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1.

Características generales

• Los enzimas son proteínas que catalizan reacciones


químicas en los seres vivos.
• Los enzimas son catalizadores, es decir, sustancias que,
sin consumirse en una reacción, aumentan
notablemente su velocidad.
• No hacen factibles las reacciones imposibles, sino que
solamente aceleran las que espontáneamente podrían
producirse.
• Ello hace posible que en condiciones fisiológicas tengan
lugar reacciones que sin catalizador requerirían
condiciones extremas de presión, temperatura o pH.
2. Características de la enzima

• Proteínas altamente especializadas como


catalizadores
• Macromoléculas
• Son muy específicas respecto a sus sustratos
• Funcionan en solución acuosa en condiciones
limitadas de temperatura y pH
• Su actividad depende de la integridad de su
conformación
• Hay enzimas que requieren de un grupo químico
adicional llamado cofactor
Cofactores

• Son sustancias no proteicas, requeridos a veces por


una enzima para su función, puesto que colaboran
en la catálisis
• Los cofactores pueden ser iones inorgánicos como
el Fe++, Mg++, Mn++, Zn++ etc. Casi un tercio de los
enzimas conocidas requieren cofactores.
• Cuando el cofactor es una molécula orgánica se
llama coenzima. Muchos de estas coenzimas se
sintetizan a partir de vitaminas.
• Cuando los cofactores y las coenzimas se
encuentran unidos covalentemente a la enzima, se
llaman grupos prostéticos.
cofactor

PROTEÍNA

coenzima

apoenzima o
apoproteína grupo prostético

HOLOENZIMA
HOLOENZIMA
OO
PROTEINA CONJUGADA
PROTEINA CONJUGADA
Molécula de hemoglobina (proteína que transporta
oxígeno) y su coenzima (el grupo hemo).
3. Nomenclatura de las enzimas

Hay varias formas mediante las cuales se asigna un


nombre a un enzima:

• nombres particulares
Estos eran asignados por su descubridor. Al ir
aumentando el número de enzimas conocidos, se
hizo necesaria una nomenclatura sistemática que
informara sobre la acción específica de cada enzima
y los sustratos sobre los que actuaba.
• nombre sistemático
El nombre sistemático de un enzima consta
actualmente de 3 partes:
1.- el sustrato preferente
2.- el tipo de reacción realizado
3.- terminación "asa"

Un ejemplo sería la glucosa fosfato


isomerasa que cataliza la isomerización de la
glucosa-6-fosfato en fructosa-6-fosfato.
• código de la comisión enzimática (enzyme
comission)
El nombre de cada enzima puede ser identificado
por un código numérico, encabezado por las letras
EC (enzyme commission), seguidas de cuatro
números separados por puntos. El primer número
indica a cual de las seis clases pertenece la enzima,
el segundo se refiere a distintas subclases dentro de
cada grupo, el tercero y el cuarto se refieren a los
grupos químicos específicos que intervienen en la
reacción.
4. Clasificación de las enzimas

CLASIFICACION INTERNACIONAL DE LAS ENZIMAS


TRANSFERENCIA DE ELECTRONES
OXIDORREDUCTASAS
( iones hidruro o átomos de hidrogeno
TRANSFERASAS TRANSFERENCIA DE GRUPOS
HIDROLASAS REACCIONES DE HIDRÓLISIS
ADICION DE GRUPOS A DOBLES ENLACES
LIASAS
FORMACION DE DOBLES ENLACES
ISOMERASAS TRANSFERENCIA DE GRUPOS DENTRO DE UNA MOLECULA
FORMACION DE ENLACES ( C-C // C-S // C-O// C-N)
LIGASAS
MEDIANTE REACCIONES ACOPLADAS DE ATP
5. Sitio Activo

• La reacción catalizada enzimáticamente tiene lugar


en una zona de la enzima denominada sitio activo y
la molécula que es fijada en el sitio activo y sobre la
cual actúa la enzima se denomina sustrato

• El sitio activo comprende


(1) un sitio de unión formado por los aminoácidos
que están en contacto directo con el sustrato
(2) un sitio catalítico, formado por los aminoácidos
directamente implicados en el mecanismo de la
reacción
6. Mecanismo de ación enzimática

Para que una reacción química tenga lugar, las


moléculas de los reactantes deben chocar con una
energía y una orientación adecuada.

La actuación de la enzima permite:


• que los reactantes (sustratos) se unan a su sitio
activo con una orientación óptima para que la
reacción se produzca y
• modifica las propiedades químicas del sustrato
unido a su sitio activo, debilitando los enlaces
existentes y facilitando la formación de otros
nuevos.
Hay dos modelos sobre la forma en que el sustrato
se une al sitio activo de la enzima:

• el modelo llave-cerradura
Este supone que la estructura del sustrato y la del
sitio activo son complementarias, de la misma forma
que una llave encaja en una cerradura. Este modelo
es válido en muchos casos, pero no es siempre
correcto.
• el modelo del ajuste inducido
En algunos casos, el sitio activo adopta la
conformación idónea sólo en presencia del sustrato.
La unión del sustrato al sitio activo de la enzima
desencadena un cambio conformacional que da
lugar a la formación del producto.
7. Comportamiento cinético de las enzimas

• En las reacciones espontáneas, los productos


finales tienen menos energía libre de Gibbs (ΔG) que
los reactantes. Por tanto, en las reacciones
espontáneas se libera energía de Gibbs (ΔG<0).
• Sin embargo, el comienzo de la reacción requiere un
aporte inicial de energía. Esta energía inicial que hay
que suministrar a los reactantes para que la
reacción transcurra se llama energía de activación
(Ea). Cuanto menor es la Ea más fácilmente
transcurre la reacción.
• La acción de los catalizadores consiste,
precisamente, en disminuir la Ea. Los enzimas son
catalizadores especialmente eficaces, ya que
disminuyen la Ea aún más que los catalizadores
inorgánicos.
• Por ejemplo, la descomposición del agua oxigenada
(H2O2) para dar H2O y O2 puede ocurrir sin
catalizador, con un catalizador inorgánico (platino),
o con un enzima específica (catalasa). Las
respectivas Ea para cada proceso son 18, 12 y 6
Kcal/mol.
LOS GRUPOS ªPueden interactuar de manera
transitoria con un sustrato activándolo
CATÁLITICOS DE
UNA ENZIMA ªDisminuyen la energía de activación
( CADENAS LATERALES DE LOS de una reacción al proporcionar una
AMINOACIDOS, IONES, COENZIMAS)
ruta alternativa de menor energía

ªLa energía requerida para disminuir la


energía de activación proviene
generalmente de las interacciones débiles
no covalentes entre sustrato y enzima

ªla formación del [ES] viene


acompañada de una pequeña liberación
de energía libre

ENERGÍA DE FIJACIÓN

Es la principal fuente de energía libre para


disminuir la energía de activación de las
reacciones
8. Actividad enzimática

• La actividad de una enzima se determina midiendo la


cantidad producto formado (o de sustrato
consumido) por unidad de tiempo.

• Una molécula de enzima no tiene por qué actuar


siempre a la misma velocidad. Su actividad puede
estar modulada por:
a) Concentración de enzima
b) Concentración sustrato
c) Temperatura
d) pH
e) Inhibidores
a) Concentración de enzima

• La actividad enzimática es directamente


proporcional a la concentración de la enzima,
cuando se mantienen los otros factores ambientales
constantes (temperatura y pH).
b) Concentración de sustrato

• Uno de los factores clave que afectan a la velocidad


de una reacción catalizada por una enzima es la
cantidad de sustrato presente, [S].
• La forma hiperbólica de esta curva se puede
expresar algebraicamente mediante la ecuación de
Michaelis- Menten:
V * [S]
V = max
o Km + [S]
• donde
Vmax = Velocidad máxima
Vo = Velocidad inicial
[S] = Concentración del sustrato
Km = Constante de Michaelis-Menten
• Esta ecuación se puede transformar a una forma
más útil de representar los datos experimentales, la
ecuación denominada ecuación de Lineweaver-Burk

1 Km 1 1
= * +
V
o
V
max
[S] Vmax
• Para las enzimas que obedecen la relación de
Michaelis-Menten la gráfica de 1/Vo frente a 1/[S] da
una línea recta
• Para poder comparar una enzima con otra en cuanto
a su poder catalítico debe estandarizarse al estado
estacionario
• En el estado estacionario la velocidad de formación
y desaparición del complejo ES se igualan.

S + E ↔[ES]→ E+P
K2
k1

k-1

• Se establece que Km = (k-1+k2)/k1


Km UN PARÁMETRO CINÉTICO IMPORTANTE

• Km es la concentración de sustrato para la cual la


velocidad de reacción es la mitad de la velocidad
máxima. En efecto, si Km = [S], la ecuación de
Michaelis-Menten se reduce a: v = Vmax/2.

• El valor de Km da idea de la afinidad del enzima por


el sustrato: A menor Km, mayor afinidad de la
enzima por el sustrato, y a mayor Km, menor
afinidad.
c) Temperatura

• En las reacciones catalizadas por enzimas los


aumentos de temperatura aceleran las reacciones.
Sin embargo, al ser proteínas, a partir de cierta
temperatura, se empiezan a desnaturalizar por el
calor. La temperatura a la cual la actividad catalítica
es máxima se llama temperatura óptima.
d) pH

• Los enzimas poseen grupos químicos ionizables (carboxilos -COOH;


amino -NH2; tiol -SH, etc.) en las cadenas laterales de sus
aminoácidos. Según el pH del medio, estos grupos pueden tener
carga eléctrica positiva, negativa o neutra. Como la conformación de
las proteínas depende, en parte, de sus cargas eléctricas, habrá un pH
en el cual la conformación será la más adecuada para la actividad
catalítica. Este es el llamado pH óptimo.
d) Inhibidores

INHIBICIÓN REVERSIBLE INHIBICIÓN IRREVERSIBLE


™ Unión no covalente entre un ™ Unión covalente entre un
compuesto y la enzima compuesto y la enzima
™ El compuesto inhibidor puede ™ Se unen al sitio activo de la
unirse al sitio activo de la enzima enzima en forma irreversible
o en otro sitio dejando libre el sitio ™ Casi todos estos inhibidores son
activo sustancias tóxicas naturales o
1. - Inhibición Competitiva sintéticas
2.- Inhibición NO Competitiva ƒ Cianuro
ƒ Diisopropil fluorofosfato
ƒ Sarin
ƒ Penicilina
ƒ Paration
ƒ Fisostgmina
INHIBICION REVERSIBLE
Competitiva No competitiva
™ El inhibidor compite con el ™ El inhibidor se fija a un sitio distinto
sustrato por el sitio activo de la al sitio activo
enzima
™ Impide la formación del complejo ™ No se bloquea la formación del
enzima- sustrato complejo enzima-sustrato
Competitiva No competitiva
™ El inhibidor se parece al sustrato y ™ El inhibidor no se parece al
puede formar el complejo sustrato
enzima-inhibidor
™
™ Impide la formación del complejo ™ No se bloquea la formación del
enzima- sustrato complejo enzima-sustrato

™ La enzima no puede unirse al ™ La enzima se inactiva al unirse al


sustrato inhibidor estando o no unido el
sustrato

™ Puede anularse el efecto del ™ No se puede anular el efecto con


inhibidor aumentando la el aumento del sustrato
concentración de enzima
™ Si aumenta la concentración de ™ El inhibidor disminuye la
sustrato, se minimiza la concentración de enzima
probabilidad que se forme el
complejo enzima-inhibidor

™ La velocidad máxima de la ™ Por lo tanto disminuye la


reacción es norma velocidad máxima

™ Aumenta Km ™ No tiene efecto sobre Km


1/V
1/V
inhibidor
inhibidor

Sin inhibidor

1/ Vmax Sin inhibidor

1/ Vmax

-1/ Km 1/S
-1/ Km 1/S
9. Enzimas Reguladoras
• Son enzimas que no siguen el comportamiento
cinético de Michaelis-Menten, pero fijan la velocidad
de la secuencia global, ya que catalizan la reacción
más lenta, es decir, la limitante de velocidad.

• Estas enzimas muestran una actividad catalítica


mayor o menor en respuesta a ciertas señales,
ajustando constantemente la velocidad de cada
secuencia metabólica para adaptarse a los cambios
en las necesidades de la célula con respecto a la
energía y a las biomoléculas requeridas durante el
crecimiento celular y en la reparación de lesiones.
Enzimas Alostéricas

• Son proteínas con múltiples subunidades y múltiples sitios


activos
• Presentan cooperatividad de unión del sustrato:
HOMOALOSTERISMO
• Su actividad esta regulada por otras moléculas efectoras:
HETEROALOSTERISMO
• Todas las enzimas están dispuestas en “ líneas de ensamblaje”
para llevar a cabo los pasos secuenciales necesarios en una
ruta metabólica
• Las enzimas reguladoras son inhibidas de forma especifica por
los productos finales de la ruta metabólica cuando hay una alta
concentración de ellos o bien por otro tipo de compuestos
denominados MODULADORES ALOSTÉRICOS
• Cuando una enzima alostérica disminuye de velocidad, todas
las otras enzimas de una ruta también trabajan a menor
velocidad.
• Las enzimas alostéricas por lo general tienen:
Uno o más sitios activos y uno o más sitios alostéricos o
moduladores ( enzimas HETEROTRÓPICAS)
• En algunas el sitio activo y el alostérico son el mismo (
enzimas HOMOTRÓPICAS)
• Su comportamiento cinético es diferente al Michaeliano.
Dan una curva sigmóide al graficar V vrs [S] en vez de la
hipérbola Michaeliana.
• Se utiliza K0,5 que equivale a la Km
• Este comportamiento cinético sigmoideo es el reflejo de
interacciones cooperativas ente sus múltiples subunidades
• Es decir los cambios de estructura de una subunidad se
traducen en cambios estructurales en las subunidades
adyacentes., efecto que es facilitado por interacciones no
covalentes en las interfase entre unidades.
Enzimas por modificación covalente

• Se modula la actividad por modificación covalente


de la molécula enzimática.
• Se utilizan grupos modificadores que se unen a la
enzima para activarlas: Fosfato, AMP ,UMP ,ADP,
Metilos ,Acetilos , etc.
• Se eliminan de la enzima por otras enzimas

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