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Actualizaciones de las

enfermedades más
importantes.
Revisión de signos
atípicos externos
causando un diagnóstico
equivocado en el campo
Dr. Allan Heres

Foto referencial/ Imagen depende de la conferencia


Enfermedades actuales en camarones peneidos

AHPND (Enfermedad de la necrosis


hepatopancreático aguda) (Han, 2016)
- China 2009
- Camarón enfermo (flecha roja)
- Vibrio parahaemolyticus
- A 69-kb plásmido con genes de
toxina
- Photorhabdus insect-related (PirAB)
- Photorhabdus luminescens
• Bacteria presente en el nematodo del
insecto.

2 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

AHPND: La presencia del plásmido


portador del gen de la toxina en otras
vibrios spp.
- Diagnóstico rápido de Vibrio owensii
responsable de AHPND con isotermo
recombinase amplificación de la
polimerasa (Liu et al. 2017)
- Cepa de Vibrio campbellii portadores
del gen de PirVP causa la enfermedad
de la necrosis hepatopancreático
aguda (Dong et al. 2017)

3 03/26/18 Confidential
AHPND/EMS confirmado en Cameron, Texas, 2017

4 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

Hemocyanin of L. vannamei agglutinates V.


parahaemolyticus AHPND and neutralizes its
toxin (Boonchuen et al. 2018, Thailand)
- La hemocianina (HMC) es el gen más
abundante identificado como el gen regulado
por incremento (3h, 6h, 48h post desafío)
- La hemocianina podría inducir la aglutinación
bacteriana.
- La hemocianina podría neutralizar la toxina
VPAHPND a través de la interacción PirA

5 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

Hemocyanin of L. vannamei agglutinates V.


parahaemolyticus AHPND and neutralizes its
toxin (Boonchuen et al. 2018, Thailand)
- La hemocianina (HMC) es el gen más
abundante identificado como el gen regulado
por incremento (3h, 6h, 48h post desafío)
- La hemocianina podría inducir la aglutinación
bacteriana.
- La hemocianina podría neutralizar la toxina
VPAHPND a través de la interacción PirA
- Post desafío, 7 días, cada 12h

6 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos
Vibrio parahaemolyticus
Transcriptome analysis of Litopenaeus vannamei
challenged by V parahaemolyticus reveals
unique immune-related genes. (Qin et al. 2018)
- Los perfiles transcriptómicos de los hemocitos de
camarón se exploraron inyectando con o sin Vp.
- 42,632 genes se obtuvieron con RNAseq
- 2,258 genes expresados después del desafío con
Vp
• 1,017 genes, expresión aumento
• 1,241 genes, expresión disminuyo
- Sistema inmune innato: humorales y celulares
- Inmunidad humoral (5 genes): SR, MNK, CTL3,
GILT y ALFP.
• Expresión aumento en 6 diferentes tejidos expuestos
a Vp (Gram -) y S. aureus (Gram +)
• “knock down” los 5 genes, se redujo significativamente
la habilidad de eliminar las bacterias

7 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

EHP (Enterocytozoon hepatopenaei)


- Microsporidiosis hepatopancreático
- Tailandia 2004
- Crecimiento lento, no hay mortalidad
significativa en P. monodon y P.
vannamei.

8 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

EHP Enterocytozoon hepatopenaei


(Rajendran et al. 2016)
- India, 2016
- Brotes de EHP en granjas de
Penaeus vannamei.
- Asociado con la enfermedad de las
heces blancas (WFS).
- Diferencia en tallas (Fig. A)
- Camarón enfermo con intestino
vacío y blanco (Fig. B, flecha)

9 03/26/18 Confidential
Brote de EHP y TSV en Venezuela, 2016

Detectado el Enterocytozoon
hepatopenaei (EHP) y Sindrome de Taura
Viral (TSV) en Penaeus vannamei
cultivado en Venezuela (Tang et al. 2017).
- Universidad de Arizona, Articulo publicado
en Aquaculture, 480 (2017), pp: 17–21.
- En 2016, se observó una variación grande
en tallas y crecimiento reducido.
- La tasa de crecimiento era 0.58 g /
semana, menos del crecimiento usual 1
g/semana.
- No hubo una perdida substancial, la
supervivencia era de 78%.

10 03/26/18 Confidential
Brote de EHP y TSV en Venezuela, 2016 A

EHP venezolano y SEA


- Las similitudes de secuencia de nucleótidos
en 18S rRNA, B-tubulina y proteína de la
pared de esporas
- Sugiere que el EHP venezolano no se
introdujo recientemente desde el sudeste
asiático. B
El TSV aislado es similar al TSV venezolano
aislado en 2005.
- Órgano linfoide con esferoides (A)
- Esferoides ectópicos (B)

11 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

WFS - white feces síndrome


(Sriurairatana et al. 2014)
- Síndrome de las heces blancas,
Asia
- Heces blancas en el agua (Fig. a
y b)
- Camarón enfermo (C) y camarón
sano (D).
- Puede estar asociado con EHP y
ATM (microvellosidades
transformadas agregadas)

12 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones
peneidos
Microbiota en casos de WFS (Hou et al. 2018)
- La microbiota intestinal está estrechamente
relacionada con el estado de salud del
huésped.
- Se comparo la microbiota en el intestino
entre camarones sanos y camarones con
WFS.
- La diversidad microbiana es reducida en
camarones enfermos, por ejemplo reducción
Paracoccus y Lactococcus.

13 03/26/18 Confidential
Microbiomas
Poblaciones bacterianas en camarones sanos y con el síndrome de las heces blancas (WFS)

Intestinal bacterial signatures of


white feces syndrome in shrimp,
Hou et al. 2018, China
- Microbiota de intestinos de
camarones sanos y con WFS
- 20 g
- DNA genómico de los intestinos
- “Primers” universales para
amplificar la región hipervariable
V4 del gen 16S rRNA bacteriano

14 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

ATM (aggregated transformed microvilli), Asia,


Dr. Tim Flegel
- Microvellosidades transformadas agregadas
- Aparición de cuerpos vermiformes similares
a gregarinas dentro de los túbulos del HP e
intestino
- No hay núcleos.

15 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

HPH, haplosporidiosis hepatopancreático


- 2007-2009 Indonesia, brotes severos
- En cultivos de Penaeus vannamei
- Por examen histológico, el agente es
similar a un haplosporidio reportado en
Centro América.
- Sequencia ssu rRNA, 96% similar al
haplosporidio de Centro America.

16 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

CMD - Covert mortality disease (Zhang et al.


2014)
- Enfermedad de la mortalidad oculta, Penaeus
vannamei, China, 2002-2003
- Detectado virus RNA, CMNV, Nodavirus,
China, 2009
- Mortalidad crónica en lugar de precipitada y
alcanza su punto máximo en 60 a 80 días de
cultivo
- Signos clínicos: necrosis muscular
blanquecina abdominal, atrofia y necrosis
hepatopancreática, estómago y estómago
vacíos, caparazón blando y crecimiento lento.

17 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

CMD (Covert mortality disease), Zhang


et al. 2014
- Necrosis coagulativo del músculo,
asociada con signos macroscópicos
del musculo blanco
- Hepatopancreas pálidos, necrosis
• Núcleos agrandados en el
hepatopáncreas, cuerpos de inclusión
- Esferoides en el órgano linfoide
• cuerpos de inclusión

18 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

VCMD (Viral covert mortality disease), Liu et al. 2018


- CMD cambio a VCMD
- 2002-2003, empezó en piscinas de alta densidad
con Penaeus vannamei, South China
- 2009, detectado el virus, CMNV
- 2012, Penaeus chinensis y Penaeus japonicus,
China
- 2013-2015, P. monodon y Macrobrachium
rosenbergii, China
- 2016, Tailandia, (Thitamadee et al. 2016)
- 2017, P. vannamei de Vietnam y Ecuador (sin
publicar, Zhang et al. 2017)

19 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

VCMD (Viral covert mortality disease), Liu et al. 2018


- Detección de CMNV por RT-LAMP
- Vectores y reservorios, 11 especies, positivos
CMNV, en piscinas con camarones enfermos VCMD
- Artemia sínica, percebe, rotífero, anfípodos, almeja,
ostras, cangrejo ermitaño, fantasma y violinista
- Factores de riesgo biológicos

20 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos
Shrimp hemocyte iridescent virus (SHIV), Qiu
et al. 2017
- Virus iridiscente en el hemocito del camarón
(Iridovirus), nuevo virus en la familia Iridoviridae
- Granjas de Litopenaeus vannamei, Provincia
Zhejiang, China, Diciembre, 2014
- Causa una enfermedad severa y alta
mortalidad
- Signos clínicos: intestinos y estómagos vacíos,
hepatopáncreas pálidos, caparazón suave y
perdida de color
- Libre de WSSV, YHV, TSV, IHHNV, AHPND

21 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

Shrimp Hemocyte iridescent virus (SHIV), Qiu et al. 2017


- TEM, virus icosaédricos en el citoplasma (Fig. e)
- Árbol filogenético basado en secuencia de
aminoácidos MCP y ATPase
- Nuevo genero, Xia’irido’virus, virus iridiscente del
camarón
- Detectado en otros crustáceos por PCR anidada

22 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

Shrimp Hemocyte iridescent virus (SHIV),


Qiu et al. 2017
- Tejido hematopoyético con inclusiones
basófilas y núcleos picnóticos (a).
- Branquias (a), hepatopancreas (b),
pereiópodos (c) con inclusiones
basófilas y hemocitos picnóticos.
- Flechas negras: inclusiones basófilas
- Flechas blancas: núcleos picnóticos

23 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

YHV-7 (yellow head virus), Mohr et al. 2015


- Enfermedad de la cabeza amarilla
- Nuevo genotipo 7, P. monodon, Australia,
2015
- Letal, severidad menor a YHV1 (Tailandia)

24 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos P. monodon

YHV (yellow head virus), Songsok et al. 2009


- 1991, brote en Penaeus monodon, Tailandia
• Aumento de la alimentación durante varios días
• Disminución repentina del apetito
• Nadando cerca del borde del estanque
• Las mortandades pronto siguen
• Coloración amarillenta del cefalotórax y branquias
- 2002, Empezó el cultivo de L. vannamei
- 2006, Brote de YHV en L. vannamei,
Tailandia
• Baja salinidad y manejo deficiente
• 40-60 días

L. vannamei

25 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos
YHV (yellow head virus), Songsok et al. 2009
- Severidad de YHV en L. vannamei, infección
experimental a diferentes salinidades.
- Camarones 8-10 g, aclimatos a 5, 15, 30
psu

Desafío por inyección, Desafío vía oral,


100% mortalidad 100% mortalidad
5 psu 5 días 5 psu 7 días
15 psu 6 días 15 psu 8 días
30 psu 20 días 30 psu 40 días

26 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos
YHV (yellow head virus)
- Litopenaeus vannamei en Tailandia
- Núcleos picnóticos y kariorexis de los
hemocitos
- Tejido hematopoyético, órgano linfoide,
- Branquias, corazón.

27 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

WSSV (white spot syndrome virus)


- Australia
- Primer brote de WSD, Noviembre 2016
- Penaeus monodon

28 03/26/18 Confidential
Source: https://www.shrimpnews.com/ Bob Rosenberry
Enfermedades actuales en camarones peneidos

WSSV (white spot síndrome virus),


- Enfermedad de la mancha blanca (WSD)
- Sigue siendo una amenaza en el Asia
para P. vannamei and P. monodon
- Control: medidas preventivas, filtros,
invernaderos, uso de camarones
domesticados genéticamente
seleccionados, SPF.

29 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos
Carga circulante de WSSV en la Table 1. Category of Severity of WSSV Severity of WSSV infection in shrimps
región sudoeste de Bangladesh infection in Shrimp from January 2014 to June 2017

desde 2014-2017 (Siddique et al. 2018) CT value Level of infection Total (n = 120) % of samples

- qPCR < 24.33 Heavy 37 30.83

- Un nivel crítico de la carga de WSSV 28.33–24.33 Moderate 36 30

para la manifestación y transmisión 31.52–28.33 Light 11 9.17

de WSD 34.82–31.52 Very little 10 8.33

- Variación genética (VP28) en la > 34.82 Negative 26 21.67

región
- 2.1×108 - 2.64×1014 copias/g de tejido
Table 2. WSSV
load/g shrimp Severity level Total (n = 120) % of samples
de camarón (n=120) tissue

- Carga WSSV,
2.0 × 105 G1-mild 0 0
2.0 × 107 G2-mild to moderate 7 5.83
• Escala log 14, manchas en todo el G3-moderate to
2.0 × 109 74 61.67
exoesqueleto severe
• Escala log 8, sin manchas 2.0 × 1011 G4-severe 13 10.83

- Tabla 1, Walker (2011) No load Negative 26 21.67

- Tabla 2, Tang & Lightner (2000)

30 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

Carga circulante de WSSV en la región


sudoeste de Bangladesh desde 2014-2017,
Infección WSSV copias
Siddique et al. (2018)
Transmisión por inmersión 105
- Recomendaciones para reducir riesgos Inoculación peroral 107.1-107.5 /g
• Siembra de PL libre de virus a partir de Letal 96H 6X107 /g
reproductores negativos para PCR Muestras (Siddique et al.) >108 /g
• Mantenimiento adecuado de post-siembra para
reducir los riesgos de infección por WSSV

31 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

Carga circulante de WSSV en la región sudoeste de Bangladesh desde 2014-2017


(Siddique et al. 2018)
- Conclusiones
• Los estanques con cargas altas o moderadas de infección tenían 1,6 veces más probabilidades
de tener un brote de enfermedad que aquellos con infecciones leves o muy leves
• No hay una técnica de tratamiento sostenible disponible
• Implementando buenas prácticas acuícolas
• Vigilancia regular de la carga viral crítica
• Técnica cuantitativa de PCR en tiempo real
• Equipo portátil,
• http://www.smith-root.com/edna/ande

32 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

IMNV (infectious mionecrosis virus), Thitamadee et al.


2015
- Virus de la mionecrosis infecciosa
- P. vannamei, Indonesia, 2006
- Severidad de IMNV ha disminuido, perdidas de
producción 30%
- CP Prima, 2014, mezcla patentada de "extractos de
hierbas naturales“ para reducir IMNV

33 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos
IMNV (infectious mionecrosis virus), Hameed et al.
2017
- P. vannamei, Estado de Bengala Occidental, India,
2017
- Signo clínico de opacidad muscular con color rojizo
en los segmentos abdominales distales
- La mortalidad vario de 20% a 50%, aumentando
- IMNV detected by RT-PCR assay
- El virus causó mortalidad en camarón desafiado
intramuscularmente
• Virus presente: hemolinfa, musculo, branquias,
hepatopancreas
- No pudo causar mortalidad por vía oral
- Fig. (a) naturalmente (b) experimentalmente
infectado
- Histopatología: necrosis multifocal, infiltración
hemocítica e inflamación fibroquística del musculo
esquelético

34 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

ASDD (abdominal segment deformity


disease), Sakaew et al. 2008
- Enfermedad de la deformidad del
segmento abdominal
- Tailandia, Malasia e Indonesia 2004-
2006.
- Segmentos abdominales deformados,
agrandados o torcidos
- A veces acompañado por músculos
opacos.
- Pérdida económica, sin problemas con
supervivencia y crecimiento

35 03/26/18 Confidential
Enfermedades actuales en camarones peneidos

ASDD (abdominal segment deformity


disease)
- El análisis histológico reveló necrosis y
degeneración del músculo abdominal,
con infiltración hemocítica.
- PCR e ISH negativo para IHHNV,
IMNV, MrNV, TSV and LSNV
- TEM, 20-22 nm, partículas virales sin
envoltura en el citoplasma de las
lesiones musculares, el tejido
conjuntivo y las células gliales de los
tejidos neurales y las branquias.

36 03/26/18 Confidential
ESTADO ACTUAL DE LAS ENFERMEDADES DEL CAMARÓN EN ASIA

Grupo Consultivo Regional de Asia para la Sanidad de los Animales Acuáticos,16vo


reunión, Bali, Indonesia, NACA, Agosto, 2017 (Dr. Timothy Flegel)
- WSSV e YHV-1 para P. vannamei y P. monodon
- YHV-8 (China), no hay noticias recientes, P. monodon
- CMNV (China, Tailandia, Vietnam), P. vannamei
- IMNV (Indonesia, India), P. vannamei
- TSV e IHHNV, no son amenazas graves, camarones mas tolerantes P. vannamei
- ASSD, retrovirus-like, baja prevalencia, P. vannamei
- Laem Singh virus (LSNV) y un elemento que contiene integrasa (ICE) que están
asociados en conjunto con el síndrome de crecimiento lento de monodon (MSGS),
P. monodon en Tailandia
- Menos importante, HPV y MBV, P. monodon
- MBV no es infeccioso para P. vannamei (manuscrito enviado)

37 03/26/18 Confidential
ESTADO ACTUAL DE LAS ENFERMEDADES DEL CAMARÓN EN ASIA

Grupo Consultivo Regional de Asia para la Sanidad de los Animales Acuáticos,16vo


reunión, Bali, Indonesia, NACA, Agosto, 2017 (Dr. Timothy Flegel)
- AHPND sigue siendo la enfermedad bacteriana mas importante
• Ahora esta incluida en la lista de enfermedades de camarón de la OIE
• V. parahaemolyticus portador del plásmido (pAP) codifica dos toxinas (PirvpA and PirvpB) que
causan AHPND
• Vp portador del plásmido (pAP) mutado no produce toxinas pero causa 50% de mortalidad
• V. harveyi, V. owensii y V. campbellii portadores del plásmido (pAP) deben ser incluidos en la
enfermedad AHPND.
• Roseateles sp. (Berkholderiales, Comamonadaceae) and Shewanella sp.
(Alteromonadales, Shewanellaceae) pueden potenciar la virulencia AHPND (sin
publicar)
• V. harveyi con los genes de las toxinas en el cromosoma (Australia)

38 03/26/18 Confidential
ESTADO ACTUAL DE LAS ENFERMEDADES DEL CAMARÓN EN ASIA

Grupo Consultivo Regional de Asia para la Sanidad de los Animales Acuáticos,16vo


reunión, Bali, Indonesia, NACA, Agosto, 2017 (Dr. Timothy Flegel)
- Otra enfermedad importante es la microsporidiosis hepatopancreática (HPM)
causada por Enterocytozoon hepatopenaei (EHP)
• Recomendaciones:
• Tratar con oxido de calcio (cal viva) piscinas de tierra para inactivar las esporas antes de las
siembras
• Permanganato de potasio a 15 ppm por 15 min mas efectivo para desactivar las esporas
durante desinfección de rutina en laboratorios en comparación con cloro y formalina.
- Hay informes de lotes de Artemia positivos para EHP
- Una variante de EHP ha sido reportada recientemente desde Venezuela
- Laboratorio de Flegel ha recibido muestras de camarones de otro país en Sur
América positivo para EHP por PCR e hibridación in situ. Secuencia del gen de la
proteína de la pared de la espora casi idéntica a la del EHP asiático

39 03/26/18 Confidential
ESTADO ACTUAL DE LAS ENFERMEDADES DEL CAMARÓN EN ASIA
Grupo Consultivo Regional de Asia para la Sanidad de los Animales Acuáticos,16vo
reunión, Bali, Indonesia, NACA, Agosto, 2017 (Dr. Timothy Flegel)
- Spiroplasma eriocheiris, cangrejo chino Eriocheir sinensis (Wang et al. 2002)
• Procambarus clarkii, Machrobrachium rosenbergii, Machrobrachium nipponensis y
Penaeus vannamei (Wang et al. 2011)
• Desafío con este patógeno en P. vannamei usando inóculo obtenido de infecciones en M.
rosenbergii no causaron ninguna mortalidad (Flegel)
- Macrobrachium rosenbergii Taihu virus (MrTV) (Pan et al. 2016), familia
Dicistroviridae (TSV)
- Macrobrachium nipponense reovirus (MnRV) (Zhang et al. 2016)
- CQIV, nuevo iridovirus de cangrejos rojos de rio exóticos, Cherax quadricarinatus
(Xu et al. 2016)
• CQIV, en un desafío en Procambarus clarkii Americano y Penaeus vannamei causo alta
mortalidad
- Chequa iflavirus, nuevo picornavirus en Cherax quadricarinatus, Australia (Sakuna
et al. 2017)

40 03/26/18 Confidential
Histopatología
Camaronera B1, April 2017

Órgano linfoide con esferoides, WSSV, epitelio subcuticular del Hepatopancreas sin patologías,
necrosis, núcleos picnóticos y estomago. 400X (piscina 1) niveles altos de vacuolas de lípidos.
kariorexis. 400x (piscina 1) 400X (piscina 1)

41 03/26/18 Confidential
Histopatología
Camaronera E1, Agosto, 2017

Hepatopancreas sin patología con SHPN, necrosis Fuerte inflamación y


niveles altos de lípidos. hepatopancreático séptico. Posible desprendimiento de células de los
400X (piscina 1) causa por Vibriosis. túbulos del hepatopancreas.
100X (piscina 2) 100X (piscina 3)

42 03/26/18 Confidential
Histopatología
Camaronera E1, Agosto 2017

HP

Intestine lumen

Fuerte inflamación y desprendimiento de Gregarinas en el intestino. Órgano linfoide con esferoides.


células de los túbulos del hepatopancreas. 400x (piscina 1) 100X (piscina 2)
400X (piscina 3)

43 03/26/18 Confidential
Histopatología
Camaronera E2, Agosto 2017.

Hepatopancreas con túbulos SHPN, Fuerte inflamación y


deformes, necróticos y necrosis hepatopancreático séptico, desprendimiento de células de los
constricciones, posible caso NHP. posible caso Vibriosis. túbulos del hepatopancreas,
100X (piscina 2) 100X (piscina 1) posible caso de AHPND/EMS.
100X (piscina 2)

44 03/26/18 Confidential
Histopatología
Camaronera M1, Agosto 2017

Hepatopancreas

Lumen del Intestino

Hepatopancreas

Gregarinas en el intestino. Gregarinas en el intestino. Necrosis muscular en el ultimo


100X (piscina 3) 100X (piscina 3) segmento.
100X (piscina 2)

45 03/26/18 Confidential
Histopatología
Camaronera M2, Agosto 2017

Gregarinas en el intestino. Órgano linfoide con esferoides. Necrosis muscular en el ultimo


400x (piscina 3) 400X (piscina 4) segmento de la cola.
400X (piscina 1)

46 03/26/18 Confidential
Histopatología
Camaronera M3, Agosto 2017

Órgano linfoide con esferoides Esferoides ectópicos. Gregarinas en el intestino.


400x (piscina 1) 400X (2) 400X (piscina 2)

47 03/26/18 Confidential
Histopatología
Camaronera N1, Octubre-2017

Hepatopancreas, H&E, 1000X Hepatopancreas, GRAM (+), 1000X

48 03/26/18 Confidential
Histopatología
Camaronera N2, Octubre-2017

Hepatopancreas, H&E, 1000X Hepatopancreas, GRAM (+), 1000X

49 03/26/18 Confidential
Microbiomas
Poblaciones bacterianas en camarones sanos y con el síndrome de las heces blancas (WFS)

Composición general de la comunidad bacteriana


- Los productos de PCR de las muestras se combinaron
por igual y luego se secuenciaron utilizando la
plataforma Illumina Hiseq2500.
- Las secuencias se agruparon en unidades taxonómicas
operativas (OTU) 97% de similitud
- Para determinar las relaciones filogenéticas de las
diferentes OTU y las especies dominantes en las
diferentes muestras, se realizó una alineación de
secuencia múltiple con MUSCLE.
- El índice de Shannon y los análisis de correlación de
Spearman se usaron para probar las correlaciones
entre comunidades microbianas grupos sanos y WFS

50 03/26/18 Confidential
Microbiomas
Poblaciones bacterianas en camarones sanos y con el síndrome de las heces blancas (WFS)

Composición general de la comunidad


bacteriana
- 34 phyla: Proteobacteria (57%), Tenericutes
(23%), Firmicutes (9%) y Bacteroidetes (6.6%)
- Nivel de genero: Candidatus Bacilloplasma,
Photobacterium, Vibrio, Paracoccus,
Lactobacillus, Ruegeria, Haloferula,
Shewanella, Marinicella, and Helicobacter
- Se compartieron 1395 OTUs (sanos y
enfermos)

51 03/26/18 Confidential
Microbiomas
Poblaciones bacterianas en camarones sanos y con el síndrome de las heces blancas (WFS)

Composición de OTU en camarones con WFS


- Phascolarctobacterium, Blautia,
- Clostridium, Subdoligranulum y Bacteroides
- Candidatus Bacilloplasma, Phascolarctobacterium
- Ruminococcus
Composición de OTU en camarones sanos
- Paracoccus, Lactococcus

52 03/26/18 Confidential
Reliable extraction of DNA from Whatman™ FTA™ cards
Extracción confiable de AND, sin refrigeración

53 03/26/18 Confidential
Reliable extraction of DNA from Whatman™ FTA™ cards
Extracción confiable de AND, sin refrigeración
A simple non-enzymatic method for the
preparation of white spot syndrome virus
(WSSV) DNA from the haemolymph of
Marsupenaeus japonicus using FTA
matrix cards, Sudhakaran et al. 2009
(Japón)
Field diagnostic tools for pathogenic
vibrios, King et al. 2014 (GAA)
Phibro Aqua, desafío en Tilapia.
HyLab, Israel, laboratorio molecular,
confirmo Streptococcus agalactiae

54 03/26/18 Confidential
MUCHAS GRACIAS
Dr. Allan Heres
ISRAEL
allan.heres@pahc.com
Mobil: +972-52-518-5748

55 03/26/18 Confidential
© 2018 Phibro Animal Health Corporation, Teaneck, NJ 07666
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