Académique Documents
Professionnel Documents
Culture Documents
proteína desplegada
Plegamiento
sitio de unión
proteína plegada 1
interacciones no covalentes
Ligando
Sitio de
unión
2
Figure 3-36 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
La comparación de la secuencia
La. de las proteínas revela
regiones conservadas (motivos conservados)
que son cruciales para la actividad y/o interacción
con diferentes ligandos
3
Regiones conservadas implicadas en la unión de ATP
ATP
4
Proteína
con dominio
de unión a …
5
CELL
Volume 85, Issue 4, 17 May 1996, Pages 607–615
Motivos conservados
entre la ADN-ligasa y
otras enzimas de
función similar
(nucleotidil transferasa)
6
ADN ligasa
7
Domino SH2:
Interacciona con ciertas tirosinas fosforiladas
Dominio
Dominio
quinasa
quinasa
Proteínas
Dominio
de la familia quinasa
de las
quinasas Dominio
quinasa
Proteínas
de otra familia
8
Estos sitios conservados se encuentran en lugares específicos
en la estructura global de la proteína.
9
Figure 3-39 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
Las proteínas interaccionan con sus ligandos a través de diferentes tipos de
interfaces.
11
La fuerza de unión de la proteína a su ligando se puede evaluar
determinando la constante de equilibrio
12
Figure 3-43a Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
RELACIÓN ENTRE LAS DIFERENCIAS
DE ENERGÍA LIBRE (AG)
Y LAS CONSTANTES DE EQUILIBRIO
• El AG NO da información sobre la
velocidad de la reacción
13
Figure 3-43b Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
Las enzimas son catalizadores biológicos
14
TIEMPO MEDIO DE LA REACCIÓN
NO CATALIZADA CATALIZADA 15
Figure 3-48 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
16
• LAS ENZIMAS AUMENTAN LA VELOCIDAD DE LA REACCIÓN
• NO ALTERAN EL EQUILIBRIO DE LA REACCIÓN
¿Cómo lo logran?
CATÁLISIS QUÍMICA S ST P
ESTADO DE TRANSICIÓN
17
AG‡ ENERGÍA LIBRE DE ACTIVACIÓN
S ST P
E+S EST E + P
• SON CAPACES DE
ESTABILIZAR LOS ESTADOS DE
TRANSICIÓN DE LA REACCIÓN
(ST)
DISMINUYENDO DE ESTA
MANERA LA ENERGÍA DE
ACTIVACIÓN REQUERIDA PARA
LLEGAR A DICHO ESTADO
• LO HACEN GRACIAS A LA
FORMACIÓN DE COMPLEJOS
DE TRANSICIÓN
ENZIMA-SUSTRATO
18
Figure 3-46 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
REACCIÓN CATALIZADA POR LA LISOZIMA: estados de transición
19
Figure 3-50a Molecular Biology
of the Cell (© Garland Science
2008)
REACCIONES EN EL SITIO ACTIVO DE LA LISOZIMA
20
Figure 3-51 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
21
22
Un aminoácido catalítico es un aminoácido que participa de la reacción catalítica
y forma parte del sitio activo de la enzima
23
Figure 3-38 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
CARACTERÍSTICAS DE LOS SITIOS ACTIVOS
24
EJEMPLO DE SITIO ACTIVO
25
Figure 3-37b Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
26
• LAS ENZIMAS SE ENCUENTRAN
A CONCENTRACIONES DEL ORDEN DE 10-10 a 10-8 M
CONVENCIÓN DE 1964
INTERNATIONAL UNION OF BIOCHEMISTRY
NOMENCLATURA-ENZIMAS
29
NOMBRE SISTEMÁTICO
• 3 partes:
• el sustrato preferente
• el tipo de reacción catalizada
• terminación "asa“
30
• En función de su acción catalítica específica,
los enzimas se clasifican en 6 grandes grupos o
clases:
• Clase 1: OXIDORREDUCTASAS
• Clase 2: TRANSFERASAS
• Clase 3: HIDROLASAS
• Clase 4: LIASAS
• Clase 5: ISOMERASAS
• Clase 6: LIGASAS
31
MUCHAS VITAMINAS PROPORCIONAN DE COFACTORES ORGÁNICOS
-LLAMADOS COENZIMAS-
QUE SON CRUCIALES PARA LAS CÉLULAS HUMANAS
32
Table 3-2 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
NOMENCLATURA DE LA COMISIÓN ENZIMÁTICA
33
• El primer número indica a cual de las seis clases
pertenece el enzima
34
35
Especificidad por sustrato.
TRIPSINA
TROMBINA
36
Muchas enzimas requieren de cofactores para poder realizar su actividad
COFACTORES:
»METALES
»PEQUEÑAS MOLÉCULAS
ORGÁNICAS LLAMADAS COENZIMAS
»- GRUPOS PROSTÉTICOS
»- CO-SUSTRATOS
37
38
CATÁLISIS ÁCIDA Y CATÁLISIS BÁSICA
39
Figure 3-49 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)