MICROBIOLOGIA AVANZADA

Cepas Microbianas.
Una cepa es una variante fenotípica de una especie o, incluso, de
variante de taxón inferior, usualmente propagada clonalmente debido
al interés en la conservación de sus cualidades definitorias.

En otras palabras, una cepa es un conjunto de células homogéneas, o

clones, que deriva de la reproducción de una célula inicial única,
seleccionada y aislada. También suele referirse a las cepas como
colonias puras de bacterias.
Existen distintos tipos de cepas entre los cuales:

Cepas de colección: Microorganismos definidos por lo menos a nivel de

género y especie, depositados y mantenidos en una Colección de
Cultivos (CC) o Centro de Recursos Biológicos (BRC) y catalogados con
el acrónimo de la colección/BRC seguido de un número identificativo. En
dicho catálogo se reseña el origen de la cepa, sus condiciones de cultivo
y, en muchas ocasiones, algunas de sus características, así como la
equivalencia, si la hay, con otras colecciones. Es equivalente a cepas de
referencia.

- Cepas de reserva: cepas idénticas obtenidas mediante un único

subcultivo de una cepa de referencia suministrada por el proveedor, o
que proceden directamente del proveedor como tales.

Estas cepas son distribuidas y presentadas comercialmente liofilizadas; los

organismos de acreditación son los encargados de considerar valida la
fuente de procedencia de la cepa a fin de que se cumpla con el requisito
de prevenir mutaciones, deterioro o alteración de las características

- Cepas de trabajo: subcultivos primarios obtenidos de una cepa de

reserva.
- Cepas comerciales: cepas suministradas por casas comerciales
diferentes de las colecciones de cultivo o Centros de Recursos Biológicos,
y que pueden o no proceder de una colección de cultivos.
- Cepas salvajes: No proceden de CC ni de BRC.

Siendo entonces la diferencia entre las cepas de referencia, de trabajo y

de reserva su uso, con las cepas de referencia ayudando a desarrollar los
otros dos tipos de cepas, ya que estas se utilizan tanto en las cepas de
reserva siendo estas como se mencionó idénticas a la cepa de referencia
y las cepas de trabajo utilizan un subcultivo con el cual se trabaja.
Un cepario es la colección de microorganismos en unas condiciones que
permitan que mantenga su viabilidad con el fin de conservarlos en el
tiempo y poder utilizarlos posteriormente.

Requerimientos:

Viabilidad: Células microbianas capaces de crecer. Cultivos de

referencia.
Pureza: Debe ser un cultivo puro.
Estabilidad: Estabilidad genética (genotípica y fenotípicamente)

Los CR son necesarios para la evaluación de la calidad de los medios de

cultivo y controles de calidad internos durante la ejecución de los
ensayos.

ATCC es la principal organización mundial de recursos y materiales

biológicos cuya misión se centra en la adquisición, autenticación,
producción, conservación, desarrollo y distribución de microorganismos
de referencia estándar, líneas celulares y otros materiales. Mientras
mantiene los materiales de recolección tradicionales, ATCC desarrolla
productos, estándares y servicios de alta calidad para respaldar la
investigación científica y los avances que mejoran la salud de las
poblaciones globales.

· Identificación de la cepa.
· Género y especie del microorganismo
· TIPO y Nº de colección.
· Nº de lote.
· Fecha de recepción.
· Control de calidad de la cepa de referencia Conforme (SI/NO).
· Fecha de caducidad de la cepa.
· Personal responsable.
Control de calidad de pureza y viabilidad:
Este control se realiza a diferentes niveles del proceso; asimismo, se
desempeña cada vez que se realiza un replique. El objetivo de dicho
control es el de asegurarse que las cepas conservan su viabilidad y sus
caracteres bioquímicos.
Frecuencia de realización de este control:
· Es el laboratorio el que establece en cada caso la frecuencia de
realización del control de calidad de pureza y viabilidad para las cepas
de reserva almacenadas.
· En caso de no ostentar las características establecidas se ejecuta la
"acciones correctivas" que se establecen en el procedimiento.
Registro de Control de calidad de pureza y viabilidad de las cepas:
· Fecha del control.
· Identificación de la cepa. Género y especie del microorganismo. TIPO
y Nº de colección.
· Tipo de cepa (Cepa de referencia, reserva o trabajo).
Pruebas a realizar (depende del microorganismo):
1. Coloración de Gram
2. Características de las colonias en medios selectivos
3. Pruebas bioquímicas y serológicas

En biología molecular, un pan-genoma (o supra-genoma ) describe el

complemento completo de genes en un clado (originalmente aplicado
a especies en bacterias y arqueas , pero también a especies
de plantas ), que puede tener una gran variación en el contenido de
genes entre Cepas o ecotipos . Es la unión de los conjuntos de genes de
todas las cepas de un clado (por ejemplo, especies). La importancia del
pan-genoma surge en un contexto evolutivo, especialmente con
relevancia para la metagenómica , [2]pero también se usa en
un contexto genómico más amplio. [3] Los estudios de plantas han
demostrado que la dinámica del pan-genoma está vinculada a
elementos transponibles.

El pan-genoma incluye el "genoma del núcleo" que contiene los genes

presentes en todos los individuos, un genoma accesorio o prescindible
que contiene los genes de la cáscara presentes en dos o más cepas, y
finalmente los genes de la nube únicos específicos de las cepas
individuales. Los genes de núcleo blando también se han encontrado en
la mayoría (95%) de las cepas o ecotipos analizados, lo que deja espacio
para errores de ensamblaje / anotación.

Estas distinciones no son completamente objetivas, ya que dependen de

qué genomas se incluyen en el análisis. Además, el término "prescindible"
ha sido cuestionado.
Hay dos tipos generalizados de pan-genomas, categorizados por el
número de nuevos genes agregados al pan-genoma por genoma
secuenciado. Los clados con un pan-genoma cerrado tendrían muy
pocos genes agregados por genoma secuenciado después de la
secuenciación de muchas cepas, y el tamaño del panoma completo
podría ser predicho teóricamente. Los clados con un pan-genoma
abierto tienen suficientes genes agregados por genoma secuenciado
adicional que no es posible predecir el tamaño del pan-genoma
completo. [8] El tamaño de la población y la versatilidad de nicho se han
sugerido como los factores más influyentes para determinar el tamaño
del pan-genoma.

El pan-genoma describe el complemento completo de genes en una

lista de organismos.

Es la unión de todas las familias de genes y genes específicos de todas las

cepas. Incluye:
El núcleo-genoma que contiene las familias de genes compartidas por
todos los organismos (intersección de las familias de genes).

El genoma variable que contiene las familias de genes compartidas por

dos o más organismos y genes específicos de cepas.

REFERENCIAS
Esperanza Gray, Rosa Aznar, Jorge Lalucat, Ferran Ribas. (noviembre
2016). Informe técnico sobre cepas de trabajo en el laboratorio de análisis
microbiológico. Sociedad Española de Microbiología, uno, 12.

Yira Stefany Reyes Tavera. (2014). Creación y Manejo de Cepario. Martes

5 del 2014, de Scribd Sitio web:
https://es.scribd.com/doc/210837319/CREACION-Y-MANEJO-DE-
CEPARIO

http://wdcm.nig.ac.jp/hpcc.html Home Pages of Culture Collections in

the World

Updated 01 January 2006 There are 508 culture collections in 66 countries

registrated in WDCM

Medini, Duccio; Donati, Claudio; Tettelin, Hervé; Masignani,

Vega; Rappuoli, Rino (2005). "El pan-genoma microbiano". Opinión
actual en Genética y Desarrollo. 15 (6): 589–594. doi : 10.1016 /
j.gde.2005.09.006 . PMID 16185861

Gordon SP, Contreras-Moreira B, Woods DP, Des Marais DL, Burgess D, Shu
S, Stritt C, Roulin AC, Schackwitz W, Tyler L, Martin J, Lipzen A, Dochy N,
Phillips J, Barry K, Geuten K, Budak H, Juenger TE, Amasino R, Caicedo AL,
Goodstein D, Davidson P, Mur LA, Figueroa M, Freeling M, Catalan P,
Vogel JP (diciembre de 2017). "Amplia variación del contenido de genes
en el pan-genoma de Brachypodium distachyon se correlaciona con la
estructura de la población" . Comunicaciones de la naturaleza. 8 (1):
2184. doi : 10.1038 / s41467-017-02292-8 . PMC 5736591