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LA SYNTHESE DES PROTEINES

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CREMEF de Meknès

LA SYNTHESE DES PROTEINES 1 CREMEF de Meknès Dr. W. IRAQI HOUSSAINI Année Universitaire 2018-2019

Dr. W. IRAQI HOUSSAINI

Année Universitaire 2018-2019

La synthèse des protéines

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Le

fonctionnement

de

la

cellule

dépend

de

l'action de ses différentes protéines.

Les protéines ont de nombreuses fonctions dans l’organisme : structurent les cellules, assurent leur

métabolisme et permettent aussi la transmission

d’information.

Dr. W. IRAQI HOUSSAINI

Les différents types de protéines

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Les protéines de structures: permettent à la cellule de maintenir

son organisation dans l'espace ( ex: les protéines de la membrane plasmique et du cytosquelette).

Les protéines de transport: assurent le transfert des différentes molécules dans et en dehors des cellules (ex: l'hémoglobine pour le transport de l’O2, les canaux ioniques, les protéines de transport actif).

Les protéines régulatrices: modulent l'activité d'autres protéines (ex: facteurs de transcription).

Les protéines de signalisation: captent les signaux extérieurs, et

assurent leur transmission dans la cellule ou l'organisme (ex: les hormones et les neurotransmetteurs).

Les protéines motrices: permettant aux cellules ou organismes de se mouvoir (ex: les protéines contractiles composant le muscle).

NB:

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Les fonctions biochimiques des protéines sont très nombreuses, et sont généralement équivalentes à la

notion d’activité enzymatique.

La synthèse des protéines

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C'est la cellule elle-même qui s'occupe de produire ses protéines.

Les

protéines

sont

synthétisées

à

contenu dans le noyau.

partir

de

l’ADN

Plusieurs étapes se succèdent avant que l'information contenue dans l’ADN ne puisse être utilisée pour fabriquer des protéines.

Les 2 étapes essentielles chez les Eucaryotes sont :

La transcription : s’effectue dans le noyau La traduction : s’effectue dans le cytoplasme

NB :

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Chez

les

Procaryotes,

la

transcription

et

la

traduction

s’effectuent

dans

le

cytoplasme

et

peuvent être simultanées.

Ce cours

sera limité

à

la

synthèse des

protéines chez les Eucaryotes.

Dr. W. IRAQI HOUSSAINI

Schéma de la synthèse des protéines

chez les Eucaryotes

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Schéma : Wikipedia

Schéma de la synthèse des protéines chez les Eucaryotes 7 Schéma : Wikipedia Dr. W. IRAQI

Dr. W. IRAQI HOUSSAINI

Rappel :

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La structure standard de l'ADN est une double-hélice, composée de deux brins complémentaires. Chaque brin est

constitué d'un enchaînement de nucléotides, eux-mêmes composés de bases azotées (bases nucléiques), de désoxyriboses et de groupes phosphate. Il existe 4 bases

nucléiques dans l’ADN :

Adénine (A)

Guanine (G)

Cytosine (C)

Thymine (T)

Dans l’ADN

sont

complémentaires sur le double brin d’ADN, par des liaisons

hydrogène.

A

et

T

sont complémentaires, G et C

:

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Rappel -Suite-

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L'ARN a de nombreuses similarités avec l'ADN, avec quelques différences importantes :

l'ARN est sous forme de simple brin (avec quelques exceptions). l'ARN contient un ribose à la place du désoxyribose de l'ADN. la Thymine de l'ADN est remplacée par l’Uracile. les molécules d'ARN sont plus courtes (quelques dizaines à

quelques milliers de nucléotides) que l'ADN (quelques millions à quelques milliards de nucléotides).

Dans l’ARN : A et U sont complémentaires, G et C sont complémentaires sur le brin d’ARN synthétisé La Thymine n’existe pas dans l’ARN.



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De l’ADN à la protéine

Schéma : www.gnis-pedagogie.org

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De l’ADN à la protéine Schéma : www.gnis-pedagogie.org 10 Dr. W. IRAQI HOUSSAINI

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1ère étape : La transcription

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La transcription est le processus par lequel un morceau particulier d'ARN, appelé ARN messager : ARNm, est construit à partir d'une séquence d’ADN.

Contrairement

aux molécules d’ADN, les molécules

d'ARNm sont libres de sortir du noyau par les pores de la membrane nucléaire pour passer dans le cytoplasme.

La durée de vie de l’ARN est plus courte que celle de l’ADN (qq mn à qq heures).

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A savoir:

Il existe 3 types d'ARN polymérase:

L'ARN

polymérase

I:

permet

ribosomique.

la

synthèse

d’ARN

L'ARN polymérase II: transcrit l'ADN en ARN pré- messager.

L'ARN polymérase III: permet la synthèse des ARN de transfert. Ce sont des ARN non codants.

Ces ARN polymérases doivent être accompagnés de facteurs de transcription (protéines): TF I , TF II , TF III .

Les ARN polymérases sont un complexe protéique constitué de 8 à 14 sous-unités.

NB :

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L’ADN est formé de 2 brins. Durant la transcription,

l’hélicase sépare les deux brins de l'ADN, permettant ainsi l'action de l'ARN polymérase.

Seul un brin d’ADN est transcrit et est appelé brin non sens ou brin non codant (3vers 5’): Brin matrice.

L’ARN polymérase se lie au brin non codant et se déplace le long du

brin. Le sens 5' vers 3' est le sens de croissance du brin synthétisé.

Le brin non codant contient les anti-codons.

Le brin d'ADN non transcrit est appelé brin sens ou brin codant (5vers 3’): Brin non matrice.

Le brin codant est identique à l’ARNm sauf que T remplace U dans le brin codant. Contient les codons.

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Schématisation de la transcription

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Schéma : Wikipedia

Schématisation de la transcription 15 Schéma : Wikipedia Dr. W. IRAQI HOUSSAINI

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NB :

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Le repérage des gènes le long de la molécule d'ADN se

fait

de nucléotides (séquences proximales) qui vont indiquer le

début du gène : Séquences consensus (la boîte CAAT ou

Cat et les régions riches en GC) et permettre à l'ARN

polymérase II de se fixer à l’ADN sur la séquence

l’aide de séquences particulières

à

promotrice ou Promoteur : la boîte TATA.

La terminaison est assurée par des signaux spécifiques dont le signal de polyadénylation AAUAAA. L’ARN

polymérase II se détache ensuite sous l'action de divers

facteurs.

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A savoir:

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Il existe deux séquences régulatrices de la transcription:

Les séquences proximales : permettent le recrutement de

l’ARN polymérase (Les boîtes CAAT et les motifs riches en GC).

Les séquences distales : Elles peuvent être activatrices ou inhibitrices. Elles sont composées de multiples sites de liaison

pour les facteurs transcriptionnels.

L'ARN transcrit n'est pas toujours directement utilisable, il est souvent appelé ARN pré-messager, et peut

nécessiter différentes modifications avant de pouvoir

être traduit. Les modifications les plus connues sont :

l'ajout d'une coiffe, d'une queue poly (A) et l'épissage.

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Structure et rôle de la coiffe

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La coiffe ou 5'-cap est un nucléotide modifié, la guanosine méthylée, que l'on trouve à l'extrémité 5'

des ARNm dans les cellules eucaryotes. C'est une modification post-transcriptionnelle qui est introduite par l'action successive de plusieurs enzymes localisées dans le noyau. La coiffe joue plusieurs rôles :

Stabilité et la protection de l'ARNm contre la dégradation. Recrutement du ribosome pour permettre sa traduction en protéine.

La coiffe est un élément essentiel permettant aux ARNm d'être traduits dans la cellule. Ce processus nécessite l'action de plusieurs protéines et en particulier des facteurs d'initiation de la traduction.

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Structure et rôle de la queue Poly (A)

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La polyadénylation consiste en l'addition d'une queue poly (A) à

l'extrémité 3' des ARNm, par une enzyme spécifique, la poly (A)

polymérase. Chez les eucaryotes, cette étape s'effectue aussi dans le noyau, avant l'export vers le cytoplasme, lors de sa maturation.

La queue poly(A) a tendance ensuite à raccourcir sous l'action de nucléases. Les ARN à queue poly(A) courte sont

moins traduits et sont dégradés.

La polyadénylation joue plusieurs rôles essentiels au cours des différentes étapes de la vie d'un ARNm. Elle a plusieurs rôles :

Stabilité et la protection de l'ARNm contre la dégradation.

Transport vers le cytoplasme.

Excision du dernier exon.

Recrutement du ribosome pour permettre sa traduction en protéine.

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NB :

La

grande majorité des ARNm sont

polyadénylés. Cependant, il existe quelques exceptions (certains ARNm viraux et les ARNm des histones).

très

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L’épissage

21 Chez les eucaryotes, l’épissage est un processus par lequel les ARN transcrits à partir de l'ADN peuvent

subir des étapes de coupure et ligature qui conduisent

à l'élimination de certaines régions dans l’ARN final. Les segments conservés s’appellent des exons (régions codantes) et ceux qui sont éliminés s’appellent

des introns (régions non codantes).

Lors de la transcription, l’ARN pré-messager synthétisé est épissé dans le noyau de la cellule pour donner lieu

à l’ARNm dit mature. L’ARNm mature, constitué des seuls

exons, est alors exporté vers le cytoplasme pour être traduit en protéine.

L’épissage est assuré par un ensemble de complexes ribonucléoprotéiques appelé splicéosome, localisé dans le noyau. Chaque complexe contient un ARN et plusieurs

nucléoprotéines.

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NB :

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Le splicéosome, appelé aussi particule d'épissage, est localisé dans le noyau des cellules. Son rôle est d'assurer

l'excision des introns et la suture des exons. Les exons vont

donc être suturés pour donner l’ARN mature par le

mécanisme d’épissage. L’ARN obtenu est de type Exon1 -

L’épissage est une étape essentielle du

processus de maturation des ARNm. L’épissage est un mécanisme conservé chez tous les organismes eucaryotes.

Exon2 - Exon3 -

Le splicéosome est en général composé de cinq particules ribonucléoprotéiques, appelées snRNP.

Il existe des introns auto-épissables ou auto-catalytiques,

cad capables de s’exciser sans intervention d’un splicéosome : cas des mitochondries et des plastes.

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2ème étape : La traduction

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La traduction est le processus de fabrication d'une protéine en fonction de l'information fournie par la molécule d'ARNm. En d’autres termes, la traduction correspond au décodage de l'information portée par l'ARNm en protéines.

L'information contenue dans l'ARNm prend la forme de

groupements de trois nucléotides, complémentaires aux triplets de nucléotides de l’ADN. Un codon correspond à trois

nucléotides et désigne un acide aminé (AA) identifié par le

code génétique (code universel).

Chaque codon de l’ARNm code pour un AA particulier. Les 20 AA, employés pour fabriquer les protéines, ont au moins un

codon correspondant à chacun d’entre eux (le même AA peut

être codé par plusieurs codons, ex : UCU, UCC, UCA, UCG codent pour la Sérine).

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2ème étape : La traduction -Suite-

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Certains codons spécifiques indiquent aux ribosomes quand et où commencer la synthèse d'une protéine Codon Start

(Codon initiateur) et quand la compléter Codon Stop (Il existe

1 codon Start : AUG et 3 codons Stop : UAA, UGA, UAG).

Les ribosomes assurent la synthèse des protéines. Ils s'attachent au brin d'ARNm et «lisent» la séquence de codons de 5vers 3, commandant au fur et à mesure aux ARN de transfert (ARNt) les AA appropriés pour synthétiser la protéine pendant qu'ils font la lecture de l’ARNm.

NB : L'ordre des codons sur l'ARNm détermine la protéine à synthétiser.

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A noter :

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L'anticodon est formé de trois nucléotides localisé dans la structure des ARNt, qui joue un rôle important dans la traduction. Ce triplet de nucléotides s'apparie spécifiquement à la séquence complémentaire du codon

présent sur le brin d'ARNm. Cette complémentarité

spécifique des codons et anticodons permet de faire correspondre un AA à un codon selon le code universel.

correspondre un AA à un codon selon le code universel.  L'anticodon positionne l'ARNt, chargé avec

L'anticodon positionne l'ARNt, chargé avec son AA, sur le codon.

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Le code génétique

Schéma :

www.assistancescolaire.com

26 Le code génétique Schéma : www.assistancescolaire.com Dr. W. IRAQI HOUSSAINI

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Déroulement de la traduction

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Initiation : Le ribosome se fixe sur le codon-initiateur (AUG) du brin d'ARNm et va permettre de commencer la traduction, en formant l’AA Méthionine. Le ribosome va ensuite assembler

une séquence d’AA selon les "instructions" du code génétique.

Elongation : Le ribosome va parcourir le brin d'ARNm, codon par codon, (translocation) et va, par l'intermédiaire d'un ARNt, ajouter au fur et à mesure un AA à la protéine en cours de

fabrication selon le codon lu.

Terminaison : Une fois un codon-stop est atteint, la protéine est complète, le ribosome se détache de la protéine et du brin de l’ARNm, et la protéine est libérée.

Le ribosome détaché pourra faire une autre synthèse sur un autre ARNm. Les protéines synthétisées sont soit exportées par exocytose soit utilisées dans la cellule même où elles ont été produites. Dr. W. IRAQI HOUSSAINI

NB:

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La petite sous-unité du ribosome porte les sites de fixation

des ARNt sur l'ARNm (L'ARNm passe à travers la petite sous-unité du ribosome).

La grande sous-unité du ribosome contient:

la partie catalytique, qui effectue la liaison peptidique entre les

AA consécutifs de la protéine.

un tunnel par lequel sort la chaîne protéique en cours de synthèse.

trois sites où vont se fixer les ARNt porteurs des AA pendant la

traduction:

le site A (pour aminoacyl-ARNt), qui est occupé par un ARNt porteur d'un AA en attente d'être lié à la chaîne polypeptidique.

le site P (pour peptidyl-ARNt), qui est occupé par un ARNt porteur d'un AA lié à la chaîne polypeptidique résultante.

le site E (pour exit), qui permet la libération de l'ARNt qui a livré son AA.

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Ribosome ARNt

29

Wikipédia

Ribosome – ARNt 29 Wikipédia Dr. W. IRAQI HOUSSAINI
Ribosome – ARNt 29 Wikipédia Dr. W. IRAQI HOUSSAINI
Ribosome – ARNt 29 Wikipédia Dr. W. IRAQI HOUSSAINI

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A retenir :

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Les ribosomes sont la machine cellulaire responsable de l'assemblage des protéines à partir de

l'information génétique contenue dans l'ARNm.

Les

ARNt

sont

des

intermédiaires

clés

dans la

traduction. Ils apportent les AA au ribosome.

Chaque ARNt est spécifique d’un AA.

Les ARNt sont des ARN non codants.

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Schématisation de la traduction

Schéma : Wikipedia

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Schématisation de la traduction Schéma : Wikipedia 31 Dr. W. IRAQI HOUSSAINI

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Exemple

Schéma : Wikipedia

32 Exemple Schéma : Wikipedia Dr. W. IRAQI HOUSSAINI

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Important

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Les protéines synthétisées dans le cytoplasme restent soit sur place, sont soit intégrées dans la membrane du réticulum endoplasmique rugueux (protéines membranaires), soit transférées dans le lumen du

réticulum endoplasmique rugueux (protéines solubles).

Pour les modifications post-traductionnelles et la destinée des protéines, voir cours sur les organites cellulaires.

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A noter :

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Chez les eucaryotes : Un ARNm donné ne code que pour une seule protéine donnée : ARN monocistronique.

Chez les procaryotes : Plusieurs protéines peuvent être

synthétisées

à

partir

du

même

ARNm

:

ARN

polycistronique.

Ce

dernier

peut

être

traduit sans

maturation préalable.

 

Un

cistron

est

l'ensemble

des

codons

qui

code

une protéine donnée.

des codons qui code une protéine donnée. Il existe, dans les mitochondries et les chloroplastes, des

Il existe, dans les mitochondries et les chloroplastes, des ARN polycistroniques, mais qui doivent subir une maturation préalable, avec une coupure physique de l'ARN entre les cistrons, avant que la traduction ne puisse avoir lieu. Dr. W. IRAQI HOUSSAINI

Bon à savoir :

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Les AA qui ne peuvent être synthétisés par l'organisme et doivent être apportés par l'alimentation sont appelés AA essentiels. Chez l'homme, ils sont au nombre de 8 (Leucine, Isoleucine, Lysine, Méthionine, Phénylalanine, Thréonine Tryptophane, Valine).

Les AA qui sont produits in vivo par le métabolisme des cellules sont appelés AA non essentiels.

Le cas de l'histidine est un peu particulier : Chez les enfants, il est considéré comme essentiel car ils ne peuvent pas le synthétiser (Les adultes peuvent le synthétiser et n'est donc pas considéré comme essentiel).

Dr. W. IRAQI HOUSSAINI

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