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FACULTAD DE AGRONOMÍA
DEPARTAMENTO DE FITOTECNIA
FITOMEJORAMIENTO GENERAL
Trabajo encargado N° 3
La Molina – Perú
2018
DOGMA CENTRAL DE BIOLOGÍA MOLECULAR
En 1958, Francis Crick compendió los delineamientos amplios de este proceso en un esquema de flujo que
denomino Dogma Central de la Biología molecular: el DNA dirige su propia replicación y su transcripción
para formar RNA, que a su vez, dirige la traducción para formar las proteínas. Aquí, el término
"transcripción" indica que en la transferencia de la información de RNA a las proteínas el "lenguaje" cambia
del de secuencias de bases nitrogenadas al de secuencias de aminoácidos. La maquinaria requerida para
llevar a cabo las tareas complejas de la expresión y la replicación génicas del DNA de una manera organizada
y con alta fidelidad ocupa una porción importante de cada célula.
1) Separación de las cadenas del DNA. La enzima DNA helicasa ayuda a romper los enlaces
puente de hidrogeno establecidos entre los pares de bases complementarias; gracias a estos enlaces
se han mantenido juntas las dos cadenas de DNA parentales. Dicha enzima separa y desenrolla la
doble hélice parental y forma una “burbuja” de duplicación (figura 1a, b). Dentro de esta burbuja
de duplicación, las bases de nucleótidos de estas cadenas de DNA parentales ya no forman pares
entre sí. Cada burbuja de duplicación contiene dos “horquillas” de duplicación donde las dos
cadenas de DNA parentales dejan sus nucleótidos expuestos que van a servir de molde para la
síntesis de las nuevas cadenas hijas de DNA.
Por lo tanto, se puede decir que la enzima DNA polimerasa “fabrica” un polímero de DNA
¿Por qué una molécula de DNA polimerasa no puede unir el DNA desde un extremo de la doble
hélice hacia el otro extremo?
Los cromosomas eucarióticos son muy largos: los cromosomas humanos van desde “sólo” 23 millones
de bases en el caso del cromosoma Y, que es relativamente pequeño a comparación de los 246 millones
de bases presentes en el cromosoma 1. El DNA eucariótico se copia con una rapidez de 50 nucleótidos
por segundo; esto parece bastante rápido, sin embargo, tomaría de 5 a 57 días copiar los cromosomas
humanos en una pieza continua. Para duplicar un cromosoma completo en un tiempo razonable, muchas
enzimas DNA helicasa abren numerosas burbujas de duplicación, permitiendo que una gran cantidad de
enzimas DNA polimerasa copien las cadenas parentales en segmentos pequeños. Las burbujas crecen
conforme progresa la duplicación del DNA y se fusionan cuando hacen contacto entre ellas.
Conforme la helicasa continúa desenrollando más la doble hélice, DNA polimerasas adicionales
(III, IV, etc.), deben “aterrizar” en esta cadena y sintetizar más fragmentos de DNA. A estos
segmentos de DNA que se sintetizan en la cadena rezagada se les conoce como fragmentos de
Okazaki. De esta forma, múltiples DNA polimerasas catalizan la síntesis de fragmentos de DNA
de diversas longitudes. Cada cromosoma puede formar cientos de burbujas de duplicación. Dentro
de cada burbuja hay una cadena guía, de decenas a cientos de miles de pares de nucleótidos de
longitud, y de docenas a miles de fragmentos de Okazaki en las cadenas rezagadas, cada uno quizá
con 100 a 200 pares de nucleótidos de longitud. De esta forma, una célula sintetiza millones de
fragmentos de DNA mientras duplica un solo cromosoma: estos fragmentos son unidos por acción
de la DNA ligasa (figura 1e). Muchas de estas enzimas unen los fragmentos de DNA hasta que
cada cadena hija contenga un polímero DNA largo y continuo.
La transcripción es el proceso por el cual se sintetiza RNA a partir de un molde de DNA. El mRNA lleva
la información que dicta qué aminoácidos formarán la proteína que se va a sintetizar. El tRNA y el rRNA
forman parte de la maquinaria de síntesis proteica. Los tres tipos de RNA están codificados por genes
distintos.
Figura 2. Transcripción del DNA. En la región del promotor, punto de unión de la enzima RNA polimerasa,
la doble hélice de DNA se abre y, a medida que la RNA polimerasa avanza a lo largo de la molécula de DNA, se
separan las dos cadenas. Los ribonucleótidos, que constituyen los bloques estructurales, se ensamblan en la
dirección 5' a 3' a medida que la enzima lee la cadena molde de DNA. Nótese que la cadena de RNA recién
sintetizada es complementaria, no idéntica, a la cadena molde a partir de la cual se transcribe; su secuencia, sin
embargo, es idéntica a la cadena codificante de DNA (no transcrita), excepto por un detalle: en el RNA, la timina
(T) se reemplaza por uracilo (U). El RNA recién sintetizado se separa de la cadena molde de DNA.
Fuente: Curtis H., Barnes N., Massarini A., Schnerck A., Biologia. Edición 7º. Editorial Médica Panamericana
(2008).
Como también ocurre en la síntesis del DNA, los ribonucleótidos presentes en la célula como trifosfatos
son añadidos por una enzima, en este caso, la RNA polimerasa. Esta enzima cataliza la adición de
ribonucleótidos, uno a uno, al extremo 3' de la cadena de RNA en crecimiento. Se mueve en dirección
3' a 5' a lo largo de la cadena molde da DNA, sintetizando la nueva cadena complementaria de
ribonucleótidos en la dirección 5' a 3' . La cadena de mRNA es antiparalela a la cadena molde de DNA
de la cual es transcrita. El RNA tiene una secuencia complementaria a la cadena molde de DNA, que es
igual a la otra cadena del DNA denominada codificante codificante, salvo el reemplazo de T por U. Para
simplificar y por convención, cuando se informa la secuencia de un gen, se escribe, de izquierda a
derecha, la secuencia de la cadena codificante en dirección 5' a 3' .
En el promotor de los eucariontes, en una región localizada unos 30 nucleótidos “río abajo” del
nucleótido en el que comienza la transcripción, hay una secuencia conocida como caja TATA cuyo
nombre se debe a qyue es rica en adenina (A) y timina (A). La caja TATA (5' –TATAAAA – 3') es
importante para determinar con precisión el sitio donde se inicia la transcripción.
Una vez unida al DNA, la RNA polimerasa abre una pequeña región de la doble hélice de manera que
quedan expuestos unos pocos nucleótidos. La enzima va añadiendo ribonucleótidos, moviéndose a lo
largo de la cadena molde, desenrollando la hélice y exponiendo así nuevas regiones con las que se
aparearán los ribonucleótidos complementarios.
En procariontes, el proceso de elongación de la nueva cadena de mRNA continúa hasta que la enzima
encuentra una secuencia especial en la molécula naciente, la señal de terminación señal de terminación
señal de terminación de la transcripción. En eucariontes, el proceso finaliza cuando el RNA es cortado
en una secuencia específica.
Cuando finaliza la transcripción, la RNA polimerasa se detiene, libera la cadena de DNA molde y
también la recién sintetizada cadena de mRNA. Las RNA polimerasa no corrigen errores como ocurre
con las DNA polimerasas cuando replican el DNA. Esto no resulta un problema, ya que de una misma
secuencia de DNA se producen varias copias de RNA; los posibles errores que pudieran aparecer en
alguna molécula de RNA afectarían exclusivamente a la molécula proteica sintetizada a partir de la
molécula defectuosa de mRNA y no serían heredables.
El mRNA transcripto a partir del DNA es la copia activa de la información genética. Con la
incorporacion de las instrucciones codificadas en el DNA, el mRNA contiene la informacion de la
secuencia de aminoacidos que tendran las proteinas.
El proceso de traducción asegura tanto la formación de enlaces peptídicos como la unión de los
aminoácidos en la secuencia correcta que especii can los codones en el ARNm. Un aminoácido se une
al ARNt antes de su incorporación en un polipéptido
Los aminoacidos se alinean en la secuencia adecuada para poder unirse, gracias a la accion del ARNt. El
ADN contiene genes que se transcriben para formar los ARNt. Cada tipo de molécula ARNt se une a
un aminoácido específico. Los aminoácidos se unen covalentemente a sus respectivas moléculas de
ARNt mediante enzimas, llamadas aminoacil-ARNt sintetasas, que utilizan ATP como fuente de energía
(figura 6). Los complejos resultantes, llamados aminoacil ARNt, se unen a la secuencia codificante
ARNm, a fin de alinear los aminoácidos en el orden correcto para formar la cadena polipeptídica.
Figura 6. Unión de un aminoácido especifico al ARNt apropiado. Los aminoácidos estan covalentemente
acoplados a sis respectivas moleculas de ARNt mediante las aminoacil ARNt sintetasas, que utilizan ATP como
fuente de energia.
Fuente: Solomon E., Berg L., Martin D. 201). Biología. Novena Edición. MC Graw–Hill Interamericana.
Los ARNt son cadenas polinucleótidas de 70 a 80 nucleótidos de largo, cada una con varias secuencias
de bases únicas y también con algunas secuencias que son comunes a todas. A pesar de ser
considerablemente más pequeñas que las moléculas de ARNm o ARNr, las moléculas de ARNt
presentan una estructura complicada.
(1) contiene un anticodón, una secuencia de unión complementaria para el correcto codón de ARNm;
(2) es reconocida por un aminoacil-ARNt sintetasa que agrega el correcto aminoácido;
(3) tiene un sitio de unión para el particular aminoácido que especifica el anticodón (el sitio está a cerca
de 180 grados del anticodón); y
(4) es reconocida por los ribosomas.
El proceso de síntesis proteínica tiene tres distintas etapas: iniciación, ciclos de elongación repetidos, y
terminación.
1) Iniciación de la traduccion
La iniciación de la síntesis proteínica es esencialmente la misma en todos los organismos. La iniciación
de la traducción utiliza proteínas llamadas factores de iniciación, que se adhieren a la subunidad
ribosómica pequeña. En las bacterias, tres diferentes factores de iniciación se adjuntan a la subunidad
pequeña, la cual entonces se une a la molécula de ARNm en la región del codón iniciador AUG (figura
8). Una secuencia líder ascendente (hacia el extremo 5¿) del AUG ayuda al ribosoma a ai identificar la
secuencia AUG que indica el inicio del ARNm codificante de proteína.
El ARNt que transporta el primer aminoácido del polipéptido es el iniciador ARNt. El aminoácido
metionina se une al iniciador ARNt, y como resultado, el primer aminoácido en los nuevos polipéptidos
es metionina. (Muy frecuentemente, la metionina es posteriormente eliminada).
En las bacterias, el iniciador metionina se modifica agregando un grupo de un carbono derivado del
ácido fórmico y se llama fMet, de N formilmetionina. El fMet iniciador del ARNt, que tiene el anticodón
3’ –UAC–5’, se une al codón iniciador AUG, liberando uno de los factores de iniciación en el proceso.
El complejo de iniciación se completa cuando se une la subunidad ribosómica grande a la subunidad
pequeña y se liberan los factores de iniciación residuales
En las eucariotas, el inicio de la traducción difiere en tres aspectos. Primero, la metionina del iniciador
ARNt no se modifica. Segundo, en lugar de una secuencia líder para ayudar a identificar el codón
iniciador en el ARNm, el codón iniciador está inmerso dentro de una corta secuencia (como
ACCAUGG) que indica el sitio (el AUG subrayado) de inicio de la traducción. Tercero, el complejo de
iniciación, que contiene quizás 10 factores de proteína, es diferente del de las bacterias.
2) Elongacion
La figura 9 esboza las cuatro etapas en un ciclo de elongación, la etapa de traducción en la cual se agregan
los aminoácidos uno por uno a la cadena polipeptídica en crecimiento. La elongación es esencialmente
igual en bacterias y eucariotas. El aminoacil-ARNt apropiado reconoce el codón en el sitio A y se une
ahí mediante el emparejamiento de las bases de su anticodón con el codón de ARNm complementario.
Esta etapa de unión requiere varias proteínas llamadas factores de elongación. También requiere energía
del trifosfato de guanosina (GTP), una molécula de transferencia de energía similar al ATP.
Figura 9. Ciclo de elongación en la traducción. Esta ilustración inicia después de que se ha formado una corta
cadena de aminoácidos.
Fuente: Solomon E., Berg L., Martin D. 201). Biología. Novena Edición. MC Graw–Hill Interamericana.
El grupo amino del aminoácido en el sitio A es ahora alineado con el grupo carboxilo del aminoácido
precedente adherido a la cadena polipeptídica en crecimiento, en el sitio P. Se forma un enlace peptídico
entre el grupo amino del nuevo aminoácido y el grupo carboxilo del aminoácido precedente. De esta
manera, se libera el polipéptido del ARNt en el sitio P y se adhiere al aminoacil-ARNt en el sitio A. Esta
reacción es espontánea (no requiere energía adicional) porque el ATP transi rió energía durante la
formación del aminoacil ARNt. Sin embargo, la formación de enlaces peptídicos sí requiere la enzima
peptidil transferasa. Notablemente, esta enzima no es una proteína sino un ribozima que es un
componente ARN de la subunidad ribosómica grande.
El proceso de translocación requiere energía, que de nuevo es aportada por la GTP. El ARNt
descargado, es decir, el ARNt sin un aminoácido adherido, se mueve del sitio P al sitio E. De ahí sale
del ribosoma y se une a la matriz citosólica de ARNt. Como la translocación implica el movimiento del
ribosoma en la dirección 3’ a lo largo de la molécula de ARNm, entonces la traducción siempre procede
en la dirección 5’ 3’. Cada enlace peptídico se forma en una fracción de segundo; repitiendo el ciclo
de elongación, una proteína de tamaño promedio con cerca de 360 aminoácidos se forma por una
bacteria en aproximadamente 18 segundos y por una célula eucariota en un poco más de 1 minuto.
3) Terminación de la traducción
La terminación es la etapa final de la traducción. En la terminación, la síntesis de la cadena polipeptídica
se finaliza con un factor de liberación, una proteína que reconoce el codón de parada en el extremo de
la secuencia codificante. (Como ninguna molécula de ARNt se une a un codón de parada, el codón está
disponible para unirse al factor de liberación). Cuando el factor de liberación se une al sitio A, entonces
se rompe el enlace entre el ARNt en el sitio P y el último aminoácido de la cadena polipeptídica (figura
10). Esta reacción de hidrólisis libera los polipéptidos recién sintetizados y también separa la estructura
de traducción en sus partes: la molécula de ARNm, el factor de liberación, la molécula de ARNt en el
sitio P, y las subunidades ribosómicas (grande y pequeña). Las dos subunidades ribosómicas se pueden
utilizar para formar una nueva estructura de iniciación con otra molécula de ARNm. Cada ARNm se
traduce sólo un limitado número de veces antes de ser destruido. Las proteínas especializadas asociadas
a los ribosomas, llamadas chaperonas moleculares, apoyan el plegado de la cadena polipeptídica recién
sintetizada en su forma activa tridimensional (vea el capítulo 3). La secuencia de aminoácidos en la
cadena polipeptídica determina la configuración que finalmente se formará. Sin embargo, sin la ayuda
de las chaperonas moleculares, las interacciones entre las diferentes regiones de la cadena de
aminoácidos podrían evitar el proceso de plegamiento.