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Introducción
Unidad 3 Catalizadores biológicos: por primera vez a comienzos del
ENZIMAS s. XIX: digestión de la carne por secreciones del estómago y
la conversión del almidón en azúcar por la saliva.
1835: J.J. Berzelius: Diastasa de la malta, señalando que la
hidrólisis del almidón se catalizaba más eficazmente por
ésta que por el ácido sulfúrico.
Introducción
POLÍMEROS BIOLÓGICOS
1878: Kühne: Denominación "enzima" (etimológicamente "en • Catalizadores; aceleran la velocidad
la levadura"). Invertasa, diastasa, pepsina ya aisladas; ≠ de Rxns bioquímicas y no se altera
de forma permanente por la reacción
Levadura (Formada por células). ENZIMAS
1897: E. Büchner: Extrae de las células de la levadura; • Reacción bioquímica: cuando las
moléculas que chocan poseen una
enzimas que catalizan la fermentación alcohólica. Demostró cantidad mínima de energía (energía
de activación, Ea, o energía libre de
que pueden actuar independientemente de la estructura activación, ΔG).
Enzimas
• Son proteínas. Pero no todas las proteínas son enzimas
• Son específicas
• Funcionan en soluciones acuosas bajo suaves condiciones de T° y pH
• Su actividad puede regularse
• Muy potentes y eficaces
• Actúan en pequeñas cantidades
• Se recuperan indefinidamente
• No llevan a cabo Rxs que son E desfavorables
• No modifican el sentido de los equilibrios químicos
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Depende: SUSTRATO: Molécula sobre la que actúa la enzima y cuya transformación está
condicionada por ella.
1. Moléculas con energía cinética suficiente PRODUCTO: molécula resultante de la acción de la enzima sobre el o los sustratos
(a menudo se obtiene varios productos)
2. Orientación correcta para reaccionar (aproximación
Holoenzimas: Poseen una parte proteica llamada apoenzima y otra no proteica
entre si a la distancia de formación de enlace) denominada cofactor.
Son esenciales: estructuras 1aria, 2aria, 3aria, 4aria Unión al apoenzima es covalente Grupo prostético: proteínas conjugadas.
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Apoenzima
Un tercio de los enzimas requieren algún ión -Proteína globular formada exclusivamente por secuencias de aminoácidos.
-Determinan la especificidad de la reacción enzimática.
metálico para catalizar -Se pueden distinguir 4 tipos de AAs según la función que desempeñen en la actividad enzimática.
Hexoquinasas, Glucosa6-P, Piruvato quinasa Mg+2 d) Catalíticos: Se unen al sustrato mediante un enlace covalente debilitando su estructura y
favoreciendo su ruptura.
Dinitrogenasa Mo
Ureasas Ni+2 Centro Activo
Glutation Peroxidasa Se -Pequeña parte de enzima: lugar donde encaja específicamente el sustrato.
-Tiene una estructura tridimensional en forma de hueco, generalmente hidrófoba
-Es donde actúan las cadenas laterales de los aminoácidos con poder catalítico
-El centro activo se une al sustrato y, si lo hay, al coenzima.
NOMENCLATURA Y CLASIFICACIÓN 1. Denota la subclase a la cual pertenece la enzima. Indica mayor especificidad de
los cambios químicos señalados por la subclase (7). Por ejemplo, detallar sobre
Antiguamente, recibían nombres particulares asignados por su descubridor antes de cuáles átomos se realizan las oxidaciones o reducciones, o cuales reciben a los que
conocer función. se transfieren o cuales grupos o átomos se transfieren o desprenden o cuales
enlaces se forman o rompen.
PEPSINA actúa en la digestión. Pepsin griego: digestión.
1. Este último número corresponde a la identificación precisa de las sustancias sobre
Se basan en la reacción química catalizada (propiedad específica de cada enzima). las cuáles actúa la enzima, y normalmente indica el orden en el que cada enzima se
va agregando a la lista.
COMISIÓN ENZIMÁTICA (1964) – Unión Internal de Bioquímica y Biología
Molecular (IUBMB): nombre de completo no ambiguo y código numérico.
2: Clase a la cual pertenece la enzima. Indica el cambio químico global que realiza la
enzima sobre el sustrato.
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Ejemplo:
Ejemplos:
Enzimas relacionadas con las oxidaciones y las reducciones biológicas. Transferencia 3.- HIDROLASAS
de hidrógenos o e- .
Hay varias subclases: Poseen la capacidad de introducir los elementos del agua, H+ y -OH, en el sustrato
Deshidrogenasas y oxidasas importantes en los procesos oxidativos de la atacado, produciendo así su rompimiento
respiración celular
Peroxidasas usan agua oxigenada (H2O2) como oxidante Subclases importantes:
Hidroxilasas incorporan átomos de oxígeno en los sustratos Esterasas atacan diversas uniones éster
Fosfatasas enzimas encargadas de la eliminación de fosfato
Glicosidasas sobre compuestos glucosídicos
Enzimas activas sobre uniones peptídicas muy comunes en el aparato digestivo
2.- TRANSFERASAS
4.- LIASAS
Catalizan el traspaso de grupos químicos entre dos sustratos (excepto el hidrógeno)
Catalizan la introducción o la eliminación de un grupo químico a un doble enlace.
Principales grupos: Tienen varias subclases de acuerdo con la unión atacada y el grupo separado o
Metiltransferasas traspaso de grupos metilo entre 2 sustratos añadido:
Aciltransferasas catalizan el traspaso de grupos acilo Descarboxilasas aldehído-reductasas
Glucosiltransferasas catalizan el traspaso de residuos de azucares Cetoácido-liasa
Transferasas enzimas de la transferencia de grupos nitrogenados
Quinasas traspaso de grupos fosfatos por medio del ATP
5.- ISOMERASAS
6.- LIGASAS
Catalizan diversos tipos de isomerización (óptica, geométrica, funcional, de posición)
Intercorversión de isómeros Permiten la unión de 2 moléculas simultáneamente a la degradación del ATP u otro
enlace químico, con la liberación de la energía necesaria para la unión de dichas
Varias subclases: moléculas.
Racemasas responsables de racemización de aminoácidos
Epimerasas responsables de epimerización de azúcares Grupos importantes:
Isomerasas cis-trans modifican la configuración geométrica a Acetil coenzima A sintetasa formadora de acetil-CoA a partir del
nivel de un doble enlace acetato y coenzima A
Óxido-reductasas intramoleculares catalizan la interconversión de aldosas y Enzimas activadoras de aminoácidos
cetosas o cambian de lugar los dobles enlaces
Transferasas intramoleculares (mutasas) facilitan el traspaso de grupos
químicos de una parte a otra de la molécula
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PROPIEDADES
A. Velocidades de las reacciones que catalizan extraordinariamente elevadas
(aumento de la velocidad 105 veces mayor) REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
Una molécula de enzima no tiene porque actuar siempre a la
misma velocidad. Su actividad puede estar modulada por:
Cambios en el pH
Cambios en la temperatura
Presencia de cofactores
Las [sustrato] y [productos]
Presencia de inhibidores
Isoenzimas
B. Muy especificas para las reacciones que catalizan (extremadamente
selectivas; tipo de reacción, sustrato o conjunto pequeños de sustratos), poco
habitual productos secundarios.
C. Estructuras complejas
D. Pueden regularse
EFECTO DEL pH SOBRE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA EFECTO DEL pH SOBRE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
• Los enzimas poseen grupos químicos ionizables • La mayoría de enzimas son muy sensibles a los
(carboxilos -COOH; amino -NH2 ; Grupo R: tiol -SH; cambios de pH.
imidazol, etc.) en las cadenas laterales de sus Aas. • Desviaciones de pocas décimas por o del pH
óptimo pueden afectar drásticamente su actividad.
• Según el pH del medio, estos grupos pueden tener carga
eléctrica +, -, 0. • Pepsina gástrica tiene un pH óptimo de 2, la ureasa lo
tiene a pH 7 y la arginasa lo tiene a pH 10.
• Como la conformación de las proteínas depende, en • Ligeros cambios del pH pueden provocar la
parte, de sus cargas eléctricas, habrá un pH en el cual la desnaturalización de la proteína, los seres vivos han
desarrollado sistemas más o menos complejos para
conformación será la más adecuada para la actividad mantener estable el pH intracelular: Los
catalítica. Este es el llamado pH óptimo. amortiguadores fisiológicos.
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• En general, ↑ Temp. aceleran las Rxs químicas: 10 ºC • Temp. Óptima: Temp actividad catalítica máxima.
de incremento Vel. Rxn (↑ duplica).
• Por encima de esta, el aumento de Vel de Rx debido a la
• Rxs catalizadas por enzimas siguen esta ley general. temp es contrarrestado por la pérdida de actividad catalítica
debida a la desnaturalización térmica, y la actividad
, al ser proteínas, a partir cierta temp. (Desnaturaliza). enzimática decrece rápidamente hasta anularse.
EFECTO DE LOS COFACTORES SOBRE LA ACTIVIDAD EFECTO DE LOS COFACTORES SOBRE LA ACTIVIDAD
ENZIMÁTICA ENZIMÁTICA
• Casi un tercio de los enzimas conocidos requieren para • Grupos prostéticos: Si cofactores y coenzimas se
su función la presencia de sustancias no proteicas que encuentran unidos covalentemente al enzima.
colaboran en la catálisis: cofactores y coenzimas.
• Cofactores: Iones inorgánicos como el Fe++, Mg++, Mn++, • Holoenzima: La forma catalíticamente activa del enzima, es
Zn++ etc.. decir, enzima unida a su grupo prostético.
La Vel de Rx enzimática depende de la concentración de • Ciertas moléculas pueden inhibir la acción catalítica de un enzima:
son los inhibidores.
sustrato.
• Estos inhibidores bien pueden ocupar temporalmente el centro
activo por semejanza estructural con el sustrato original (inhibidor
La presencia de los productos finales puede hacer que competitivo) o bien alteran la conformación espacial del enzima,
la reacción sea más lenta, o incluso invertir su sentido. impidiendo su unión al sustrato (inhibidor no competitivo).
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óptima pH 1-5
-Trombina Protrombina Parte del sistema de coagulación
sanguíneo-
- Quitina sintasa** Zimógeno Implicada en la formación del septum
- El pepsinógeno es una proteína de masa molecular 40 kDa que
durante la división celular en las levaduras se auto-hidroliza al bajar el pH, eliminándose un péptido de
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* Dijkstra et al (1981) Nature 289, 604 ** Cabib (1976) Trends Biochem Sci. 1, 275 naturaleza básica de 44 AAs del extremo N-terminal.
* Los zimógenos tras un proceso de proteólisis parcial, en el duodeno, se * La transformación de los zimógenos o proproteasas en
transforman en las correspondientes enzimas activas. Estas enzimas tras proteasas activas la podemos representar esquemáticamente de
cumplir sus fines, se degradan completamente, por lo que no ponen en
la siguiente manera:
peligro el tejido intestinal.
Tripsinógeno
Enteopeptidasa
Enteropeptidasa
Quimotripsinógeno
Tripsina
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Acción enzimática
ESPECIFICIDAD
ENZIMA SUSTRATO
• Proporcionan una ruta de reacción que requiere de menos energía de activación a) La especificidad óptica; solo sobre isómeros de la
que la reacción sin catalizar serie L (catabolismo de aminoácidos), sobre los de
la serie D (metabolismo de carbohidratos)
• No altera el equilibrio si no que aumenta la velocidad hacia el equilibrio
b) Especificidad de grupo; sobre un grupo
• El equilibrio se alcanza en segundos o minutos en lugar de horas o días determinado de moléculas
Reacción en varios pasos, el paso o pasos con Ea más alta: ETAPA LIMITANTE
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ACCIÓN ENZIMÁTICA
ACCIÓN ENZIMÁTICA
ACCIÓN ENZIMÁTICA
TEORÍAS DE LA ACCIÓN ENZIMÁTICA
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3. ESTADO DE TRANSICIÓN
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X X CULTIVOS
ANIMALES
PLANTAS
MICROORGANISMOS
CELULARES
CULTIVOS CELULARES
Fácil manejo
Rendimiento
Estabilidad
ENZIMAS INTRACELULARES:
ENZIMAS EXTRACELULARES
Permanecen en el interior de la célula. Actúan sobre
sustratos de bajo peso molecular. Glucosa isomerasa, Sustratos de PM. Se sintetizan en
Glucosa oxidasa, Penicilin acilasa, -Galactosidasa grandes cantidades. Muy reguladas.
pullulanasa y Lactasa.
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MICROORGANISMOS: FUENTE DE
ETAPAS EN LA OBTENCIÓN DE ENZIMAS INDUSTRIALES
ENZIMAS
Enzimas hidrolíticas simples:
Selección de la fuente Proteasas, Amilasas, Pectinasas.
Producción de células con un alto nivel de la enzima Degradan polímeros naturales:
Rotura celular y eliminación de los restos celulares Proteínas, Almidones o Pectina.
Enzimas extracelulares.
(enzimas intracelulares)
Poco específicas.
Concentración y enriquecimiento Fácil extracción
Purificación con alta resolución (dependiendo de su Bajo costo
uso final)
Concentración y formulación del preparado
AMILASAS Amilasas
Producción de Cerveza Hornear pan
Reemplazo de malta por granos sin germinar El uso de enzimas en panadería se ha vuelto popular.
de maíz o arroz.
Prácticamente no contienen enzimas. Las amilasas aceleran la degradación del almidón, y así
[azúcar] en la masa Fermentación volumen
+ Enzimas: del pan.
Amilasas, Glucanasas y Proteasas (Hongos
y Bacterias).
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Extremoenzimas
A)Temperatura
- Psicrófilos
- Mesófilos
- Termófilo
- Hipertermófilos
B) Acidez y alcalinidad
• Acidófilos
• Alcalófilos
C) Disponibilidad de agua
- Sal: Halófilos y Halófilos extremos
- Azúcar: Osmófilos
- Secos: Xerófilos
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ENZIMAS
Microorganismos Acidófilos y
ENZIMAS
Obtención de enzimas industriales: procesos a partir de microorganismos
CINÉTICA ENZIMÁTICA
Estudia la velocidad de las reacciones catalizadas por enzimas
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[A]
1600 0,73 -0,31 1,37 1
A
2 2000 0,54 -0,62 1,85 Lineal (A)
Orden de
3,50
ln[A]
1/[A]
lnA 1/A
1,50
-0,50 Lineal (lnA) Lineal (1/A)
1,00 y = 0,0011x + 0,041
R² = 0,9022
-1,00 y = -0,0007x + 0,8581 0,50
R² = 0,9991
0,00
0 500 1000 1500 2000 2500 3000
-1,50
t (s) t (s)
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CONSTANTE Km
KM :indicador de la afinidad de
la enzima por el sustrato
Etapa Limitante
concentración de sustrato a la
ECUACIÓN DE MICHAELIS-MENTEN que la enzima tiene la mitad de la
velocidad máxima
Determinación KM es aproximado.
Gráfica de línea recta 3. La actividad específica es el número de unidades de enzima por miligramo
de proteína (U/mg prot) o por mililitro de disolución (U/mL).
La pendiente de la línea es
Km/Vmax
Si se conoce el peso molecular del enzima puro y el número de centros activos
La intersección en el eje vertical
es 1 / Vmax por molécula de enzima, las medidas de actividad enzimática permiten calcular
el número de recambio del enzima: número de reacciones elementales que
La intersección en el eje realiza el enzima por cada centro activo y por unidad de tiempo.
horizontal es – 1 / Km
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K M parámetro importante:
No Recambio ≡ KCAT de algunas enzimas KM es la concentración de sustrato para la cual la velocidad de
reacción es la mitad de la velocidad máxima.
ENZIMA SUSTRATO Kcat (s-1)
El valor de KM : afinidad del enzima por el sustrato: A menor KM
Catalasa H2O2 40.000.000 mayor afinidad del enzima por el sustrato, y a mayor KM menor
afinidad.
Acetil colinesterasa AcCoA 14.000
La KM del sustrato natural es menor que la de los sustratos
Anhidrasa carbónica HCO3
- 400.000 análogos.
1. Concentración de Enzima
3. Efecto del pH
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Inactiva Enzimas
Destruyen grupo funcional de E que es esencial para la actividad
Forman asociación No covalente pero ESTABLE
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Enzimas Enzimas
2. ¿Qué tipos de grupos funcionales esperaría que 3. Para una reacción catalizada por una enzima de
estuvieran involucrados en el enlazamiento de sustrato único, se determinaron las
piridoxal-5'-fosfato a las enzimas transaminasas representaciones de las dobles recíprocas para
que requieren a este como cofactor (Derivado de la tres diferentes concentraciones de enzima. ¿Cuál
vitamina B6)? Represente los grupos funcionales de las siguientes curvas (curvas 1, 2 ó 3), se
apropiados alrededor de este Cofactor. esperaría obtener para una enzima que obedece la
cinética de Michaelis-Menten? Explique.
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