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II
QUÍMICA DE LOS
SERES VIVOS
Ing. Francisco Javier Camacho Calderón
SUCRE - BOLIVIA
1
BIOELEMENTOS
Los elementos químicos que forman parte de
la materia viva.
Elementos químicos:
Más de 100 conocidos 92 naturaleza
70 en los seres vivos
22 en cierta abundancia y cumplen una
función.
Su abundancia en la tierra es reflejada.
Clasificados por su cantidad e importancia.
2
BIOELEMENTOS
Un bioelemento de una categoría puede, en
determinados organismos, pertenecer a otra.
Ej. Si es un oligoelemento
En diatomeas (algas unicelulares), es
primario constituyente del caparazón.
Cualquier bioelemento es indispensable para
el ser vivo que lo posea.
Aunque esté en muy pequeña proporción su
carencia puede ser mortal.
3
BIOELEMENTOS
Mayoritarios.
Presentes en más del 0.1 %.
Pueden ser:
Primarios: C, H, O, N, P, S
Secundarios: Na, K, Ca, Mg, Cl
Oligoelementos.
Fe, I, F, Mn, Co, Si, Cr, Zn, Li, Mo
4
BIOELEMENTOS
Primarios.
Principales constituyentes de bio-moléculas.
En conjunto el 95 % de la materia viva
C 20 %
H 9.5 %
O 62 %
N 2.5 %
Resto 1 % P y S.
5
BIOELEMENTOS
Primarios - Características.
Se considera son el motivo por el que están
en mayor proporción en los seres vivos.
Aunque no son abundantes, se encuentran
fácilmente en las capas externas terrestres.
Están en corteza, atmósfera e hidrosfera
Los seres vivos los pueden incorporar
desde el medio externo (CO2, H2O, nitratos).
6
BIOELEMENTOS
Primarios - Características.
Sus compuestos son polares solubles
en agua fácil incorporación y
eliminación.
Capas electrónicas externas incompletas
pueden formar enlaces covalentes dan
lugar a bio-moléculas:
Constituyen estructuras biológicas
Realizan funciones vitales.
7
BIOELEMENTOS
Primarios - Características.
Número atómico bajo son los elementos
más ligeros con capacidad de formar enlace
covalente electrones compartidos
próximos al núcleo moléculas estables.
C, H, O y N
Pequeña masa atómica.
Valencia variable compartir electrones
y formar enlaces covalentes fuertes y
estables moléculas variadas y
grandes. 8
BIOELEMENTOS
Primarios - Características.
CyN
Misma afinidad para unirse al O o H
fácil oxidación ↔ reducción (CO2 ↔ CH4 o
HNO3 ↔ NH3)
Gran importancia Procesos Redox
base de procesos químicos en la célula.
Especialmente para obtener y producir
energía. Ej. Fotosíntesis y respiración
celular. 9
BIOELEMENTOS
Primarios - Características.
C, N y O
Pueden compartir más de un par de
electrones Forman enlaces dobles y
triples les da gran versatilidad para el
enlace químico.
NyO
Electronegativos bio-moléculas
polares solubles en agua.
10
BIOELEMENTOS
Primarios - Características.
C
El más importante
Base de la Qmc. Orgánica y de los seres
vivos.
Configuración tetraédrica de sus enlaces
Estructura tridimensional a sus
moléculas Responsable de la actividad
biológica.
11
BIOELEMENTOS
Primarios - Características.
C
En su orbital externo tiene cuatro
electrones cuatro enlaces covalentes
unirse entre ellos forma cadenas
largas (lineales, ramificadas o cíclicas)
12
BIOELEMENTOS
Primarios - Características.
P
Compone los nucleótidos forman ADN
y ARN
Coenzimas.
Otras moléculas: Fosfolípidos, sustancias
fundamentales de las membranas
celulares.
Fosfatos, sales minerales abundantes en
los seres vivos. 13
BIOELEMENTOS
Primarios - Características.
P
Está en el tejido óseo, fluidos y tejidos
blandos forma parte de todas las
células en forma de fosfatos orgánicos o
inorgánicos.
Interviene en los procesos de osificación.
Forma enlaces ricos en energía (ATP).
14
BIOELEMENTOS
Primarios - Características.
S
Compone varias moléculas (polisacáridos
complejos).
Algunos aminoácidos (cisteína, cistina,
metionina, entre otros) presentes en
todas las proteínas
Puede formar enlaces energéticos.
En algunas sustancias (Coenzima A).
15
BIOELEMENTOS
Secundarios.
En conjunto el 4.5 % de la materia viva.
Suelen formar:
Sales
Ciertas moléculas (tiroxina, clorofila,
hemoglobina).
16
BIOELEMENTOS
Secundarios.
Ca
Forma iónica fluidos y tejidos,
llamado Ca soluble.
Precipitado huesos, conchas, entre
otras estructuras esqueléticas.
En equilibrio dinámico con el Ca
plasmático en proceso continuo de
formación y resorción ósea
(homeostasis). 17
BIOELEMENTOS
Secundarios.
Ca
Regula las funciones fisiológicas:
Irritabilidad neuromuscular
Automatismo cardíaco
Contracción muscular
Coagulación sanguínea
18
BIOELEMENTOS
Secundarios.
Ca
Segundo mensajero en transducción
de señales para:
Secreción de neurotransmisores en
las neuronas
Contracción de las células
musculares
Fertilización.
19
BIOELEMENTOS
Secundarios.
Ca
Coadyuva en las funciones de
enzimas y proteínas.
Mantiene la diferencia de potencial
en:
Membranas de tejidos excitables
Formación de los huesos
20
BIOELEMENTOS
Secundarios.
Mg
En pequeñas proporciones pero vital
para el organismo
Presente en forma en forma iónica y/o
de precipitado.
Reduce:
Cálculos renales
Stress 21
BIOELEMENTOS
Secundarios.
Mg
En forma iónica + enzimas cataliza
muchas reacciones químicas del
organismo
> 300 reacciones enzimáticas
metabolismo energético y proteico
(formación de AMP cíclico).
22
BIOELEMENTOS
Secundarios.
Mg
Coadyuva en:
Transporte de Na y K a través de las
membranas celulares.
Funciones de contracción celular,
formación ósea, transmisión del
código genético.
23
BIOELEMENTOS
Secundarios.
Mg
Mantener integridad del sistema
nervioso central.
Transmisión del impulso nervioso.
Sistema endocrino.
Des-intoxicante, antidepresivo y
relajante.
24
BIOELEMENTOS
Secundarios.
Na y K
Ampliamente distribuidos en los
organismos.
En forma iónica íntimamente
relacionados a funciones fisiológicas.
Su proporción es importante.
25
BIOELEMENTOS
Secundarios.
Na y K
Regulan constantes vitales:
Potencial de membrana
Presión osmótica Equilibrio
electrolítico y osmótico a ambos
lados de la membrana celular, el Na
en el medio extracelular y el K en el
interior de las células.
26
BIOELEMENTOS
Secundarios.
Na
Secreciones digestivas.
interviene en la absorción activa de
numerosos nutrientes Intestino.
27
BIOELEMENTOS
Secundarios.
K
Esencial para:
Automatismo cardíaco.
Actividad enzimatica relacionada a
la síntesis proteica
Evitar desagregación de ribosomas.
28
BIOELEMENTOS
Secundarios.
Cl
Anión más frecuente.
Mantiene el balance de agua entre la
sangre y el fluido intersticial.
Coadyuva en:
Depuración del hígado y su buen
funcionamiento
Contracción muscular 29
BIOELEMENTOS
Secundarios.
Cl
Regula:
P osmótica y pH.
Junto al Na y K:
Parte del jugo gástrico
Interviene en el proceso digestivo
Regula el balance electrolítico
30
BIOELEMENTOS
Oligoelementos.
{Elementos} presentes en cantidades
ínfimas (< 0.1 %).
Indispensables para el desarrollo
armónico de los seres vivos.
No están presentes en todos.
Aprox. 60 oligoelementos.
Sólo 14 comunes a casi todos: Fe, I, F,
Mn, Co, Si, Cr, Zn, Mo, Cu, B, V, Se y
31
BIOELEMENTOS
Oligoelementos.
Carencia trastornos e incluso de
enfermedades esenciales para
algunos procesos bioquímicos y
fisiológicos.
Exceso perjudicial, tóxico, mortal.
32
BIOELEMENTOS
Oligoelementos.
Fe
Esencial para el metabolismo
energético y oxidativo.
En todas las células.
Transporte y almacenamiento de O.
Fundamental para la síntesis de
clorofila.
33
BIOELEMENTOS
Oligoelementos.
Fe
Catalizador en reacciones químicas.
Necesario Funcionamiento normal
de mecanismos de defensa a nivel
celular, humoral y secretorio.
En enzimas
Citocromos respiración celular
Peroxidasas. 34
BIOELEMENTOS
Oligoelementos.
I
Indispensable para la formación de
las hormonas tiroideas
Intervienen en el metabolismo.
Esenciales para el desarrollo
normal.
35
BIOELEMENTOS
Oligoelementos.
F
Indispensable para la formación del
esmalte de los dientes.
Forma parte de los huesos.
Cr
Junto a la insulina regula la glucosa
en sangre.
36
BIOELEMENTOS
Oligoelementos.
Mn
Interviene en la fotolisis del agua en
la fotosíntesis en las plantas
Procesos redox.
Activador de enzimas importantes.
37
BIOELEMENTOS
Oligoelementos.
Co
Necesario para síntesis de vitamina
B12 para sintetizar hemoglobina.
Anticanceroso utilizado en medicina.
Mo
Parte de enzimas vegetales actúan
en la reducción de los nitratos.
38
BIOELEMENTOS
Oligoelementos.
Si
Proporciona resistencia al tejido
conjuntivo.
Endurece los tejidos vegetales como
en las gramíneas.
Forma los caparazones de las
diatomeas .
39
BIOELEMENTOS
Oligoelementos.
Zn
Cataliza muchas reacciones.
Esencial para la actividad de más de
70 enzimas Parte de su molécula o
porque lo requieren como co-factor.
40
BIOELEMENTOS
Oligoelementos.
Zn
Relacionado a:
Uso de energía
Síntesis de proteínas
Protección oxidativa.
41
BIOELEMENTOS
Oligoelementos.
Li
Actúa
Mejorar la actividad de los
neurotransmisores
Permeabilidad celular
Antidepresivo
Regular Na y K Equilibrio
electrolítico 42
BIOELEMENTOS
Oligoelementos.
Cu
Forma parte de:
Diversas enzimas intervienen en
reacciones oxidativas relacionadas
al metabolismo del Fe
Aminoácidos precursores de
neurotransmisores.
43
BIOELEMENTOS
Oligoelementos.
Cu
Necesario en la síntesis de elastina
proteína fibrosa de la matriz
extracelular.
44
MOLÉCULAS
Agrupación definida y ordenada de
átomos En gral. son de diversos tipos
o elementos
La porción más pequeña de una
sustancia pura que conserva todas sus
propiedades.
La unión entre elementos se produce a
través de enlaces químicos entre los
que destacan los de tipo covalente.
45
MOLÉCULAS
En gral. se forman guiadas por las
siguientes reglas sencillas:
Elementos cercanos a los gases
nobles ionizarse y formar enlaces
iónicos.
Elementos alejados de los gases
nobles compartir sus electrones y
formar enlaces covalentes forman
moléculas muy estables.
46
MOLÉCULAS
Cada elemento trata de tener su capa
más externa completa tener 8
electrones en su último nivel de
energía lograr la configuración de
un gas noble cediendo, ganado o
compartiendo electrones.
47
MOLÉCULAS POLARES
Tienen electrones asimétricamente
distribuidos por la diferencia de
electronegatividad y al tamaño de los
átomos los electrones son atraídos
con más fuerza por uno de ellos.
Exponen dos zonas una que adquiere
una carga eléctrica positiva y otra que
adquiere una carga eléctrica negativa,
donde se concentran más electrones.
48
MOLÉCULAS POLARES
Adquiere un momento dipolar
Se orientan en una dirección al ser
colocadas en un campo eléctrico.
Se relacionan por interacciones
eléctricas carga – carga interactúan
bien con el agua y forman puentes de
H.
49
MOLÉCULAS POLARES
Ej.
C2H5OH, azúcares O del OH- atrae
los electrones con más fuerza que los
otros átomos.
Muy solubles en agua.
50
MOLÉCULAS NO POLARES
No son solubles en agua para ello,
se deberían romper los enlaces de
puente de hidrógeno presentes en el
agua.
Forman
Una capa separada del agua (Ej. Una
capa de aceite sobre el agua)
Glóbulos de grasa dentro del agua.
Ej. Hidrocarburos
51
ENLACES QUÍMICOS
Unión de dos o más átomos ya sean
iguales o de distinta naturaleza los
electrones juegan un papel decisivo.
Cuando dos o más átomos se acercan
fuerzas de atracción, de diversa
naturaleza, entre electrones y núcleo de
uno y otro átomo
Si esta fuerza es suficientemente grande
para mantenerlos unidos se produce el
enlace. 52
ENLACES QUÍMICOS
Fuertes Débiles
Iónico Puente de hidrógeno
Covalente Fuerzas de Van der
metálico. Waals
Interacción ión – dipolo
Interacciones
hidrofóbicas.
53
ENLACE IÓNICO
54
ENLACE IÓNICO
Unión debida a fuerzas de atracción
eléctricas catión - anión.
Forman compuestos con:
Altos puntos de fusión y ebullición.
Generalmente solubles en agua
en solución acuosa conducen la
corriente eléctrica.
55
ENLACE COVALENTE
Ocurre especialmente cuando no existe
diferencia de electronegatividad o es
muy baja.
Es el caso de gases y elementos no
metálicos. Ej. H-H, O-O, C-C, C-O, C-N, C-
H, entre otros.
56
ENLACE COVALENTE
Diferencia de electronegatividad ↑, como
entre O y N con H elemento más
electronegativo atrae hacia sí los
electrones la molécula se polariza.
57
ENLACE COVALENTE
La polaridad es importante en los
procesos biológicos.
Polaridad del agua facilita:
Estabilidad de proteínas y ADN .
Solubilidad.
Los átomos completan el octeto estable
al compartir 1, 2 o 3 pares de electrones
Da lugar a enlace: simple, doble o
triple
58
ENLACE COVALENTE
Los electrones compartidos se mueven
en un nuevo tipo de orbital orbital
molecular
59
ENLACE COVALENTE
Los compuestos formados tienen baja
conductividad los electrones están
fuertemente localizados atraídos por los
núcleos de los dos átomos.
La elevada energía necesaria para
romper un enlace covalente los
compuestos donde los átomos
extienden sus enlaces en las tres
direcciones del espacio (diamante)
tienen altos puntos de fusión
60
ENLACE COVALENTE
Si el número de enlaces es limitado,
como en la mayoría de las sustancias (O2,
H2, NH3), los átomos se saturan y la
interacción molecular es débil tienen
puntos de fusión y ebullición bajos
son gasea a P y T ordinarias.
En gral. es fuerte y muy estable.
61
ENLACE COVALENTE
Una vez formado rara vez se rompe
espontáneamente La energía de una
molécula a temperatura ambiente es de
aproximadamente 0.6 Kcal/M que es
mucho menor la requerida para romper
el enlace covalente.
Su energía típica es de 80 Kcal/M
Normalmente varía entre 50 y 110 Kcal/M
de los elementos involucrados.
62
ENLACE COVALENTE
Son notables los enlaces C-C, que son
extraordinariamente fuertes y estables:
Enlace simple 80 Kcal/M
Enlace doble 150 Kcal/M
Enlace triple 200 Kcal/M
63
ENLACE METÁLICO
Enlace que une a metales entre sí, sus
núcleos y electrones de valencia
Son extraídos de sus orbitales la
baja electronegatividad de los átomos
Se juntan alrededor de átomos y
núcleos como nube
Están libres y se pueden mover con
facilidad los metales tengan elevada
conductividad eléctrica y térmica.
64
ENLACE METÁLICO
Los átomos comparten muchos
electrones de valencia forman un mar
que rodea una gran malla de cationes.
65
ENLACE METÁLICO
Enlace primario fuerte.
Se forma entre elementos de la misma
especie.
Los átomos están tan cerca, que se
producen estructuras muy compactas,
donde cada átomo está rodeado por
otros doce átomos.
66
ENLACE METÁLICO
67
ENLACE METÁLICO
Los metales tienen propiedades
características que los diferencian de los
demás materiales.
Suelen ser sólidos a temperatura
ambiente, excepto el mercurio.
Tienen un punto de fusión alto.
En gral. brillan devuelven la mayor
parte de la energía lumínica que reciben
Son maleables
68
ENLACE METÁLICO
Es no polar la diferencia de
electronegatividad entre átomos:
No existe en metales puros.
Es pequeña en aleaciones.
69
ENLACE POR PUENTE DE H
Un tipo especial de interacción
electrostática dipolo-dipolo.
Entre un H en un enlace covalente muy
polarizado y un átomo pequeño muy
electronegativo como F, N y O.
El H tiene una carga parcial positiva
atrae la densidad electrónica de un átomo
cercano.
70
ENLACE POR PUENTE DE H
71
ENLACE POR PUENTE DE H
Poco energético frente
al covalente.
Su energía típica está
entre 3 – 5 Kcal/Mol
Fundamental para
explicar procesos
como la solvatación o
el plegamiento de
proteínas.
72
ENLACE POR PUENTE DE H
Si el puente se establece entre dos
moléculas diferentes de la misma o de
diferentes especies se llama enlace
intermolecular (Ej. H2O, HF).
73
ENLACE POR PUENTE DE H
Si se establece entre dos elementos
electronegativos de la misma molécula,
se llama enlace intramolecular
74
ENLACE POR PUENTE DE H
La vida depende de algunas propiedades
específicas de este enlace que favorecen
a la estabilidad de compuestos orgánicos
como: lípidos, proteínas, ADN y ARN.
75
ENLACE F. VAN DER WAALS
Los átomos de muchas moléculas tienen
diferente electronegatividad aunque
son neutras distribución no homogénea
de cargas en el enlace covalente, los
electrones compartidos son atraídos con
> fuerza por el más electronegativo.
76
ENLACE F. VAN DER WAALS
Una unión por fuerzas de atracción
eléctrica entre dipolos.
Estos dipolos, en gral. son instantáneos,
pero inducen a la formación de dipolos
en otras moléculas.
77
FUERZAS VAN DER WAALS
Menos intensas que los puentes de H,
donde los dipolos son permanentes y las
fuerzas son más localizadas.
en moléculas grandes sus capas
electrónicas se deforman facilmente
deslocalización de electrones >.
Al igual que los de puentes de H dan
estabilidad a las estructuras terciarias y
cuaternarias de proteínas y otras bio-
moléculas.
78
FUERZAS VAN DER WAALS
Explican:
Forma en que agrupan las moléculas
de I2 / es sólido, mientras sus
homólogos, son gases
Pero se sublima fácilmente vencer
fuerzas de Van der Waals no requiere
esfuerzo.
Energía típica < 1 Kcal/Mol.
79
FUERZAS VAN DER WAALS
Aunque transitorias y débiles son
importantes en la estructura de las
proteínas su número.
La mayoría de los átomos de una
proteína están tan próximos unos a otros
como para involucrar estas fuerzas
transitorias.
80
ENLACE IÓN – DIPOLO
Los iones de una sustancia interactúan
con los polos de otras moléculas
covalentes polares / el polo negativo de
una molécula atrae al catión y el polo
positivo al anión.
81
INTERAC. IÓN – DIPOLO
Ej. Solvatación de NaCl en solución
acuosa.
82
ENLACE I. HIDROFÓBICAS
Sustancia hidrofóbica inmiscible con
agua.
Ocurre si la molécula y el agua no
pueden interactuar ni por puentes H ni
por fuerzas ión-dipolo. Ej. HC saturados.
Interacción hidrofóbica es la tendencia de
las moléculas no polares a agruparse
cuando se encuentran en medio acuoso,
aunque, es el agua el que tiende a
comprimirlas entre si hasta que se unen.
83
INTERAC. HIDROFÓBICAS
84
INTERAC. HIDROFÓBICAS
Las moléculas de agua cercanas a la
molécula hidrofobica se orientan y se
asocian formando una estructura
parecida al hielo, una jaula de moléculas
de agua alrededor de la molécula
hidrofóbica, llamada clatrato.
85
INTERAC. HIDROFÓBICAS
Se presentan entre las cadenas laterales
de los aminoácidos hidrofóbicos.
87
INTERAC. HIDROFÓBICAS
Intervienen en el correcto plegamiento de
las proteínas.
Se presentan en el corazón hidrofóbico,
en la parte interna de las proteínas,
donde las cadenas laterales se asocian
estrechamente para protegerse de las
interacciones con el disolvente
88
BIO-MOLÉCULAS
Compuestos que se forman de la unión
de los bioelementos.
Llamadas principios inmediatos se
pueden extraer fácilmente de la materia
viva, mediante métodos físicos
sencillos, como evaporación, filtración,
destilación y disolución, entre otros.
Pueden ser:
1. Orgánicas
2. Inorgánicas. 89
BIOMOLÉCULAS ORGÁNICAS
Moléculas de compuestos orgánicos que:
Caracterizan la materia viva.
Son responsables de sus funciones.
El C es el elemento esencial que forma
una cadena básica donde se unen los
demás elementos químicos.
Se pueden considerar derivados de los
HC, donde un H o más se sustituyen
por un átomo o grupo de átomos
90
GRUPOS FUNCIONALES
Un átomo o grupo de átomos que ha
sustituido a un H en la cadena principal
de las bio-moléculas
Otorgan a las bio-moléculas nuevas
propiedades:
Mayor reactividad.
Facilidad para unirse a otras
moléculas.
91
GRUPOS FUNCIONALES
HIDROFÓBICOS
92
GRUPOS FUNCIONALES
POLARES
93
GRUPOS FUNCIONALES
POLARES
94
GRUPOS FUNCIONALES
POLARES
95
GRUPOS FUNCIONALES
ENLACES Y PUENTES
96
GRUPOS FUNCIONALES
GRUPO
FÓRMULA TIPO
FUNCIONAL
Oxigenados
Hidroxilo Polar
Carbonilo -
Polar
Aldehido
Carbonilo -
Polar
Cetona
97
GRUPOS FUNCIONALES
GRUPO
FÓRMULA TIPO
FUNCIONAL
Oxigenados
Carboxilo Ionizado
98
GRUPOS FUNCIONALES
GRUPO
FÓRMULA TIPO
FUNCIONAL
Nitrogenados
Amino Ionizado
Imina Ionizado
Amida Ionizado
Nitro Polar
Nitrilo Polar
99
GRUPOS FUNCIONALES
GRUPO
FÓRMULA TIPO
FUNCIONAL
Nitrogenados
Isocianuro Polar
Isocianato Polar
Azo No Polar
Hidrazina No Polar
Hidroxilamina No Polar
100
GRUPOS FUNCIONALES
GRUPO
FÓRMULA TIPO
FUNCIONAL
Halogenados
Haluro No Polar
Acilo No Polar
101
GRUPOS FUNCIONALES
GRUPO
FÓRMULA TIPO
FUNCIONAL
Sulfurados
Tioeter Polar
Tiol o
No Polar
Sulfidrilo
Sulfóxido Polar
Sulfonato Polar
Sulfónico Polar
Disulfuro Enlace
102
GRUPOS FUNCIONALES
GRUPO
FÓRMULA TIPO
FUNCIONAL
Fosfatados
Fosforilo Polar
Monohidrofosfato Polar
Fosfato Polar
103
BIOMOLÉCULAS ORGÁNICAS
104
BIOMOLÉCULAS ORGÁNICAS
105
BIOMOLÉCULAS ORGÁNICAS
Tienen funciones muy variadas.
Glúcidos y lípidos energéticas y
estructurales.
Proteínas enzimáticas y
estructurales.
Ácidos nucleicos portadores de la
información genética.
106
BIOMOLÉCULAS ORGÁNICAS
Algunas sustancias
Son muy importantes para los seres
vivos, pero se las necesita en muy
pequeña cantidad.
No tienen funciones energéticas, ni
estructurales
Son biocatalizadores
1. Enzimas
2. Vitaminas
3. Hormonas 107
BIOMOLÉC. INORGÁNICAS
Son características de la materia inerte, pero
se encuentran también en los seres vivos.
No poseen átomos de C o no forma
cadenas.
Entre éstas tenemos:
1. Agua.
2. Sales minerales.
3. Algunos gases que se desprenden o
utilizan en las reacciones químicas de las
células como: O2 y CO2 108