Gambar 2.5.

Membran eksternal terbuat dari bilayer fosfolipid dengan protein yang tertanam dalam
matriks lipid. Mitokondria mengandung system yang kompleks dari membran bagian dalam yang disebut
krista. Matriks gellike yang mengandung protein dalam jumlah besar mengisi ruang di dalam krista.
Beberapa enzim respirasi oksidatif terikat pada krista. Sebuah mitokondria memiliki mekanisme DNA dan
sintesis-proteinnya sendiri dan bereproduksi secara independen.
Retikulum endoplasma adalah sistem membran kompleks dan berbelit-belit yang mengarah dari
membran sel ke dalam sel. Retikulum endoplasma kasar mengandung ribosom pada permukaan bagian
dalam dan merupakan tempat sintesis protein dan modifikasi struktur protein setelah sintesis. Retikulum
endoplasma halus lebih terlibat dengan sintesis lipid.
Lisosom adalah partikel terikat-membran yang sangat kecil yang mengandung dan melepaskan
enzim pencernaan. Lisosom berkontribusi pada pencernaan nutrisi dan zat penyerang.
Peroksisom mirip dengan lisosom dalam strukturnya, tetapi tidak dalam fungsi. Peroxisomes
melakukan reaksi oksidatif yang menghasilkan hidrogen peroksida.
Glyoxysomes juga merupakan partikel terikat-membran yang sangat kecil yang mengandung
enzim-enzim siklus glioksilat.
Golgi tubuh adalah partikel yang sangat kecil yang terdiri dari agregat membran dan bertanggung
jawab untuk sekresi protein tertentu. Golgi tubuh adalah situs di mana protein dimodifikasi dengan
penambahan berbagai gula dalam proses yang disebut glikosilasi. Modifikasi seperti itu penting untuk
fungsi protein dalam tubuh.
Vakuola adalah organel yang terikat membran dengan kepadatan rendah dan bertanggung jawab
untuk pencernaan makanan, pengaturan osmotik, dan penyimpanan produk limbah. Vakuola dapat
menempati sebagian besar volume sel (hingga 90% dalam sel tumbuhan).

Gambar 2.5. Diagram mitokondria. Enzim pernafasan yang membuat ATP terletak di
permukaan membran bagian dalam dan krista, yang merupakan infold dari membran dalam.
(Dengan izin, dari J. G. Black, Microbiology Principles and Applications, 3d ed., 1996, p. 94.
This material is used by permission of John Wiley & Sons, Inc.)
 Kloroplas relatif besar, mengandung klorofil, organel hijau yang bertanggung jawab untuk
fotosintesis di eukariot fotosintesis, seperti ganggang dan sel tumbuhan. Setiap kloroplas mengandung
membran luar dan sejumlah besar membran bagian dalam yang disebut tilakoid. Molekul klorofil terkait
dengan tilakoid, yang memiliki struktur membran teratur dengan bilayers lipid. Kloroplas adalah unit
otonom yang mengandung DNA dan mekanisme penyintesis protein sendiri.
Organisme prokariotik dan eukariotik tertentu mengandung flagela — struktur panjang yang
berserabut yang melekat pada salah satu ujung sel dan bertanggung jawab untuk gerakan sel. Flagela
eukariotik mengandung dua serabut tengah yang dikelilingi oleh delapan belas serabut perifer, yang ada
di doblet. Serat berada dalam struktur tabung yang disebut mikrotubulus dan terdiri dari protein yang
disebut tubulin. Seluruh perakitan serat tertanam dalam matriks organik dan dikelilingi oleh membran.
Sitoskeleton (dalam sel eukariotik) mengacu pada filamen yang menyediakan kerangka internal
untuk mengatur aktivitas internal sel dan mengendalikan bentuknya. Filamen ini sangat penting dalam
gerakan sel, transduksi kekuatan mekanik menjadi respon biologis, dan pemisahan kromosom ke dalam
dua sel anak selama pembelahan sel. Ada tiga jenis serat: filamen aktin, filamen intermediet, dan
mikrotubulus.
Silia adalah struktur mirip flagellalike, tetapi banyak dan lebih pendek. Hanya satu kelompok
protozoa, yang disebut ciliata, mengandung silia. Spesies paramecium mengandung hampir 104 silia per
sel. Organisme bersilia bergerak jauh lebih cepat daripada organisme yang ber-flagela.
Ini melengkapi ringkasan struktur sel eukariotik kami. Sekarang mari kita mengalihkan perhatian
kita ke eukariota mikroskopis.
Jamur adalah heterotrof yang tersebar luas di alam. Sel jamur lebih besar dari sel bakteri, dan
struktur internal mereka yang khas, seperti nukleus dan vakuola, dapat dilihat dengan mudah dengan
mikroskop cahaya. Dua kelompok utama jamur adalah ragi dan kapang.
Ragi adalah sel tunggal berukuran kecil 5 hingga 10 mm. Sel-sel ragi biasanya berbentuk bulat,
silindris, atau oval. Ragi dapat berkembang biak dengan cara aseksual atau seksual. Reproduksi aseksual
adalah dengan tunas atau fisi. Dalam tunas, bentuk sel tunas kecil di sel, yang secara bertahap membesar
dan memisahkan dari sel induk. Reproduksi aseksual oleh fisi mirip dengan bakteri. Hanya beberapa jenis
ragi yang dapat berkembang biak dengan fisi. Dalam fisi, sel-sel tumbuh dengan ukuran tertentu dan
dibagi menjadi dua sel yang sama. Reproduksi seksual ragi melibatkan pembentukan zigot (sel diploid)
dari fusi dua sel haploid, masing-masing memiliki satu set kromosom. Inti sel diploid membagi beberapa
kali untuk membentuk ascospores. Setiap ascospore akhirnya menjadi sel haploid baru dan dapat
berkembang biak dengan tunas dan fisi. Siklus hidup dari sel ragi yang khas disajikan pada Gambar 2.6.
Klasifikasi ragi didasarkan pada mode reproduksi (misalnya, tunas atau fisi) dan persyaratan
nutrisi sel. Ragi yang paling banyak digunakan, Saccharomyces cerevisiae, digunakan dalam pembentukan
alkohol dalam kondisi anaerobik (misalnya, dalam pembuatan anggur, bir dan wiski) dan juga untuk
produksi ragi baker dalam kondisi aerobik.
Jamur adalah jamur berfilamen dan memiliki struktur miselium. Miselium adalah sistem tabung
bercabang yang mengandung sitoplasma seluler dengan banyak nuklei. Filamen tipis yang panjang pada
miselium disebut hifa. Cabang-cabang tertentu dari miselium dapat tumbuh di udara, dan spora aseksual
yang disebut konidia terbentuk pada cabang-cabang udara ini. Conidia memiliki struktur yang hampir
bulat dan sering berpigmen. Beberapa cetakan berkembang biak dengan cara seksual dan membentuk
spora seksual. Spora ini memberikan ketahanan terhadap panas, pembekuan,
 Gambar 2.6. Siklus pembelahan sel dari ragi yang khas, Saccharomyces
cerevisiae. (dengan izin, T. D. Brock, D. W. Smith, and M. T. Madigan, Biology of
Microorganisms, 4th ed., Pearson Education, Upper Saddle River, NJ, 1984, p. 80.)

pengeringan, dan beberapa agen kimia. Spora-spora jamur baik seksual maupun aseksual dapat
berkecambah dan membentuk hifa baru. Gambar 2.7 menggambarkan struktur dan reproduksi aseksual
dari cetakan.
Cetakan biasanya membentuk sel yang panjang dan bercabang tinggi dan mudah tumbuh pada
permukaan nutrisi yang lembab dan padat. Ukuran khas dari bentuk cetakan filament adalah 5 hingga 20
mm. Ketika ditanam dalam budaya terendam, jamur sering membentuk agregat sel dan pelet. Ukuran
khas pelet cetakan bervariasi antara 50 mm dan 1 mm, tergantung pada jenis cetakan dan kondisi
pertumbuhan. Pembentukan pelet dapat menyebabkan masalah transfer nutrisi (terutama oksigen) di
dalam pelet. Namun, pembentukan pelet mengurangi viskositas kaldu, yang dapat meningkatkan transfer
oksigen massal.
Berdasarkan cara mereka reproduksi seksual, jamur dikelompokkan dalam empat kelas.

1. Phycomycetes adalah jamur algalike; Namun, mereka tidak memiliki klorofil dan tidak dapat
berfotosintesis. Cetakan akuatik dan terestrial termasuk dalam kategori ini.

2. Ascomycetes membentuk spora seksual yang disebut ascospores, yang terkandung dalam kantung
(struktur kapsul). Beberapa jamur dari genera Neurospora dan Aspergillus dan ragi termasuk dalam
kategori ini.

3. Basidiomycetes bereproduksi dengan basidiospora, yang diperpanjang dari tangkai sel khusus yang
disebut basidia. Jamur adalah basidiomycetes.
 Gambar 2.7. Struktur dan reproduksi aseksual dari cetakan. (Dengan izin, dari T. D. Brock, K. M.
Brock, and D. M. Ward, Basic Microbiology with Applications, 3d ed., Pearson Education,
Upper Saddle River, NJ, 1986, p. 35.)

4. The deuteromycetes (Fungi imperfecti) tidak dapat berkembang biak dengan cara seksual. Hanya
aseksual yang mereproduksi cetakan yang termasuk dalam kategori ini. Beberapa jamur patogen,
seperti Trichophyton, yang menyebabkan kaki atlet, termasuk ke deuteromycetes.

Jamur digunakan untuk produksi asam sitrat (Aspergillus niger) dan banyak antibiotik, seperti penicillin
(Penicillium chrysogenum). Mould fermentasi membuat sebagian besar industri fermentasi.
Ganggang biasanya organisme uniseluler. Namun, beberapa struktur multiseluler seperti
tumbuhan hadir di perairan laut. Semua alga bersifat fotosintetik dan mengandung kloroplas, yang
biasanya memberi warna hijau pada organisme. Kloroplas adalah situs pigmen klorofil dan bertanggung
jawab untuk fotosintesis. Ukuran alga uniseluler khas adalah 10 hingga 30 mm. Ganggang multiseluler
kadang-kadang membentuk struktur filamen bercabang atau tidak bercabang. Beberapa ganggang
mengandung silika atau kalsium karbonat di dinding sel mereka. Diatom yang mengandung silika di
dinding sel mereka digunakan sebagai alat bantu filter dalam industri. Beberapa alga, seperti Chlorella,
Scenedesmus, Spirullina, dan Dunaliella, digunakan untuk pengolahan air limbah dengan produksi protein
sel tunggal secara simultan. Agen gelling tertentu seperti agar dan asam alginat diperoleh dari ganggang
laut dan rumput laut. Beberapa alga berwarna coklat atau merah karena keberadaan pigmen lainnya.
Protozoa adalah sel eukariotik uniseluler, motil, relatif besar (1 mm sampai 50 mm) yang tidak memiliki
dinding sel.
Protozoa biasanya memperoleh makanan dengan menelan organisme kecil lainnya, seperti
bakteri, atau partikel makanan lainnya. Protozoa biasanya tidak berinti dan bereproduksi dengan cara
seksual atau aseksual. Mereka diklasifikasikan berdasarkan gerakan mereka. Gerakan amuba oleh gerakan
ameboid, dimana sitoplasma sel mengalir ke depan untuk membentuk pseudopodium (kaki palsu), dan
sel sel lainnya mengalir menuju lobus ini. Flagelata
 Gambar 2.8. Protozoa. (a) Seekor amuba, Amoeba proteus. Pembesaran, 125X. (B) A ciliata,
Blepharisma. Pembesaran, 120X. (c) Sebuah flagellate, Dunaliella. Pembesaran, 1900X. (Dengan izin, dari
T. D. Brock, K. M. Brock, and D. M. Ward, Basic Microbiology with Applications, 3d ed., Pearson
Education, Upper Saddle River, NJ, 1986, p. 40.)

bergerak menggunakan flagela mereka. Trypanosomes bergerak dengan flagella dan menyebabkan
sejumlah penyakit pada manusia. Ciliata bergerak dengan gerakan sejumlah besar pelengkap kecil pada
permukaan sel yang disebut silia. Sporozoans adalah nonmotile dan mengandung anggota yang
merupakan parasit manusia dan hewan. Protozoa ini tidak menelan partikel makanan, tetapi menyerap
komponen makanan yang larut melalui membrannya. Protozoa menyebabkan beberapa penyakit,
seperti malaria dan disentri. Protozoa mungkin memiliki peran menguntungkan dalam menghilangkan
bakteri dari air limbah dalam proses pengolahan air limbah biologis dan membantu untuk memperoleh
limbah bersih. Gambar mikroskopis dari beberapa protozoa disajikan pada Gambar 2.8.

2.2. KONSTRUKSI SEL

2.2.1. pengantar

Sel hidup terdiri dari senyawa polimerik berberat molekul tinggi seperti protein, asam nukleat,
polisakarida, lipid, dan bahan penyimpanan lainnya (lemak, polihidroksibutirat, glikogen). Biopolimer ini
merupakan elemen struktural utama dari kehidupan