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CLASIFICACIÓN
El reino Protista ha tenido un papel central en el origen y evolución de la célula
eucariota. Constituye un taxón parafilético con respecto a otros reinos puesto
que se basa en el carácter plesiomórfico de la unicelularidad y no contiene a
todos los descendientes de las especies que abarca. Aun así, se encuentran
entre ellos miembros que aumentaron su nivel de complejidad hacia la
pluricelularidad. Varios grupos de eucariotas desarrollaron independientemente
la pluricelularidad teniendo como origen un protista: animales, hongos, plantas,
algas rojas y algas pardas. De ellos, los tres primeros grupos se consideran
reinos independentes, miestras que los dos últimos se suelen incluir dentro del
reino Protista.
Los análisis genéticos, por su parte, han permitido establecer parentescos entre
grupos de protistas que superficialmente parecen muy diferentes. Se han
propuesto varias hipótesis considerando la acumulación de datos sobre la
naturaleza quimérica del genoma de los eucariontes. La evolución subsecuente
es difícil de determinar por las recombinaciones intertaxonómicas primarias,
secundarias e incluso terciarias que tuvieron lugar. Sin embargo, comparaciones
de múltiples genes y de datos ultraestructurales aclaran en cierta medida tales
eventos. Sobre la base de estos datos se han propuesto algunos grupos
monofiléticos y una filogenia aproximada de los protistas. Actualmente se
distinguen las siguientes líneas o clados de protistas, a los que se da
habitualmente la categoría de supergrupos:
Archaeplastida (Primoplantae)
comprende a Rhodophyta (algas
rojas) y Glaucophyta, los cuales
pueden ser considerados
protistas. Es también el origen de
las algas verdes y de las plantas
vasculares terrestres, reino de las
Plantas en la taxonomía de
Whittaker de 1969. Por ello hoy
varios autores incluyen a los tres
grupos en el reino de las plantas
y no en el protista. Este clado se
caracteriza por la presencia de
cloroplastos que se considera que fueron obtenidos por la endosimbiosis
primaria de una cianobacteria. La mayoría de los miembros de Rhodophyta son
pluricelulares.
Stramenopiles (= Heterokonta)
incluye algas de diferentes tipos,
desde las diatomeas
unicelulares componentes del
plancton hasta las pluricelulares
algas pardas que pueden llegar
a ser muy grandes y formar
bosques submarinos. También
incluye los oomicetos, protistas
sin cloroplastos que se
asemejan superficialmente a
mohos y que por lo tanto son
parásitos o saprofitos. El
nombre de heteroconto hace
referencia a la presencia de
flagelos desiguales en forma.
Este clado, junto a los dos
siguientes, forma parte del supergrupo SAR (Stramenopiles, Alveolata y
Rhizaria),2 caracterizado por presentar cloroplastos supuestamente adquiridos
por endosimbiosis secundaria de un alga roja, aunque algunos de sus miembros
posteriormente los hayan perdido. Cavalier-Smith13 define una clasificación
ligeramente diferente en la cual el supergrupo SAR se incluye junto a otros
grupos en Chromista.
Alveolata contiene tanto organismos
con cloroplastos como otros que
caracen de ellos. Entre los primeros se
encuentran los dinoflagelados (un
extenso grupo de protistas flagelados)
y entre los segundos Apicomplexa (la
mayoría de los antiguos esporozoos),
que son parásitos y Ciliophora
(ciliados), microorganismos cuya
presencia es común en donde haya
agua. El término que da nombre al
grupo hace referencia a la presencia de
alvéolos corticales, vesículas que apoyan la membrana citoplasmática
usualmente formando una película flexible, aunque pueden llegar a formar las
placas de una armadura como en el caso de los dinoflagelados.