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201103 – BIOQUÍMICA
MEDELLÍN
Mayo, 2019
1
1. ASPECTOS DE PROPIEDAD INTELECTUAL Y VERSIONAMIENTO
2
Este documento se puede copiar, distribuir y comunicar públicamente
bajo las condiciones siguientes:
3
2. INDICE DE CONTENIDO
Pág.
3. Características generales 5
4. Descripción de prácticas 9
5. Anexos 60
4
3. Características generales
5
El diseño de este manual de laboratorio se realizó con
el propósito de complementar y correlacionar los
conceptos teóricos con los resultados experimentales
del curso de bioquímica de la cadena de ciencias
básicas, tecnología e ingeniería de la Universidad
Nacional Abierta y a Distancia. Este protocolo consta
de 5 prácticas que integran los temas de las tres
unidades temáticas del curso.
Propósito:
Objetivo general:
6
Meta:
Competencia:
7
Curso Evaluado
por proyecto SI___ NO_X_
8
4. DESCRIPCIÓN DE PRÁCTICAS
Objetivo general.
Competencia.
9
Fundamentación Teórica
Normas Personales
10
Recomendaciones generales en la operación segura de los productos
químicos en el laboratorio.
Normas de emergencia
Descripción de la práctica.
Equipos
Seguridad Industrial
Metodología
12
Procedimiento.
Sistema de Evaluación
14
NOTA: Recuerde que el pre informe es individual y el informe en grupo
de máximo 4 estudiantes( de acuerdo como el tutor de componente
práctico indique durante el desarrollo del mismo).
Rúbrica de evaluación
La evaluación estará a cargo de los tutores de laboratorio siguiendo la
Guía y Rúbrica de Evaluación de la tarea 4 – componente practico.
Realimentación
15
4.2. Práctica No. 2. Identificación de Lípidos
Tipo de practica
Presencial X Autodirigida Remota
Porcentaje de 15%
evaluación
Horas de la practica Dos
Temáticas de la Ácidos nucleicos (estructura, función y
práctica propiedades químicas)
Intencionalidades Propósito
formativas
Relacionar los conceptos de los lípidos a partir
de procedimientos de laboratorio que describen
el comportamiento químico de los mismos.
Objetivo general.
Competencia
Fundamentación Teórica
16
Éstas biomoléculas se encuentran en todos los tejidos de los animales,
vegetales y en la flora y fauna microscópicas. Todos los lípidos contienen
carbono, hidrógeno y oxígeno, y algunos nitrógeno, fósforo y azufre. El
metabolismo intermedio de los lípidos en animales superiores está
íntimamente relacionado con el de los glúcidos y con algunas
degradaciones de las proteínas, pues sus vías metabólicas tienen
diversos puntos en común; forman la parte principal de los combustibles
productores de energía del cuerpo. Lípidos.
Descripción de la practica
Equipos
Materiales
17
Reactivos
•
• Agua destilada
• Al(OH)2
• NaOH
• Etanol
• Solución de NaCl a saturación
• Aceite vegetal de cocina
• Aceite de oliva
• Manteca de cerdo
Seguridad Industrial
Metodología
Procedimiento.
Parte I. Emulsificación.
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b) Agitar fuertemente, observar y registras cuanto tiempo dura la
emulsión.
c. Hervir a fuego directo 4 veces cada uno de los tubos, por dos
minutos.
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a. Tomar 3 tubos de ensayo y colocar a cada uno de ellos 2 ml de
alcohol y 1 g de una muestra de lípido diferente en cada tubo
(manteca, aceite de cocina y aceite de oliva).
Sistema de Evaluación
20
NOTA: Recuerde que el pre informe es individual y el informe en grupo
de máximo 4 estudiantes.
Rúbrica de evaluación
Retroalimentación
El tutor de laboratorio hará la correspondiente retroalimentación 15 días
luego de entregado el informe o en la fecha que se coloquen de acuerdo
con el tutor.
21
4.3. Práctica No. 3. Extracción y Caracterización de ADN.
Tipo de practica
Presencial X Autodirigida Remota
Porcentaje de 15%
evaluación
Horas de la practica Dos
Temáticas de la Ácidos nucleicos (estructura, función y
práctica propiedades químicas)
Intencionalidades Propósito
formativas
Relacionar los conceptos de los ácidos
nucleicos a partir de procedimientos de
laboratorio que describen el comportamiento
químico de los mismos.
Objetivo general.
Competencia
22
Fundamentación Teórica
Descripción de la practica
23
Recursos a utilizar en la práctica (Equipos / instrumentos)
Equipos
No Aplica
Materiales
Reactivos
• Agua destilada.
• Cloruro de sodio.
• Alcohol Isopropílico frío (-20)
• Jabón líquido para lavar platos
• Zumo de piña fresco
Seguridad Industrial
24
Guantes de nitrilo, gafas de seguridad translucidas, blusa para
laboratorio blanca manga larga, tapa bocas.
Metodología
Procedimiento.
Sistema de Evaluación
Preguntas
26
NOTA: Recuerde que el pre informe es individual y el informe en grupo
de máximo 4 estudiantes.
Rúbrica de evaluación
Retroalimentación
El tutor de laboratorio hará la correspondiente retroalimentación 15 días
luego de entregado el informe o en la fecha que se coloquen de acuerdo
con el tutor.
27
4.4. Practica No. 4. Extracción de la caseína, determinación del
punto isoeléctrico y precipitación salina de proteínas.
Tipo de practica
Presencial X Autodirigida Remota
Porcentaje de 15%
evaluación
Horas de la practica Tres
Temáticas de la Propiedades estructurales de aminoácidos y
práctica proteínas
Intencionalidades Propósito
formativas
Relacionar las propiedades estructurales y
químicas de los aminoácidos y proteínas, a
partir de procedimientos de laboratorio que
describen su comportamiento bioquímico.
Objetivo general.
Competencia
28
Fundamentación Teórica
1.
29
están protonados) y la proteína neutra precipita como se muestra en
el gráfico 3.
La kappa caseína, sin embargo, tiene pocos grupos fosfato y un alto
contenido de carbohidratos unidos a ella. También tiene todos sus
residuos de serina y treonina con sus correspondientes grupos
hidroxilo, así como los carbohidratos dispuestos en una sola cara de
su superficie por lo que esta parte exterior es fácilmente soluble en
agua gracias a los grupos polares que posee. La otra parte de su
superficie se une fácilmente a las alfa y beta caseína insolubles, lo
que da lugar a la formación de la micela.
La caseína está presente en la leche como sal de calcio y caseinato
de calcio. Es una mezcla de caseínas alfa, beta y kappa para formar
un grupo llamado micela. Estas micelas son responsables de la
apariencia opaca blanca de la leche. Como se muestra en el gráfico
5.
30
Miller D.D. 2001. Química de Alimentos, Manual de
Laboratorio. Limusa Wiley, México
El gráfico 5 muestra la kappa-caseína formando una micela o unidad
soluble. La caseína presenta baja solubilidad a pH 4,6. El pH de la
leche es 6,6 aproximadamente, estando a ese pH la caseína se
encuentra cargada negativamente y se solubiliza como sal cálcica. Si
se añade ácido a la leche, la carga negativa de la superficie de la
micela se neutraliza (los grupos fosfato se protonan) y la proteína
neutra precipita
El punto isoeléctrico
31
De lo anterior se deduce que las proteínas tienen un pH característico
al cual su carga neta es cero. A este pH se le denomina punto
isoeléctrico (pI). Estas moléculas constituidas por múltiples
aminoácidos unidos por enlaces peptídicos, cuyos grupos R,
determinan las cargas positivas y negativas al igual que el grupo amino
y el grupo carboxilo libres, como se muestra en el gráfico 6.
Descripción de la practica
32
Mediante el análisis del pH vs absorbancia por métodos
espectrofotométricos.
Equipos
• Espectrofotómetro
• Potenciómetro (pHmetro)
• Centrífuga
Materiales
Reactivos
33
• Leche 200mL
• Agua destilada
• Acetato sódico 0,1 N
• Ácido acético 0,01 N
• Ácido acético 0,1 N
• Ácido acético 1,0 N
• NaOH 1N
• Éter etílico
• Etanol al 70%
Seguridad Industrial
Metodología
Procedimiento.
35
TUBO Acetato Acético Acético pH
0.1N 0.1N 0.01 N resultante
(aprox.)
1 0.5 9.5 - 3.2
2 1 9 - 3.6
3 1.5 8.5 - 3.8
4 2 8 - 4.0
5 3 7 - 4.2
6 4 6 - 4.5
7 6 4 - 4.7
8 8 2 - 5.1
9 6 - 4 5.5
10 8 - 2 6.1
36
f. Anotar los resultados, y graficar la absorbancia frente al pH, y
determinar el pI.
Sistema de Evaluación
37
cálculos realizados, análisis y resultados obtenidos, solución a las
preguntas, conclusiones y bibliografía.
Preguntas:
6.
NOTA: Recuerde que el pre informe es individual y el informe en grupo
de máximo 4 estudiantes.
Rúbrica de evaluación
Retroalimentación
38
Practica No. 5. Cuantificación de proteínas.
Tipo de practica
Presencial X Autodirigida Remota
Porcentaje de 15%
evaluación
Horas de la practica dos
Temáticas de la Propiedades estructurales de aminoácidos y
práctica proteínas
Intencionalidades Propósito
formativas
Relacionar las propiedades estructurales y
químicas de los aminoácidos y proteínas, a
partir de procedimientos de laboratorio que
describen su comportamiento bioquímico.
Objetivo general.
Competencia
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Fundamentación Teórica
Método de Bradford
40
Descripción de la practica
Equipos
• Espectrofotómetro
• Incubadora
• Agitador
Materiales
Reactivos
• Reactivo de Bradford
• Solución de Albúmina sérica Bovina (10mg/mL)
• Caseína y sobrenadante (obtenidos en la práctica anterior)
• Leche
• NaCl al 1%
• NaOH 1N
41
Software a utilizar en la práctica u otro tipo de requerimiento
para el desarrollo de la práctica
Seguridad Industrial
Procedimiento.
43
Sistema de Evaluación
Preguntas:
Rúbrica de evaluación
44
Retroalimentación
45
4.6. Práctica No. 6. Hidrólisis del Almidón
Objetivo general.
Competencia
46
Fundamentación Teórica
47
De acuerdo con las reacciones que catalizan, las enzimas se clasifican
en 6 clases:
1. OXIDORREDUCTASAS
2. TRANSFERASAS
3. HIDROLASAS
4. LIASAS
5. ISOMERASAS
6. LIGASAS
Descripción de la practica
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En esta sección se va a estudiar carbohidratos poliméricos, enlaces
glucosídicos y actividad enzimática determinada por la identificación de
sustrato y productos de la reacción catalizada por la amilasa salival.
Equipos
• Baño de Maria
• Plancha de calentamiento
Materiales
Reactivos
• Lugol
• Reactivo de Benedict
• Solución de Almidón al 1%
• Solución de celulosa al 1%
• HCl concentrado
• NaOH 0,4M
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Guantes de nitrilo, gafas de seguridad translucidas, blusa para
laboratorio blanca manga larga, tapa bocas.
Metodología
Procedimiento
Sistema de Evaluación
Rúbrica de evaluación
Retroalimentación
52
4.7. Práctica No. 7. Efectos de la temperatura y el pH
sobre la actividad enzimática
Tipo de practica
Presencial X Autodirigida Remota
Otra
¿Cuál
Porcentaje de 15%
evaluación
Horas de la practica Tres
Temáticas de la Factores físicos, químicos y actividad
práctica enzimática.
Intencionalidades Propósito
formativas
Relacionar los conceptos del cinética e
inhibición enzimática, a partir de
procedimientos de laboratorio que describen
el comportamiento bioquímico de las
enzimas.
Objetivo general.
53
Competencia
Fundamentación Teórica
54
La mayoría de las enzimas son muy sensibles a los cambios de pH.
Desviaciones de pocas décimas por encima o por debajo del pH óptimo
pueden afectar drásticamente su actividad. Así, la pepsina gástrica tiene
un pH óptimo de 2, la ureasa lo tiene a pH 7 y la arginasa lo tiene a pH
10. Como ligeros cambios del pH pueden provocar la desnaturalización
de la proteína, los seres vivos han desarrollado sistemas más o menos
complejos para mantener estable el pH intracelular: Los amortiguadores
fisiológicos.
Descripción de la practica
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Equipos
• Baño de María
• Plancha de Calentamiento
Materiales
Reactivos
• Lugol
• Reactivo de Benedict
• Solución de Almidón al 2%
• HCl 0,1N
• NaOH 0,1M
No Aplica
Seguridad Industrial
56
Metodología
Procedimiento
1. Prepare una solución de amilasa salival diluida, para esto tome 1mL
de saliva y adicione 9mL de agua destilada, agite cuidadosamente
hasta formar una solución homogénea.
2. Tome tres tubos de ensayo y adicione:
• Tubo 1: 2mL de HCl 0,1N + 2mL de solución de almidón al
2%
• Tubo 2: 2mL de NaOH 0,1N + 2mL de solución de almidón al
2%
• Tubo 3: 2mLde agua destilada + 2mL de solución de almidón
al 2%
3. Adicione 2mL de solución de amilasa salival diluida a cada tubo de
ensayo.
4. Agite bien y mida rápidamente el pH de cada tubo , para esto utilice
cinta indicadora de pH, compare el color obtenido con el de la
escala.
5. Coloque los tres tubos en baño de maría a 37°C durante 15
minutos.
6. Transcurridos los 15 minutos, por cada una de las tres condiciones
evaluadas (HCL 0,1N, NaOH 0,1N y Agua destilada) tome dos tubos
de ensayo y transfiera 1mL de la solución.
7. En un tubo, realice el ensayo de yodo, por adición de 2 gotas de
Lugol y en el otro adicione 2mL de reactivo de Benedict y lleve a
baño maría a ebullición
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Parte II. Influencia de la temperatura en la velocidad enzimática
Sistema de Evaluación
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parte del aprendiente, informes y pre informes de laboratorio. La
valoración de la práctica se dará en términos de una nota de 0.0 a 5.0
Retroalimentación
El tutor de laboratorio hará la correspondiente retroalimentación 15 días
luego de entregado el informe o en la fecha que se coloquen de acuerdo
con el tutor.
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5. Anexos.
Presentación de preinformes
60
Presentación de informes
61
62