2018

ÁCIDOS
NUCLEICOS I
- ESTRUCTURA -

Mc Frank Medina Villalobos

 ÁCIDOS NUCLEICOS

• Los ácidos nucleicos

participan en el
almacenamiento,
transmisión y
expresión de la
información genética. Se diferencian de las proteínas,
esencialmente, en su mayor
contenido de fósforo (10%) y en la
ausencia total de azufre.
• La información contenida en los ácidos nucleicos
es transcrita y luego traducida a las proteínas.
Las proteínas son las moléculas que finalmente
ejecutarán las "instrucciones" codificadas en los
ácidos nucleicos.
 I. NUCLEÓTIDOS:
MONÓMEROS DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS

Están formados por:

• Una base
nitrogenada
• Un azúcar
• Un ácido fosfórico
La unión de estas tres
moléculas en relación
1:1:1
ESTRUCTURA DE UN NUCLEÓTIDO
 1. ÁCIDO FOSFÓRICO
• Le brinda el carácter ácido y polianiónico.
• Se encuentra formando complejos con iones Mg++
 2. PENTOSA
• Monosacárido esqueleto de los nucleótidos.
LAS PENTOSAS (MONOSACÁRIDOS)
LAS PENTOSAS (MONOSACÁRIDOS)
Diferencia ente Ribosa y Desoxirribosa
RIBOSA DESOXIRRIBOSA

2 OH: Carbono diferencial entre las pentosas.

Carbono reactivo para ataques nucleofílicos.
Participa en la hidrólisis alcalina de los ARN.
 3. BASE NITROGENADA
• Se encargan de darle la especificidad y el carácter
básico a los ácidos nucleicos. Derivan del anillo
de pirimidina o del doble anillo de purina.
En las bases nitrogenadas
encontramos los radicales:

«OXO» «AMINO»
6 – amino purina 2 - amino - 6 oxi purina
2- oxi- 4 amino pirimidina 2 ,4 dioxi pirimidina 5- metil -2 ,4 dioxi pirimidina
Sustituyentes en cada base nitrogenada

- NH2 =O - CH3
A 6

C 4 2

U 2y4

G 2 6

T 2y4 5
Bases púricas derivadas
Tautomería de las bases nitrogenadas
• La tautomería o isomería dinámica consiste en
la migración de un átomo de hidrógeno unido
a un átomo de O , C o N a otro átomo
adyacente.

TAUTOMERÍA CETO-ENÓLICA TAUTOMERÍA IMINA-AMINA

PRIMARIA
• En las bases nitrogenadas, la migración del H
tiene lugar en el N nuclear hacia otro átomo
extranuclear y viceversa.
TAUTOMERÍA IMINA-AMINA
TAUTOMERÍA LACTAMA-LACTIMA
PRIMARIA

OXO SUSTITUCIÓN EN LAS AMINO SUSTITUCIÓN EN

BASES LAS BASES
• Las bases nitrogenadas presentan formas tautoméricas con
sustituyentes hidroxilados o aminados.

a) Tautomería ceto-enólica

b) Tautomería amino-imino
Formas tautoméricas de las bases nitrogenadas (I)
Formas tautoméricas de las bases nitrogenadas (II)
Dipolos en las bases nitrogenadas
APAREAMIENTRO ENTRE UN ACEPTOR – UN DADOR
ENLACE PUENTE DE HIDRÓGENO

X H Y

ELECTRONEGATIVOS: N u O
¿De qué depende la cantidad de enlaces que se
forman entre las bases nitrogenadas?
NUCLEÓSIDOS
Estructura y nomenclatura
ENLACES:
C1 - N1
(PIRIMIDINA)
C1 - N9
(PURINA)
NUCLEOSIDO: INOSINA
NUCLEÓTIDOS
Estructura y nomenclatura
 ALMACENAMIENTO DE ENERGÍA
FUNCION DE • Llevan la energía química en sus
LOS enlaces fosfo-anhidros.
NUCLEOTIDOS Ejm: ATP, GTP.
 ACTIVADORES ENZIMÁTICOS
FUNCION DE
LOS • Se combinan con otros grupos
NUCLEOTIDOS para formar coenzimas. Ejm:
CoA, NAD+, FAD
 FUNCION DE SEGUNDOS MENSAJEROS
LOS • Participan como moléculas de
NUCLEOTIDOS señalización. Ejm: AMPc, GMPc
 ALGUNOS NUCLEÓTIDOS CELULARES

AMPc ATP Coenzima

 POLINUCLEÓTIDOS

Se forman al
unirse los
nucleótidos
en cadena
mediante
enlaces
fosfodiéster.
 DNA
(ÁCIDO
DESOXIRRIBONUCLEICO)
 HISTORIA (1)
• Friedrich Miescher aisló en 1869 del esperma de salmón y de
pus de heridas abiertas una sustancia a la que llamó nucleína,
por encontrarse en el núcleo. Años más tarde, se fragmentó esta
nucleína, y se separó un componente proteico y un grupo
prostético, este último, por ser ácido, se le llamó ácido nucleico.
 HISTORIA (2)
• El experimento de
Frederick Griffith,
llevado a cabo en
1928, fue unos de los
primeros
experimentos que
demostró que las
bacterias eran
capaces de transferir
información genética
mediante un proceso
llamado
transformación.
 HISTORIA (3)
• Durante 1909-1929 Phoebus Levene determina la
estructura molecular y modo de polimerización de los
nucleótidos en el ADN.
• Levene formula la hipótesis incorrecta que el ADN
consiste en tetra-nucleótidos CATG repetidos
(…CATGCATGCATGCATG…).
 HISTORIA (4)
• Erwin Chargaff descubre
en 1950 que los cuatro
nucleótidos no están
presentes en los ácidos
nucleicos de diversos
organismos en la misma
proporción, como proponía
Levene. También descubre
que parecen valer ciertas
reglas generales (ahora
llamada reglas de Chargaff).
 HISTORIA (5)
• Linus Pauling (1951) había
demostrado que las cadenas
de aminoácidos que
componen las proteínas
están dispuestas a menudo
en forma de una hélice por la
presencia de puentes de
hidrógeno.
• Pauling había sugerido que
la estructura del ADN podía
ser semejante a la hélice
que presentaban las
proteínas.
 HISTORIA (5)
• Watson y Crick (1951)
construyen un modelo
de ADN. El mismo
consistía en tres
hélices con los
fosfatos hacia dentro y
sus cargas negativas
neutralizadas por
iones Mg2+
Francis Harry Compton Crick (1916–2004) y James Dewey
Watson (1928).
 HISTORIA (6)
• En 1953,
Rosalind
Franklin y
Maurice H.
Wilkins
trabajando sobre
la difracción de
rayos X, describen
la estructura DE
DOBLE HELICE
del ADN.
Imagen del ADN obtenida
por Rosalind Franklin
mediante difracción de rayos
Fotografía 51
X en 1952 y que fue una
evidencia fundamental, para
identificar la estructura del
ADN. La fotografía fue tomada
por Franklin mientras
trabajaba en el King's College
de Londres.
Maurice Wilkins mostró la
fotografía a James D.
Watson sin que Franklin lo
supiera y se convirtió en la
prueba decisiva que llevó a la
confirmación de la
estructura doble helicoidal del
ADN que había sido postulada
a lo largo de 1953 en una serie
de cinco artículos publicados
en la revista Nature.
 HISTORIA (7)

• 1953 Watson y
Crick
formularon su
modelo de la
doble hélice del
DNA: «en forma
de escalera de
caracol»
Watson, Crick y Wilkins reciben el Nobel de Medicina en 1962. La
gran ausente en la ceremonia: Rosalind Franklin quien ya había
fallecido de cáncer de ovario.
 ESTRUCTURA PRIMARIA
• Se trata de la
secuencia de
desoxirribonucleó-
tidos de una de las
cadenas. La
información genética
está contenida en el
orden exacto de los
nucleótidos.
• Enlace responsable:
Fosfodiéster
Representaciones esquemáticas
 ESTRUCTURA SECUNDARIA
(LA DOBLE HÉLICE DE WATSON Y CRICK )

• Permite explicar el almacenamiento de la

información genética y el mecanismo de duplicación
del ADN.
¿Qué ventaja tiene el ADN de ser
doble hélice?
• Fue postulada por Watson y Crick, basándose en:
– A) La difracción de rayos X que habían realizado Franklin
y Wilkins.
• Fue postulada por Watson y Crick, basándose en:
– B) La equivalencia de bases de Erwin Chargaff:

“En prácticamente todas las

especies, el contenido de A se
aproxima a T, y el contenido de G
al de C”
Relación entre purinas y pirimidinas

“La suma de
adeninas más
guaninas es igual a
la suma de timinas
más citosinas”
 Razón de asimetría

• Esta razón no es constante entre especies.

• No se aproxima a la unidad.
• En eucariotas es mayor que 1 y en procariotas y virus es
menor o mayor que 1 (variable).
a) Es una doble
cadena que se
enrolla en
disposición
helicoidal. Puede
ser dextrógira
(principalmente) o
levógira, según el
tipo de ADN.
b) Las dos cadenas son antiparalelas (polaridad opuesta).
pues el extremo 3´de una se enfrenta al extremo 5´de la otra.
c) Las bases
nitrogenadas son
hidrófobas
(compuestos a
aromáticos) por lo
que quedan en el
interior de la hélice,
mientras que el ácido
fosfórico y la
desoxirribosa son
hidrófilas ( hacia el
exterior )
d) Ambas cadenas son complementarias: la adenina se empareja
con la timina con dos enlaces por puente de hidrógeno (y
atracciones hidrofóbicas) y la citosina con la guanina con tres.

G C
A T
• El 1% de los enlaces entre la adenina y timina
del ADN son de tipo Hoogsteen en lugar de
tipo Watson-Crick.

Cualquier emparejamiento de bases distintos de los de Watson y Crick son

llamados genéricamente de Hoogsteen.
Se pueden obtener girando 180° la purina respecto al enlace glucosídico y
dejando la pirimidina igual.
Tipos de enlaces presentes en el ADN - B
Posición de la base nitrogenada con
respecto a la pentosa
 ADN TIPO B
Es el modelo propuesto por Watson y
Crick sobre la estructura secundaria del
ADN y es la forma predominante en las
células.
Es una doble hélice dextrógira de
2,37 nm de diámetro.
Como resultado de la asimetría de
cada par de nucleótidos presenta
surcos de tamaño diferente, y como
cada par de bases (perpendiculares
al eje del hélice) gira unos 34,6º
respecto al anterior, estos surcos se
van repitiendo.
No cabe agua en el interior.
• Se van alternando así dos tipos de surcos: un
surco mayor donde las bases están más
expuestas y pueden ser reconocidas, y un
surco menor.
• Por cada vuelta completa o paso de rosca de la
hélice hay el mismo número de pares de
bases, que son 10,4. La distancia entre pares
de bases es de 0,34 nm y la vuelta completa
mide 3,54 nm.
• El ángulo entre los enlaces glucosídicos es de
120° (para el estrecho y 240° para el amplio). El
ángulo estrecho entre los monosacáridos en un
borde de los pares de bases generan un surco
menor y el amplio en el otro borde generan un
surco mayor.

120°
El ADN tiene enrrollamiento plectonémico
La mayoría de
los factores de
transcripción se
unen al SURCO
MAYOR del ADN
 EN RESUMEN:
EL ADN : PORQUE …
ES BICATENARIO Carece de azúcar con
(ADN forma B) extremo 2 OH.
Posee sus bases
ES DEXTRÓGIRO nitrogenadas internas en
posición anti.

POSEE SURCO El ángulo en el enlace N

MAYOR Y MENOR glucosídico es de 120°.
 VARIACIONES EN LA
ESTRUCTURA DEL ADN
• VARIACIONES BICATENARIAS
• VARIACIONES LOCALES
• La molécula de ADN no
es una estructura
estática, sino flexible y
dinámica. Gracias a la
capacidad de rotación
alrededor de los enlaces
de los nucleótidos, el
ADN puede adoptar in
vivo diversas formas,
distintas de la forma B
de Watson y Crick.
 I. VARIANTES BICATENARIAS
• Existen otras formas estructurales diferentes a la B-DNA, en las que se
mantienen las características básicas de ésta (complementariedad,
antiparalelismo, helicidad, etc.), pero con algunas diferencias.
• ADN-A.
• Se forma a partir de la forma B
por deshidratación.
• Presenta 11 pares de bases por
vuelta.
• Es más gruesa y corta de modo
que el surco mayor es más
profundo y menos accesible y
en el interior de la doble hélice
cabe agua.
• Las bases no son
perpendiculares al eje de la
hélice.
• La forma A no se ha
encontrado para el DNA
bajo condiciones
fisiológicas (es un
ejemplo de la
flexibilidad de la
molécula)
• Su estudio es de interés
por ser la que adopta el
RNA cuando posee
regiones bicatenarias,
así como en los
híbridos DNA:RNA.
• ADN-Z.
• La forman secuencias que alternan
purinas y pirimidinas (ej: poli d (GC)
con poli d (CG)).
• Es levógiro o sinistrorso.
• Los fosfatos se sitúan en zig-zag.
• Presenta 12 pares de bases por giro.
• Su hélice es más estrecha y más
larga.
• En su superficie forma un solo
surco, profundo (correspondiente a
la posición del surco menor).
• En las formas A y B todas las bases nitrogenadas se
orientan alejadas del anillo de pentosa, en la llamada
conformación anti, mientras que en Z-DNA sólo lo
hacen las pirimidinas; las purinas tienden a situarse
sobre la pentosa (conformación sin).
• La función del DNA
– Z parece estar
relacionada con el
control de la
expresión génica y
con la
recombinación, a
través de sus
efectos sobre el
superenrollamiento.
 II. VARIANTES LOCALES
A) PALÍNDROMOS
• Regiones de un DNA cuya secuencia es la
misma en ambas hebras.
 Palíndromos interrumpidos
Cuando una pequeña región del ácido nucleico separa las
dos mitades del palíndromo

Las secuencias palindrómicas son autocomplementarias

Consecuencias estructurales de los palíndromos
La existencia de palíndromos, por ser secuencias
autocomplementarias, puede afectar de forma importante a la
estructura secundaria.
B) SECUENCIAS REPETIDAS
• Aparecen con una gran frecuencia en el
genoma, tanto en posiciones contiguas o
adyacentes (repeticiones en tándem) como
separadas por un número elevado de pares de
bases (repeticiones dispersas).
• Ejemplo: telómeros de los cromosomas humanos,
en los que el hexanucleótido (TTAGGG) se repite
miles de veces.
 Importancia de variantes locales:
palíndromos y secuencias repetidas
• a) Son dianas de las enzimas de restricción
(herramientas experimentales para escindir
ácidos nucleicos en la tecnología del DNA
recombinante);
• b) intervienen en la regulación de la expresión
génica, pues son puntos de unión de los factores
de transcripción, y
• c) generan estructuras secundarias peculiares en
• DNA y RNA (horquillas y cruciformes)
C) ADN TRIPLE HÉLICE
• Se trata de una estructura poco habitual, formada por 3
hebras: una triple hélice, también llamada tríplex o tríplice.
• Se forma en regiones ricas en pirimidinas en una hebra
(secuencia (CT)n) y ricas en purinas (secuencia (AG)n) en la
hebra complementaria.
Es posible obtener tramos de triple hélice intercalando oligonucleótidos
cortos constituidos solamente por pirimidinas (timinas y citosinas) en
el surco mayor de una doble hélice.
D) ADN CUADRÚPLEX
• Formadas por secuencias ricas en guanina
alrededor de un ión ubicadas en los telómeros.
Estabilizan los telómeros.

Cuartetos de
guanina
 TIPOS DE ADN

EL ADN en los seres vivos siempre es bicatenario

 GENOMA HUMANO
 Término que se utiliza para describir la información
genética de las células humanas.
 Tamaño: 3200 Mb (megabases) ;es decir,3200 millones
de pares de bases.
 Se piensa que la cifra total de genes del genoma
humano oscila entre 30 000 y 35 000.
 Comprende: genoma nuclear y genoma mitocondrial.
 El genoma nuclear está distribuido entre 24 tipos
distintos de moléculas de DNA lineal de doble cadena,
cada una de las cuales tienes histonas y otras proteínas
no histonas enlazadas a ellas para formar un
cromosoma.
¿QUÉ PORCENTAJE DE NUESTRO ADN SON GENES?
 CODIFICANTE
DNA de copia * Secuencias estructurales (EXONES)
- Se transcriben(exclusivamente en
única, simple o no RNA) o se transcriben y traducen(en
repetitivo un mRNA que da lugar a una proteina)
* Secuencias reguladoras
- Controla la transcripción
DNA repetitivo * Familias génicas clásicas o
conservadas, con genes repetidos en
tándem
- Alto grado de homología(copias
prácticamente idénticas).
AGRUPADO -Se expresan todas.
-Ejem: Histonas,rRNAs.
* Familias multigénicas agrupadas
-Menor homología (variantes,
pseudogenes,genes truncados,
fragmentos de genes).
- Se expresan algunas.
- Ejem: globinas.
* Familias multigénicas con genes
dispersos
- Número pequeño de repeticiones
DISPERSADO repartidos por todo el genoma.
-Genes que codifican proteínas de
funciones diversas.
NO CODIFICANTE
* DNA intragénico (INTRONES)
- Intercalado entre genes.
- Se transcriben pero no se traducen.
*DNA intergénico
-Separa los genes.
-Nunca se transcriben ni traduce.
Altamente repetitivo:
- Agrupado en regiones heterocrómaticas.
- Repeticiones en tándem(DNA
satélites)  en torno al centrómero, en
los telómeros.
Moderadamente repetitivos:
- Disperso por todo el genoma.
* Bloques dispersos de repeticiones en
tándem (minisatélites y microsatélites)
* Repeticiones dispersas(SINE,LINE).
TIPOS FUNCIONALES DE DNA
DISTRIBUCION DEL ADN EN EL GENOMA
HUMANO
Escala del
genoma
Humano
 RNA
(ÁCIDO
RIBONUCLEICO)
 EL ÁCIDO RIBONUCLEICO: ARN

• Descubierto por Félix-

Hoppe-Seyler.
• Cadena de ribonucleótidos.
• Unión fosfodiéster 5’ - 3’
• Monocatenario
• Cuatro bases: A, C, G, U.
 EL ARN
• Lleva ribosa y no
desoxirrribosa.
• Sus bases
nitrogenadas son : A.
G. C y U.
• Es una molécula más
corta que el ADN
• Salvo excepciones no
forma cadenas dobles.
 FUNCIONES
1. Todo aquello relacionado con
la síntesis de proteínas. Se
forma como cadena
complementaria de una
hebra de ADN: transcripción
2. Pueden almacenar el
material genético.
1. En algunos virus
2. Posiblemente, en el origen de
la vida, primera molécula que
albergó la información
genética.
 TIPOS DE ARN
• ARN ribosomal : forma los ribosomas.
• ARN de transferencia: capta aminoácidos en su extremo 3’.
• ARN mensajero: lleva la información genética desde el núcleo al
citoplasma.
• ARN np- ARN nuclear pequeño: Con proteínas, forma complejos que
son usados en el proceso de ARN en las células eucarióticas (no se
encuentra en las células procarióticas).
TIPOS DE ARN
TIPOS DE ARN
 ARN ribosomal - (ARNr)
• Constituye el 80 %
del total del ARN
celular.
• Tiene función
estructural.
• Se une a más de
70 proteínas
diferentes,
formando los
ribosomas.
ARN DE TRANSFERENCIA
 ARN trasferencia (ARNt)
• Función: transportar los
aminoácidos hasta los
ribosomas.
• Contiene de 70 a 90
nucleótidos.
• Zonas:
– Con emparejamiento en
doble hélice.
– Sin emparejamiento: bucles.
• Presenta un 10 % de bases
diferentes.
ARN transferencia (ARNt)

• CARACTERÍSTICAS
GENERALES:
– Extremo 5’ : con guanina y
H3PO4 libre.
– Extremo 3’: formado por
CCA sin aparear. Es el
punto en el que el ARNt se
une con el aminoácido
– Brazo A: contiene el
anticodón, complementario
al codón del ARNm.
ARN transferencia (ARNt)

• CARACTERÍSTICAS
GENERALES:
– Brazo T: tiene timina y
por aquí se fija al
ribosoma.
– Brazo D: unión con
aminoacil-t-ARN
sintetasa.
 ARN mensajero (ARNm)
• Constituye el 2-5 % del total de ARN.
• Longitud variable de 105 y 106 pb: CODONES.
• Presenta estructura lineal.
• Se forma por transcripción.
• Lleva el mensaje hasta los ribosomas.
 ARN mensajero (ARNm)
• Según la información que
lleve:
– Monocistrónico:
• En eucariotas.
• Información para sintetizar
una sola proteína.
– Policistrónico:
• En procariotas.
• Información para sintetizar
varias proteínas.
• Vida corta en el
citoplasma. (minutos)
luego de lo cual es
digerida por ribonucleasas.
 ARN nucleolar (ARNn)
• Se encuentra asociado a
distintos tipos de proteínas
en el NUCLEOLO.
• Se origina a partir de la
transcripción de unas
regiones del ADN del
núcleo llamados
organizadores
nucleolares.
• Una vez transcrito se
fragmenta y da lugar a los
distintos tipos de ARNr.
 OTROS TIPOS DE ARN
• Se localizan tanto en el
núcleo como en el
citoplasma.
• Algunos tienen función
catalítica: RIBOZIMAS.
• Ribonucleoproteínas:
asociación ARN-prot.
Modifican a los ARNm
para hacerlos funcionales.
• Autocatalíticos.
FLUJO INFORMACIÓN GENÉTICA
ADN-ARN