Guía Unidad 2.

Modelación
Actividad. Clasificación de Modelos
Un modelo es una representación de un proceso. Los modelos nos ayudan a poder
visualizar dichos procesos de una forma más simple y comprensible para con ellos describir
algún comportamiento actual o predecir alguno.
En el caso del crecimiento microbiano se deben tomar en cuenta los factores más
importantes para elaboración del modelo como lo pueden ser la concentración de sustrato,
inoculo, aireación, entre otras. Considerados todos los parámetros y establecido un modelo
matemático este tiene que comprobar su validez mediante la comparación con la
experimentación, la cual sustentara la viabilidad del uso del método, además, con la
comparación puede continuar el diseño y mejoramiento del modelo al encontrar diferencias
en los resultados obtenidos.
Los modelos matemáticos se pueden clasificar en cuatro rubros: No estructurado-no
segregado, estructurado-no segregado, no estructurado-segregado y estructurado-
segregado. De manera que la complejidad va aumentando respectivamente siendo el
modelo más complejo y por ende el más preciso el modelo estructurado-segregado y el
más simple el modelo no estructurado-no segregado. Para los estudios de crecimiento
microbiano dado que este es analizado como un crecimiento poblacional se decide utilizar
el modelo más simple (no estructurado-no segregado) en el cual no se consideran
variaciones en las estructuras internas, si estás fueran consideradas entonces se estaría
hablando de un modelo estructurado-no segregado. De igual forma los términos segregado
y no segregado se refieren a la consideración de variaciones entre los individuos de una
población; el determinar si es o no es segregado dependerá del tamaño de la población.
Retomando, en el análisis de crecimiento microbiano se utiliza el modelo más simple debido
a que la población de microorganismos comúnmente es heterogénea y por ello se
consideran como un “microorganismo promedio” de igual forma al ser una población
sumamente grande sería impráctico el considerar las variaciones que pudiera tener cada
individuo de la población además de ser algo casi imposible de determinar.
Conociendo esto, se diseñaron diversos modelos para poder estudiar el crecimiento
microbiano, el más conocido y ampliamente utilizado es el de Monod debido a la simpleza
del modelo el cual involucra a la velocidad específica de crecimiento, velocidad específica
de crecimiento máxima, la concentración de sustrato y la constante de saturación por
sustrato y se representa de la siguiente manera:
𝑆
(1) 𝜇 = 𝜇𝑚á𝑥
𝑆+𝐾𝑠

Para simplificar el maneja del modelo y para la obtención de los valores de intereses, al
igual que en muchos modelos matemáticos, este se linealiza para obtener una forma más
“amigable” a la otra de utilizarlo. Para el modelo de Monod se tienen dos linealizaciones
que son las siguientes:
1 1 𝐾𝑠 1 1 1 𝐾𝑠 1
(2) 𝜇 = 𝜇 +𝜇 ∙𝑆 (3) 𝜇
=𝜇 +𝜇 ∙𝑆
𝑚á𝑥 𝑚á𝑥 𝑚á𝑥 𝑚á𝑥

La diferencia entre ella es la precisión de los valores que se pueden obtener.

Actividad. Estequiometría y balances elementales
¿Cómo clasifico a los microorganismos?
Los MO se pueden clasificar según sus requerimientos energéticos, condiciones
ambientales y su afinidad por el oxígeno. De esta manera la clasificación sería la siguiente:
Energía:

 Autótrofos
 Heterótrofos
Condiciones ambientales:

 pH
o Acidófilos
o Nutrófilos
o Acalinófilos
 Temperatura
o Psicrófilos
o Mesófilos
o Termófilos
o Extremófilos
Afinidad de oxígeno:

 Aerobios
 Anaerobios
¿Qué son las fuentes nutricias?
Son los “requerimientos alimenticios” del MO, los cuales se dividen en cuatro principales
fuentes:
1. Fuentes de carbono.
La fuente de mayor uso son los carbohidratos como lo son: hexosas,
pentosas, disacáridos y polisacáridos.
2. Fuentes de nitrógeno.
Éstas pueden clasificarse en orgánicas e inorgánicas, donde las orgánicas
son: harinas de pescado y de soya, hidrolizados de proteínas. Y las
inorgánicas son: urea, nitrato, nitrito, sales de amonio y amoníaco líquido o
gaseoso.
3. Fuentes de macro y micro-elementos.
En esta fuente se encuentra en resto de nutrimentos que requiere el MO,
donde los macro-elementos son: azufre, calcio, magnesio, hidrogeno y
oxígeno, mientras que los micro-elementos son: hierro, zinc, manganeso,
cobre, vitaminas, etc., estos se requieren en menores concentraciones.
4. Fuentes de oxígeno.
Es un nutriente que se obtiene mediante la aireación del medio de cultivo,
por medio de inyección de aire o columnas de burbujeo de manera
 constante, esto debido al alto consumo del mismo y a su baja solubilidad en
los medios de cultivo.
¿Para qué sirven los balances elementales?
Porque con los balances elementales se pueden determinar los moles involucrados en la
reacción así como las relaciones estequiométricas entre las fuentes nutricias, el MO en
cuestión y sus posibles productos.

Actividad. Balance de Electrones

¿Qué es el grado de reducción?
Es el número de electrones disponibles equivalentes a una cantidad de material que
contiene 1g de carbono.
¿Qué son los rendimientos: Yxs, Yps?
Son las relaciones lineales existentes entre la biomasa y el producto con el sustrato.
¿Menciona las diferentes maneras de definir los rendimientos?

¿Qué relación hay entre estos rendimientos?

De manera directa podemos mencionar que en ambos rendimientos se involucra el sustrato,
de modo que en el rendimiento Yxs nos dice la cantidad de biomasa producida por la
cantidad consumida del sustrato mientras que en el rendimiento Yps nos dice la relación
que existe entre la cantidad de productos extracelulares producidos por la cantidad de
sustrato consumido, ambos se representan como un cociente y ayudan a determinar los
coeficientes estequiométricos de la biomasa y el producto respectivamente.
¿Qué es la estequiometría de producto?
Es la estequiometría de la cual se necesita para tratar balances y cálculos relaciones con
el crecimiento de un producto extracelular en el cultivo. Con ella podemos conocer el
rendimiento Yps, el cual está compuesto como el cociente de los g de producto producido
por los g de sustrato consumido.
¿Qué significado tiene la demanda teórica de oxígeno?
Debido a que el oxígeno es el nutriente más importante para los cultivos aerobios siendo
este el reactivo limitante del cultivo es de suma importancia conocer el consumo pues este
se ve involucrado directamente en los electrones disponibles para transferencia lo cual
permite obtener un balance de electrones apropiado el cual es de suma importancia pues
permite una evaluación más rápida y sin la necesidad de conocer las cantidades de la fuente
de N, CO2 y H20 involucradas en la reacción.
¿Puedo saber cuál es el rendimiento máximo posible?
Sí, es posible conocerlo gracias al balance de electrones disponibles pues con él es posible
suponer la ausencia de producto o biomasa y así poder obtener los límites superiores, o
sea, los rendimientos máximos del cultivo.
¿Qué tiene que ver la “Termodinámica” con el crecimiento microbiano?
Al igual que en cualquier reacción, en el crecimiento microbiano y sus reacciones oxido-
reducción, existe energía que se libera y energía necesaria para poder llevar a cabo la
reacción. Esto quiere decir que involucra cambios de entalpía o energía libre de Gibbs en
el sistema y por ende existe la termodinámica en el crecimiento microbiano.
¿Cómo estimo la producción de calor?
Con las energías libres de combustión y las entalpías de combustión las cuales para poder
calcularlas es necesario tomar ciertas consideraciones las cuales son: la entalpía y la
energía libre debe ser tratadas como energías estándares, o sea a concentraciones 1M,
presión atmosférica y 298K de temperatura y que en crecimientos aerobios la combustión
del sustrato produce CO2 y H2O en donde dichos productos y el nitrógeno no pueden
suministrar energía para los sistemas vivos. De modo que el contenido energético
disponible será equivalente a la entalpía de combustión y la energía libre de combustión.

Actividad. Cinética de crecimiento

Actividad. Cinetica de formación de producto
Actividad. Cinética de consumo de sustrato

¿Qué otras velocidades o cinéticas identificas?

Se encuentra la velocidad específica de crecimiento, de consumo de sustrato y de consumo
de producto así como se pueden modelar las cinéticas correspondientes al consumo de
sustrato y formación de biomasa y producto con las cuales se pueden determinar los
diferentes parámetros de dichas cinéticas.
¿Es importante conocer la cinética de consumo de oxígeno?
Sí, debido a que el oxígeno es vital para cultivos aerobios es importante conocer el grado
al que este será consumido por el MO puesto que este consumo será específico para cada
uno de ellos el tener un exceso de oxígeno puede ser inhibitorio de crecimiento así como
una concentración baja lo será. Conocer la cinética ayudará a determinar la concentración
y la velocidad de administración continua de este que se adecue al MO en cuestión.
¿Es importante conocer la cinética de producción de dióxido de carbono?
Al igual que el oxígeno, la producción de CO2 aun siendo un producto no deseado su
completa ausencia en el cultivo puede presentar inhibición de crecimiento o una
concentración excesiva será tóxica e inhibitoria. Es por ello que al conocer la producción
específica del MO es posible determinar la cantidad justa o aproximada que se puede
permitir en el cultivo para evitar resultados negativos y dificultades en el crecimiento del
cultivo.

Actividad. Reactor por Lote

¿Cuál es el tiempo de generación de biomasa?
El tiempo de generación de biomasa en un reactor por lote se puede calcular mediante la
siguiente ecuación:

1 𝑥𝑓
𝑡𝑏 = 𝑙𝑛
𝜇𝑚𝑎𝑥 𝑥0
¿Cuál es el tiempo de consumo de sustrato?
El tiempo de consumo de sustrato en un reactor por lote se puede calcular mediante la
siguiente ecuación:

1 𝑠𝑓 − 𝑠0
𝑡𝑏 = 𝑙𝑛 1 +
𝜇𝑚𝑎𝑥 1 𝑞𝑃 𝑚𝑠
( + + )𝑥
[ 𝑌𝑋𝑆 𝜇𝑚𝑎𝑥 ∙ 𝑌 𝜇𝑚𝑎𝑥 0 ]
𝑃𝑆

¿Cuál es el tiempo de generación de producto?

El tiempo de generación de producto en un reactor por lote se puede calcular mediante la
siguiente ecuación:

1 𝜇𝑚𝑎𝑥
𝑡𝑏 = 𝑙𝑛 [1 + ( 𝑝𝑓 − 𝑝0 )]
𝜇𝑚𝑎𝑥 𝑞𝑃 ∙ 𝑥0

¿Cuál es el tiempo de un ciclo por lote?

El tiempo de un ciclo se determina en base a los tiempos de cosecha, de preparación, al
tiempo de la fase lag de las células y los tiempos de crecimiento de biomasa, consumo de
sustrato y generación de producto (tb) de modo que el tiempo total se puede expresar
mediante las siguientes ecuaciones:

𝑡𝑑𝑛 = 𝑡ℎ𝑣 + 𝑡𝑝 + 𝑡𝑙
donde tdn es el tiempo de inactividad, thv el tiempo de cosecha, tp el tiempo de preparación
y tl el tiempo de fase lag.

𝑡𝑇 = 𝑡𝑏 + 𝑡𝑑𝑛
donde tT es el tiempo total del ciclo.

Actividad. Biorreactor Continuo

¿Qué es la velocidad de dilución D?
Es la velocidad a la que van saliendo los productos del biorreactor, de modo que al buscar
una tasa de dilución estable se busca que la salida de los productos sea igual a la entrada
de nutrientes, o sea, tasa de dilución = tasa de crecimiento.
¿Qué es el tiempo de residencia τ?
Es el tiempo que los productos del cultivo continuo permanecerán dentro del biorreactor.
¿Qué es el washout?
Se le conoce como washout a la condición en la que se tiene una alta tasa de eliminación
de células en la corriente de salida y se tiene una baja velocidad de generación de
crecimiento, o sea, el washout se produce cuando se tiene una tasa de dilución alta.
¿Qué es la velocidad de dilución crítica?
La velocidad de dilución crítica es la velocidad a la cual se trabaja en el límite del lavado o
washout. Al operar cerca de estas condiciones es beneficioso dado que la productividad
se hace máxima aunque es arriesgado trabajar en estas condiciones.
¿Qué es la velocidad de producción de biomasa?
La velocidad de producción de biomasa es igual a la tasa a la que las células salen del
reactor, el cual se denota como flujo (Fx).
¿Qué es la velocidad de producción de producto?
Al igual que la velocidad de producción de biomasa, la velocidad de producción de
producto es igual a la velocidad con la que los productos salen del reactor, de igual forma
este se denota como un flujo (Fp).

Actividad. Biorreactor Lote Alimentado

¿Cuáles son las tres formas de alimentar un biorrector tipo alimentado?
¿Cómo predigo el cambio de volumen según la forma de alimentación?

Actividad. Simulación de un biorreactor por Lote