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el 1 de agosto Enter a gene, protein, metabolite or pathway... Búsqueda rápida de genes
Buscando en la base de datos de MetaCyc change organism
Resumen:
antecedentes generales
https://metacyc.org/META/new-image?type=PATHWAY&object=PWY-5486 1/4
27/9/2018 Fermentación de piruvato MetaCyc a etanol II
Esta vía describe una fermentación de piruvato a etanol , una vía natural común que también se utiliza para la generación
de bebidas alcohólicas y panes.
La enzima piruvato descarboxilasa (PDC) cataliza el paso clave de esta vía. Esta enzima es común en plantas superiores
y hongos, pero es rara en procariotas y está completamente ausente en animales [ Candy98 ]. Los únicos procariotas en
los que se ha confirmado la actividad de PDC (desde 2007) son Zymomonas mobilis , Clostridium ventriculi , Clostridium
botulinum , especies de Acetobacter y Erwinia amylovora .
esconder
Mientras que la vía es conocida principalmente por su aparición en la levadura, también es común en las plantas MetaCyc
superiores en condiciones de privación de oxígeno causada por inundaciones (véase la degradación de la sacarosa II
Camino:
(sacarosa sintasa) ).
fermentación de piruvato a
Superpathways: superwayway de la degradación anaeróbica de la sacarosa , superwayway de la fermentación ( etanol II
Chlamydomonas reinhardtii )
OPERACIONES
Variantes: degradación de acetileno , de fermentación heteroláctica , hexitol fermentación a lactato, formiato, etanol y acetato , Personalizar o superponer datos de
la fermentación de ácido mixto , la fermentación de piruvato a etanol I , piruvato de fermentación a etanol III Omics en el diagrama de ruta
Generar el collage Pathway
Créditos:
Creado el 21 de febrero de 2007 por Caspi R , SRI International Descargar Genes
BioPax Nivel 2
BioPax Nivel 3
Referencias Operaciones de comparación
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Candy98 : Candy JM, Duggleby RG (1998). "Estructura y propiedades de piruvato descarboxilasa y mutagénesis de datos
dirigida a sitio de la enzima Zymomonas mobilis". Biochim Biophys Acta 1385 (2); 323-38. PMID: 9655927
Cambiar organismos / bases de
datos para operaciones de
Dey97 : Dey, PM, Harborne, JB "Plant Biochemistry". Academic Press 1997.
comparación
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Otras referencias relacionadas con enzimas, genes, vías secundarias y sustratos de esta vía bases de datos
Comparación de especies
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Atteia03 : Atteia A, van Lis R, Mendoza-Hernández G, Henze K, Martin W, Riveros-Rosas H, González-Halphen D (2003).
"Aldehído bifuncional / alcohol deshidrogenasa (ADHE) en las mitocondrias de algas clorofíticas". Plant Mol Biol
53 (1-2); 175-88. PMID: 14756315
Bennetzen82: Bennetzen JL, Hall BD (1982). "The primary structure of the Saccharomyces cerevisiae gene for alcohol
dehydrogenase." J Biol Chem 257(6);3018-25. PMID: 6277922
Bindschedler05: Bindschedler LV, Wheatley E, Gay E, Cole J, Cottage A, Bolwell GP (2005). "Characterisation and
expression of the pathway from UDP-glucose to UDP-xylose in differentiating tobacco tissue." Plant Mol Biol
57(2);285-301. PMID: 15821883
Boer03: Boer VM, de Winde JH, Pronk JT, Piper MD (2003). "The genome-wide transcriptional responses of
Saccharomyces cerevisiae grown on glucose in aerobic chemostat cultures limited for carbon, nitrogen,
phosphorus, or sulfur." J Biol Chem 278(5);3265-74. PMID: 12414795
https://metacyc.org/META/new-image?type=PATHWAY&object=PWY-5486 2/4
27/9/2018 Fermentación de piruvato MetaCyc a etanol II
Brown73: Brown AT, Patterson CE (1973). "Ethanol production and alcohol dehydrogenase activity in Streptococcus
mutans." Arch Oral Biol 18(1);127-31. PMID: 4513107
Catalanotti12: Catalanotti C, Dubini A, Subramanian V, Yang W, Magneschi L, Mus F, Seibert M, Posewitz MC, Grossman AR
(2012). "Altered fermentative metabolism in Chlamydomonas reinhardtii mutants lacking pyruvate formate lyase
and both pyruvate formate lyase and alcohol dehydrogenase." Plant Cell 24(2);692-707. PMID: 22353371
Chae11: Chae, Lee (2011). "The functional annotation of protein sequences was performed by the in-house Ensemble esconder
Enzyme Prediction Pipeline (E2P2, version 1.0). E2P2 systematically integrates results from three molecular MetaCyc
function annotation algorithms using an ensemble classification scheme. For a given genome, all protein
Camino:
sequences are submitted as individual queries against the base-level annotation methods. The individual
fermentación de piruvato a
methods rely on homology transfer to annotate protein sequences, using single sequence (BLAST, E-value cutoff
<= 1e-30, subset of SwissProt 15.3) and multiple sequence (Priam, November 2010; CatFam, version 2.0, 1% FDR etanol II
profile library) models of enzymatic functions. The base-level predictions are then integrated into a final set of OPERACIONES
annotations using an average weighted integration algorithm, where the weight of each prediction from each
individual method was determined via a 0.632 bootstrap process over 1000 rounds of testing. The training and Personalizar o superponer datos de
testing data for E2P2 and the BLAST reference database were drawn from protein sequences with experimental Omics en el diagrama de ruta
support of existence, compiled from SwissProt release 15.3." Generar el collage Pathway
Descargar Genes
Cheraiti08: Cheraiti N, Sauvage FX, Salmon JM (2008). "Acetaldehyde addition throughout the growth phase alleviates
the phenotypic effect of zinc deficiency in Saccharomyces cerevisiae." Appl Microbiol Biotechnol 77(5);1093-109. BioPax Nivel 2
PMID: 17938904 BioPax Nivel 3
Operaciones de comparación
Clark89: Clark DP (1989). "The fermentation pathways of Escherichia coli." FEMS Microbiol Rev 1989;5(3);223-34. PMID: Mostrar este camino en otra base
2698228 de datos
Cambiar organismos / bases de
Dennis84: Dennis ES, Gerlach WL, Pryor AJ, Bennetzen JL, Inglis A, Llewellyn D, Sachs MM, Ferl RJ, Peacock WJ (1984).
datos para operaciones de
"Molecular analysis of the alcohol dehydrogenase (Adh1) gene of maize." Nucleic Acids Res 12(9);3983-4000. PMID: comparación
6328449
Buscar este camino en otras
Dickinson00: Dickinson JR, Harrison SJ, Dickinson JA, Hewlins MJ (2000). "An investigation of the metabolism of bases de datos
isoleucine to active Amyl alcohol in Saccharomyces cerevisiae." J Biol Chem 275(15);10937-42. PMID: 10753893 Comparación de especies
Dickinson03: Dickinson JR, Salgado LE, Hewlins MJ (2003). "The catabolism of amino acids to long chain and complex
alcohols in Saccharomyces cerevisiae." J Biol Chem 278(10);8028-34. PMID: 12499363
Dickinson98: Dickinson JR, Harrison SJ, Hewlins MJ (1998). "An investigation of the metabolism of valine to isobutyl
alcohol in Saccharomyces cerevisiae." J Biol Chem 273(40);25751-6. PMID: 9748245
Drewke88: Drewke C, Ciriacy M (1988). "Overexpression, purification and properties of alcohol dehydrogenase IV from
Saccharomyces cerevisiae." Biochim Biophys Acta 950(1);54-60. PMID: 3282541
Fauchon02: Fauchon M, Lagniel G, Aude JC, Lombardia L, Soularue P, Petat C, Marguerie G, Sentenac A, Werner M, Labarre
J (2002). "Sulfur sparing in the yeast proteome in response to sulfur demand." Mol Cell 9(4);713-23. PMID:
11983164
Feldmann94: Feldmann H, Aigle M, Aljinovic G, Andre B, Baclet MC, Barthe C, Baur A, Becam AM, Biteau N, Boles E (1994).
"Complete DNA sequence of yeast chromosome II." EMBO J 13(24);5795-809. PMID: 7813418
https://metacyc.org/META/new-image?type=PATHWAY&object=PWY-5486 3/4
27/9/2018 Fermentación de piruvato MetaCyc a etanol II
Flikweert96: Flikweert MT, Van Der Zanden L, Janssen WM, Steensma HY, Van Dijken JP, Pronk JT (1996). "Pyruvate
decarboxylase: an indispensable enzyme for growth of Saccharomyces cerevisiae on glucose." Yeast 12(3);247-
57. PMID: 8904337
Flikweert99: Flikweert MT, de Swaaf M, van Dijken JP, Pronk JT (1999). "Growth requirements of pyruvate-decarboxylase-
negative Saccharomyces cerevisiae." FEMS Microbiol Lett 174(1);73-9. PMID: 10234824
Ganzhorn87: Ganzhorn AJ, Green DW, Hershey AD, Gould RM, Plapp BV (1987). "Kinetic characterization of yeast esconder
alcohol dehydrogenases. Amino acid residue 294 and substrate specificity." J Biol Chem 262(8);3754-61. PMID: MetaCyc
3546317
Camino:
Gerlach82: Gerlach WL, Pryor AJ, Dennis ES, Ferl RJ, Sachs MM, Peacock WJ (1982). "cDNA cloning and induction of the fermentación de piruvato a
alcohol dehydrogenase gene (Adh1) of maize." Proc Natl Acad Sci U S A 79(9);2981-2985. PMID: 16593188 etanol II
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Please cite the following article in publications resulting from the use of MetaCyc: Caspi et al, Nucleic Acids Research 42:D459- Generar el collage Pathway
D471 2014 Descargar Genes
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BioPax Nivel 3
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Comparación de especies
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