TALLER BIOLOGÍA MOLECULAR

Camilo Almario Ramos

Darío Arrieta García
Andrés Monterroza Palomino
Juan Mercado Núñez

1. Describa la diferencia entre la organización polimérica del ADN y la del ARN

Existen numerosas diferencias entre el ADN y el ARN. Las más importantes se refieren
a la presencia de diferentes glucosas en las moléculas de ambas. Ribosa en al ARN y
desoxirribosa en el ADN.
ADN: ácido desoxirribonucleico
ARN: ácido ribonucleico.

 A pesar de que el ADN y el ARN consisten en unidades repetidas de

nucleótidos, como hemos visto antes, la diferencia está en la glucosa. Por lo
demás, el ARN una gama mucho más amplia de ácidos nucleicos, unas 4
veces más grande comparado con el ADN. Esta singularidad del ARN le
confiere una mayor capacidad para asumir diferentes formas y funciones.

 El ADN lleva a cabo la parte más importante, que es la de seleccionar el

código genético que se va a transmitir a la siguiente generación, y el ARN va
a ser el encargado de transmitir dicho código, digamos que el ADN lo escribe
y el ARN lo transporta. El ADN funciona en dos fases y el ARN en una sola
fase, pero los dos son de una importancia crítica para la evolución y ambos
se necesitan el uno del otro.

 La desoxirribosa en el ADN contiene enlaces CH por lo que es más estable

y reacciona menos en condiciones alcalinas. El ADN resulta muy difícil de
atacar por enzimas u otras sustancias perjudiciales. En cambio, la diferencia
con la ribosa es que es más reactiva con enlaces C-OH y no es tan estable
en condiciones alcalinas, lo que le confiere una gran vulnerabilidad a los
ataques de enzimas o la exposición a rayos ultravioletas.

 Tanto el ADN como el ARN son ácidos nucleicos, pero tienen algunas
diferencias básicas. Tal y como hemos explicado antes, el ADN agrupa sus
 proteínas en forma de hélices, pero a pares, siendo una doble cadena,
mientras que el ARN, forma una hélice simple.

 La misión final del ADN es la de llevar a cabo el almacenamiento a largo plazo

y la trasferencia al futuro vástago de la información genética. El ARN, por otra
parte, realiza la función de mensajero entre el ADN y los ribosomas.

 El ADN se encuentra siempre en el núcleo, en cambio el ARN puede encontrarse

tanto en el núcleo como en el citoplasma.

 Podemos resumir las anteriores diferencias en estas 4 diferencias principales:

 El ARN usa ribosa y el ADN desoxirribosa

 El ADN tiene doble cadena de hélice y el ARN cadena simple
 El ADN es estable en condiciones alcalinas, pero al ARN no lo es.
 El ADN almacena y guarda la información genética, pero el ARN hace de
mensajero.

2. Explique la relación que existe entre la diferencia de tamaño entre el ADN y el

ARN y los procesos fisiológicos en los cuales están implicadas estas
moléculas.

El ADN debe ser más grandes puesto que contiene toda la información genética de un
ser vivo.
El ARN solo es UN SEGMENTO DE ADN recuerda que hay 3 tipos de ARN,
1) ARN ribosómico.
2) ARN mensajero.
3) ARN de transferencia.
Cada uno de estos tiene una función diferente pero muy específica dentro de cualquier
célula
ADN.
1) Contiene un azúcar (desoxirribosa)
2) una de las siguientes bases nitrogenadas (adenina, timina, guanina y citosina).
3) Se podría decir que son 2 cadenas de ARN complementarias entre si
ARN.
1) contiene un azúcar (en este caso ribosa)
2) contiene las siguientes bases nitrogenadas (adenina, guanina, citosina y uracilo).
3) es solo una cadena en comparación del ADN.
En conclusión, el ADN es más grande debido a que contiene más componentes
químicos es por eso que se encuentra empaquetado en los cromosomas.
Mientras que el ARN es solo un pequeño segmento muy corto de ADN además de ser
químicamente diferente en unos aspectos.

3. Describa la razón por la cual los ácidos nucleicos son ácidos.

Son ácidos por qué tienen un radical fosfato (PO4), que es un ácido, aunque también
son bases por algunos nitrógenos qué contienen, y nucleicos por estar en el núcleo de
la célula, el (ico) es por lo mismo de ser acido.

4. Que diferencias estructurales determinan la estabilidad del ADN respecto a la

inestabilidad del ARN.

Una de las causas que determinan la estabilidad de la molécula de ADN es la ausencia

del grupo 2’ Hidroxilo (-OH) de la desoxirribosa, lo cual favorece termodinámicamente
la ruptura de los enlaces 3’,5’ fosfodiester, ralentizando de manera considerable su
hidrolisis, garantizando que el DNA en las células sea suficientemente estable como
para cumplir una función útil de depósito de la información genética. En el RNA el grupo
2’ (-OH) presente, funciona como un nucleófilo acelerando la hidrolisis, lo cual hace
que la molécula sea menos estable en las condiciones acuosas de la células vivas.
Gran parte de la estabilidad del ADN de doble hebra se debe a las interacciones no
covalentes que se presentan, estas crean un interior hidrofóbico que hace que se tuerza
el esqueleto de azúcar-fosfato proporcionándole la forma helicoidal conocida. Estas
fuerzas son:
  Interacciones de apilamiento: Los pares de bases apilados forman contactos de van
der Waals. Aunque las fuerzas entre los pares de bases individuales apilados son
débiles, son aditivas, por lo que en las moléculas grandes de ADN los contactos de
van der Waals son una fuente importante de estabilidad.

 Puentes de hidrógeno: Los puentes de hidrógeno entre pares de bases forman una
importante fuerza estabilizadora.

 Efectos hidrofóbicos: Al sepultar los anillos hidrofóbicos de purina y pirimidina en el

interior de la doble hélice aumenta Interacciones entre cargas.
Los ARN son moléculas de una hebra, por lo tanto menos estable, pero con frecuencia
tienen estructura secundaria compleja. Bajo condiciones fisiológicas, la mayor parte de
los polinucleótidos de una cadena se doblan hacia atrás sobre sí mismos para formar
regiones estables de ARN de doble hebra, con bases apareadas.

5. ¿Que son los marcos de lectura de aminoácidos, provenientes de una

secuencia de ADN?

Los marcos de lectura son las secuencias de codones que transcurren desde un
codón de inicio específico hasta un codón de terminación. Debido a que el código
genético es un código de tripletes sin comas, en teoría un mismo ARNm podría ser
traducido en tres marcos de lectura diferentes, produciendo distintos polipeptidos.
Por ejemplo: La siguiente secuencia puede ser leída de tres formas dependiendo
del codón inicial seleccionado: AGGTGACACCGCAAGCCTTATATTAGC.
AGG·TGA·CAC·CGC·AAG·CCT·TAT·ATT·AGC
A·GGT·GAC·ACC·GCA·AGC·CTT·ATA·TTA·GC
AG·GTG·ACA·CCG·CAA·GCC·TTA·TAT·TAG·C
6. Explique por qué las hélices que conforman la doble hélice de ADN son
complementarias y antiparalelas.

Se dice que son complementarias debido a que las bases nitrogenadas de la

estructura se encuentran enlazadas de manera que una está apareada o es
complementada con la otra. Adenina está apareada con Timina a través de dos
enlaces de hidrógeno y Guanina está apareada con Citosina a través de tres
enlaces de hidrógeno. Por esta razón las dos hebras que conforman la doble
hélice deben tener direcciones 5’ —>3’ opuestas es decir con una orientación
antiparalelas.

7. Explique la importancia de la formación del surco mayor y surco menor en la

molécula de ADN

La torsión de la doble hélice del ADN y la geometría de las bases

crea un hueco más amplio (llamado surco mayor) y un hueco más estrecho (llamado
 surco menor) que corren a lo largo de la molécula, como se muestra en la figura
anterior. Estos surcos son importantes sitios de unión para las proteínas que
mantienen el ADN y regulan la actividad de los genes.

8. Explique la estructura primaria, secundaria y terciaria del ADN y el ARN.

Estructura del DNA

En su estructura tridimensional, se distinguen distintos niveles:
Estructura primaria: Se trata de la secuencia de desoxirribonucleótidos de una de las
cadenas. La información genética está contenida en el orden exacto de los nucleótidos.
Las bases nitrogenadas que se hallan formando los nucleótidos de ADN son Adenina,
Guanina, Citosina y Timina. Los nucleótidos se unen entre sí mediante el grupo fosfato
del segundo nucleótido, que sirve de puente de unión entre el carbono 5' del primer
nucleótido y el carbono 3' de siguiente nucleótido.
Como el primer nucleótido tiene libre el carbono 5' y el siguiente nucleótido tiene libre el
carbono 3', se dice que la secuencia de nucleótidos se ordena desde 5' a 3' (5' → 3').
Estructura secundaria: Es una estructura en doble hélice. Permite explicar el
almacenamiento de la información genética y el mecanismo de duplicación del ADN.
Fue postulada por James Watson y Francis Crick.
Es una cadena doble, dextrógira o levógira, según el tipo de ADN. Ambas cadenas son
complementarias, pues la adenina de una se une a la timina de la otra, y la guanina de
una a la citosina de la otra. Estas bases enfrentadas son las que constituyen los Puentes
de Hidrógeno.
Adenina forma dos puentes de hidrógeno con Timina. Guanina forma tres puentes de
hidrógeno con Citosina.
Ambas cadenas son antiparalelas, pues el extremo 3´ de una se enfrenta al extremo 5´
de la otra.
Las dos hebras están enrolladas en torno a un eje imaginario, que gira en contra del
sentido de las agujas de un reloj. Las vueltas de estas hélices se estabilizan mediante
puentes de hidrógeno.
Esta estructura permite que las hebras que se formen por duplicación de ADN sean
copia complementaria de cada una de las hebras existentes.
Existen tres modelos de ADN:

 ADN-B: ADN en disolución, 92% de humedad relativa, se encuentra en

soluciones con baja fuerza iónica se corresponde con el modelo de la Doble
Hélice. Es el más abundante y es el descubierto por Watson y Crick.
  •ADN-A: ADN con 75% de humedad, requiere Na, K o Cs como contraiones,
presenta 11 pares de bases por giro completo y 23 Å de diámetro. Es
interesante por presentar una estructura parecida a la de los híbridos ADN-
ARN y a las regiones de autoapareamiento ARN-ARN.
 ADN-Z: doble hélice sinistrorsa (enrollamiento a izquierdas), 12 pares de
bases por giro completo, 18 Å de diámetro, se observa en segmentos de
ADN con secuencia alternante de bases púricas y pirimidínicas (GCGCGC),
debido a la conformación alternante de los residuos azúcar-fosfato sigue un
curso en zig-zag.

Estructura terciaria: El ADN presenta una estructura terciaria, que consiste en que la
fibra de 20 Å se halla retorcida sobre sí misma, formando una especie de super-hélice.
Esta disposición se denomina ADN Superenrollado, y se debe a la acción de enzimas
denominadas Topoisomerasas-II. Este enrollamiento da estabilidad a la molécula y
reduce su longitud.
Varía según se trate de organismos procariontes o eucariontes:
a) En procariontes se pliega como una super-hélice en forma, generalmente, circular y
asociada a una pequeña cantidad de proteínas. Lo mismo ocurre en la mitocondrias y
en los plastos.

b) En eucariontes el empaquetamiento ha de ser más complejo y compacto y para esto

necesita la presencia de proteínas, como son las histonas y otras de naturaleza no
histona (en los espermatozoides las proteínas son las protamínas). A esta unión de ADN
y proteínas se conoce como Cromatina, en la cual se distinguen diferentes niveles de
organización:

- Nucleosoma
- Collar de perlas
- Fibra cromatínica
- Bucles radiales
- Cromosoma.

El ADN es una molécula muy larga en algunas especies y, sin embargo, en las células
eucariotas se encuentra alojado dentro del minúsculo núcleo. Cuando el ADN se une a
proteínas básicas, la estructura se compacta mucho.
Las proteínas básicas son Histonas o Protamínas.

La unión con Histonas genera la estructura denominada Nucleosoma. Cada

nucleosoma está compuesto por una estructura voluminosa, denominada Core, seguida
por un eslabón o "Linker". El core está compuesto por un octámero de proteínas,
Histonas, denominadas H2A, H2B, H3 y H4. Cada tipo de histona se presenta en
número par. Esta estructura está rodeada por un tramo de ADN que da una vuelta y 3/4
en torno al octámero. El Linker está formado por un tramo de ADN que une un
nucleosoma con otro y una histona H1.
El conjunto de la estructura se denomina Fibra de Cromatina de 100Å. Tiene un aspecto
repetitivo en forma de collar de perlas, donde las perlas serían los nucleosomas, unidos
por los linker.

Estructura cuaternaria: La cromatina en el núcleo tiene un grosor de 300Å. La fibra de

cromatina de 100Å se empaqueta formando una fibra de cromatina de 300Å. El
enrollamiento que sufre el conjunto de nucleosomas recibe el nombre de Solenoide.
Estructura del ARN
El Ácido Ribonucleico se forma por la polimerización de ribonucleótidos, los cuales se
unen entre ellos mediante enlaces fosfodiéster en sentido 5´-3´ (igual que en el ADN).
Estos a su vez se forman por la unión de un grupo fosfato, una ribosa (una aldopentosa
cíclica) y una base nitrogenada unida al carbono 1’ de la ribosa, que puede ser citosina,
guanina, adenina y uracilo. Esta última es una base similar a la timina.
En general los ribonucleótidos se unen entre sí, formando una cadena simple, excepto
en algunos virus, donde se encuentran formando cadenas dobles.
Un gen está compuesto, como hemos visto, por una secuencia lineal de nucleótidos en
el ADN, dicha secuencia determina el orden de los aminoácidos en las proteínas. Sin
embargo el ADN no proporciona directamente de inmediato la información para el
ordenamiento de los aminoácidos y su polimerización, sino que lo hace a través de otras
moléculas, los ARN.
Se conocen tres tipos principales de ARN y todos ellos participan de una u otra manera
en la síntesis de las proteínas. Ellos son: El ARN mensajero (ARNm), el ARN ribosomal
(ARNr) y el ARN de transferencia (ARNt).
ARN mensajero (ARNm)
Consiste en una molécula lineal de nucleótidos (monocatenaria), cuya secuencia de
bases es complementaria a una porción de la secuencia de bases del ADN. El ARNm
dicta con exactitud la secuencia de aminoácidos en una cadena polipeptídica en
particular. Las instrucciones residen en tripletes de bases a las que llamamos Codones.
ARN ribosomal (ARNr)
Este tipo de ARN una vez trascrito, pasa al nucleolo donde se une a proteínas. De esta
manera se forman las subunidades de los ribosomas.
ARN de transferencia (ARNt)
Este es el más pequeño de todos, tiene aproximadamente 75 nucleótidos en su cadena,
además se pliega adquiriendo lo que se conoce con forma de hoja de trébol plegada. El
ARNt se encarga de transportar los aminoácidos libres del citoplasma al lugar de
síntesis proteica. En su estructura presenta un triplete de bases complementario de un
codón determinado, lo que permitirá al ARNt reconocerlo con exactitud y dejar el
aminoácido en el sitio correcto. A este triplete lo llamamos Anticodón.

Estructura primaria: Estructura secundaria: Al igual que el ADN, se refiere a la

secuencia de las bases nitrogenadas que constituyen sus nucleótidos. La estructura
primaria del ARN es similar a la del ADN, excepto por la sustitución de desoxirribosa
por ribosa y de timina por uracilo. La molécula de ARN está formada, además por una
sola cadena.
Estructura secundaria: La cadena simple de ARN puede plegarse y presentar regiones
con bases apareadas, de este modo se forman estructuras secundarias del ARN, que
tienen muchas veces importancia funcional, como por ejemplo en los ARNt (ARN de
transferencia). Aunque existan zonas apareadas, los extremos 5’ y 3’ que marcan el
inicio y el final de la molécula permanecerán libres.

Estructura terciaria: Es un plegamiento complicado sobre la estructura secundaria

adquiriendo una forma tridimensional.
9. Explique la estructura y función de los micro ARNs. ¿En qué procesos
fisiológicos están implicados?

Los genes codificadores para microARNs pueden estar localizados en diferentes

regiones del genoma8, 21. Con base en lo cual son clasificados en:

(i) microARNs exónicos localizados en transcriptos no codificantes

(ii) microARNs intrónicos localizados en transcriptos no codificantes
(iii) microARNs intrónicos localizados en transcriptos codificantes para proteínas
(iv) microARNs exónicos localizados en transcriptos codificantes para
proteínas22.

Adicionalmente, existen también algunos microARNs ubicados en unidades

transcripcionales que son expresados en grupo23.

Biogénesis y procesamiento de los microARNs

En una gran proporción los microARNs son generados a partir de un transcripto
primario largo, en un proceso secuencial de dos reacciones las cuales son guiadas
por Drosha y Dicer, en la llamada vía canónica de generación de microARNs. Sin
embargo, actualmente han sido descritos microARNs generados por vías alternas
llamadas vías no canónicas9, muchos de los microARNs procesados por estas vías
no satisfacen la definición clásica de microARNs.

Vía canónica de biogénesis de microARNs

En la vía canónica los microARNs son inicialmente transcriptos en el núcleo a partir
de precursores largos de ARN llamados microARNs primarios o (pri-microARNs, del
inglés primary transcritps). La transcripción de los genes de microARNs
 generalmente es mediada por la ARN polimerasa II24; sin embargo, un grupo menor
de microARNs asociados con repeticiones Alu pueden ser transcriptos por la ARN
Polimerasa III25. Los (pri-microARNs) generados por la ARN polimerasa II tienen
usualmente varias kilobases de longitud y contienen estructuras en forma de
horquilla compuesta de un tallo y un bucle.

Importancia biológica de los microARNs:

Los microARNs tienen diferentes funciones regulatorias a nivel del desarrollo y

proliferación celular en diferentes organismos. De igual forma, los microARNs
median diferentes procesos en tumorogénesis, como inflamación, regulación del
ciclo celular, respuesta a estrés, diferenciación, apoptosis e invasión. En células
madre de tejidos somáticos, los microARNs tienen diferentes funciones incluyendo
la regulación de múltiples pasos de la hematopoyesis, modulación de la miogénesis
y cardiogénesis, diferenciación osteogénica y de la piel15. Los microARNs también
actúan como oncogenes y genes supresores de tumor, estos microARNs son
denominados en el idioma inglés como "oncomirs"16 y presentan diferentes
patrones en sus funciones, tasa de evolución, expresión, distribución cromosómica,
tamaño molecular, factores de transcripción y blancos17. Dada la importancia de los
microARNs en los procesos de tumorogénesis y su expresión en enfermedades
específicas, tienen un gran potencial como blancos terapéuticos y nuevos
biomarcadores para pronóstico y diagnóstico de cáncer18. Por lo que se ha
propuesto que la manipulación de la actividad y biogénesis de los microARNs como
una estrategia para el desarrollo de terapias eficaces contra el cáncer19.

10. Explique cómo se produce el giro dextrógiro y levógiro de la cadena de ADN.

La Doble hélice es una espiral Dextrógira, esto es, cada una de las cadenas de
Nucleótidos gira a derechas; esto puede verificarse si nos fijamos, yendo de abajo
a arriba, en la dirección que siguen los segmentos de las hebras que quedan en
primer plano. Si las dos hebras giran a derechas se dice que la doble hélice es
dextrógira, y
Si giran a izquierdas, levógira (esta forma puede aparecer en hélices alternativas
debido a cambios conformacionales en el ADN). Pero en la conformación más
común que adopta el ADN, la doble hélice es dextrógira, girando cada par de bases
respecto al anterior unos 36º.
ADN-A: Dextrógiro (con ADN-B: Dextrógiro (con giro ADN-Z: Levógiro (con
giro a la derecha) a la derecha) giro a la izquierda)

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