-En las reacciones químicas propiamente tales, independientemente que ocurran dentro o fuera

de la célula, puede haber producción de calor o utilización de calor, desde ese punto de vista
tenemos reacciones que pueden ser endergónicas o exergónicas y eso se puede medir calculando
el H que es la variación de la entalpia y por lo tanto esto nos da una idea si la reacción está o no
generando calor.
-La generación de calor requiere trabajo, el cual puede ser el resultado de un cambio de volumen
o cambio de presión.
-La entropía va en aumento, lo que significa que si estamos aumentando la entropía y el desorden
aumenta, desde el punto de vista de las reacciones químicas aumenta el número de colisiones lo
que permite que haya interacciones entre las moléculas.
-Variación de la energía libre, la cual es la energía disponible del sistema para que ocurran las
reacciones y con esto evaluamos espontaneidad.
-Keq es una constante que termina el punto medio en donde la reacción transcurre en ambos
sentidos, y a través de la Keq uno puede evaluar cuáles son las concentraciones de los compuestos
en el equilibrio. Cuando las reacciones están en equilibrio el G= 0

Guía 6

2-
a.-G de la reacción catalizada por una enzima a 25°C y pH 7,0, sabiendo que su constante de
equilibrio es Keq= 0,0475

G= -RT ln[B]

[A] R=0,082 Lt Atm/Kmol

G= -0,082*298,15*ln 0,0475

G = 74,49
Es una reacción no espontanea, pero si ocurre en la célula, esto se debe a que para que la
reacción transcurra hacia la derecha teniendo un G>0 se tiene que sacar producto y por lo tanto
el equilibrio se desplazara hacia la derecha y obligo a esta reacción a la formación de producto,
entonces si se modifica el flujo de una reacción puedo hacer que una reacción que es no
espontanea fluya hacia la formación de producto.

3-
a.- G = -RTln 1,97
G= -1,98*298,15*ln 1,97
G= -400,268

b.- G= -400,268+ (1,98*298,15*ln [0,5] )

[1,5]

G= -1048,81
-El punto isoeléctrico es el valor del pH al cual la carga neta es cero. Por ejemplo si el ácido
aspártico es un aminoácido acido su rango de pH debería estar en el rango de los ácidos, si el
aminoácido es asparragina es un aminoácido básico, por lo tanto su punto isoeléctrico debería
estar básico alrededor de 9 o 10.
-Si un aminoácido o una proteína tiene una carga neta =0 tiene varias propiedades en relación a
eso: primero no tiene movilidad electroforética, pero además tanto para proteínas como para
aminoácidos cuando una molécula está en su punto isoeléctrico, es decir su carga neta es = 0
tiende a precipitar, esto quiere decir que no es soluble, pierde solubilidad.

Enzimas
-Para que las reacciones en las células puedan ocurrir necesitamos biocatalizadores que son las
enzimas y las enzimas son proteínas, dado que son proteínas son susceptibles a regulaciones, son
capaces de unir moléculas y también son sensibles a la desnaturación.
-Las enzimas unen a sus reguladores a través de uniones por afinidad o por interacciones de tipo
iónica y en algunas ocasiones de manera covalente (la mayor cantidad de las veces), los cofactores
son los que se unen de manera covalente, no todos ellos se unen covalentemente pero las
enzimas pueden unir sus cofactores de manera covalente.
-La afinidad es un concepto que tiene que ver con la facilidad que tiene una proteína de unir una
determinada molécula, en este caso puede ser un sustrato. La afinidad está dada por los
aminoácidos y por la interacción que tienen esos aminoácidos por las moléculas que unen, por lo
tanto la afinidad varía entre una enzima y otra en relación al mismo sustrato, por ejemplo dos
proteínas pueden unir a un mismo substrato con distinta afinidad o una misma proteína puede
unir a dos substrato con distinta afinidad, la afinidad es una constante que uno puede calcular y
depende del par proteína-ligando, proteína-sustrato, proteína-cofactor.
-Las enzimas disminuyen la energía de activación pero no cambian la energía libre de Gibs de la
reacción, por lo tanto son catalizadores de la reacción van a acelerar el proceso.
-En una reacción enzimática vamos a hablar de substrato y producto, con una Keq que
corresponda y en presencia de un catalizador que es una enzima.
-La hidrolisis del ATP es una reacción que ocurre entre dos moléculas ATP y agua, al estar presente
una enzima, esta reacción se transforma en una reacción unimolecular, es decir toda la reacción
ocurre dentro de la enzima, si uno favorece el encuentro del substrato para la transformación de
producto utilizando una enzima, de tal manera que la enzima no es solo un catalizar inespecífico,
sino que es un catalizar que específicamente une a estas moléculas para la transformación de
producto.
-El tamaño de una proteína es bastante mayor que el tamaño de los sustratos y tienen, dentro de
las enzimas, sitios para la unión de estos substratos, sitios en donde ocurre la catálisis, que es lo
que nosotros denominamos sitio activo, y un sitio para la unión de los productos y generación de
los productos, de tal manera que funcionalmente la proteína tiene distintos motivos en donde van
a ir ocurriendo la entrada de substrato, la transformación de substrato y la salida del producto.
Además tienen, dependiendo de la naturaleza de las enzimas, sitios que permitan la unión de
cofactores.
-Algunas enzimas utilizan cofactores, lo cuales pueden ser: grupos prostéticos, iones (metálicos
especialmente) o vitaminas. SI son vitaminas o moléculas derivadas de las vitaminas, las
conocemos como coenzimas. La unión de estos grupos a las enzimas es a través de los residuos de
los aminoácidos , porque los aminoácidos tienen comprometido, en el enlace peptídico, el grupo
carboxilo y el grupo amino y solo nos queda libre el residuo de los aminoácidos, por lo tanto unen
a estos cofactores a través de los residuos de los aminoácidos, y los residuos de los aminoácidos
que tienen propiedades por ejemplo para unir iones, generalmente los iones que unen las
enzimas son cationes, pueden ser bivalentes o monovalentes, las mayoría de las veces unen
cationes bivalentes y para poder unirlos, la célula o la proteína, utiliza residuos de aminoácidos
que tenga la capacidad de unir estos cationes. Los residuos de los aminoácidos que se comportan
como aniones son los residuos de los aminoácidos ácidos, los grupos carboxilos o en algunos
casos, como en el caso del zinc y del manganeso, la unión ocurre a través de lisinas e histidinas,
entonces de esta forma la proteína va a mantener unido a los grupos prostético. Por ejemplo el
grupo hem de la hemoglobina está unido por lisina y forma un plano dentro de la proteína y en el
otro plano tiene unido el oxígeno, de esa manera el estado iónico de hierro de la hemoglobina es
el que la estabiliza.
-Las hemoproteinas son proteínas que tienen unido grupos hem, una de esas proteínas es la
hemoglobina, pero la hemoglobina no es una enzima, existen enzimas que también tienen grupos
hem en su estructura.
-Vamos a encontrar como iones unidos a las enzimas al cobre, hierro, magnesio, manganeso,
cadmio, zinc, cobalto, por lo tanto existen muchos grupos prostéticos que aportan iones a la
estructura y son necesario para la actividad.
-Las enzimas que usan cofactores no funcionan si su cofactor. Cuando una enzima usa un cofactor
y la proteína no está unida al cofactor se llama apoenzima.

Funciones de las enzimas

-Su función es hacer que ocurra la catálisis.
-La catálisis ocurre dentro de la enzima en el sitio activo. Si decimos que la transformación de
substrato ocurre en el sitio activo, es decir la catálisis ocurre en el sitio activo, quiere decir que los
residuos de los aminoácidos de sitio activo están relacionados con la catálisis.
-La transformación, reacción, ruptura, condensación, adición, sustitución, etc. ocurre dentro del
sitio activo y por lo tanto son los aminoácidos del sitio activo los que participan de la reacción.
-En el caso de la quimiotripsina, que es un tipo de proteasa, dentro de su sitio activo tenemos los
aminoácidos aspártico (102), histidina (57) y serina (195), sus números indica que son aminoácidos
no adyacente y se ubican en distintos lugares de la proteína que forman un sitio activo, por lo
tanto la conformación de la proteína permite la formación del sitio activo. La catálisis ocurre en
donde la participación de estos residuos (serina, histidina, aspártico) activamente participan de la
catálisis y de esta manera ahora llega un residuo de un aminoácido que puede atacar a un enlace
peptídico y romperlo
-Dentro del sitio activo, además de encontrar al sustrato, también puede haber moléculas de
agua, el agua que esta solvatando a la proteína es distinta al agua que está dentro del sitio activo.
-Las proteasas tienen como substrato a proteínas y tienen tendencia a romper determinadas
secuencias de aminoácidos y cientos de enlaces peptídicos.
 Actividad enzimática
-Es una unidad de mediada de la velocidad de reacción enzimática, es decir cuando nosotros
evaluamos la actividad de una enzima, para poder hacerlo lo hacemos en función de la velocidad
de transformación, por lo tanto la actividad enzimática es la velocidad con la que ocurre la
reacción y la velocidad es la variación de substrato en función de la variación del tiempo, dado que
el substrato desaparece en el tiempo

V= dp = -ds
dt dt

Cuando decimos que estamos evaluando la velocidad de reacción lo que estamos haciendo es
evaluar la actividad enzimática.
-Existen distintas formas de expresar la actividad enzimática, la que más utilizamos es el dp a dt
que es la aparición de producto en el tiempo y se expresa como mmol/min, pero también la
podemos evaluar utilizando otras unidades de medidas como es el catal que es la cantidad de
enzima necesaria para catalizar la transformación de 1 mol de substrato en 1 seg (mol s/seg), por
otro lado están las unidades internacionales para la actividades de la enzimas, que se define como
la cantidad de enzimas necesarias para la transformación de un micromol de substrato en 1
minuto.

-La pendiente es el  y/  x, en donde y =p y x = dt, por lo tanto a partir de la pendiente

de una curva p versus t en la zona lineal podemos obtener la velocidad.

Vo
Producto

m = cte = p = V
t

Tiempo (min)

-La velocidad inicial (Vo) es la tangente a la curva.

-Si decimos que la actividad de la enzima, la velocidad con que ocurre la reacción, puede ser
modificada, quiere decir que la proteína puede interactuar con compuesto distintos al sustrato,
estos compuestos los conocemos como activadores e inhibidores, no es el cofactor porque el
cofactor es necesario para la actividad, pero si una molécula distinta al substrato o al cofactor
puede actuar como activador o inhibidor. Un activador es cualquier sustancia química de
naturaleza no proteica que produzca un aumento de la actividad de la enzima, es decir que
produzca un aumento en la velocidad de reacción y un inhibidor es todo lo contrario, es decir
aquel compuesto químico que produzca una disminución de la velocidad de reacción o de la
actividad enzimática.

Modificadores de las enzimas

-Podemos tener inhibidores que se unan de manera reversible a las enzimas o inhibidores que se
unan de manera irreversible.
-Los inhibidores reversibles implica que existe un equilibrio entre la forma libre de la enzima y la
forma unida al inhibidor a esto se le llama complejo enzima inhibidor.
-Los inhibidores irreversibles se une a la enzima y la modifica de manera permanente, por lo tanto
una vez que el inhibidor se une a la enzima se pierde la forma libre de la enzima.

-Las reacciones enzimáticas van a ocurrir de la siguiente forma: un substrato más una enzima libre
van a formar el complejo enzima substrato el cual se va a transformar
en producto, la formación del complejo enzima substrato es
reversible, una vez que se transforma el producto la enzima vuelve a
quedar libre, disponible para unir un nuevo sustrato, entonces
cuando decimos que hay inhibidores que se pueden unir a la enzima lo pueden hacer a la enzima
libre de manera reversible o lo pueden hacer de manera irreversible, de cualquiera de las dos
formas que ocurra lo que estamos haciendo es disminuir la concentración de enzima disponible
para la reacción, es por ello que la actividad enzimática disminuye.
-La concentración de enzima es importante para la actividad.
-La parte de la curva que es lineal indica que es una constante, si es constante quiere decir que la
velocidad con la que se transforma siempre es la misma, en cualquier punto de la recta. Esto se
debe a que la concentración del complejo enzima substrato es constante y por lo tanto por
condición tenemos que tratar de mantener la concentración del complejo enzima substrato
constante, cuando la concentración del complejo enzima substrato no es constante la velocidad
baja.
-La concentración del complejo enzima substrato depende de la constante de formación,
constante de disociación y la constante de formación a producto (liberación de la enzima).

Cofactores
-Son moléculas que se unen a las enzimas y son necesarias para la actividad, sin ser substrato y sin
ser activadores. En general los cofactores participan de la catálisis y lo pueden hacer participando
de manera directa o ayudando en la fijación de alguno de los sustratos.
-Así como las enzimas son catalizadores y por lo tanto sabemos que los catalizadores no participan
de la estequiometria de la reacción.
-Los cofactores no pueden ser modificados, pero si un cofactor cambia su estado de ionización o
su estructura, de alguna manera tiene que recuperarla y volver a su estado inicial, entonces lo más
importante en la catálisis enzimática es que la enzima debe restablecer su estado inicial. Los
cofactores que participen de la reacción deben restablecer su estado inicial. Esto es cuando
tenemos a una enzima en donde el cofactor está unido permanentemente a la enzima.
-Cuando una enzima tiene unido su cofactor se denomina holoenzima y por lo tanto es funcional.
-Una de las coenzimas que participan en la catálisis es la tiamina pirofosfato (vitamina B1), la cual
es bastante grande y se va a unir a los residuos de los aminoácidos y en el sitio activo a la enzima,
porque se necesita que el cofactor este en el sitio activo, una vez que la coenzima entra al sitio
activo y forma parte de la proteína, es decir forma la holoenzima, este cofactor puede ser
modificado de tal manera que quede en un estado reactivo para la transformación de sustrato, las
coenzimas tienen que ser moléculas que tengan centros reactivos de tal manera que cuando el
substrato sea unido al sitio activo este cofactor pueda participar de la catálisis.

-Esta es una reacción de desaminación, en donde se le saca el grupo amino y queda como amonio
y además tiene acoplada una reacción de oxidación, en donde hay participación de oxígeno para la
formación de un ceto acido. La enzima que
cataliza esta reacción es la L-aminoácido
oxidasa y se define como una flavoporteina,
como es una oxidasa va a catalizar una
reacción de oxidación, las cuales requieren
de agente oxidante y en este caso es el
oxígeno. La reacción de oxidación es que
acoplada una reacción de desaminación se
oxida el carbono transformando el
aminoácido en un ceto acido. La
flavoproteina usa como coenzima a la
flavina, si no tuviera flavina esta reacción no
podría ocurrir, al final de la reacción la
flavina recupera su esta de oxidación, para recuperar su estado de oxidación usan otra enzima
para restablecer el estado de oxidación.

-La lactato deshidrogenasa también es una enzima oxido reductasa, en este caso particular es una
reacción de reducción, de tal manera
que la lactato deshidrogenasa puede
transformar el piruvato a lactato, si no
hubiese NADH en el sistema no habría
formación de lactato. Para volver a
utilizar el NADH como agente reductor
tiene que ser reducido por otra enzima
distinta, no se restablece su estado de
oxidación dentro de la enzima porque es
usada como cosustrato, entonces queda
transformado como NAD oxidado, para
restablecerlo necesitamos una enzima distinta que debiera ser una reductasa.
-La lactato deshidrogenasa es una enzima que tiene isoenzimas.
-Las isoenzimas son enzimas que tienen la misma actividad biológica y que son codificada por
genes diferentes, esto quiere decir que la secuencia de aminoácido es distinta, la estructura
primaria es diferente y el peso molecular es diferente.
-La lactato deshidrogenasa es funcional cuando tiene 5 subunidades y esta sostenida por
interacciones hidrofóbicas.

Especificidad

-Las enzimas unen a su substrato de manera específica, dado que la enzima es una proteína y que
la unión a substrato es a través de los residuos de aminoácidos, por lo tanto esa interacción es
específica y pude serlo porque la enzima tiene un grupo definido, por ejemplo la hexoquinasa va a
fosforilar a las hexosas, otra enzima que hace lo mismo es la glucoquinasa pero solo fosforila a la
glucosa, hay especificidad, pero va a depender del tipo de enzima si la especificidad es por toda la
molécula o solo por un grupo de la molécula.

-En el caso de las especificidades la fumaratohidratasa es una enzima que hidrata entre doble
enlace lo que implica la adición de un grupo alcohol en un carbono y un protón en el otro carbono
y lo transforma entonces en malato. La
fumaratohidratasa necesita unir fumarato, como el
fumarato tiene doble enlace tenemos entonces dos
configuraciones la cis y la trans, particularmente esta
enzima solo une a fumarato trans, entonces esto es
una especificidad por la configuración.

Especificidad de grupo
-En el caso de este ejemplo, las esterasas en general rompen esteres, por lo tanto cualquier
molécula que tenga un estere
va a estar roto por una
esterasa.
Las lipasas son esterasas, hay
distintas lipasas; la fosfolipasa
A2, fosfolipasa D, fosfolipasa
C y por lo tanto estas
esterasas tienen especificidad
por el carbono y no solo por el grupo.