BIOQUIMICA 2018

Docente: Isabel Cristina Castellanos TALLER 9

PROTEÍNAS Y BASES DE DATOS

El presente taller es una evaluación formativa centrada tanto en procesos como en productos que valora las
siguientes competencias:

- Uso de herramientas tecnológicas (TIC) para adquisición de competencias en química orgánica e

investigación.
- Capacidad de reconocer la necesidad continúa de nuevos conocimientos y localizar, evaluar, integrar
y aplicar este conocimiento de manera apropiada.
- Capacidad de trabajar en equipo de manera efectiva con objetivos establecidos, planificación de
tareas, cumplimiento de plazos

Fomenta la capacidad de aplicación práctica de los conceptos, las capacidades investigativas en la revisión
bibliográfica, presentación de diversas alternativas para la solución a un problema y análisis crítico de
diferentes fenómenos de la naturaleza desde el contexto científico.

Copito de Nieve fue capturado en el año 1966 en Guinea Ecuatorial cuando tan
sólo era un pequeño gorila de aproximadamente unos 2 años de edad. Su pelo
era blanco; su piel, rosada y sin pecas, y tenía los ojos azules. Cuando llegó al
Zoo de Barcelona se le realizó un examen dermatológico y biopsias de su piel, a
partir de las que se determinó que presentaba las características propias del
albinismo oculocutáneo de tipo IA (OCA1A).

1. Consulte en la base de datos de las enfermedades genéticas (OMIM) en

el ncbi la descripción de la enfermedad (albinism OCA1A en inglés).
Registre la descripción.
2. En el genoma de copito de nieve el gen que registró la mutación asociada a su fenotipo de el gen con ID
101148846 en la base de datos del ncbi.

A continuación, por favor registre las siguientes características del gen extrayendo la información de la base de
datos del ncbi.

Nombre del Gen

Cromosoma en el que se ubica
Tamaño del gen (en nucleótidos)
Hebra codificante
Número de exones
Número de acceso de la Proteina (XP..)

3. Abra en una ventana la página de UniprotKB. Y usando el número de acceso de la proteína busque en esta
base de datos la proteína que es codificada por este gen.

Nombre de la proteína
Tamaño de la Proteína (en aminoácidos)
BIOQUIMICA
Isabel Cristina Castellanos iccastellan@universidadean.edu.co
 Existe reporte de estructura terciaria?
La Proteína posee péptido señal?
4. Predicción estructura terciaria. En este punto realizaremos la predicción de la estructura terciaria de la
proteína usando el método de modelamiento por homología.
5. De la entrada de Uniprot obtenga la secuencia de aminoácidos de la proteína en formato FASTA. Copiar.
6. Diríjase al servidos SWISSMODEL en https://swissmodel.expasy.org/ e inicie el modelling. Seleccione las
plantillas y calcule el mejor modelo: Mayor Cobertura y mayor QMEAN. Copie una captura de pantalla de
la estructura terciaria calculada.
7. Consulte la siguiente información referente a todas las proteínas tyrosinasa en los diferentes organismos,
usando la base de datos de PFAM:

¿Qué función enzimática ejecutan las proteínas Tirosinasas?

¿Qué cromosoma codifica este gen en humanos?

¿Qué ubicación (loci tiene en este cromosoma)?

¿En qué células se transcribe en mayor cantidad?

¿Qué estructuras secundarias son las predominantes en la estructura terciaria de la proteína?

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Isabel Cristina Castellanos iccastellan@universidadean.edu.co