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Biotechnologie des

métabolites secondaires
Les métabolites végétaux sont les molécules issues
du métabolisme

Deux classes : métabolites primaires et métabolites


secondaires

Les métabolites primaires: ont un rôle essentiel pour le


métabolisme et le développement végétal, se retrouvent
dans toutes les espèces

Les métabolites secondaires: sont des molécules qui ne


participent pas directement au développement des
plantes mais plutôt interviennent dans les relations avec
les stress biotiques, abiotiques ou améliorent l’efficacité
de reproduction. Ils sont très variés selon différentes
espèces
Les métabolites primaires sont connus
par leur caractère nécessaire et vital à la
survie de la cellule, de l’organisme :
-les glucides, source d’énergie, paroi
cellulaire (cellulose)
-les lipides, source d’énergie,
membranes cellulaires
-les acides aminés, source primaire de
construction des protéines.
métabolites primaires
métabolites primaires

LES GLUCIDES
Glucide c’est un saccharide (de Grec Sakcharon=Sucre)

Glucide = saccharide = sucre

3 types de glucides: mono-, oligo- et poly-saccharide

Monosaccharide (Oses, 1 monomère)

3 types de Oligosaccharide (oligosides, quelques monomères)


glucides HOLOSIDES
Polysaccharide (Polyosides, plusieurs monomères)
HOLOSIDES
Monomère de glucides

Composition: (C n H2O)n où n ≥ 3

+ populaire: glucose (C6H12O6)

n=3 triose (glycéraldéhyde)


n=4 tetrose (érythrose, thréose)
n=5 pentose (lyxose, xylose, arabinose, ribose)
n=6 hexose (talose, galactose, idose, gulose, mannose,
glucose, altrose, allose)
FONCTIONS DES GLUCIDES
Nutriments essentiels pour les
cellules
•  Source d’énergie des cellules

•  Permet la synthèse d’autres biomolécules (acides


aminés et acides gras)

•  Permet la formation d’oligo- et polysaccharide


LES MONOSACCHARIDES
Classement des monosaccharides

•  Nature chimique du groupe carbonyl

  Aldose

  Cétose

•  Nombre de carbone ( 3 à 7)
LES MONOSACCHARIDES
Structures les plus importantes

Galactose Fructose
Glucose

Nature chimique: Disposition autour du carbone asymétrique


OLIGOSACCHARIDE: DISACCHARIDE
Diholoside

2 monosaccharides reliés par une liaison glycosidique


C  H  2O
   H  
O  
   2O    H  
CH
H   H   O   CH2OH  
H  
O  H   H   O  H   H  
H  O   O   O  H  

H   O  H   H   O  H  

Liaison glycosidique
DISACCHARIDE
C  H  2O
   H  
O  
   2O    H  
CH
H   H   O   CH2OH  
H  
O  H   H   O  H   H  
H  O   O   O  H  

H   O  H   H   O  H  
Glucose   Fructose   Galactose   Glucose  
Saccharose   Lactose  
Sucre  granulé  de  table   Sucre  du  lait  

Glucose   Glucose  
Maltose  
Sucre  de  Malt  
LES POLYSACCHARIDES
(Polyosides)
Un polysaccharide est un glucide formé d’un grand nombre
d’unité de monosaccharide
LES POLYSACCHARIDES

FONCTIONS

Structurale Réserve nutritionnelle

Cellulose
Animale Végétale

Glycogène Amidon
SYNTHÈSE

Glucose,
Monosaccharide
Galactose,
(des légumes)
Fructose, etc.
Disaccharide (du Maltose,
GLUCIDES lait et des Lactose,
mayonnaises) Saccharose, etc.
Glycogène
Polysaccharide
Amidon
(pain)
Cellulose

Fonctions: Nutriments essentiels des cellules


La cellulose

Permet d’obtenir une


paroi cellulaire rigide
La Cellulose:

C’est une polyglucane dont les monomères (2K à 25k) de D-glucopyranose sont liés β(1->4) pour
former une chaîne linéaire qui prend la conformation d’un ruban plat ondulé (unité cellobiose).

Les possibilités de liaisons hydrogènes entres


les chaînes sont importantes, ce qui rend la
molécule hydro-insoluble et même
partiellement cristalline quand les molécules
s’associent pour former des microfibrilles.

La cellulose et la callose, une autre glucane


liée β(1->3), sont synthétisées à la membrane
plasmatique à partir d’un donneur d’unités de
glucose - l’uridine diphosphoglucose
Le glycogène: réserve animale de
glucose

Dans les muscles squelettiques et le foie


L’amidon

Les deux constituants de l’amidon : a – l’amylose, b – l’amylopectine


L’amidon: réserve végétale de
glucose

Présent dans les


Tubercules de la pomme de terre,
céréales, riz, etc

Granules d’amidon dans une pomme de terre


métabolites primaires
métabolites primaires

LES Acides aminés


Substances de métabolismes primaires issues de l’amination
des acides organiques au niveau des cellules végétales.

Sont des composés chimiques possédant un groupe COOH et un


groupe NH2.

Les acides aminés sont synthétisés par des voies métaboliques


différentes.

Sont les constituants élémentaires des protéines.


Biosynthèse des acides aminés
Les amino-acides proviennent de la fixation du groupement
NH3 sur les acides cétoniques.

Cette fixation peut s’opérer de trois façons:

1-L’amination réductrice.
 
COOH  
2-La voie de la glutamine.
3-La transamination. C   O  

R  
    C  
HO H  

H   C   O  H  
H   C   OH
   
   2O
CH    
  H
1-L’amination réductrice.
Elle s’amène à la réaction globale:

R-CO-COOH [2H] + NH3 R-CH-[NH2]-COOH + H2O

Elle s’effectue dans la mitochondrie à partir des acides cétoniques


issus du cycle de Krebs
2-Voie de la glutamine:
La synthèse de la glutamine s’effectue à partir du
glutamate.

R-COO + H + NH3 R-CONH2 + H2O


O
ATP + H2O ADP + P C-NH2
COO
CH2 CH2
CH2 CH2
C NH2 CH-NH2
COO COO

-La glutamate déshydrogénase catalyse l’amination


réductrice de l’α cétoglutarate grâce au NADPH.
-La glutamine synthétase catalyse l’incorporation de
l’ammoniaque dans la glutamine grâce à l’ATP.
3-La transamination: C’est le procédé le plus
répandu.

NH2 O O NH2

R1-CH-COOH + R2-C-COOH R1-C-COOH + R2-CH-COOH

Il porte comme dans l’amination réductrice, sur un acide cétonique,


mais le radical amine, au lieu d’être apporté par NH3, il est fourni
par un acide déjà aminé, qui l’échange contre l’oxygène cétonique.

Le glutamate est l’un des principaux donneurs de NH2 et il assure,


par transamination, la formation de nombreux acides.

EXP/ Aspartate à partir de l’oxalo-acétate


Alanine à partir du pyruvate.
Catabolisme des acides aminés:
La dégradation des acides aminés, s’effectue par une
désamination en acides cétoniques, qui rentrent dans le
cycle de Krebs.

Cette désamination est l’inverse de la réaction


d’amination vue à propos de leur biosynthèse
métabolites primaires
LES Lipides
Substances de métabolismes primaires issues par des
allongements réalisés à partir de l’acétyl-COA (en C2) par le
malonyl-COA (en C3).

CH3-CO~S-C0A + CO2 HOOC-CH2-CO~S-C0A

Le malonyl-COA soude alors un reste acétyle à chaque étape de


l’allongement avec décarboxylation.
Catabolisme des acides gras (LIPIDES)

C’est une source énergétique primordiale dans certains cas;


notamment dans les graines oléagineuses.
Après hydrolyse des réserves lipidiques par des lipases,
diverses acides gras libérés sont dégradés par un processus
de béta oxydation qui les tronçonne en restes acétyles.

L’acide gras est mobilisé sous forme d’un acétyl-C0A.


L’acétyl-C0A entre alors dans le cycle glyoxylique qui conduit
au succinate, exporté vers les mitochondries et entrant dans
le cycle de Krebs.
Catabolisme des acides gras (LIPIDES)
Ac.  Stéarique    (C18)   Stéaryl-­‐Coenzyme  A  

Acétyl-­‐Coenzyme  A   Palmityl-­‐Coenzyme  A  

Acétyl-­‐Coenzyme  A   Myristyl-­‐Coenzyme  A  

Acétyl-­‐Coenzyme  A   Lauryl-­‐Coenzyme  A  

Acétyl-­‐Coenzyme  A   Capryl-­‐Coenzyme  A  

Acétyl-­‐Coenzyme  A   Caprylyl-­‐Coenzyme  A  
Caproyl-­‐Coenzyme  A  
Acétyl-­‐Coenzyme  A  

Butyryl-­‐Coenzyme  A  
Acétyl-­‐Coenzyme  A  

Acétyl-­‐Coenzyme  A   Acétyl-­‐Coenzyme  A  
(CH3-­‐CO~S-­‐C0A)  
Métabolites secondaires
Métabolites secondaires

Les métabolites secondaires ne sont pas par essence nécessaires, vitales


pour la cellule, l’organisme.

- Ces molécules sont en très grand nombre, d’une variété structurale


extraordinaire.

-  Elles marquent de manière originale (identité), une espèce, famille ou genre.

- Permettent parfois une taxonomie chimique.

- Elles sont souvent impliquées dans une écologie chimique inter-espèces.

- Elles ont de nombreuses applications pharmaceutiques.


Trois grandes catégories de métabolites
secondaires ont été définies

- Composés phénoliques:

- Terpènoïdes et Stéroïdes

- Les composés azotés ou alcaloïdes


Familles de métabolites secondaires
Familles de métabolites secondaires
Familles de métabolites secondaires
Relations entre métabolisme secondaire et métabolisme primaire
17- Génie génétique

Génie  généLque  et  génie  


métabolique  

Stratégies  moléculaires  pour  manipuler  des  


voies  de  biosynthèse  
L’ouLl  moléculaire  au  service  
du  génie  métabolique  
  CaractérisaLon  des  voies  de  biosynthèse  
  CaractérisaLon  des  principales  étapes  enzymaLques  
  Clonage  des  gènes  correspondants  
  Transgénèse  
  Surexpression    
  de  gènes  homologues    

  De  gènes  hétérologues  (plantes,  bactéries…)  

  RNAi  
Modulation de la voie synthèse de la
scopolamine chez Hyoscyamus

Häkkinen et al.
Surexpression de la hyoscyamine 6-hydroxylase
(H6H) et de la putrescine methyl-esterase (PMT)

PMT + H6H

Témoin
H6H PMT

Témoin racines
transformées par
A. rhizogenes

Zhang et al.
Stratégie « Facteurs de
transcription»

Moduler l’expression de gènes


codant les enzymes impliquée
dans toute une chaîne de
biosynthèse
Stratégie « Facteurs de
Transcription »
CONCLUSIONS

  Produc'on  de  métabolites  2aires  


  Quelques  réussites  en  CIV  
  De  gros  efforts  de  recherche  depuis  40  ans  

  L’espoir  renouvelé  par  le  génie  géné'que  


  CIV  

  Plantes  en'ères