Alur kerja yang dilakukan di Unit Sterilisasi adalah sebagai berikut :
1. Penerimaan alat dari pengguna (Rajal, IGD, VK, Perinatologi, Ranap)
2. Perendaman 3. Pencucian dan dekontaminasi 4. Pengeringan 5. Pengesetan 6. Pengecekan/ seleksi dan dicatat. 7. Pengemasan 8. Diserahkan ke Unit Sterilisasi melalui bagian penerimaan alat kotor. 9. Proses sterilisasi 10. Labeling 11. Distribusi