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REPUBLIQUE ALGERIENNE DEMOCRATIQUE ET POPULAIRE

MINISTERE DE L’ENSEIGNEMENT SUPERIEUR


ET DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE

HARMONISATION

OFFRE DE FORMATION MASTER

ACADEMIQUE

Etablissement Faculté / Institut Département


Université M’Hamed Des sciences Biologie
Bougara de Boumerdes

Domaine : SNV

Filière : Sciences Biologiques

Spécialité : Biochimie Appliquée

Année universitaire : 2015/2016

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 1


Année universitaire : 2015/2016
‫الجمهورية الجزائرية الـديمقراطيـة الـشعبيــة‬
‫وزارة التعليــم العالــي والبحــث العلمــي‬

‫مواءمة‬

‫عرض تكوين ماستر‬

‫أكاديمي‬

‫القسم‬ ‫الكلية‪ /‬المعهد‬ ‫المؤسسة‬


‫بىيولجيا‬ ‫العلوم كلية‬
‫جامعة‬
‫بومرداس بوقرة محمد‬

‫الميدان ‪ :‬علوم الطبيعة و الحياة‬

‫الشعبة ‪ :‬علوم بيولوجية‬

‫التخصص ‪ :‬بيوكيمياء تطبيقية‬

‫السنة الجامعية‪2017/2016 :‬‬

‫‪Etablissement : UMBB‬‬ ‫‪Intitulé du master : biochimie appliquée‬‬ ‫‪Page 2‬‬


‫‪Année universitaire : 2015/2016‬‬
SOMMAIRE

I - Fiche d’identité du Master ------------------------------------------------------------------


1 - Localisation de la formation ------------------------------------------------------------------
2 - Partenaires de la formation---------------------------------------------------------------
3 - Contexte et objectifs de la formation----------------------------------------------------------
A - Conditions d’accès ------------------------------------------------------------------
B - Objectifs de la formation ---------------------------------------------------------
C - Profils et compétences visées ------------------------------------------------
D - Potentialités régionales et nationales d’employabilité ----------------------
E - Passerelles vers les autres spécialités ---------------------------------------
F - Indicateurs de suivi de la formation ------------------------------------------------
G – Capacités d’encadrement-------------------------------------------------------------
4 - Moyens humains disponibles-------------------------------------------------------------------
A - Enseignants intervenant dans la spécialité---------------------------------------
B - Encadrement Externe -----------------------------------------------------------------
5 - Moyens matériels spécifiques disponibles---------------------------------------------------
A - Laboratoires Pédagogiques et Equipements -------------------------------
B- Terrains de stage et formations en entreprise -------------------------------
C - Laboratoires de recherche de soutien au master--------------------------------
D - Projets de recherche de soutien au master----------------------------------------
E - Espaces de travaux personnels et TIC ----------------------------------------

II - Fiche d’organisation semestrielle des enseignement---------------------------


1- Semestre 1 -----------------------------------------------------------------------------------
2- Semestre 2 -----------------------------------------------------------------------------------
3- Semestre 3 -----------------------------------------------------------------------------------
4- Semestre 4 -----------------------------------------------------------------------------------
5- Récapitulatif global de la formation --------------------------------------------------------

III - Programme détaillé par matière --------------------------------------------------------

IV – Accords / conventions ------------------------------------------------------------------

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Année universitaire : 2015/2016
I – Fiche d’identité du Master
(Tous les champs doivent être obligatoirement remplis)

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Année universitaire : 2015/2016
1 - Localisation de la formation :
Faculté (ou Institut) : des Sciences
Département : Biologie

2- Partenaires de la formation *:
- autres établissements universitaires :

- entreprises et autres partenaires socio économiques :


- Institut Pasteur Alger
- SAIDAL
- HCR
- CRAPC
- LISMANN
-INRA
- hôpitaux Alger

- Partenaires internationaux :

* = Présenter les conventions en annexe de la formation

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Année universitaire : 2015/2016
3 – Contexte et objectifs de la formation

B – Conditions d’accès (indiquer les parcours types de licence qui peuvent


donner accès à la formation Master proposée)

- Licence Biochimie
- Licence biologie moléculaire

- Licence Biotechnologie (santé, végétale)

B - Objectifs de la formation (compétences visées, connaissances pédagogiques


acquises à l’issue de la formation- maximum 20 lignes)

L’étudiant en Master en biochimie, doit acquérir un savoir et maîtriser un savoir-faire lui permettant
de comprendre en profondeur et d’aborder expérimentalement toute question relative à la structure,
au fonctionnement et à l’exploitation à des fins biotechnologiques des cellules vivantes et de leurs
composants moléculaires. Il doit non seulement avoir appris, mais aussi et surtout avoir appris à
apprendre de manière autonome : en tant que biochimiste : comment sont construites, comment
fonctionnent et comment évoluent les macromolécules qui constituent le fondement moléculaire de
la structure, du fonctionnement et de la programmation du vivant.
L'objectif de ce master est de donner aux étudiants les connaissances et outils nécessaires pour
aborder des domaines de pointe de la biologie, y compris à travers une vision transversale de ces
domaines. Grâce à son intégration au sein d'une équipe de recherche au cours du mémoire, l'étudiant
apprendra également à mettre en place une démarche scientifique visant à tester l'hypothèse posée,
et à la réaliser expérimentalement. Finalement, le stage de la dernière année offrira à l'étudiant une
insertion en milieu professionnel et lui permettra ainsi de se préparer à exercer son futur métier, fort
de son bagage scientifique, tant théorique que pratique

Les finalités de cette formation sont l'acquisition par les étudiants d'une formation multidisciplinaire
de haut niveau à l'interface entre la Biologie, la Chimie et la Physique. L'enseignement dispensé
permettra de répondre aux exigences de la Recherche et du Développement en Sciences de la Vie et
de la Santé, en mettant l'accent sur les aspects industriels dans le domaine de la Recherche et du
Développement de l'industrie des Biotechnologies.

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Année universitaire : 2015/2016
C – Profils et compétences métiers visés (en matière d’insertion professionnelle
- maximum 20 lignes) :

Les étudiants de cette spécialité ont pour vocation à acquérir une formation par la recherche dans
des laboratoires publics ou privés développant ou intégrant l’un des s axes suivants : · Techniques et
méthodes de la biophysique structurale. Clonages, expressions et purifications des macromolécules
biologiques. Cristallographie, résonance magnétique nucléaire, microscopie électronique,
spectroscopie de masse, méthodes physico-chimiques d’études et de caractérisations des
macromolécules biologiques. Applications au haut débit (génomique structurale). · Techniques et
méthodes de la "biologie in silico", analyse et valorisation de l’information génomique.· Techniques
et méthodes de modélisation en biologie. Applications à la conception rationnelle de médicament et
aux méthodes de simulations en biologie.

La formation théorique et méthodologique, actuellement indispensable dans tous les secteurs de la


Biochimie, portera principalement sur les aspects de la biosynthèse et de la biodégradation des
macromolécules biologiques, sur l'analyse de leurs propriétés structurales et fonctionnelles, sur la
caractérisation de leurs interactions aux niveaux moléculaire et cellulaire, ainsi que sur les aspects
liés à leurs propriétés physico-chimiques. Les différents aspects fondamentaux et les champs
d'application de la Biochimie sont couverts grâce à la mise en place d'enseignements reposant sur
l'utilisation des approches et outils les plus modernes relevant de la chimie bio-organique, de la
biochimie analytique, de la biologie structurale et fonctionnelle, de la bioinformatique, de la biologie
moléculaire et cellulaire, de l'immunologie, de la pharmacologie moléculaire, et des nano
biotechnologies ce qui permettra aux étudiants de pouvoir s'intégrer parfaitement dans les industries
de Biotechnologies.

La deuxième année de la formation proposée est particulièrement orientée vers les aspects
technologiques et appliqués de la Biochimie, avec des enseignements spécifiques portant notamment
sur les développements les plus appliqués de la biochimie , sur la conception de molécules
bioactives, sur les techniques modernes en immunologie, du "design" moléculaire aux outils de
diagnostic.

Intégration d'une proportion importante des étudiants dans la filière académique de préparation à la
thèse. Les équipes d'accueil des Ecoles Doctorales “ Biochimie et Biologie moléculaire ” (B2M) et “
Biologie Biotechnologie ” (B2T) constituent un support important pour l'insertion des étudiants en
stage dès le quatrième semestre de formation (S4) au sein des laboratoires de recherche.

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Année universitaire : 2015/2016
D- Potentialités régionales et nationales d’employabilité des diplômés

Ce type de master convient aux étudiants qui envisagent une carrière dans la recherche publique et
l’enseignement supérieur ou d’ingénieur de recherche ou de développement dans le secteur
industriel des biotechnologies, de l’agro-alimentaire, de la santé et industries pharmaceutiques.

Par ailleurs, une formation approfondie en biologie structurale et biotechnologie est exploitable
comme support scientifique d'une double compétence pour l'accès aux métiers "péri-scientifiques"
par exemple : aspects réglementaires en biotechnologie, propriété industrielle, financement et
gestion de l'innovation, communication scientifique.
En résumé : il y a deux finalités
La finalité approfondie prépare au métier de chercheur. Des enseignements spécialisés ouvrent des
questions qui se situent à la limite des connaissances On insiste sur la formation à la démarche
expérimentale, à la communication scientifique, écrite et orale. Le programme comprend un stage
ou une formation dans un laboratoire extérieur à l’Université de Boumerdes.

La finalité spécialisée en Biochimie industrielle


Cette finalité permet à ceux qui envisagent de s’engager directement vers une profession en milieu
industriel de bénéficier d’un stage leur permettant de participer activement à la vie d’une entreprise
du secteur biotechnologique et de se faire connaître. Cette finalité est axée essentiellement sur la
biochimie appliquée ainsi que sur la biochimie industrielle. En outre, afin de préparer l’étudiant au
mieux, la Faculté propose un stage en entreprise ainsi que de nombreux séminaires faisant
intervenir des partenaires industriels lui permettant de participer activement à la vie d’une entreprise
du secteur biotechnologique et de se faire connaître. Enfin, des cours sont consacrés à des notions
de gestion (management, comptabilité, propriété industrielle...).

Les étudiants de cette spécialité ont pour vocation à acquérir une formation par la recherche dans
des laboratoires publics ou privés développant ou intégrant l’un des s axes suivants : · Techniques et
méthodes de la biophysique structurale. Clonages, expressions et purifications des macromolécules
biologiques. Cristallographie, résonance magnétique nucléaire, microscopie électronique,
spectroscopie de masse, méthodes physico-chimiques d’études et de caractérisations des
macromolécules biologiques. Applications au haut débit (génomique structurale). · Techniques et
méthodes de la "biologie in silico", analyse et valorisation de l’information génomique.· Techniques
et méthodes de modélisation en biologie. Applications à la conception rationnelle de médicament et
aux méthodes de simulations en biologie.

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Année universitaire : 2015/2016
La formation théorique et méthodologique, actuellement indispensable dans tous les secteurs de la
Biochimie, portera principalement sur les aspects de la biosynthèse et de la biodégradation des
macromolécules biologiques, sur l'analyse de leurs propriétés structurales et fonctionnelles, sur la
caractérisation de leurs interactions aux niveaux moléculaire et cellulaire, ainsi que sur les aspects
liés à leurs propriétés physico-chimiques. Les différents aspects fondamentaux et les champs
d'application de la Biochimie sont couverts grâce à la mise en place d'enseignements reposant sur
l'utilisation des approches et outils les plus modernes relevant de la chimie bio-organique, de la
biochimie analytique, de la biologie structurale et fonctionnelle, de la bioinformatique, de la biologie
moléculaire et cellulaire, de l'immunologie, de la pharmacologie moléculaire, et des nano
biotechnologies ce qui permettra aux étudiants de pouvoir s'intégrer parfaitement dans les industries
de Biotechnologies.

La deuxième année de la formation proposée est particulièrement orientée vers les aspects
technologiques et appliqués de la Biochimie, avec des enseignements spécifiques portant notamment
sur les développements les plus appliqués de la biochimie , sur la conception de molécules
bioactives, sur les techniques modernes en immunologie, du "design" moléculaire aux outils de
diagnostic.

Intégration d'une proportion importante des étudiants dans la filière académique de préparation à la
thèse. Les équipes d'accueil des Ecoles Doctorales “ Biochimie et Biologie moléculaire ” (B2M) et “
Biologie Biotechnologie ” (B2T) constituent un support important pour l'insertion des étudiants en
stage dès le quatrième semestre de formation (S4) au sein des laboratoires de recherche.

E – Passerelles vers d’autres spécialités

L’unité optionnelle permet le passage à d’autres parcours types notamment vers les autres Masters
de biotechnologie et santé, bioingénierie des biomolécules, biochimie-microbiologie appliquées,
génie pharmacologique et biochimique et protéomique et santé.

F – Indicateurs de suivi de la formation


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Année universitaire : 2015/2016
Les étudiants titulaires de master en biochimie appliquée sont des biochimistes ayant l’aptitude de
superviser la fabrication et le contrôle dans les industries biochimiques, agro-alimentaires,
pharmaceutiques, de génie génétique ou de fermentation ; ils sont également appelés à travailler
dans les laboratoires de recherche appliquée dans les domaines précités.

Ce diplômé Biochimiste sera aussi amené à prendre en compte l’exploitation et la protection des
ressources naturelles. Sa formation lui permet d’appréhender les processus de fabrication afin de
déterminer les sources de rejets, de mettre au point des technologies propres et d’intégrer ces
données afin d’en dégager l’impact économique et social.

G – Capacité d’encadrement (donner le nombre d’étudiants qu’il est possible de


prendre en charge)

Trente étudiants

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Année universitaire : 2015/2016
4 – Moyens humains disponibles
A : Enseignants de l’établissement intervenant dans la spécialité :

Diplôme graduation Diplôme Post graduation Type


Nom, prénom Grade Emargement
+ Spécialité + Spécialité d’intervention *
Ingéniorat biochimie- Magister et Doctorat d’état
FAZOUANE Fethia Prof. Cours, TD, Encadrement
bactériologie appliquées en biochimie
DES Biochimie et Doctorat d’état en
RIBA Amar Prof. Cours et encadrement
microbiologie appliquée microbiologie
Magister en biochimie-
Cours, TP, TD,
KHEMILI Souad DES microbiologie microbiologie appliquées MC A Encadrement
Doctorat en bioinformatique
Magister en biochimie Cours, TP, TD,
RAHIM M.Z. DES biochimie MA A Encadrement
immunologie
Magister en biochimie- Cours, TP, TD,
AZZOUNE Nadia Ingénieur génie biologique MA A
microbiologie appliquées Encadrement
OURARI-HEDJEM Magister en biochimie et Cours, TP, TD,
DES physiologie animale MA A Encadrement
Amel biologie cellulaire humaine
Magister en biochimie et
OURARI-HADJEM Cours, TP, TD,
Ingénieur génie biologique biologie moléculaire et MA A
Amel Encadrement
cellulaire
Ingénieur contrôle de Magister en biochimie- Cours, TP, TD,
BOUDJEMA Khaled MA A Encadrement
qualité microbiologie appliquées
Magister en biochimie- Cours, TP, TD,
MAAMRI Sarra Ingénieur génie biologique MA A
microbiologie appliquées Encadrement
BELKHEIR Mimi Magister en biochimie-
Ingénieur génie biologique MA A , Encadrement
Belilia microbiologie appliquées
Magister en physiologie Cours, TP, TD,
AIT FELLA Radhia MA B
animale Encadrement
Doctorat en biologie Cours, TP, TD,
HAROUZ Habiba DES génétique MC B Encadrement
moléculaire
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Année universitaire : 2015/2016
Diplôme graduation Diplôme Post graduation Type
Nom, prénom Grade Emargement
+ Spécialité + Spécialité d’intervention *
Magister en biologie
LAHIANI Sadjia Licence sciences naturelles MA A Encadrement
moléculaire
Ingénieur en technologie Magister en technologie Cours, TP, TD,
AIT AMEUR Leila MA A
alimentaire alimentaire Encadrement
Magister en biochimie- Cours, TP, TD,
DAHMANI Mohamed DES biochimie MA A Encadrement
immunologie
NOREDDINE Fatima Magister en biochimie- Cours, TP, TD,
Zohra immunologie Encadrement

* = Cours, TD, TP, Encadrement de stage, Encadrement de mémoire, autre ( à préciser)

B : Encadrement Externe :

Etablissement de rattachement :

Diplôme graduation Diplôme Post graduation Type


Nom, prénom Grade Emargement
+ Spécialité + Spécialité d’intervention *

Etablissement de rattachement :

Diplôme graduation Diplôme Post graduation Type


Nom, prénom Grade Emargement
+ Spécialité + Spécialité d’intervention *

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 12


Année universitaire : 2015/2016
Etablissement de rattachement :

Diplôme graduation Diplôme Post graduation Type


Nom, prénom Grade Emargement
+ Spécialité + Spécialité d’intervention *

* = Cours, TD, TP, Encadrement de stage, Encadrement de mémoire, autre ( à préciser)

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Année universitaire : 2015/2016
5 – Moyens matériels spécifiques disponibles
A- Laboratoires Pédagogiques et Equipements : Fiche des équipements
pédagogiques existants pour les TP de la formation envisagée (1 fiche par laboratoire)

Intitulé du laboratoire : biochimie

N° Intitulé de l’équipement Nombre observations


Agitateur Magnétique 2
Bain Marie 1
Balance Analytique 1
Balance De Précision 1
Réfrigérateur 1
Fermenteur 1
Cuve D’électrophorèse Verticale 2
Etuve 2
Lecteur ELISA 1
Microscope 1
Ph Mètre 1
Plaque Chauffante 2
centrifugeuse Réfrigéré 1
Spiromètre 4
Appareil myographe 5
lyophilisateur 2
Hotte 1
Broyeur de Tissu 1
Lecteur Elecsys 1

Intitulé du laboratoire : immunologie

N° Intitulé de l’équipement Nombre observations


1 Spectrophotomètre 02
2 Centrifugeuse 02
3 Distillateur 02
4 HPLC 01
5 Spectrophotomètre à absorption atomique 01
6 Spectrophotomètre à Flamme 01
7 Microscope inversé 01
8 Hote à flux laminaire 02
9 Autoclave 01
10 Microtome 01
11 Microscope avec caméra intégrée 01
12 Stéréo microscope avec caméra intégrée 01
13 Balance de précision 01
14 Autoclave 01
15 Four à moufle 01

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Année universitaire : 2015/2016
16 Bain Marie 02
17 Ultra Centrifugeuse réfrigérée 01
18 Etuve bactériologique 01
19 Balance de précision 01
20 Stérilisateur 01
21 Polarimètre 01
22 pH mètre 03
23 Etuve réglable 01
24 Extracteur des lipides 01
25 ELISA 01
26 Cuve électrophorèse 02
27 PCR 01
28 Cytomètrie de flux 01
29 Chambre de culture 02
30 Bain Marie Agitateur 01
31 Plaque Chauffante 01

B- Terrains de stage et formation en entreprise :

Lieu du stage Nombre d’étudiants Durée du stage


Lieu du stage 04 04 mois
SAIDAL 04 04 mois
Institut Pasteur 04 04 mois
CRAPC 02 04 mois
LISMANN 02 04 mois
Hôpitaux 08 04 mois
INRA 02 04 mois

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Année universitaire : 2015/2016
C- Laboratoire(s) de recherche de soutien au master :

Chef du laboratoire
N° Agrément du laboratoire

Date :

Avis du chef de laboratoire :

Chef du laboratoire
N° Agrément du laboratoire

Date :

Avis du chef de laboratoire:

D- Projet(s) de recherche de soutien au master :

Intitulé du projet de Date du début Date de fin du


Code du projet
recherche du projet projet

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Année universitaire : 2015/2016
E- Espaces de travaux personnels et TIC :

Espaces de l’UMBB et des bibliothèques de l’UMBB (centrale, de la faculté


des sciences, de la faculté des sciences de l’ingénieur).

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Année universitaire : 2015/2016
II – Fiche d’organisation semestrielle des enseignements
(Prière de présenter les fiches des 4 semestres)

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Année universitaire : 2015/2016
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Année universitaire : 2015/2016
1- Semestre 1 :
VHS V.H hebdomadaire Mode d'évaluation
Unité d’Enseignement Coeff Crédits
14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen
UE fondamentales
UEF1(O/P) physiologie
45h00 1h30 1h30 - 55h00 2 4 40% 60%
cellulaire
UEF2(O/P) Bioénergétique,
voies métaboliques et sites de
contrôle
Matière 1 : Bioénergétique 45h00 1h30 1h30 - 55h00 2 4 40% 60%
Matière 2 : Voies
métaboliques et sites de 67h30 3h00 1h30 - 82h30 3 6 40% 60%
contrôle
UEF3(O/P) Physiologie et
biochimie des 45h00 1h30h 1h30 - 55h00 2 4 40% 60%
microorganismes
UE méthodologie
UEM1(O/P) Technique
d’analyse biochimiques et
de biospectroscopie

Matière 1 : techniques
45h00 1h30 - 1h30 55h00 2 4 40% 60%
d’extraction et purification
Matière 2 : Techniques de 3 5
60h00 1h30 1h30 65h00 40% 60%
biospectroscopie 1h00
UE découverte
UED1 (O/P) ) Analyse
45h00 1h30 1h30 - 5h00 2 2 40% 60%
d’articles I
UE transversales
UET1 (O/P)
Communication 22h30 1h30 - - 2h30 1 1 40% 60%
Total Semestre 1 375h00 13h30 9h00 2h30 375h00 17 30
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Année universitaire : 2015/2016
2- Semestre 2 :
VHS V.H hebdomadaire Mode d'évaluation
Unité d’Enseignement Coeff Crédits
14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen
UE fondamentales
UEF1 (O/P) Immunologie
67h30 3h00 1h30 - 82h30 3 6 40% 60%
appliquée
UEF2 (O/P) Applications
67h30 3h00 1h30 - 82h30 3 6 40% 60%
industrielles des fermentations
UEF3 (O/P) Dynamique
structurale des 67h30 3h00 1h30 - 82h30 3 6 40% 60%
macromolécules
UE méthodologie
UEM1 (O/P) Cytogénétique et
37h30 1h30 - 1h00 37h30 2 3 40% 60%
culture cellulaire
UEM(O/P) Bioinformatique
67h30 3h00 - 1h30 82h30 3 6 40% 60%
appliquée
UE découverte
UED1 (O/P) Aspects
biochimique et génétique de 45h00 1h30 1h30 - 5h00 2 2 40% 60%
l’évolution
UE transversales
UET1 (O/P) Législation 22h30 1h30 - - 2h30 1 1 40% 60%
Total Semestre 2 375h00 16h30 6h00 2h30 375h00 17 30

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Année universitaire : 2015/2016
3- Semestre 3 :
VHS V.H hebdomadaire Mode d'évaluation
Unité d’Enseignement Coeff Crédits
14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen
UE fondamentales
UEF1 (O/P) Biochimie
90h00 3h00 - 3h00 110h00 4 8 40% 60%
industrielle
UEF2 (O/P) Protéomique et
génomique
Matière 1 : Génomique 67h30 3h00 1h30 - 82h30 3 6 40% 60%
Matière2 : Protéomique 45h00 1h30 1h30 - 55h00 2 4 40% 60%
UE méthodologie
UEM1 (O/P: physicochimie
appliquée aux processus 45h00 1h30 - 1h30 55h00 2 4 40% 60%
biologiques
3 5
UEM2 (O/P: biostatistiques 60h00 1h30 1h30 1h00 65h00 40% 60%
UE découverte
UED1 (O/P) analyse
22h30 1h30 - - 2h30 1 1 - 100%
d’articles II
UE transversales
UET1 (O/P)
entreprenariat et gestion de
45h00 3h00 - - 5h00 2 2 - 100%
projet
Total Semestre 3 375h 15h00 4h30 6h00 45h30 17 30

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Année universitaire : 2015/2016
4- Semestre 4 :

Domaine : SNV
Filière : biologie
Spécialité : biochimie appliquée

Stage en entreprise sanctionné par un mémoire et une soutenance.

VHS Coeff Crédits


Travail Personnel 450h00 9 18
Stage en entreprise 175h00 5 7
Séminaires
Autre (préciser) 125h00 3 5
Total Semestre 4 375h00 17 30

5- Récapitulatif global de la formation : (indiquer le VH global séparé en cours,


TD, pour les 04 semestres d’enseignement, pour les différents types d’UE)

UE UEF UEM UED UET Total


VH
Cours 360h00 157h30 67h30 90 675h00
TD 202h30 45h00 45h00 - 292h30
TP 45h00 295 - - 340h00
Travail personnel 742h30 360 12h30 10 1125h00
Autre (préciser) - - 125h00 - 125h00
Total 1800h00 857h30 250h00 100h00 2432h30
Crédits 72 32 8 4 120
% en crédits pour
60% 27% 7% 3 ,33%
chaque UE

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 23


Année universitaire : 2015/2016
III - Programme détaillé par matière
(1 fiche détaillée par matière)

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 24


Année universitaire : 2015/2016
Intitulé du Master : biochimie appliquée
Semestre : 1
Intitulé de l’UEF1 :
Intitulé de la matière : Physiologie cellulaire
Crédits : 4
Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement : Approfondir les connaissances sur la physiologie cellulaire


notamment sur la mise en place de système de régulation responsables d’un contrôle coordonné des
grandes fonctions et de ses interactions avec son environnement.

Connaissances préalables recommandées : Physiologie cellulaire et biochimie cellulaire

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en


présentiel et du travail personnel)

I- Les techniques d’étude de la cellule


Les microscopes, les techniques de préparation conventionnelles, l’histochimie, les sondes
moléculaires, culture cellulaire, techniques de microdissections, les technique
d’ultracentrifugation, les techniques de diffraction cellulaire.

II- Etude des constituants des biomembranes


Structure de la membrane plasmique, composition biochimique, rapport de la membrane
plasmique avec la matrice extracellulaire, spécialisation de la membrane plasmique.

III- Communication et signalisation cellulaire


Les molécules de signalisation intercellulaire, les divers modes de communication
intercellulaire, les molécules d’adhérence cellulaire, les jonctions intercellulaires.

IV- Les cellules différenciées et la conservation des tissus.


Le renouvellement par simple duplication, renouvellement par des cellules souches,
renouvellement par les cellules multipotentes, genèse, modulation et régénération.

V- Les bases moléculaires et cellulaires de la physiopathologie


La stabilité du génome, le cycle cellulaire et l’appoptose, les gènes impliqués dans le cancer.

Le TD : exercices sur : les constituants des biomembranes, adhérence cellulaire, jonctions


cellulaires, exposés.

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à


l’appréciation de l’équipe de formation)

Références (biologie moléculaire de la cellule, biologie cellulaire, sites internet, etc).

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 25


Année universitaire : 2015/2016
Intitulé du Master : biochimie appliquée
Semestre : 1
Intitulé de l’UEF2 : Bioénergétique, voies métaboliques et sites de contrôle
Intitulé de la matière 1: bioénergétique
Crédits : 4
Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement : Donner des notions approfondies en bioénergétique qui sont régies
par des lois de conservation de l’énergie pour la compréhension du métabolisme énergétique.

Connaissances préalables recommandées : Thermodynamique,

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en


présentiel et du travail personnel)

I- Les différents types de métabolismes


II-Les différentes sources de carbone et d’énergie
III-Thermodynamique et cellule
IV-Oxydation cellulaire
V-Production d’énergie cellulaire, son utilisation et sa mise en réserve
VI-Equilibre énergétique

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à


l’appréciation de l’équipe de formation)

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 26


Année universitaire : 2015/2016
Intitulé du Master : biochimie appliquée
Semestre : 1
Intitulé de l’UEF2 : Bioénergétique, voies métaboliques et sites de contrôle
Intitulé de la matière 2 : voies métaboliques et sites de contrôles
Crédits : 6
Coefficients : 3

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en


présentiel et du travail personnel)

Objectifs de l’enseignement : Illustrer par des exemples précis l’interdépendance des grandes
voies métaboliques de la cellule au cours desquelles l'énergie obtenue est utilisée pour la synthèse
de métabolites et de diverses macromolécules.
Connaissances préalables recommandées : régulation métabolique, Bioénergétique

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en


présentiel et du travail personnel)

1.Métabolisme des glucides: digestion chimique, rappel sur les voies d‘oxydation et de mise en
réserve du glucose et la néoglucogenèse
- Formation des radicaux libres oxygénés et les réactions parasites de l’oxydation (notion de stress
oxydatif)
- Mécanismes de la régulation du métabolisme glucidique
2.Métabolisme des lipides : digestion chimique, rôleset interactions entre les principaux organes
impliqués dans le métabolisme lipidique(Rappels sur la lipogenèse/lipolyse et leur régulation)
- Métabolisme des lipoprotéines, sphingolipides et glycérophospholipides
- Métabolisme du cholestérol (synthèse et régulation, hypercholestérolémie, catabolisme et formation
des sels biliaires, synthèse de la vitamine D, synthèse des hormones stéroïdiennes)
- Voie semi-pathologique : Formation des corps cétoniques
3. Métabolisme des protéines :digestion chimique, catabolisme des acides aminés(Acides aminés
glucoformateur et cétogènes)
- Décarboxylation des acides aminés et formation des amines bioactifs
-Exemples de la synthèse de quelques dérivés d’acides aminés (gluthation, créatine……)
4.Métabolisme de certaines molécules complexes (glycosaminoglycannes, glycoprotéineset
porphyrines)
5. Interactions des voies métaboliques et régulation neuroendocrinienne du
métabolismeénergétique(axe hypothalamo-adenohypophysaire, Rôles de l’insuline, glucagon,
catécholamines, GH et les hormones thyroïdiennes dans l’état postprandial et de jeune)
6. Régulation du métabolisme phosphocalcique (calcitonine, parthormone, vit D…….)
7. Régulation de l’apport alimentaire
- À court terme (hormone du TD, ghreline, cck )
- À long terme (leptine, NPY, orexine)

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 27


Année universitaire : 2015/2016
Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à
l’appréciation de l’équipe de formation)

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 28


Année universitaire : 2015/2016
Intitulé du Master : Biochimie appliquée
Semestre : 1
Intitulé de l’UEF3 :
Intitulé de la matière : Physiologie et biochimie des microorganismes
Crédits : 4
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement : Remettre à niveau et approfondir les connaissances sur la
physiologie des champignons et parasites, notamment ceux qui sont impliqués dans des interactions
micro-organisme-hôte et ceux qui présentent un intérêt pour les biotechnologies
Connaissances préalables recommandées : Connaissances en Biologie et Physiologie des micro-
organismes eucaryotes : champignons et parasites.

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en


présentiel et du travail personnel)

Chapitre I
1. Nutrition et types trophiques
2. Croissance bactérienne (cinétique et paramètres de croissance)

Chapitre II
Le Métabolisme Microbien
1. Principe général
2. Voies métaboliques chez les microorganismes.
3. Le Catabolisme : Hydrolyse et Oxydation
4. Différents types de fermentations

Chapitre III
Propriétés des micro-organismes utilisés en biotechnologies
1. Propriétés morphologiques et physico-chimiques des micro-organismes
2. Propriétés physiologiques des micro-organismes:
2.1. Nutrition;
2.2. multiplication;
2.3. Mutations.

IV. Domaines d'application des microorganismes


1. Fermentations;
2. Production de biomasse;
3. Production de métabolites;
4. Bioconversions;
5. Epuration et biodégradation;

V . Les champignons et leur métabolisme


1. Rappel sur le mode de vie et la multiplication des champignons
2. Utilisation des moisissures en biotechnologies:
2.1. Production de biomasse;
Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 29
Année universitaire : 2015/2016
2.2. Production d'enzymes
2.3. production d'acides et d'alcools
2.4. Production d'arômes
2.5. Production d'antibiotiques et d'autres molécules d'intérêt
3. Les champignons pathogènes et toxinogènes:
Notions fondamentales et intérêts agroalimentaires

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à


l’appréciation de l’équipe de formation)

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Intitulé du Master : biochimie appliquée

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 30


Année universitaire : 2015/2016
Semestre : 1
Intitulé de l’UEM1 : Techniques d’analyses biochimiques et de biospectroscopie
Matière 1 :
Intitulé de la matière 1: Techniques d’analyses biochimiques
Crédits : 4
Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement : Ce module est destiné aux étudiants souhaitant acquérir la


connaissance d'outils performants en biochimie. Il est organisé de façon à placer l'étudiant dans des
conditions les plus proches possible du travail expérimental en laboratoire (sessions pratiques par
journées complètes, cahier de laboratoire,...). Ce module a aussi pour vocation de permettre aux
étudiants d’aborder un panel le plus exhaustif possible des méthodologies employées dans le
domaine de la biochimie.
Connaissances préalables recommandées : Analyses Biochimiques de bases, Biochimie
Structurale, Enzymologie.

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en


présentiel et du travail personnel)

I- Techniques d’extraction
-Tampons
-Extractions chimiques
-Extractions enzymatiques
-Extractions mécaniques

II- Purifications et analyse de molécules biologiques

II-1 -Techniques chromatographiques


- Chromatographie d’exclusion
- Chromatographie En phases inversées
- Chromatographie Sur échangeur d’ions
-Chromatographie d’affinité
- Chromatographie Gaz- liquide

II-2 -Techniques électro-phorétiques

- Electrophorèse en gel de polyacrylamide (PAGE)


- Electrofocalisation bidimensionnelle
- Immunoélectrophorèse
- Electrophorèse capillaire

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à


l’appréciation de l’équipe de formation)

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 31


Année universitaire : 2015/2016
Intitulé du Master : biochimie appliquée
Semestre : 1
Intitulé de l’UEM : Techniques d’analyses biochimiques et de biospectroscopie
Intitulé de la matière 2: techniques de biospectroscopie
Crédits : 5
Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement : Accroître les compétences de l'étudiant en ce qui concerne les


méthodes spectroscopiques disponibles pour l'étude de la dynamique conformationnelle des acides
nucléiques et de leurs interactions avec de petits ligands.

Connaissances préalables recommandées : Chimie, biochimie et propriétés fonctionnelles des


macromolécules biologiques des macromolécules.

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en


présentiel et du travail personnel)

1. La spectroscopie UV/visible (principe et Applications en biochimie : dosages, etude des


effets de l’environnement sur la structure/fonction)
2. La spectroscopie Vibrationnelle
-Spectroscopie d’absorption infrarouge (Principe, Analyse des spectres infrarouge et
identification des groupements fonctionnels, applications en biochimie)
- Diffusion Raman (principe, interprétation des spectres Raman, applications biochimiques)
3. La spectrométrie de masse (Principe, couplage aux techniques chromatographiques,
interprétation des spectres de masse, applications en biochimie analytique : contrôle
antidopage à partir de matrices biologiques, identification phytochimique)
4. La diffraction aux rayons x (principe, applications)
5. le dichroïsme circulaire
6. Spectrométrie a émission optique ICP-OES
8. Applications des sondes fluorescentes, imagerie en biologie

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à


l’appréciation de l’équipe de formation)

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 32


Année universitaire : 2015/2016
Intitulé du Master : biochimie appliquée
Semestre : 1
Intitulé de l’UE : UED
Intitulé de la matière : Analyse d’articles
Crédits : 2
Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement : familiariser l’étudiant à analyser un article s c i e n t i f i q u e ;


d’avoir la capacité de synthétiser l’essentiel d’un travail et se
familiariser à la recherche au niveau international, tant au niveau
de l’écrit que de l’oral, afin de fournir des bases suffisantes pour
permettre une progression autonome aux étudiants

Connaissances préalables recommandées : Avoir des connaissances en Anglais.

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en présentiel


et du travail personnel)

-Evaluation individuelle du niveau de l'étudiant, identification des


difficultés.
- Sé an ce d’a na ly se e t l ec tu re d’ ar ti cl es c ho is is .
-Séance de présentation d’articles choisis.
-Rédaction de résumes.

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à l’appréciation
de l’équipe de formation)

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 33


Année universitaire : 2015/2016
Intitulé du Master : biochimie appliquée
Semestre : 1
Intitulé de l’UE : UET
Intitulé de la matière : législations
Crédits : 1
Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement :
Analyser les objectifs de la communication interne et externe et preé senter les meé thodologies
neé cessaires pour conduire les principales actions de communication

Connaissances préalables recommandées


Les bases linguistiques

Compétences visées : Capaciteé de bien communiquer oralement et par eé crit


- Capaciteé de bien preé senter et de bien s’exprimer en public
- Capaciteé d’eé coute et d’eé change
- Capaciteé d’utiliser les documents professionnels de communication interne et externe
- Capaciteé de reé diger des documents professionnels de communication interne et externe

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en


présentiel et du travail personnel)
o Renforcement des compeé tences linguistiques
o Les meé thodes de la Communication
o Communication interne et externe
o Techniques de reé union
o Communication orale et eé crite

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à


l’appréciation de l’équipe de formation)

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 34


Année universitaire : 2015/2016
Intitulé du Master : biochimie appliquée
Semestre : 2
Intitulé de l’UE : UEF1
Intitulé de la matière : immunologie appliquée
Crédits : 6
Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement : Cet enseignement doit permettre aux étudiants d'acquérir les techniques
essentielles d'immunologie.

Connaissances préalables recommandées : Des connaissances en immunologie générale sont


nécessaires.
Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en
présentiel et du travail personnel)
1. Bases cellulaires du système immunitaire
2. Molécules membranaires et solubles de la réponse immunitaire innée
2.1. Récepteurs de la réponse immunitaire innée
2.2. Le système de complément
3. Molécules membranaires et solubles de la réponse immunitaire adaptative
3.1. Le complexe majeur d’histocompatibilité (CMH)
3.2. Récepteurs à l’antigène des cellules de réponse immunitaire adaptative
4. Mécanisme cellulaires et moléculaires de la réponse immunitaire
4.1. Mécanisme cellulaires et moléculaires de la réponse immunitaire innée
4.2. Mécanisme cellulaires et moléculaires de la réponse immunitaire adaptative
5. Immunotechnologie
5.1. Immunoélectrophorèse et applications
5.2. Immunodiffusion radiale et applications
5.3. Immunodiffusion double et applications
5.4. Agglutination et applications
5.5. ELISA et applications
5.6. Western blot et applications
5.7. Immunofluorescence et applications
5.8. Radio immunologie et applications
5.9. Immunothérapie appliqué
5.10. Cytométrie en flux et applications
5.11. Anticorps de synthèse et leurs applications

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à


l’appréciation de l’équipe de formation)

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 35


Année universitaire : 2015/2016
Intitulé du Master : biochimie appliquée
Semestre : 2
Intitulé de l’UE : UEF2
Intitulé de la matière : Applications industrielles des fermentations
Crédits : 6
Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement : Ce cours permet de donner aux étudiants des connaissances relatives
aux procédés de fabrications des différents métabolites primaires et secondaires par fermentations.

Connaissances préalables recommandées : Biochimie, Microbiologie.

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en présentiel


et du travail personnel)

- Rôle des dans l’industrie alimentaire


- Les produits industriels issus de microorganismes (enzymes, antibiotiques, vitamines et
biocarburant…………….)
1. Microorganismes à intérêt industriel
Rappel et Principe général
- Rôle des dans l’industrie alimentaire
- Les produits industriels issus de microorganismes (enzymes, antibiotiques, vitamines et
biocarburant…………….)
- Les microorganismes en tant que produit industriel

2. Industries alimentaire et diverses


Principaux acides organiques produits par fermentation
Principaux acides aminés produits par fermentation
Principaux biopolymères produits par fermentation
Principales vitamines produites par fermentation
Principaux ferments pour l’industrie laitière et fromagère
Principales levures et leurs applications dans le secteur de l’alimentation
3. Industries chimique et pharmaceutique
Principaux antibiotiques produits par fermentation
Principales protéines d’intérêt pharmaceutique produites
par des micro-organismes à ADN recombiné
Quelques produits pharmaceutiques nécessitant une étape de fermentation
4. Autres industries
Principaux biopesticides produits par fermentation

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à


l’appréciation de l’équipe de formation)

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 36


Année universitaire : 2015/2016
Intitulé du Master : biochimie appliquée
Semestre : 2
Intitulé de l’UE : UEF3
Intitulé de la matière : Dynamique structurale des macromolécules
Crédits : 6
Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement

Ce module aborde les connaissances approfondies sur les phénomènes dynamiques qui
entraînent ou impliquent, au moins transitoirement, une modification de la structure
interne des molécules. L’étude de la dynamique d’assemblage des macromolécules
biologiques ainsi que l’analyse de leurs structure et leurs interactions constituent les grands domaines
émergents en biologie

Connaissances préalables recommandées : Biochimie structurale, Biophysique

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en


présentiel et du travail personnel)

I- Relations structure-fonction des protéines et des acides nucléiques


II- Dynamique des protéines et des acides nucléiques
III. Enzymologie moléculaire et biocatalyse ; protéines : repliement, protéines membranaires et

complexes multi protéiques

IV. Biocristallographie

méthodes spectrales : infrarouge,

dichroisme circulaire

Diffusion RAMAN/Diffusion des rayons X

RMN des macromolécules.

V. Ingénierie des protéines in silico

Programme de TD :

- Exercices sur les structures secondaires, tertiaires et quaternaires des protéines

- Exercices sur les structures des acides nucléiques et leur hydrolyse enzymatique

- Exercices sur les protéines membranaires

- Exercices sur RMN et RX

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 37


Année universitaire : 2015/2016
-

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à


l’appréciation de l’équipe de formation)

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 38


Année universitaire : 2015/2016
Intitulé du Master : biochimie appliquée
Semestre : S2
Intitulé de l’UEM :
Intitulé de la matière 1 : Cytogénétique et culture cellulaire
Crédits : 3
Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement : Connaissance des différentes techniques en


cytogénétique moléculaire et leurs applications en cartographie du génome et en
diagnostic

Connaissances préalables recommandées :


1. Connaissance des différentes techniques en cytogénétique moléculaire et leurs
applications en cartographie du génome et en diagnostic.
2. Appréhender l'ensemble des concepts théoriques nécessaires à la réalisation de la
culture cellulaire Comprendre l’ensemble des paramètres qui influencent la culture
cellulaire afin de répondre de manière adéquate aux différents éléments qui peuvent
influencer le rendement de croissance des cultures.
3. Utiliser la culture cellulaire comme moyen d’analyse cytogénétique.

Contenu de la matière : Cytogénétique et culture cellulaire


1. Cytogénétique
- Chromosome : organisation, anomalie chromosomique, conséquences des
anomalies chromosomiques.
- Les techniques d’études : le caryotype, cytogénétique moléculaire (différents types
de sondes utilisés, principales applications de l’hybridation in situ).
- Interprétation du caryotype : cytogénétique conventionnelle, cytogénétique
moléculaire.
2. Culture cellulaire
- Introduction/Définitions/Historique
- Les modalités d’obtention des cellules (à partir des cellules en suspension,
d’explants entiers, d’explants dissociés) ;
- Les systèmes cellulaires (culture primaire, lignées cellulaires, hybridomes, cellules
souches, banques de cellules) ;
- Les systèmes de culture (culture d’organes, d’explants, de cellules,
organotypique) ;
- La culture de cellules (la culture des cellules en suspension, de cellules
adhérentes, en monocouche, en trois dimensions) ;
- Les conditions de culture ;
- Les milieux de culture
- La culture à l’échelle industrielle.
Mode d’évaluation : Contrôle continu + Examens
Références :
1. Petit, J.-M. (2006)- Biologie cellulaire et moléculaire: cours et questions de révision,
Dunod.
2. Descamps, M.-C. (2006)- Biologie cellulaire PCEM1 : cours, exercices, annales et
QCM corrigés, Ed. Science internationale
3. Petit, J.-M. (2002)- Biologie cellulaire, Dunod
Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 39
Année universitaire : 2015/2016
4. Petit, J.-M. (2001)- Biologie cellulaire : DEUG, PCEM, Prépas, CAPES, Dunod

Intitulé du Master : biochimie appliquée


Semestre : 2
Intitulé de l’UEM :
Intitulé de la matière : Bioinformatique appliquée
Crédits : 6
Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement : L'objectif de cet enseignement est de fournir les bases indispensables


pour   comprendre   les   principes   gouvernants   sur   les   recherche   bioinformatique,   analyse   des
séquences de biomolécules et sur les techniques de modélisation moléculaire, et les interactions
protéine­protéine / protéine­ligand. 

Connaissances préalables recommandées : Biochimie, biologie moléculaire.

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en


présentiel et du travail personnel)

I­ Introduction à la Bioinformatique 

II­Recherche dans les bases et les banques de données 

II­Analyse de Séquences de biomolécules

- Introduction

- Alignement de séquences 

IV­ Structures de protéines 

- Prédiction de la structure secondaire et tertiaire des protéines

- Prédiction de la structure de complexes protéiques et protéine­ligand 

V­ Expression de gènes et modélisation 

VI­ Modélisation de systèmes biochimiques 

- Processus de modélisation 

- Modèle différentiel 

- Modélisation stochastique

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à


l’appréciation de l’équipe de formation)

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 40


Année universitaire : 2015/2016
Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Intitulé du Master : biochimie appliquée


Semestre : 2
Intitulé de l’UED :
Intitulé de la matière : Aspects génétiques et biochimiques de l’évolution
Crédits : 2
Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement : Faire prendre conscience aux étudiants de l'importance de


l'évolution. Le cours révèle les mécanismes de l'évolution et montre la diversification des
macromolécules ainsi que des voies du métabolisme secondaire. Les méthodes de reconstruction de
l'évolution des macromolécules et leur intérêt fondamental sont évoqués de manière à éveiller le
sens critique des étudiants.

Connaissances préalables recommandées : Des connaissances de base en génétique et biochimie


sont nécessaires.

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en


présentiel et du travail personnel)

I- Introduction à l’évolution biologique : les différentes théories de l’évolution

II- Evolution des macromolécules (rôle fonctionnel des acides aminés et des nucléotides)

IIl- Notion de population (Fréquences phénotypiques, fréquence génotypiques et fréquences


géniques ou alléliques, L’équilibre de Hardy-Weinberg).

IV- Facteurs génétiques de l'évolution (mutations, migration et le flux génique,


sélection naturelle, dérive génétique, consanguinité et homogamie)

V- Utilisation des séquences d'acides aminés ou de nucléotides pour la reconstitution de


l'évolution

VI- Mécanismes contribuant à la spéciation

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à


l’appréciation de l’équipe de formation)

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 41


Année universitaire : 2015/2016
Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Intitulé du Master : biochimie appliquée


Semestre 2:
Intitulé de l’UET :
Intitulé de la matière : Législations
Crédits : 1
Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement
Initier l’apprenant aux notions reé glementaire, les deé finitions et origines des textes de loi et les
connaissances des conseé quences peé nales.

Connaissances préalables recommandées


Ensembles des contenus de la formation

Compétences visées :
o Capaciteé aà lire et comprendre un texte de loi
o Capaciteé aà appliquer une reé glementation

Contenu de la matière :

 Notions geé neé rales sur le droit (introduction au droit, droit peé nal).
 Preé sentation de leé gislation algeé rienne (www.joradp.dz, reé feé rences des textes).
 Reà glementation geé neé rale (loi sur la protection du consommateur, hygieà ne, eé tiquetage
et information, additifs alimentaires, emballage, marque, innocuiteé , conservation).
 Reà glementation speé cifique (travail personnel, exposeé s).
 Organismes de controô le (DCP, CACQUE, bureau d’hygienne, ONML).
 Normalisation et accreé ditation (IANOR, ALGERAC).
 Normes internationales (ISO, codex alimentarius, NA, AFNOR)

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à


l’appréciation de l’équipe de formation)

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 42


Année universitaire : 2015/2016
Intitulé du Master : biochimie appliquée
Semestre : 3
Intitulé de l’UEF1 :
Intitulé de la matière : biochimie industrielle
Crédits : 8
Coefficients : 4

Objectifs de l’enseignement : L'objectif est de donner une formation générale dans le domaine
choisi mais également d'approfondir les connaissances et le savoir-faire des étudiants dans un
domaine plus spécialisé soit dans le domaine des Industries alimentaires, soit dans le domaine des
Industries biochimiques, soit dans le domaine de la Biotechnologie pharmaceutique.

Connaissances préalables recommandées : Enzymologie, Génie biochimique.

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en


présentiel et du travail personnel)

I- Rappels sur les enzymes :


- Purification des enzymes
-Catalyse enzymatique
II- Enzymes et technologies appliquées :
- Enzymes et lessives en poudre
-Transformation enzymatique de l’amidon
-Les édulcorants dérivés de l’amidon
- Enzymes et fabrication de la cellulose et du papier
- Enzymes et fabrication du pain
- Enzymes et transformation du cuir et des textiles
-Enzymes et fabrication des produits laitiers
III- Enzymes et applications analytiques

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à


l’appréciation de l’équipe de formation)

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 43


Année universitaire : 2015/2016
Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Intitulé du Master : biochimie appliquée


Semestre 3:
Intitulé de l’UEF2 : Génomique et protéomique
Intitulé de la matière1 : génomique
Crédits : 6
Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement. Offrir aux étudiants une solide connaissance des propriétés
structurales et fonctionnelles des macromolécules biologiques avec l’approche génomique : Le
génome, sa structure et son environnement cellulaire, Centromères et télomères

Connaissances préalables recommandées : Biologie moléculaire, biochimie structurale.

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en


présentiel et du travail personnel)

I- La génomique structurale
- Rappels et définitions des principaux types de gènes
- Les marqueurs génétiques
- Les éléments génétiques mobiles
- Identification et cartographie de tous les gènes d’un génome par séquençage
- Le projet du génome Humain (PGH)
- Le séquençage à haut débit
- Annotation de la séquence
II- Les objectifs de la génomique
III- La génomique fonctionnelle
- Classement des gènes et identification de leurs fonctions
- La stratégie pour attribuer une fonction a un gène inconnu.
- Manipulation génétique chez les organismes models
- La génétique classique
- La génétique inverse
- Les ARN interférents
IV - La génomique comparative
- La découverte de nouveaux gènes par la génomique comparative
- La génomique comparative et les organismes modèles
- La génomique comparative des récepteurs nucléaires et le développement d'agents
thérapeutiques
IV- Les différentes approches méthodologiques en génomique fonctionnelles
- Développement d’approches systématique pour l’analyse fonctionnelle de familles de gènes
Le TD : exercices : sur la génomique structurale et fonctionnelle.
Etudier les articles qui traites des problématiques sur la génomique structurale et fonctionnelle.

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 44


Année universitaire : 2015/2016
Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à
l’appréciation de l’équipe de formation)
Références la génétique, principes de biologie moléculaire en biologie clinique, sites
internet, etc).

Intitulé du Master : biochimie appliquée


Semestre 3:
Intitulé de l’UEF2 : Génomique et protéomique

Intitulé de la matière 2: protéomique


Crédits : 4
Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement : Offrir aux étudiants une solide connaissance des propriétés
structurales et fonctionnelles des macromolécules biologiques avec l’approche protéomique :
Méthodes d’études des complexes multiprotéiques impliqués dans l’expression des gènes.
Formation approfondie dans l'utilisation de l'approche protéomique pour l'identification des
interactions entre protéines, la recherche de marqueurs précoces dans le domaine de la santé. Ou
l'annotation des génomes.

Connaissances préalables recommandées : Biologie moléculaire, bioinformatique, Biochimie


structurale.

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en


présentiel et du travail personnel)

I- L'extraction des protéines et électrophorèse bidimentionnelle

II- Principe de l'analyse protéomique par spectrométrie de masse

III- Identification des protéines par des méthodes bioinformatiques


IV-Initiation à la recherche dans les banques de données
V- Nano-LC et quantification des protéines
VI- Recherche de bio-marqueurs en cancérologie, des protéines impliquées dans les voies de
transduction des signaux, et cibles de médicaments.
VII. La métabolomique

Programme TD :
- Exercices sur les séquences des protéines
- Exercices sur les méthodes de purification des protéines
- Exercices sur l’électrophorèse 2D-PAGE et 2D-DIGE
- Exercices sur la spectrométrie de masse et sur la quantification des protéines (technique

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 45


Année universitaire : 2015/2016
ICAT)

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à


l’appréciation de l’équipe de formation)

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).


Intitulé du Master : biochimie appliquée
Semestre 3 :
Intitulé de l’UEM1 :
Intitulé de la matière : Physico-chimie Appliquée aux Processus Biologiques
Crédits : 4
Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement Approfondir les connaissances des notions de base de la physico-


chimie nécessaires à la compréhension des processus chimiques, biochimiques et biologiques régis
par les interactions intermoléculaires, la thermodynamique, la cinétique, les propriétés des
interfaces et les phénomènes de transport

Connaissances préalables recommandées Connaissances en physico-chimie permettant la


compréhension des processus biochimiques et biologiques avec pour objectif, en particulier, une
meilleure pratique au laboratoire.

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en


présentiel et du travail personnel)

Nombre de crédits enseignements :

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 46


Année universitaire : 2015/2016
I- Des atomes aux structures biomoléculaires

II-Thermodynamique chimique et biochimique

III- Transferts de protons et d'électrons en milieu biologique

VI- Mouvements moléculaires et propriétés de transport

V- Phénomènes interfaciaux

VI- Cinétique des processus chimiques et biologiques

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à


l’appréciation de l’équipe de formation)

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Intitulé du Master : biochimie appliquée


Semestre : 3
Intitulé de l’UEM2 :
Intitulé de la matière : Biostatistiques
Crédits : 5
Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement :
Pouvoir décrire les principales caractéristiques d'une matrice de données multivariées, d'en définir
de façon pertinente des grands groupes, d'analyser de tels matrices ou tableaux de données et de
décrire les relations entre ces variables à l'aide de modèles linéaires et non linéaires (exponentiels,
Bêta, Gamma par exemple) adaptés aux besoins des généticiens, des immunologistes et des
biologistes.

Connaissances préalables recommandées : Avoir des connaissances en outil statistique.

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en


présentiel et du travail personnel)

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 47


Année universitaire : 2015/2016
I-Analyses de variances à deux facteurs (ou plus) Croisées (interaction des effets des facteurs)
II-Hiérarchisées (inclusion des effets d'un facteur dans l'autre)
III-Corrélation et régression linéaire.
IV-Régression non linéaire (modèles logistiques, exponentiel, Monod, Beta, Gamma É).
V-Analyses multivariées (Analyse en composantes principales).
VI-Classification hiérarchique ascendante.
VII-Interprétation d’une analyse expérimentale.

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à


l’appréciation de l’équipe de formation)

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Intitulé du Master : biochimie appliquée


Semestre 3:
Intitulé de l’UED :
Intitulé de la matière : Analyse d’articles II
Crédits : 1
Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement
: familiariser l’étudiant à analyser un article s c i e n t i f i q u e ;
d’avoir la capacité de synthétiser l’essentiel d’un travail et se
familiariser à la recherche au niveau international, tant au niveau
de l’écrit que de l’oral, afin de fournir des bases suffisantes pour
permettre une progression autonome aux étudiants

Connaissances préalables recommandées : Avoir des connaissances en Biochimie Anglais.

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en


présentiel et du travail personnel)

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 48


Année universitaire : 2015/2016
-Evaluation individuelle du niveau de l'étudiant, identification des
difficultés.
-Séance d’analyse et lecture d’articles choisis.
-Séance de présentation d’articles choisis.
-Rédaction de résumes.
-séminaires suivis de discussions avec le conférencier.
-Evaluation de fin de stage et découverte des outils de travail en
autonomie.
Mode d’évaluation :

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à


l’appréciation de l’équipe de formation)

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Intitulé du Master : biochimie appliquée


Semestre 3:
Intitulé de l’UET : UET
Intitulé de la matière : Entreprenariat et gestion de projet
Crédits : 2
Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement
Initier l’apprenant au montage de projet, son lancement, son suivi et sa reé alisation.

Connaissances préalables recommandées


Ensembles des contenus de la formation

Compétences visées :
o Compreé hension de l’organisation et de fonctionnement d’une entreprise
o Capaciteé aà monter un projet de creé ation d’entreprise

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 49


Année universitaire : 2015/2016
o lancer et aà geé rer un projet
o Capaciteé aà travailler meé thodiquement
o Capaciteé aà planifier et de respecter les deé lais
o Capaciteé aà travailler en eé quipe
o Capaciteé d’eô tre reé actif et proactif
o Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme
en présentiel et du travail personnel)

1. L’entreprise et gestion d’entreprise


o Deé finition de l’entreprise
o L’organisation d’entreprise
o Gestion des approvisionnements :
- Gestion des achats,
- Gestion des stocks
- Organisation des magasins
o Gestion de la production :
- Mode de production,
- Politique de production
o Gestion commerciale et Marketing :
- Politique de produits,
- Politique de prix,
- Publiciteé ,
- Techniques et eé quipe de vente
2. Montage de projet de création d’entreprise
o Deé finition d’un projet
o Cahier des charges de projet
o Les modes de financement de projet
o Les diffeé rentes phases de reé alisation de projet
o Le pilotage de projet
o La gestion des deé lais
o La gestion de la qualiteé
o La gestion des couô ts
o La gestion des taô ches
Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à
l’appréciation de l’équipe de formation)

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 50


Année universitaire : 2015/2016
Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 51
Année universitaire : 2015/2016
Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 52


Année universitaire : 2015/2016
V- Accords ou conventions

Oui

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 53


Année universitaire : 2015/2016
NON X

(Si oui, transmettre les accords et/ou les conventions dans le dossier papier
de la formation)

LETTRE D’INTENTION TYPE

(En cas de master coparrainé par un autre établissement universitaire)

(Papier officiel à l’entête de l’établissement universitaire concerné)

Objet : Approbation du coparrainage du master intitulé :

Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 54


Année universitaire : 2015/2016
Par la présente, l’université (ou le centre universitaire) déclare
coparrainer le master ci-dessus mentionné durant toute la période d’habilitation de ce
master.

A cet effet, l’université (ou le centre universitaire) assistera ce projet en :

- Donnant son point de vue dans l’élaboration et à la mise à jour des programmes
d’enseignement,
- Participant à des séminaires organisés à cet effet,
- En participant aux jurys de soutenance,
- En œuvrant à la mutualisation des moyens humains et matériels.

SIGNATURE de la personne légalement autorisée :

FONCTION :

Date :

LETTRE D’INTENTION TYPE

(En cas de master en collaboration avec une entreprise du secteur


utilisateur)

(Papier officiel à l’entête de l’entreprise)

OBJET : Approbation du projet de lancement d’une formation de master intitulé :

Dispensé à :
Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 55
Année universitaire : 2015/2016
Par la présente, l’entreprise déclare sa volonté de
manifester son accompagnement à cette formation en qualité d’utilisateur potentiel du
produit.

A cet effet, nous confirmons notre adhésion à ce projet et notre rôle consistera à :

- Donner notre point de vue dans l’élaboration et à la mise à jour des programmes
d’enseignement,
- Participer à des séminaires organisés à cet effet,
- Participer aux jurys de soutenance,
- Faciliter autant que possible l’accueil de stagiaires soit dans le cadre de mémoires
de fin d’études, soit dans le cadre de projets tuteurés.

Les moyens nécessaires à l’exécution des tâches qui nous incombent pour la réalisation
de ces objectifs seront mis en œuvre sur le plan matériel et humain.

Monsieur (ou Madame)…………………….est désigné(e) comme coordonateur externe de


ce projet.

SIGNATURE de la personne légalement autorisée :

FONCTION :

Date :

CACHET OFFICIEL ou SCEAU DE L’ENTREPRISE

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Année universitaire : 2015/2016

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