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Unidad 2: Fase 4
ABP De Ácidos Nucleicos
Presentado por:
Código: 99061402558
Presentado A:
Alberto García
Tutor
Abril 2018
BIOQUIMICA 201103_28
INTRODUCCIÓN
La bioquímica es una ciencia que comenzó a emerger desde comienzos del siglo pasado. Es
frecuentemente descrita como el estudio de la química de la vida e incluye el estudio de
todas las formas de vida y utiliza los conceptos básicos derivados de la biología, química,
física y matemáticas.
La Bioquímica es, comparativamente con otras áreas del conocimiento, una disciplina
científica joven, que integra múltiples conceptos de la Física, la Química y la Biología en
un cuerpo coherente de generalizaciones que permiten comprender cómo operan los
organismos vivientes. Sus puntos de contacto con otras áreas son múltiples y no siempre es
fácil establecer las fronteras respectivas. La comprensión de las propiedades estructurales y
funcionales de las principales moléculas que intervienen como constituyentes de los
alimentos y del papel que ellas juegan en el metabolismo, nos proporciona criterios para
juzgar el valor nutritivo de un alimento de uso común o de una fuente nutricional
potencialmente utilizable.
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El punto de vista bioquímico como estas alteraciones producen enfermedades (Describan dos
casos, en humanos, animales o plantas) hay muchas formas en que la expresión génica es
controlada en eucariotas, pero la metilación del ADN (que no debe confundirse con la
metilación de las histonas) es una herramienta de señalización epigenética común que las
células usan para bloquear los genes en la posición "off".
La metilación del ADN se produce en las bases de citosina del ADN eucariótico, que se
convierten en 5-metilcitosina por las enzimas ADN metiltransferasa (DNMT). Los residuos
de citosina alterados son usualmente inmediatamente adyacentes a un nucleótido de guanina,
dando como resultado dos residuos de citosina metilados que se sientan diagonalmente entre
sí en hebras de ADN opuestas.
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1. Analice En términos bioquímicos que implica la metilación del ADN que se produce
en las bases de citosina del ADN eucariótico, que se convierten en 5-metilcitosina
por las enzimas ADN metiltransferasa (DNMT).
Las citosinas 5- metiladas están presentes en el ADN de todos los vertebrados y plantas con
flores; además, se encuentran en algunos hongos, invertebrados, protistas y bacterias. Este
tipo de metilación es más común en eucariotas con genomas largos que en cortos. Las
citosinas metiladas se ubican casi exclusivamente en islas CpG, fragmentos de secuencias
ricas en citosina y guanina (CG, 500 pb) que sirven como promotores para los genes
asociados a estas.
Cuando el ADN se replica, el grupo metilo de la hebra guía es reconocido y se introduce uno
nuevo en la hebra hija por medio de la actividad DNMT1, la cual puede estar asociada a la
maquinaria de replicación. En presencia de DNMT1, el ADN hemimetilado se metila y así
los patrones de metilación se mantienen. La desmetilacion puede ocurrir en ausencia de
DNMT1 en rondas continuas de replicación de ADN (desmetilacion pasiva) y de forma activa
(sin replicación de ADN) (Adaptado de Reik & Walter, 2001)
Cáncer
En mamíferos se presentan enfermedades como el cáncer ya que los genes con niveles
elevados de 5-metilcitosina en su región promotora son transcripcionalmente silenciosos, y
que la metilación del ADN se acumula gradualmente en el silenciamiento de genes a largo
plazo debido a La hipermetilación que se produce normalmente en las islas CpG en la región
promotora y se asocia con la inactivación de genes, la hipometilación global también ha sido
implicada en el desarrollo y progresión del cáncer a través de diferentes mecanismos, hay
hipermetilación de genes supresores de tumores y la hipometilación de oncogenes.
Aterosclerosis
El tejido vascular así como las células sanguíneas mononucleares exhibe hipometilación
global con áreas de genes específicos de la hipermetilación, donde la metilación del ADN se
puede usar como biomarcadores de la aterosclerosis.
Los monocitos y linfocitos en los polimorfismos de metilación del ADN experimentan una
hipometilación general.
2. Analice. Por qué la metilación del ADN es de vital importancia para mantener el
silenciamiento génico en el desarrollo normal, la impronta genómica y la inactivación
del cromosoma X.
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Además, las mutaciones naturales en genes involucrados en los patrones de metilación del
ADN incluyendo las ADN – metiltransferasas, resulta en síndromes como el de Rett, Retardo
Mental/ talasemia Ligado a cromosoma X (ATRX), X frágil, y el de ICF (Insuficiencia,
Inestabilidad Centromerica y Anormalidad Facial) (Robertson & Wolffe, 2000).
Además, otros estudios han revelado que existen cambios en los patrones de metilación en
etapas tempranas de la tumorigenesis y que estos contribuyen directamente en la
transformación de las células (Robertson, 2001)
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Existe una pérdida neta de citosinas metiladas en varios genomas tumorales, lo cual es
inconsistente con los niveles de DNMT1. Hasta el momento no se ha reportado mutación
o amplificación del gen Dnmt1 en cáncer, por lo que no hay evidencia de que sea un
oncogen. No hay información genética que implique a alguna ADN- metiltransferasa o
factor relacionado en carcinogénesis (Baylin & Bestor, 2002).
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Esta es la DNMT mas distribuida, ya que sus homólogos están presente aun en especies
que aparentemente no metilan su ADN (p.e Schizosaccharomyces pombe,
Caenorhabditis elegans). No obstante, hasta el momento no se ha reportado actividad
metiltransferasa in vitro en DNMT2 (Dong et al, 2001; Okano et al, 1998ª; Yoder and
Bestor, 1998); aunque si forma complejos proteicos estables in vitro (Dong et al, 2001).
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Por lo tanto, DNMT2 podría ser una subunidad catalítica de un complejo ADN – metilasa
que esta inactiva cuando se encuentra sin ciertos cofactores (aun no determinados). Por
otro lado, también podría tener un campo de reconocimiento que actúa más allá de los
dinucleotidos CpG.
Los grupos metilo pueden ser introducidos al ADN no-metilado por las enzimas de
metilación de novo DNMT3a y DNMT3b. Cuando el ADN se replica, el grupo metilo de
la hebra guía es reconocido y se introduce uno nuevo en la hebra hija por medio de la
actividad DNMT1, la cual puede estar asociada a la maquinaria de replicación.
Esta glándula endocrina responde a la entrada de glucosa en sus células durante y después
de los alimentos, secretando insulina, cuando la concentración de glucosa en plasma es
superior al valor normal, las células del páncreas captan rápidamente el monosacárido
mediante la proteína transportadora de glucosa GluT2, el constante transporte propio de
esta proteína permite la entrada de glucosa y no saturable en condiciones fisiológicas a
la célula, la glucosa por la acción catalítica de la glucocinasa se convierte inmediatamente
en glucosa-6-fosfato que sigue la vía glucolítica, favoreciendo la entrada de Ca2+ en las
células pancreáticas a través de los canales situados en la membrana plasmática
permitiendo la liberación de insulina por exocitosis.
El sistema digestivo está compuesto por variedad de órganos que se pensaban que
cumplían con funciones bastante básicas, las cuales solo eran triturar, lubricar, absorber
y excretar, pero con todos los avances que ha tenido la medicina y la química se ha podido
determinar que este sistema regula muchas cosas que solo aportar nutrientes necesarios
para realizar las actividades cotidianas, un caso notable de esto es el equilibrio que haya
entre estos dos compuestos como lo son la insulina y el glucagón, cuando en nuestras
actividades diarias no podemos ingerir alimentos a las horas habituales; el hígado por el
órgano que regula todo el paso de nutrientes en el proceso de digestión, acumula glucosa
cuando está disponible para poder dar energía cuando por los motivos anteriormente
mencionados el cuerpo no ha ingerido alimentos, realizando las diferentes degradaciones
de esta, la insulina desvía estos compuestos para la estimulación de la desfosforilacion
de enzimas del grupo fosfatrasa y glucagón activa estas mismas enzimas pero realizando
la fosforilacion en las proteínas cinasa, dando así una carga de energía a nuestro cuerpo
para que siga realizando las diferentes actividades.
2. Analice Las enzimas alostéricas son aquellas para las cuales la catálisis en el sitio
activo puede modularse por la presencia de efectores en un sitio alostérico.
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Enzima A Enzima A
[S] Vo [S] Vo
3000 1,70053 200 1,52398
2500 1,50116 200 1,49269
2400 1,40209 100 0,90211
2000 1,0674 200 1,42131
1500 0,80567 150 1,2038
1480 0,80351 130 1,09978
200 0,09402 88 0,81399
167 0,06543 52 0,61246
110 0,03772 40 0,39543
58 0,00819 20 0,34542
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De esta gráfica, determine los valores para Vmax y Km, determinando los recíprocos de los
interceptos en Y y X de la gráfica
S Vo 1/[S] 1/Vº m b
3000 1,70053 0,00033333 0,58805196 0,00058455 -0,03560229
2500 1,50116 0,0004 0,666151509
2400 1,40209 0,00041667 0,713220977 Vmax = -28,0880811
2000 1,0674 0,0005 0,936855912 Km = -0,0164189
1500 0,80567 0,00066667 1,241202974
1480 0,80351 0,00067568 1,244539583
200 0,09402 0,005 10,63603489
167 0,06543 0,00598802 15,28350909
110 0,03772 0,00909091 26,51113468
58 0,00819 0,01724138 122,1001221
S Vo 1/[S] 1/Vº m b
200 1,52398 0,005 0,65617659 0,00633352 0,23374175
200 1,49269 0,005 0,669931466
100 0,90211 0,01 1,108512266 Vmax = 4,27822584
200 1,42131 0,005 0,703576278 Km = 0,02709622
150 1,2038 0,00666667 0,830702775
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Las Enzimas
Las enzimas son grandes proteínas que poseen un efecto catalizador ya que reducen la barrera
energética de las reacciones químicas e influyen solo en la velocidad de reacción, no alteran
el equilibrio ya que actúan en pequeñas cantidades.
Características estructurales
Las enzimas son mucho más eficaces que cualquier catalizador artificial conocido. La idea
de que la enzima se combine transitoriamente con el sustrato para formar un complejo
enzima- sustrato en el cual se alcanza más fácilmente el estado de transición de la reacción
catalizada.
El sitio activo se constituye de cadenas laterales compuesta de aminoácidos que forma una
estructura tridimensional y es allí donde se unen los sustratos, es donde se forma el complejo
sustrato – enzima para convertirse después en enzima – producto donde finalmente se
disocian.
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Analice significado biológico de Km. En términos prácticos la Km, como una medida de a
afinidad de la enzima por un sustrato, más pequeño en su valor mayor es la afinidad de la
enzima por el sustrato.
2. Analice Significado biológico de Km. En términos prácticos la Km, como una medida
de la afinidad de la enzima por su sustrato, entre más pequeño es su valor mayor es
la afinidad de la enzima por el sustrato.
Desde mi punto de vista es porque las enzimas actúan en pequeñas partes y es más afín
cuando es más pequeño su valor por que puede integrarse con más facilidad al sustrato.
tiene un valor más pequeño, el complejo es estable, ya que predomina la tendencia a fórmalo
por la gran afinidad que se tiene hacia el sustrato.
El Km permite discernir entre el sustrato natural y sus análogos, ya que la enzima trabaja
mejor con el sustrato que se presenta menor Km.
3. Analice Las enzimas con una Km muy baja (10-6-10-8M) son importantes en el
metabolismo.
Las enzimas con Km baja (afinidad alta) son altamente importantes en el metabolismo: los
valores bajos de Km son de orden de 1/ 1000 000 Molar= 10-6M o aun menores (10-7, o 10-
8 M).
Una enzima que tiene una Km baja tiene una alta afinidad por su sustrato, porque se
satura (trabaja a su máxima velocidad) a una baja concentración del sustrato.
Las enzimas con una Km muy baja ayudan a regular el metabolismo y a prevenir algunas
enfermedades como la leucemia; aquellas enzimas con el valor de Km muy bajo (poseen una
mayor afinidad por el sustrato) serían capaces de provocar hidrolisis de la Asn, los valores
bajos de Km significan alta afinidad.
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CONCLUSION
Todas las células vivas codifican el material genético en forma de ADN, ácido nucleico
contenido en los cromosomas de las células y portador de la información genética.
El papel de los genes y de los cambios epigeneticos puede ser una herramienta muy útil
para avanzar en el conocimiento y tratamiento de las enfermedades, la concecusion de la
epigenetica tendría un gran impacto para los pacientes con cáncer, ya que sabemos que en
dicha enfermedad una de las lesiones principales es la alteración de los patrones de
metilación del ADN y modificación de las histonas.
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REFERENCIAS BIBLIOGRAFÍA