corral, J. (2010).
Antithrombin Murcia (K241E) causing antithrombin deficiency: a possible role for altered
glycosylation. Haematologica-The Hematology Journal 95: 1358-1365.
37. Jayo, A., Conde, I., Lastres, P., Martínez, C., Rivera, J., Vicente, V., and González-
Manchón, C. (2010). L718P mutation in the membrane-proximal cytoplasmic tail of
β3 promotes abnormal αIIbβ3 clustering and lipid microdomain coalescence, and
associates with thrombasthenia-like phenotype. Haematologica-The Hematology
Journal 95:1158-1166.
38. Valero, R.A., Oeste, C.L., Stamatakis, K., Ramos, I., Herrera, M., Boya, P., and Perez-Sala,
D. (2010). Structural Determinants Allowing Endolysosomal Sorting and Degradation of
Endosomal GTPases. Traffic 11: 1221-1233.
39. Hakobyan, S., Tortajada, A., Harris, C.L., de Cordoba, S.R., and Morgan, B.P. (2010).
Variant-specific quantification of factor H in plasma identifies null alleles associated with
atypical hemolytic uremic syndrome. Kidney International 78: 782-788.
40. Gomez-Martinez, R., Vazquez, P., Duch, M., Muriano, A., Pinacho, D., Sanvicens, N.,
Sanchez-Baeza, F., Boya, P., de la Rosa, E.J., Esteve, J., Suarez, T.*, and Plaza, J.A.* (2010).
Intracellular Silicon Chips in Living Cells. Small 6: 499-502.
41. Casagolda, D., del Valle-Perez, B., Valls, G., Lugilde, E., Vinyoles, M., Casado-Vela, J.,
Solanas, G., Batlle, E., Reynolds, A.B., Casal, J.I., de Herreros, A.G., and Dunach, M. (2010).
A p120-catenin-CK1 epsilon complex regulates Wnt signaling. Journal of Cell Science
123: 2621-2631.
Actividades y Datos | Activities and Data
42. Zhang, J., Zhuang, L., Lee, Y., Abenza, J.F., Penalva, M.A., and Xiang, X. (2010). The
microtubule plus-end localization of Aspergillus dynein is important for dynein-
early-endosome interaction but not for dynein ATPase activation. Journal of Cell
Science123: 3596-3604.
43. Bartolome, F., Munoz, U., Esteras, N., Alquezar, C., Collado, A., Bermejo-Pareja, F., and
Martin-Requero, A. (2010). Simvastatin overcomes the resistance to serum withdrawal-
induced apoptosis of lymphocytes from Alzheimer’s disease patients. Cellular and
Molecular Life Sciences 67: 4257-4268.
44. Abenza, J.F., Galindo, A., Pantazopoulou, A., Gil, C., de los Rios, V., and Penalva, M.A.
(2010). Aspergillus RabB(Rab5) Integrates Acquisition of Degradative Identity with the Long
Distance Movement of Early Endosomes. Molecular Biology of the Cell 21: 2756-2769.
45. Herranz, R., Benguria, A., Lavan, D.A., Lopez-Vidriero, I., Gasset, G., Medina, F.J., van
Loon, J.J.W.A., and Marco, R. (2010). Spaceflight-related suboptimal conditions can
accentuate the altered gravity response of Drosophila transcriptome. Molecular
Ecology 19: 4255-4264.
46. Holton, M., Mohamed, T.M.A., Oceandy, D., Wang, W.G., Lamas, S., Emerson, M.,
Neyses, L., and Armesilla, A.L. (2010). Endothelial nitric oxide synthase activity is inhibited
by the plasma membrane calcium ATPase in human endothelial cells. Cardiovascular
Research 87: 440-448.
47. Lopez-Sanchez, C., Bartulos, O., Martinez-Campos, E., Ganan, C., Valenciano, A.I.,
Garcia-Martinez, V., De Pablo, F., and Hernandez-Sanchez, C. (2010). Tyrosine hydroxylase
is expressed during early heart development and is required for cardiac chamber
formation. Cardiovascular Research 88: 111-120.
48. Redondo-Horcajo, M., Romero, N., Martinez-Acedo, P., Martinez-Ruiz, A., Quijano, C.,
Lourenco, C.F., Movilla, N., Enriquez, J.A., Rodriguez-Pascual, F., Rial, E., Radi, R., Vazquez,
J., and Lamas, S. (2010). Cyclosporine A-induced nitration of tyrosine 34 MnSOD in
endothelial cells: role of mitochondrial superoxide. Cardiovascular Research 87: 356-365.
49. Dianzani, C., Minelli, R., Mesturini, R., Chiocchetti, A., Barrera, G., Sblattero, D., Yagi, J.,
Rojo, J.M., Fantozzi, R., and Dianzani, U. (2010). B7h triggering inhibits umbilical vascular
endothelial cell adhesiveness to colon carcinoma cell lines and polymorphonuclear
cells. Journal of Immunology 185: 3970-3979.
50. Parra, J.A., Bueno, J., Zarauza, J., Farinas-Alvarez, C., Cuesta, J.M., Ortiz, P., Zarrabeitia, R.,
del Molino, A.P., Bustamante, M., Botella, L.M., and Delgado, M.T. (2010). Graded contrast
echocardiography in pulmonary arteriovenous malformations. European Respiratory
Journal 35: 1279-1285.
51. Luque-Ortega JR, Cruz LJ, Albericio F, Rivas L. (2010).The Antitumoral Depsipeptide
IB-01212 Kills Leishmania through an Apoptosis-like Process Involving Intracellular
Targets. Molecular Pharmaceutics 7:1608–1617.
52. Arda, A., Venturi, C., Nativi, C., Francesconi, O., Gabrielli, G., Canada, F.J., Jimenez-Barbero,
J., and Roelens, S. (2010). A Chiral Pyrrolic Tripodal Receptor Enantioselectively Recognizes
beta-Mannose and beta-Mannosides. Chemistry- A European Journal 16: 414-418.
53. Hernandez-Gay, J.J., Arda, A., Eller, S., Mezzato, S., Leeflang, B.R., Unverzagt, C.,
Canada, F.J., and Jimenez-Barbero, J. (2010). Insights into the Dynamics and Molecular
Recognition Features of Glycopeptides by Protein Receptors: The 3D Solution Structure
of Hevein Bound to the Trisaccharide Core of N-Glycoproteins. Chemistry- A European
Journal 16: 10715-10726.
54. Morando, M., Yao, Y.P., Martin-Santamaria, S., Zhu, Z.Y., Xu, T., Canada, F.J., Zhang, Y.M.,
and Jimenez-Barbero, J. (2010). Mimicking Chitin: Chemical Synthesis, Conformational
158
Proyectos Especiales | Special Projects
R European Commission
ILSRA-2009-0932 / ILSRA-2009-1177 (2010-2015).
Seedling Growth.
Tomás Canto:
Jesús Jiménez Barbero: International Project co-funded by the Spanish Ministry of Innovation and Science and
Analysis, and Molecular Recognition of the beta(1 -> 3) N-Acetylchitopentaose Dynamic Interactive Chemical Biology and Biomedicine. the Government of India,
Analogue. Chemistry- A European Journal 16: 4239-4249. EU HPRN-CT2005-00173. 01.10.2005 - 30.09.2009. Functional significance of potyviral HCPro interactions with host and vector factors.
55. Diago-Navarro, E., Mora, L., Buckingham, R.H., Diaz-Orejas, R., Lemonnier, M. (2009). An integrated, interdisciplinary approach to Nod factor perception. ACI2009-0855, (2010 -2013).
Novel Escherichia coli RF1 mutants with decreased translation termination activity EU HPRN-CT2006-35546. 01.10.2006 - 30.09.2010.
R CONSOLIDER, CENIT
and increased sensitivity to the cytotoxic effect of the bacterial toxins Kid and RelE. GlycoHIT—Glycomics by High-throughput Integrated Technologies.
Molecular Microbiology. 71: 66-78. EU. FP7-HEALTH-2010. Collaborative Project 260600. 01.01.2011-31.12.2014.
56. Fernandez-Tresguerres, M.E., de la Espina, S.M.D., Gasset-Rosa, F., and Giraldo,
& others with industry
Luis Rivas:
R. (2010). A DNA-promoted amyloid proteinopathy in Escherichia coli. Molecular Targeting the Leishmania kinome for the development of novel antiparasitic drugs.
Microbiology 77: 1456-1469. EU. FP7-HEALTH -2007-223414 (2009-2011).
57. Garzia, A., Etxebeste, O., Herrero-Garcia, E., Ugalde, U., and Espeso, E.A. (2010). The
Germán Rivas: Víctor Muñoz (coordinator), Antonio Romero, Eva de Alba and Rafael Giraldo:
concerted action of bZip and cMyb transcription factors FlbB and FlbD induces brlA
DIVINOCELL-EU: From Protein Structure and Dynamics to Tailored Enzymes, Therapeutics, and
expression and asexual development in Aspergillus nidulans. Molecular Microbiology
Exploiting Gram-negative cell division targets in the test tube to obtain anti- Synthetic Macromolecular Devices (PRODESTECH).
75: 1314-1324.
microbial compounds. MICINN, CONSOLIDER (CSD2009-00088), (2010-2014).
58. Kwon, N.J., Garzia, A., Espeso, E.A., Ugalde, U., and Yu, J.H. (2010). FlbC is a putative FP7-HEALTH-2007-B, (5.000.000 €). Coordinator: Miguel Vicente, CNB-CSIC (2009-2013).
nuclear C2H2 transcription factor regulating development in Aspergillus nidulans. Julio Salinas:
Molecular Microbiology 77: 1203-1219. Dolores Pérez-Sala: Función y potencial biotecnológico de los factores de transcripción en las plantas
COST Action (European Cooperation in the field of Scientific and Technical Research), (Transplanta).
59. Porrua, O., Platero, A.I., Santero, E., del Solar, G., and Govantes, F. (2010). Complex
CM1001: MICINN, CONSOLIDER (CSD2007-500057), (2007-2012).
interplay between the LysR-type regulator AtzR and its binding site mediates atzDEF
Chemistry of non-enzymatic protein modification - modulation of protein
activation in response to two distinct signals. Molecular Microbiology 76: 331-347. Jose Luis García:
structure and function.
60. Andreu, J.M., Schaffner-Barbero, C., Huecas, S., Alonso, D., Lopez-Rodriguez, M.L., MICINN, CONSOLIDER CSD2007-00005;
Julio Salinas:
Ruiz-Avila, L.B., Nunez-Ramirez, R., Llorca, O., and Martin-Galiano, A.J. (2010). The Diversidad y metagenoma microbiano de la Península Ibérica
Antibacterial Cell Division Inhibitor PC190723 Is an FtsZ Polymer-stabilizing Agent That ERA-NET, ERAPGFP/06.026B, (2008-2012).
Induces Filament Assembly and Condensation. Journal of Biological Chemistry 285: Cold tolerance for the future: the CBFs and beyond (FROSTY).
UE (2007-2010). Enrique J. de la Rosa:
14239-14246.
MICINN, CONSOLIDER CSD2010-00045,
61. Barbier, P., Dorleans, A., Devred, F., Sanz, L., Allegro, D., Alfonso, C., Knossow, M., Angel T. Martínez: Disfunción cerebral durante el envejecimiento: relevancia para la enfermedad de
Peyrot, V., and Andreu, J.M. (2010). Stathmin and Interfacial Microtubule Inhibitors NMP2-CT-2006-026456, Alzheimer (Brainage).
Recognize a Naturally Curved Conformation of Tubulin Dimers. Journal of Biological White biotechnology for added value products from renewable plant polymers: Carlos Dotti (Coordinador), Patricia Boya (colaboradora CIB), 2010-2016.
Chemistry 285: 31672-31681. Design of tailor-made biocatalysts and new industrial bioprocesses (BIORENEW).
FP6 (2006-2010). Coordinator. KBBE-2009-3-244362. Mª Jesús Martínez:
62. Bustamante, M., Campillo, N.E, García, E., Gallego, C., Pera, P., Diakun, G.P., Sáiz, Etanol para automoción.
J.L., García, P, Díaz, J.F, and Menéndez, M. (2010). Cpl-7, a Lysozyme Encoded by a Optimised pre-treatment of fast growing woody and nonwoody Brazilian
crops by detailed characterisation of chemical changes produced in the lignin- MICINN-CENIT 2007-1031 (2007-2010). Proyecto de Demostración PEN-120000-2009,
Pneumococcal Bacteriophage with a Novel Cell Wall-binding Motif. Journal of Biological
carbohydrate matrix (LIGNODECO). Plan E del Gobierno de España:
Chemistry. 285, 33184-96.
FP7 (2010-2012).KBBE-2010-4-265397. “Demostración de etanol de segunda generación a escala industrial (Demo E-2)
63. Desai, T.M., Cerminara, M., Sadqi, M., and Munoz, V. (2010). The Effect of Electrostatics (2009-2010).
Novel and more robust fungal peroxidases as industrial biocatalysts (PEROXICATS).
on the Marginal Cooperativity of an Ultrafast Folding Protein. Journal of Biological
FP7 (2010-2013) A. Martínez, coordinator, F. J. Ruiz-Dueñas, PI. Patricia Boya:
Chemistry 285: 34549-34556.
Jose L. García: MICINN, INNPACTO IPT-010000-2010-48
64. Durante-Rodriguez, G., Valderrama, J.A., Mancheno, J.M., Rivas, G., Alfonso, C., “Automated image analysis for migration, angiogenesis, autophagy and apoptosis”.
Arias-Palomo, E., Llorca, O., Garcia, J.L., Diaz, E., and Carmona, M. (2010). Biochemical ERANET GEN2006-27750-C5-3-E; MICINN (2007-2010).
Systems analysis of biotech induced stresses: towards a quantum increase in With WIMASIS S.L. (2010-2013).
Characterization of the Transcriptional Regulator BzdR from Azoarcus sp. CIB. Journal of
Biological Chemistry 285: 35694-35705. process performance in the cell factory Pseudomonas putida. Angel Corbí:
Eduardo Díaz and Mª Auxiliadora Prieto: Proyecto MEICA
65. Fernandez, I.S., Cuevas, P., Angulo, J., Lopez-Navajas, P., Canales-Mayordomo, A.,
Gonzalez-Corrochano, R., Lozano, R.M., Valverde, S., Jimenez-Barbero, J., Romero, A., and NMP2-CT-2007-026515. (Genoma España/Comunidad de Madrid, ALK-Abelló), 2009-2011.
Gimenez-Gallego, G. (2010). Gentisic Acid, a Compound Associated with Plant Defense Sustainable microbial and biocatalytic production of advanced functional materials. Jesús del Mazo:
and a Metabolite of Aspirin, Heads a New Class of in Vivo Fibroblast Growth Factor FP6 (2006-2010). Project CEFIC-Long-range Research Iniciative (joining chemical industry associations
Inhibitors. Journal of Biological Chemistry 285: 11714-11729. Mª Carmen Risueño: from USA, Japan and Europe).
66. Hervas-Aguilar, A., Galindo, A., and Penalva, M.A. (2010). Receptor-independent Euroinvestigación, EUI2008-00157. Reprograming of DNA methylation during mammalian development and
Ambient pH Signaling by Ubiquitin Attachment to Fungal Arrestin-like PalF. Journal of Development of ultrasensitive detection methods of the fungi Fusarium spp. environmental impact of endocrine disruptors.
Biological Chemistry 285: 18095-18102. (NANODETECTION2). (2008-2011).
67. Lacal, J., Alfonso, C., Liu, X.X., Parales, R.E., Morel, B., Conejero-Lara, F., Rivas, G., Duque, Coordinator: A. González (ITQB). 2009- 2011.
E., Ramos, J.L., and Krell, T. (2010). Identification of a Chemoreceptor for Tricarboxylic
Acid Cycle Intermediates DIFFERENTIAL CHEMOTACTIC RESPONSE TOWARDS RECEPTOR
Joaquín Teixidó:
FP6 Health 2007-2.4.1-6. R Networks from Institute
of Health Carlos III &
LIGANDS. Journal of Biological Chemistry 285: 23124-23134. Understanding and fighting metastasis via dissection of the Core Invasive
68. Lucas, M., Gonzalez-Perez, B., Cabezas, M., Moncalian, G., Rivas, G., and de la Cruz, Machinery (MetaFight).
F. (2010). Relaxase DNA Binding and Cleavage Are Two Distinguishable Steps in
Conjugative DNA Processing That Involve Different Sequence Elements of the nic Site.
Agreement: 201862. 2008-2010.
others
 Other european &
Journal of Biological Chemistry 285: 8918-8926.
69. Martin-Galiano, A.J., Buey, R.M., Cabezas, M., and Andreu, J.M. (2010). Mapping Carmelo Bernabeu, Roberto Parrilla, Matilde Sánchez Ayuso y Consuelo González Manchón:
Flexibility and the Assembly Switch of Cell Division Protein FtsZ by Computational and
Mutational Approaches. Journal of Biological Chemistry 285: 22554-22565.
70. Matilla, I., Alfonso, C., Rivas, G., Bolt, E.L., de la Cruz, F., and Cabezon, E. (2010). The
international Nodos del CIBER de Enfermedades Raras (CIBERER),
CB06/07/0038 (2006-2011).
Flora de Pablo:
Conjugative DNA Translocase TrwB Is a Structure-specific DNA-binding Protein. Journal
Germán Rivas: CIBER de Diabetes y Enfermedades Metabólicas Asociadas (CIBERDEM),
of Biological Chemistry 285: 17537-17544.
Synthetic biology of bacterial cell division. CB07/08/0036 (2008-2011).
71. Moreno-Manzano, V., Rodriguez-Jimenez, F.J., Acena-Bonilla, J.L., Fustero-Lardies,
S., Erceg, S., Dopazo, J., Montaner, D., Stojkovic, M., and Sanchez-Puelles, J.M. (2010). Human Frontier Science Program (RGP0050-2010). Coordinator: M. Vicente, CNB-CSIC. Ernesto García López:
FM19G11, a New Hypoxia-inducible Factor (HIF) Modulator, Affects Stem Cell 2011-2014. CIBER de Enfermedades Respiratorias (CIBERES),
Differentiation Status. Journal of Biological Chemistry 285: 1333-1342 Oscar Llorca / Pablo Chacón: 2006-2011.
72. Sanchez-Gomez, F.J., Diez-Dacal, B., Pajares, M.A., Llorca, O., and Perez-Sala, D. Motions in Macromolecular Function: New Approaches to Visualize and Simulate Joaquín Teixidó (PI)/ Angeles García Pardo (nodo 1) y Óscar Llorca (nodo 2):
(2010). Cyclopentenone Prostaglandins with Dienone Structure Promote Cross-Linking Conformational Flexibility in Large Protein Complexes. RETIC, Red Temática de Investigación Cooperativa en Cáncer.
of the Chemoresistance-Inducing Enzyme Glutathione Transferase P1-1. Molecular Human Frontiers Science Program (RGP39/2008-C). 2008-2012. RD06/0020/0011 y RDD6/0020/1001. 2006-2011.
Pharmacology 78: 723-733. F. Javier Medina: Dolores Pérez-Sala: RETIC, Red de Investigación de reacciones adversas a alergenos
Projects from the European Space Agency: ISLRA-2001-001 (2009-2014). y fármacos (RIRAAF) RD07/0064/0007 (2007-2011).
Gravity regulated genes in Arabidopsis thaliana Ignacio Casal: Ayudas a grupos estables de investigación en cáncer.
(GENARA); ESA-RA-GBF/DT/PF-2004 (2009-2011). Asociación Española contra el Cáncer. En colaboración con el Hospital Puerta de Hierro
Systematic Evaluation of the ground-based (micro-)gravity simulation paradigms (Madrid) y el IMIM-Hospital del Mar. (2010-2015).
available in Europe.
159
 Ciencia y Sociedad | Science and Society
E l centro está comprometido con la divulgación y difusión
de la ciencia a la sociedad. Por ejemplo, como parte de la
“Semana de la Ciencia” de Madrid, aquellas personas interesadas en
conocer de cerca la investigación, pueden visitar nuestro Centro,
asistir a conferencias divulgativas y en algunos casos participar en
experimentos sencillos destinados a mostrar cómo ciertas aplicaciones
de los microorganismos y sus enzimas pueden ser beneficiosas para
el medio ambiente. Durante el resto del año, el CIB organiza también
otras actividades como seminarios y jornadas, y también contribuye a
la difusión de la ciencia a través de diferentes medios de comunicación
como TV, radio y prensa. En este periodo podemos destacar la Jornada
conmemorativa del Bicentenario del nacimiento de Charles Darwin,
realizada en colaboración con el Museo de Ciencias Naturales, y una
Exposición en conmemoración de la constitución del primer centro
T he center is committed to dissemination
of science and communication to
society.For example, as a part of Madrid
of view. In addition, during the rest of the
year we also arrange other activities such
as seminars, meetings and disseminate
Association of Students and Scientists
“Siglo XXI”. A workshop in collaboration
with the Complutense University of
físico de la JAE, organizada con la Asociación Nacional de Estudiantes “Science Week”, those who wish to establish science by other means such as TV, radio Madrid informed about the changes due
e Investigadores SIGLO XXI. También se realizó una Jornada en contact with the reality of research can visit and the press. During this period took place to the implementation of the European
colaboración con la Universidad Complutense de Madrid sobre el our centre, attend informative conferences a Remembrance of the 200 Anniversary High Education Strategy (affecting grade,
Espacio Europeo de Educación Superior en la Facultad de Ciencias and, in some cases, participate in basic of Charles Darwin’s birth, organized in Master’s and Doctoral studies) in the Biology
Biológicas, UCM, abordando los cambios en Grado, Máster y Doctorado. experimental work aimed to show how collaboration with the Natural Sciences School. In addition, to boost the social
Además, como parte del fomento de relaciones sociales entre las certain applications of microorganisms and Museum, and an exhibit to recapitulate interaction among personnel from different
personas de los distintos departamentos, el personal investigador en their enzymes could be very beneficial from the origins of the “Junta para la Ampliación departments, the fellows organize a spring
formación organiza una Fiesta de primavera, muy concurrida. an environmental and sustainable point de Estudios” organized with the National Fiesta with high participation.

50 de
50 of

years
años

E l Centro de Investigaciones Biológicas y sus investigadores han sido impulsores de la

creación de sociedades científicas como la SociedadEspañola de Microbiología (SEM T he CIB and its investigators lead the creation of scientific societies such
as the Society of Microbiology (SEM, 1946) and the Spanish Society of

Biología [1946]), la Sociedad Española de Bioquímica (SEB [1963]) así como la fundación en 1960
de la Colección Española de Cultivos Tipo (CECT). Biology Biochemistry (SEB, 1963). Additionally in 1960 the center gave impulse to the
foundation of the Spanish Type Culture Collection (CECT).
Actividades y Datos | Activities and Data

SEB SEM
Lorenzo Vilas López. Arnaldo Socías Amorós, Alberto Sols en su despacho del CIB, cuarta planta.
Primer Secretario SEM Presidente SEM
(1946-1967). (1956-1957).

Reunión de Fundación de la SEB, Santiago de Compostela, 1963.

Sols Jiménez-Díaz Lora Tamayo Ochoa

Desde su fundación el Instituto Jaime Ferrán fue el gran impulsor de
la Sociedad Española de Microbiología (SEM) fundada en el mismo
CSIC en 1946 y con sede en dicho instituto, así como de la revista
“Microbiología Española” (1947).
Desde esta sociedad surgieron posteriormente las Sociedades de
Fitopatología, Virología y Microbiología Clínica.
En la actualidad cuenta con más de 1600 socios.
160
From its foundation, the Jaime Ferrán Institute was the major impulse
for the creation of the Spanish Society of Microbiology (SEM) founded
within the CSIC in 1946 and located in the Jaime Ferran itself; there it
was as well the journal Spanish Microbiology (1947).
From this Society branched off later the Societies of Phytopathology,
Virology and Clinical Microbiology.
Presently the SEM has more than 1600 members.
La Sociedad Española de Bioquímica nació en Santiago de
Compostela en 1963 con varias decenas de miembros (entre los más
jóvenes, la pareja Margarita Salas, Eladio Viñuelas y Manuel Losada).
Hoy la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular (SEBBM)
cuenta casi con 4000 socios.
The Spanish Society of Biochemistry was born in Santiago de
Compostela in 1963 with several dozens of members (among the
youngest, the couple Margarita Salas and Eladio Viñuelas, and Manuel
Losada).
Today the Spanish Society of Biochemistry and Molecular Biology
(new name, SEBBM) has almost 4000 members.
161
 Ciencia y Sociedad | Science and Society

2009

Jubilaciones | Retirements
Ofelia GARCIA HERMIDA
Científica Titular | 31/05/2009
Angela MUÑOZ ALONSO
Ayte. de Act. Técn. y Prof. (G.P.5) | 14/07/2009
Domingo MURIEL MUÑOZ
Ofic. de Gest. y serv. com. (G.P.4) | 20/12/2009

2010
Juan M. RAMIREZ DE VERGER LOBO
Prof. de Investigación | 09/01/2010
Juan Carlos STOCKERT COSSU
Investigador Científico | 15/03/2010
Felina SOMOLINOS GARCIA
Ofic. de Act. Téc. y Prof. (G.P. 4) | 02/06/2010
José M. PEREZ CABRIA
Ofic. de gest. y serv. com. (G.P.4) | 06/10/2010
Actividades y Datos | Activities and Data

La profesora Gabriella Morreale, miembro importante del CIB en los años de la calle Prof. Gabriella Morreale, an important member of the CIB then in Velazquez 144, thanks
Velazquez 144, agradece su nombramiento como Asociada Ad Honorem de AMIT AMIT fot her nomination as Ad Honorem Associate (during its General Assambly Mª Luisa POZO DEL CAMPILLO
(en su Asamblea General de 2007) en presencia del Director, Vicente Larraga, el SE in 2007) in the presence of the Director, Vicente Larraga, the Secretary of State for Ayte. Diplomado Invest. | 22/10/2010
de Universidades e Investigación, Miguel Angel Quintanilla y la presidenta de AMIT, Universities and Science, Miguel Angel Quintanilla and the at that time President of
Flora de Pablo. AMIT, Flora de Pablo. Diego GARCIA HERRANZ
Auxiliar Investigación | 13/11/2010

Programa de
M. Carmona, “¿Evolución o Diseño?”
Andrés Moya “El papel de la simbiosis en la evolución de los eucariotas”
Juan Luis Arsuaga, “El eslabón perdido”
2010
Prof. Susan M. Lea. Sir William Dunn School of Pathology. Oxford, UK | Invitada por
Hue Sun Chan, Ph.D., Professor & Canada Research Chair, Faculty of Medicine,
University of Toronto, Canada | Invitado por Prof. Víctor Muñoz
“Cooperativity in Protein Folding: What is the Shape of the Funnel?”

Seminarios Generales
JORNADA CONMEMORATIVA DEL BICENTENARIO DEL NACIMIENTO DE CHARLES DARWIN 28 de mayo de 2010
13 de mayo de 2009. Prof. S. Rodríguez de Córdoba Organizado y dirigido por Dra. M.A. Prieto Jiménez
Prof. Gustavo D. Aguirre. Department of Clinical Studies, School of Veterinary “Structural perspectives on pathogen evasion of host complement” Optimización de procesos industriales para la obtención de bioplásticos y otros productos
Medicine, University of Pennsylvania. | Organizado y dirigido por Dr. E. J.de la Rosa 22 de enero de 2010. (PRIBOP)

Scientific General “Modelos experimentales, mutantes y pacientes: Desarrollando nuevas terapias para
enfermedades degenerativas de la retina”
Presentación de ProRetina Therapeutics, S. L. Iniciativa de creación de una Empresa de
Dr. Wolfgang Wenzel. Institute for Nanotechnology. Karlsruher Institut für
Tecnologie (KIT). Alemania | Invitado por Prof. V. Muñoz
“Protein structure prediction and folding with free energy methods: from algorithms to
8 de junio de 2010.
D. Antonio Tormo, Decano.
D. Benito Muñoz, Vicedecano de Grado.

Seminars Base Tecnológica surgida del Centro de Investigaciones Biológicas del CSIC.
21 de mayo de 2009
Prof. Dhruba Chattoraj. NIH-Bethesda, USA | Invitado por Prof. M. Espinosa
treatment options”
17 de febrero de 2010.
Michael Weber, Ph.D. Institut de Génétique Moléculaire CNRS UMR 5535, France |
Dª Mª Teresa González Jaen, Vicedecana Investigación y Relaciones Internacionales
D. Alfredo Baratas Díaz, Vicedecano Posgrado y Extensión Cultural
Facultad de Ciencias Biológicas de la Universidad Complutense | Invitados por Dra.
Mª J. Martínez
“DNA methylation requirement for once per cell cycle chromosome replication in Vibrio cholerae” Invitado por Dr. J. del Mazo
Adicionalmente cada departamento organiza 22 de mayo de 2009. “Role of DNA methylation in mammalian genome regulation”
“El Espacio Europeo de Educación Superior en la Facultad de Ciencias Biológicas, UCM: Grado,
Máster y Doctorado”
2 de marzo de 2010.
conferencias abiertas Dra. Catherine Royer. Centre de Biochimie Structurale, Montpellier (Francia) |
Invitada por Dr. G. Rivas Organizada por Dr. C. Alfonso Botello
23 de junio de 2010.
Prof. Diego de Mendoza , Centro de Biología Molecular y Celular de Rosario
Additionally each department organizes open lectures “Protein interactions in vitro and in vivo: Quantitative studies using fluorescence correlation
methodologies”
Jornadas Científico-Técnicas del CIB
4 de marzo de 2010.
Universidad Nacional de Rosario, Argentina | Invitado por Prof. M. Espinosa
“The Molecular Logic of Cold Sensation in Bacteria”

2009
28 de mayo de 2009.
Prof. John Vontas . Department of Biology. Laboratory of Molecular Entomology.
University of Crete, Greece | Invitado por Dr. P. Hernández Crespo
“Molecular characterization of insecticide resistance in major agricultural pests”
Dr. David Pina. Scientific Officer, Comisión Europea | Invitado por Prof. V. Muñoz
1 de junio de 2009.
“Marie Curie Actions: Funding opportunities for researchers”
6 de marzo de 2009. Dr. Andrew J. Nicoll. The Institute of Neurology, UCL. London, U.K. | Invitado por
Prof. V. Muñoz
Dr. Victor Guallar. ICREA Research Professor, Barcelona Supercomputing Center |
“Forcing Proteins to Fold: From de novo design to a high throughput screen for anti-prion
Invitado por Prof. A.T. Martínez
therapeutics”
“Computer modelling: An atomic and electronic view of Nature”
5 de octubre de 2009.
25 de febrero de 2009.
Rafael Radi, M.D., Ph.D. Department of Biochemistry, Facultad de Medicina
Organizado por Dr. P. Hernández Crespo
Universidad de la República, Montevideo, Uruguay | Invitado por Prof. S. Lamas
IIª Reunión de la Unidad Asociada de Entomología
“Bioquímica del peroxinitrito y su rol como efector citotóxico nitroxidativo”
26 y 27 de marzo de 2009.
10 de noviembre de 2009.
Andrew J. Saurin, PhD. Institut de Biologie du Développement de Marseille-Luminy
Organizado y Dirigido por Prof. S. Lamas
(IBDML).France | Invitado por Dr. M.A. Caballero
XVI SYMPOSIUM INSTITUTO “Reina Sofia”de la FUNDACIÓN RENAL Iñigo Álvarez de Toledo
“Acute Promyelocytic Leukaemia: How differing ways to recruit PRC1 and PRC2 PcG complexes
Prof. Detlef Schlondorff.
play a central role in transformation”
Conferencia Inaugural: “Modulators of progression of kidney disease”.
15 de abril de 2009.
Dr. Alberto Martínez Castelao y Dr. Manuel Praga.
Joshua LaBaer, M.D., Ph.D. Harvard Medical School Institute of Proteomics
“Glomerular disease and Complement”.
Massachussets, USA | Invitado por Dr. J.I. Casal Alvárez
Dr. Santiago Rodríguez de Córdoba (CIB, Madrid).
“High Throughput Cell-Based Studies and Protein Microarrays for Biomarker and Target Discovery”
Genetics of hemolytic-uremic syndrome and dense deposit disease.
28 de abril de 2009. Dr. Matthew Pickering (Imperial College, London).
Prof. Daniela Rhodes. MRC, Laboratory of Molecular Biology (LMB). Cambridge, Lessons from animal models.
Ernesto Caballero Garrido, Presidente Asociación Nacional de Estudiantes e
Investigadores SIGLO XXI | Invitado por Dra. Mª J. Martínez
“La Junta para Ampliación de Estudios e Investigaciones Científicas: Historia de sus centros y
protagonistas (1907-1939)”
8 de marzo de 2010.
Vassiliki A. Boussiotis, M.D. Ph.D. Associate Professor, Department of Medicine,
Harvard Medical School ,Boston Massachusetts, USA | Invitado por Prof. J. Teixidó
“Control of T cell responses by RIAM, a novel cytoskeletal regulator”
10 de marzo de 2010.
Ernesto Caballero Garrido, Presidente Asociación Nacional de Estudiantes e
Investigadores SIGLO XXI.
Exposición JAE en el Centro de Investigaciones Biológicas del CSIC
Exposición en el Centro de Investigaciones Biológicas (CIB) en conmemoración de la
constitución del primer centro físico de la JAE.
Exposición organizada por la Asociación Nacional de Estudiantes e Investigadores SIGLO
XXI, con la colaboración de la Sociedad Catalana de Biología.
9 a 25 de marzo de 2010.
Organizado por Dr. J.L. Rodríguez Fernández
2ª Reunión Científica de la Red de Inflamación y Enfermedades Reumatológicas (RIER)
19 de abril de 2010.
Hue Sun Chan, Ph.D., Professor & Canada Research Chair, Faculty of Medicine,
University of Toronto, Canada | Invitado por Prof. Jorge B. Schvartzman
“Selective Passage at Hooked or Twisted-Hooked DNA Juxtapositions Consistently
16 de septiembre.
Prof. Marie-France Carlier , Laboratory of Structural Enzymology and Biochemistry
(LEBS), CNRS, Gif-sur-Yvette, Francia | Invitada por Dr. G. Rivas
“From molecules to movement: reconstitution of actin-based motility”
30 de septiembre de 2010.
Prof. Kirsten Skarstad , Institute for Cancer Research ,The Norwegian Radium
Hospital, Montebello, Norway | Invitada por Prof. M. Espinosa
“Replication of the two chromosomes of Vibrio cholerae”
21 de octubre de 2010.
Dra. Amanda Sierra yDr. Juan M. Encinas, Department of Pediatrics, Baylor College
of Medicine, Houston, USA. | Invitados por Dr. E.J. de la Rosa
“Microglia shape adult hippocampal neurogenesis through apoptosis-coupled phagocytosis.
Y, Neural Stem Cells and Neurogenesis in the Adult Hippocampus”
23 de noviembre de 2010.
Prof. Jerson L. Silva , Presidente de la Sociedad Brasileña de Biofísica, Director de
la Fundación Carlos Chagas | Invitado por Prof. R. Giraldo
“The Intriguing Interaction of Prion Protein with Nucleic Acids and Glycosaminoglycans:
Functional and Pathological Implications”
Centro Nacional de Ressonância Magnética Nuclear Jiri Jonas, Universidade Federal do
Rio de Janeiro, Brasil
20 de diciembre de 2010.

2009

2010
Dra. Marina Noris (Mario Negri, Bergamo). Rationalizes the Decatenating, Unknotting, and Supercoil Distribution Narrowing Actions of Jornadas de Navidad CIB/2009 Jornadas de Navidad CIB/2010
UK | Invitada por Prof. V. Larraga
Pathophysiology and implications for treatment. Type-2 Topoisomerases” Martes, 15 de diciembre de 2009. Miércoles, 15 Diciembre 2010
“Regulation of telomere structure and telomerase recruitment”
12 de mayo de 2009. 19 Noviembre 2009. 27 de mayo de 2010.

162 163
 Spin-Rffs | | Spin-offs
www.proretina.com www.secugen.es
Lab S03. CIB. Ext. 4402 Tel. 91 804 49 05
Sede: Noaín (Navarra) Tel. 94 831 73 45

Director General: Stuart Medina. En colaboración con | In collaboration with:

Director D+i: Dr. Antonio López.
Investigadores | Scientists:
Dres. Carolina Isiegas, José Mª Ruiz y Jorge Marinich.
P. Técnico | Technical Personnel: Mª Jesus Cano.
Administración | Administration: Patricia Zabalza
Actividades y Datos | Activities and Data
Univ. Autónoma de Barcelona: Dra. Fátima Bosch.
Univ. Alcalá de Henares: Dr. Pedro de la Villa.
Univ. de Alicante: Dr. Nicolás Cuenca.
S ecugen es una empresa española especializada en tecnologías
de secuenciación de ADN para la aplicación al diagnóstico
genético y como apoyo a grupos de investigación básica y aplicada.
Promotores-Asesores: Dres. Enrique J. de la Rosa y Flora de Pablo.
Actualmente Secugen tiene cinco años de vida en los que se ha
consolidado como referente nacional en el campo de la secuenciación
de ADN. Secugen se constituyó a finales en 2005 con el impulso de los
Profesores de Investigación del Consejo Superior de Investigaciones
Científicas, CSIC, Santiago Rodríguez de Córdoba y José Luis García
López y la participación de las empresas SADNA y NT Global.
Secugen cuenta con dos áreas diferenciadas, el de secuenciación y
el de diagnóstico molecular. Hoy día tiene más de 1500 usuarios de

1400 grupos distintos en el área de secuenciación y trabaja con más

de 40 hospitales en el área de diagnóstico molecular. Secugen cuenta
con un departamento de I+D+I que desarrolla proyectos que le
permiten poner en el mercado pruebas genéticas útiles y novedosas
como el test de riesgo genético de padecer Degeneración Macular
Asociada a la Edad (DMAE) y que está a la vanguardia de las nuevas
Proyecto financiado por | Innding from: tecnologías haciendo uso de éstas en sus desarrollos, como puede
ser la secuenciación de ADN de tercera generación. Además tiene en
curso colaboraciones con otras empresas de base tecnológica como
X-Pol Biotech y centros asistenciales como la Fundación Jiménez Díaz.

Objetivo | Aim:
Desarrollar terapias para enfermedades degenerativas de retina | To develop therapies for retinal degenerations.

Premio | Award: FIN-RETINA 2010

otorgado por | given by: Asociación Retina Navarra

Microesferas de PLGA como posible vehículo de fármacos

inyectables intravitrealmente en ratón y rata.
PLGA microspheres as possible vehicle of medicines to inyect
intravitreous.

S ecugen is a Spanish company specialized in DNA sequencing

technologies for the genetic diagnosis and support application to
basic and applied research groups.
Currently Secugen has five years of life and is consolidated as a
national leader in the field of DNA sequencing. Secugen was formed
late in 2005 with the support of the Professors from the Consejo
Superior of Investigaciones Científicas, CSIC, Santiago Rodríguez
de Córdoba y José Luis García López and the participation of the
companies SADNA and NT Global.
Retina de ratón silvestre y ratón con degeneración de fotorreceptores rd10 (cortesía del Prof. Nicolás
Cuenca), modelo tratable con vectores AAV-Proinsulina
Wild type retina and retina with degeneration of photoreceptors rd10 (courtesy of Prof. Nicolás Cuenca) a model
164 to treat with vectors AAV-Proinsulin.
Secugen has two different areas, sequencing and molecular diagnostics.
Today it works with more than 1500 users of 1400 groups in the area
of sequencing and over 40 hospitals in the molecular diagnostic field.
Secugen has a Department of R&D that develops projects that allow
putting innovative and useful genetic tests on the market, like test for
the genetic risk of Age associated Macular Degeneration (AMD). Our
R&D Department is at the forefront of new technologies, such as third
generation DNA sequencing, and makes use of these in their new
developments. It also has ongoing collaborations with other companies
such as X-Pol Biotech and care centers as the Fundación Jiménez Díaz.
165
 Servicios Generales | | General Facilities Personnel
Actividades y Datos | Activities and Data

L a Gerencia del Centro se encarga de la gestión de los

asuntos administrativos y económicos. Al ser el CIB uno de
los centros más grandes del CSIC, estas tareas están repartidas
C IB management is responsible for overseeing all
administrative and economic matters relative to the
centre, and as the CIB is one of the largest centres in the CSIC,
Personal de Gerencia y Servicios Generales | Management and General Facilities Personnel:

en diferentes unidades: Gestión Económica, Gestión de these tasks have been divided between different units such Gerencia | Management: Gestión Económica | Economical Management: Servicios Generales | General Facilities:
Proyectos, Gestión de Personal y Gestión de Compras. as Economical management, Projects management, Human Chavarría, José Luis (hasta Marzo 2009) Abril Novela, Ángel Arellano Herrero, José Javier
En cada una de estas Unidades existe un responsable que actúa resources and Purchases unit. Pueyo Pérez, Encarnación (desde Octubre 2009) Anades Besnard, Julia Carrión Fernández, Blasa
bajo la supervisión de la Gerencia y, en última estancia de la In each of these units there is a person in charge, who works under Castro Castro, José luis Carroza Utrero, César
Dirección, y que son esenciales para el buen funcionamiento the supervision of the management team and ultimately Gestión de Proyectos | Projects Management: Chorro de Villaceballos, Concepción Fuentes Romero, Sara
del Centro. under that of the director, all of whom are essential for the Fernández García, Margarita García Giménez, Concepción
Blanco Gómez, Sara Mª
proper functioning of the Centre. Fernández Núñez, Lorenzo García Hernández, Ana Isabel
También depende de la Gerencia la Unidad de Secretaría, cuya Veira Millarengo, Mª del Rosario
De la Flor Hernández, Fco. Javier Gonzalez Díaz, Lucía
función es asistir a diversas tareas, más relacionadas con la The secretarial administrative office, which is also under Varón Crespo, Isabel (desde Septiembre 2010)
Rubio Alcalde, Raúl Lara Martínez, Felicidad
tramitación de viajes de los investigadores y la gestión de los management supervision, is responsible for a variety of tasks López Castellanos, Carmen
Seminarios del Centro. Así mismo dependen de la Gerencia el which includes making travel arrangements for researchers, Gestión de Personal | Human Resources
López Fabregat, Mª José
Servicio de Gestión Patrimonial, la coordinación del Servicio and the coordination of CIB seminars. Likewise, coordination Molina Morente, Manuel
Gestión de Compras | Purchases Management: Maroto Heras, Cristina
de Limpieza de Material, el Servicio de Recepcionistas y de of Patrimony, the cleaning service and the receptionists and Martín Sánchez, Jesús
Montero Vera, Lorenzo
Vigilancia. security surveillance service are controlled by CIB management. Utrilla Martínez, Mª Mercedes Ballesteros Villamayor, Elisa
Moreno Calle, Antonio
Carrasco Alarcón, Mª Jesús
Morante González, Francisca Pilar
Gestión Patrimonial | Patrimony Management: Fraile Fernández, Beatriz
Omil López, Mª Paz
González Esteban, Mª Nieves
Hernández Paradelo, Mª José Somolinos García, Felina
Mateos Moya, Dolores
Muñoz Díaz, Miguel Ángel
Secretarias | Secretaries:
Muñoz Sauquillo, Mª Dolores
Lafita Togores, Mª Victoria Pérez Cabria, José Manuel
Melgarejo Moreno, Valena Ramos Jiménez, Mª Teresa
Serrano Coronado, Francisco

166 167

Actividades y Datos | Activities and Data
L T
a Unidad de Servicios Técnicos e Infraestructuras esta
formada por un equipo multidisciplinar de carácter
eminentemente técnico cuyas funciones van encaminadas al
desarrollo y buen funcionamiento de las instalaciones y equipos,
así como el soporte especializado a los distintos grupos
de investigación y servicios del Centro de Investigaciones
Biológicas en las materias que son de su competencia,
asumiendo también tareas relacionadas con el mantenimiento
de algunas infraestructuras del campus del CSIC en la Ciudad
Universitaria de Madrid, (comunicaciones informáticas y central
de control de accesos).
La unidad de servicios es responsable administrativo, y en
algunos casos del control de uso y soporte a usuarios finales, de
los equipos de uso general no asignados a otros servicios.
Los servicios que integran esta unidad son:
• Servicio de Diseño y Mecánica (D.M.)
• Servicio de Electrónica e Instrumentación (E.I.)
• Servicio de Fotografía (F)
• Servicio de Informática (INF.)
• Servicio de Mantenimiento e Instalaciones (M.I.)
La coordinación y gestión administrativa se realiza a través
de la Jefatura y Administración de Servicios Técnicos e
Infraestructuras. (JF-AD)
168
Servicios Técnicos |
Maintenance and Facilities Service
he Technical Services and Infrastructures Unit, consists
of a multidisciplinary team eminently technical in nature
whose functions are directed towards the development and
satisfactory operation of the facilities and equipment. This unit
also offers specialized support to the different research groups
and services of the Biological Research Centre in matters that
are within its scope, also undertaking tasks related to the
maintenance of some infrastructures of the CSIC campus in
the University Complutense of Madrid, (computer science
communications, access control centre).
The unit has administrative responsibility and in some cases
controls equipment use, as well as giving support to end users
of general equipment not assigned to other services.
The services that make up this unit are the following:
• Computer science service. (INF.)
• Design and Mechanical service. (D.M.)
• Electronics and Instrumentation service. (E.I.)
• Maintenance and Facilities service. (M.I.)
• Photography service. (F)
Coordination and management is carried out in conjunction
with the head office and administration of the Technical
Services and Infrastructures unit. (JF-AD)
| Technical Services Unit
Personal del Servicio | Staff:
Unidad de Servicios Técnicos
García Álvarez, Antonio M. J. Head
Technical Services Unit
Angulo Zapatero, José Manuel INF.
Arranz Bombin, Ángel M.I.
Atienza Guerrero, Ángel E.I.
Ayuda Pascual, Alejandro D.M.
Servicio de Mantenimiento Servicio de Electrónica Cabañas Olivares, José M.I.
e Instalaciones e Instrumentación
Electronics and Instrumentation Cristóbal de Lucas, Eduardo INF.
Service De la Cruz Tosso, Jerónimo E.I.
Fontenla Lago, Mónica Mª F.
García Herranz, Diego M.I.
Servicio de Diseño y Mecánica Servicio de Fotografía García Lacoba, Mario INF
Designand Mechanical Service Photography Service González López, David JF-AD
Granizo Barba, Miguel INF.
Guerrero Rivero, Ángel M.I.
Hurtado Caro, Aurelio D.M.
Servicio de Informática | Computer Science Service Jalon Rico, Pablo F.
Pérez Pardo, Antonio M.I.
Pop, Marin M.I.
Tijero Paramo, Juan Miguel E.I.
Toro Monsalve, Ramon Manuel INF
Velasco de la Roca, Mª Paloma JF-AD
Servicios Prestados | Features Offered:
• Gestión técnica de concursos públicos • Technical management of public tenders
• Gestión de las comunicaciones telefónicas • Management of telephone communications
• Control técnico de empresas externas que realicen trabajos en el CIB • Technical supervision of external companies that do work in the CIB
• Asesoramiento Técnico • Technical advice
• Biocomputación: Soporte de sistemas y proyectos de usuarios. • Microcomputing software user support.
• Gestión del servidor Web. • Biocomputing facilities: System support & user proyects.
• Soporte de software a usuarios • Web server management.
• Soporte a usuarios de Hardware y software de red. • Hardware and software network user support.
• Soporte a usuarios de correo electrónico. • Support to User E-mail.
• Gestión de servidores. • Server Management.
• Soporte de Salas multimedia y Salón de actos • Servicing multimedia lecture rooms and Assembly hall
• Tratamiento digital de imagen • Image Digitalization
• Realización de tomas fotográficas • Use of photographic techniques
• Reparación, limpieza y calibración de pipetas automáticas • Repair, cleaning and calibration of automatic pipettes
• Realización de posters, gráficos y planos. • Preparation of posters, graphs and plans.
• Gestión residuos tóxicos • Toxic waste management
• Mantenimiento de maquinas reveladoras • Maintenance of developers
• Adecuación de laboratorios • Adaptation of laboratories
• Mantenimiento preventivo y correctivo de equipos frigoríficos • Preventive and corrective maintenance of refrigerating equipment
• Diseño y realización de prototipos, actualización de equipos • Designing and making prototypes, up-dating equipment
• Mecanizado de piezas. • Machining of pieces.
• Mantenimiento y reparación de hardware de equipos informáticos • Maintenance and repair of computer hardware
• Revisión de equipos de rayos X • Checking x-ray equipment
• Mantenimiento preventivo y correctivo de sistemas autónomos de • Preventive and corrective maintenance of the independent systems
climatización e invernadero for the air conditioning and greenhouse
• Mantenimiento de obra civil • Civil work maintenance
• Mantenimiento de instalaciones de fluidos • Maintenance of installations for fluids
• Jardinería • Gardening
• Reparación de equipamiento básico de laboratorio • Repair of basic laboratory equipment
• Mantenimiento de cuadros eléctricos • Maintenance of electrical switchboards
• Administración de comunicaciones y electrónica de red. • Administration of Communications and Network Electronics.
• Reparación y calibrado de equipamiento especializado de laboratorio • Repairing and calibrating specialized laboratory equipment
• Mantenimiento preventivo y correctivo del sistema de vigilancia y • Preventive and corrective maintenance of the access monitoring
control de accesos. and control system.
169
 Organigrama | CIB Structure
VicedirectorAs
María Jesus Martínez
Localización CIB
director
Vicente Larraga
Location CIB
Claustro científico Junta de centro CIB-Centro de Investigaciones Biológicas +34 91 837 31 12
Ramiro de Maetzu 9
28040 Madrid
Spain +34 91 536 04 32
Dolores Pérez Sala

Unidad de servicios técnicos Servicios científicos

Línea 6 de Metro: Estación de Metropolitano | Underground line 6: Metropolitano Station
Technical services unit Scientific facilities
GERENCIA
Encarnación Pueyo EMT Madrid | Bus Lines 132, F, C1 y C2

Biblioteca | Library Ciudad Universitaria | University Campus

Actividades y Datos | Activities and Data

Gestión Personal Compras | Store

Human Resources

Gestión de Proyectos Administración

Projects management Administration

Facultad de
Ciencias Físicas

as
er
or
Servicios Generales | General Services

M
Facultad de

las
Ciencias Químicas

de
ino
m
DEPARTAMENTOS DE INVESTIGACIÓN | RESEARCH DEPARTMENTS

Ca
E.T.S.I. Montes
Facultades de
Matemáticas,
Geológicas, Biológicas

C/ R
y Escuela de Informática
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Rectorado

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Biología Físico-Química | Chemical & Physical Biology E miro Politécnica
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Centro de

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Instituto del Frío Investigaciones
Biología Medioambiental | Environmental Biology
Parque Biológicas

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Botánico
Centro Nacional
de Investigaciones

al
Medicina Celular y Molecular | Cellular & Molecular Medicine Avd Metalúrgicas
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rio Organización
Avda. Co

Microbiología Molecular y Biología de las Infecciones del Industrial

C/ Doct
Molecular Microbiology & Infection Biology Am
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de
Facultad
Metropolitano
de Farmacia

se
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or Sever
Centro Nacional

Pa
plutense

Proliferación Celular y Desarrollo | Cell Proliferation & Development de Especialidades

Quirúgicas

o
170 171

Ochoa
Facultad
de Medicina
 Otros Teléfonos del Centro
Other CIB Telephone numbers
CIB centro
de investigaciones
biológicas

Departamento | Department Teléfono | Telephone Despacho | Office No.

Aula de Seminarios
Mª Victoria Lafita Togores 4268 270

Biblioteca
Olvido Partearroyo Lacaba 4299 S21

Compras y Almacén
Mª Dolores Muñoz Sauquillo 4342. Directo: 91 535 0627 B46

Dirección
Ana Chao Vázquez (Secretaría) 4250. Directo: 91 535 4486 173

Gerencia
Encarnación Pueyo Pérez 4254. Directo: 91 535 2194 B43

Gestión Económica
Angel Abril Novella 4282. Directo: 91 535 0519 B42

Gestión de Personal
Manuel Molina Morente 4420 B43

Gestión de Proyectos
Isabel Varón Crespo 4326 170.3

Servicio Técnico
Paloma Velasco de la Roca (Secretaria) 4286 S28

Para llamadas directas marque

For direct calls, dial
(34) 918 373 112 y después el Nº de Extensión de 4 dígitos
followed by the 4 digit extension number

Directorio CIB
C
I
B
CIB Directory
CIB - Centro de Investigaciones Biológicas
Ramiro de Maeztu, 9 - 28040 Madrid - SPAIN
www.cib.csic.es - Tel: (+34) 91 837 3112
172 173
 Índice de Investigadores en Plantilla
List Staff Scientists 2011 Apellidos, Nombre | Página | Escala | Correo electrónico | Ext. Nº Laboratorio
Last Name, Name Page Rank e-mail Lab No.
Para llamadas directas marque
For direct calls, dial (34) 918 373 112 y después el Nº de Extensión de 4 dígitos
followed by the 4 digit extension number Hernández Valenzuela, Pablo 120 INVESTIGADOR CIENTÍFICO p.hernandez@cib.csic.es 4240 104
Jiménez Barbero, Jesús 10 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN jjbarbero@cib.csic.es 4370 B01
Apellidos, Nombre | Página | Escala | Correo electrónico | Ext. Nº Laboratorio Jiménez Sarmiento, Mª Mercedes 12 CIENTÍFICA TITULAR enoe@cib.csic.es 4408 B09
Last Name, Name Page Rank e-mail Lab No.
Krimer Smunis, Dora B. 120 CIENTÍFICA TITULAR dbkrimer@cib.csic.es 4238 103
Alfonso Botello, Carlos 146 CIENTÍFICO TITULAR uanalitica@cib.csic.es 4297 278 Larraga Rodríguez de Vera, Vicente E. 106 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN vlarraga@cib.csic.es 4207 349
Aller Tresguerres, Patricio 70 INVESTIGADOR CIENTÍFICO aller@cib.csic.es 4247 148 Lastres Varo, Pedro 88 INVESTIGADOR TIT. OPIs plastres@cib.csic.es 4295 277
Andreu Morales, José Manuel 18 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN j.m.andreu@cib.csic.es 4381 308 Leal Ojeda, J. Antonio - DR. “AD HONOREM” aleal@cib.csic.es 4437 272*
Barasoain Blasco, Isabel 16 CIENTÍFICA TITULAR i.barasoain@cib.csic.es 4216 149 López Abella, Dionisio 52 DR. “AD HONOREM” dlabella@cib.csic.es 4404 206
Barbero Esteban, José Luis 130 INVESTIGADOR CIENTÍFICO jlbarbero@cib.csic.es 4310 B05 López García, Paloma 98 INVESTIGADORA CIENTÍFICA plg@cib.csic.es 4202 306
Bernabeu Quirante, Carmelo 90 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN bernabeu.c@cib.csic.es 4246 108 Lozano Puerto, Rosa Mª 30 CIENTÍFICA TITULAR rlozano@cib.csic.es 4208 B48
Botella Cubells, Luisa Mª 90 INVESTIGADORA CIENTÍFICA cibluisa@cib.csic.es 4312 109 Llave Correas, César 52 CIENTÍFICO TITULAR cesarllave@cib.csic.es 4259 270.4*
Boya Tremoleda, Patricia 136 CIENTÍFICA TITULAR pboya@cib.csic.es 4369 101 Llorca Blanco, Oscar A. 24 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN ollorca@cib.csic.es 4446 B47
Bravo García, Alicia 100 CIENTÍFICA TITULAR abravo@cib.csic.es 4308 307 Martín Requero, Mª Angeles 82 INVESTIGADORA CIENTÍFICA amrequero@cib.csic.es 4222 242
Camarero Fernández, Susana 40 CIENTÍFICA TITULAR susanacam@cib.csic.es 4307 248 Martínez Ferrer, Angel T. 40 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN atmartinez@cib.csic.es 4407 248
Actividades y Datos | Activities and Data

Canto Ceballos, Tomás R. 52 CIENTÍFICO TITULAR tomas.canto@cib.csic.es 4223 271 Martínez Hernández, María Jesús 40 INVESTIGADORA CIENTÍFICA mjmartinez@cib.csic.es 4440 249
Cañada Vicinay, Francisco Javier 10 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN jcanada@cib.csic.es 4374 B00 Medina Díaz, F. Javier 48 INVESTIGADOR CIENTÍFICO fjmedina@cib.csic.es 4261 205
Casado Moragón, Ángela 84 CIENTÍFICA TITULAR acasado@cib.csic.es 4219 107/171* Moreno Díaz de la Espina, Susana 126 INVESTIGADORA CIENTÍFICA smoreno@cib.csic.es 4257 200
Casal Álvarez, José Ignacio 60 INVESTIGADOR CIENTÍFICO icasal@cib.csic.es 4363 245 Muñoz van den Eynde, Victor 26 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN vmunoz@cib.csic.es 4389 B04
Castañera Domínguez, Pedro 46 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN castan@cib.csic.es 4264 201 Ortego Alonso, Felix 46 INVESTIGADOR CIENTÍFICO ortego@cib.csic.es 4267 202
Corbí López, Ángel L. 114 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN acorbi@cib.csic.es 4376 145 Páez Abril, Eduardo - CIENTÍFICO TITULAR epaez@cib.csic.es 4387 170.1*
De Alba Bastarrechea, Eva 32 CIENTÍFICA TITULAR dealbae@cib.csic.es 4355 170* Parrilla Sánchez, Roberto L. 86 PROF. DE INV. (JUBILADO 2011) rparrilla@cib.csic.es 4272 244
De la Rosa Cano, Enrique J. 80 INVESTIGADOR CIENTÍFICO ejdelarosa@cib.csic.es 4375 101/172* Peñalva Soto, Miguel A. 62 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN penalva@cib.csic.es 4358 246
De la Torre García-Quintana, Consuelo 126 DOCTORA “AD HONOREM” delatorre@cib.csis.es 4257 200 Pérez Farinós, Gema Mª 46 CIENTÍFICA TITULAR gpfarinos@cib.csic.es 4306 270.5*
De Pablo Dávila, Flora 80 PROFESORA DE INVESTIGACIÓN fdepablo@cib.csic.es 4362 100 Pérez Maceda, Blanca T. 143 INVESTIGADORA TIT. OPIs bpm@cib.csic.es 4396 175
Del Mazo Martínez, Jesús 134 INVESTIGADOR CIENTÍFICO jdelmazo@cib.csic.es 4324 140 Pérez Prieto, Sara Isabel 108 INVESTIGADORA TIT. OPIs saraip@cib.csic.es 4385 348
Del Solar Dongil, Gloria 104 INVESTIGADORA CIENTÍFICA gdelsolar@cib.csic.es 4413 305 Pérez-Sala Gozalo, Mª Dolores 20 INVESTIGADORA CIENTÍFICA dperezsala@cib.csic.es 4212 304
Díaz Fernández, Eduardo 42 INVESTIGADOR CIENTÍFICO ediaz@cib.csic.es 4426 342 Prieto Jiménez, Mª Auxiliadora 42 CIENTÍFICA TITULAR auxi@cib.csic.es 4428 343
Díaz Orejas, Ramón 102 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN ramondiaz@cib.csic.es 4351 345 Prieto Orzanco, Alicia Mª 40 CIENTÍFICA TITULAR aliprieto@cib.csic.es 4353 346
Díaz Pereira, J. Fernando 16 INVESTIGADOR CIENTÍFICO fer@cib.csic.es 4269 309 Rial Zueco, Eduardo 72 INVESTIGADOR CIENTÍFICO rial@cib.csic.es 4236 301
Díaz-Ruiz Alba, José Ramón 50 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN jrdiazruiz@cib.csic.es 4406 206 Risueño Almeida, Mª del Carmen 44 PROFESORA DE INVESTIGACIÓN risueno@cib.csic.es 4229 209
Espeso Fernández, Eduardo A. 62 CIENTÍFICO TITULAR eespeso@cib.csic.es 4227 246/247 Rivas Caballero, Germán 12 INVESTIGADOR CIENTÍFICO grivas@cib.csic.es 4304 B09
Espinosa Padrón, Manuel 100 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN mespinosa@cib.csic.es 4209 307 Rivas López, Luis Ignacio 14 INVESTIGADOR CIENTÍFICO luis.rivas@cib.csic.es 4234 300
Esponda Fernández, Pedro H. 128 INVESTIGADOR CIENTÍFICO esponda@cib.csic.es 4336 B08 Rodríguez de Córdoba, Santiago 74 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN srdecordoba@cib.csic.es 4432 143
Fernández Tornero, Carlos 28 CIENTÍFICO TITULAR cftornero@cib.csis.es 4378 B03 Rodríguez Fernández, José Luis 112 INVESTIGADOR CIENTÍFICO rodrifer@cib.csic.es 4302 303
Fernández de Palencia Delgado, Pilar 98 CIENTÍFICA TITULAR pfpalencia@cib.csis.es 4203 306 Rodríguez Saint-Jean, Sylvia 108 INVESTIGADORA TIT. OPIs sylvia@cib.csic.es 4384 348
Fdez.-Tresguerres Rodríguez-Vigil, Mª Elena 22 CIENTÍFICA TITULAR etresguerres@cib.csic.es 4352 346 Rojo Hernández, José María 78 INVESTIGADOR CIENTÍFICO jmrojo@cib.csic.es 4217 146
García González, Pedro A. 110 INVESTIGADOR CIENTÍFICO pgarcia@cib.csic.es 4428 341 Romero Garrido, Antonio 28 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN romero@cib.csic.es 4244 B02
García López, Ernesto A. 110 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN e.garcia@cib.csic.es 4424 340 Salinas Muñoz, Julio 38 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN salinas@cib.csic.es 4303 241
García López, José Luis 42 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN jlgarcia@cib.csic.es 4427 342/343 Sánchez Ayuso, Matilde 86 INVESTIGADORA CIENTÍFICA msayuso@cib.csic.es 4272 244
García Luque, María Isabel 54 INVESTIGADORA CIENTÍFICA igarcia@cib.csic.es 4410 204 Sánchez Rodríguez, Lucas 132 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN lsanchez@cib.csic.es 4322 B06
García Mendoza, Concepción - DOCTORA “AD HONOREM” cgm@cib.csic.es 4262 344 Sánchez-Puelles González-Carvajal, José María 76 INVESTIGADOR CIENTÍFICO jmspuelles@cib.csic.es 4305 302
García Pardo, Mª de los Angeles 68 PROFESORA DE INVESTIGACIÓN agarciapardo@cib.csic.es 4430 142 Sánchez Testillano, Pilar 44 INVESTIGADORA CIENTÍFICA testillano@cib.csic.es 4365 208
García-Sanz, José Alberto 64 CIENTÍFICO TITULAR jasanz@cib.csic.es 4431 144 Schvartzman Blinder, J. Bernardo 120 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN schvartzman@cib.csic.es 4232 102
Giménez Abián, Juan F. 128 CIENTÍFICO TITULAR gimenezjf@cib.csic.es 4336 105 Serra Yoldi, Mª Teresa 54 CIENTÍFICA TITULAR mserra@cib.csic.es 4411 203
Giménez Gallego, Guillermo 28 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN gimenez_gallego@cib.csic.es 4378 370.3 Suárez Gónzalez, Mª Teresa 80 CIENTÍFICA TITULAR teresa@cib.csic.es 4398 105
Giraldo Suárez, Rafael 22 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN rgiraldo@cib.csic.es 4348 347 Teixidó Calvo, Joaquín 66 PROFESOR DE INVESTIGACIÓN joaquint@cib.csic.es 4392 141
Goday Baylina, Clara 124 INVESTIGADORA CIENTÍFICA claragoday@cib.csic.es 4314 B07 Tenllado Peralo, Francisco 50 CIENTÍFICO TITULAR tenllado@cib.csic.es 4379 206
González Manchón, Consuelo 88 CIENTÍFICA TITULAR cgmanchon@cib.csic.es 4441 107 Vega Fernández, Mª Cristina 28 CIENTÍFICA TITULAR cvega@cib.csic.es 4270 B01/370.2*
Hernández Crespo, Pedro 46 CIENTÍFICO TITULAR pedro@cib.csic.es 4393 240 Vega Palacios, Miguel Angel 114 INVESTIGADOR CIENTÍFICO mavega@cib.csic.es 4386 147
Hernández Sánchez, Catalina 80 CIENTÍFICA TITULAR chernandez@cib.csic.es 4335 100 Vidal Caballero, Miguel Ángel 122 INVESTIGADOR CIENTÍFICO mvidal@cib.csic.es 4382 106
* Despacho | Office
Memoria científica CIB 2009-2010 | Scientific Report 2009-2010

Coordinación de la edición | Report Coordinators:

Flora de Pablo, Julio Salinas, Oscar Llorca y Jesus Díaz

Fotografía científica | Scientific Photography: C

Investigadores/as de los grupos y servicios del CIB | Members of the CIB I
B

Fotografía de personal | Personnel Photography:

Servicio de fotografía del CIB | CIB Photography Unit (Mónica Fontela y Pablo Jalón)
CIB - Centro de Investigaciones Biológicas
Ramiro de Maeztu, 9 - 28040 Madrid - SPAIN
Diseño gráfico | Graphics design:
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91 478 4711

D.L.: M-26950-2009