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Las restricciones en el tamaño a través del cual pueden pasar las poblaciones son llamados cuellos
de botella. Un cuello de botella particularmente interesante cuando se produce una nueva
población se establece por un pequeño número de colonos, o fundadores --- a veces tan pocos
como un solo par de acoplamiento (o una sola hembra inseminadas, como en los insectos en el
que el esperma tienda de las mujeres). La deriva genética aleatoria que se produce a menudo se
llama un efecto fundador. Si la nueva población crece rápidamente a un tamaño grande, las
frecuencias de alelos (y por lo tanto heterocigosidad) probablemente no se alteran en gran
medida de las de la población de origen, aunque algunos alelos raros no se han realizado por los
fundadores. Si la colonia sigue siendo pequeña, sin embargo, la deriva genética va a alterar las
frecuencias alélicas y erosionar la variación genética. si la colonia persiste y crece, nuevas
mutaciones finalmente restaurar la heterocigosidad a niveles más altos (Figura 10.6)
Laboratorio poblaciones. Peter Buri (1956) describe la deriva genética en un experimento con
Drosophila melanogaster, inició 107 poblaciones experimentales de moscas, cada uno con 8
hombres y 8 mujeres, todos heterocigotos para dos alelos (bw y bw75) que afectan el color de ojos
(por el cual los tres genotipos son reconocibles), Así, la frecuencia inicial de bw75 fue de 0,5 en
todas las poblaciones, se propagan cada población durante 19 generaciones dibujando 8 moscas
de cada sexo al azar y transferirlos a un vial de alimentos frescos. (Así, cada generación –
Figura 10.6 Efectos de un cuello de botella en tamaño de la población sobre la variación genética, medida
por la heterocigosidad. La heterocigosidad se reduce más si el número de fundadores es menor (No = 2) que
si es más alto (n = 10; curva superior), y si la tasa de aumento de la población es menor (r = 0,1, la curva más
baja) que si es más alta (r = 1,0). Con el tiempo, la mutación proporciona una nueva variación genética, y el
aumento de heterocigosidad. (Después de Nei et a1. 1975.)
se inició con 16 moscas x 2 copias de genes = 32 copias del gen) La frecuencia de bw 75 se extendió
rápidamente hacia fuera entre las poblaciones (Figura 10.7).; después de una generación, el número de
copias bw75 varió de 7 (q = 7/32 = 0,22) a 22 (q = 0,69). Por la generación de 19,30 poblaciones habían
perdido el alelo bw75, y 28 habían convertido en fijo correspondiente; entre las poblaciones no fijadas, las
frecuencias de alelos intermedios fueron distribuidos bastante uniformemente. Los resultados bien
coincidían con las que se espera de la teoría de la deriva genética (véase la figura 10.4).
1. Aunque las 107 poblaciones comenzaron con alelos 16 bw75, en la generación de las poblaciones ya
variaron en frecuencia de los alelos.
2. Las primeras poblaciones que pierden el alelo bw75 aparece en la generación 6.
3. Después de 19 generaciones, las frecuencias de alelos (número de alelos bw7S) se habían vuelto
más uniformemente distribuida entre 0 y 1,0 (32 copias), y el alelo bw7S se perdió (0) o fijo (32) en
un número cada vez mayor de la población.
Las poblaciones naturales. Cuando describimos las características genéticas de las poblaciones
naturales, los datos por lo general no se basan en la manipulación experimental, ni tampoco por lo
general tienen información detallada sobre las historias de las poblaciones. Por lo tanto,
intentamos inferir las causas de la evolución (como la deriva genética o la selección natural)
mediante la interpretación de los patrones. Tales inferencias son posibles sólo sobre la base de las
teorías que nos dicen qué patrón para esperar si una u otra causa ha sido más importante.
Los niveles reducidos de la variación genética en las poblaciones que han experimentado los
cuellos de botella como el elefante marino del norte, pueden tener consecuencias importantes. La
fijación de alelos deletéreos, por ejemplo, puede reducir sunvival y reproducción, aumentando el
riesgo de extinción de la población. reducción de la viabilidad en una pequeña población de
ejemplo addersan Europea de la depresión endogámica-fue descrito en el capítulo 9. En casos
raros, sin embargo, la reducción de la variación genética en realidad puede beneficiar a una
población. La hormiga argentina (Linepithema humile) es relativamente poco común y coexiste
con muchas otras especies de hormigas en su Argentina natal, pero es altamente invasiva en
muchas partes del mundo a la que ha sido transportado accidentalmente por los seres humanos.
La teoría neutral de la evolución molecular sostiene que aunque una pequeña minoría de las
mutaciones en las secuencias de ADN o proteínas son ventajosas y están fijados por la selección
natural, y aunque muchas mutaciones no son ventajosos y son eliminados por la selección natural,
la gran mayoría de esas mutaciones que se fijan son efectivamente neutral con respecto a la
aptitud y están fijados por la deriva genética. De acuerdo con esta teoría, la mayor variación
genética en el nivel molecular, ya sea revelada mediante secuenciación de ADN o mediante la
enzima de electroforesis es selectivamente neutral y carece de significado adaptativo. Esta teoría,
por otra parte, sostiene que las sustituciones de evolución a nivel molecular avanzan a un ritmo
más o menos constante, por lo que el grado de diferencia en la secuencia entre las especies puede
servir como un RELOJ MOLECULAR, lo que nos permite determinar el tiempo de divergencia de las
especies (véase el Capítulo 2).
Es importante reconocer que la teoría neutral no se sostiene que las características morfológicas,
fisiológicas y de comportamiento de los organismos evolucionan por la deriva genética aleatoria.
Muchos -tal vez más, estas características pueden evolucionar principalmente por la selección
natural, y están basados en sustituciones de pares de bases que (de acuerdo con los neutralistas)
constituyen una fracción muy pequeña de los cambios en la secuencia de ADN. Por otra parte, la
teoría neutral reconoce que muchas mutaciones son perjudiciales y son eliminados por la
selección natural, por lo que contribuyen poco a la variación que observamos. Así, la teoría neutral
no niega el funcionamiento de la selección natural en algunos pares de bases o aminoácidos
diferencias. Se mantiene, sin embargo, que la mayor parte de la variación observamos a nivel
molecular, tanto dentro como entre las especies, tiene un efecto ligero sobre la aptitud, ya sea
porque las diferencias en la secuencia de pares de bases no se traducen en diferencias en el nivel
de proteína, o porque la mayoría las variaciones en la secuencia de aminoácidos de una proteína
tienen poco efecto sobre la fisiología del organismo.
Supongamos que se producen mutaciones en un gen a una velocidad constante de Ut por gametos
por generación, y que debido a la gran cantidad de sitios mutables, cada mutación constituye una
nueva secuencia de ADN (o alelo, o haplotipo). De todas estas mutaciones, una fracción (f0) son
efectivamente neutral, por lo que la tasa de mutación neutral, u0 = f0Ut es menor que la tasa de
mutación total de, ut Por efectivamente neutral, nos referimos a que el alelo mutante es tan
similar a otros alelos en su efecto sobre la supervivencia y la reproducción (es decir, la aptitud)
que los cambios en su frecuencia se rigen por la deriva genética por sí sola, no por la selección
natural. (Es, por supuesto, es posible que la mutación afecta a la aptitud alguna pequeña medida,
como veremos en el capítulo 12. A continuación, la selección natural y la deriva genética operar
simultáneamente, pero debido a la deriva genética es más fuerte en en las poblaciones pequeñas
que en grandes, los cambios en la frecuencia del alelo mutante se regirán casi por completo por la
deriva genética si la población es lo suficientemente pequeño. Por lo tanto, un alelo particular
puede ser efectivamente neutral, con relación a otro alelo, cuando la población es pequeña, pero
no cuando la población es grande.)
La tasa de origen de alelos efectivamente neutros por mutación, U0, depende de la función del
gen. Si muchos de los aminoácidos en la proteína que codifica no puede alterarse sin afectar
seriamente a una función, tal vez importantes porque afectan a la forma de una proteína que se
une a ADN o a otras proteínas, entonces la mayoría de las mutaciones en el gen será perjudicial en
lugar de neutral, y u0 será mucho más baja que la tasa de mutación total de, se dice que ut Tal
locus tener muchas limitaciones funcionales. Por otra parte, si la proteína puede funcionar bien a
pesar de cualquiera de los muchos cambios de aminoácidos (es decir, es menos limitada), u0 será
mayor. Dentro de las regiones de ADN que codifican para las proteínas, esperaríamos que la tasa
de mutación neutra para ser más alto en las posiciones de tercera base de par en los codones y la
más baja en las posiciones segunda base de par porque esas posiciones tienen la redundancia alta
y más baja, respectivamente (véase la Figura 8.2). Esperaríamos que las limitaciones sean menos,
o incluso inexistente, y la tasa de mutación neutra a ser más grande, para las secuencias de ADN
que no se transcriben y no tienen ninguna función conocida, tales como intrones y pseudogenes.
Consideremos ahora una población de tamaño efectivo Ne en el que la tasa de mutación neutra en
un locus es u0 por gametos por generación (figura 10.9). El número de nuevas mutaciones es, en
promedio, u0 x 2Ne ya que hay 2NE copias de genes que podrían mutar. A partir de la teoría de la
deriva genética, hemos aprendido que la probabilidad de que una mutación será fijado por la
deriva genética es su frecuencia, p, que es igual a 1 / (2Ne) para una mutación recién surgido. Por
lo tanto el número de mutaciones neutras que surgen en cualquier generación y algún día será
fijado es
Dado que, en promedio, tomará generaciones 4NE para tales mutaciones para llegar a la fijación,
aproximadamente el mismo número de mutaciones neutrales debe fijarse en cada generación: la
tasa de fijación de mutaciones es teóricamente constante, y es igual a la tasa de mutación neutra
baldosas. esta es la base theoritical del reloj molecular (véase el capítulo 2). Observe que,
sorprendentemente, la tasa de sustitución no depende del tamaño de la población: cada mutación
deriva hacia una fijación más lentamente si la población es grande, pero esto es compensado por
el mayor número de mutaciones que surgen.
a. Surgen nuevos alelos horas extras. La mayoría se perdieron pronto, pero uno puede
aumentar la fijación por la deriva genética.
b. Durante un tiempo más largo, las mutaciones sucesivas son fijos.
c. El tiempo requerido para la fijación (f) es más largo en poblaciones más grandes.
Figura 10.9 Evolución de la deriva genética. Cada gráfico traza el número de copias (n) de una
mutación en una población diploide de N individuos (copias de genes 2N) frente al tiempo. (A) La
mayoría de nuevas mutaciones se pierden poco después de que se presenten, pero de vez en
cuando un alelo aumenta hacia la fijación por la deriva genética. El tiempo promedio requerido
para tal fijación es t. (B) durante un tiempo más largo, las mutaciones sucesivas quedar fijado en
este Iocus. C) El tiempo necesario para la fijación es más largo en poblaciones más grandes. Por lo
tanto, en cualquier momento habrá más alelos neutros en una población mayor. (Después de
CRMV y Kimura 1.970).
Esta fórmula debe de ser matizada, sin embargo. Durante un tiempo suficientemente largo,
algunos sitios experiencia repetida sustituciones de bases: un sitio particular puede experimentar
sustitución de, por ejemplo, de A a C y luego de C a T o incluso volver a A. Por lo tanto el número
observado de diferencias entre las especies será menor que el número de sustituciones que han
ocurrido. A medida que el tiempo desde la divergencia se hace mayor, el número de diferencias
comienza a meseta, como es evidente por el número de diferencias por pares de bases entre el
ADN mitocondrial de diferentes taxones de mamíferos (Figura 10.10; véase también la Figura
2.15). En la figura 10.10, cada punto representa un par de taxones para los que la edad del
ancestro común se ha estimado a partir del registro fósil. El número de diferencias de pares de
bases se incrementa linealmente durante unos 5-10 millones de años, y luego comienza a
estabilizarse; después de unos 40 millones de años, poco más divergencia es evidente debido a las
"múltiples golpes", es decir, sustituciones sucesivas. A partir de la parte lineal de la curva, la tasa
de mutación puede ser fácilmente calculada, suponiendo que todos los pares de bases diferentes
representan sustituciones neutras (en la figura 10.10, que es de unos 0,01 mutaciones por par de
bases por linaje por millón de años, o aproximadamente 10-5 por año). Como la curva comienza a
nivelarse, sin embargo, la tasa puede estimarse solamente por hacer correcciones para múltiples
sustituciones (Li 1997). Los datos de los taxones en la meseta no se pueden utilizar para estimar la
tasa de sustitución. Dentro de una población, no hay rotación, o flujo, de alelos o haplotipos
(véase la figura 10.9). Como uno u otro alelo se acerca fijación (aproximadamente cada
generaciones 4N, en promedio), otros alelos se pierden. Pero los nuevos alelos neutros
continuamente surgen por mutación, y aunque muchos se pierden inmediatamente por la deriva
genética, otros se desvían a una mayor frecuencia y persisten durante algún tiempo en un estado
polimórfico antes de que se pierdan o fijos. Aunque la identidad de los varios o muchos alelos
presentes en la población cambia con el tiempo, el nivel de variación alcanza un equilibrio cuando
la velocidad a la que surgen alelos por mutación está equilibrada por la velocidad a la que se
pierden por la deriva genética. Este nivel de equilibrio de la variación, representada por la
frecuencia de heterocigotos, H, es mayor en una población grande que en una pequeña. Se puede
demostrar matemáticamente que en el equilibrio,
(Figura 10.11). Por ejemplo, dada la tasa de mutación observada para alozimas, 10-6 por gametos
(Voelker y aJ. 1980), la frecuencia de equilibrio de heterocigotos sería 0,004 si el tamaño efectivo
de la población N, eran 1000, pero sería 0.50 si no eran 250.000.
Figura 10.10 El número de diferencias de pares de bases por sitio entre el ADN mitocondrial de los
pares de taxones de mamíferos, representada frente a la hora prevista, ya que su antepasado
común más reciente. (Después de Brown et al. 1979.)
Según la teoría neutral, la tasa de sustitución de alelos con el tiempo y el nivel de equilibrio de
heterocigosidad son tanto proporcional a la tasa de mutación neutral, uo. Si, debido a las
diferencias en la restricción u otros factores, distintos tipos de secuencias de ADN o de los sitios de
pares de bases difieren en su tasa de mutación neutra, esas secuencias o sitios que difieren más
entre especies relacionadas también deben mostrar mayores niveles de variación dentro de las
especies. Es decir, no debe haber una correlación positiva entre la heterocigosidad en un locus y
su tasa de evolución. John McDonald y Kreitman Martin (1991) aplicado este principio en su
análisis de secuencias de ADN de 6 a 12 copias de la región de codificación del gen Adh (alcohol
deshidrogenasa) (ver figura 9.14) en cada uno de tres especies estrechamente relacionadas de
Drosophila. sitios polimórficos (diferencias dentro de las especies) y sustituciones (diferencias
entre especies) fueron clasificados como sinónimo o amino ácido-sustitución (no sinónimos). Si la
tasa de mutación neutral es uR para los cambios de recambio y us para cambios sinónimos, a
continuación, de acuerdo con la teoría neutral, la relación de sustitución a las diferencias
sinónimos debe ser el mismo--UR:US--tanto para los polimorfismos y sustituciones, si es que el
reemplazo los cambios están sujetos únicamente a la deriva genética. Los datos (Tabla 10.2)
mostraron, sin embargo, que sólo el 5 por ciento de los polimorfismos, pero completamente 29
por ciento de las sustituciones que distinguen especies, son cambios de recambio. McDonald y
Kreitman consideraron que este resultado era una evidencia de que la evolución de sustituciones
sustitutivas de aminoácidos es un proceso adaptativo gobernado por la selección natural. Si la
mayoría de las sustituciones de reemplazo son ventajosas en lugar de neutrales, aumentarán en
frecuencia y se fijarán más rápidamente que por deriva genética sola. Por lo tanto, pasan menos
tiempo en un estado polimórfico que los cambios selectivamente neutros, y por lo tanto
contribuirán menos a la variación polimórfica dentro de las especies.
Recordemos de nuestro análisis de los usos de los datos moleculares en la inferencia filogenética
(véase el capítulo 2) que la tasa de nucleótidos o la sustitución de aminoácidos se puede estimar a
partir del número de secuencias diferencias entre las especies de dos maneras. En primer lugar, se
puede estimar una tasa absoluta mediante una calibración basada en la evidencia fósil del tiempo,
ya que dos o más taxones divergieron de su antepasado común (véase la figura 2.13). En segundo
lugar, las tasas relativas de evolución entre los diferentes linajes se pueden estimar simplemente a
partir del número de diferencias que se han acumulado en cada miembro de un grupo
monofilético, en relación con un grupo externo (véase la figura 2.14). La secuenciación del ADN ha
proporcionado una gran cantidad de datos sobre las tasas de evolución molecular. Estos datos han
proporcionado pruebas de que la mayoría de la evolución de la secuencia de ADN, aunque no
todos, ha sido neutra. En primer lugar, la tasa de sustituciones sinónimas es generalmente mayor
que la tasa de sustituciones de sustitución, como en varios genes de los seres humanos frente a los
roedores (Tabla 10.3). Es decir, las sustituciones ocurren con más frecuencia en las posiciones de
la tercera base en los codones y menos frecuentemente en las posiciones de la segunda base. En
segundo lugar, las tasas de sustitución son más altas en los intrones que en las regiones
codificantes del mismo gen, y aún más en pseudogenes, los genes no funcionales relacionados en
secuencia a los genes funcionales (Figura 10.12). Tercero, algunos genes, como los genes de
histonas, evolucionan mucho más lentament Los genes que evolucionan más lentamente son
aquellos que se cree que están más fuertemente limitados por su función precisa. Un ejemplo
notable es el de la hormona peptídica insulina, que se forma por el empalme de dos segmentos de
una cadena de proinsulina, cuyo tercer segmento (el péptido C) se elimina, aparentemente no
desempeñando otro papel que en la formación de la hormona madura Cadena de insulina. Entre
los mamíferos, la tasa media de sustitución de aminoácidos ha sido 6 veces mayor en el lugar del
péptido C que en los loci que codifican las otras porciones de proinsulina (Kimura 1983). Estas
clases de evidencia indican que la tasa de evolución es mayor en las posiciones de ADN que,
cuando se alteran, son menos propensas a afectar la función, y por lo tanto menos probable para
alterar la aptitud del organismo. Esta conclusión proporciona un fuerte apoyo a la teoría neutral. e
que otros (Tabla 10.3). El apoyo a la predicción de la teoría neutraI de que las tasas de evolución
de la secuencia debe ser constante entre los linajes filéticos es más equívoca: algunas tasas han
sido constantes y otras no. Por ejemplo, las tasas de sustitución sinónima han sido
aproximadamente las mismas en los linajes que condujeron a roedores, primates y artiodáctilos
(mamíferos ungidos con pezuña, como ovejas y cerdos), basado en la prueba de tasa relativa
(Figura 10.BA). Sin embargo, las sustituciones no sinónimas se han producido a una tasa
significativamente inferior en los primates que en los otros dos órdenes, y los roedores han
mostrado la tasa más alta (Figura 10.13B). La constancia de las sustituciones sinónimas, que son
presumiblemente neutras, implica que la tasa total de mutación (ut) ha sido la misma, por unidad
de tiempo, en estos linajes. Si es así, entonces la tasa más alta de sustituciones no sinónimos en
roedores podría ser debido a Selección positiva de mutaciones ventajosas o tamaños de población
eficaces más bajos, lo que haría que algunas mutaciones ligeramente deletéreas fueran neutrales
de manera efectiva. Este es sólo uno de muchos ejemplos de diferencias en la tasa de evolución de
secuencia entre los taxones superiores. Por ejemplo, las secuencias de ADN mitocondrial han
evolucionado más lentamente en las tortugas que en otros vertebrados (Avise et al., 1992) Las
causas de la variación en las tasas de evolución de la secuencia todavía no se entienden
completamente.
TABLA 10.2 Sustitución (no sinónimos) y sustitutos y polimorfismos sinónimo dentro y entre tres
especies de Drosophila ·
TABLA 10.3 Tasas de sustituciones sinónimas y sustitutivas (no sinónimos) En algunos genes
codificadores de proteínas, calculados a partir de la divergencia entre humanos y varias especies
de roedores
La tasa es el número de sustituciones por par de bases por 104 años. Se supone un tiempo de
divergencia de 80 millones (8 x 107) años entre humanos y roedores. Tenga en cuenta que las tasas
de reemplazo varían mucho más que las tarifas sinónimas.
Figura 10.13 Constancia e inconstancia en la velocidad de evolución de la secuencia. El número de
sustituciones de nucleótidos en 14 genes nucleares entre marsupiales (M), roedores (R), primates
(P) y artiodáctilos (A) está representado por las longitudes de rama, que son proporcionales al
número de sustituciones por 100 pares de bases. (A) Las sustituciones sinónimas no han ocurrido
más rápido en el linaje de los roedores (28,0) que en los linajes que condujeron a los primates
(12,3 + 17,6 = 29,9) o artiodáctilos (12,3 + 17,5 = 29,8). (8) Las sustituciones sin sinónimos han
ocurrido en una raza de higner en roedores (8.9) que en el linaje del antepasado primate de
roedor a los primates modernos (1.2 + 5.7 = 6.9). La tasa ha sido menor en los primates (5.7) que
en los artiodáctilos (7.3). En ambos diagramas, los marsupiales son un outgroup, y las sustituciones
a lo largo de esta rama no se pueden dividir en los betvveen el linaje que lleva a los marsupiales y
el linaje que conduce a mamíferos placentarios. (Alter Eosteol et Collett 1994.)