Departamento de Ingeniería Bioquímica

Lab Diseño de Bioreactores

Determinación de parámetros para modelos de crecimiento celular

Carlos Alvarez-Vasco, Ph.D.

Universidad Icesi, Cali-CO. Marzo 23, 2018
 Modelo de una cinética enzimática.

La sala de informática 205C, esta disponible en los siguientes

horarios para que puedan practicar MATLAB:

Fecha Hora
Marzo 9 5-8pm
Marzo 23 5-8pm
Abril 6 5-8pm
Abril 20 5-8pm
Mayo 11 5-8pm

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 Modelo de una cinética de crecimiento celular.

THE FERMENTATION KINETICS OF

ETHANOL PRODUCTION BY Z. mobilis
Modelo propuesto por Lee y Rogers (1983).
Articulo original adjunto

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 Modelo de una cinética de crecimiento celular.

 Propósito: Modelo que describa comportamiento de

1. Producción de etanol
2. Consumo de sustrato
3. Producción de biomasa

Inicialmente se plantea una estructura general para el modelo

empírico de la cinética microbiana

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EXPLICACIÓN DEL DESARROLLO
DEL MODELO
 Suposiciones:

1. Los factores que afectan la cinética del proceso:

-Limitación de sustrato
-Inhibición por producto
-Inhibición por altas concentraciones de sustrato

2. Muerte celular despreciable

3. Mezcla perfecta (homogénea)

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 Estructura inicialmente propuesta para la cinética

dx s  K p  K i 
 m   x (1)
dt  
K s  s  K p  p  K i  s 

ds   1  dP   1  dx
     mx (2)
 
dt  Yp / s  dt  Yx / s  dt

dP s  K p '  K i ' 

 (q p ) m   x (3)
dt  
K s ' s  K p ' p  K i ' s 

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Estructura Final para la cinética

Cinética de Crecimiento celular:

dx s  . p  pi  K i  si 
(4)
 m 
 1 

  x
dt Ks  s  pm  pi  ( K i  si )  ( s  si ) 

La ecuación 4 esta sujeta a las siguientes restricciones:

 p  pi 
   0 si p  pi (5)
 pm  pi 
 p  pi  si p  pm (6) 7
   1
 p  p de Ingeniería Bioquímica
Departamento 4
 m i 
 Estructura Final para la cinética
Cinética de formación de etanol:

dp s  . p  p 'i  K ' i 
 (q p ) m ' 1  '  '  x
dt K s s p m  p 'i  K i  s 
(7)

La ecuación 7 esta sujeta a las siguientes restricciones:

 p  p 'i 
 ' ' 
0 si (8)
 p m  p i  p  p '
i

 p  p 'i  8
 ' ' 
Ingeniería
1 si (9)
4
Departamento de
 pm  pi 
Bioquímica p  p '
m
 Estructura Final para la cinética

Cinética de consumo de sustrato:

ds   1  P
 (10)
dt  Yp / s  t

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Tabla 1. Valor y significado de los parámetros empleados en el modelo de (Lee and Rogers 1983).
Parame Descripción Valor Fuente
tro
µm Velocidad especifica de crecimiento Celular máxima. 0.5h-1 Experimental
Ks Constante de limitación por sustrato para crecimiento Celular. 0.5g/l Asumido
Ki Constante de inhibición por sustrato para crecimiento. 220 g/l A.sensibilidad
Si Umbral de concentración de sustrato para crecimiento celular. 100g/l Experimental
Pi Umbral de concentración de etanol para 22g/l Experimental
crecimiento celular
Pm Máxima concentración de etanol para que haya crecimiento celular. 86g/l Experimental
(qp)m Velocidad especifica de producción de etanol máxima. 5.0g/gh Experimental

Ks’ Constante de limitación por sustrato para producción de etanol. 0.5g/l Asumido
Ki’ Constante de inhibición por sustrato para producción de etanol. 2000g/l A.sensibilidad
Pi’ Concentración umbral de etanol para la producción de etanol. 55g/l Experimental
P m’ Concentración de etanol máxima para que haya producción de etanol. 127g/l Experimental
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Yp/s Departamento
Rendimiento de de Ingeniería
etanol a partirBioquímica
del sustrato. 4 0.48g/g Experimental
FIGURAS 4 Y 5 PRESENTADAS EN
EL ARTÍCULO

Objetivo:

1)Reproducir las figuras 4 y 5 presentadas en el articulo

2) Proponer mejoras para determinar los parámetros Ki y

Ki’ utilizando herramientas matemáticas de optimización
numérica.

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FIGURAS 4 Y 5 PRESENTADAS EN
EL ARTÍCULO
Reproducir las figuras 4 y 5 presentadas en el articulo

-Se debe simular las ecuaciones 4, 7 y10 sujetas a las restricciones 5,

6, 8 y 9.

-Utilizando el valor de los parámetros mostrados en la tabla 1

-Una concentración inicial de sustrato de 250 g/l.

-Los valores experimentales se determinaron a partir de los datos

presentados en las figuras 4 y 5

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 Analisis de sensibilidad para el efecto de la constante de inhibición Ki
Analisis de sensibilidad para el efecto de la constante de inhibición Ki prima
250
250

200 200

150
Concentración (g/l)

Concentración (g/l)
150

100
Biomasa Biomasa
100
Etanol Etanol
Glucosa 50 Glucosa

50
0

0 -50
0 5 10 15 20 25 30 0 5 10 15 20 25 30
tiempo (h) tiempo (h)

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 FIGURAS 4 Y 5 PRESENTADAS EN
EL ARTÍCULO
Proponer mejoras para determinar los parámetros Ki y Ki’ utilizando
herramientas matemáticas de optimización numérica.

Deseamos ajustar un modelo matemático a un sistema minimizando la suma

de las diferencias cuadradas existentes entre el modelo y los datos
experimentales.

Deseamos determinar: θ=[Ki, Ki’] que minimicen la función de costo:

1 Nd
Fc ( )   [ S pred (t ;  )  S Obs (t )]2  [[ X pred (t ;  )  X Obs (t )]2  [[ Ppred (t ;  )  PObs (t )]2 (12)
2 1

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 FIGURAS 4 Y 5 PRESENTADAS EN
EL ARTÍCULO
Proponer mejoras para determinar los parámetros Ki y Ki’ utilizando
herramientas matemáticas de optimización numérica.

Dificultades:

-Los datos experimentales de X,P y S se presentan para diferentes tiempo:

Análisis de los datos de forma separada

-Las figuras 4 y 5 se elaboran con datos experimentales diferentes

Se define Fn de costo como la sumatoria de los errores de la figura 4 y 5:

Con el fin de minimizar los errores en ambas graficas
15
Se determina:
Departamento Ki=204 Ki’=2*106
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 FIGURAS 4 Y 5 PRESENTADAS EN
250
EL ARTÍCULO
Analisis de sensibilidad para el efecto de la constante de inhibición Ki

250
Analisis de sensibilidad para el efecto de la constante de inhibición Ki prima

200

200
Concentración (g/l)

150
150

Concentración (g/l)
Biomasa
100
Etanol 100
Glucosa
Biomasa
Etanol
50 50 Glucosa

0
0
0 5 10 15 20 25 30
tiempo (h)
-50
0 5 10 15 20 25 30
tiempo (h)

Determiacion de los Parametros optimos para la figura 4

250
Determiacion de los Parametros optimos para la figura 5
Biomasa 250
Etanol Biomasa
200 Glucosa Etanol
200 Glucosa
Concentración (g/l)

150

Concentración (g/l)
150

100
100

50
50

0 0
0 5 10 15 20 25 30 0 5 10 15 20 25 30
tiempo (h) tiempo (h)16
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 BIBLIOGRAFIA

Lee K.J. y Rogers P.L., The fermentation kinetics of ethanol production by

Zymomonas mobilis. Chemical Engineering Journal 27 (1983) pp 31-38.

Beers, K.J. Numerical Methods for chemical Engineering: Applications in

MATLAB, Cambridge University Press, 1ra ED. (2003)

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1. https://www.mathworks.com/videos/introduction-to-matlab-
81592.html

2. https://ocw.mit.edu/courses/mathematics/18-s997-introduction-to-
matlab-programming-fall-2011/the-basics/

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