Peter Parker se va de vacaciones a Europa con sus amigos Ned y Michelle;
pero sus vacaciones van a tener que esperar ya que se verá obligado a unirse a con el objetivo de detener a los Elementales, unos extraños seres que nadie sabe de Misterio dónde vienen pero dispuestos a acabar con todo lo que se les atreviese en su camino.
En Ixtenco, Nick Fury y María Hill investigan una extraña tormenta no
natural, y luego se encuentran con el Elemental de la Tierra. Un misterioso hombre con superpoderes, Quentin Beck, llega para luchar contra la criatura.
En Ciudad de Nueva York, la Escuela Midtown de Ciencia y
Tecnología reinicia su año académico para acomodar a los estudiantes que se encontraban entre los resucitados ocho meses antes.
La escuela organiza un viaje de verano de dos semanas a Europa,
donde Peter Parker, todavía angustiado por la muerte de Tony Stark, planea confesar sus sentimientos crecientes hacia su compañera de clase MJ, así como evitar los actos heroicos. MJ deduce que Parker es Spider- Man.
Descubren que una pieza de escombros que recuperaron durante la batalla
del carnaval es un proyector que presenta una simulación del Elemental del Aire, lo que lleva a los dos a darse cuenta de que Beck es un fraude. Cuando se prepara para otra ilusión, Beck descubre que MJ tomó evidencia de su engaño. Parker viaja a Berlín y se encuentra con Fury, solo para darse cuenta de que la versión que tiene ante sí es una ilusión creada por Beck.
Él lucha contra múltiples ilusiones, pero es atropellado por un tren, Parker
sobrevive, resultando gravemente herido y luego cae inconsciente en un vagón de tren.
Al despertar en una celda de una prisión en los Países Bajos, escapa y
contacta a Hogan. Hogan lleva a Parker a Londres y revela una máquina de fabricación de trajes dejada por Stark, que Parker usa para sintetizar un traje personalizado.
En Londres, Beck desata el ataque del Elemental, buscando matar a MJ y a
cualquier otro a quien ella le haya revelado su secreto. Parker rompe la ilusión, recupera el control de y derrota a Beck, quien muere por una bala perdida. Riva se escapa con los archivos y grabaciones de los drones, mientras que Parker regresa a la ciudad de Nueva York y comienza una relación con MJ.