6.

TERMODINÁMICA DE LA VIDA

de los últimos refugios deVitalLsm, la doctrina que biologi

i procesos no están sujetos a las leyes físicas que rigen

objetos primitivos, era la creencia de que los seres vivos pueden

inchow evadir las leyes de thermodynamj. Esta vista era

rtialmente refutado por medidas calorimétricas elaboradas

animales vivos que son completamente consistentes con el

y predicciones de conservación de la primera ley de termodinia

micrófonos Sin embargo, la verificación experimental de la escena

La ley de la termodinámica en los sistemas vivos es más

ult. No ha sido posible medir la entropía de

anillo de materia desde el calor, q ,, de una reacción a una constante T

I P solo es igual a Tr3S si la reacción se lleva a cabo

versificablemente (Ecuación [3.81). Obviamente, el desmantelamiento de una vida

rganismo a sus moléculas componentes para tal medida

el resultado invariablemente resultaría en su muerte irreversible. Estafa

con frecuencia, el presente estado verificado experimentalmente

uiowledgc es que la entropía de la materia viva es menor que

t de los productos a los que se descompone.

En esta sección consideramos los aspectos especiales del

la dinámica de los sistemas vivos. Conocimiento de estos asuntos,

que de ningún modo es completo, ha mejorado nuestra

A fin de determinar cómo se regulan las vías metabólicas, inclinarse

Ils responden a los estímulos, y cómo los organismos crecen y

ange con el tiempo. A.

399/5000
Los sistemas de tendido no pueden estar en equilibrio

Csskal o termodinámica de equilibrio (Capítulo 3) ap

muere en gran medida a procesos reversibles en sistemas cerrados. los

6te de cualquier sistema cerrado, como discutimos en la Sección 3-4A, es

que inevitablemente debe alcanzar el equilibrio. Por ejemplo, si es

los reactivos están en exceso, la reacción de tcrward procederá

aster que la reacción inversa hasta que se alcanza el equilibrio

— 0). ¡n contrast, open systems may remain in a non-

estado de equilibrio, siempre que puedan adquirir

energía de su entorno en forma de reactivos,

calor o trabajo. Mientras que la termodinámica clásica5 proporciona

información invaluable sobre los sistemas abiertos por mdi

cating si un proceso dado puede ocurrir espontáneamente,

más análisis termodinámico de sistemas abiertos requiere

la aplicación de los principios recién elucidados

ples de desequilibrio o thermodynaa irreversible, jcs. En

contraste con la termodinámica clásica, esta teoría explícitamente

toma tiempo en cuenta.

Los organismos vivos son sistemas abiertos y, por lo tanto, pueden

nunca rompa el equilibrio Como se indicó anteriormente, continúan

ingieren alimentos de alta entalpía y baja entropía, que

se convierten a baja entalpía. productos de desecho de alta entropía.

La energía libre que resulta de este proceso se usa para hacer

trabajo árido para producir el alto grado de organización char

característico de la vida. Si este proceso se interrumpe, el organismo

finalmente alcanza el equilibrio, que para los seres vivos es

sinónimo de muerte. Por ejemplo, una teoría del envejecimiento

sostiene que la senescencia es resultado de lo aleatorio pero inevitable

acumulación de células en defectos genéticos que interfieren

con y en última instancia perturbar el correcto funcionamiento de la vida

procesos. [La teoría no explica, sin embargo, cómo el pecado

organismos de células iguales o las células germinales de la orga multicelular

nismos (esperma y óvulos), que son en efecto inmoruil. son

capaz de escapar de esta llamada catástrofe de error.]

Los sistemas vivos deben mantener un estado de no equilibrio para

Muchas rasones: solo un proceso de desequilibrio puede realizar

A'ork.

2. Las intrincadas funciones reguladoras características de la vida

requieren un estado de no equilibrio porque un proceso en

equilibrio no puede ser dirigido (de manera similar, un barco que es

muerto en el agua no responderá a su timón).

3. Los complejos sistemas celulares y moleculares que

los procesos biológicos del conducto se pueden mantener solo en el

estado de desequilibrio. Los sistemas vivos son inherentemente un

estable porque están degradados por la muy bioquímica

reacciones a las que dan lugar. Su regeneración,

que debe ocurrir casi simultáneamente con su deg

ración, requiere la afluencia continua de energía libre.

Por ejemplo, el consumo de ATP-generatjng

cose (Sección 16-2), como se mencionó anteriormente,

ocurre con el consumo inicial de ATP a través de su

reacciones con glucosa para formar glucosa-6-fosfato y

con fructosa-6-fosfato para formar fructosa-1, 6-bisfos-

phate, En consecuencia, si el metabolismo se suspende largo

suficiente para agotar el suministro de ATP disponible, glucosa

el metabolismo no puede reanudarse. La vida por lo tanto, difiere en

una forma fundamental de una máquina compleja como una

computadora. Ambos requieren un rendimiento de energía libre para ser

activo, Sin embargo, la función de la máquina se basa en

una estructura estática para que la máquina pueda repetirse

encendido y apagado La vida, en cambio, se basa en un yo

proceso destructivo pero autorrenovable que, una vez

B. Ninguna termodinámica de equilibrio y la

Estado estable

En un proceso nonequiibrium, algo (como materia,

carga eléctrica, o calor) debe fluir, es decir, cambiar su spa

distribución tial. En la mecánica clásica, la aceleración de

la masa ocurre en respuesta a la fuerza. Del mismo modo, fluya en otro

sistema modynamic ocurre en respuesta a una termodinámica

fuerza (fuerza motriz), que resulta de la falta de

estado de equilibrio. Por ejemplo, el flujo de materia en diffu

sion está motivada por la fuerza termodinámica de una concentración

gradiente de tración; la migración de carga eléctrica (eléctrica

actual) se produce en respuesta a un gradiente en un campo eléctrico (una diferencia de voltaje);

el transporte de calor proviene de

gradiente de temperatura; y una reacción química resulta de

una diferencia en el potencial químico. Tales flujos se dicen '

conjugarse con su fuerza termodinámica.

Una fuerza termodinámica también puede promover un noi

flujo de compuerta en las condiciones adecuadas. Por ejemplo, un gra

cliente en la concentración de materia puede dar lugar a az

corriente eléctrica (una celda de concentración), calor (como occ

al mezclar H20 y HCl), o una reacción química (

producción mitocondrial de ATP a través de la disipación

de un gradiente de protones). Del mismo modo, un gradiente en po eléctrico

potencial puede motivar un flujo de materia (electroforesis), calor

(calentamiento resistivo), o una reacción química (la carga de un

batería). Cuando una fuerza termodinámica estimula un no

flujo conjugado, el proceso se llama energía tra

Los seres vivos mantienen el estado estable

Los sistemas vivos son, jòr el más pari, caracterizados.

estando en un estado estable, con esto se quiere decir que todo fluye en el

sistema son constantes para que el sistema no cambie ingenio) '

hora. Algunos procesos de estado estacionario ambiental son sche

ilustrado en la figura 15-29. Ilya Prigogine, un pionero

en el desarrollo de la termodinámica irreversible, har

demostrado que un sistema de estado estacionario produce el máximo

cantidad de trabajo útil para un gasto de energía determinado

bajo las condiciones imperantes. El estado estable de un abierto

sistema es por lo tanto su estado de máxima termodinámica

eficiencia. Además, en analogía con Le Châtelier

principio, ligeras perturbaciones del estado estacionario dan lugar

condiciones del estado

(gravedad)
FIGURA 15-29. Dos ejemplos de sistemas abiertos en un

estado. (a) Un flujo constante de agua en el río ocurre debajo del

influencia de la fuerza de la gravedad. El nivel del agua en el embalse

es mantenido por la lluvia, la fuente principal de la cual es la

evaporación de agua de mar. Por lo tanto, todo el ciclo es en última instancia

impulsado por el sol. (b) El estado estacionario de la biosfera es

mantenido de manera similar por el sol. Las plantas aprovechan el sol radiante

energía para sintetizar carbohidratos a partir de CO2 y H20. los

eventual metabolismo de los hidratos de carbono por las plantas o por

los animales que los comen da como resultado el lanzamiento de sus

energía libre y el retorno del CO2 y H2O a la

ambiente para completar el ciclo.

eficiencia. Además, en analogía con Le Châtelier

principio, ligeras perturbaciones del estado estacionario dan lugar

a los cambios en los flujos que contrarrestan estas perturbaciones para

para regresar el sistema al estado estable. El estado estable de

un sistema abierto es por lo tanto análogo al equilibrio

estado de un sistema cerrado; ambos son estados estables.

En los siguientes capítulos se verá que muchos biólogos

mecanismos reguladores ical funcionan para mantener un

estado. Por ejemplo, el flujo de intermedios de reacción

a través de una vía metabólica a menudo se ve inhibida por un exceso

del producto final y estimulado por un exceso de comenzar

material a través de la regulación alostérica de sus enzimas clave

(Sección 12-4). Los seres vivos aparentemente han evolucionado para

tomar la máxima ventaja termodinámica de su entorno

ron ment.

C. Termodinámica del control metabólico

Las enzimas catalizan de manera selectiva las reacciones requeridas

Las reacciones biológicas son altamente específicas jfic; solo reacciones

que se encuentran en las vías metabólicas se producen a tasas sig- nfíclicas

a pesar de las muchas otras reacciones termodinámicamente favorables

ciones que también son posibles. Como ejemplo, consideremos

las reacciones de ATP, glucosa y agua. Dos termodinámica

Las reacciones favorablemente favorables que puede experimentar el ATP son

transferencia de fosforilo para formar ADP y glucosa-6-fosfato,

e hidrólisis para formar ADP y P (figura 15-21 a). El libre

los perfiles de energía de estas reacciones están diagramadas en la Fig.

15-30. La hidrólisis del ATP es termodinámicamente favorecida sobre

) transferencia de osforilo a la glucosa. Sin embargo, su rIativo

ies están determinados por sus energías libres de activación para

sus estados de transición (valores G 1, sección 13-1 C) y la

Jative concentraciones de glucosa y agua. El mas largo

..G, más lenta es la reacción. En ausencia de enzimas,

para la reacción de transferencia de fosforilo es mayor que

bi para la hidrólisis, por lo que predomina la reacción de hidrólisis

aunque ninguna de las dos reacciones se produce a nivel biológico signifi

tarifa).

Las barreras de energía libre de ambos de los no enzimáticos

, las acciones son mucho más altas que las de la enzima catalizada

transferencia de Hosphoryl a la glucosa. Por lo tanto forma enzimática

n de glucosa-6-fosfato se favorece cinéticamente sobre la

hidrólisis enzimática de ATP. Es el papel de un

yme, en este caso hexoquinasa, para reducir selectivamente el libre

, una gran cantidad de activación de una reacción químicamente acoplada para que

r se acerca al equilibrio más rápido que la termodinámica

amicalmente favorecida reacción desacoplada.

las reacciones enzimáticas de Lany están cerca del equilibrio

Aunque el metabolismo como un todo es un desequilibrio

Ocess, muchas de sus reacciones componentes funcionan cerca de

, .uilibñum. La reacción de Al? y creatina para formar

fosfocreatina (Sección 1 5-4C) es un ejemplo de tal

reacción. La relación [creatina] / [fosfocreatina] depende

en [ATP] porque la creatina quinasa, la enzima que cataliza

esta reacción tiene suficiente actividad para equilibrar la reacción

u ... 'vu, ... ... ... rp,' tinn IC

, l'hroughput es ou

Operando Lejos del Equilibrio

Otras reacciones biológicas funcionan lejos del equilibrio.

Por ejemplo, la reacción de fosfofructocinasa (Fig. 15-

26) tiene una constante de equilibrio de K '= 300 pero bajo

condiciones fisiológicas en el músculo cardíaco de rata tiene la masa

relación de acción [fructosa-1, 6-bisfosfato] [ADP] / [fructosa-6-

fosfato] [ATP] = 0.03, que corresponde a AG =

-25.7 Ici • moi '(Ecuación [3.15]). Esta situación surge de una

acumulación de reactivos porque no hay suficiente fosfo

actividad fructoquinasa para equilibrar la reacción. Cambios en

por lo tanto, las concentraciones de sustrato tienen relativamente poca eficacia

efecto en la velocidad de la reacción de fosfofructocinasa; el

la enzima es esencialmente saturada. Solo cambios en la actividad

de la enzima, a través de interacciones alostéricas, por ejemplo,

puede alterar significativamente esta tasa. Una enzima, como phos

phofructokinase, por lo tanto, es análoga a una presa en un río.

Controla el flujo del sustrato (tasa de flujo) al variar su actividad

(aflosterically o por otros medios), tanto como una presa controla

el flujo de un río al variar la apertura de sus compuertas.

La comprensión de cómo el flujo de reactivo en un camino metabólico

el camino está controlado requiere conocimiento de qué reacciones son

funcionando cerca del equilibrio y que están lejos de él.

La mayoría de las enzimas en una vía metabólica operan cerca de equi

librium y por lo tanto tienen tasas netas que varían con su

concentraciones de sustrato. Sin embargo, como veremos en el

siguientes capítulos (particularmente la Sección 16-4),

RESUMEN DEL CAPÍTULO

Las vías metabólicas son series de reacciones enzimáticas consecutivas

que producen productos específicos para el uso de un organismo. El libre

la energía liberada por la degradación (catabolismo) es, a través de

mediación de ATP y NADPH, utilizada para impulsar el pro endergónico

procesos de biosíntesis (anabolismo). Carbohidratos, lípidos y pro

todas las proteínas se convierten en la acetil-CoA intermedia común,

cuyo grupo acetilo se convierte luego en CO2 y H2O a través del

acción del ciclo del ácido cítrico y la fosforilación oxidativa. UN

relativamente pocos metabolitos sirven como materiales de partida para una gran cantidad de

productos biosintéticos. Las vías metabólicas tienen cuatro principales

características: (1) las vías metabólicas son irreversibles por lo que si dos

metabolitos son iflterconvertible, la ruta sintética desde el primer

al segundo debe diferir de la ruta del segundo al

primero; (2) cada vía metabólica tiene un primer compromiso exergónico

paso; (3) todas las rutas metabólicas están reguladas, generalmente en el primer

paso comprometido; y (4) las rutas metabólicas en eucariotas ocurren

en compartimentos subcelulares específicos.

Casi todas las reacciones metabólicas se dividen en cuatro categorías: (1)

reacciones de transferencia de grupo; (2) reacciones de oxidación-reducción; (3)

eliminaciones, isomerizaciones y reordenamientos; y (4) reac

ciones que hacen o rompen los enlaces carbono-carbono. La mayoría de estos

reacciones implican la división del enlace heterolítico o la formación ocurre

anillo a través de la adición de nucleófilos al carbono electrófilo

átomos. Las reacciones de transferencia grupal implican, por lo tanto, la transferencia de un

grupo electrófilo de un nucleófilo a otro. El principal

Los grupos electrófilos transferidos son grupos acilo, fosforilo

grupos y grupos glicosilo. Los nucleófilos más comunes son

grupos amino, hidroxilo, imidazol y sulfhidrilo. Oxidación-

las reacciones de reducción implican pérdida o ganancia de electrones. Oxidación en

posibilitar la expresión de genes extraños en organismos superiores

(animales transgénicos) y estudiar los efectos de estos genes en metab

olismo Cuando las etiquetas isotópicas se incorporan en los metabolitos y

permitido entrar en un sistema metabólico, sus caminos se pueden rastrear

de la distribución de la etiqueta en los productos intermedios. NMR es un no

técnica invasiva que puede usarse para detectar y estudiar metabo

lites in vivo. Estudios sobre órganos aislados, cortes de tejido, células y

los orgánulos subcelulares han contribuido enormemente a nuestro conocimiento

borde de la localización de las vías metabólicas.

La energía libre se suministra a los procesos metabólicos endergónicos por el

ATP producido a través de procesos metabólicos exergo. ATP's -30.5

mol- '¿SG "de hidrólisis, es intermedio entre los de

Metabolitos de "alta energía" como fosfoenol piruvato y

Metabolitos de "baja energía" como la glucosa-6-fosfato. los

Los grupos fosforilo de "alta energía" se transfieren enzimáticamente a

ADP y el ATP resultante, en una reacción separada, phosphorylatcs

Compuestos de "baja energía". ATP también puede sufrir pirofosfato

escisión para producir PP ,, cuya hidrólisis posterior agrega más

ímpetu termodinámico a la reacción. ATP también está presente

corto un suministro para actuar como un depósito de energía. Esta función, en

células nerviosas y nerviosas de vertebrados, se lleva a cabo mediante fosfocrea

nuevo, que bajo condiciones bajas de ATP, transfiere fácilmente sus fos

grupo phoryl a ADP para formar ATP.

Las semirreacciones de las reacciones redox pueden separarse físicamente

calificado para formar una celda electrochemjcaJ. El potencial de reducción para

la reducción de A por B,

A '- + B

buey buey rojo rojo

en el cual n electrones se transfieren, es dado por Nernst equi átomos, las reacciones de
transferencia de grupo implican, por lo tanto, la transferencia de un

grupo electrofítico de un nucleófilo a otro. El principal

los grupos electrofílicos transferidos son grupos acilo. fosforilo

grupos y grupos glicosilo. Los nucleófilos más comunes son

grupos amino, hidroxilo, imidazol y sulfhidrilo. Oxidación-

las reacciones de reducción implican pérdida o ganancia de electrones. Oxidación en

el carbono generalmente involucra la escisión del enlace C-H, con lo último

pérdida por C de los dos electrones de enlace a través de su transferencia a un

electron acceptQr uch a NAD El aceptador de electrones terminal en

aerobios es 02. Las reacciones de eliminación son aquellas en las que un CC

doble enlace se crea a partir de dos centros de carbono saturados con el

pérdida de H20, NH3, ROH o RNH2. Las reacciones de deshidratación son

eliminaciones más comunes. Los iones de Isomerjzat implican cambios de dou

ble enlaces dentro de las moléculas. Los reordenamientos son bioquímicamente

reacciones poco comunes en las que los enlaces C-C intramoleculares son

roto y reformado para producir nuevos esqueletos de carbono. Reacciones

que hacen y rompen los enlaces C-C forman la base de ambos degrada

metabolismo biológico y biosintético. En la dirección sintética, estos

reacciones implican la adición de un carbanión nucleófilo a una elec

átomo de carbono trofílico El carbono electrofisiico mas comun

átomo es el carbono carbonilo, mientras que los carbaniones son generalmente gen

generada por la eliminación de un protón de un átomo de carbono adyacente a un

grupo carbonilo o por descarboxilación de un ß-cetoácido.

Enfoques experimentales empleados para dilucidar el metabolismo

las vías incluyen el uso de inhibidores metabólicos, estudios de crecimiento,

y genética bioquímica. Los inhibidores metabólicos bloquean las vías en

2tZ ¶It. h cfi re iccMrng menne

diates indica el curso de la ruta. Mutaciones, que ocurren

naturalmente en enfermedades genéticas o puede ser inducido en microorganismos

por mutágenos. Los rayos X, o ingeniería genética, también pueden resultar en la

ausencia o inactividad de una enzima. Técnicas genéticas modernas

Las semirreacciones de las reacciones redox pueden separarse físicamente

calificado para formar una celda electrochemjcaj. El potencial de reducción para

la reducción de A por B,

A+BA+B

en el que se transfieren n electrones, se da por la ecuación de Nernst

ción

RT f [A] [B] 4 \

k [AJ [BJ)

El cambio en el potencial de reducción de tal reacción está relacionado con

los potenciales de reducción de sus medias reacciones, A y

,, por

JA> B 'entonces A tiene una mayor afinidad electrónica que la B.

La escala de potencial de reducción se define estableciendo arbitrariamente

potencial de reducción de la semicelda de hidrógeno estándar a cero.

Las reacciones redox son de gran importancia metabólica. Por ejemplo,

la oxidación de NADH produce tres ATP a través de la mediación

de la cadena de transporte de electrones

Los organismos vivos son sistemas abiertos y, por lo tanto, no pueden estar en

equilibrio. Deben disipar continuamente la energía libre en

Para llevar a cabo sus diversas funciones y preservar su

estructuras altamente ordenadas. El estudio del termo no deseable

la dinámica ha indicado que el estado estacionario, que viven pro

cesos de maternidad, es el estado 01 etticiency máximo bajo el

restricciones que rigen los sistemas abiertos. Mecanismos de control que

regular los procesos biológicos preservar el estado estable regulando

las actividades de las enzimas que se encuentran estratégicamente ubicadas en el metabolismo

caminos