métabolites secondaires Les métabolites végétaux sont les molécules issues du métabolisme
Deux classes : métabolites primaires et métabolites
secondaires
Les métabolites primaires: ont un rôle essentiel pour le
métabolisme et le développement végétal, se retrouvent dans toutes les espèces
Les métabolites secondaires: sont des molécules qui ne
participent pas directement au développement des plantes mais plutôt interviennent dans les relations avec les stress biotiques, abiotiques ou améliorent l’efficacité de reproduction. Ils sont très variés selon différentes espèces Les métabolites primaires sont connus par leur caractère nécessaire et vital à la survie de la cellule, de l’organisme : -les glucides, source d’énergie, paroi cellulaire (cellulose) -les lipides, source d’énergie, membranes cellulaires -les acides aminés, source primaire de construction des protéines. métabolites primaires métabolites primaires
LES GLUCIDES Glucide c’est un saccharide (de Grec Sakcharon=Sucre)
Glucide = saccharide = sucre
3 types de glucides: mono-, oligo- et poly-saccharide
Monosaccharide (Oses, 1 monomère)
3 types de Oligosaccharide (oligosides, quelques monomères)
glucides HOLOSIDES Polysaccharide (Polyosides, plusieurs monomères) HOLOSIDES Monomère de glucides
Composition: (C n H2O)n où n ≥ 3
+ populaire: glucose (C6H12O6)
n=3 triose (glycéraldéhyde)
n=4 tetrose (érythrose, thréose) n=5 pentose (lyxose, xylose, arabinose, ribose) n=6 hexose (talose, galactose, idose, gulose, mannose, glucose, altrose, allose) FONCTIONS DES GLUCIDES Nutriments essentiels pour les cellules • Source d’énergie des cellules
• Permet la synthèse d’autres biomolécules (acides
aminés et acides gras)
• Permet la formation d’oligo- et polysaccharide
LES MONOSACCHARIDES Classement des monosaccharides
• Nature chimique du groupe carbonyl
Aldose
Cétose
• Nombre de carbone ( 3 à 7) LES MONOSACCHARIDES Structures les plus importantes
Galactose Fructose Glucose
Nature chimique: Disposition autour du carbone asymétrique
OLIGOSACCHARIDE: DISACCHARIDE Diholoside
2 monosaccharides reliés par une liaison glycosidique
C
H
2O
H
O
2O
H
CH H
H
O
CH2OH
H
O
H
H
O
H
H
H
O
O
O
H
H
O
H
H
O
H
Liaison glycosidique DISACCHARIDE C
H
2O
H
O
2O
H
CH H
H
O
CH2OH
H
O
H
H
O
H
H
H
O
O
O
H
H
O
H
H
O
H
Glucose
Fructose
Galactose
Glucose
Saccharose
Lactose
Sucre
granulé
de
table
Sucre
du
lait
Glucose
Glucose
Maltose
Sucre
de
Malt
LES POLYSACCHARIDES (Polyosides) Un polysaccharide est un glucide formé d’un grand nombre d’unité de monosaccharide LES POLYSACCHARIDES
FONCTIONS
Structurale Réserve nutritionnelle
Cellulose Animale Végétale
Glycogène Amidon SYNTHÈSE
Glucose, Monosaccharide Galactose, (des légumes) Fructose, etc. Disaccharide (du Maltose, GLUCIDES lait et des Lactose, mayonnaises) Saccharose, etc. Glycogène Polysaccharide Amidon (pain) Cellulose
Fonctions: Nutriments essentiels des cellules
La cellulose
Permet d’obtenir une
paroi cellulaire rigide La Cellulose:
C’est une polyglucane dont les monomères (2K à 25k) de D-glucopyranose sont liés β(1->4) pour former une chaîne linéaire qui prend la conformation d’un ruban plat ondulé (unité cellobiose).
Les possibilités de liaisons hydrogènes entres
les chaînes sont importantes, ce qui rend la molécule hydro-insoluble et même partiellement cristalline quand les molécules s’associent pour former des microfibrilles.
La cellulose et la callose, une autre glucane
liée β(1->3), sont synthétisées à la membrane plasmatique à partir d’un donneur d’unités de glucose - l’uridine diphosphoglucose Le glycogène: réserve animale de glucose
Dans les muscles squelettiques et le foie
L’amidon
Les deux constituants de l’amidon : a – l’amylose, b – l’amylopectine
L’amidon: réserve végétale de glucose
Présent dans les
Tubercules de la pomme de terre, céréales, riz, etc
Granules d’amidon dans une pomme de terre
métabolites primaires métabolites primaires
LES Acides aminés
Substances de métabolismes primaires issues de l’amination des acides organiques au niveau des cellules végétales.
Sont des composés chimiques possédant un groupe COOH et un
groupe NH2.
Les acides aminés sont synthétisés par des voies métaboliques
différentes.
Sont les constituants élémentaires des protéines.
Biosynthèse des acides aminés Les amino-acides proviennent de la fixation du groupement NH3 sur les acides cétoniques.
Cette fixation peut s’opérer de trois façons:
1-L’amination réductrice.
COOH
2-La voie de la glutamine. 3-La transamination. C
O
R
C
HO H
H
C
O
H
H
C
OH
2O CH
H 1-L’amination réductrice. Elle s’amène à la réaction globale:
R-CO-COOH [2H] + NH3 R-CH-[NH2]-COOH + H2O
Elle s’effectue dans la mitochondrie à partir des acides cétoniques
issus du cycle de Krebs 2-Voie de la glutamine: La synthèse de la glutamine s’effectue à partir du glutamate.
R-COO + H + NH3 R-CONH2 + H2O
O ATP + H2O ADP + P C-NH2 COO CH2 CH2 CH2 CH2 C NH2 CH-NH2 COO COO
-La glutamate déshydrogénase catalyse l’amination
réductrice de l’α cétoglutarate grâce au NADPH. -La glutamine synthétase catalyse l’incorporation de l’ammoniaque dans la glutamine grâce à l’ATP. 3-La transamination: C’est le procédé le plus répandu.
NH2 O O NH2
R1-CH-COOH + R2-C-COOH R1-C-COOH + R2-CH-COOH
Il porte comme dans l’amination réductrice, sur un acide cétonique,
mais le radical amine, au lieu d’être apporté par NH3, il est fourni par un acide déjà aminé, qui l’échange contre l’oxygène cétonique.
Le glutamate est l’un des principaux donneurs de NH2 et il assure,
par transamination, la formation de nombreux acides.
EXP/ Aspartate à partir de l’oxalo-acétate
Alanine à partir du pyruvate. Catabolisme des acides aminés: La dégradation des acides aminés, s’effectue par une désamination en acides cétoniques, qui rentrent dans le cycle de Krebs.
Cette désamination est l’inverse de la réaction
d’amination vue à propos de leur biosynthèse métabolites primaires LES Lipides Substances de métabolismes primaires issues par des allongements réalisés à partir de l’acétyl-COA (en C2) par le malonyl-COA (en C3).
CH3-CO~S-C0A + CO2 HOOC-CH2-CO~S-C0A
Le malonyl-COA soude alors un reste acétyle à chaque étape de
l’allongement avec décarboxylation. Catabolisme des acides gras (LIPIDES)
C’est une source énergétique primordiale dans certains cas;
notamment dans les graines oléagineuses. Après hydrolyse des réserves lipidiques par des lipases, diverses acides gras libérés sont dégradés par un processus de béta oxydation qui les tronçonne en restes acétyles.
L’acide gras est mobilisé sous forme d’un acétyl-C0A.
L’acétyl-C0A entre alors dans le cycle glyoxylique qui conduit au succinate, exporté vers les mitochondries et entrant dans le cycle de Krebs. Catabolisme des acides gras (LIPIDES) Ac.
Stéarique
(C18)
Stéaryl-‐Coenzyme
A
Acétyl-‐Coenzyme
A
Palmityl-‐Coenzyme
A
Acétyl-‐Coenzyme
A
Myristyl-‐Coenzyme
A
Acétyl-‐Coenzyme
A
Lauryl-‐Coenzyme
A
Acétyl-‐Coenzyme
A
Capryl-‐Coenzyme
A
Acétyl-‐Coenzyme
A
Caprylyl-‐Coenzyme
A
Caproyl-‐Coenzyme
A
Acétyl-‐Coenzyme
A
Butyryl-‐Coenzyme
A
Acétyl-‐Coenzyme
A
Acétyl-‐Coenzyme
A
Acétyl-‐Coenzyme
A
(CH3-‐CO~S-‐C0A)
Métabolites secondaires Métabolites secondaires
Les métabolites secondaires ne sont pas par essence nécessaires, vitales
pour la cellule, l’organisme.
- Ces molécules sont en très grand nombre, d’une variété structurale
extraordinaire.
- Elles marquent de manière originale (identité), une espèce, famille ou genre.
- Permettent parfois une taxonomie chimique.
- Elles sont souvent impliquées dans une écologie chimique inter-espèces.
- Elles ont de nombreuses applications pharmaceutiques.
Trois grandes catégories de métabolites secondaires ont été définies
- Composés phénoliques:
- Terpènoïdes et Stéroïdes
- Les composés azotés ou alcaloïdes
Familles de métabolites secondaires Familles de métabolites secondaires Familles de métabolites secondaires Relations entre métabolisme secondaire et métabolisme primaire 17- Génie génétique
Génie
généLque
et
génie
métabolique
Stratégies
moléculaires
pour
manipuler
des
voies
de
biosynthèse
L’ouLl
moléculaire
au
service
du
génie
métabolique
CaractérisaLon
des
voies
de
biosynthèse
CaractérisaLon
des
principales
étapes
enzymaLques
Clonage
des
gènes
correspondants
Transgénèse
Surexpression
de
gènes
homologues
De
gènes
hétérologues
(plantes,
bactéries…)
RNAi
Modulation de la voie synthèse de la scopolamine chez Hyoscyamus
Häkkinen et al. Surexpression de la hyoscyamine 6-hydroxylase (H6H) et de la putrescine methyl-esterase (PMT)
PMT + H6H
Témoin H6H PMT
Témoin racines transformées par A. rhizogenes
Zhang et al. Stratégie « Facteurs de transcription»
Moduler l’expression de gènes
codant les enzymes impliquée dans toute une chaîne de biosynthèse Stratégie « Facteurs de Transcription » CONCLUSIONS
Produc'on
de
métabolites
2aires
Quelques
réussites
en
CIV
De
gros
efforts
de
recherche
depuis
40
ans
