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BIOQUIMICA

AMBIENTAL
ORIGEN DE LA VIDA
ORIGEN DE LA VIDA
EL ORIGEN DE LA VIDA
http://www.astro.psu.edu./users/tabel/GB/gb.html
Sobre la base de estudios astronómicos y de
exploraciones llevadas a cabo por vehículos espaciales
no tripulados, parece ser que sólo la Tierra, dentro de
los planetas del Sistema Solar, sustenta vida.
La Tierra presenta condiciones ideales para la vida

No esta cerca ni lejos del sol.


Las reacciones químicas requieren H2O líquida
y temperaturas moderadas.
El tamaño y la masa de la Tierra permite
mantener una atracción gravitacional para poseer
una atmósfera protectora.
La atmósfera bloquea las radiaciones más
energéticas del sol pero deja pasar la luz visible.
EL ORIGEN DE LA VIDA EN LA TIERRA
CARACTERÍSTICAS DEL JOVEN PLANETA

ATMÓSFERA
- Ausencia de Oxígeno
- Atmósfera reductora
- Composición: CO2
H2O
H2S
H2
N2
CH4
NH3
- Tormentas eléctricas
- Bombardeo de Meteoritos
- Ingreso de luz ultravioleta
EL ORIGEN DE LA VIDA EN LA TIERRA
CARACTERÍSTICAS DEL JOVEN PLANETA

- Intensa actividad volcánica


¿COMO SURGIÓ LA VIDA?

TEORIAS QUE LA EXPLICAN


Origen de la moléculas Biológicas

En 1920 Oparín (bioquímico ruso ) y Haldane (genetista


inglés) sugieren que a pesar de que la atmósfera
primitiva de la Tierra era reductora y pobre en O2 y
rica en H, los compuestos orgánicos formados en esa
atmósfera eran similares a los que utilizan los seres vivos
modernos.
Ellos concluyen que la vida pudo haber surgido de la
materia no viviente, mediante reacciones químicas
simples lo que se llamó Evolución Química o Evolución
Prebiótica ( antes de la vida )
EL ORIGEN DE LA VIDA EN LA TIERRA
TEORÍA DE OPARIN

FORMACIÓN DE COACERVADOS
EL ORIGEN DE LA VIDA EN LA TIERRA
TEORÍA DE OPARIN

-Almacenamiento de agua en el
interior.
- Se concentran las moléculas
orgánicas por fuerzas electrostáticas e
hidrofílicas.
- Ingreso pasivo de sustancias
- Mayor número y diversidad de
moléculas en el interior
- Mayor número de reacciones
químicas (catálisis)
- Aumento de volumen
- División mecánica
Teoría de la Panspermia u origen extraterrestre
La vida surge en la Tierra por la acción de otro planeta y
desde allí llegaron bacterias o esporas resistentes, capaces
de viajar por el espacio o por otros medios.
Arrhenius (1859-1927)
EL ORIGEN DE LA VIDA EN LA TIERRA
UN LARGO VIAJE
Hoyle también propone que los compuestos
químicos tenían un origen extraterrestre por
que la Tierra había estado sometida desde su
formación al bombardeo continuo de materia
cósmica.
Esta teoría se fundamentó al analizar un

meteorito que cayó en Australia, Murchinson,
en 1969, que contenía grandes cantidades de
materia biológica equivalentes a las que
encontró Miller posteriormente.
En 1953 Miller mezcló en un aparato de vidrio: metano –
amoniaco y gases de H. En un matraz de 5 litros, se generaba
una chispa eléctrica, mientras que en uno más pequeño se
hervía agua para proporcionar vapor a la chispa para hacer
circular los gases .
Los compuestos que se
formaron por la acción de
las descargas eléctricas se
condensaban o bien
recirculaban, si eran
volátiles .

RESULTADOS
- Inicialmente Cianuro de
Hidrógeno y aldehídos
- Aminoácidos y azúcares
 Del experimento de Miller y la Teoría de Hoyle se puede
concluir que:

a) La atmósfera primitiva era reductora


b) En la atmósfera se pueden producir compuestos
orgánicos.
c) Estos compuestos orgánicos pueden llegar a la Tierra
por meteoritos o cometas.
Tras una semana de descargas eléctricas continuas, los
productos acumulados en la fase acuosa fueron
analizados y correspondían principalmente:

Glicina 2,1%
Ácido glicólico 1,9%

Alanina 1,7%

Ácido Láctico 1,6%

Ácido fórmico 4%

Urea y otros 0,034%


Los compuestos resultaron ser relativamente
sencillos: aminoácidos y sustancias como la urea
que se encuentran en los seres vivos .

Es importante este experimento por que


permite formar una parte importante de
compuestos esenciales para la vida

N2 + H2
NH3(amoníaco)
N2 + H2O
CH4 C2H2 Acetileno
Se han comparado los aminoácidos hallados en el
meteorito de Muchinson y los obtenidos en el
experimento de Miller .
Este meteorito se habría formado en Marte hace
4.500 millones de años y habría estado a la deriva en
el espacio por 16 millones de años . La gravedad
terrestre lo capturó

• El planeta Marte y la Tierra eran bastante similares hace


3.500.000 años atrás. En Marte había existido H2O líquida
en forma de lagos y ríos.
Entre otras moléculas
orgánicas que se pueden
sintetizar fácilmente en
condiciones sencillas son los
azúcares (glucosa –ribosa y
la desoxiribosa)
También en condiciones prebióticas se pueden sintetizar
las bases purinas y la pirimidinas que son compuestos
esenciales de los ácidos nucleicos .
Bases de purina :Adenina y Guanina
Bases de pirimidina :Citosina, Uracilo, Timina
De igual manera ocurre con la
síntesis de ácidos grasos que
fueron compuestos que se
utilizaron en las etapas
iniciales del sistema solar y
también se encontraron en el
meteorito de Murchinson
Podemos observar que muchas de estas
moléculas orgánicas básicas utilizadas por los
seres vivos pueden formarse fácilmente en
numerosas reacciones gracias a la acción de
los fotones de la luz, de los rayos UV
 Existió una pre-adaptación
molecular para todos los procesos
bioquímicos que desembocan en la
formación de la vida:
 Había fuente de energía
 Productos químicos
 Temperatura
 Disolvente: H2O
EL ORIGEN DE LA VIDA EN LA TIERRA
EL MUNDO ARN

La molécula de ARN presenta dos características importantes:


- Almacenamiento de información
- Catalizador (Ribozimas)
EL ORIGEN DE LA VIDA EN LA TIERRA
EL MUNDO ARN
AZÚCAR PENTOSA

- La ribosa es la base de moléculas


muy importantes como: ATP, NAD,
FAD, CoA, AMPc, GTP.
- En el metabolismo celular a partir
de ribonucleóridos se sintetizan
desoxirribonucleótidos
- El ADN es una molécula mas
estable.
EL ORIGEN DE LA VIDA EN LA TIERRA
REGISTRO FÓSIL

Los fósiles y estromatolitos mas antiguos datan de


aproximadamente hace 3,500 millones de años
EL ORIGEN DE LA VIDA EN LA TIERRA
METABOLISMO
EL ORIGEN DE LA VIDA EN LA TIERRA
METABOLISMO
EL ORIGEN DE LA VIDA EN LA TIERRA
LAS ARQUEAS

Methanosarcina barkeri

Las arqueas se caracterizan por


vivir en condiciones extremas,
como temperatura, pH, salinidad o
falta de oxígeno.
Halobacterium halobium
EL ORIGEN DE LA VIDA EN LA TIERRA
LAS CIANOBACTERIAS

Oscillatoria sp.

Las cianobacterias
Anabaena sp. tienen la capacidad
de realizar
fotosíntesis
BASES MOLECULARES ADN ADN
genoma
DE LA VIDA
ARN
Célula
cromosomas
PROTEÍNAS
genes
los genes
contienen
instrucciones
para hacer
ADN
proteínas

proteínas

las proteínas actúan


solas o en complejos
para realizar las
funciones celulares
Bioquimica celular
ANTECEDENTES HISTÓRICOS DE LA
BIOQUÍMICA
Avances bioquímicos: S.XVI – XVIII
Principios S. XIX: mundo vivo y no vivo.
Von Hohenheim (1493-1541) química
médica. Procesos vitales esencialmente
químicos.
Teoría del Vitalismo: ≠ viviente y no
viviente – acción de una fuerza vital.
Sostiene q la urea sólo se obtenía de orina
de organismos vivos.
ANTECEDENTES HISTÓRICOS DE
LA BIOQUÍMICA

Wöhler (1800-1882): demostró lo


contrario.
Miescher (1844-1895) descubre ácidos
nucleicos.
Fischer (1852-1919) comprensión
estructura enzimas; estr. y síntesis
azúcares, grasas y proteínas.
Chevreul (1786-1889) estudió estructura
de lípidos.
ANTECEDENTES HISTÓRICOS DE
LA BIOQUÍMICA
Con I. Pavlov (1849-1936) se alcanzó desarrollo
de cirugía experimental.
Pasteur (fermentaciones) desarrolló la ciencia
de la microbiología. “Teoría de la generación
expontánea”. En 1862, Pasteur demostró q los
mo no aparecían en soluc. esterilizadas de
material orgánico. Org. vivos sólo provienen de
otros org. vivos.
Relación entre microb y bioq se reforzó con los
trabajos de Winogradsky (1900-1950).
ANTECEDENTES HISTÓRICOS DE
LA BIOQUÍMICA
H. Buchner (1897) demuestran poder catalítico de
enzimas.
Principios S. XX: aislamiento de biomoles, estructura,
funciones y metabolismo (Embden, Meyerhof, Parnas,
Warburg, Knoop, krebs)
J. Summer (1926) demostró q una E se podía cristalizar.
Tb demostró q la ureasa es una proteína.
F. Sanger (1945): estruc.de la insulina de buey. Nicol y
Smith: insulina humana.
ANTECEDENTES HISTÓRICOS DE
LA BIOQUÍMICA
J. Watson y F. Crick (1953): estructura
tridimensional del ADN.
Posteriormente: replicación del ADN, naturaleza
del código genético, fundamento estructural y
funcional de la síntesis de proteínas, procesos de
reparación del ADN, mapa físico del genoma
humano completo, secuenciamiento del
cromosoma 21.
CONCEPTO

 Comprende estudio de las moles y de las


reacciones químicas de la vida.
 Estudio de la composición química de la
materia viva y de los procesos
bioquímicos.
 Diccionario de la Real Academia de la
Lengua Española: parte de la química que
estudia composición y transformación de
los seres vivos.
 Otros conceptos.
La Bioquímica es la ciencia de la vida.
OBJETIVO Y FINALIDAD

 Objetivo fundamental: estudiar las reacciones


individuales en una vía metabólica, estruc y func
de Es.

 Determinar cómo interactúan las moléculas


inertes en los org vivos.

 Finalidad: comprender cómo las Rx quím son


coordinadas y controladas.
METODOLOGÍA

 Del material biológico: animal,


órgano, tejidos, células, levaduras,
bacterias o virus.

 De la técnica: conocer los procesos


que sigue un compuesto químico
natural dentro de la célula.
COMPOSICIÓN QUÍMICA DE LA CÉLULA
(La base bioquímica de todos los seres vivos es común)
Hombre de 70 Kg Célula bacteriana
Componentes % (Kg) %

Compuestos
nitrogenados 19 (11) 18

Grasas 15 (9) 2

Carbohidratos 1,5 (1) 3

Agua 70 (45) 70

Minerales 5 (4) 3,5


CARACTERES Y COMPONENTES DE LA MATERIA VIVA

1. LA BIOQUÍMICA COMO CIENCIA QUÍMICA

COMPONENTES:
• Bioelementos
• Biomoléculas
Fuerzas que los unen

2. LA BIOQUÍMICA COMO CIENCIA BIOLÓGICA


CARACTERÍSTICAS de la materia viva:
• Complejidad
• Orden
• Capacidad de replicación
ESTRUCTURA Y ORGANIZACIÓN CELULAR: Procariotas y Eucariotas
1.- COMPONENTES DE LA MATERIA VIVA
Todas las formas de vida están constituidas por los mismos
elementos químicos que forman los mismos tipos de moléculas.
Ello refleja el origen evolutivo común de las células y organismos
A.- BIOELEMENTOS
Primarios Secundarios Oligoelementos
Carbono (C) Azufre (S) Hierro (Fe) Silicio (Si)
Fósforo (P) Manganeso (Mn) Vanadio (V)
Hidrógeno (H)
Magnesio (Mg) Cobre (Cu) Cromo (Cr)
Oxígeno (O)
Calcio (Ca) Zinc (Zn) Cobalto (Cu)
Nitrógeno (N)
Sodio (Na) Flúor (F) Selenio (Se)
Potasio (K) Yodo (I) Molibdeno (Mb)
Cloro (Cl) Boro (B) Estaño (Sn)
BIOELEMENTOS

 De los 92 elementos que surgen en forma


natural, sólo 24 son indispensables en la
célula viva, y de ellos 06 son los +
comunes: C, H, N, O, P y S.
 El agua: importante, a ella se debe el alto
% en peso, de O2. El C es mucho +
abundante en org vivos.
 Si, Al, Fe: sólo en trazas.
Composición elemental de 3 organismos:

Elemento Humano Alfalfa Bacteria

Carbono 19,37% 11,34% 12,14%

Hidrógeno 9,31 8,72 9,94

Nitrógeno 5,14 0,83 3,04

Oxígeno 62,81 77,90 73,68

Fósforo 0,63 0,71 0,60

Azufre 0,64 0,10 0,32

Total 97,90 % 99,60 % 99,72 %


Clasificación de los bioelementos:
A) De acuerdo a su abundancia:

 Primarios: O,H,C,N. + abundantes (99,3%).


 Secundarios: Ca,P,K,S,Na,Cl,Mg,Fe. 0,7% del total de átomos del
cuerpo.

 Oligoelementos: Mn,I,Cu,Zn,F,Mo,Se, otros. Sólo en trazas o huellas.


Esenciales para buen funcionamiento del organismo. Su ausencia 
enfermedades carenciales.
Clasificación de los bioelementos:

B) De acuerdo a la función q desempeñan:

 Plástica o estructural: C,H,O,N,P,S,Ca


 Catalítica: Fe, Co, Cu, I, Zn

 Osmótica y electrolítica: Na, K, Cl. Mantienen


y regulan
fenómenos osmóticos y de potencial químico y
electrónico.
 Energética: C, O, H, P. Forman parte de moles energéticas.
 Esquelética: Ca, Mg, P, F, Si. Confieren rigidez.
BIOMOLÉCULAS
(Moléculas integrantes de los seres vivos)
 Son los bloques con los que se edifican los tejidos
y los organismos.

 Son la base a partir de la cual se forman los


organelos de las células.

 Se denominan también “Principios inmediatos”.


Clasificación de las biomoléculas:

De acuerdo a su naturaleza química:

 Inorgánicas: agua, gases (O2,CO2,N2), sales inorgánicas:


- aniones  PO4-3, HCO3-, SO4-2, Cl-
- cationes  Na+,K+,Ca+2,Mg+2,Zn+2, Fe+2 ……

 Orgánicas: Proteínas, glúcidos, lípidos, ácidos nucleicos, metabolitos


interme - diarios (ác. pirúvico, ác. láctico, ác. cítrico, urea,
etc.)
Contenido de agua en diversos
tejidos u órganos humanos
ESTRUCTURA DEL AGUA

• Tetraedro irregular.

• < H–O–H = 104,5º

• Distancia entre O–H


es de 0,096 nm.
PROPIEDADES FÍSICAS, QUÍMICAS Y
BIOLÓGICAS

1. Acción disolvente.
 Es el que más sustancias disuelve (disolvente
universal).

 Capacidad para formar puentes de hidrógeno con


otras sustancias con grupos polares o con carga iónica
(alcoholes, azúcares con grupos R–OH, aminoácidos y
proteínas), lo que da lugar a disoluciones moleculares

 Puede disolver a sustancias salinas que se disocian


formando disoluciones iónicas
Representación de soluciones iónicas y
moleculares

Iones hidratados o solvatados


…. Propiedades del agua

2. Elevada fuerza de cohesión.


 Los puentes de hidrógeno mantienen las moléculas de
agua fuertemente unidas, formando una estructura
compacta (líquido casi incomprimible).

3. Elevada fuerza de adhesión.


 Esta fuerza está en relación con los puentes de
hidrógeno que se establecen entre las moléculas de
agua y otras moléculas polares y es responsable, junto
con la cohesión del llamado fenómeno de la capilaridad.
…. Propiedades del agua

Representación
gráfica de la
fuerza de
adhesión
…. Propiedades del agua

4. Gran calor específico.


Contribuye a estabilizar la Tº del organismo.

Calor específico: calor necesario para elevar en

1ºC un gramo de líquido.

Por ello el organismo dispone de un mecanismo

tampón o amortiguador que evita la elevación


o disminución de la temperatura corporal.

Manteniéndose la Tº constante.
…. Propiedades del agua

5. Elevado calor de vaporización.

Permite eliminar el exceso de calor

Manteniendo la Tº del organismo más baja que la


del ambiente.

Es otro mecanismo regulador de la Tº del organismo


al vaporizar agua por la piel y los pulmones en la
respiración.
…. Propiedades del agua

6. Conductividad térmica.
 Por su elevada conductividad térmica, el agua influye
en la termorregulación corporal, al conducir
fácilmente el calor e igualar la Tº del medio interno
en su integridad.
7. Densidad.
 La densidad máxima del agua se da a 4ºC.
 Lo q permite que el hielo flote en el agua y pueda
existir vida marina en los casquetes polares.
 El hielo flotante actúa como aislante térmico
impidiendo que la masa oceánica se congele,
posibilitando la existencia de seres acuáticos en
tales latitudes.
…. Propiedades del agua

8. Elevada tensión superficial.


Elevada cohesión entre las moléculas de la superficie.
La presencia de proteínas y sustancias tensoactivas,
disminuyen la tensión superficial del agua.
Facilitan la mezcla, emulsión y digestión de grasas en el
medio acuoso.
El epitelio alveolar secreta una sustancia fosfolipídica
tensoactiva, que disminuye la tensión superficial del agua
que reviste los alvéolos.
Sin esta molécula, no se podría producir la expansión
pulmonar, colapsándose las estructuras alveolares.
…. Propiedades del agua

9. Elevada Tº de ebullición.
100ºC a 1 atmósfera.
Permite que se mantenga líquida en un amplio margen de
Tº.
Pueden existir diferentes formas organizadas de vida incluso
a temperaturas extremas.
10. Electrólito débil.
Se debe a la naturaleza de su estructura molecular.
Origina el mismo catión que los ácidos y el mismo anión que
las bases, por lo que el agua es una sustancia anfótera o
anfolito.
…. Propiedades del agua

11. Formación de enlaces de H.


Se pueden formar hasta cuatro enlaces de H por
molécula de agua.
El agua es muy estable (no un gas) a la Tº ordinaria.
Admite en disolución numerosas moléculas que pueden
formar enlaces de H con ella (alcoholes, aminas,
ácidos, etc.).
Las moléculas de agua forman una malla de simetría
hexagonal (hielo).
…. Propiedades del agua

Enlaces de hidrógeno en la molécula de agua


FUNCIONES BIOQUÍMICAS Y FISIOLÓGICAS DEL
AGUA

a) Soporte o medio donde ocurren las reacciones


metabólicas.
b) Termorregulación.
c) Transporte de sustancias.
d) Lubricante, amortiguadora del roce entre órganos.
e) Favorece la circulación y turgencia.
f) Flexibilidad y elasticidad a los tejidos.
g) Sustrato o producto de reacciones enzimáticas. El
agua aporta H+ u OH– al medio.
h) Componente estructural de macromoléculas. Tienen
la capacidad de fijar sobre ellas moléculas de agua en
forma ordenada.
i) Disolvente universal de sustancias iónicas, anfipáticas
y polares no iónicas.
EQUILIBRIO IÓNICO – pH

SOLUCIONES TAMPÓN
EQUILIBRIO IÓNICO

• El agua: biomolécula más abundante, constituye la mayor parte de la


masa de las células vivientes (60 – 90%).
• Fundamental para las funciones de las proteínas, ácidos nucleicos y
muchas otras biomoléculas.
• La sangre: primera línea de defensa contra las alteraciones del pH de los
líquidos orgánicos y tejidos
• La oxidación de diversos metabolitos en el organismo
viviente produce la formación de una variedad de
ácidos y bases.
Ejemplo: los protones pueden provenir de la
ionización de diversos ácidos orgánicos

• El ácido úrico (catabolismo de las purinas) es otra


fuente de protones (iones H+) como lo es el sulfato
formado en la oxidación del azufre de la cistina-
cisteína y la metionina.

• El dióxido de carbono, puede combinarse con el agua


formando ácido carbónico, siendo retenido hasta
cierto grado en los tejidos y líquidos orgánicos; éste se
ioniza en forma limitada transformándose en otra
fuente de protones.
… EQUILIBRIO IÓNICO

• En los procesos metabólicos normales se forman ácidos


y bases (predominan las sustancias ácidas).

• Pueden ingresar al plasma sanguíneo y otros líquidos


extracelulares para fines metabólicos o de excreción.

• En una variedad de condiciones patológicas, cantidades


excesivas de ácidos o bases pueden acumularse en las
células y tejidos del organismo, conduciendo a
trastornos del equilibrio ácido-base.
Procesos bioquímicos que dependen de la concentración de iones H +:

 Transporte de oxígeno en la sangre.

 Catálisis de reacciones por enzimas.

 Generación de energía metabólica


durante la respiración o la fotosíntesis.
pH - ESCALA

Debido a que el nivel de la [H+] es elevado en las


soluciones acuosas, es necesario utilizar una escala
logarítmica llamada pH para medir la concentración
de iones H+.

pH = – log. [ H+]
pOH = – log. [ OH–]

Escala de pH

 Solución neutra: pH = 7,0


 Solución ácida: pH < de 7,0
 Solución básica: pH > 7,0.
 Cuanto < el pH > la acidez
 Cuanto > el pH por arriba de 7,0 más básica será la solución.
pH de diferentes líquidos o fluidos:

NaOH 1M 14,0
Amoníaco 11,6
Leche de magnesia saturada 10,5
Jugo pancreático humano 8,8
Bicarbonato de sodio 8,4
Clara de huevo fresca 7,8
Plasma sanguíneo humano 7,4
Saliva de humano 7,0
Contenido duodenal humano 7,0
Orina de humano 7,0
Leche de vaca 6,4
Jugo de tomate 4,0
Vinagre 3,0
Jugo de limón 2,2
Contenido gástrico humano 2,2
Ácido clorhídrico 1M 0,0
En las disoluciones acuosas debe cumplirse el
equilibrio de ionización del agua; es decir:

[ H+ ] [ OH- ] = Kw = 1 x 10–14
Si se conoce [H+], fácilmente se puede determinar [OH-].

Entonces se puede deducir la siguiente relación


entre pH y pOH:
[ H+ ] [ OH- ] = Kw

Tomando logaritmos en ambos miembros:

Log. [ H+ ] + log. [ OH- ] = log. Kw


Concepto de Bronsted y Lowry sobre ácidos y bases:

ACIDO: sustancia que puede donar protones.

BASE: sustancia que puede aceptar protones.

Un dador de protón y el correspondiente aceptor de protón


constituyen un par ácido – base conjugado.

El ácido acético (CH3COOH) que es un dador de protón, y el


anión acetato (CH3COO–) que es el aceptor de protón,
constituyen un par ácido–base conjugado, relacionados entre
sí por la siguiente reacción reversible:

CH3COOH  H+ + CH3COO–
Cada ácido (HA) muestra una tendencia a
perder su protón (H+) en disolución acuosa.

Cuanto más fuerte es el ácido, mayor es


su tendencia a perder su protón. La
tendencia de cualquier ácido (HA) a
perder su protón (H+) y formar una base
conjugada (A–) está definida por una
constante de equilibrio, donde:

[ H+ ] [ A- ]
K´ = -------------------
[ HA ]
SOLUCIÓN TAMPÓN

 Un ácido débil y su anión pueden actuar como un TAMPÓN.


Si el pH de una solución permanece constante cuando se
añaden pequeñas cantidades de ácido o de base fuerte, se
dice que la solución está amortiguada o tamponada.

 Los TAMPONES, llamados también soluciones reguladoras de


pH o soluciones buffer, son sistemas acuosos que tienden a
resistir los cambios en su pH cuando se les añade pequeñas
cantidades de ácido (H+) o de base (OH–).

 Un sistema tampón está constituido por un ácido débil


(dador de protón) y su base conjugada (aceptor de protón).

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