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1
Estructura primaria.
La formación de un puente disulfuro
2
Análisis de Aminoácidos. Reacción química
CH
CH
H2 H2
O C C
o-ftalaldehído HO S
R1
R1
C O
+
+
H3N H C N C
H O
C
O
O
HS Aminoácido
CH2
CH2 Derivado
HO
Fluorescente
2-mercaptoetanol
Análisis de Aminoácidos.
Perfil de elución desde el analizador
3
Degradación de EDMAN
Ciclo 1
1 2 3 4 5
1 2 3 4 5
1 2 3 4 5
Analizador
Degradación de EDMAN
Ciclo 2 2 3 4 5
2 3 4 5
2 3 4 5
Analizador
y así sucesivamente ....
4
Las reacciones químicas de la
reacción de Edman
Hecho
Problema
5
Determinación estructura primaria
Solución
Proteína
1. Fragmentación
Péptidos
2. Secuenciar péptidos
3. Ordenar la secuencia
O R2 O
H
C C N H C
C N H C C N
H
R1 O R3
Enlace peptídico
6
Ejemplo de secuenciació
secuenciación de un pépido
Tyr-
Tyr-Lys
Glu-
Glu-Met-
Met-Leu-
Leu-Gly-
Gly-Arg
Hidró
Hidrólisis con Tripsina
Pro-
Pro-Met-
Met-Arg
Met-
Met-Gly-
Gly-Cys-
Cys-Lys
Leu-
Leu-Gly-
Gly-Arg-
Arg-Met
Tyr-
Tyr-Lys-
Lys-Glu-
Glu-Met
Hidró
Hidrólisis con CNBr
Gly-
Gly-Cys-
Cys-Lys-
Lys-Pro-
Pro-Met
+ un aminoá
aminoácido bá
básico
Secuencia Deducida
Fragmentos CNBr
Tyr-
Tyr-Lys-
Lys-Glu-
Glu-Met-
Met-Leu-
Leu-Gly-
Gly-Arg-
Arg-Met-
Met-Gly-
Gly-Cys-
Cys-Lys-
Lys-Pro-
Pro-Met-
Met-Arg
7
Análisis filogenéticos