Para generar los espectros de absorcion con GaussSum, primero se busca el 

archivo  de  salida  generado  por  el  gausian    o  cualquier  otro  programa  de 
calculo molecular, en este caso sera un archivo log.  

 
Al seleccionar el archivo y abrirlo por GaussSum, se mostrara la ventana con 
el  aspecto  que  muestra  la  gráfica,  en  donde  debe  seleccionar  la  opción 
Electronic  Transitions,  UV‐Visible  y  si  es  necesario  se  pueden  modificar  los 
parámetros  de  longitud  de  onda  de  inicio  y  final,  además  del  número  de 
puntos en la construcción de la gráfica.  

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Luego  de  haber  hecho  todo  esto,  se  presiona  el  botón  que  tiene  el  logo  de 
GaussSum  para  generar  la  gráfica  correspondiente,  mostrando  por  ende  el 
resultado que a continuación se puede observar en una nueva ventana.  

 
Luego de esto se procede a guardar esta imagen si así lo desea. Pero nuestro 
trabajo está encaminado es en lograr generar los espectros superpuestos de 
varios compuestos al tiempo, para lo cual se utilizara el archivo que genera el 
GaussSum  para  posteriormente  implementarlo  en  el  programa  graficador 
Gnuplot, que es ultima donde se realizara la construcción de las gráficas de 
los espectros de absorción superpuestas.  

Para  la  siguiente  etapa  puede  cerrar  el  programa  GaussSum  si  así  lo  desea, 
teniendo en cuenta que ha generado todos los espectros de los compuestos 
que  desea  superponer  con  Gnuplot.  Cabe  resaltar  que  luego  de  haber 
generado cada grafica se debe dirigir a la carpeta donde tiene guardado los 
archivos  log  y  en  la  carpeta  que  por  defecto  crea  el  programa  GaussSum  le 

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cambia el nombre al archivo por unos más conveniente si lo desea, para que 
le  sea  más  fácil  manejar  la  información.  En  la  siguiente  imagen  se  puede 
observar el nombre de la carpeta que se genera: 

 
 

Se ingresa a esta y se encuentran los archivos siguientes:  

 
Los  modifica  ambos  con  el  nombre  deseado,  por  ejemplo  con  el  nombre 
corto  de  la  molécula,  teniendo  en  cuenta  que  el  que  se  va  a  trabajar  en 
Gnuplot  es  el  que  tiene  por  nombre  UVSpectrum,  aunque  el  otro  lo  crea  el 
sistema  no  lo  elimine,  dele  un  nombre  que  tenga  que  ver  con  la  molécula 
también,  pero  diferente  al  que  se  va  a  llevar  a  graficar  en  Gnuplot.  Cabe 
recordar  que  en  el  ejemplo  que  se  está  siguiendo  solo  se  hizo  para  una 
molécula,  usted  deberá  hacerlo  para  podas  las  moléculas  que  desea 
superponer. 

Para la siguiente parte del trabajo ya se tienen todos los archivos organizado 
como a continuación se muestra:  

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En este caso la organización se siguió colocándole un consecutivo al archivo 
generado,  vale  la  pena  decir  que  esto  se  debe  hacer  manualmente,  pues  el 
sistema  cada  vez  que  genera  un  archivo  sino  lo  ha  hecho  sobrescribe  el 
archivo  que  encuentra.    Para  esta  para  parte  del  trabajo  debe  abri  el 
programa Gnuplot, el cual mostrara la siguiente ventana: 

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Escribe  el  comando  plot    y  posteriormente  selecciona  el  primer  archivo  a 
graficar,  para lo cual se  va al  menú  plot. Es necesario  que en  la ventana de 
selección de archivos le indique que muestre todos los archivos. 

 
 

 
En este momento la línea de comando toma la forma siguiente:  
gnuplot> plot 'C:\Users\HugoAlberto\Desktop\gausssumAmino\UVSpectrum_01.txt' 

Se  le  informa  a  Gnuplot  cuáles  son  los  datos  que  se  van  a  graficar,  que  en 
este  caso  son  los  de  las  columnas  2  y  3,  y  se  utiliza  la  expresión  siguiente  
using 2:3, quedando para esta para la línea de entrada de la siguiente forma:  
gnuplot> plot 'C:\Users\HugoAlberto\Desktop\gausssumAmino\UVSpectrum_01.txt' using 
2:3 

Lo que sigue a continuación es indicar el tipo de línea, el color de la línea, el 
título  del  gráfico,  obteniendo  la  línea  de  comando  ya  en  forma  final  de  la 
siguiente manera:  

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gnuplot> plot 'C:\Users\HugoAlberto\Desktop\gausssumAmino\UVSpectrum_01.txt' using 
2:3 with lines linewidth 2 linecolor 1 title 'Quinoleina' 

Al presionar la tecla enter, debe mostrarle la gráfica en nueva ventana como 
la indicada: 

 
Para esta parte, si todo lo hizo bien lo que sigue es mucho más fácil, pues se 
utilizara lo que ya hizo. Cierre la venta de la gráfica y diríjase a Gnuplot el cual 
tendrá la apariencia:  

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Es  decir  está  a  la  espera  de  una  nueva  instrucción,  en  este  caso  vamos  a 
tomar la última digitada y para ello solo debe presionar la tecla cursora flecha 
hacia arriba y de inmediato le trae la última línea digitada, coloca una coma y 
copia la misma instrucción solo que  ahora cambiara el nombre del archivo, el 
color de línea y el título, de esta forma se va hacer para todos los archivos a 
graficar en forma superpuesta dando a lugar a la siguiente línea de código:  

 
 

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Al presionar ENTER, inmediatamente si todo fue digitado en forma correcta 
se mostrara una ventana con el grafico deseado como a continuación:  

 
Para darle un poco de formato a la gráfica puede agregarle un título, además 
de colocarles los nombres a los respectivos ejes según conveniencia. Para tal 
efecto  se  utilizan  los  siguientes  comandos,  los  cuales  puedes  ir  ejecutando 
uno a uno y por último se vuelve a graficar con el comando replot. 

Para el título del gráfico: gnuplot> set title ’Espectros de Absorción Molecular ’

Para el título del eje horizontal: gnuplot> set xlabel ’Longitud de Onda’

Para el título del eje vertical: gnuplot> set ylabel ’Epsilon’

Para volver a graficar: gnuplot> replot

Al ejecutar correctamente las instrucciones en la ventana de gráficos aparecerá

algo como lo que se muestra a continuación:

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Para obtener los diferentes colores de línea puede seguir la presente tabla:  

Color Código
Rojo 1
Verde Claro 2
Azul 3
Fucsia 4
Azul Claro 5
Amarillo 6
Negro 7
Naranja 8
Gris 9
 

Por  el  momento  es  todo,  en  una  próxima  versión  se  corregirán  los  errores 
que  por  la  premura  de  tiempo  se  han  podido  cometer  en  la  redacción  y 
organización del presente material. 

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