UNIVERDIDAD MAYOR DE SAN ANDRÉS

FACULTAD DE CIENCIAS FARMACÉUTICAS Y

BIOQUÍMICAS
CARRERA DE BIOQUÍMICA
CÁTEDRA BIOLOGÍA MOLECULAR

PRÁCTICA N°10
BIOINFORMATICA

CATEDRATICO:
Dra. XIMENA TABORGA
ESTUDIANTES:
Univ. RENE CARLOS CHAMBI NICOLAS

DÍA DE PRÁCTICA: JUEVES “B”

GRUPO: PAR

LAPAZ-BOLIVIA
1. OBJETIVOS

Objetivo general
 Realizar un PCR convencional a través de una bases de datos
Objetivos específicos
 Realizar el diseño de primer y el aplicon para la evaluación de productos
inespecíficos a través de programas online.
 Conocer las estructuras secundarias de los productos inespecíficos.
 Comparar la secuencia con la base de datos.

2. METODOLOGIA

H-ns DNA binding protein (Salmonella enterica subsp. enterica serovar

Typhi)

Tamaño del gen es de 405nt para el producto de PCR

FASTA VIEW: Salmonella Typhi

ATGTCCGAAGCACTCAAATCATTAAACAACATTCGTACTCTTCGTGCGCAGGGCCGTGAACTGCCGTTAG
AGATCCTTGAAGAACTGCTGGAAAAATTAAGCGTTGTTGTTGAAGAACGACGTCAGGAAGAATCTTCAAA
AGAAGCTGAGCTGAAAGCGCGTCTGGAGAAGATTGAATCCCTGCGTCAATTAATGCTTGAAGATGGAATT
GACCCTGAAGAGTTACTGAGTTCTTTCTCTGCAAAGTCCGGAGCACCTAAAAAAGTTCGCGAACCGCGCC
CTGCGAAATATAAATACACTGATGTTAATGGTGAAACGAAAACCTGGACTGGCCAGGGGCGTACCCCTAA
AGCACTGGCCGAACAACTTGAAGCCGGTAAAAAACTGGATGATTTCCTCATCTAA

Tamaño del producto de PCR: 200 - 400

PRIMER METODO:

Características del par de Primers

Segundo método

FASTA VIEW: Salmonella Typhi

ATGTCCGAAGCACTCAAATCATTAAACAACATTCGTACTCTTCGTGCGCAGGGCCGTGAACTGCCGTTAG
AGATCCTTGAAGAACTGCTGGAAAAATTAAGCGTTGTTGTTGAAGAACGACGTCAGGAAGAATCTTCAAA
AGAAGCTGAGCTGAAAGCGCGTCTGGAGAAGATTGAATCCCTGCGTCAATTAATGCTTGAAGATGGAATT
GACCCTGAAGAGTTACTGAGTTCTTTCTCTGCAAAGTCCGGAGCACCTAAAAAAGTTCGCGAACCGCGCC
CTGCGAAATATAAATACACTGATGTTAATGGTGAAACGAAAACCTGGACTGGCCAGGGGCGTACCCCTAA
AGCACTGGCCGAACAACTTGAAGCCGGTAAAAAACTGGATGATTTCCTCATCTAA

Primer Foward ACTCAAATCATTAAA

Primer Reverse CTGAGTTCTTTCTCT AGAGAAAGAACTCAG

Características del primer

3. Discusión

La utilización de la bioinformatica nos sirve para el análisis de productos biológicos

como el DNA a través de la secuenciación en una base de datos.

El NCBI nos permite la búsqueda de secuencia a través de un código o palabra clave

los cual nos da información de un organismo su genoma completo, su tamaño de
genoma, el número de acceso, GenBank, la taxonomía, de bacteria el paper, el autor
la secuencia del aminoácido.

La base de datos nos proporciona la secuencia de DNA de una sola cadena (revers,
foward, continua), de DNA copy.

4. Conclusiones

Se puede realizar un PCR convencional de un organismo mediante su código o

palabra clave a través de una base de datos.

Conocer los productos inespecíficos (estructuras secundarias) que se da entre la

interacción del foward y revers mediante programas online.

Conocer qué organismo reconoce nuestro primer y con quien esta tiene una reacción
cruzada.

6. Bibliografía

www.ncbi.nlm.nih.gov/
Www.bioinformatics.nl/primer3plus
Www.premierbiosoft.com
www.idtdna.com
www.blast.ncbi.nlm.nih.gov