ESTRUCTURA DE LOS

ÁCIDOS NUCLEICOS
GENOMAS
EXPRESIÓN GÉNICA
- QUE SABES DE LOS ÁCIDOS NUCLÉICOS?

- TIPOS DE ÁCIDOS NUCLÉICOS?

- DIFERENCIAS ESTRUCTURALES?
 Medicina Química

Biología

DOGMA DE LA
BIOLOGÍA
 ELEMENTO TRANSFORMADOR
Que sucede?

Streptococcus neumoniae
MATERIAL HEREDITARIO: AISLADO Y ANALIZADO
COMPONENTES BÁSICOS DE LOS ÁCIDOS NUCLÉICOS

ESTRUCTURA
ASIMÉTRICA

ESTRUCTURA
SIMÉTRICA
TIPOS DE ÁCIDOS NUCLÉICOS
Diferencia???
 AZÚCARES DE LOS ÁCIDOS NUCLÉICOS?

PENTOSAS
DNA

RNA
AZUCAR VS AISLAMIENTO DE ÁCIDOS NUCLÉICOS
POR ULTRACENTRIFUGACIÓN
AZUCAR VS AISLAMIENTO DE ÁCIDOS NUCLÉICOS
POR ULTRACENTRIFUGACIÓN (velocidad?)
BASES NITROGENADAS EN LOS ÁCIDOS NUCLÉICOS
COMPONENTE ESTRUCTURAL BÁSICO:
NUCLEÓSIDO VS NUCLEÓTIDO
SÍNTESIS DE ÁCIDOS NUCLÉICOS
UNIÓN AZUCAR + BASE NITROGENADA: dehidratación

Adedina
NUCLEÓSIDO + FOSFATO: dehidratación
FORMACIÓN DE NUCLEÓTIDO
ENLACE FOSFODIESTER: 5´ 3´

5’-fosfato SIEMPRE
Los nucleotidos
se añaden al
extremo 3’-OH

- H2O

3’-hidroxilo

- H2O

- 2Pi
 GEOMETRÍA UNION PURINA :: PIRIMIDINA

Análisis químico de la
composición en bases
nitrogenadas

Puentes de hidrógeno
LA DOBLE HÉLICE:
GEOMETRÍA DE LOS PUENTES DE HIDRÓGENO
DOBLE CADENA DEL ADN: ANTIPARALELA (5´ 3´)
5’-fosfato 3’-hidroxilo

3’-hidroxilo 5’-fosfato
 TRES TIPOS DE CONFORMACIONES

75 % humedad
Contraiones Na+, K+
11 pb giro derecho
23 Ȃ diámetro

TIPO B
92 % humedad
Baja fuerza iónica
10 pb giro derecho

TIPO B TIPO A TIPO Z

DNA-DNA DNA-RNA Secuencias G:C
RNA-RNA Contraiones Na+, K+
12 pb giro izquierdo
 DNA: ESTRUCTURA HELICOIDAL
SURCO MAYOR Y SURCO MENOR

Patrón de difracción de Rayos X

Giro dextrógiro
Rosalind Franklin
SURCO MAYOR Y MENOR: ACCESO A PROTEÍNAS
EL ADN ESTA SUPERENROLLADO

El DNA está superenrrollado

negativamente
E. coli, genoma = 4.600.000
Relajado = 1mm
(célula = 2µm)

cromosoma en 50 dominios
superenrrollados, unidos a proteínas
EL ADN ESTA EMPAQUETADO EN EUCARIOTES
EL ADN ESTA SUPERENROLLADO
PROCARIOTAS vs EUCARIOTAS?
 BIOSÍNTESIS DE LOS ÁCIDOS NUCLÉICOS

DNA polimerasa I

T7 DNA polimerasa
 BIOSÍNTESIS DE LOS ÁCIDOS NUCLÉICOS
DNA polimerasas
ENZIMAS EN LA REPLICACIÓN:
procariotes - Cadena codificante
- Cadena rezagada

- Helicasa
- Primasa
- DNA polimerasa III

E. coli, 1.000 nt/segundo

 REPLICACIÓN DEL DNA
DNA polimerasas

•Añaden nucleótidos al
extremo 3’-OH preexistente
•Nunca inician cadenas
nuevas
•Debe existir un cebador o
iniciador = RNA
 Replicación cadena rezagada

Fragmentos
de OKAZAKI

DNA polimerasa III + DNA polimerasa I + Ligasa

 BIOSÍNTESIS DE LOS ÁCIDOS NUCLÉICOS
Reparación:
polimerasa 5’->3’ (II)
exonucleasa 3’->5’
Reparación de errores de la replicación (10-8 - 10-11)

5’->3’
 EL REPLISOMA

Lagging
Dirección strand
de avance
de la replicación

Leading
strand
Helicasa + Primasa + DNA polimerasa III + Proteinas SSB (estabilizar)
BIOSÍNTESIS CONSERVATIVA O
SEMICONSERVATIVA DE LOS ÁCIDOS NUCLÉICOS?

Gradiente de CsCl
 EL DOGMA DE LA BIOLOGÍA ?

Procariotes
Vs
Eucariotes?
 PROCARIOTAS vs EUCARIOTAS
ORGANIZACIÓN GENÓMICA

Regiones intergénicas?
Splicing?
 DIFERENTES TIPOS DE ARN

Transcripción
DNA RNA
1)tRNA
2)rRNA
3)snRNA, scRNA
4)mRNA
Traducción
Proteína

mRNA, hnRNA es el único tipo de RNA celular que se traduce a proteínas

hnRNA = Pre mRNA en eucariotas (inmaduro), no siempre proteínas
snRNA = proceso de splicing (intrón-exón)
scRNA = transporte de proteínas
RNA ribosómico (rRNA)
Esencial para síntesis protéica

RNA = 60% peso del ribosoma

Eucariotas: 60S + 40S = 80S

Procariotas: 50S + 30S = 70S
Eucariotas: 5S, 5.8S, 18S, 28S
RNA ribosómico (rRNA)
Identificación de microorganimos
TRANSCRIPCIÓN EN PROCARIOTAS
ARN polimerasas y Factor sigma
TRANSCRIPCIÓN EN PROCARIOTAS
ARN polimerasas y Factor sigma

+NTPs, no hace falta cebador

RNA POLIMERASA
RNA polimerasa I, sintetiza el rRNA (ribosomal)
RNA polimerasa II, sintetiza el mRNA (mensajero)
RNA polimerasa III, sintetiza el tRNA (transferencia)

II

III
 INICIO DE LA TRANSCRIPCIÓN
REGIONES PROMOTORAS

E. coli, 7s
B. subtilis 17s
a,a,b,b’

Caja TATA / Pribnow = -10

Caja -35
FIN DE LA TRANSCRIPCIÓN
REGIONE TERMINADORA
HORQUILLAS DE TERMINACIÓN:
secuencias palíndrome

1, 2, 3, ….. 10
PROCESAMIENTO (splicing) DEL mRNA EN EUCARIOTES

¿ribozimas?

Se añaden Cap y Poli A

TRADUCCIÓN: reconocimiento codón-anticodón

3’ 5’
RNA de transferencia (tRNA)
73-93 nt, algunos modificados
TRADUCCIÓN

Secuencia
Shine-Dalgarno
AGGAGG

Sitios en el ribosoma
E= salida (exit)
P= peptídico
A= aceptor
Factores de elongación

Requiere GTP

Factores de liberación
POLISOMAS
 Código genético
Combinaciones vs No aminoácidos
U C A G
UUU Phe (F) UCU Se r (S) UAU Tyr (Y) UGU Cys (C)
U UUC Phe (F) UCC Ser (S) UAC Tyr(Y) UGC Cys (C)
UUA Leu (L) UCA Ser (S) UAA Ter UGA Ter
UUG Leu (L) UCG Ser (S) UAG Ter UGG Trp (W)
CUU Leu (L) CCU Pro (P) CAU His (H) CGU Arg (R)
C CUC Leu (L) CCC Pro (P) CAC His (H) CGC Arg (R)
CUA Leu (L) CCA Pro (P) CAA Gln (Q) CGA Arg (R)
CUG Leu (L) CCG Pro (P) CAG Gln (Q) CGG Arg (R)
AUU Ile (I) ACU Thr (T) AAU Asn (N) AGU Ser (S)
A AUC Ile (I) ACC Thr (T) AAC Asn (N) AGC Ser (S)
AUA Ile (I) ACA Thr (T) AAA Lys (K) AGA Arg (R)
AUG Met (M) ACG Thr (T) AAG Lys (K) AGG Arg (R)
GUU Val (V) GCU Ala (A) GAU Asp (D) GGU Gly (G)
G GUC Val (V) GCC Ala (A) GAC Asp (D) GGC Gly (G)
GUA Val (V) GCA Ala (A) GAA Glu (E) GGA Gly (G)
GUG Val (V) GCG Ala (A) GAG Glu (E) GGG Gly (G)

No polar Ionizable (básico)

No ionizable (polar) Ionizable (ácido)
ATG = inicio TGA = terminación
Marco abierto de lectura (ORF)
ATG = Met
OPERON Lac
Bacterias

Estado no inducido Estado inducido

Regulación positiva
Represor desactivado por sustrato
 Operón de biosíntesis del triptófano (Trp)

Regulación negativa

Co-represor: Trp

Represor activado por sustrato

 PRIMER EJERCICIO
ESTRUCTURA DE DNA Y GENOMAS
PROCARIOTAS vs EUCARIOTAS
TERMINACIÓN DE LA TRANSCRIPCIÓN

Proteína Rho, se une al RNA y lo disocia del

complejo DNA-RNApolimerasa

Región rica en GC segida de región rica en AT

En eucariotas: procesamiento del 3’ del RNA

¿Cómo se replican los elementos genéticos lineales?
Recircularizar, unión de varias moléculas, utilizar
proteínas, telomerasa…
 Aminoacyl-tRNA
sintetasa

aa + ATP

aa-AMP + PPi

aa-AMP + tRNA

aa-tRNA + AMP