Contenidos

Introducción al uso de las técnicas multivariantes

Clasificación
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Análisis Multivariante con R

José Antonio Palazón Palazón Ferrando
y
José Francisco Calvo Sendı́n

Depto. Ecologı́a e Hidrologı́a

palazon@um.es jfcalvo@um.es
Universidad de Murcia

Taller Caldum, 22 de Julio de 2004

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasificación
Ordenación
Análisis Multivariante con R

1 Introducción al uso de las técnicas multivariantes

Observaciones, objetividad
Semejanza
2 Clasificación
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación jerárquica
3 Ordenación
4 Análisis Multivariante con R
Funciones interesantes
Representación gráfica y problemas múltivariantes
Clasificación con R
Ordenación con R

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Contenidos
1 Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Semejanza
2 Clasificación
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación jerárquica
3 Ordenación
4 Análisis Multivariante con R
Funciones interesantes
Representación gráfica y problemas múltivariantes
Clasificación con R
Ordenación con R
J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R
 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

De la observación

Observaciones: objetos de estudio

Medidas: Procedimiento (tipos de variables)
Objetividad: Regla de repetibilidad
Sistema de referencia objetivo para los casos observados y
por tanto puedo compararlos

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

De la observación

Observaciones: objetos de estudio

Medidas: Procedimiento (tipos de variables)
Objetividad: Regla de repetibilidad
Sistema de referencia objetivo para los casos observados y
por tanto puedo compararlos

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

De la observación

Observaciones: objetos de estudio

Medidas: Procedimiento (tipos de variables)
Objetividad: Regla de repetibilidad
Sistema de referencia objetivo para los casos observados y
por tanto puedo compararlos

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

De la observación

Observaciones: objetos de estudio

Medidas: Procedimiento (tipos de variables)
Objetividad: Regla de repetibilidad
Sistema de referencia objetivo para los casos observados y
por tanto puedo compararlos

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

De la observación

Observaciones: objetos de estudio

Medidas: Procedimiento (tipos de variables)
Objetividad: Regla de repetibilidad
Sistema de referencia objetivo para los casos observados y
por tanto puedo compararlos

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

De la teorı́a

Conceptos: abstacción
Realidad compleja: Multiples variables
Procesos y patrones

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

De la teorı́a

Conceptos: abstacción
Realidad compleja: Multiples variables
Procesos y patrones

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

De la teorı́a

Conceptos: abstacción
Realidad compleja: Multiples variables
Procesos y patrones

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Dado un conjunto de datos ...

Arb Herb
1 18 1
2 14 3
3 10 2
4 5 4
5 2 5
6 1 3

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

. . . ¿cuál es más real?

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

. . . ¿cuál es más real?

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

. . . ¿cuál es más real?

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Principales problemas a resolver con técnicas

multivariantes

Los datos La clasificación La ordenación



 

 

 

 

 

   

 

   



   

  
  

   

  
  

  
  

    
    

    

    

    
    

    

   

    

   

   

   

   

     

   



   

   

   

 

 

   


   

   

   

   

   

   

   

   

   
   

   
   

   

   

   

   

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Principales problemas a resolver con técnicas

multivariantes

Los datos La clasificación La ordenación



 

 

 

 

 

   

 

   



   

  
  

   

  
  

  
  

    
    

    

    

    
    

    

   

    

   

   

   

   

     

   



   

   

   

 

 

   


   

   

   

   

   

   

   

   

   
   

   
   

   

   

   

   

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Principales problemas a resolver con técnicas

multivariantes

Los datos La clasificación La ordenación



 

 

 

 

 

   

 

   



   

  
  

   

  
  

  
  

    
    

    

    

    
    

    

   

    

   

   

   

   

     

   



   

   

   

 

 

   


   

   

   

   

   

   

   

   

   
   

   
   

   

   

   

   

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

¿A quién me parezco más?

Tres mejor que dos...

170 84 170 74
176 80 176 80
180 70 180 70

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

¿A quién me parezco más?

Tres mejor que dos...

170 84 170 74
176 80 176 80
180 70 180 70

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Las cosas se complican en la realidad . . .

. . . cuando el número de variables > 3

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

¿Qué variables puedo analizar?

cualitativas
cuantitativas
una sóla naturaleza u origen
más de un origen o naturaleza
mixtas

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Datos, datos, datos

Ecologı́a metodológica y cuantitativa

Censos de la población murciana
Datos biométricos de alumnos de Ecologı́a metodológica
y cuantitativa (2003–04)
Hábitos y dietas de rapaces

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Índices, similaridades y distancias

Datos de presencia–ausencia
Objeto j
1 0
Objeto i 1 a b a+b
0 c d c +d
a+c b+d a+b+c +d

a a+d
IJ = ICS =
a+b+c a+b+c +d
Transformación de similaridad a distancia euclı́dea
p p
d J = 1 − IJ dCS = 1 − ICS
J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R
 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Clasificación
Semejanza
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Distancia entre dos puntos

q
y d(i, j) = (xi − xj )2 + (yi − yj )2
yj

,j)
d(i

yi
v
u p
uX
xi xj
x d(i, j) = t (xi,k − xj,k )2
k=1

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Contenidos
1 Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Semejanza
2 Clasificación
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación jerárquica
3 Ordenación
4 Análisis Multivariante con R
Funciones interesantes
Representación gráfica y problemas múltivariantes
Clasificación con R
Ordenación con R
J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R
 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Tipos de clasificación

Automática
Supervisada
Particiones
Jerárquicas
Aglomerativas
Divisivas

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

k − means: El procedimiento
1. Seleccionar el número de grupos que ha de tener la partición.
2. Elegir de forma aleatoria tantos lı́deres como grupos.
3. Calcular la distancia de todos los objetos a clasificar a cada uno de
los lı́deres.
4. Asignar cada objeto a su lı́der más próximo.
5. Si no se han realizado cambios en la asignación a los lı́deres, o se ha
pasado por este punto más del número fijado de veces ir al paso 8.
6. Cacular el centroide de cada grupo y declararlo nuevo lı́der del
grupo.
7. Ir al paso 3.
8. La clasificación ha terminado: cada objeto pertenece al grupo al
que ha sido asignado.
J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R
 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

k − means: El procedimiento
1. Seleccionar el número de grupos que ha de tener la partición.
2. Elegir de forma aleatoria tantos lı́deres como grupos.
3. Calcular la distancia de todos los objetos a clasificar a cada uno de
los lı́deres.
4. Asignar cada objeto a su lı́der más próximo.
5. Si no se han realizado cambios en la asignación a los lı́deres, o se ha
pasado por este punto más del número fijado de veces ir al paso 8.
6. Cacular el centroide de cada grupo y declararlo nuevo lı́der del
grupo.
7. Ir al paso 3.
8. La clasificación ha terminado: cada objeto pertenece al grupo al
que ha sido asignado.
J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R
 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

k − means: El procedimiento
1. Seleccionar el número de grupos que ha de tener la partición.
2. Elegir de forma aleatoria tantos lı́deres como grupos.
3. Calcular la distancia de todos los objetos a clasificar a cada uno de
los lı́deres.
4. Asignar cada objeto a su lı́der más próximo.
5. Si no se han realizado cambios en la asignación a los lı́deres, o se ha
pasado por este punto más del número fijado de veces ir al paso 8.
6. Cacular el centroide de cada grupo y declararlo nuevo lı́der del
grupo.
7. Ir al paso 3.
8. La clasificación ha terminado: cada objeto pertenece al grupo al
que ha sido asignado.
J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R
 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

k − means: El procedimiento
1. Seleccionar el número de grupos que ha de tener la partición.
2. Elegir de forma aleatoria tantos lı́deres como grupos.
3. Calcular la distancia de todos los objetos a clasificar a cada uno de
los lı́deres.
4. Asignar cada objeto a su lı́der más próximo.
5. Si no se han realizado cambios en la asignación a los lı́deres, o se ha
pasado por este punto más del número fijado de veces ir al paso 8.
6. Cacular el centroide de cada grupo y declararlo nuevo lı́der del
grupo.
7. Ir al paso 3.
8. La clasificación ha terminado: cada objeto pertenece al grupo al
que ha sido asignado.
J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R
 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

k − means: El procedimiento
1. Seleccionar el número de grupos que ha de tener la partición.
2. Elegir de forma aleatoria tantos lı́deres como grupos.
3. Calcular la distancia de todos los objetos a clasificar a cada uno de
los lı́deres.
4. Asignar cada objeto a su lı́der más próximo.
5. Si no se han realizado cambios en la asignación a los lı́deres, o se ha
pasado por este punto más del número fijado de veces ir al paso 8.
6. Cacular el centroide de cada grupo y declararlo nuevo lı́der del
grupo.
7. Ir al paso 3.
8. La clasificación ha terminado: cada objeto pertenece al grupo al
que ha sido asignado.
J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R
 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

k − means: El procedimiento
1. Seleccionar el número de grupos que ha de tener la partición.
2. Elegir de forma aleatoria tantos lı́deres como grupos.
3. Calcular la distancia de todos los objetos a clasificar a cada uno de
los lı́deres.
4. Asignar cada objeto a su lı́der más próximo.
5. Si no se han realizado cambios en la asignación a los lı́deres, o se ha
pasado por este punto más del número fijado de veces ir al paso 8.
6. Cacular el centroide de cada grupo y declararlo nuevo lı́der del
grupo.
7. Ir al paso 3.
8. La clasificación ha terminado: cada objeto pertenece al grupo al
que ha sido asignado.
J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R
 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

k − means: El procedimiento
1. Seleccionar el número de grupos que ha de tener la partición.
2. Elegir de forma aleatoria tantos lı́deres como grupos.
3. Calcular la distancia de todos los objetos a clasificar a cada uno de
los lı́deres.
4. Asignar cada objeto a su lı́der más próximo.
5. Si no se han realizado cambios en la asignación a los lı́deres, o se ha
pasado por este punto más del número fijado de veces ir al paso 8.
6. Cacular el centroide de cada grupo y declararlo nuevo lı́der del
grupo.
7. Ir al paso 3.
8. La clasificación ha terminado: cada objeto pertenece al grupo al
que ha sido asignado.
J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R
 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

k − means: El procedimiento
1. Seleccionar el número de grupos que ha de tener la partición.
2. Elegir de forma aleatoria tantos lı́deres como grupos.
3. Calcular la distancia de todos los objetos a clasificar a cada uno de
los lı́deres.
4. Asignar cada objeto a su lı́der más próximo.
5. Si no se han realizado cambios en la asignación a los lı́deres, o se ha
pasado por este punto más del número fijado de veces ir al paso 8.
6. Cacular el centroide de cada grupo y declararlo nuevo lı́der del
grupo.
7. Ir al paso 3.
8. La clasificación ha terminado: cada objeto pertenece al grupo al
que ha sido asignado.
J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R
 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Las observaciones

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Los lideres

1 2

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

La primera partición

1 2

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Los centroides de la 1a partición

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

La segunda partición

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Los centroides de la 2a partición

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

La tercera partición

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Los centroides de la 3a partición

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

La cuarta partición

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Los centroides de la 4a partición

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

La partición definitiva

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Clasificación mediante el criterio de

agregación del vecino más próximo

6.0
1 6.0
2
5.0 5.0

4.0 4.0

3.0 3.0

2.0 2.0

1.0 1.0

0.0 0.0
0.0

1.0

2.0

3.0

4.0

5.0

6.0

7.0

8.0

0.0

1.0

2.0

3.0

4.0

5.0

6.0

7.0

8.0
6.0
3 6.0
4
5.0 5.0

4.0 4.0

3.0 3.0

2.0 2.0

1.0 1.0

0.0 0.0
0.0

1.0

2.0

3.0

4.0

5.0

6.0

7.0

8.0

0.0

1.0

2.0

3.0

4.0

5.0

6.0

7.0

8.0

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Clasificación mediante el criterio de agregación del

vecino más próximo

1 2 3 4 5
1 0.00
2 1.00 0.00
3 2.83 2.24 0.00
4 7.07 6.40 4.24 0.00
5 7.62 7.28 5.10 2.83 0.00

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Clasificación mediante el criterio de agregación del

vecino más próximo

1 2 3 4 5
1 0.00
2 1.00 0.00
3 2.83 2.24 0.00
4 7.07 6.40 4.24 0.00
5 7.62 7.28 5.10 2.83 0.00

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Criterios de agregación

A
B

a
b

c
C

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Clasificación mediante el criterio de agregación del

vecino más próximo

1,2 3 4 5
1,2 0.00
3 2.24 0.00
4 6.40 4.24 0.00
5 7.28 5.10 2.83 0.00

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Clasificación mediante el criterio de agregación del

vecino más próximo

1,2 3 4 5
1,2 0.00
3 2.24 0.00
4 6.40 4.24 0.00
5 7.28 5.10 2.83 0.00

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Clasificación mediante el criterio de agregación del

vecino más próximo

1,2,3 4 5
1,2,3 0.00
4 4.24 0.00
5 5.10 2.83 0.00

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Clasificación mediante el criterio de agregación del

vecino más próximo

1,2,3 4 5
1,2,3 0.00
4 4.24 0.00
5 5.10 2.83 0.00

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Clasificación mediante el criterio de agregación del

vecino más próximo

1,2,3 4,5
1,2,3 0.00
4,5 4.24 0.00

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación
Clasificación jerárquica
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Criterios de agregación

1 2
Distancia

Distancia
5.00 5.00

4.00 4.00

3.00 3.00

2.00 2.00

1.00 1.00

0.00 0.00

1 2 3 4 5 1 2 3 4 5

Objeto Objeto

4
Distancia

Distancia
5.00 3 5.00

4.00 4.00

3.00 3.00

2.00 2.00

1.00 1.00

0.00 0.00

1 2 3 4 5 1 2 3 4 5

Objeto Objeto

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasificación
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Contenidos
1 Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Semejanza
2 Clasificación
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación jerárquica
3 Ordenación
4 Análisis Multivariante con R
Funciones interesantes
Representación gráfica y problemas múltivariantes
Clasificación con R
Ordenación con R
J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R
 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasificación
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Técnicas de ordenación

Análisis de componentes principales

Análisis de coordenadas principales
Análisis de correspondencias binarias
Análisis de correspondencias múltiples
Análisis de correspondencias “difuso”
Análisis de correspondencias sin tendencia
Análisis de correspondencias canónicos
Análisis factorial múltiple
Análisis RLQ
Escalamientos multidimensionales
J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R
 Contenidos
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Clasificación
Ordenación
Análisis Multivariante con R

Resultado general de un análisis de ordenación

Matriz de datos Matriz transformada

Análisis

nxp n x p’

Siendo p ≥ p 0

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Funciones interesantes
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Representación gráfica y problemas múltivariantes
Clasificación
Clasificación con R
Ordenación
Ordenación con R
Análisis Multivariante con R

Contenidos
1 Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Observaciones, objetividad
Semejanza
2 Clasificación
Clasifiación no jerárquica k − means
Clasificación jerárquica
3 Ordenación
4 Análisis Multivariante con R
Funciones interesantes
Representación gráfica y problemas múltivariantes
Clasificación con R
Ordenación con R
J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R
 Contenidos
Funciones interesantes
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Representación gráfica y problemas múltivariantes
Clasificación
Clasificación con R
Ordenación
Ordenación con R
Análisis Multivariante con R

¿Donde localizo las funciones?

Paquete mva
Encontramos muchas (27) librerı́as con funciones para
análisis multivariante:
ade4 amap cclust culster CoCoAn DAAG
fpc gclus hier.part knncat knnTree multidim
multiv vnormtest mvpart mvtnorm norm pan
pcurve prabclus princurve rpart sca tree
vegan
xgobi scatterplot3d

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Funciones interesantes
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Representación gráfica y problemas múltivariantes
Clasificación
Clasificación con R
Ordenación
Ordenación con R
Análisis Multivariante con R

Contributed Packages en
http://cran.at.r-project.org/

Número total: 366

Relacionadas con técnicas multivariantes: 27
Proporción: 7.5 %
ADE4 231 items (60 ficheros de datos): 171 funciones

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Funciones interesantes
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Representación gráfica y problemas múltivariantes
Clasificación
Clasificación con R
Ordenación
Ordenación con R
Análisis Multivariante con R

Solo ante plot()

Una figura se inicia con plot()

Tenemos points(), lines(), segments(), rect(),
arrows(), text(), abline(), . . .

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Funciones interesantes
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Representación gráfica y problemas múltivariantes
Clasificación
Clasificación con R
Ordenación
Ordenación con R
Análisis Multivariante con R

Funciones relevantes

kmeans()
dist()
hclust()
cov()
cor()
scale()
dist()
table()
cutree()

J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R

 Contenidos
Funciones interesantes
Introducción al uso de las técnicas multivariantes
Representación gráfica y problemas múltivariantes
Clasificación
Clasificación con R
Ordenación
Ordenación con R
Análisis Multivariante con R

Funciones relevantes

cov()
cor()
scale()
acp()
acb()
cmdscale()
mca()
biplot()
dibujaacp()
dibujaacb()
J.A. Palazón y J.F. Calvo Análisis Multivariante con R