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Investigación documental y de campo

Informe final

¿Cuál es la estructura del ciclo del ácido cítrico y su


importancia en las rutas metabólicas?

Ricardo Antonio Gallardo Sánchez


Junio 2018
Índice

Contenido
Índice ................................................................................................................................................... 2
Introducción ........................................................................................................................................ 3
Objetivos ......................................................................................................................................... 4
Objetivos generales ..................................................................................................................... 4
Objetivos específicos ................................................................................................................... 4
Metodología ........................................................................................................................................ 5
Resultados ........................................................................................................................................... 7
1 ................................................................................................................................................... 7
2 ................................................................................................................................................... 7
3 ................................................................................................................................................... 7
4 ................................................................................................................................................... 7
5 ................................................................................................................................................... 7
6 ................................................................................................................................................... 7
7 ................................................................................................................................................... 8
8 ................................................................................................................................................... 8
9 ................................................................................................................................................... 8
10 ................................................................................................................................................. 8
Moléculas ........................................................................................................................................ 8
Tipo de reacciones .......................................................................................................................... 9
Enzimas............................................................................................................................................ 9
Productos ........................................................................................................................................ 9
Conclusiones ..................................................................................................................................... 10
Referencias ........................................................................................................................................ 11
Fuentes primarias.......................................................................................................................... 11
Fuentes Secundarias ..................................................................................................................... 12
Anexos ............................................................................................................................................... 12
Instrumentos para la recolección de datos ................................................................................... 12
Guión de la entrevista ................................................................................................................... 12
Video de la entrevista ................................................................................................................... 13
Gráficas.......................................................................................................................................... 13

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Introducción
En el mundo hemos encontrado muchos padecimientos en el cuerpo humano,
enfermedades, las cuales tienen diferentes patologías y síntomas, con la tecnología
actual nos encontramos cada vez con más detalles de cada una de esas
enfermedades, las cuales han fascinado a un sinfín de personas que indagaron en
ellas; el cuerpo humano con toda su complejidad y belleza oculta todavía muchas
cosas, cada una de nuestras células platica quienes somos y quien será nuestra
descendencia, el analizar cada aspecto y cada movimiento que se lleva dentro de
ella no solo es apasionante sino necesario, dentro de las células eucariotas se
encuentra un pequeño apéndice al que llamamos mitocondria, la cual da regulación
a diversas reacciones, pero esta pequeña están susceptible a tener problemas
enzimáticos los cuales derivan a muchas enfermedades, actualmente hay más de
150 mutaciones que acaban en enfermedades de distinto tipo, las enfermedades
mitocondriales causan el mayor daño a las células del cerebro, corazón, hígado,
músculo esquelético, riñones, el sistema endocrino y respiratorio, por eso entender
sus funcionamientos, sus aportes, sus reacciones entenderemos muchas
enfermedades más, una de esas reacciones es el ciclo del ácido cítrico, el entender
sus funcionamiento, su estructura, y participación dentro de estas reacciones, nos
hará comprender mejor lo que pasa en nuestro cuerpo.

Estudiar el Ciclo de Krebs en un curso propedéutico de Ingeniería en Biotecnología


(IBT) es muy útil porque servirá como centro para las diversas rutas metabólicas y
energéticas que forman parte de la respiración celular, como ocurre en todas las
células aerobias ya sea en la mitocondria o en el citoplasma dependiendo de la
célula en cuestión.

Esta investigación se enfocará en las células eucariotas, se hará una búsqueda


explicativa del tema, seleccionaremos elementos y analizaremos cada una de ellas
para poder entender la ruta metabólica llamada Ciclo de Krebs.

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Objetivos

Objetivos generales

Se estudiará la ruta metabólica Ciclo de Krebs, a partir de las diferentes


investigaciones y recursos bibliográficos de bioquímica y química, para explicar su
desarrollo.

Objetivos específicos

1. Identificar moléculas, enzimas, tipos de reacción, productos y niveles


energéticos.
2. Analizar los componentes dentro de la ruta metabólica ciclo de Krebs.
3. Explicar a partir de la información recopilada la estructura del ciclo de Krebs.

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Metodología

El siguiente trabajo se realizó en sesiones semanales las cuales partieron del 9 de


mayo al 12 de junio y el trabajo fue ejecutado, en dos partes, la primera fue una
investigación documental, la primer semana que constó del 9 al 13 de mayo se
realizó la delimitación del tema los objetivos de la investigación y el plan de trabajo,
la semana del 14 al 20 de mayo se realizó la selección y recopilación de información
así como el marco teórico (análisis y abstracción de información), la investigación
documental fue en gran parte realizada por libros de bioquímica, los cuales fueron
buscados en el buscados Google académico.

Con referente a la recopilación de información y análisis y abstracción de


información se dieron los siguientes pasos, Explorador de Google, Google
académico: 1.- se puso en el buscador libros de bioquímica, 2.- se abrío el primer
libro como resultado, 3.- se buscó en el índice las partes donde aparecía el ciclo del
ácido cítrico, 4.- se le dio lectura al tema completo, 5.- se repitieron los pasos del 1
al 4 con diferentes libros extrayendo información relevante del tema.

Para un mejor entendimiento del tema se buscaron bases teóricas que facilitarían
el manejo del tema.

Explorador Google, Google académico: 1.- se puso en el buscador libros de química


orgánica, fisicoquímica, química, biología, 2.- se abrió el primer libro que
proporcionaba el buscador, 3.- se buscó en el índice del libro las diferentes bases
teóricas que facilitarían el tema.

La segunda parte fue una investigación de campo en la cual la primera semana del
21 al 27 de mayo se llevó acabo la realización de una bitácora de investigación
(observación de campo), la planeación y aplicación de entrevista para la recolección
de datos relevantes a la investigación, la siguiente semana del 30 al 3 de junio se
realizó el análisis de datos recabados y la aplicación de una encuesta con su análisis
de resultados, y para finalizar la semana del 4 al 12 de junio se realizó la integración
y redacción del informe final.

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En la encuesta del 30 mayo al 3 de junio se realizaron preguntas cerradas con la
finalidad de ver la importancia del ciclo del ácido cítrico dentro de las rutas
metabólicas, la muestra de la entrevista fue un grupo de la Ingeniería en
Biotecnología de la Universidad Politécnica del Valle de Toluca (UPVT) el cual
constó de 23 integrantes, se llevaron a cabo 10 preguntas puntualizando la
importancia de reacciones, moléculas, enzimas, productos, dentro del ciclo del ácido
cítrico.

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Resultados

De la información recolectada tanto en la investigación documental y de campo se


obtuvo la siguiente información.

El ciclo del ácido cítrico consiste en una serie de reacciones consecutivas que se
termina en el mismo compuesto en que se inicia, el ácido pirúvico sale del
citoplasma, donde se produce mediante la glucolisis y atraviesa las membranas
externas de las mitocondrias, antes de entrar al Ciclo de Krebs el ácido pirúvico de
tres carbonos se oxida.

1.- Todo empieza con la citrato sintasa, realizando una reacción de condensación
en el oxalacetato y la acetil-CoA, produciendo citrato + Co-A, esto es el paso que le
da nombre al ciclo.

2.- La enzima aconitasa hace una reacción de deshidratación en el citrato, el cual


pudo haber partido a la biosíntesis de ácidos grasos o a la biosíntesis de colesterol,
cuando la enzima cataliza la reacción se libera agua y el cis-Aconitato.

3.- Nueva mente la enzima aconitasa entra y hace una reacción, pero ahora de
hidratación en la molécula cis-Aconitato implantando de nuevo el grupo alcohol,
dando forma al isocitrato.

4.- Ahora la enzima isocitrato deshidrogenasa realiza una reacción de oxidación


junto a un Nicotinamida adenin dinucleótido (NAD) en el isocitrato, produciendo
NADH, oxalasuccinato y H+.

5.- La isocitrato deshidrogenasa realiza una descarboxilación en el oxalasuccinato,


produciendo alfa-cetoglutarato y CO2.

6.- La alfa-cetoglutarato deshidrogenasa realiza una descarboxilación oxidativa en


la molécula alfa-cetoglutarato la cual pudo haber venido también de la oxidación y
biosíntesis de aminoácidos y viceversa, produciendo NADH, H+, CO2 y la molécula
succinil-CoA el cual también pudo haber venido de la oxidación de ácidos grasos o
se pudo haber ido a la biosíntesis de porfirina.

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7.- La succinil CoA sintetasa cataliza una reacción de hidrolisis en la succinil-CoA
produciendo un susinato y un CoA-SH, en la reacción participa una
guanisinadifosfato (GDP) y termina como guanisinatrifosfato (GDP).

8.- La succinato deshidrogenasa cataliza una reacción de oxidación junto con un


Dinucleotido de flavina y adenina (FAD) en el succinato produciendo la reducción
de FAD y transformándolo en FADH y Fumarato.

9.- La fumarato hidratasa cataliza la adición de agua en el fumarato produciendo la


L-Malato

10.- La malato deshidrogenasa junto con un NAD oxida la molécula de L-Malato,


produciendo NADH, H+ y el Oxalacetato renovando así el ciclo.

De ese modo, los grupos acetilo se oxidan por completo a CO2con la siguiente
ecuación:

3NAD- +FAD + GDP + P, + acetil-CoA → 3NADH +FADH2 +GTP + CoA + 2CO2

Donald Voet & Judhit G. (2004) explican “ El ciclo del ácido cítrico actúa de manera
catalítica como resultado de la formación de oxalacetato: se puede oxidar un
número infinito de grupos acetilos por medio de una molécula de oxalacetato”.

Daniel Pacheco (2004) “ tradicionalmente el Ciclo de Krebs relacionado con el


metabolismo de carbonos; sin embargo, es también una vía final en el metabolismo
de lípidos y aminoácidos, a través de diferentes entradas, la principal de ellas, acetil
CoA”. Durante el curso de la oxidación de la acetil CoA en el ciclo, se forma
equivalentes reducidos (NADH,FADH2) como resultado de deshidrogenasas
específicas. Estos equivalentes reducidos entran en la cadena respiratoria donde
se generan grandes cantidades de ATP por fosforilación oxidativa.

Una de las funciones primordiales del ciclo de los ácidos tricarboxilicos es la de


aportar hidrogeno a la cadena respiratoria.

Moléculas: citrato, cis-Aconitato, Isocitrato, oxalosuccinato, α-cetoglutarato,


succinil-CoA, succijnato, Fumarato, L-Malato, oxalacetato.

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Tipo de reacciones: deshidratación, hidratación, oxidación, descarboxilación,
hidrolisis, condensación.

Enzimas: aconitasa, isocitrato deshidrogenasa, α-cetoglutarato deshidrogenasa,


succinil CoA sintetasa, succinato deshidrogenasa, fumarato hidratasa, malato
deshidrogenasa, citrato sintasa.

Productos: NADH, FADH, CO2

Imagen: Donald Voet & Judhit G. Voet. (2004). Bioquímica, p. 796

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Conclusiones
Se concluyó que no solo es importante el ciclo del ácido cítrico sino que hay
diversas partes que lo conforman al que tienen mayor o menor relevancia, como
Acetil-CoA la que le da parte inicial al ciclo y que sin ella no comenzaría este, que
aunque es muy bajo su porcentaje de producción de ATP es un producto
necesario y muy útil , que las enzimas en conjunto son más importantes y qué una
sola no es útil, que hay reacciones reversibles en el ciclo y también hidrolisis y que
todo esto es llevado a cabo en la matriz mitocondrial.

También el ciclo del ácido cítrico oxida un grupo acetilo de la acetil-CoA a dos
moléculas de CO2 de tal forma que conserva la energía libre liberada para
utilizarla en la producción de ATP.
Y que el ciclo de Krebs es parte de la vía catabólica que realiza la oxidación de
glúcidos, ácidos grasos y aminoácidos hasta la producción de CO2, liberando
energía en forma utilizable (GTP).

Sabemos que es útil el ciclo del acido cítrico por que, en la siguiente reacción en
paso, es la fosforilación oxidativa, la cual necesita de los productos ya reducidos
(NADH, FADH2) del ciclo de Krebs, los cuales ayudaran a generar ATP la
molécula energética de cambio en el cuerpo humano.

Se recomienda el estudio en bibliografías ya que es un tema ya conocido, y fue lo


que mas ayudo a esta investigación.

Se cumplieron los objetivos de la investigación con éxito que, aunque es un tema


un poco cerrado aun falta más investigación por parte del ámbito científico.

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Referencias
Fuentes primarias:

https://books.google.com.mx/books?redir_esc=y&hl=ES&id=r5bedH_aST0C&q=cic
lo+de+krebs#v=snippet&q=ciclo%20de%20krebs&f=false
Donald Voet & Judhit G. Voet. (2004). Bioquímica . Buenos Aires- Bogota- Caracas-
México- Sao Paulo : Editorial Medica Panamericana pp 795-824.
https://books.google.com.mx/books?redir_esc=y&hl=es&id=IxvzwWVjz40C&q=cicl
o+de+krebs#v=snippet&q=ciclo%20de%20krebs&f=false
Daniel Pacheco leal . (2004). BIOQUÍMICA MEDICA. México- España- Colombia-
Venezuela : Limusa NorIega editores. pp 222-233.
https://books.google.com.mx/books?hl=es&id=EFUP472dyEMC&q=ciclo+de+kreb
s#v=snippet&q=ciclo%20de%20krebs&f=false
Antonio Peña Díaz & Ángel Arrollo & Armando Gomez & Ricardo Tapia. (1988).
Bioquímica Temas básicos : Área Química. México : Editorial Limusa pp 238-253
https://books.google.com.mx/books?redir_esc=y&hl=es&id=_lf7CAAAQBAJ&q=cicl
o+de+krebs#v=snippet&q=ciclo%20de%20krebs&f=false
Charlotte W. Pratt & Katlheen Cornely. (2012). Bioquímica . México : Editorial el
manual moderno. pp indefinido
https://books.google.com.mx/books?id=aDPwkniCkRgC&printsec=frontcover&dq=
BIOQUIMICA&hl=es&sa=X&ved=0ahUKEwizlruA44vbAhUKxVkKHZGQBOMQ6AE
IKDAA#v=onepage&q=CICLO%20DE%20KREBS&f=false
Frank Bradley & Thomas Peter. (1982). Bioquímica . Barcelona, Bogota, Buenos
Aires, Caracas, México, Río de Janeiro: Editorial Reverte S.A. pp 276-288.
https://books.google.com.mx/books?lr=&hl=es&id=p3DCb9lTLx8C&dq=books+bio
quimica&q=ciclo+de+krebs#v=snippet&q=ciclo%20de%20krebs&f=false
Thomas M. Devlin. (2006). Bioquímica . Barcelona, Bogota, Buenos Aires, Caracas,
México: Editorial Reverte pp 153-162.
Robert C. Bohinski. (1978). Bioquímica. Bogot, Caracas, México, Panama, San
Juan, Santiago, Sao Paulo: Fondo Educativo Interamericano S.A. pp 324-420

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Fuentes Secundarias:
Guillermo Perez . (1999). Ciclo de Krebs . 1999, de Ciclo de Krebs.com Sitio web:
https://www.ciclodekrebs.com/
Claus A. Ville. (2002). BiologÍa . México, Buenos Aires, Caracas, Guatemala, Lisboa,
Madrid, Nueva, York: Mc Graw Hill. pp 884-889.
Philip S. Bailey & Cristina A. Bailey. (1995). Química Orgánica. México, Nueva York,
Bogota, Londres, Madrid, Munich: Prentice hall.pp indeterminado.
Raymond Chang. (2008). Fisicoquímica. México, Bogota, Buenos Aires, Caracas:
Mc Graw Hill.
H. D. Crockford & Samuel B. Knight. (1981). Fundamentos de Fisicoquímica.
México, Bolivia, Brasil, Costa Rica: C.E.C.S.A pp indeterminada
https://books.google.com.mx/books?id=JjtISAiZG4YC&printsec=frontcover&hl=es&
source=gbs_ge_summary_r&cad=0#v=onepage&q&f=false
Alan Fersht. (1980). Estructura y mecanismos de las enzimas . Barcelona, México,
Bogota, Caracas: Editorial Reverte

Anexos
Instrumentos para la recolección de datos: Google académico

Guión de la entrevista: Dentro de la entrevista que fue realizada el 21 y 27 de


mayo se realizó las siguientes preguntas:

1.- ¿Qué tipo de reacciones tiene el ciclo del ácido cítrico?

2.- ¿Cuáles son las enzimas que participan en el ciclo?

3.- ¿Por qué moléculas está formado el ciclo del ácido cítrico?

4.- ¿Por qué factores está regulado el ciclo del ácido cítrico?

5.- ¿Qué productos son formados en el ciclo del ácido cítrico?

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6.- ¿Podría proporcionar comentarios relevantes sobre el ciclo del ácido cítrico?, 7.-
¿Cuál es la importancia del ciclo del ácido cítrico en las diferentes rutas
metabólicas?

La entrevista fue realizada a dos personas destacadas en el área de la bioquímica,


la Maestra en Ciencias Biológicas Susana González, y el Ingeniero en
Biotecnología Daniel Quintana.

Video de la entrevista:
https://www.youtube.com/watch?v=mmrTpA96sLQ&feature=youtu.be

https://www.youtube.com/watch?v=WLZYhQSHNyE&feature=youtu.be

Gráficas

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