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Las vías de procesamiento del antígeno convierten los antígenos proteínicos presentes
en el citosol o interiorizado del ambiente extracelular en péptidos, y los cargan en las
moléculas del MHC para presentárselos a los linfocitos T.
Los mecanismos de procesamiento del antígeno están diseñados para generar péptidos
que tengan las características estructurales requeridas para asociarse a moléculas del
MHC y colocarlos en el mismo lugar que las moléculas del MHC recién formadas que
tengan disponible la hendidura de unión al péptido. La unión del péptido a las moléculas
del MHC se produce antes de que se exprese en la superficie celular, y es un
componente integral de la biosíntesis y el ensamblaje de las moléculas del MHC.
Por ello es necesario que el péptido se asocie para el ensamblaje estable y expresión
en la superficie de las moléculas de las clases I y II del MHC.