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Abstracto
PRRS es la enfermedad más costosa en la industria porcina estadounidense. Si
bien la vacunación, bioseguridad y el esfuerzo de erradicación han tenido cierto
éxito, la variabilidad y capacidad de infección de cepas de virus de PRRS han
obstaculizado la eficacia de estas medidas. Proponemos el uso de la selección
genética de los cerdos como un esfuerzo adicional y complementaria. Varios
estudios han demostrado que la respuesta del huésped a la infección de PRRS
tiene un componente genético importante y los recientes avances en la genómica
proporcionar oportunidades para sacar provecho de estas diferencias genéticas y
mejorar nuestra comprensión de la respuesta del huésped a PRRS. Mientras se
está trabajando también para entender la base genética de la respuesta del
huésped a PRRS reproductivos, el objetivo de esta revisión es en la investigación
realizada en la respuesta del huésped a PRRS en el vivero y en fase de
crecimiento-engorde como parte del PRRS anfitrión Genética Consorcio. Uso de la
infección experimental de un gran número de cerdos de cría comerciales,
combinados con profunda fenotipificación y la genómica, esta investigación ha
identificado un gen importante que está asociado con respuesta del huésped a
PRRS. genómica funcional adicional de trabajo identificadas gen GBP5 como
portadoras de la mutación causante putativo. GBP5 se asocia con la respuesta
inmune innata. El trabajo posterior ha validado el efecto de esta región genómica
en respuesta del huésped a una segunda cepa de PRRSV y a la vacunación
PRRS y co-infección de los cerdos de cría con PRRSV y PCV2b. Un marcador
genético cerca GBP5 está a disposición de la industria para su uso en la
selección. Las diferencias genéticas en respuesta del huésped más allá de GBP5
parecen ser altamente poligénica, es decir, controlado por muchos genes en todo
el genoma, cada uno con un pequeño efecto. Tales efectos pueden por
capitalizado en un programa de selección a través de la predicción genómico en
un gran número de marcadores genéticos en todo el genoma. El trabajo adicional
también ha identificado la base genética de la respuesta de anticuerpos a PRRS,
lo que podría dar lugar a la utilización de respuesta a la vacuna como un rasgo
indicador para seleccionar de respuesta del huésped a PRRS. Otros análisis
genómico, incluyendo la expresión de genes análisis, han genes y módulos de
genes que están asociados con diferencias en la respuesta del huésped a PRRS y
identificados se pueden utilizar para comprender mejor y utilizar las diferencias en
la respuesta del huésped. En conjunto, estos resultados demuestran que la
selección genética puede ser una herramienta adicional y complementario para
combatir PRRS en la industria porcina.
Palabras clave
cerdos ;
La genética del huésped ;
PRRS
1. Introducción
Síndrome reproductivo y respiratorio porcino (PRRS) es la enfermedad viral más
costoso en los EE.UU. y en todo el mundo ( Holtkamp et al., 2013 ). PRRS afecta
tanto a los sectores reproductivos y de crecimiento-finalización de la industria
porcina a través de una disminución en la salud reproductiva, un aumento en la
mortalidad y la morbilidad, y la reducción de la velocidad y eficiencia del
crecimiento ( Zimmerman et al., 2012 ). Virus PRRS (PRRSV) también funciona
como un cofactor en otros síndromes de enfermedades, tales como complejo
respiratorio porcino (CRP) y la enfermedad PCV-asociado (PCVAD)
( 0095 ; 0110 ). Holtkamp et al. (2013) estima que el costo anual de las pérdidas
relacionadas con la producción de PRRS en los EE.UU. en $ 664 millones ($ 1.8
millones de euros / día), que fue del 18% mayores que los costos estimados en
2005 ( Neumann et al., 2005 ), a pesar de grandes esfuerzos a controlar la
enfermedad a través de mejoras en la gestión veterinaria salud, la bioseguridad, la
eliminación de la enfermedad, y la vacunación ( 0060 ; 0140 ; 0045 ). Los costos
adicionales atribuidas a PRRS para uso veterinario, la bioseguridad y otros gastos
relacionados con el brote se estimaron en $ 478 millones ( Holtkamp et al., 2013 ),
sugiere que el coste acumulado más de $ 1 mil millones por año. Cincuenta y
cinco por ciento de los costos se atribuyeron al sector porcino creciente ( Holtkamp
et al., 2013 ). La vacunación para la protección contra la infección por PRRSV ha
sido generalmente un fracaso, debido principalmente al alto grado de deriva
antigénica y genética en proteínas estructurales y no estructurales virales y la
capacidad del virus PRRS de subvertir principios de la respuesta inmune innata
( 0090 ; 0155 ; 0205 ; 0220 ; 0225 ; 0195 ). Por lo tanto, los métodos distintos de
la vacunación deben ser exploradas para ayudar en la lucha contra esta
pandemia; mejora genética del huésped es uno de estos métodos ( Lewis et al.,
2007 ).
Durante las últimas décadas, la selección genética ha sido muy eficaz en el
desarrollo y mejora de líneas de cerdos que producen carne magra de cerdo de
alta calidad de una manera eficiente ( Dekkers et al., 2010 ). Esto se ha logrado
mediante una selección sistemática de las estimaciones del valor genético de los
padres potenciales de la base de una amplia grabación fenotipo de la tasa de
crecimiento, la grasa dorsal, calidad de la carne, y la reproducción. En principio,
estos mismos métodos de selección se pueden aplicar para identificar y
seleccionar los cerdos que son más resistentes, tolerante, o resistentes a
enfermedades, siempre que éstos se determina al menos parcialmente por la
genética del cerdo (es decir, los rasgos son hereditarias) y fenotipos relacionados
para la resistencia a enfermedades, tolerancia o la resistencia puede ser recogido
en animales de cría. Aquí, la resistencia se refiere a la capacidad de un animal
para prevenir la infección cuando se exponen a un patógeno o para limitar la
replicación del patógeno cuando se infectan ( Bishop, 2012 ). Tolerancia se refiere
a la capacidad de un animal para mantener el rendimiento a un nivel dado de
infección o de la carga de patógenos ( Bishop, 2012 ). Por lo tanto, a un nivel dado
de la viremia, el crecimiento y el rendimiento de los animales tolerantes es menos
afectado que la de los animales menos tolerantes. Mientras que la tolerancia se
refiere al impacto en el rendimiento de una carga patógeno dado que está
presente en el animal, los conceptos de resistencia y robustez se refieren a la
capacidad de un animal para mantener el rendimiento tras la exposición a un
patógeno. Por lo tanto, la capacidad de recuperación combina resistencia y
tolerancia ( Doeschl-Wilson et al., 2012 ).
Los primeros trabajos que investigó un componente genético huésped a respuesta
a PRRS reveló lesiones pulmonares más brutas en PRRSV infectan cerdos
Hampshire comparación con los cerdos Duroc y Meishan ( Halbur et al.,
1998 ). Con un modelo de cerda, Lowe et al. (2005) encontraron que la genética
puede afectar la tasa de abortos PRRSV inducida, posiblemente debido a los
niveles circulantes de células IFN-secretoras. 0305 ; 0310 encontraron que las
respuestas de los macrófagos fueron parcialmente predictivo de asociaciones de
razas y de línea con resistencia a PRRSV. Petry et al. (2005) encontró que una
línea sintética Large White / Landrace tenía bajas temperaturas rectales y menos
viremia cuando están infectadas con PRRSV en comparación con una línea
sintética Hampshire / Duroc. Petry et al. (2007) encontró que, pre-infección, los
cerdos que eran menos susceptibles a PRRSV tenían mayores niveles de IL-8 en
suero. Las estimaciones de heredabilidad de la resistencia a PRRSV o resiliencia
han sido escasos, pero las estimaciones para los números de nacidos vivos,
nacidos muertos y momias de cerdas infectadas con PRRSV rango 0,12 a 0,15
( Lewis et al., 2009 ). Rashidi et al. (2014) mostraron cómo reproductiva se podrían
utilizar los datos de rendimiento recogidos en granjas comerciales para identificar
los brotes de la enfermedad, específicamente de PRRS, que fue utilizado
por Mathur et al. (2014) para obtener una medida cuantitativa de la carga de
interrogación. Herrero-Medrano et al. (2015) mostraron cómo estos datos podrían
ser utilizados para estimar los parámetros genéticos para el rendimiento
reproductivo bajo diferentes niveles de desafío, que se pueden incorporar en los
programas de cría para seleccionar la capacidad de recuperación de la
enfermedad.
Aunque esta investigación demuestra que la respuesta de acogida a PRRS tiene
un importante componente genético, la recolección de datos fenotípicos sobre los
efectos de la infección por PRRSV en pie de cría es problemática debido a la
necesidad de mantener un excelente estado de salud y en la cría de rebaños
multiplicadores núcleo. Sin embargo, si los genes o marcadores genéticos ligados
a genes que están asociados con la resistencia o susceptibilidad de los cerdos a la
infección por PRRSV pueden ser identificados, esto puede proporcionar
oportunidades para seleccionar cerdos utilizando selección asistida por
marcadores o selección genómica. Oportunidades para investigar el papel de la
genética del huésped sobre la resistencia a la enfermedad han expandido en la
última década a través de los rápidos avances que se han producido en la
genómica y en la tecnología genómica. Estos desarrollos permiten ahora a los
animales a ser genotipados para miles de marcadores genéticos (polimorfismos de
un solo nucleótido o SNP) en todo el genoma, lo que permite SNPs que están
asociados con los rasgos de interés para ser identificados por los estudios de
asociación en todo el genoma ( Goddard y Hayes, 2009 ).
El propósito de esta revisión es describir los esfuerzos en curso para investigar
oportunidades de usar la genética del cerdo como una herramienta más en la
lucha contra el PRRS, como parte del PRRS anfitrión Genética Consortium
(PHGC). El PHGC se estableció en 2007 con fondos de la National Pork Board
para investigar la base genética de la respuesta del huésped a la infección por
PRRSV, después de una amplia participación de los interesados (NC229 PRRS
investigadores de la enfermedad, los investigadores del genoma NC1037 /
NRSP8, National Pork Board porcina Comité de Salud y Ciencia Animal miembros,
veterinarios, la Asociación Americana de veterinarios Porcinos, productores y
socios comerciales que representan a los criadores, la salud animal, alimentación,
y las compañías de diagnóstico) ( 0190 ; 0260 ). El uso novedoso de genotipado
y enfoques de fenotipo profundas que combinan estado de la genómica de arte
con el estado de la virología arte, el objetivo final de estos esfuerzos es el
desarrollo de herramientas y criterios de selección que se pueden utilizar en los
programas de cría de cerdos para disminuir el impacto de PRRS en el industria
porcina. Aunque el trabajo sustancial También está en marcha sobre la base
genética de PRRS reproductivos (resumidos en Dekkers et al., 2014 y Harding et
al., 2016 ), el objetivo principal de esta revisión es en la investigación terminados y
en curso de PRRS durante la fase de crecimiento como parte de la PHGC. Los
principales resultados de estos estudios se resumen en la Tabla 1 y se describirán
con más detalle en el resto de esta revisión.
Tabla 1.
Resumen de los principales resultados de las investigaciones sobre la base genética de la
respuesta del huésped a la infección por el virus de síndrome reproductivo y respiratorio en
cerdos destetados.
# #
ensayo cerdo Resultados
Experimentar s s principales referencias
Generación La infección 9 1499 respuesta del 0030 ; 0035 ; 0040
1 de experimental huésped a
pruebas con NVSL 97 PRRS es
PHGC moderadament
e heredable
Identificación
de un gen
importante para
la resistencia y
capacidad de
recuperación
en SSC4
Generación La infección 5 845 Confirmación Hess et al. (2016)
2 ensayos experimental del efecto
PHGC con KS- SSC4 para una
2.006-72.109 segunda cepa
Generación 14 2344 correlaciones
1 y 2 PHGC genéticas altas
ensayos entre respuesta
del huésped a
cepas
heterólogas
# #
ensayo cerdo Resultados
Experimentar s s principales referencias
Anfitrión Waide et al. (2017)
respuesta a
PRRS es
altamente
poligénica, más
allá del efecto
SSC4
predicción Waide (2015)
genómico de
respuesta del
huésped dentro
ya través de las
cepas
Generación vacunación 4 660 Confirmación Dunkelberger et
3 ensayos PRRS y co- del efecto al. (2017)
PHGC infección SSC4 en
experimental respuesta a la
con PCV2b vacuna y la
coinfección
El impacto
negativo de la
vacuna del
PRRS en la
respuesta
PCV2b
Pruebas de cerdos 4 ~ 800 En progreso
campo limpios en
establos reto
naturales
La respuesta PRRSV IgG 4 1189 MHC Hess et al. (2016)
de específica de identificado
anticuerpos los ensayos como principal
de infección gen para IgG
de PRRS
experimento Micro-array y Identificación Koltes et al. (2015)
s de RNAseq de de GBP5 como
expresión cerdos la mutación
génica seleccionado causal de los
s a partir de principales
los ensayos genes SSC4
de infección Identificación Arceo et
de PRRS de genes y las al. (2013) ; Schroye
vías asociada n et al. (2015) ; Bao
con alta y baja et al. (2016)
viremia y el gen
importante
SSC4
opciones de la tabla
El objetivo de esta revisión es sobre las oportunidades para sacar provecho de la
variación genética que ya está presente en las poblaciones porcinas a través de la
selección genética, en lugar de oportunidades para generar nueva variación a
través de métodos tales como la edición de genes. Este último ha, sin embargo, se
ha demostrado recientemente para proporcionar oportunidades para generar
cerdos que demuestran una resistencia completa a la infección por PRRSV
( Whitworth et al., 2016 ). El uso de estos métodos para la producción porcina
comercial es, sin embargo, dependen de la aprobación por las agencias
gubernamentales pertinentes, que es en el momento incierto.
respuesta 6. Anticuerpo
Se evaluó la respuesta de anticuerpos a la infección por PRRSV en varios
ensayos PHGC usando fluorescente microesferas de Inmunoensayo, evaluada
como la muestra a la relación positiva (S: P) de PRRSV N-proteína IgG específico
en suero a 42 dpi ( Hess et al, 2016. ). Se encontró relación de P a ser
moderadamente heredable para ambas cepas (0,31 ± 0,09 para NVSL y 0,40 ±
0,10 para KS06), pero no tienen una relación clara con VL o WG después de la
infección, ya sea en el fenotípica o nivel genético (: El S Hess et al., 2016 ). Sin
embargo, GWAS identificó fuertes asociaciones de SNPs en el Complejo Mayor de
Histocompatibilidad con respuesta de anticuerpos, lo que explica ~ 10 y 45% de la
varianza genética de S: P para NVSL y KS06, respectivamente. El WUR SNP no
se asoció con la respuesta de anticuerpos, confirmando que el modo de acción de
los principales genes en esta región probablemente no es a través de las
respuestas inmunes mediadas por anticuerpos de adaptación.
En conjunto, estos hallazgos sugieren que la respuesta de anticuerpos a la
infección por PRRSV podría ser un posible rasgo indicador para la selección de
cerdos con aumento de la resistencia a la infección por PRRSV. Esta proposición
se ve reforzada por los resultados de un brote en una manada cerda reproductora
informado por Serão et al. (2014) , que encontraron correlaciones altas favorables
genéticos de S: relación P medidos por ELISA ~ 46 días después del brote con el
rendimiento reproductivo (tamaño de la camada, número de nacidos muertos,
momias número) durante el brote. De hecho, otros estudios indican precisión de la
predicción genómicas moderadas para PRRS S: P utilizando SNPs situados
dentro de dos regiones genómicas en SSC7 que tenían grandes efectos sobre S:
P, mientras que el resto del genoma mostró capacidad predictiva limitada ( . Serão
et al, 2016 ). Se necesita más trabajo para confirmar estas asociaciones, así como
la relación de S: P después de la vacunación con respuesta del huésped y el
rendimiento durante la infección de PRRS. Sería necesario Este último con el fin
de implementar S: P como un rasgo indicador en programas de selección.
8. ensayos Co-infección
En la práctica, PRRS se encuentra a menudo para aumentar la incidencia de
infecciones secundarias, resultando en complejo por ejemplo, porcino respiratorio
enfermedad (CRP) y la enfermedad asociada circovirus porcino (PCVAD)
( Baekbo et al., 2012 ). Para investigar la base genética de la respuesta del
huésped a co-infección, cuatro ensayos de co-infección se llevaron a cabo en la
Universidad del Estado de Kansas, en la que los cerdos de cría fueron infectados
con cepas de campo del PRRSV y PCV2b. Para evaluar la respuesta del huésped
a la vacunación de PRRS, la mitad de los cerdos en cada ensayo fueron
vacunados con un PRRSV vivo modificado 28 días antes de co-infección. Los
detalles del diseño de estos experimentos, junto con los resultados para la
patogénesis y los efectos de la vacunación PRRSV están en Niederwerder et
al. (2015) . Los resultados mostraron que la vacunación a PRRS aumentó el
impacto de la exposición posterior a PCV2b, consistente con los hallazgos
anteriores de que la infección por PRRSV debilita el sistema inmunológico y
aumenta la susceptible de cerdos a otros patógenos ( Yin et al., 2013 ). Los
análisis genéticos de los dos primeros ensayos por Dunkelberger et
al. (2017) demostraron una baja a moderada base genética para la respuesta del
huésped a la vacunación PRRS (PRRS VL y WG) y para co-infección (PRRS y
PCV2b VL y WG con o sin vacunación previa), con heredabilidades que van ,07-
,57. Genotipo en el WUR SNP tenía una asociación significativa con la respuesta
del huésped, tanto después de la vacunación y post co-infección: después de la
vacunación, los cerdos AB tenido inferior virus de la vacuna VL y más rápido ganar
que los cerdos de AA, lo que confirma los resultados por Abella et al. (2016) para
la vacunación con una cepa europea atenuada del PRRSV. Mensaje co-infección,
los cerdos tuvieron una menor AB PRRSV LV, pero no difirieron significativamente
de los cerdos de AA en la tasa de crecimiento. Para PCV2b VL, se detectó
evidencia sugerente de una interacción entre la vacunación y el genotipo WUR,
donde los cerdos AB tenían significativamente menor PCV2b VL cuando
vacunados pero PCV2b similares VL cuando no estaban vacunados. Esto
demuestra que el principal gen de resistencia PRRS en SSC4 no sólo proporciona
un cierto nivel de resistencia contra la infección por PRRS pero también reduce el
nivel de co-infección con o después de la infección por PRRSV.
10. Conclusiones
se encontró respuesta Host de cerdos de destete a la infección por PRRSV a tener
un componente genético considerable bajo estudios de desafío experimental
controladas. En particular, un gen importante para la respuesta del huésped a
PRRS se identificó en SSC4. Una mutación causante putativo fue identificado en
el gen GBP5, que está implicado en la respuesta inmune innata. Los cerdos con el
genotipo favorable para este gen se han demostrado tener una mejor respuesta
del huésped a dos cepas del PRRSV I Tipo diferente, así como para las cepas de
vacuna de virus vivos II tanto modificados Tipo I y Tipo. El SNP WUR en esta
región se puede utilizar para seleccionar a los cerdos que son más resistentes y
resistentes a PRRS. Si bien este amplio conjunto de estudios es poco probable
para identificar los cerdos que son completamente resistentes a PRRS, que están
empezando a desentrañar la base genética de la respuesta del huésped a PRRS,
dando lugar a la posibilidad de seleccionar los cerdos que son menos susceptibles
a la infección por PRRSV y para los efectos de PRRS en el rendimiento. Este
trabajo demuestra que, a pesar de la selección genética no ofrecerá una solución
única 'bala mágica', es decir, una resistencia completa, especialmente teniendo en
cuenta la complejidad y variabilidad del virus del PRRS, la genética del huésped
puede ser un enfoque adicional y complementaria para combatir el impacto de
PRRS en la producción de carne de cerdo. Además, penetración en respuesta a la
infección con PRRSV puede conducir a nuevas vías para el desarrollo de vacunas
y terapias más eficaces.
Expresiones de gratitud
Los proyectos descritos en este documento son apoyados por la Junta Nacional
de cerdo subvenciones, USDA NIFA (premios 2008-55620-19132 , 2010-65205-
20433 y 2013-68004-20362 ), Genoma Canadá , Genoma Alberta y la Alberta
Ganado y Carne de la Agencia , PigGen Canadá , Asociación de Criadores de
cerdos canadienses , Canadian Centre for porcina mejora , los proyectos NRSP-8
porcina Genoma Humano y de coordinación de Bioinformática y el PRRS anfitrión
Genética Consorcio formado por la USDA ARS, la Universidad del Estado de
Kansas, Universidad del Estado de Iowa, Michigan State University, del estado de
Washington universitaria de la Universidad de Purdue, la Universidad de
Nebraska-Lincoln, Universidad de Saskatchewan, Universidad de Alberta, PIC /
Género, Choice Genetics, Genética Fast, Genesus, Inc., TOPIGS, PigGen
Canada, Inc., IDEXX Laboratories, y Tetracore, Inc.
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