Fundamentos de Ecología Octubre 2018 – Febrero 2019

Carrera Ingeniería en Biotecnología

DCVDA - ESPE

Nombres: Cadme Vázquez Mauro Emiliano, Paredes Escobar Michelle Marcela

Fecha: 10 de octubre de 2018

Integrando Ecología - Ingeniería en Biotecnología

A. Objetivos
Identificar la aplicación de principios de Ecología en Ingeniería en Biotecnología.
Identificar que herramientas biotecnológicas se aplican para resolver problemas de
Ecología.

B. Introducción
¿Por qué un estudiante de Biotecnología tiene que aprobar la cátedra de Ecología?
Es una pregunta frecuente, que se debe solucionar entendiendo el carácter
interdisciplinar de la Ecología y Biotecnología.

La diversidad de organismos y de las interacciones entre ellos ha hecho que el

estudio de la ecología sea fascinante y compleja al mismo tiempo. No existe una
manera inequívoca de reducir esa diversidad a un conjunto de reglas fáciles de
entender y aplicar. En su lugar, uno debe mirar a través de una amplia gama de
ejemplos diversos y buscar principios comunes de unificación. En casi todos los
casos, es difícil determinar el dominio de aplicabilidad de los resultados de
experimentos o estudios comparativas. Sin embargo, existen varios principios
importantes. La teoría de la evolución es central entre ellas, que describe las formas
en que la selección natural, los factores estocásticos y las restricciones históricas
han interactuado para determinar los patrones que vemos en la naturaleza. Otros
conceptos, como sucesión y comunidad, proporcionan principios de organización.

Las técnicas moleculares modernas prometen revolucionar el estudio de la ecología,

por ejemplo, la aplicación de estas técnicas permitirán determinar la tasa de
recombinación en poblaciones de bacterias con mucha más precisión de lo que
hemos podido hacer anteriormente y mejorarán los estudios de genética ecológica,
incluidas las de interacciones simbióticas. Nuestra capacidad para producir bacterias
diseñadas de manera precisa permitirá estudiar la importancia adaptativa de las
mutaciones de un solo gen en la naturaleza y en condiciones experimentales. A la
vez la Ecología proporciona una referencia teórica de principios que ayudan en la
comprensión de fenómenos y procesos de los sistemas biológicos utilizados en
Biotecnología.
 La biotecnología ha sido la fuente de un nuevo conjunto de desafíos para los
ecólogos, que han tenido que verlo tanto en términos de su potencial como de sus
riesgos. La ingeniería genética promete aumentar los rendimientos de los cultivos,
proporcionar alternativas no contaminantes a los fertilizantes químicos y pesticidas,
y derribar los contaminantes que ya existen en el ambiente. Sin embargo, debido a
la falta de información básica sobre la ecología microbiana y la falta de familiaridad
con los métodos que ahora se utilizan para alterar las propiedades de los
organismos, los ecólogos se han movido con cautela para aprovechar estas
oportunidades a pesar de su obvio valor para la sociedad. Los próximos años
deberían ver la resolución de estos problemas y la aplicación generalizada de nuevas
técnicas para el avance científico y el beneficio humano.

Actividad previa: Leer los artículos

1. McMahon, K. D., Martin, H. G., & Hugenholtz, P. (2007). Integrating ecology into
biotechnology. Current opinion in biotechnology, 18(3), 287-292.
2. Monsen-Collar, K. J. & Dolcemascolo, P. (2010) Using Molecular Techniques to Answer
Ecological Questions. Nature Education Knowledge 3(10):1
3. Vázquez-Domínguez e (2007) ¿Cuál es el enfoque de la ecología molecular? Ejemplos con
un ratón espinoso. En: Sánchez-Rojas G & AE Rojas-Martínez (eds) Tópicos en sistemática,
biogeografía, ecología y conservación de mamíferos: 59-70. Universidad Autónoma del Estado de
Hidalgo, Serie Ciencia al día 1, México.

C. Palabras Clave
Ecología molecular, Biotecnología, Ecología, Marcadores moleculares.

D. Desarrollo
Responder las preguntas de discusión después de leer los artículos.

Preguntas de Discusión (Discusión de Conceptos)

1. Describa un ejemplo de las herramientas de Biotecnología aplicadas a
Ecología

Una de las herramientas más utilizadas en la ecología son los marcadores

moleculares tales como microsatélites y minisatélites que son repeticiones cortas
en tándem al igual que los RFLP que son sitios de reconocimiento de las
enzimas de restricción, estos en conjunto con la reaccíon en cadena de la
polimerasa (PCR) han permitido el estudio de las relaciones entre especies, la
historia evolutiva entre especies, relaciones evolutivas a lo largo de la historia.

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 2. Compare y contraste: herramientas tradicionales vs. moleculares para
explorar preguntas en Ecología.

Herramientas tradicionales Herramientas moleculares

 Los enfoques ecológicos  Por otro lado, los acontecimientos
tradicionales tienen plazos de observación históricos dejan en las moléculas de los
relativamente cortos. A menos que se haya organismos señales distintas que pueden ser
recopilado directamente una larga historia interpretadas con precisión.
de datos sobre un organismo en particular a
través de los años, los enfoques ecológicos
tradicionales se limitan al período durante el
cual se lleva a cabo un estudio.

 Dependencia de la observación  Un enfoque basado en el

directa. Uno de los métodos más
comúnmente usados para rastrear los
movimientos de animales y la inmigración a
nuevas poblaciones es la telemetría. Una
limitación fundamental de la telemetría es
que no puede detectar si un animal en
dispersión se aparea con éxito en su nuevo
territorio o al unirse a una nueva población.
El éxito reproductivo es una indicación de
la aptitud física y, por lo tanto, de la
supervivencia a largo plazo de una
población, una cuestión fundamental en la
ecología.
ADN puede proporcionar mucha más
información sobre los comportamientos
de apareamiento de los animales
dispersos. Al observar los marcadores
moleculares en un grupo particular de
animales, los investigadores pueden
establecer las relaciones familiares entre
los miembros de ese grupo; por lo tanto,
pueden obtener una imagen precisa de
quién se está apareando con quién.

 Los enfoques ecológicos  Es posible que los organismos

tradicionales se basan en observaciones
directas de organismos, con frecuencia no
detectan variaciones subyacentes en los
organismos que no influyen en las
apariencias físicas.
aparezcan físicamente de la misma manera,
al mismo tiempo que muestran tanta
divergencia genética como la que se
encuentra entre las distintas especies. La
variación críptica a veces sólo puede
detectarse comparando el ADN

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 3. Describa cómo la integración de las dos herramientas soportó el estudio de
caso del ratón espinoso.
El término ecología molecular es relativamente nuevo. Sus primeras apariciones
fueron en la revista científica Molecular Ecology a finales del siglo XX, y en la
Escuela de Ecología Genética a mediados del siglo pasado; esta escuela buscó
introducir los estudios e interpretación de las variaciones ecológicas desde un
punto de vista evolutivo. Haciendo uso de marcadores moleculares se puede
explicar las diferencias y similitudes entre los individuos. Esta revisión busca
cómo se puede responder a una pregunta ecológica y evolutiva desde el punto de
vista de ecología molecular.
Se investigó si existe correlación entre la heterocigosidad de los roedores
Liomys pictus en su sistema de adecuación a las condiciones de escasez de agua
y alimento. Para lo cual se tomaron individuos de dicha especia de la selva baja
y selva media para evaluar la variabilidad genética en escases de 1) alimento y
2) agua. Por medio de geles de almidón, se identificó 8 loci heterócigos. Los
individuos con heterocigosidad se dividieron en dos grupos: alta y baja. Se
observó que aquellos dentro de la categoría alta, disminuían relativamente poco
de peso ante escases de alimento, a diferencia de los individuos de categoría
baja. De igual manero, esto se observó con la disminución de agua.
Como segundo experimento, se analizó la relación entre la variación genética y
cambios en la densidad, tomando como variable el tamaño corporal. Se
analizarón 19 loci y aquellos individuos que mostraron mayor heterocigosidad
tenían un tamaño corporal mayor. Esto permite comprobar el argumento que
sugiere que, frente a un ambiente en condiciones desfavorables, los individuos
con mayor heterocigosidad, se adaptan de mejor manera, frente a los individuos
de menor heterecigosidad.
Los resultados obtenidos por métodos electroforéticos son una de las
herramientas mas utilizadas en la biología molecular. Son cualitativos, por lo
que sus resultados se pueden volver subjetivos. Sin embargo, la presencia o
ausencia de bandas en el gel son indicadores muy utilizados para demostrar si un
organismo es homocigótico o heterocigótico. En este experimento, se realizó
también un análisis estadístico para determinar la significancia de los resultados
por el número de loci presentes en los individuos. Este análisis cuantitativo
sugiere un tratamiento adecuado de los datos.
Los resultados obtenidos en ambos experimentos muestran como las
interacciones de L. pictus con el medio ambiente cambian sus características
fenotípicas, como su tamaño corporal. Las características fenotípicas derivadas
del genotipo pueden ser analizas haciendo uso de técnicas moleculares
enfocadas a responder preguntas de ecología y evolución. Por lo tanto, se ha
comprobado que por medio del análisis molecular se puede responder a
preguntas de ecología y evolución.

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 4. Defina teoría y principio

Una teoría es el conjunto de conceptos y reglas que dan una explicación a lo que
ocurre en la naturaleza formada por datos obtenidos por evidencia científica y
verificada en múltiples ocasiones.

Un principio es una regla que explica como funciona un proceso y que generalmente
deriva de resultados matemáticos

5. Realice un diagrama de espina de pescado para resumir los principios de

Ecología aplicados el caso de estudio descrito por McMahon et al 2007.
(Plantilla al final del documento)

E. Conceptos Clave (Resumen de los puntos-conclusiones principales)

Estos son tiempos emocionantes para trabajar con sistemas biológicos. La ecología
microbiana como disciplina está a punto de madurar más allá de la fase descriptiva
y ahora podemos empezar a explicar los patrones observados basados en los
procesos que los generan, ademeás el estudio de la ecología en general mediante
herramientas biotecnológicas nos permite descubrir los secretos guardados entre las
interacciones de individuos dentro de una población. Sería prudente que exploraran
los campos de la ecología, la ciencia de los ecosistemas y la biología de sistemas
para desarrollar enfoques verdaderamente innovadores para su comercio.

F. Lecturas Sugeridas
Eguarite, L. E., Souza, V., & Aguirre, X. (2007). Ecología Molecular. México. Universidad
Autónoma de México.

G. Referencias
1. McMahon, K. D., Martin, H. G., & Hugenholtz, P. (2007). Integrating ecology into
biotechnology. Current opinion in biotechnology, 18(3), 287-292.
2. Monsen-Collar, K. J. & Dolcemascolo, P. (2010) Using Molecular Techniques to Answer
Ecological Questions. Nature Education Knowledge 3(10):1
3. VÁZQUEZ-DOMÍNGUEZ E (2007a) ¿Cuál es el enfoque de la ecología molecular?
Ejemplos con un ratón espinoso. En: Sánchez-Rojas G & AE Rojas-Martínez (eds) Tópicos en
sistemática, biogeografía, ecología y conservación de mamíferos: 59-70. Universidad Autónoma del
Estado de Hidalgo, Serie Ciencia al día 1, México.

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 Asamblea de la
From tools to Una mentalidad
comunidad: de la
principles perturbadora pauta a la marcha

Revolucionario impacto que de Biotecnólogos ambientales comprender la Modelo estocástico de asamblea comunitaria que
han tenido en las disciplinas de la importancia de la dinámica comunitaria se basa principalmente en las tasas de inmigración
ecología frente al desempeño estable del proceso. y extinción

Comprender y cuantificar las características de dispersión

Necesidad de ir más allá de la ciencia Cualquier comunidad bajo la influencia
para los taxones microbianos que son importantes en el
descriptiva y aplicar la ecología de perturbaciones periódicas que
medio ambiente sistemas biotecnológicos
teórica para entender, modelar y actúan externamente a la no se espera
gestionar los sistemas de que el sistema esté en equilibrio
biotecnología ambienta
Utilidad de este enfoque
ya ha sido demostrada
Necesidad de para determinar qué para las comunidades
Enriquecer un organismo disponible tipo de regímenes de perturbación microbianas del intestino
para realizar el trabajo con el menor satisfarán nuestra meta de ingeniería humano.
coste. de estabilidad de procesos Integrating
ecology into
Queda mucho por aprender acerca de Varias características ecológicamente biotechnology
estos importantes ríos de composición
Ecologistas deberían
relevantes, como los flujos metabólicos
de la comunidad procariotas en los podrían predecirse usando análisis de
reconocer los procesos
sistemas de ingeniería balance de flujo de ingeniería
Estudio del fago en plantas de
tratamiento de aguas residuales a lo Integrar eficazmente los datos moleculares
largo del tiempo reveló similitudes entre Exposición a ecología y ciencias de los ecosistemas en sus estudios de
de alta resolución de toda la comunidad en
plantas, y patrones diferenciales de académico, y como parte de la formación profesional continua
un marco de predicción cuantitativo
persistencia y variabilidad
Modelos para tratar de comprender Necesidad de desarrollar nuevos planes de estudio y
Pocos estudios han abordado dinámica
cuantitativamente los ecosistemas. Debe esfuerzos de investigación concertados para integrar mejor
depredador-presa. Los modelos para
ser capaz de predecir el comportamiento los conocimientos y las herramientas de la microbiología y la
predecir el rendimiento no incluyen las
del sistema a la resolución requerida. ingeniería molecular.
interacciones de la red alimentaria

Una capa adicional de

complejidad: las Describir, explicar, Cerrar la brecha
interacciones tróficas de predecir, controlar entre las disciplinas
la cadena alimentaria

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