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Module de Biophysique
Faculté de Médecine
ALGER I – CENTRE MAHERZI / ZIANIA
UNIVERSITE D’ALGER
e-mail : biophysique_facmed-alger@hotmail.com
Professeur M. CHEREF
Introduction et définitions
AGITATION THERMIQUE
FORCES D’ATTRACTION
ENTRE PARTICULES FORCES DE REPULSION
INTERMOLECULAIRES
ATTRACTION REPULSION
ETAT DE LA MATIERE
FORCES D’ATTRACTION
Etat solide
Etat gazeux
définitions
DIFFERENCIATION
ENTRE
SOLUTION ET SUSPENSION
caractérisation
définitions (1)
Concentration pondérale Cp
Elle traduit le rapport de la masse du soluté mS au volume V de la
solution :
Cp = mS / V
Elle est souvent exprimée sous la forme d’une masse du soluté dans le
volume unité de la solution (g/l).
Remarques :
Pratique d’emploi mais peu satisfaisante théoriquement :
- V dépend de la température
- V n’est pas forcément égal à la somme des volumes de constituants (contraction ou
dilatation selon la nature attractive ou répulsive des molécules des substances mélangées)
définitions (2)
Remarques :
- La concentration molaire a pour dimension L-3 .
- L’unité de volume est souvent le litre.
définitions (3)
Remarque :
- La concentration osmolaire est égale à la concentration molaire pour les molécules dites
neutres (glucose, urée,…).
définitions (4)
mL = n / M
Remarques :
Cette manière d’exprimer la concentration permet de s’affranchir des variations dans le
volume final. La molalité a pour dimension les moles/kilogrammes [mol/kg].
Elle intervient directement dans les relations de Fick (diffusion), de van’t Hoff (pression
osmotique, ou de Donnan (équilibre électro-diffusif)
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définitions (5)
définitions (6)
Fraction molaire
définitions (7)
La concentration équivalente
Afin d’apprécier le nombre de charges électriques par unité de volume
de solution, on définit la concentration équivalente qui s’exprime comme
le produit de la concentration molaire des ions présents dans la solution
par la valence de celui-ci
Nature de la solution :
idéale ou réelle, diluée ou concentrée
définition et caractérisation
Remarque :
Une solution tendra vers la solution dite idéale lorsque celle-ci sera
suffisamment diluée :
le nombre d’interactions soluté-solvant et soluté-soluté négligeables
devant le nombre d’interactions solvant-solvant.
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SOLUTION IDEALE
DEVELOPPEMENT THEORIQUE
SOLUTION REELLE
Solution concentrée :
– le volume du (ou des) soluté(s) n’est plus négligeable devant celui
du solvant.
Solution diluée :
– La concentration du ou des soluté(s) est très faible voire
négligeable devant celle du solvant.
Remarque :
Par la caractérisation de la conductivité équivalente, les lois applicables aux
solutions diluées peuvent être appliquées également aux solutions concentrées.
Solutions : Classification
Solutions macromoléculaires
Définition - Caractérisation
COMPORTEMENT ET USAGES
ETUDE PHYSICOCHIMIQUE
DE
MACROMOLECULES ARTIFICIELLES
AIDE CONSIDERABLE
A L’ETUDE ET A LA COMPREHENSION
DES MACROMOLECULES DITES BIOLOGIQUES
acides nucléiques, protéines, polyosides, copolymères biologiques
Définition (1)
MACROMOLECULES
Définition (2)
MACROMOLECULES
BIOPOLYMERES
- simples: formés d’unités monomériques identiques (même
taille et même poids), la chaîne polymérique est uniforme
(oligomère). exemples : amidon, glycogène
HOMOPOLYMERES
complexes: formés de plusieurs chaines oligomériques
identiques, cas des macromolécules à conformation
quaternaire. exemples : hémoglobine, collagène
HOMOPOLYMERES
HETEROPOLYMERES
SOLUTIONS MONODISPERSES
SOLUTIONS HETERODISPERSES
DEPENDANCE FORTE
CONCEPT DE CONFORMATION
Préciser les arrangements des différents monomères, les uns par rapport
aux autres
STRUCTURE PRIMAIRE
STRUCTURE SECONDAIRE
STRUCTURE TERTIAIRE
STRUCTURE QUATERNAIRE
DÉNATURATION TRANSCONFORMATION
Dénaturation :
- Les différentes structures sont maintenues par de nombreuses liaisons
possédant individuellement une énergie peu élevée ;
- pH
une élévation du pH au dessus du pK des fonctions basiques ou une diminution au dessous de ce pK
des groupements acides neutralise ces derniers et annule les forces d’interaction électrostatiques
entrainant une dénaturation de la protéine
- Force ionique
la concentration en électrolyte modifie la charge des macromolécules donc toutes les forces
électrostatiques qui sont mises en jeu dans le maintien de leur structure
- Pression
des pressions élevées (plusieurs MPa) entraînent des dénaturations irréversibles des protéines.
- Agents chimiques
oxydants et réducteurs : Ils modifient la structure chimique des monomères. Les dénaturations
provoquées sont souvent irréversibles. Exemples d’application : antiseptiques,…
Solutions macromoléculaires
Propriétés - Caractérisation
RT - c = concentration pondérale
π=c� - R = constante des gaz parfaits
M - M = masse molaire
Explicitation :
Van’t Hoff écrit l’expression de la pression osmotique, en faisant l’analogie
avec les gaz parfaits.
- Notion de sédimentation
Processus physique simple qui facilite la séparation à partir de phases différentes, non
miscibles, et de masses volumiques différentes
- solide – liquide :
phénomène de précipitation (le solide migre et se dépose au fond du contenant
- liquide – liquide :
phénomène de décantation (le liquide de masse volumique plus élevée sédimente
kT
D=
f
- D = coefficient de diffusion (Il dépend de la température et du coefficient de friction)
- f = coefficient de friction (Il dépend de la forme de la macromolécule et de la viscosité η du milieu
dans lequel celle-ci se déplace).
Dans le cas où la macromolécule serait considérée comme sphérique (loi de Stokes) : f = 6πηr
Remarque : une macromolécule atteint rapidement une vitesse limite en raison des
frottements qu’elle subit de la part des autres molécules.
- Notion de centrifugation
Il est souvent utile d’accélérer le processus de sédimentation en modifiant l’accélération
(exemple de la pesanteur)
S = v / ω²r
Remarque : Cette caractéristique dépend de la masse molaire et du coefficient
de friction (l’objectif peut être ici de déterminer la masse molaire M)
Phénomène de viscosité
- Notion de viscosité intrinsèque η
Elle s’exprime comme :
η = limite (pour c tendant vers 0) de (η-η0 / η0)
η0 est la viscosité du solvant et c la concentration pondérale de la macromolécule
- Relation d’Einstein :
pour des particules rigides et sphériques, en concentration faible, la viscosité intrinsèque
s’écrit :
η=ν/ρ
ν est l’incrément de viscosité (qui vaut 2,5 pour une particule sphérique) et ρ la masse volumique de la
particule considérée
Principe BIOPOLYMERES
capacité
d’absorber et d’émettre de la lumière
spectres
Absorption de la lumière
la quantité de lumière absorbée dépend :
- de la longueur du trajet parcouru par le rayonnement lumineux qui traverse la particule
- de la concentration de la solution
- du coefficient d’extinction ε (loi de Beer Lambert)
Remarques : cette loi n’est valable que pour les solutions diluées
ε = caractéristique de la molécule étudiée (à longueur d’onde donnée)
Applications
Introduction
DIFFUSION
FILTRATION
OSMOSE
CRYOSCOPIE
DIFFUSION
MELANGE
(dû à l’agitation thermique des molécules)
X DEBIT DE DIFFUSION
rigoureusement
x+dx niveau 2
O 𝛛𝛛𝐂𝐂
S
Flux de substance JD = − 𝐃𝐃 �
𝛛𝛛𝐱𝐱
Flux de substance JD : quantité de matière qui passe d’un compartiment à un autre, par unité de surface et par
unité de temps (proportionnel au gradient - variation suivant x - de concentration).
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X
DEBIT DE DIFFUSION
𝛛𝛛𝟐𝟐 𝐂𝐂 𝛛𝛛𝛛𝛛
x+dx niveau 2 D� =
𝐝𝐝𝐱𝐱 𝟐𝟐 𝛛𝛛𝛛𝛛
x niveau 1
O
S
détermination plus commode
du coefficient de diffusion D
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Phénomènes de surface
Applications médicales
Introduction (1)
SOLIDES LIQUIDES
INTERFACE
Introduction (2)
PHENOMENES DE
SURFACE
Introduction (3)
CREATION DE
CONSOMMATION D’ENERGIE
SURFACES NOUVELLES
vrai pour les solides : fournir un travail contre les forces de cohésion
vrai pour les liquides : toute surface liquide tend spontanément à prendre une aire
minimale
Remarques :
- exemple de la goutte liquide qui prend spontanément la forme sphérique qui correspond
à l’aire minimale pour un volume donné.
- Exemple de gouttes d’huile dans une suspension (eau-huile) qui tendent à se
rassembler, et qui a pour effet de diminuer l’interface eau-huile. Pour disperser la
suspension, il est nécessaire de fournir de l’énergie.
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𝛿𝛿w = 𝜎𝜎 � 𝛿𝛿𝑠𝑠
consommation d’énergie dw
Remarques :
- La définition de la tension superficielle σ suppose que les variations de surface
sont réversibles et isothermes
- La tension superficielle traduit une énergie rapportée à une surface
- La tension superficielle de l’eau : la plus élevée
(due à l’importance de ses liaisons intermoléculaires)
2 � 𝜎𝜎
𝛿𝛿𝑃𝑃 =
𝑟𝑟
2 � 𝜎𝜎 P0
′
𝑃𝑃 − 𝑃𝑃0 =
𝑟𝑟 + 𝛿𝛿𝛿𝛿 P’ 4 � 𝜎𝜎
δr ~ 𝛿𝛿𝑃𝑃 =
2 � 𝜎𝜎 𝑟𝑟
𝑃𝑃 − 𝑃𝑃𝑃 = r
𝑟𝑟 P
Remarque :
deux gouttes de rayons différents entrent en contact, et se fondent l’une dans l’autre, la plus grosse
absorbant la plus petite.
la goutte résultante offre une surface plus petite que celle de la somme des deux gouttes originelles
IL EN RESSORT
ANGLE DE CONTACT
θ θ θ θ
mouillement nul mauvais mouillement bon mouillement mouillement
θ=π parfait θ = 0
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θ LOI DE JURIN
h
h. r. ρ. g
σ. cosθ =
2
LOI DE JURIN
h. r. ρ. g
σ. cosθ =
h 2
θ